PROSITE entry PS50859
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | LONGIN |
| Accession [info] | PS50859 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JUL-2003 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50859 |
| Associated ProRule [info] | PRU00231 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Longin domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=112; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=107; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1883000; R2=0.0190139; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6296.2392578; R2=6.7789855; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=401; H_SCORE=9015; N_SCORE=8.8; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=280; H_SCORE=8194; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='M'; M= -7,-24,-12,-28,-23, 6,-18,-19, 10,-20, 13, 14,-21,-26,-19,-17,-15, -8, 11,-21, -4,-21; /M: SY='I'; M= -6,-29,-20,-33,-27, 5,-33,-27, 33,-25, 17, 13,-24,-25,-24,-24,-15, -5, 31,-23, -3,-27; /M: SY='A'; M= 15,-15, -9,-20,-14, -1,-12, -8, -7,-16, -2, -5,-12,-19,-13,-17, -2, -4, -4,-15, 2,-14; /M: SY='R'; M=-18, -8,-30, -8, 2,-22,-20, -2,-30, 34,-22,-10, 0,-18, 10, 62,-10,-10,-20,-20,-10, 2; /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='V'; M= -1, -6,-10, -5, -6, -8, 2,-10, -3, -7, -6, -4, -6,-11, -9, -8, 0, -3, 4,-15, -9, -7; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='G'; M= 4, -4,-13, -4, 0,-13, 5, -8,-12, -4,-11, -8, -2, -3, -3, -5, 3, -2, -9,-14,-12, -2; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='D'; M= -4, 16,-14, 23, 9,-18, -5, -2,-18, 1,-15,-13, 7, -5, 1, -4, 4, -2,-13,-20,-11, 5; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='G'; M= -3, -4,-28, -2, -7,-28, 40,-15,-34, -6,-27,-18, 0,-12,-11,-10, -2,-16,-26,-20,-24, -9; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='T'; M= 4, -7,-14,-11,-10, -9,-15,-16, -2,-13, 1, -3, -7,-11,-11,-13, 2, 10, 1,-25,-11,-11; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='V'; M= -5,-23,-20,-23,-18, -7,-26,-21, 12,-15, 5, 6,-22, -5,-16,-13,-11, -1, 17,-27,-11,-18; /M: SY='L'; M= -8,-24,-15,-25,-16, -2,-30,-22, 18,-22, 19, 10,-22,-20,-17,-20,-17, -5, 15,-25, -7,-18; /M: SY='L'; M= -1,-27,-12,-29,-19, 4,-26,-21, 14,-27, 37, 14,-27,-28,-19,-20,-23, -8, 9,-22, -5,-19; /M: SY='A'; M= 20,-12, -8,-18,-13,-16,-10,-21, -5, -7,-10, -7,-11,-16,-13,-13, 6, 6, 7,-26,-16,-13; /M: SY='E'; M= -2, 10,-21, 12, 23,-25,-13, -6,-24, 4,-22,-18, 6, -7, 6, -3, 12, 6,-19,-32,-18, 15; /M: SY='Y'; M= 3,-17,-19,-22,-17, 5,-17, -4, -1,-13, -1, 4,-13,-20,-14,-13, -7, -5, 3,-14, 6,-16; /M: SY='S'; M= 0, 3,-19, 1, 3,-20,-13, -7,-18, 1,-18,-12, 4,-12, 4, -1, 11, 9,-13,-27,-10, 3; /M: SY='D'; M= -8, 18,-28, 25, 12,-27, -9, -7,-23, -5,-21,-18, 7,-11, 0,-11, 0, -8,-20,-24,-16, 6; /M: M= -6, -6, -9, -6, -5, -4,-16,-15, -9,-15, -1, -7, -9,-21,-14,-15, -8, -5, -4,-26,-10, -9; /M: SY='S'; M= 0, 3,-18, 0, 2,-21, -4, -9,-19, -5,-23,-16, 9, -6, 0, -7, 17, 12,-15,-33,-18, 1; /M: SY='G'; M= -5, 1,-25, 1, -2,-28, 13, -4,-29, -4,-25,-14, 4,-14, 5, -4, 6, -3,-23,-26,-17, 1; /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='G'; M= 4, -3,-11, -3, -3,-13, 12, -8,-14, -8,-14,-10, 1, -8, -4, -8, 11, 1,-10,-18,-13, -4; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='F'; M=-10,-10,-11,-13,-10, 15,-16, -7, -3, -6, 1, -1, -8,-15,-11, 0,-10, -6, -3, -4, 8,-10; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='F'; M= -8, -3,-11, -6, -8, 20,-11, -7, -6,-10, -3, -5, 0,-12,-13, -8, -3, -3, -5, -5, 6, -9; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='N'; M= -5, 18,-20, 12, 5,-20, -3, -2,-23, -2,-26,-18, 25,-14, 1, -4, 14, 4,-22,-34,-17, 3; /M: SY='Y'; M= -9,-20,-21,-24,-19, 18,-26, 3, 2,-16, 0, 2,-16,-25,-16,-12,-13, -8, 5, -8, 20,-18; /M: SY='Q'; M= -2, -2,-23, -5, 0,-24, -6, -9,-18, 5,-20, -9, 3,-13, 9, 0, 6, 1,-15,-26,-14, 4; /M: SY='E'; M= -4, 5,-23, 4, 16,-19,-15, -4,-19, 0,-16,-12, 4,-10, 11, -3, 4, 0,-19,-27,-13, 14; /M: SY='F'; M=-12,-19,-24,-23,-11, 10,-28, -9, 5,-14, 3, 4,-14,-21, -5,-11,-13, -9, 1,-14, 5, -8; /M: SY='A'; M= 24,-14,-14,-23,-15,-11,-11,-16, 3,-12, 2, 10,-14,-15,-10,-17, -1, 1, 7,-21,-12,-12; /M: SY='K'; M= -3, -1,-22, -4, 5,-22,-17,-10,-20, 18,-20,-10, 0,-12, 5, 14, 1, 4,-12,-25,-12, 5; /M: SY='F'; M=-13,-15,-25,-19, -8, 6,-19, -4, -7, -7, -2, 6,-10,-20, 4, -1,-12,-11,-11,-12, 3, -1; /M: SY='L'; M= -7,-26, -4,-32,-25, 14,-30,-24, 14,-27, 19, 8,-23,-27,-25,-23,-18, -6, 13,-19, 0,-25; /M: SY='L'; M= -3,-23,-11,-27,-20, 11,-20,-21, 6,-24, 15, 4,-18,-25,-21,-20,-11, -4, 5,-19, -3,-20; /M: SY='K'; M= -7, 0,-26, 1, 15,-27,-15, -5,-25, 18,-22,-11, 0,-10, 15, 16, 0, -2,-21,-24,-14, 15; /M: SY='K'; M= -9, 2,-24, 0, 3,-23,-19,-10,-23, 25,-21,-10, 2,-12, 3, 20, -3, 4,-15,-24,-10, 2; /M: SY='L'; M= -8,-30,-21,-33,-25, 5,-33,-25, 31,-28, 33, 18,-27,-27,-22,-23,-23, -8, 24,-22, -2,-25; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='S'; M= 7, -1, -6, -4, -5, -8, -4, -7, -3, -5, -8, -5, 2, -8, -5, -7, 8, 5, 1,-16, -9, -5; D=-4; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='P'; M= -9, -9,-32, -3, 11,-25,-15,-10,-21, 0,-24,-16,-10, 39, 1, -8, -5, -8,-25,-24,-17, 3; D=-4; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='R'; M= -3, -6,-22, -7, -3,-21, 2, -8,-23, 2,-20,-11, 0,-11, 4, 13, 5, 1,-17,-22,-15, -1; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='P'; M= 0, -3,-23, -4, 1,-19, -5, -8,-21, -6,-24,-17, 2, 12, -5,-11, 9, 0,-19,-29,-18, -3; /M: SY='G'; M= 0, 5,-25, 3, -4,-25, 8,-12,-22, -9,-24,-18, 7, 4, -9,-14, 2, -5,-20,-29,-23, -7; /M: SY='N'; M= -2, 5,-19, -2, 0,-20,-12, 0,-15, -1,-16, -8, 12,-15, 9, 0, 9, 6,-15,-29,-12, 4; /M: SY='R'; M=-15, -5,-29, -5, 5,-23,-20, 1,-27, 28,-20, -8, 1,-16, 10, 42,-10,-10,-20,-22, -9, 5; /M: SY='Q'; M= -1,-13, -6,-18, -8, -8,-20,-11, -7, -8, -5, 1,-11,-19, 4, -8, -4, -3, -5,-22, -8, -1; /M: SY='T'; M= 3, 0, -8, -4, -6,-16,-11,-15,-14,-11,-19,-15, 4,-11, -6,-12, 26, 28, -5,-35,-15, -6; /M: SY='Y'; M=-10,-27,-22,-29,-25, 14,-32,-12, 21,-20, 14, 10,-25,-28,-21,-18,-18, -7, 20, -6, 24,-25; /M: SY='E'; M= -5, 6,-23, 7, 22,-25,-13, -6,-23, 5,-22,-16, 5, -2, 9, -1, 9, 6,-21,-31,-18, 15; /M: SY='H'; M= -4, -1, -5, -2, 8,-24,-16, 12,-23, -6,-21,-11, 1,-14, 12, -5, 8, 1,-19,-32,-11, 9; /M: SY='G'; M= -8, 16,-29, 22, 5,-33, 24, -8,-36, -8,-29,-22, 10,-14, -4,-12, 2,-13,-29,-29,-24, 0; /M: SY='N'; M= -5, 15,-26, 14, 4,-27, -2, -4,-26, 0,-26,-19, 17, -1, 0, 0, 3, -6,-25,-32,-21, 1; /M: SY='Y'; M=-18,-19,-27,-20,-19, 26,-28, 24, -2,-13, -1, 3,-16,-28,-12,-10,-18,-11, -8, 12, 55,-18; /M: SY='I'; M= -7,-13,-20,-19,-14, -4,-25,-17, 12,-15, 12, 8,-10,-21,-13,-14,-10, 4, 9,-26, -6,-14; /M: SY='F'; M=-15,-26, -8,-33,-28, 44,-21,-18, -1,-26, 3, -2,-19,-29,-32,-21,-17,-10, 0, -1, 19,-28; /M: SY='H'; M=-19, 5,-29, 2, 0,-20,-18, 90,-29, -9,-21, -2, 16,-20, 9, 0, -8,-18,-30,-31, 15, 0; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='Y'; M=-17,-21,-26,-22,-21, 29,-30, 9, 3,-13, 2, 1,-20,-29,-14,-12,-17, -6, -3, 19, 61,-21; /M: SY='L'; M= -5,-18,-21,-23,-18, -3,-26,-19, 16,-16, 17, 11,-14,-22,-14,-15,-14, -2, 11,-24, -5,-17; /M: SY='R'; M=-11,-17,-13,-21,-14,-12,-26,-16, 0, 0, -6, -1,-10,-21, -7, 15, -9, -4, 4,-25, -9,-14; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='E'; M= -2, 8,-21, 11, 22,-24,-13, -5,-22, 2,-20,-16, 5, -7, 8, -4, 9, 2,-17,-30,-17, 15; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='D'; M=-13, 34,-25, 35, 14,-31, -5, 3,-29, 1,-28,-22, 30,-13, 6, -4, 5, -5,-29,-37,-20, 10; /M: SY='G'; M= -5, 0,-28, -1,-11,-27, 37, -9,-33, -9,-27,-15, 7,-18,-10, -7, 0,-14,-26,-25,-23,-11; /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-34,-26, 14,-33,-24, 28,-28, 30, 16,-26,-27,-24,-23,-23, -8, 21,-18, 2,-26; /M: SY='C'; M= 6,-14, 33,-22,-19,-13,-20,-22,-11,-18,-11,-11,-13,-24,-19,-20, 3, 8, 3,-33,-15,-19; /M: SY='Y'; M= -8,-18,-26,-20,-21, 13, -4, 0, -8,-15, -6, -5,-15,-26,-16,-15,-12,-11, -8, 8, 35,-21; /M: SY='L'; M= -9,-29, -8,-31,-24, 7,-31,-23, 20,-28, 31, 15,-27,-29,-23,-22,-23, -8, 17,-23, -3,-24; /M: SY='C'; M= -3,-23, 29,-29,-27, -9,-24,-28, 4,-24, 1, -1,-22,-30,-26,-24,-10, -4, 16,-34,-16,-27; /M: SY='I'; M= -3,-26,-21,-33,-25, 4,-29,-22, 29,-23, 20, 22,-22,-23,-18,-22,-17, -7, 23,-20, -2,-23; /M: SY='C'; M= 15,-13, 25,-22,-17,-11,-15,-22,-13,-17,-10, -9,-12,-20,-17,-20, 4, 6, -1,-29,-17,-17; /M: SY='D'; M=-16, 30,-29, 44, 20,-33,-14, 2,-30, -1,-24,-23, 11, -5, 1, -9, -2, -9,-23,-36,-18, 10; /M: SY='E'; M= -9, 10,-21, 13, 15,-27,-16, 0,-26, 12,-23,-15, 6,-12, 6, 6, -1, -7,-20,-30,-14, 10; /M: SY='E'; M= -2, 9,-22, 11, 16,-24, -8, -2,-24, 0,-22,-15, 7, -9, 4, -5, 10, 3,-19,-32,-16, 9; /M: SY='Y'; M=-11,-23,-24,-27,-22, 33,-27, -1, 3,-17, 5, 1,-20,-28,-19,-15,-17, -8, -1, 12, 45,-22; /M: SY='P'; M= -6,-13,-34, -7, -2,-29, 11,-18,-27,-12,-29,-20,-10, 41,-10,-18, -3,-12,-29,-27,-29, -9; /M: SY='R'; M=-13,-12,-25,-12, -5,-17,-21, -3,-16, 18,-14, -5, -6,-20, 1, 34, -8, -7, -6,-23, -8, -5; /M: SY='R'; M=-13, -3,-28, -4, 5,-25,-17, -1,-27, 26,-23,-10, 4,-15, 17, 42, -3, -7,-21,-23,-11, 9; /M: SY='I'; M= -8,-26,-23,-28,-20, -3,-29,-22, 21,-20, 16, 11,-21,-13,-17,-15,-16, -7, 16,-24, -6,-21; /M: SY='A'; M= 30,-13,-20,-17, -7,-23, -7,-20,-13,-10,-17,-13,-13, 23,-10,-20, 3, -3,-10,-23,-23,-10; /M: SY='F'; M=-18,-24,-22,-32,-24, 54,-28, -5, 0,-23, 5, 3,-17,-28,-27,-16,-17, -9, -3, 7, 34,-24; /M: SY='T'; M= 9, -3,-15, -9, -3,-16,-10,-13,-11,-10, -8, -8, 0,-13, -2,-11, 10, 12, -7,-28,-14, -3; /M: SY='F'; M=-17,-27,-23,-32,-24, 46,-30, -9, 6,-24, 18, 6,-23,-30,-26,-17,-23,-10, 0, 7, 36,-24; /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21, 9,-31,-21, 23,-30, 47, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 12,-20, 0,-21; /M: SY='E'; M= -6, 19,-23, 17, 28,-25,-11, 1,-24, 3,-23,-19, 21, -9, 8, -2, 8, -1,-26,-34,-19, 18; /M: SY='D'; M=-16, 22,-30, 33, 22,-34,-16, -2,-34, 17,-27,-20, 9,-10, 10, 11, -3,-10,-27,-30,-16, 15; /M: SY='I'; M= -8,-30,-23,-36,-28, 2,-36,-28, 39,-28, 24, 18,-24,-24,-22,-26,-20, -8, 31,-22, -2,-28; /M: SY='K'; M= -3,-12,-16,-14, -6,-16,-17, -1,-13, 3, -2, -1,-10,-19, -3, 2,-12,-10,-10,-23, -7, -5; /M: SY='D'; M=-12, 16,-29, 22, 19,-34,-12, 1,-28, 10,-24,-13, 8,-10, 21, 3, 0, -9,-26,-28,-15, 20; /M: SY='E'; M=-13, 12,-30, 20, 36,-32,-18, 1,-30, 13,-22,-17, 3, -7, 21, 11, -2,-10,-28,-28,-17, 28; /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-37,-29, 73,-30,-14, 0,-27, 9, 0,-20,-30,-36,-19,-20,-10, -1, 13, 37,-29; /M: SY='L'; M= -9, -8,-14,-12, -7, -8,-22,-11, -1,-13, 2, 0, -6,-21, -8,-12, -8, -3, -3,-21, -7, -8; /M: SY='R'; M= -4, 0,-23, -2, 6,-23,-15, -2,-22, 14,-21,-11, 4,-13, 7, 16, 3, 0,-15,-26,-12, 5; /M: SY='S'; M= -3, 1,-20, -2, 5,-20,-14, -7,-17, 4,-17,-10, 5,-13, 7, 5, 8, 7,-13,-29,-14, 5; /M: SY='Y'; M=-15,-13,-25,-17,-18, 18,-20, 14, -5,-15, -3, -1, -7,-27,-14,-11,-14,-10, -7, -1, 33,-18; /M: SY='G'; M= 1, -7,-26, -6,-12,-27, 34,-16,-29,-15,-26,-16, -1, -3,-13,-17, 5,-10,-23,-26,-26,-13; /I: I=-5; MD=-25; /M: SY='R'; M= -6, -3,-23, -5, 1,-18, -5, -4,-18, 7,-15, -8, 2,-14, 0, 13, -4, -8,-15,-21,-12, -1; D=-5; /I: I=-5; MD=-25; /M: SY='E'; M= 0, -3,-18, -2, 3,-16, -3, -9,-11, -7, -8, -6, -3,-11, 2, -9, 1, -3, -9,-20,-12, 2; D=-5; /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25; /M: SY='K'; M= -8, 2,-24, 4, 8,-21,-15, 0,-21, 14,-19, -9, 1,-12, 14, 14, -1, -6,-18,-17, -3, 10; D=-5; /I: I=-5; DM=-25; /M: SY='W'; M= 1,-26,-26,-29,-22, 1,-15,-24, 1,-19, -3, -4,-24,-18,-19,-20,-16,-12, 0, 28, 2,-20; D=-5; /I: I=-5; DM=-25; /M: SY='E'; M= 0, 1,-25, 0, 10,-23,-14, -2,-22, 3,-21,-13, 2, 3, 6, 0, 2, -3,-20,-27,-15, 7; /M: SY='T'; M= -4, 3,-18, -2, -4,-17,-16, -5,-14, -7,-17,-11, 5, -5, -1, -8, 12, 20,-10,-30,-10, -3; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='A'; M= 17, -7, -9,-13,-11,-11, -5,-15, -2, -9, -7, -5, -5,-12,-11,-13, 6, 5, 6,-20,-13,-11; D=-5; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='V'; M= 1,-13,-14,-15,-11, -8,-12,-15, 4,-13, 1, 1,-10,-12, -8,-12, -1, 3, 6,-20, -9,-10; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='P'; M= 8,-16,-27,-14, -7,-21, -4,-18,-13,-12,-18,-13,-14, 26,-12,-19, -4, -8,-14,-22,-18,-12; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='Y'; M=-12, -5,-23, -6, -8, 2,-20, 9,-11, -4,-11, -7, -3,-20, -2, -2, -3, 2,-13, -3, 30, -8; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='A'; M= 17, -3,-16, -6, 0,-23, -2, -8,-19, -5,-21,-14, 2, -6, 0,-10, 15, 4,-12,-28,-18, -1; /M: SY='F'; M= -4,-16,-19,-22,-18, 19,-22,-15, 4,-19, 9, 10,-15,-22,-19,-17,-12, -5, 4,-13, 4,-17; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='N'; M= -4, 14,-15, 6, 0,-11, -8, 0,-10, -3,-14,-10, 21,-12, -2, -5, 5, 5,-13,-23, -8, -2; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='I'; M= -7, -8,-24, -8, -3, -9,-24,-16, 2, -9, 1, -1, -9,-17, -9, -9, -8, -5, 2,-24, -8, -7; /M: SY='E'; M= -8, 7,-26, 9, 28,-26,-16, 2,-25, 7,-22,-16, 6, -2, 14, 0, 5, 0,-24,-30,-16, 20; /M: SY='F'; M=-18,-28,-23,-35,-25, 55,-29,-17, 2,-24, 9, 3,-19,-23,-31,-15,-19,-10, 0, 3, 23,-26; /M: SY='D'; M= -9, 13,-28, 21, 7,-29, -3, -9,-27, -4,-26,-20, 5, -4, -1,-10, 3, -6,-23,-24,-18, 3; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='R'; M= -6, -6,-22, -7, -1,-12,-16, -8,-17, 5,-17,-10, -2, -3, 0, 8, 1, 3,-13,-21, -7, -2; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='F'; M=-11,-22,-19,-24,-19, 10,-23,-16, 2,-11, 5, 2,-19,-20,-19, -9,-16, -8, 5,-13, 6,-19; /M: SY='L'; M=-12,-13,-24,-14,-13, -2,-26,-12, 12,-20, 23, 12,-15,-24,-10,-16,-20, -9, 3,-21, 0,-13; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 61 in 61 different sequences |
| Number of true positive hits | 61 in 61 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 3 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 95.31 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Longin |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
61 sequences
PHL11_ARATH (Q9SN26), S22BA_DANRE (Q7ZV15), S22BB_DANRE (Q7SXP0), SC221_ARATH (Q94AU2), SC22A_HUMAN (Q96IW7), SC22A_MACFA (Q4R866), SC22A_MOUSE (Q8BH47), SC22A_RAT (Q642F4), SC22B_CHICK (Q5ZJW4), SC22B_CRIGR (O08595), SC22B_HUMAN (O75396), SC22B_MOUSE (O08547), SC22B_PONAB (Q5RAI9), SC22B_RAT (Q4KM74), SC22B_XENTR (Q6P7L4), SC22C_BOVIN (Q2YDJ2), SC22C_HUMAN (Q9BRL7), SC22C_MOUSE (Q8BXT9), SEC22_CANGA (Q6FWT0), SEC22_EREGS (Q74ZD2), SEC22_KLULA (Q6CJA0), SEC22_SCHPO (Q9Y7L0), SEC22_YARLI (Q6C880), SEC22_YEAST (P22214), VA711_ARATH (O49377), VA712_ARATH (Q9SIQ9), VA713_ARATH (Q9LFP1), VA714_ARATH (Q9FMR5), VA721_ARATH (Q9ZTW3), VA722_ARATH (P47192), VA723_ARATH (Q8VY69), VA724_ARATH (O23429), VA725_ARATH (O48850), VA726_ARATH (Q9MAS5), VA727_ARATH (Q9M376), VAM7A_DICDI (Q54NW7), VAM7B_DICDI (Q86AQ7), VAMP7_BOVIN (Q17QI5), VAMP7_CHICK (Q5ZL74), VAMP7_HUMAN (P51809), VAMP7_MOUSE (P70280), VAMP7_PONAB (Q5RF94), VAMP7_RAT (Q9JHW5), YKT61_ARATH (Q9ZRD6), YKT62_ARATH (Q9LVM9), YKT6A_XENLA (Q6DDU7), YKT6B_XENLA (Q32N70), YKT6_BOVIN (Q3T000), YKT6_CANGA (Q6FW27), YKT6_DANRE (Q7ZUN8), YKT6_DEBHA (Q6BSL0), YKT6_DICDI (Q54ES8), YKT6_EREGS (Q757A4), YKT6_HUMAN (O15498), YKT6_KLULA (Q6CSA2), YKT6_MOUSE (Q9CQW1), YKT6_RAT(Q5EGY4), YKT6_SCHPO (O60073), YKT6_XENTR (Q6P816), YKT6_YARLI (Q6C537), YKT6_YEAST (P36015)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
3 sequences
PHL12_ARATH (Q84WF5), PHL21_ARATH (Q9STP2), PHL22_ARATH (Q9LVV3) |
| PDB [Detailed view] |
28 PDB
1H8M; 1IFQ; 1IOU; 2DMW; 2NUP; 2NUT; 2VX8; 3BW6; 3EGD; 3EGX; 3KYQ; 4AFI; 4B93; 5VNE; 5VNF; 5VNG; 5VNH; 5VNI; 5VNJ; 5VNK; 5VNL; 5VNM; 5VNN; 5VNO; 6J74; 6J7F; 6J7X; 8HR0 » more |