 |
|
| Entry: PS50863 |
General information about the entry
| Entry name [info] | B3 |
| Accession [info] | PS50863 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] | 01-MAR-2004 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 18-JUL-2018 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50863 |
| Associated ProRule [info] | PRU00326 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | B3 DNA-binding domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=94; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=94; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.3398848; R2=0.0141015; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=366; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=189; N_SCORE=6.0; MODE=1; TEXT='R?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-30; I=-30; B1=-140; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='F'; M=-13,-21,-11,-27,-21, 27,-24,-15, -4,-19, 1, -2,-15,-24,-22,-13,-14, -8, -3, -5, 9,-20; /M: M= -8,-12,-18,-14, -9, -1,-22,-14, -5, -8, -5, -4,-10,-12,-10, -6, -8, -5, -2,-21, -6, -9; /M: SY='K'; M= -8, -6,-21, -8, -2,-14,-20, -5,-13, 5,-14, -6, -4,-13, -1, 3, -4, -2, -8,-24, -7, -2; /M: SY='L'; M= -5,-19,-20,-22,-14, 7,-21,-15, 3,-15, 8, 5,-16,-19,-14,-13,-11, -5, 3,-18, -2,-14; /M: SY='L'; M= -7,-14,-19,-18,-12, -2,-23,-14, 3,-11, 8, 5,-12,-21,-11,-10, -9, 0, 3,-22, -3,-12; /M: SY='V'; M= -6,-12,-19,-14,-10, -9,-22,-11, -2, -6, -2, 0,-10,-14, -8, -5, -7, -1, 1,-24, -7,-10; /M: SY='T'; M= -3, -5,-20, -9, -7,-12,-15,-10,-12, -5,-15, -9, -1, -2, -6, -5, 4, 7, -9,-26,-11, -7; /M: SY='S'; M= -2, 0,-19, 0, -4,-16,-12,-10,-11,-11,-12, -9, 2, -5, -6,-13, 6, 1, -9,-31,-15, -6; /M: M= -9, -1,-20, -1, -5, -5,-16, -2,-12,-11,-10, -9, -1,-18, -9,-10, 0, -1, -8,-23, -2, -7; /M: SY='V'; M= -2, -9,-17,-11,-11,-11,-15,-12, -2,-12, -4, -3, -7,-15,-12,-12, -2, 0, 2,-26,-11,-12; /M: M= -5, -9,-22,-12,-10,-10, -3,-13,-10,-11, -6, -6, -5,-19,-10, -9, -2, -2, -8,-23, -9,-11; /M: SY='R'; M= -9, -2,-24, -3, 1,-12,-16, -6,-16, 2,-17,-10, 1, -9, -1, 3, 2, -1,-13,-24, -7, -1; /M: SY='N'; M= -8, -1,-23, -1, 0,-17,-13, -2,-15, -1,-14, -9, 1,-13, -2, 0, -2, -4,-13,-25, -8, -2; /M: SY='D'; M= -6, 3,-18, 4, 3,-18, -3, -6,-22, -4,-19,-13, 3,-14, -3, -7, 1, -6,-18,-27,-14, 0; /M: SY='R'; M= -9, -9,-19,-13, -8, -6,-19, -6,-11, -2, -7, -2, -5,-20, -3, 7, -6, -2, -9,-18, -3, -6; /M: SY='L'; M=-11,-24,-20,-26,-17, 5,-28,-15, 12,-16, 22, 15,-21,-25,-13, -8,-20, -9, 8,-19, 1,-16; /M: SY='V'; M= -4,-16,-23,-18,-13, -6,-18,-12, 2,-10, -2, 0,-13,-15,-11, -8, -7, -4, 3,-17, 0,-14; /M: SY='I'; M= -9,-29,-24,-33,-25, 4,-33,-25, 31,-27, 26, 17,-25,-21,-21,-24,-21, -8, 21,-20, -2,-25; /M: SY='P'; M= -7,-11,-30, -4, 0,-28,-16,-16,-20, -7,-27,-18,-12, 53, -7,-16, -3, -6,-24,-31,-25, -6; /M: SY='R'; M= -9, -6,-25, -5, 1,-17,-18,-10,-16, 9,-14, -7, -5, -9, 0, 10, -7, -7,-12,-23,-10, -1; /M: SY='D'; M= -7, 6,-25, 10, 7,-23,-10, -1,-24, 3,-21,-14, 4, -8, 2, 2, 2, -4,-19,-28,-13, 3; /M: SY='F'; M=-13,-20,-19,-26,-17, 37,-26,-12, -5,-17, 1, -3,-15,-23,-23,-12,-14, -7, -4, -1, 18,-18; /M: SY='A'; M= 7,-11,-10,-16,-10, -8,-17,-14, -5,-10, -6, -4, -9,-18,-10,-12, -1, 1, 0,-23, -8,-10; /M: SY='R'; M= -7, 1,-23, 1, 6,-17,-14, -7,-18, 4,-16,-11, 3,-13, 1, 8, 1, -3,-14,-27,-13, 2; /I: I=-6; MD=-19; /M: SY='E'; M= -2, 1,-20, 1, 2,-17,-11, -2,-14, -2,-11, -6, 0,-13, 0, -3, -1, -3,-11,-23, -9, 0; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='N'; M= -7, -1,-19, -4, -6, -6, -6, 0,-11,-10, -8, -6, 3,-17, -8, -9, -3, -5,-11,-18, -1, -8; D=-6; /I: I=-6; DM=-19; /M: M= -5, -5,-25, -5, 0,-15, -1, -9,-16, -7, -9, -8, -3,-12, -5, -8, -5, -9,-15,-23,-14, -3; D=-6; /I: I=-6; DM=-19; /M: M= -8, -2,-27, -3, -4,-18,-12, -8,-12, -3,-12, -7, 0, -3, -5, -5, -6, -7,-13,-25,-11, -6; D=-6; /I: I=-6; DM=-19; /M: SY='K'; M= -7, -5,-26, -7, 0,-17,-18, -8,-10, 2,-12, -5, -2, -6, -1, 1, -5, -4,-10,-25,-11, -2; /M: SY='E'; M= -8, -4,-27, -3, 3,-17, -5, -6,-18, -1,-11, -7, -3,-14, -3, -2, -7,-10,-16,-24,-12, -1; /M: SY='S'; M= 0, -6,-16, -5, -3,-22, -3,-15,-19,-10,-20,-15, -5, 2, -8,-12, 5, -1,-13,-30,-20, -7; /M: SY='R'; M= -6, -7,-21, -8, -3,-21, -5, -8,-18, 3,-15, -7, -4,-16, 0, 5, -4, -6,-12,-24,-13, -2; /M: SY='E'; M= -4, -2,-23, -3, 6,-19,-16,-11,-14, 1,-13, -5, -4, -6, 1, -3, 0, 3,-10,-26,-13, 3; /M: SY='I'; M= -2,-27,-21,-33,-24, 4,-30,-25, 28,-24, 19, 14,-23,-23,-21,-23,-16, -7, 24,-21, -3,-24; /M: SY='V'; M= -5,-11,-18,-15,-11, -5,-24,-17, 3, -8, -1, -1,-10,-19,-12, -8, -5, 5, 6,-23, -4,-13; /M: SY='L'; M= -7,-29,-19,-30,-22, 7,-30,-22, 23,-26, 35, 18,-28,-28,-21,-20,-23, -8, 19,-21, -2,-22; /M: SY='M'; M= -9, -6,-20, -7, -1,-15,-21, -8, -7, 1, -4, 2, -6,-18, 1, 1, -7, -2, -5,-25, -8, -1; /I: I=-7; MD=-23; /M: SY='D'; M= -9, 21,-22, 25, 4,-24, -3, 0,-24, -2,-21,-17, 16,-13, -1, -4, 4, -3,-19,-31,-15, 1; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='E'; M= -5, -9,-26, -7, 5,-19,-14,-10,-14, 0,-12, -8, -8, 1, 2, -1, -4, -6,-15,-22,-13, 3; D=-7; /I: I=-7; DM=-23; /M: SY='R'; M= -7, -1,-26, 0, 2,-19, -6, 2,-24, 1,-21,-13, 2,-15, 1, 4, 1, -6,-20,-18, -9, 1; /M: SY='G'; M= -2, -3,-25, -2, -9,-26, 40,-15,-34,-13,-27,-18, 2,-17,-12,-14, 3,-13,-26,-24,-25,-10; /M: SY='R'; M=-10, -4,-24, -5, 1,-21,-16, -7,-19, 17,-17, -7, -1,-16, 3, 20, -6, -6,-13,-23,-11, 1; /M: SY='K'; M= -4, -4,-22, -5, 5,-20,-17,-10,-15, 8,-18, -8, -1,-10, 4, 3, 6, 3, -9,-28,-13, 4; /M: SY='W'; M=-20,-36,-46,-37,-27, 10,-21,-24,-18,-17,-17,-16,-35,-29,-17,-15,-36,-27,-27,126, 29,-19; /M: SY='E'; M= -6, 0,-23, 1, 7,-21,-10, -6,-20, 3,-18,-12, 2, -7, 2, 0, 1, -2,-17,-27,-14, 4; /M: SY='V'; M= -5,-26,-16,-30,-24, 12,-27,-22, 18,-22, 16, 12,-23,-25,-23,-19,-13, -2, 23,-21, -1,-23; /M: SY='R'; M= -9, -3,-26, -4, 0,-18,-12, -7,-16, 8,-16, -7, -1,-15, 0, 10, -5, -7,-13,-20, -9, -1; /I: I=-5; MD=-18; /M: SY='L'; M=-12,-24,-13,-27,-21, 17,-28, -8, 9,-22, 20, 10,-21,-27,-19,-17,-20, -8, 5, -9, 15,-20; D=-5; /I: I=-5; MD=-18; /M: SY='R'; M= -8, -8,-15,-10, -3,-16,-19,-11,-13, 10,-10, -4, -5,-17, -1, 11, -7, -4, -8,-23, -9, -3; D=-5; /I: I=-5; MD=-18; /M: SY='R'; M=-11,-13,-25,-16, -8, 0,-19, -5, -8, 0, -7, -3, -9,-17, -5, 5,-10, -8, -8, -5, 5, -8; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='N'; M= -1, 5,-19, 3, 0,-20, 0, -4,-19, 1,-20,-12, 8, -9, 0, -2, 6, -1,-15,-24,-13, 0; D=-5; /I: I=-5; DM=-18; /M: SY='N'; M= -3, -1,-21, -4, -3,-19, -2, -9,-19, -2,-17,-11, 4,-14, -3, 1, 4, 0,-15,-27,-15, -4; /M: SY='N'; M= -7, -1,-20, -2, -2,-18, 1, -8,-22, -6,-18,-13, 3,-17, -3, -5, 1, -4,-19,-20,-12, -3; /M: SY='R'; M= -7, -3,-21, -7, -4,-16, -9, -8,-19, 3,-17,-10, 2,-17, -1, 9, 1, 0,-15,-20,-10, -3; /M: SY='Y'; M= -8,-14,-20,-18,-15, 2,-18, -3, -2, -9, -3, 4,-10,-22, -9, -6, -8, -3, -1,-14, 9,-13; /M: SY='Y'; M= -9,-18,-21,-22,-18, 9,-20, -8, 0,-11, 0, 4,-13,-23,-14, -6,-11, -5, 0, -7, 11,-17; /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-32,-23, 19,-30,-18, 19,-26, 28, 16,-24,-27,-22,-20,-22, -8, 13,-15, 6,-22; /M: SY='S'; M= 0, -6,-18,-10, -7,-17, -4,-11,-14, -7,-13, -9, -1,-14, -4, -4, 5, 4,-10,-27,-14, -6; /M: SY='R'; M= -5, -2,-16, -2, 0,-21, -4, -8,-26, 2,-22,-15, 0,-15, -2, 4, 1, -4,-18,-21,-14, -1; /M: SY='G'; M= -1, -8,-29, -8,-18,-29, 62,-19,-37,-19,-28,-19, 1,-20,-19,-19, 1,-18,-28,-22,-29,-18; /I: I=-8; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='W'; M=-19,-38,-48,-39,-29, 9,-20,-29,-18,-20,-18,-19,-38,-29,-20,-20,-37,-27,-27,139, 29,-20; /M: SY='R'; M= -8, 2,-23, 0, 4,-22,-12, -5,-21, 13,-21,-12, 8,-12, 4, 15, 1, -3,-18,-27,-14, 3; /M: SY='E'; M= -7, 8,-24, 11, 12,-27, -5, -3,-28, 8,-25,-17, 8,-11, 5, 6, 3, -6,-23,-29,-17, 8; /M: SY='F'; M=-17,-30,-18,-38,-30, 62,-30,-22, 7,-29, 12, 3,-21,-29,-36,-21,-19, -9, 7, 2, 22,-29; /M: SY='V'; M= 9,-21, 17,-26,-23,-10,-22,-26, 5,-19, -3, -2,-20,-26,-23,-21, -3, -1, 20,-32,-16,-23; /M: SY='K'; M= -7, 4,-24, 5, 9,-24,-14, -4,-21, 10,-18,-11, 3,-13, 7, 7, 0, -3,-17,-27,-13, 7; /M: SY='D'; M= 9, 10,-21, 14, 8,-26, -5,-10,-22, -3,-19,-17, 2,-10, -2,-11, 5, -3,-14,-29,-19, 3; /M: SY='N'; M=-11, 23,-23, 10, 1,-19, -8, 19,-20, 2,-24,-12, 37,-18, 3, 1, 3, -4,-26,-34,-10, 1; /M: SY='G'; M= -5, 1,-23, 0, -3,-25, 13, -6,-27, -3,-24,-15, 5,-15, -5, -2, 1, -9,-21,-27,-19, -5; /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-21, 11,-30,-21, 20,-27, 39, 18,-28,-29,-20,-19,-26, -9, 13,-19, 1,-21; /M: SY='K'; M= -8, -4,-25, -3, 9,-24,-16, -7,-18, 14,-16, -6, -3,-13, 9, 11, -6, -8,-14,-24,-12, 8; /M: SY='E'; M= 3, -4,-21, -3, 4,-17,-17,-12, -9, -6, -9, -8, -7, -9, -4,-10, 0, 0, -5,-26,-13, -1; /M: SY='G'; M= -4, -3,-29, -4,-14,-27, 46,-12,-34,-14,-27,-18, 5,-18,-14,-14, -1,-16,-28,-21,-24,-14; /M: SY='D'; M=-15, 35,-28, 49, 21,-34,-11, 0,-34, 0,-26,-25, 15,-10, 3, -8, 2, -7,-27,-36,-17, 12; /M: SY='F'; M= -5,-10,-17,-16,-15, 4,-19,-15, 0,-12, -5, -3, -5,-19,-15,-11, -1, 2, 3,-21, -3,-15; /M: SY='L'; M= -9,-27, 6,-32,-26, 10,-31,-24, 13,-26, 15, 6,-23,-29,-25,-22,-18, -7, 14,-22, -1,-26; /M: SY='V'; M= -3,-17,-15,-20,-15, -3,-23,-20, 7,-14, 5, 2,-15,-21,-15,-12, -3, 7, 13,-25, -7,-16; /I: I=-9; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='F'; M=-18,-31,-25,-38,-28, 56,-29,-21, 1,-27, 11, 1,-24,-29,-33,-20,-24,-13, -2, 24, 24,-27; /M: SY='E'; M= -7, -3,-24, -3, 11,-19,-19, -5,-17, 9,-14, -6, -3,-12, 6, 8, 0, -1,-13,-24, -8, 8; /I: I=-6; MD=-19; /M: SY='F'; M=-13,-21,-22,-23,-15, 16,-25, -5, 1,-15, 14, 5,-17,-24,-14, -5,-18, -9, -2, -8, 13,-15; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='R'; M=-10, -1,-21, 1, 0,-18,-14, -7,-16, 1,-15, -9, -2,-16, -3, 5, -3, -4,-10,-24,-12, -3; D=-6; /I: I=-6; DM=-19; /M: SY='G'; M= -6, 1,-20, 4, 6,-27, 11, -9,-32, 2,-25,-17, 2,-14, -1, 0, 0,-10,-24,-27,-20, 2; D=-6; /I: I=-6; DM=-19; /M: SY='N'; M= -4, 7,-20, 6, 2,-21, -8, -6,-21, -2,-22,-16, 9, -7, -3, -4, 3, -1,-18,-28,-15, -1; /M: SY='G'; M= -1, -5,-22, -6, -8,-18, 13,-12,-21,-10,-15, -9, -2,-17, -9, -9, 3, -3,-15,-24,-15, -9; /M: SY='E'; M= -4, -4,-21, -5, 5,-18,-18,-11,-12, 0,-14, -9, -4, -6, -2, -2, 2, 3, -7,-29,-14, 1; /M: SY='F'; M=-11,-22,-21,-26,-18, 18,-24,-15, 0,-18, 10, 4,-18,-12,-19,-13,-16, -7, -2,-12, 4,-18; /M: M=-11,-12,-11,-13, -7, -8,-21, -3,-10, -8, -7, -3,-10,-12, -9, -6, -9, -6, -7,-23, -5, -9; /M: SY='V'; M= -6,-27,-16,-31,-26, 15,-27,-23, 19,-22, 15, 12,-24,-27,-25,-18,-15, -4, 25,-19, 0,-25; /M: SY='A'; M= 1,-11,-16,-14,-10,-11, -9, -6,-11, -9, -6, -3, -8,-18, -6, -7, -3, -4, -8,-22, -7, -9; /M: SY='I'; M= -8,-24,-21,-28,-21, 2,-28,-20, 20,-19, 17, 12,-20,-24,-17,-15,-17, -7, 16,-20, -2,-20; /M: SY='F'; M=-12,-17,-16,-19,-14, 11,-22,-12, -5,-12, 2, -2,-13,-24,-16, -2,-11, -7, -1,-16, 3,-15; /M: SY='R'; M= -9, -4,-15, -4, -1,-22,-10, -9,-24, 5,-19,-12, -1,-10, 0, 12, -2, -5,-18,-27,-16, -2; /M: SY='S'; M= -1, -6,-21, -8, -2,-18, -9, -9,-18, -1,-19,-12, -2, -3, -3, 0, 3, 0,-14,-23,-13, -4; /M: SY='E'; M= -5, 3,-24, 3, 4,-23,-10, -8,-21, 4,-22,-14, 4, -6, 2, 2, 4, 1,-17,-27,-15, 2; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 300 in 202 different sequences |
| Number of true positive hits | 300 in 202 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 22 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 93.17 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist, N_Hulo |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 7 |
| Feature key [info] | DNA_BIND |
| Feature description [info] | TF-B3 |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
202 sequences
ABI3_ARATH (Q01593 ), ARF2A_SOLLC (Q2LAJ3 ), ARF2B_SOLLC (K4DF01 ), ARFA_ARATH (Q8L7G0 ), ARFA_ORYSJ (Q5NB85 ), ARFB_ARATH (Q94JM3 ), ARFB_ORYSJ (Q0JKI9 ), ARFC_ARATH (O23661 ), ARFC_ORYSJ (Q5JMM1 ), ARFD_ARATH (Q9ZTX9 ), ARFD_ORYSJ (Q5JK20 ), ARFE_ARATH (P93024 ), ARFE_ORYSJ (Q6Z2W3 ), ARFF_ARATH (Q9ZTX8 ), ARFF_ORYSI (A2X1A1 ), ARFF_ORYSJ (Q6H6V4 ), ARFG_ARATH (P93022 ), ARFG_ORYSJ (Q6YVY0 ), ARFH_ARATH (Q9FGV1 ), ARFH_ORYSJ (Q6K223 ), ARFI_ARATH (Q9XED8 ), ARFI_ORYSJ (Q0JCZ4 ), ARFJ_ARATH (Q9SKN5 ), ARFJ_ORYSI (Q01I35 ), ARFJ_ORYSJ (Q7XKK6 ), ARFK_ARATH (Q9ZPY6 ), ARFK_ORYSI (Q01K26 ), ARFK_ORYSJ (Q8S983 ), ARFL_ARATH (Q9XID4 ), ARFL_ORYSI (Q258Y5 ), ARFL_ORYSJ (Q0J951 ), ARFM_ARATH (Q9FX25 ), ARFM_ORYSJ (Q7XSS9 ), ARFN_ARATH (Q9LQE8 ), ARFN_ORYSJ (Q0DGS1 ), ARFO_ARATH (Q9LQE3 ), ARFO_ORYSJ (Q8S985 ), ARFP_ARATH (Q93YR9 ), ARFP_ORYSI (A2YAA5 ), ARFP_ORYSJ (A3B9A0 ), ARFQ_ARATH (Q84WU6 ), ARFQ_ORYSI (A2YG67 ), ARFQ_ORYSJ (Q653U3 ), ARFR_ARATH (Q9C5W9 ), ARFR_ORYSJ (Q653H7 ), ARFS_ARATH (Q8RYC8 ), ARFS_ORYSJ (Q0D9R7 ), ARFT_ARATH (Q9C7I9 ), ARFT_ORYSJ (A3BH85 ), ARFU_ARATH (Q9C8N9 ), ARFU_ORYSJ (Q6YZW0 ), ARFV_ARATH (Q9C8N7 ), ARFV_ORYSJ (Q9AV47 ), ARFW_ARATH (Q9LP07 ), ARFW_ORYSI (A2ZET6 ), ARFW_ORYSJ (Q2R3F5 ), ARFX_ORYSJ (Q2QQX6 ), ARFY_ORYSJ (Q2QM84 ), FUS3_ARATH (Q9LW31 ), IDEF1_ORYSJ (Q6Z1Z3 ), IDEFH_ORYSJ (Q7XKC5 ), LEC2_ARATH (Q1PFR7 ), LFL1_ORYSJ (A4LBC0 ), NGA1_ARATH (O82799 ), NGA2_ARATH (Q9M268 ), NGA3_ARATH (Q9MAN1 ), NGA4_ARATH (O82595 ), RAV1_ARATH (Q9ZWM9 ), RAV2_ARATH (P82280 ), RAVL1_ARATH (Q9C6M5 ), RAVL2_ARATH (Q9C6P5 ), RAVL3_ARATH (Q9C688 ), RAVL4_ARATH (Q9LS06 ), REM10_ARATH (P0DH85 ), REM11_ARATH (P0CAP3 ), REM12_ARATH (P0CAP4 ), REM13_ARATH (P0CAP5 ), REM14_ARATH (Q8GYM4 ), REM15_ARATH (O23076 ), REM16_ARATH (Q8RYD1 ), REM17_ARATH (Q84WP3 ), REM19_ARATH (Q9XIB5 ), REM1_ARATH (Q84J39 ), REM1_BRAOB (O65098 ), REM20_ARATH (Q8LAV5 ), REM21_ARATH (Q9M8K2 ), REM22_ARATH (Q9STF1 ), REM23_ARATH (Q9LXE1 ), REM2_ARATH (Q3E9T2 ), REM3_ARATH (Q8VZQ9 ), REM4_ARATH (Q9SB79 ), REM5_ARATH (Q9SB80 ), REM6_ARATH (O81782 ), REM7_ARATH (Q8H2D0 ), REM8_ARATH (Q8H2D1 ), REM9_ARATH (O81778 ), REML1_ARATH (Q8S8E8 ), REML2_ARATH (F4IQL7 ), REML3_ARATH (F4KFT6 ), VAL1_ARATH (Q8W4L5 ), VAL2_ARATH (Q5CCK4 ), VAL3_ARATH (O65420 ), VIV1_MAIZE (P26307 ), VIV_ORYSJ (P37398 ), VRN1_ARATH (Q8L3W1 ), Y1030_ORYSJ (Q7XFU9 ), Y1054_ORYSJ (Q5N6V0 ), Y1071_ORYSJ (Q8LNN8 ), Y1086_ORYSJ (Q7XGM6 ), Y1129_ORYSJ (Q53N90 ), Y1154_ORYSJ (Q2R0Z3 ), Y1160_ORYSJ (Q53QI0 ), Y1176_ORYSJ (Q2R9D2 ), Y1203_ARATH (Q9C6X0 ), Y1208_ORYSJ (Q2QMT6 ), Y1209_ORYSJ (Q2QMT5 ), Y1214_ORYSJ (Q2QMT7 ), Y1223_ORYSJ (Q2QMT2 ), Y1235_ORYSJ (Q8S2E6 ), Y1237_ORYSJ (Q5JNA1 ), Y1341_ORYSJ (Q0JP99 ), Y1407_ORYSJ (Q9AWS7 ), Y1410_ORYSJ (Q9AWS0 ), Y1475_ARATH (Q9XIB4 ), Y1592_ARATH (Q5RM09 ), Y1593_ARATH (Q9MA32 ), Y1664_ARATH (Q9FX77 ), Y1898_ARATH (Q8GWU1 ), Y1934_ORYSJ (Q8RZX9 ), Y2042_ORYSJ (A3A463 ), Y2142_ARATH (Q9SIC7 ), Y2172_ARATH (Q8RV83 ), Y2531_ARATH (Q5PNU4 ), Y2558_ORYSJ (Q6K3B2 ), Y2559_ORYSJ (Q6K3B1 ), Y2608_ARATH (Q8GYJ2 ), Y2621_ARATH (Q5BPT7 ), Y2641_ORYSJ (Q0DXB1 ), Y2835_ORYSJ (Q6EU30 ), Y2881_ARATH (Q9ZV39 ), Y2982_ORYSJ (Q6K5K2 ), Y3123_ORYSJ (Q10Q26 ), Y3158_ARATH (Q8RYD3 ), Y3160_ORYSJ (Q851V1 ), Y3196_ORYSJ (Q6AV22 ), Y3198_ORYSJ (Q10GP0 ), Y3204_ORYSJ (Q851W5 ), Y3205_ORYSJ (Q851W4 ), Y3209_ORYSJ (Q8LMR9 ), Y3216_ORYSJ (Q851V5 ), Y3221_ORYSJ (Q10GM4 ), Y3222_ORYSJ (Q10GM3 ), Y3440_ARATH (Q9SZ05 ), Y3485_ARATH (Q9LRX6 ), Y3518_ARATH (Q9LSF7 ), Y3622_ARATH (Q1PES7 ), Y3643_ORYSJ (B7EIH2 ), Y3701_ARATH (Q9LSP6 ), Y3845_ORYSJ (Q10QS9 ), Y3852_ARATH (Q9LH88 ), Y3896_ARATH (Q84R27 ), Y3918_ARATH (Q1G3M3 ), Y3961_ARATH (Q9SCJ8 ), Y3982_ORYSJ (Q6AV21 ), Y4158_ARATH (Q9ZSH7 ), Y4469_ORYSJ (Q7XS75 ), Y4474_ORYSJ (Q7XS74 ), Y4765_ORYSJ (Q7XKC4 ), Y4814_ORYSJ (Q7F9W2 ), Y4869_ORYSJ (Q7XLP4 ), Y5013_ARATH (Q9LVG1 ), Y5014_ARATH (Q9FHB0 ), Y5142_ARATH (Q9LST3 ), Y5270_ARATH (Q9FMZ4 ), Y5405_ARATH (Q9FLV7 ), Y5475_ARATH (Q680D9 ), Y5498_ORYSJ (Q6L4H4 ), Y5547_ARATH (Q1PDT6 ), Y5578_ARATH (Q9FFM6 ), Y5625_ARATH (Q9FNI3 ), Y5698_ARATH (Q9FGD2 ), Y5772_ARATH (Q9FHH1 ), Y5800_ARATH (Q9FJG2 ), Y5809_ARATH (Q9FK61 ), Y5814_ORYSJ (Q5KQI4 ), Y5828_ARATH (Q9FHB2 ), Y5849_ARATH (Q9FFX2 ), Y5850_ARATH (Q9FFX1 ), Y6078_ORYSJ (Q5VS55 ), Y6112_ORYSJ (Q9LHY9 ), Y6325_ORYSJ (Q67VL7 ), Y6944_ORYSJ (Q69V36 ), Y7282_ORYSJ (Q84YL3 ), Y7633_ORYSJ (Q0D5G4 ), Y7797_ORYSJ (Q6Z3U3 ), Y7832_ORYSJ (Q8H507 ), Y7833_ORYSJ (Q8H506 ), Y7838_ORYSJ (A3BH91 ), Y8251_ORYSJ (Q6Z0D2 ), Y8335_ORYSJ (Q6YTQ4 ), Y8347_ORYSJ (Q6Z0D9 ), Y8577_ORYSJ (Q7EZD5 )» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
22 sequences
Y1022_ARATH (Q9SX41 ), Y1045_ARATH (Q9XIK5 ), Y1056_ARATH (F4I8U3 ), Y1060_ARATH (Q9LM90 ), Y1197_ARATH (Q9ZU26 ), Y1317_ARATH (Q1G3Z6 ), Y1786_ARATH (Q9SYL8 ), Y2146_ARATH (Q9SIC3 ), Y2186_ARATH (Q6DSS2 ), Y2192_ARATH (Q9SJ07 ), Y2272_ARATH (Q1G3B8 ), Y2372_ARATH (O23659 ), Y2467_ARATH (Q9SJ98 ), Y2741_ARATH (Q9XIP5 ), Y4261_ARATH (B3H469 ), Y4287_ARATH (Q9SY12 ), Y4316_ARATH (Q9ZR15 ), Y4317_ARATH (Q9ZR14 ), Y4563_ARATH (Q9M0U1 ), Y5406_ARATH (Q3E7N5 ), Y5680_ARATH (Q3E922 ), Y5691_ARATH (F4KIX1 )» more |
| PDB [Detailed view] |
12 PDB
1WID; 1YEL; 4I1K; 4LDU; 4LDV; 4LDW; 4LDX; 4LDY; 5YZY; 5YZZ; 5Z00; 6FAS |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission