PROSITE entry PS50882

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	YTH
Accession [info]	PS50882
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-MAY-2003 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50882
Associated ProRule [info]	PRU00225

Name and characterization of the entry

Description [info]

YTH domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=136;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=131;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7912000; R2=0.0140943; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=14290.3310547; R2=5.6120996; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.1%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=476; H_SCORE=16962; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=335; H_SCORE=16170; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='A';  M= 24,-13,-15,-20,-13,-15,-11,-20,  3,-15, -7, -5, -8,-13,-10,-20, 10,  2,  5,-25,-15,-13;
/M: SY='R';  M=-12, -5,-25, -8,  0,-20,-20, -8,-25, 24,-20,-10,  0,-15,  5, 40, -2,  6,-15,-23,-10,  0;
/M: SY='F';  M=-20,-27,-23,-35,-27, 67,-30, -9,  0,-25,  7,  0,-20,-30,-32,-17,-20,-10, -3, 15, 43,-27;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='V';  M= -3,-30,-13,-30,-27,  3,-30,-27, 27,-23, 20, 13,-30,-30,-27,-20,-15, -3, 40,-27, -7,-27;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-25,-37,-30,  0,-37,-30, 45,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 35,-23, -3,-30;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='N';  M= -7, 16,-20,  6, -5, -9, -7,  7,-15, -5,-23,-15, 29,-20, -2, -5, 11,  3,-20,-24,  3, -5;
/M: SY='N';  M=  0, 21,-15, 10,  0,-20,  0,  0,-20, -5,-30,-20, 36,-15,  0, -5, 24, 10,-20,-40,-20,  0;
/M: SY='H';  M=-15, -8,-28, -6,  9,-15,-22, 21,-18,  0, -3, -2, -5,-18,  5, 14,-13,-13,-17,-25, -2,  4;
/M: SY='D';  M=-15, 27,-30, 39, 28,-35,-15, -2,-35, 15,-27,-22, 10, -7,  8,  3, -2,-10,-28,-32,-18, 18;
/M: SY='N';  M=-15, 32,-25, 26,  5,-25, -7, 30,-27, -2,-28,-17, 38,-18,  2, -2,  3, -7,-30,-38,-10,  2;
/M: SY='V';  M= -5,-30,-13,-33,-30, 21,-30,-27, 22,-23, 10,  7,-27,-30,-33,-20,-13, -3, 37,-19,  1,-30;
/M: SY='E';  M=  3,  0,-25,  0, 16,-25,-15, 15,-25, 10,-20,-10,  0,-10,  8,  2, -2,-10,-20,-25, -8, 11;
/M: SY='L';  M=-12,-18,-25,-18, -8, -7,-25,-13, -4,  3, 14,  6,-16,-23, -6, 14,-20,-10, -4,-20, -5, -8;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='V';  M=-10,-22,-22,-27,-20, 12,-30,-22, 12, -7,  2,  5,-18,-23,-20, -9,-15, -7, 15,-15,  2,-20;
/M: SY='Q';  M= -7, -5,-25, -5,  3,-15,-17,  3,-17,  9,-20, -7, -2,-15, 16,  4,  3, -2,-18,-13, 10,  8;
/M: SY='Q';  M=-12,  5,-28,  0,  3,-17,-17,  7,-18, 13,-21, -8, 10,-17, 16,  8, -5, -8,-23,-14,  8,  9;
/M: SY='G';  M=  2, -8,-25, -8,-15,-28, 54,-18,-35,-18,-30,-20,  2,-18,-15,-18,  9,-11,-25,-25,-28,-15;
/M: SY='V';  M= -2,-30,-15,-32,-30,  0,-32,-30, 35,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 45,-28, -8,-30;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='S';  M= 21, -3,-10, -5, -3,-20,  0,-13,-17,-10,-25,-17,  5,-10, -3,-13, 32, 15, -7,-35,-20, -3;
/M: SY='T';  M=  5,  0,-10, -5, -5,-15,-10,-15,-15,-10,-20,-15,  5,-10, -5,-10, 30, 36, -5,-35,-15, -5;
/M: SY='T';  M= -5, -8,-18,-12, -5,-13,-23,-12, -5,-10,  3,  0, -8,-15,  6, -7,  2, 19, -5,-25, -7,  1;
/M: SY='H';  M=-15,-15,-33,-14, -7,-18,-25, 13, -9, -4,-14, -3, -7,  8, -2,  7,-12,-12,-14,-25, -5, -9;
/M: SY='P';  M= -7, -4,-22, -8, -7,  2,-13,-11,-15,-13,-20,-15,  6,  9,-13,-13,  5,  0,-17,-25,-10,-10;
/M: SY='G';  M= -5, 16,-25,  6,-10,-25, 33, -4,-30,-10,-30,-20, 31,-20,-10,-10,  5,-10,-30,-30,-25,-10;
/M: SY='E';  M=-10, 24,-25, 20, 31,-25,-10,  5,-25,  5,-25,-20, 29,-10, 10,  0,  5, -5,-30,-35,-20, 21;
/M: SY='A';  M= 21, -5,-20,-10,  0,-25,-10,-15,-20, 19,-20,-10, -5,-10,  0,  4,  0, -5,-10,-20,-15,  0;
/M: SY='K';  M=-12,  8,-27,  3,  5,-25,-15, -2,-27, 32,-28,-13, 15,-15,  7, 32, -5, -7,-23,-25,-13,  5;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='N';  M= -7, 32,-20, 26,  5,-25, -2,  3,-25, -2,-30,-22, 38,-15,  0, -5, 15,  3,-25,-40,-20,  2;
/M: SY='E';  M=  4,  3,-25,  6, 34,-30,-15, -2,-23,  5,-18,-13, -2, -5, 24, -2,  2, -8,-23,-25,-17, 29;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='F';  M=-20,-28,-22,-35,-28, 68,-30,-10,  0,-25,  8,  0,-20,-30,-33,-18,-20,-10, -2, 15, 42,-28;
/M: SY='R';  M=-18,  8,-30, 14,  8,-28,-17, -2,-33, 27,-25,-15,  5,-15,  7, 39, -7,-10,-23,-25,-13,  5;
/M: SY='E';  M= -7, 14,-25, 21, 22,-30,-12, -5,-30, 12,-27,-20,  7, -7,  8,  3,  8, -2,-22,-32,-18, 15;
/M: SY='V';  M= 11,-18,-12,-20,-15, -7,-15,-20,  6,-18,  5,  0,-15,-20,-15,-17,  2,  3, 13,-28,-12,-15;
/M: SY='E';  M=-13, 12,-28, 12, 30,-25,-15,  2,-28, 13,-22,-17, 15,-10, 12, 18,  0, -8,-27,-30,-17, 20;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='N';  M=-10, 16,-27,  8,  2,-25,-10, -2,-22, 10,-30,-18, 27,  7,  0,  3,  0, -5,-28,-33,-20,  0;
/M: SY='V';  M= -2,-30,-15,-32,-30,  0,-32,-30, 35,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 45,-28, -8,-30;
/M: SY='F';  M=-15,-30,-25,-40,-30, 38,-35,-25, 26,-30, 15, 10,-20,-25,-30,-25,-20,-10, 16, -6, 14,-30;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='F';  M=-15,-30,-23,-37,-27, 41,-33,-23, 18,-30, 23, 10,-23,-27,-30,-23,-23,-10, 11, -6, 14,-27;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='V';  M= -2,-30,-15,-32,-30,  0,-32,-30, 35,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 45,-28, -8,-30;
/M: SY='N';  M=-10, 30,-23, 15,  3,-23, -5,  5,-23, 13,-30,-17, 45,-17,  3,  8,  5, -3,-27,-35,-17,  3;
/M: SY='R';  M=  3, -2,-20, -5, 11,-20,-15,-10,-20,  6,-15,-13, -2,-10,  3, 12,  5,  7,-13,-25,-15,  6;
/M: SY='S';  M=  7,  0,-10, -3, -3,-17, -5,-13,-17,-10,-25,-17,  7,-10, -3,-10, 35, 28, -7,-37,-17, -3;
/M: SY='G';  M=-10,-10,-30,-10,-10,-25, 26,-10,-35,  5,-25,-15,  0,-20, -5, 24, -5,-15,-25,-20,-20,-10;
/M: SY='R';  M=-15, -2,-30, -2,  7,-27,-20, 26,-28, 20,-23, -5,  3,-15, 21, 27, -8,-13,-25,-23, -2, 12;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='C';  M=  8,-14, 17,-19,-12,-21,-20,-17, -9,-12,-11, -5,-14,-22, -1,-15, -2, -5,  1,-30,-18, -6;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='C';  M=-10,-27, 20,-33,-28, 18,-30,-25,  4,-28, 11,  2,-25,-33,-30,-23,-17, -8, 12,-23, -3,-28;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='E';  M=-13,  2,-30,  7, 31,-27,-20, -3,-30, 26,-23,-15,  0, -8, 15, 26, -5,-10,-25,-25,-15, 22;
/M: SY='M';  M=-10,-20,-20,-30,-20,  0,-20,  0, 20,-10, 20, 60,-20,-20,  0,-10,-20,-10, 10,-20,  0,-10;
/M: SY='V';  M=  0,-17,-15,-20,-22,-10, -2,-25,  1,-17, -6, -3,-14,-22,-22,-17,  1,  8, 16,-27,-15,-22;
/M: SY='S';  M= 18, -5,-15, -7, -7,-22, 16,-15,-22,-12,-25,-17,  3,-12, -7,-15, 23,  6,-12,-30,-22, -7;
/M: SY='E';  M=-17,  8,-30, 15, 16,-16,-20,  5,-26,  8,-18,-15,  0,-15,  6, 14, -7,-10,-23,-16,  5,  8;
/M: SY='I';  M=  8,-25,-18,-30,-22, -3,-25,-25, 23,-23, 18, 10,-22,-22,-20,-23,-13, -5, 22,-22, -7,-22;
/M: SY='R';  M=-12,  6,-30, 11,  2,-30,  6, -8,-35, 15,-27,-17,  5,-15,  0, 18, -5,-13,-25,-25,-18, -1;
/M: SY='M';  M=-12,-17,-25,-22,-17,  5,  2,-10,-13, -7, -6,  7,-10,-22,-12,  6,-12,-13,-11,-13, -4,-15;
/M: SY='D';  M=-18, 29,-28, 35,  5,-17,-13,  8,-25, -3,-22,-20, 18,-18, -3, -8, -3, -8,-25,-21,  7,  0;
/M: SY='L';  M=-10,-23,-25,-26,-16, -2,-30,-20, 17,-12, 24, 13,-21,-23,-13,-11,-23,-10,  9,-20, -2,-16;
/M: SY='D';  M=-12, 16,-33, 28,  4,-35,  9,-10,-35, -8,-30,-25,  4, 13, -8,-15, -3,-13,-30,-32,-25, -3;
/M: SY='A';  M= 11,-12,-18,-17,-15,-13,  7,-20,-11,-17, -2, -6, -9,-17,-15,-18,  1,  5, -6,-22,-16,-15;
/M: SY='G';  M= -2,  1,-20,  5, -9,-22,  9,-16,-17,-13,-20,-15, -1,-18,-13,-15,  7, -3, -4,-32,-20,-11;
/M: SY='N';  M=-15,  9,-25,  4, -9,  2,-19, -9, -3,-14, -8, -8, 12,-20,-14,-15, -7, -7, -8,-24, -4,-12;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='E';  M= -7, -5,-25, -3, 14,-25,-23, -8,-12, 13,-15, -5, -8,-13, 13,  5, -5, -7, -7,-25,-12, 14;
/M: SY='H';  M=-13, -2,-23,  3, -7,-13,-22, 15, -6,-15,  2,  0, -7,-22, -9,-12,-13,-10, -2,-30, -2, -9;
/M: SY='E';  M=-12, 11,-33, 24, 35,-32,-18, -5,-30,  3,-25,-22, -1, 21,  8, -7, -3,-10,-30,-32,-23, 20;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='H';  M=-10, -5,-26, -3,  5,-23,-15, 24,-18, -3,-18, -5, -2, 15, 15, -3, -5,-10,-23,-21, -5,  7; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='G';  M=  0, -5,-16, -5,-10,-16, 37,-10,-21,-10,-16,-10,  0,-10,-10,-10,  0,-10,-16,-10,-16,-10; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='A';  M= 13, -3, -5, -8, -5, -8, -5,-10, -5, -5, -5, -5, -3, -5, -5, -8,  8, 13,  0,-13, -8, -5; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='A';  M= 11, -3,-10, -5,  0,-13, -5, -8,-10, 10,-10, -5, -3, -5,  0,  2,  0, -3, -5,-10, -8,  0; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='K';  M=  5, -3,-25, -5,  8,-30,-15, -7,-22, 24,-22, -7, -3,-10, 18, 12, -2, -7,-18,-20,-13, 13;
/M: SY='Y';  M=-17,-27,-32,-27,-22, 20,-28, -2,  1,-17,  8,  1,-27,-30,-15,-15,-27,-15, -9, 44, 48,-20;
/M: SY='G';  M=  2, -8,-25, -8,-15,-28, 54,-18,-35,-18,-30,-20,  2,-18,-15,-18,  9,-11,-25,-25,-28,-15;
/M: SY='G';  M= -8, -8,-30, -8, -7,-27, 24,-12,-35, 11,-27,-15,  0,-18, -5, 16, -5,-15,-25,-20,-20, -7;
/M: SY='F';  M=  5, -6,-15,-16,-17,  8,-15,-15,  0,-14, -6, -5,  1,-22,-19,-15, -2, -2,  5,-21, -6,-17;
/M: SY='F';  M=-17,-30,-23,-40,-30, 59,-33,-23, 13,-30, 13,  5,-20,-27,-35,-23,-20,-10,  8,  2, 22,-30;
/M: SY='K';  M= -5, -5,-27, -2,  5,-27,-15,-12,-25, 20,-30,-15, -2, 13,  3,  8,  3, -2,-20,-28,-17,  3;
/M: SY='V';  M= -3,-30,-15,-33,-30,  0,-33,-30, 35,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 45,-27, -7,-30;
/M: SY='K';  M=-15, 13,-30, 20, 21,-30,-17, -3,-33, 23,-25,-17,  5,-10, 10, 23, -5,-10,-25,-27,-15, 14;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='V';  M= -7,-23,-17,-23,-21, -2,-28,  2, 14,-20, 14, 10,-21,-28,-18,-15,-15, -7, 21,-27, -1,-21;
/M: SY='C';  M= -8,-19, 13,-25,-19,-13,-30,-25,  4, -6, -6, -1,-17,-25,-17,-12,-12, -8, 11,-30,-13,-19;
/M: SY='V';  M= -5,-22,-18,-22,-17, -5,-27,-22, 12, -5, 10,  8,-22,-25,-17, -7,-15, -5, 21,-25, -7,-17;
/M: SY='K';  M=-12, -8, 10,-10, -3,-25,-23,-13,-30, 24,-25,-13, -5,-20, -1, 24,-10,-10,-17,-28,-15, -3;
/M: SY='D';  M=-15, 29,-30, 44, 41,-35,-15,  0,-35,  5,-25,-25, 10, -5, 10, -5,  0,-10,-30,-35,-20, 26;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-25,-35,-25,  5,-35,-25, 34,-30, 36, 20,-25,-25,-20,-25,-25,-10, 20,-20,  0,-25;
/M: SY='P';  M= -5,  0,-27,  0,  0,-25,-10,-10,-20, -8,-30,-20,  8, 36, -5,-12,  8,  0,-25,-35,-25, -5;
/M: SY='F';  M=-15,  3,-20,-11,-16, 32,-16, -6,-10,-16, -9,-10, 18,-25,-21,-10, -6, -5,-14,-14,  6,-16;
/M: SY='H';  M=-15,-12,-29,-14, -9,-11,-20, 15,-23, -2,-17,-10, -6,-20, -2, 10, -9, -2,-20, 13,  7, -7;
/M: SY='S';  M=  0,  2,-20,  5, 16,-25,-10, -8,-25, 11,-28,-17,  5, -8,  7,  3, 18,  5,-17,-32,-17, 12;
/M: SY='T';  M= -5,-14,-15,-20,-15,  0,-25,-20,  4,-20, 19,  4,-14,-20,-15,-15, -4, 21,  5,-25, -5,-15;
/M: SY='R';  M=-10, -5,-25, -5,  2,-22,-15, -5,-27, 25,-25,-13,  3,-15,  7, 39,  3, -2,-17,-25,-13,  2;
/M: SY='H';  M=-17,  8,-27,  3,  0,-20,-15, 51,-27,  3,-23, -8, 21,-20,  7, 17, -5,-12,-28,-30,  2,  0;
/M: SY='L';  M=-12,-30,-22,-35,-25, 25,-32,-22, 22,-30, 33, 15,-25,-28,-25,-22,-25,-10, 12,-13,  7,-25;
/M: SY='Y';  M=-15,-22,-28,-24,-17,  5,-30, -7,  8, -9, 12,  7,-17,-25, -9,  4,-20,-10,  1, -7, 18,-17;
/M: SY='N';  M=-10,  7,-22, -6,-12, -8,-17, -7,  7,-14,  1, -1, 20,-22,-10,-12, -7, -5, -6,-30,-10,-12;
/M: SY='P';  M=  3, -2,-30,  5,  2,-30,-13,-15,-22, -8,-25,-20, -8, 42, -8,-18, -3, -7,-22,-30,-25, -5;
/M: SY='W';  M=-10, -7,-28,-11,-13,  1,-13, -3,-15,-10,-19,-15,  0,-23, -8,-10, -3, -5,-20, 28, 20,-10;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='E';  M=-13, 20,-30, 33, 50,-33,-17,  0,-33,  7,-23,-23,  5, -3, 15, -3,  0,-10,-30,-33,-20, 32;
/M: SY='D';  M=-15, 30,-25, 32,  5,-25,-10,  3,-20, -2,-18, -5, 21,-15,  0, -7, -2, -7,-20,-35,-15,  2;
/M: SY='K';  M=-10, -8,-27, -8,  2,-19,-23,-13,-17, 29, -9, -2, -8,-15,  2, 17,-15,-10,-12,-20, -7,  2;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='V';  M= -2,-30,-15,-32,-30,  0,-32,-30, 35,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 45,-28, -8,-30;
/M: SY='K';  M= -5,  0,-20, -5,  0,-20,-20,-15,-20, 21,-20,-10,  0,-10,  0, 11,  4, 19,-10,-25,-10,  0;
/M: SY='H';  M=-15,-16,-30,-21,-16,-10,-30, 32, 12,-20,  1, 10, -6,-20, -6,-16,-15,-15,  1,-25, 10,-16;
/M: SY='S';  M=  5, -3,-15, -5, -7,-20, 14,-15,-23,-13,-25,-18,  5,-13, -7,-13, 25, 16,-13,-33,-20, -7;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='C';  M= -3, -8, 19,-15,-18,-18,  1,-23,-23,-18,-18,-15, -5,-21,-18,-18,  7, 16,-10,-33,-20,-18;
/M: SY='Q';  M=-12,  0,-30,  0, 15,-35,-20, 30,-22,  5,-20,  0,  2,-12, 49,  8, -2,-12,-30,-22, -3, 31;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-27,-37,-27,  3,-37,-27, 42,-30, 28, 20,-23,-23,-20,-27,-23,-10, 25,-20,  0,-27;
/M: SY='E';  M=-10,  0,-32,  8, 34,-30,-20, -7,-28, 14,-25,-18, -5, 20, 10,  2, -5,-10,-28,-28,-20, 21;
/M: SY='P';  M=-12,-22,-33,-17,-10, -6,-25,-10, -6,-15, -4, -6,-22, 33,-12,-18,-17,-10,-16,-13,  4,-15;
/M: SY='K';  M=  0,  0,-20,  0,  5,-25,-10,-10,-25, 19,-30,-15,  5,-10,  5,  9, 16,  5,-15,-30,-15,  5;
/M: SY='V';  M= -5,-21,-20,-21,-10, -7,-30,-23, 21,-16,  6,  6,-21,-21,-16,-18,-10, -5, 27,-28,-10,-14;
/M: SY='G';  M= 13,-10,-25,-13,-17,-27, 52,-20,-32,-17,-25,-17, -3,-17,-17,-20,  3,-15,-22,-20,-27,-17;
/M: SY='E';  M=-10, -9,-28, -6, 19,-13,-27,-12,  1, -9,  6, -1,-12,-12,  1,-12,-12,-10, -6,-25,-10,  9;
/M: SY='Q';  M= -5,  3,-25,  5, 25,-32,-15,  2,-23,  5,-22,-10,  2, -7, 35,  2, 10, -3,-25,-28,-15, 30;
/M: SY='L';  M=-10,-28,-22,-32,-22,  5,-30,-18, 27,-25, 36, 29,-25,-25,-15,-20,-25,-10, 15,-20,  0,-20;
/M: SY='C';  M=  6,-22, 16,-30,-22, -8,-25,-25,  7,-25,  8,  2,-20,-25,-20,-25,-12, -7,  7,-28,-13,-22;
/M: SY='N';  M= -3,  7,-18,  2,  0,-20, -5, -2,-23,  3,-27,-17, 20,-15,  3, 13, 20,  7,-18,-35,-17,  0;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-22,-32,-22,  8,-32,-22, 27,-30, 43, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 15,-20,  0,-22;
/M: SY='F';  M=-17,-30,-20,-37,-27, 61,-30,-20,  5,-30, 21,  5,-23,-30,-35,-20,-23,-10,  3,  2, 22,-27;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_02 which contains 571'282 sequence entries.

Total number of hits	26 in 26 different sequences
Number of true positive hits	26 in 26 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	YTH
Version [info]	6

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

26 sequences

C3H45_ORYSJ (Q0DA50), CPSF_ARATH  (A9LNK9), ECT1_ARATH  (Q3MK94),

ECT2_ARATH  (Q9LJE5), ECT3_ARATH  (F4K1Z0), ECT4_ARATH  (A0A1P8AS03), 
MMI1_SCHPO  (O74958), MRB1_YEAST  (Q06390), YTDC1_DROME (Q9VZQ1), 
YTDC1_HUMAN (Q96MU7), YTDC1_MOUSE (E9Q5K9), YTDC1_RAT   (Q9QY02), 
YTDC2_HUMAN (Q9H6S0), YTDC2_MOUSE (B2RR83), YTDC2_PONAB (Q5R746), 
YTHD1_HUMAN (Q9BYJ9), YTHD1_MOUSE (P59326), YTHD2_BOVIN (Q0VCZ3), 
YTHD2_DANRE (E7F1H9), YTHD2_HUMAN (Q9Y5A9), YTHD2_MACFA (Q4R5D9), 
YTHD2_MOUSE (Q91YT7), YTHD3_HUMAN (Q7Z739), YTHD3_MOUSE (Q8BYK6), 
YTHD3_PONAB (Q5RFL8), YTHDF_DROME (Q9VBZ5)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

150 PDB

2MTV; 2YU6; 2YUD; 4R3H; 4R3I; 4RCI; 4RCJ; 4RCM; 4RDN; 4RDO; 4WQN; 5DNO; 5DNP; 5EIM; 5EIP; 5H8A; 5HFZ; 5O8M; 5ZUU; 6FPP; 6FPQ; 6FPX; 6K6U; 6LR2; 6RT4; 6RT5; 6RT6; 6RT7; 6SYZ; 6SZ1; 6SZ2; 6SZ3; 6SZL; 6SZN; 6SZR; 6SZT; 6SZX; 6SZY; 6T01; 6T02; 6T03; 6T04; 6T05; 6T06; 6T07; 6T08; 6T09; 6T0A; 6T0C; 6T0D; 6T0O; 6T0X; 6T0Z; 6T10; 6T11; 6T12; 6WE8; 6WE9; 6WEA; 6YKE; 6YKI; 6YKJ; 6YKZ; 6YL0; 6YL8; 6YL9; 6YM2; 6YM8; 6YNI; 6YNJ; 6YNK; 6YNL; 6YNM; 6YNN; 6YNO; 6YNP; 6YOQ; 6ZCM; 6ZCN; 6ZD9; 6ZOT; 7A1V; 7BIK; 7L4X; 7L4Y; 7P87; 7P88; 7P8A; 7P8B; 7P8F; 7PCU; 7PJ7; 7PJ8; 7PJ9; 7PJA; 7PJB; 7PJP; 7PJQ; 7PO6; 7QKN; 7QL7; 7R5F; 7R5L; 7R5W; 7YWB; 7YX6; 7YXE; 7YYE; 7YYF; 7YYJ; 7YZ8; 7Z26; 7Z4U; 7Z54; 7Z5M; 7Z7B; 7Z7F; 7Z8P; 7Z8W; 7Z8X; 7Z92; 7Z93; 7ZG4; 8Q2Q; 8Q2R; 8Q2S; 8Q2T; 8Q2U; 8Q2V; 8Q2W; 8Q2X; 8Q2Y; 8Q31; 8Q32; 8Q33; 8Q35; 8Q37; 8Q38; 8Q39; 8Q3A; 8Q3G; 8Q4M; 8Q4N; 8Q4P; 8Q4Q; 8Q4R; 8Q4T; 8Q4U; 8Q4V; 8Q4W
» more