 |
|
| Entry: PS50904 |
General information about the entry
| Entry name [info] | PRELI_MSF1 |
| Accession [info] | PS50904 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-APR-2003 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 22-APR-2020 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50904 |
| Associated ProRule [info] | PRU00158 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | PRELI/MSF1 domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=172; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=167; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4669; R2=0.01454465; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=415; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=278; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='M'; M= -1,-17,-18,-23,-17, -9,-12,-11, 8,-11, 4, 24,-16,-20, -5,-12, -8, -3, 10,-23, -9,-11; /M: SY='K'; M= -4, -7,-24, -7, 1,-22,-19,-13,-18, 27,-18, -7, -5,-14, 2, 17, -6, -6, -9,-23,-11, 1; /M: SY='I'; M= -5,-21,-23,-27,-21, 4,-29,-16, 19,-21, 15, 9,-18,-21,-16,-20,-13, 1, 11,-13, 11,-21; /M: SY='W'; M=-16,-25, -8,-29,-22, 13,-25,-11,-12,-19, -9, -8,-23,-29,-16,-16,-21,-16,-11, 33, 16,-17; /M: SY='D'; M= -7, 6,-22, 9, 7,-23,-14, -7,-22, 4,-18,-14, 4,-12, 5, 7, 8, 6,-16,-31,-14, 5; /M: SY='S'; M= 0, 1,-18, 1, -2,-22, -3,-11,-17, -9,-24,-15, 5, -4, -1,-10, 17, 8,-11,-34,-19, -2; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='E'; M= -8, 3,-15, 3, 19,-23,-19, 4,-20, 2,-19,-12, 2,-12, 8, -2, 1, -3,-17,-31,-14, 13; /M: SY='H'; M=-12, -2,-24, -5, -2,-16,-19, 39,-22, -4,-17, -5, 4,-17, 8, 4, 1, 2,-19,-25, 8, 0; /M: SY='V'; M= -4,-19,-18,-19,-17, -6,-27,-23, 20,-18, 6, 5,-19,-23,-19,-19, -8, -2, 27,-29,-10,-19; /M: SY='F'; M=-18,-28,-22,-35,-27, 60,-30,-13, 3,-26, 14, 3,-22,-30,-32,-18,-22,-10, 0, 9, 34,-27; /M: SY='D'; M=-12, 11,-30, 12, 7,-30, -8, -3,-27, 10,-28,-16, 12, 2, 9, 6, -2, -9,-27,-29,-18, 7; /M: SY='Y'; M=-11,-11,-25,-12,-11, 5,-22, 35,-12,-10,-10, -3, -7,-23, -3, -8, -7, -5,-14, -1, 41,-11; /M: SY='P'; M= -4, -6,-29, 1, 6,-28,-13,-14,-22, -8,-29,-21, -6, 45, -4,-15, 7, -1,-24,-34,-25, -2; /M: SY='W'; M=-20,-36,-38,-40,-30, 39,-24,-26,-12,-24, -8,-12,-32,-30,-28,-20,-32,-22,-18, 92, 30,-24; /M: SY='E'; M= -9, 20,-27, 28, 32,-29,-14, -1,-27, 3,-20,-16, 8, -7, 9, -5, 0, -9,-25,-32,-18, 20; /M: SY='Q'; M= -7, 0,-21, -3, 6,-21,-18, -5,-15, 0,-12, -6, 2,-13, 16, 3, 6, 10,-15,-27,-11, 11; /M: SY='V'; M= -1,-30,-12,-31,-30, 0,-31,-30, 32,-21, 11, 11,-29,-29,-29,-21,-11, -1, 48,-29, -9,-30; /M: SY='T'; M= 7,-13,-13,-19,-15, -4,-15,-18, 2,-15, -6, 0, -9,-17,-13,-16, 9, 10, 9,-27,-10,-14; /M: SY='A'; M= 22, -8,-16,-13, -3,-23, -8,-12,-12, -4,-14, -8, -6,-12, 6, -6, 10, 0, -5,-24,-16, 1; /M: SY='A'; M= 44,-11, 3,-21,-12,-20, -3,-21,-12,-12,-11,-11,-11,-13,-12,-21, 8, -1, -1,-23,-21,-12; /M: SY='F'; M= -3,-16,-22,-23,-18, 24,-18, -3, -8,-17, -6, -7,-10,-23,-18,-15, -8, -7, -9, 8, 21,-17; /M: SY='W'; M=-17,-30,-36,-32,-19, 15,-23,-22, -8,-20, 0, -4,-30,-26,-17,-17,-30,-20,-16, 70, 18,-15; /M: SY='R'; M=-15, 5,-27, 3, 4,-24,-16, 1,-26, 18,-22,-12, 11,-16, 13, 36, -2, -4,-22,-25,-12, 6; /M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5, 5,-25,-20, -5,-30, 40,-25,-10, 0,-15, 10, 49,-10,-10,-20,-20,-10, 5; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22, 39,-30, 13, 0,-14, 2, 0,-20,-30,-15,-12,-20,-10, -8, 26, 71,-22; /M: SY='P'; M= -5,-19,-38,-11, -1,-29,-18,-20,-19,-10,-28,-19,-19, 82,-10,-20, -8, -9,-28,-29,-29,-10; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='N'; M=-11, 35, -7, 19, -1,-22, -4, 5,-23, -3,-29,-21, 49,-21, -3, -4, 7, -2,-28,-41,-21, -2; /M: SY='P'; M= -8,-14,-36, -5, 8,-29,-18,-17,-21, -7,-29,-20,-15, 70, -5,-17, -5, -8,-28,-31,-28, -3; /M: SY='Y'; M=-12,-15,-24,-18,-10, 2,-24, 13, 3,-13, 8, 15,-13,-22, -4,-11,-14, -9, -4,-13, 18, -9; /M: SY='S'; M= 6, 10,-16, 4, -3,-19, -6, -8,-13, -9,-21,-15, 16,-13, -4,-11, 18, 8,-11,-35,-17, -4; /M: SY='P'; M= -9, -9,-28, -8, 0,-22,-21,-15,-19, 12,-19,-11, -8, 18, -3, 6, -5, 2,-17,-25,-15, -3; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='H'; M=-12, 2,-24, -1, -2,-18,-14, 59,-22, -9,-19, 0, 12,-18, 6, -3, 1, -9,-22,-32, 6, -1; /M: SY='V'; M= -5,-30,-17,-34,-30, 8,-33,-29, 33,-24, 13, 12,-26,-27,-28,-23,-14, -4, 39,-23, -3,-30; /M: SY='I'; M= -8,-28,-21,-32,-25, 3,-33,-25, 31,-27, 28, 16,-24,-25,-21,-23,-19, -4, 24,-22, -2,-25; /M: SY='S'; M= 9, -4,-18, -6, -4,-22, 17,-15,-24,-11,-23,-17, 2,-12, -7,-14, 18, 7,-15,-29,-21, -6; /M: SY='V'; M= 1,-14,-18,-15, -3,-11,-23,-20, 8,-12, -2, -1,-14,-17,-11,-15, -1, 1, 15,-29,-13, -8; /M: SY='D'; M=-19, 45,-30, 63, 19,-39,-11, -1,-39, 5,-30,-28, 18,-10, 1, -6, -1,-10,-29,-38,-19, 10; /M: SY='T'; M= -1,-15,-12,-21,-20, -5,-26,-25, 12,-16, 1, 1,-14,-19,-19,-16, 4, 24, 24,-29, -9,-20; /M: SY='I'; M= -6,-30,-17,-32,-26, 4,-32,-26, 29,-26, 29, 16,-28,-28,-24,-22,-20, -6, 29,-24, -4,-26; /M: SY='E'; M= -9, 9,-26, 12, 24,-28,-14, 8,-27, 8,-24,-15, 9, -9, 18, 6, 5, -5,-25,-30,-14, 20; /M: SY='R'; M=-17, -5,-30, -3, 13,-23,-20, 1,-29, 25,-20,-11, 0,-15, 16, 52, -7,-10,-23,-22,-12, 11; /M: SY='K'; M=-12, -1,-27, -2, 12,-12,-20, -3,-22, 15,-18,-10, 1,-13, 8, 14, -5, -5,-20,-18, -2, 9; /M: SY='V'; M= -5,-24,-18,-25,-20, -4,-29,-24, 18, -9, 12, 9,-23,-25,-19,-11,-15, -5, 26,-25, -7,-20; /M: SY='D'; M=-11, 16,-23, 24, 8,-25,-15, -8,-23, 1,-18,-17, 5,-13, -2, -2, 3, 3,-15,-33,-15, 3; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='D'; M= -8, 10,-20, 16, 15,-22, -5, -4,-21, 0,-17,-14, 3, 2, 5, -5, 1, -3,-19,-22,-14, 10; D=-14; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='D'; M= -6, 16,-24, 19, 9,-27, 0, -8,-29, -2,-23,-20, 9,-12, -2, -4, 4, 0,-22,-31,-19, 3; /M: SY='G'; M= 3, -4,-27, -7,-12,-29, 45,-15,-33,-11,-27,-17, 4,-18, -9,-13, 1,-15,-26,-22,-25,-11; /M: SY='K'; M= -9,-10,-23,-13, -8,-14,-23,-15, -4, 10, -7, -1, -6,-19, -6, 10, -9, -2, 2,-24, -9, -8; /M: SY='L'; M=-11,-27,-24,-30,-21, 5,-32,-11, 23,-28, 36, 18,-24,-26,-17,-21,-26,-11, 11,-21, 2,-21; /M: SY='Y'; M=-14,-20,-23,-21,-18, 9,-27, 14, 2,-14, 5, 5,-16,-27,-13, -7,-16,-10, 4,-10, 23,-18; /M: SY='T'; M= -1, -4,-14,-11, -9,-12,-17,-17, -8, -8,-13, -9, 0,-12, -7, -4, 18, 31, -1,-30,-11, -9; /M: SY='E'; M=-11, 0,-26, 2, 21,-22,-21, -1,-23, 13,-15,-11, -2,-10, 8, 13, -3, -1,-19,-26,-11, 14; /M: SY='R'; M=-19, -9,-30, -9, 1,-21,-20, -1,-30, 32,-21,-10, 0,-19, 10, 67,-10,-10,-20,-20,-10, 1; /M: SY='L'; M= -6,-26,-22,-29,-19, 3,-28,-20, 18,-22, 33, 15,-24,-26,-16,-13,-23, -9, 10,-20, -3,-19; /M: SY='L'; M= -4,-27, -8,-32,-23, 1,-30,-24, 21,-27, 26, 13,-24,-26,-21,-24,-20, -8, 15,-24, -5,-23; /M: SY='T'; M= -2, -8,-18,-12, -6,-16,-20,-15, -4, -1,-12, -4, -5,-14, 0, -4, 7, 13, 2,-28,-11, -4; /M: SY='K'; M= -6,-11, 1,-14, -8,-17,-22,-18,-12, 6,-12, -6, -8,-19, -7, -1, -4, -1, -4,-29,-13, -8; /M: SY='H'; M=-10, 6,-25, 7, 11,-28,-18, 19,-25, 5,-21, -9, 5,-11, 19, 3, 3, -1,-23,-28, -6, 14; /M: SY='G'; M= -4, -3,-26,-10,-12,-12, 6,-11,-17,-11,-19,-12, 5,-21, -6,-11, -4,-11,-18, -1,-10, -8; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='R'; M= -6, -7,-27, -4, -5,-21, -5,-10,-21, 2,-21,-13, -5, -1, -5, 7, -3, -8,-15,-23,-13, -7; /M: SY='V'; M= -1,-26,-17,-29,-24, 3,-19,-22, 16,-22, 18, 12,-24,-26,-22,-20,-15, -7, 20,-21, -6,-23; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='R'; M=-11, -6,-27, -6, 5,-20,-17, -7,-26, 19,-23,-13, -2,-15, 6, 30, -2, -3,-19,-11, -9, 4; /M: SY='W'; M=-17,-36,-40,-38,-28, 15,-24,-27, -5,-24, -2, -8,-35,-29,-22,-21,-35,-23,-15, 93, 22,-22; /M: SY='I'; M= 6,-22,-19,-27,-21, -5,-17,-24, 15,-22, 14, 7,-19,-21,-19,-22,-11, -4, 14,-22, -9,-21; /M: SY='R'; M= -4, -5,-22, -6, 2,-19,-16, 6,-19, 7,-15, -4, -1,-14, 4, 11, 1, -1,-14,-26, -8, 1; /M: SY='R'; M= -6, -3,-27, -3, 2,-24,-17, -7,-24, 24,-21, -8, -3, -7, 4, 27, -7, -9,-17,-22,-13, 1; /M: SY='L'; M=-11,-29,-22,-34,-25, 16,-31,-21, 26,-26, 28, 22,-24,-26,-21,-21,-23, -9, 17,-16, 4,-24; /M: SY='L'; M= -2,-20,-19,-25,-18, 6,-25,-18, 11,-21, 14, 5,-16,-21,-16,-19, -8, 3, 7,-17, 3,-18; /M: SY='G'; M= -8, 4,-29, 4, -9,-26, 23,-12,-26,-11,-24,-17, 9,-10,-11,-10, -2,-13,-23,-27,-23,-11; /M: SY='V'; M= -1,-13,-20,-18,-16, -7, -4,-18, -2,-16, -3, -2, -7,-21,-13,-15, -4, -1, 1,-22,-11,-15; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='S'; M= 5, 0,-10, -4, -3,-11, -6, -8, -6, -1,-10, -6, 3, -7, -2, -4, 7, 4, -4,-17, -9, -3; D=-13; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='B'; M=-10, 10,-25, 10, 2,-26,-10, 1,-21, -2,-22,-13, 9, -5, 4, -5, 1, 0,-19,-30,-14, 2; /M: SY='T'; M= -9, -3,-24, -1, -3,-12,-21,-10, -6, -6, -7, -4, -7, -8, -6,-10, -4, 1, -5,-24, -4, -6; /M: SY='V'; M= -2,-17, 13,-22,-19,-11,-25,-23, 3,-18, -6, -3,-15,-24,-15,-18, 1, 6, 14,-34,-15,-18; /M: SY='Y'; M=-17,-16,-32,-15,-10, 8,-25, 19,-12, -5,-11, -4,-14,-15, -1, -6,-16,-13,-18, 15, 40, -9; /M: SY='I'; M= -4,-26, -9,-32,-26, 5,-30,-26, 23,-25, 11, 8,-20,-25,-23,-24,-12, -5, 22,-23, -4,-26; /M: SY='V'; M= -9,-18,-22,-19,-10, -8,-26, -9, 6, -9, 4, 4,-14,-22, -9, 1,-11, -6, 9,-25, -6,-12; /M: SY='E'; M=-10, 9,-30, 18, 56,-31,-20, 1,-29, 10,-20,-18, 0, -1, 24, 1, 0,-10,-30,-29,-19, 40; /M: SY='E'; M=-11, 3,-24, 7, 9,-19,-19, 2,-19, 5,-17,-12, -1,-15, 1, 6, -1, -3,-12,-26, -5, 4; /M: SY='S'; M= 6, 4,-11, 0, -2,-18, -3,-10,-18, -9,-27,-18, 13,-11, -2, -9, 34, 23,-10,-38,-18, -2; /M: SY='V'; M= -3,-26,-17,-27,-25, 0,-26,-24, 17,-19, 2, 3,-24,-26,-23,-19, -8, 1, 28, -9, -1,-24; /M: SY='V'; M= -6,-29,-17,-31,-26, 5,-32,-23, 28,-23, 22, 13,-28,-28,-24,-21,-18, -5, 31,-21, 2,-26; /M: SY='D'; M=-15, 43,-26, 55, 15,-35, -7, 1,-35, -1,-30,-27, 26,-12, 0, -8, 6, -5,-28,-40,-20, 7; /M: SY='P'; M= -7,-18,-31,-13, -5,-20,-13,-18,-13,-10,-12,-10,-16, 36,-10,-15, -9, -8,-18,-27,-21,-10; /M: SY='K'; M= -2, -6,-20, -8, 0,-20,-18,-10,-10, 6,-14, -6, -3,-16, 6, 5, 1, 0, -3,-27,-13, 2; /M: SY='K'; M= -4, 6,-24, 4, 13,-25,-12, -5,-26, 19,-26,-15, 10,-11, 7, 16, 4, -3,-20,-28,-16, 9; /M: SY='R'; M=-12, -3,-29, -3, 7,-27,-19, -4,-28, 33,-25, -9, 1,-13, 17, 38, -5, -8,-21,-21,-11, 10; /M: SY='T'; M= -3, 5,-18, 1, 8,-20,-15, -9,-19, 5,-20,-13, 7, -9, 4, 0, 13, 19,-14,-30,-14, 6; /M: SY='M'; M=-12,-25,-20,-32,-22, 16,-25,-11, 17,-21, 30, 35,-24,-25,-14,-15,-24,-10, 8,-15, 5,-17; /M: SY='T'; M= 1, -4,-18, -8, 0,-18,-18, -3,-12, 1,-14, -7, -3,-13, 1, -3, 6, 11, -4,-27,-10, 0; /M: SY='L'; M= -5,-18,-18,-23,-17, -1,-26,-20, 13,-21, 17, 10,-15,-20,-14,-17, -6, 11, 9,-25, -5,-17; /M: SY='Y'; M=-13,-11,-14,-13, -2, 4,-24, -7,-14, -2, -7, -7,-10,-20, -7, 3, -8, -1,-11,-13, 8, -5; /M: SY='T'; M= 7, -1,-10, -9, -8,-13,-13,-18,-12,-10,-15,-12, 1,-10, -8,-11, 24, 38, -2,-31,-13, -8; /M: SY='R'; M=-15, -9,-18,-13, -8, -5,-20, 4,-21, 4,-17,-10, -3,-22, -3, 17, -7, -6,-17, -6, 5, -8; /M: SY='N'; M=-10, 34, -6, 15, -3,-20, -3, 6,-21, -3,-29,-20, 52,-22, -3, -3, 8, -1,-28,-41,-21, -3; /M: SY='L'; M= -9,-26,-22,-27,-15, 3,-31,-21, 23,-25, 33, 15,-25,-25,-17,-20,-23, -9, 14,-22, -3,-17; /M: SY='T'; M= -3, 13,-16, 8, -3,-19, -5,-11,-20, -8,-21,-17, 14,-12, -6, -9, 17, 23,-13,-34,-16, -5; /M: SY='H'; M=-16,-19,-27,-22,-17, 12,-17, 19, -8,-19, 3, 8,-13,-25,-12,-12,-19,-16,-11, 0, 14,-15; /M: SY='T'; M= 3, -8, 3,-14,-12,-14,-17,-20, -8,-10,-14,-10, -5,-16,-11,-12, 12, 18, 1,-32,-15,-12; /M: SY='N'; M= -8, 11,-25, 7, 4,-26, -5, -2,-26, 14,-28,-15, 17,-14, 8, 14, 5, -4,-23,-29,-16, 5; /M: SY='L'; M=-14,-22,-25,-27,-19, 14,-29,-13, 11,-17, 16, 8,-15,-26,-16, -5,-20, -9, 4,-12, 10,-19; /M: SY='L'; M= -3,-26,-19,-31,-23, 7,-26,-19, 21,-22, 23, 23,-24,-24,-18,-19,-18, -7, 18,-19, -1,-21; /M: SY='R'; M= -7, -7,-24, -7, 3,-21,-18, -9,-14, 12,-18, -8, -2,-14, 7, 16, 2, -2, -9,-26,-12, 3; /M: SY='V'; M= -3,-29,-14,-31,-28, 1,-30,-26, 30,-21, 15, 17,-28,-28,-25,-20,-14, -3, 41,-27, -7,-27; /M: SY='D'; M=-15, 18,-28, 22, 16,-23,-16, 9,-23, 1,-20,-16, 14,-13, 4, 1, -3, -9,-23,-29, -8, 8; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='R'; M=-14, -9,-26,-10, -2,-10,-24, 5,-13, 7,-12, -5, -5,-18, 1, 18, -7, -3,-10,-16, 6, -4; /M: SY='C'; M= -4,-20, 20,-24,-21, -7,-25,-24, 2,-23, 3, -2,-17,-27,-20,-21, -4, 2, 11,-34,-14,-21; /M: SY='V'; M= -6,-17, -3,-22,-19, -6,-26,-20, 4,-11, -3, -1,-15,-23,-16, -4, -3, 10, 14,-26, -6,-19; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-22, 39,-30, 13, 0,-13, 2, 0,-20,-30,-15,-12,-20,-10, -8, 27, 71,-22; /M: SY='T'; M= -5, 0, -9, -2, 0,-20,-17,-12,-17, -1,-18,-12, 1,-13, 1, 0, 9, 11,-10,-31,-14, 0; /M: SY='P'; M= -7,-14,-28, -9, 5,-17,-21,-15,-12, -8,-18,-12,-14, 28, -4,-13, -4, -6,-12,-27,-18, -1; /M: SY='H'; M= -6, 6,-23, 5, 2,-23,-11, 42,-25, -7,-23,-10, 12,-15, 8, -4, 7, -5,-23,-33, -2, 3; /M: SY='P'; M= -5,-11,-28, -6, 3,-24,-16, -8,-17, -5,-25,-15, -9, 32, -4,-11, 2, -3,-17,-31,-20, -3; /M: SY='E'; M= -8, 23,-27, 35, 36,-33,-14, -2,-32, 4,-24,-23, 8, -5, 9, -6, 3, -8,-27,-34,-20, 23; /M: SY='N'; M=-10, 31,-22, 22, 0,-22, 0, 2,-22, -4,-23,-19, 37,-18, -4, -6, 5, -1,-25,-36,-19, -2; /M: SY='P'; M= -1, -7,-15, -3, 9,-27,-14,-12,-22, -7,-26,-18, -6, 22, 2,-12, 8, -1,-21,-33,-23, 4; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='S'; M= 4, 10,-18, 8, 5,-24, 1, -4,-21, -4,-23,-16, 14,-11, 4, -7, 15, 2,-18,-30,-18, 4; D=-10; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='W'; M= -7,-11,-26,-13, -8, -8,-13, -3,-15, 3,-15, -5, -8,-16, -3, -2,-14,-13,-16, 29, 5, -5; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='V'; M= -9,-15, -9,-15, -8, -8,-29,-20, 10,-18, 9, 3,-17,-22,-15,-19,-14, -8, 11,-29,-10,-12; /M: SY='F'; M= -3,-26, -6,-33,-25, 23,-26,-23, 9,-25, 14, 4,-22,-27,-27,-22,-15, -7, 12,-14, 3,-25; /M: SY='E'; M= -9, 1,-24, 3, 5,-21,-20, -2,-11, 0,-11, -6, -2,-14, 5, -4, -3, -3, -9,-28, -9, 4; /M: SY='Q'; M=-10, -2,-27, -3, 11,-31,-19, 4,-22, 12,-20, -5, 1,-12, 38, 21, 2, -3,-24,-22,-11, 24; /M: SY='E'; M= -8, 4,-24, 8, 23,-23,-17, -6,-21, 4,-18,-15, 2, -8, 7, 5, 6, 1,-17,-30,-16, 14; /M: SY='A'; M= 30,-14,-12,-20,-16,-16, -2,-22, -4,-13, -7, -6,-13,-16,-16,-19, 5, 2, 8,-23,-18,-16; /M: SY='R'; M= -8,-11,-25,-14, -7,-12,-20,-11,-10, 3,-14, -7, -6,-16, 0, 7, -1, 2, -9, -8, 0, -5; /M: SY='I'; M= -9,-30,-22,-36,-29, 13,-35,-28, 34,-27, 19, 14,-24,-25,-26,-25,-18, -7, 29,-18, 2,-29; /M: SY='S'; M= 0, 2,-15, 2, 1,-18,-12,-12,-17, -5,-20,-15, 4,-12, -3, -4, 20, 19, -7,-34,-16, -1; /M: SY='I'; M= 5,-18,-19,-24,-18, -9,-21,-23, 18,-20, 0, 3,-11,-17,-14,-21, 4, 2, 17,-27,-10,-18; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='K'; M= -6, -7,-19, -9, -5, -7,-11,-10,-12, 4,-10, -6, -6, -4, -6, 0, -4, 2,-10,-13, -2, -6; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='S'; M= 1, -3, -6, -4, -5,-11, -2,-10,-15,-11,-12,-10, -2,-14, -4,-11, 6, -1,-10,-22,-12, -4; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='L'; M= -4,-17, -9,-23,-19, 0,-11,-17, -1,-18, 6, 3,-12,-25,-18,-12,-12, -9, 0,-22, -8,-19; /M: SY='F'; M= -7,-20,-24,-25,-19, 14, -8,-18, -6,-14, -5, -1,-14,-14,-20,-11,-11,-10, -4,-11, -1,-19; /M: SY='G'; M= -1,-10,-25,-11,-11,-16, 20,-15,-28, -6,-23,-15, -2,-12,-11, -2, 2, -9,-20,-21,-18,-12; /M: SY='L'; M=-12,-28,-20,-33,-24, 24,-29,-18, 18,-26, 30, 21,-25,-28,-22,-19,-24, -9, 12,-13, 7,-22; /M: SY='S'; M= 8, 1, -9, -3, 0,-23, 5,-11,-24, -6,-25,-18, 7,-13, -4,-10, 16, 2,-16,-32,-21, -2; /M: SY='N'; M= -7, 5, -8, 4, 3,-22,-11, 1,-26, 1,-25,-17, 11,-16, 2, 9, 11, 1,-19,-35,-16, 1; /M: SY='Y'; M= -2,-14,-23,-17,-11, -5,-22,-10, -3, 2, -5, -1,-12,-19, -7, 0, -8, -2, 0,-12, 9,-11; /M: SY='V'; M= -7,-27, -8,-31,-26, 3,-30,-20, 23,-22, 17, 16,-26,-28,-21,-20,-17, -6, 26,-22, 0,-25; /M: SY='E'; M=-11, 7,-30, 15, 49,-31,-20, 2,-28, 12,-20,-16, 0, -3, 25, 7, -1,-10,-29,-28,-18, 37; /M: SY='K'; M= -5, 10,-25, 13, 13,-30,-15, -6,-26, 16,-24,-14, 4, -9, 12, 6, 2, -1,-20,-27,-14, 12; /M: SY='W'; M=-14,-27,-27,-31,-23, 23,-27,-20, 3,-18, 5, 0,-23,-26,-22,-15,-21, -9, 0, 24, 17,-21; /M: SY='A'; M= 8,-13, -5,-17,-14, -9, 1,-17,-12,-17, -7, -5, -8,-19,-13,-17, 5, -1, -6,-26,-14,-13; /M: SY='L'; M= 2,-20,-17,-24,-17, -4,-21,-18, 10,-16, 14, 10,-17,-21,-13,-12, -8, -1, 10,-24, -8,-16; /M: SY='E'; M= -2, 5,-21, 3, 10,-23,-14, -7,-19, 6,-19, -8, 5,-10, 6, 0, 7, 6,-15,-29,-14, 8; /M: SY='R'; M=-11,-10,-26,-13, -6,-12, -9,-10,-19, 8,-16, -7, -3,-17, 1, 18, -5, -4,-14,-18, -8, -4; /M: SY='F'; M=-18,-28,-23,-36,-27, 54,-31,-14, 9,-27, 14, 5,-21,-29,-30,-20,-21,-10, 3, 7, 32,-27; /M: SY='K'; M= -6, -1,-13, -2, 0,-23,-10, -9,-23, 9,-22, -8, 1,-14, 4, 7, 5, 1,-15,-28,-15, 1; /M: SY='Q'; M= 0, 1,-22, 2, 18,-28,-13, -4,-22, 8,-23,-12, 2, -8, 19, 2, 10, 2,-19,-28,-15, 19; /M: SY='N'; M= -7, 26,-22, 13, 0,-23, 4, 4,-23, 1,-29,-18, 42,-18, 3, 0, 9, -2,-28,-35,-20, 2; /M: SY='A'; M= 20,-17,-16,-23,-17,-12, -9,-22, 6,-17, 0, -1,-14,-17,-16,-21, 0, -3, 10,-23,-14,-17; /M: SY='N'; M= -1, 8,-22, 2, 2,-25, -6, -6,-23, 12,-26,-13, 15,-13, 6, 5, 7, 1,-19,-28,-16, 4; /M: SY='K'; M= -9, 3,-28, 1, 8,-28,-17, -8,-28, 40,-29,-12, 6,-11, 8, 27, -4, -7,-20,-23,-12, 8; /M: SY='G'; M= 5, -7,-22, -9,-15,-25, 40,-19,-30,-16,-25,-18, 1,-16,-15,-17, 10, -1,-20,-25,-25,-15; /M: SY='R'; M=-12,-11,-27,-14, -5,-16,-20,-10,-15, 15,-15, -3, -6,-17, 2, 25, -8, -4,-11,-10, -6, -4; /M: SY='E'; M= -7, 0,-26, -1, 15,-24,-17, -1,-20, 15,-16, -2, 1,-11, 15, 15, -5, -8,-19,-24,-13, 14; /M: SY='G'; M= 2,-16,-27,-18,-22,-21, 35,-23,-14,-21,-15, -9, -7,-20,-20,-22, -4,-15,-10,-21,-22,-22; /M: SY='F'; M=-12,-27,-21,-35,-25, 25,-29,-17, 20,-24, 23, 24,-23,-26,-21,-19,-21, -9, 14,-12, 8,-23; /M: SY='E'; M= -7, 7,-26, 12, 34,-17,-18, -4,-22, 1,-13,-15, 1, -8, 7, -5, -2, -8,-22,-27,-14, 21; /M: SY='W'; M=-12,-20,-30,-21,-13, 11,-21, -3, -9, -9, -7, -3,-18,-23, -9, -6,-16,-12,-13, 32, 30,-11; /M: SY='V'; M= -6,-27,-19,-29,-25, 1,-31,-22, 26,-17, 12, 11,-24,-26,-21,-17,-15, -5, 30,-20, 2,-25; /M: SY='L'; M=-10,-29,-12,-34,-24, 4,-34,-24, 27,-30, 34, 17,-26,-27,-21,-24,-25,-10, 15,-22, -2,-24; /M: SY='E'; M= -7, 3,-28, 6, 19,-30,-12, -2,-28, 17,-22,-12, 1,-10, 19, 16, -3,-10,-24,-24,-15, 18; /M: SY='Q'; M=-12, -4,-28, -2, 12,-20,-22, 13,-19, 11,-14, -5, -4,-15, 15, 10, -8,-11,-18,-20, 0, 12; /M: SY='M'; M=-10,-19,-23,-23,-13, -1,-25,-12, 7,-10, 14, 15,-16,-21, -4, -5,-15, -8, 2,-20, -2, -9; /M: SY='E'; M=-11, -1,-10, -3, 12, -2,-20, -7,-20, -3,-15,-13, 1,-16, -1, -5, -3, -7,-19,-23, -8, 7; /M: SY='E'; M= 0, -4,-26, -3, 9,-26, 6,-10,-24, -2,-21,-11, -3, -3, 3, -7, 2, -6,-21,-25,-20, 5; /M: SY='E'; M= 2, 5,-22, 8, 21,-25,-13, -8,-20, -2,-20,-17, 2, -1, 3, -9, 7, -2,-16,-32,-20, 12; /M: SY='S'; M= 0,-14,-22,-14,-11,-13, -8,-15,-11, -6,-17,-10,-10, -9,-10, -6, 2, -2, -4,-13, -8,-12; /M: M= -4, -5,-23, -9, 0, -8,-18,-12, -5, -9, -3, -5, -1, -8, -7,-11, -5, -5, -9,-25,-11, -4; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 35 in 35 different sequences |
| Number of true positive hits | 35 in 35 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | PRELI/MSF1 |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
35 sequences
PLD3A_HUMAN (Q96N28 ), PLD3A_MOUSE (Q8VE85 ), PLD3A_XENLA (Q6GM21 ), PLD3B_BOVIN (Q58DB0 ), PLD3B_CRIGR (Q6TMK8 ), PLD3B_HUMAN (Q9Y3B1 ), PLD3B_MACFA (Q4R5S9 ), PLD3B_MOUSE (Q9CYY7 ), PLD3B_PIG (A5GFX0 ), PLD3B_RAT (Q6P9U4 ), PREL_DROME (Q9V579 ), PRLD1_BOVIN (Q32KN9 ), PRLD1_CHICK (Q90673 ), PRLD1_HUMAN (Q9Y255 ), PRLD1_MOUSE (Q8R107 ), PRLD2_HUMAN (Q8N945 ), PRLD2_MOUSE (Q0VBB0 ), PRLD2_XENLA (Q6NTS7 ), PRLD2_XENTR (Q5BKH5 ), RETM_AEDAE (Q16KN5 ), RETM_ANOGA (Q7PWB1 ), RETM_DROME (Q9VMD6 ), RETM_DROPS (Q29JQ0 ), S14L1_HUMAN (Q92503 ), S14L1_MOUSE (A8Y5H7 ), S14L5_HUMAN (O43304 ), S14L5_XENTR (Q0V9N0 ), SLMO_DICDI (Q54G07 ), SLMO_DROME (Q9V3U9 ), UPS1_SCHPO (Q9UT07 ), UPS1_YEAST (Q05776 ), UPS2_SCHPO (O59707 ), UPS2_YEAST (P35200 ), UPS3_YEAST (Q04006 ), YN02_CAEEL (Q03606 )» more
|
| PDB [Detailed view] |
11 PDB
4XHR; 4XIZ; 4XZV; 4YTW; 4YTX; 5JQL; 5JQM; 6I3V; 6I3Y; 6I4Y; 6KYL |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission