PROSITE entry PS50990

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	PEPTIDASE_C39
Accession [info]	PS50990
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-MAY-2004 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50990
Associated ProRule [info]	PRU00362

Name and characterization of the entry

Description [info]

Peptidase family C39 domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=121;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=116;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=6.5794134; R2=0.0133220; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6752.6582031; R2=2.4905064; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=250; H_SCORE=7375; N_SCORE=9.9; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=-5; H_SCORE=6740; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B0=-1000; B1=-1000; E0=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='Q';  M=-11,  0,-28, -1, 11,-28,-17,  6,-17,  7,-16,  1,  2,-12, 32, 10, -3, -9,-22,-23,-10, 21;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='A';  M=  4, -7,-17,-10, -5,-14, -9, -9, -9, -8, -7, -3, -5,-13, -6, -9, -1, -1, -5,-24,-12, -6; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='E';  M= -2, 11,-20, 11, 12,-24, -9, -3,-21,  2,-21,-14, 10,-10,  8,  0, 10,  2,-18,-30,-16, 10; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='N';  M= -2,  0,-22, -3,  3,-19, -8,  1,-13, -4,-15, -8,  4, -7,  2, -7,  1, -5,-14,-25,-12,  1; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='T';  M= -2, -3,-19, -6, -3,-14,-14, -6, -8, -5, -8, -5, -1,-11, -2, -5, -1,  2, -6,-22, -9, -3; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='D';  M=-12, 26,-25, 36, 20,-29, -7,  2,-29,  0,-22,-21, 14, -9,  3, -6,  1, -7,-25,-32,-16, 11; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='C';  M= -4,-13, 31,-16,-13,-18,-17,-15,-19,-16,-16,-13,-10,-11,-12,-17, -2, -4,-12,-30,-18,-13; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='G';  M=  1,-14,-25,-15,-16,-16, 25,-19,-21,-18,-12,-11,-10,-16,-16,-18, -6,-12,-17, -2,-15,-16; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='L';  M= -2,-26,-19,-28,-20,  5,-26,-21, 17,-24, 29, 14,-25,-22,-19,-19,-20, -7, 13,-20, -4,-20; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='A';  M= 15, -4, -3, -8, -1,-19,-12,-14,-13, -9,-11,-11, -5,-14, -5,-14,  3, -2, -6,-27,-16, -3; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='C';  M=  6,-16, 49,-22,-20,-17,-15,-24,-17,-21,-14,-13,-14,-25,-21,-23,  0, -3, -3,-36,-23,-21; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='L';  M= -8,-27,-18,-31,-22, 10,-30,-20, 22,-26, 30, 17,-24,-26,-19,-21,-22, -8, 13,-17,  3,-22; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='A';  M=  4,-13,-13,-17,-10,-11,-17,-14, -2,-11, -3, -2,-10,-18, -6,-10,  1,  1,  2,-25,-10, -9;
/M: SY='M';  M= -6,-17,-19,-23,-15, -1,-20, -5,  7,-12,  9, 23,-15,-20, -4,-10,-10, -4,  2,-16,  2,-10;
/M: SY='I';  M= -1,-26,-21,-31,-23,  2,-29,-21, 25,-25, 25, 16,-23,-24,-19,-22,-18, -8, 19,-21, -3,-22;
/M: SY='A';  M= 15,-15, -5,-21,-15, -8,-12,-17, -4,-17,  3, -2,-14,-19,-14,-19, -1,  0,  0,-23,-10,-15;
/M: SY='R';  M=-10,  3,-26,  0,  2,-23,-10,  2,-24, 12,-22,-10,  9,-16, 10, 19, -1, -6,-21,-24,-10,  4;
/M: SY='Y';  M=-15,-13,-21,-15,-12,  8,-24, 20, -7,-12, -2,  0,-10,-25, -5, -9,-14,-10,-12, -4, 31,-11;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='Y';  M=-18,-19,-26,-21,-17, 25,-25, 22, -6,-18,  4,  3,-13,-27,-14,-12,-18,-12,-10,  1, 36,-17;
/M: SY='G';  M= -7,  3,-28,  1, -7,-27, 27, -5,-31, -6,-24,-15,  9,-18, -6, -5, -2,-14,-26,-25,-20, -7;
/M: SY='I';  M= -9,-15,-20,-19,-14, -5,-25,-11,  7, -9,  4,  4,-10,-22,-11, -6,-12, -5,  5,-22, -1,-14;
/M: SY='P';  M=  2,  0,-25,  0,  4,-24,-13, -9,-21,  3,-23,-15, -1,  8,  1, -4,  3, -1,-18,-24,-16,  2;
/M: SY='V';  M= -1,-21,-12,-26,-20,  7,-23,-20, 11,-20,  8,  4,-17,-23,-20,-19, -9, -3, 13,-19, -1,-20;
/M: SY='S';  M= -2,  8,-20,  8,  2,-22, -6, -7,-23, -4,-25,-18, 10, -5, -2, -3, 14,  7,-17,-31,-18, -1;
/M: SY='P';  M= -5,-16,-26,-15, -7,-14,-22,-14, -3, -6, -2, -2,-14,  3, -7, -4,-11, -7, -4,-24,-11,-10;
/M: SY='E';  M= -5,  9,-24, 12, 17,-22,-12, -3,-22, -1,-19,-15,  4, -8,  4, -6,  3, -3,-19,-28,-14, 10;
/M: SY='E';  M= -5, -2,-22, -2,  8,-19,-18, -6,-15,  3,-14, -8, -3,-13,  8,  1,  0, -2,-12,-22, -8,  8;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-21,-33,-24,  9,-32,-24, 27,-28, 34, 18,-26,-27,-22,-22,-24, -9, 19,-20,  0,-24;
/M: SY='R';  M= -9, -9,-26,-10,  0,-18,-20, -6,-15, 11,-13, -5, -5,-15,  8, 24, -5, -6,-12,-21, -7,  2;
/M: SY='H';  M= -4,  4,-25,  5, 10,-24,-12, 13,-24,  4,-19,-11,  5,-13,  8,  5, -1, -8,-21,-27,-10,  8;
/M: SY='Q';  M= -3, -5,-25, -7, -1,-20, -7,-10,-13, -1,-10, -4, -4,-14,  2, -2, -5, -8,-13,-23,-13,  0;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='L';  M= -1,-18,-14,-21,-15,  4,-23,-14,  5,-16, 10,  5,-16,-21,-15,-15,-10, -2,  6,-18,  0,-15; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='G';  M= -2, -1,-23, -2, -2,-22,  5, -7,-22, -6,-22,-15,  3,  3, -6, -9,  1, -5,-20,-26,-18, -5; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='L';  M= -6,-16,-21,-17,-11, -1,-22,-15,  3,-15,  9,  2,-15,-17,-12,-12,-12, -2,  2, -9, -2,-12; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='S';  M= -1,  0,-19,  2,  1,-19, -4, -9,-15, -8,-15,-11, -1, -4, -3,-10,  6,  1,-11,-26,-16, -2; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='R';  M= -6, -2,-24, -2,  2,-21,-11, -5,-20,  4,-16, -9,  0, -9,  3,  7,  0, -3,-16,-26,-12,  1;
/M: SY='D';  M= -3,  7,-22,  8,  6,-26,  0, -2,-25, -3,-21,-15,  8,-12,  3, -5,  4, -5,-21,-29,-17,  4;
/M: SY='G';  M= -1, -4,-26, -5, -9,-24, 24,-13,-27, -6,-23,-15,  2,-14, -8, -5,  1, -9,-20,-23,-20, -9;
/M: SY='L';  M= -6,-18,-19,-21,-14,  1,-24,-17,  7,-18, 12,  5,-15,-16,-14,-16, -9,  0,  4,-22, -4,-15;
/M: SY='S';  M=  0,  2,-13, -1, -4,-17, -6,-10,-17, -9,-19,-15,  7,-11, -5, -8, 16, 11,-12,-32,-15, -5;
/M: SY='L';  M= -4,-15,-22,-15, -9, -4,-22,-17,  3,-14,  5,  0,-14,-11,-12,-14,-10, -4,  2,-23, -7,-11;
/M:         M= -4, -6,-23, -7,  0,-13,-17, -8,-13, -2,-10, -7, -4, -7, -2, -3, -3, -2,-12,-24, -9, -2;
/M: SY='E';  M= -3, -1,-24, -1,  2,-16, -9, -6,-13, -8, -7, -5, -3,-15,  1, -9, -4, -7,-14,-21, -7,  1;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-15,-33,-24, 10,-31,-22, 21,-27, 28, 16,-26,-27,-21,-22,-24,-10, 13,-14,  2,-24;
/M:         M= -3,-11,-19,-11, -3,-16,-13,-13,-11, -5, -7, -6, -9,-12, -5, -4, -4, -3, -6,-26,-14, -5;
/M: SY='R';  M= -8,  0,-24,  1,  8,-21,-16, -2,-19,  7,-14, -9,  2,-15,  8, 12, -3, -6,-17,-24,-10,  7;
/M: SY='A';  M= 12,-19,-13,-26,-18, -3,-16,-20,  5,-19,  6,  3,-16,-19,-16,-20, -6, -3,  6,-16, -5,-18;
/M: SY='A';  M= 27,-12,-14,-19,-11, -9, -3,-18, -8,-13, -5, -7, -9,-15,-12,-18,  4, -2, -2,-20,-14,-11;
/M: SY='E';  M= -4,  4,-26,  5, 16,-27,-12, -3,-25, 13,-21,-12,  3,-10, 12, 11,  0, -7,-21,-26,-15, 14;
/M: SY='R';  M= -8, -3,-24, -3,  4,-20,-15, -2,-20,  9,-17, -9, -1,-15,  8, 12, -3, -5,-17,-18, -7,  4;
/M: SY='L';  M=  1,-21,-21,-26,-18,  7,-22,-12,  8,-20, 13,  7,-17,-22,-16,-18,-14, -8,  5,-12,  4,-17;
/M: SY='G';  M= -3, -1,-28, -1,-11,-29, 46,-12,-36,-12,-29,-19,  7,-18,-11,-13,  2,-15,-29,-24,-25,-11;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-19,-32,-23, 19,-30,-20, 19,-27, 34, 17,-27,-29,-23,-20,-24, -9, 14,-15,  5,-23;
/M: SY='K';  M= -5,  3,-24,  3,  6,-23,-12, -4,-23, 10,-22,-13,  3,-13,  4,  8,  3, -1,-16,-25,-13,  4;
/M: SY='A';  M= 13,-13, -5,-20,-15, -8,-14,-20, -2,-16, -4, -4,-11,-16,-14,-18,  4,  6,  5,-26,-13,-15;
/M: SY='R';  M=-10,  0,-27, -1,  9,-24,-16,  2,-26, 20,-23,-11,  4,-12, 12, 25, -3, -6,-21,-24,-11,  9;
/M: SY='A';  M=  4,-15,-19,-19,-12, -6,-16,-13,  1,-14,  1,  0,-12,-17,-11,-13, -4, -1,  3,-22, -6,-12;
/M: SY='V';  M= -6,-21,-17,-23,-19,  5,-26,-14, 10,-13,  3,  4,-19,-23,-17,-12,-11, -3, 15,-16,  7,-20;
/M: SY='R';  M=-11,  4,-27,  4, 12,-27,-17,  3,-27, 21,-24,-11,  6,-12, 14, 22, -2, -7,-22,-26,-11, 12;
/M: SY='V';  M=  1,-17,-16,-21,-13, -8,-17,-17,  1,-12,  1,  1,-13,-18, -8,-10, -6, -3,  3,-22, -9,-11;
/M: SY='D';  M= -4,  5,-24,  9,  4,-26, -7, -9,-24, -3,-26,-18,  3,  8, -2, -8,  9,  4,-19,-32,-20,  0;
/M: SY='F';  M= -5,-18,-22,-20,-13,  6,-21,-18, -1,-12,  4,  1,-16,-16,-16,-12,-13, -7,  0,-11, -2,-14;
/M: SY='E';  M= -2,  6,-23,  6,  9,-22,-11, -7,-20,  1,-18,-13,  5,-10,  3, -4,  3, -3,-17,-25,-14,  6;
/M: SY='E';  M= -6,  2,-25,  2, 10,-23,-13, -3,-22,  7,-19,-11,  3,-10,  7, 10,  0, -5,-18,-27,-14,  8;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='L';  M=-11,-24,-24,-27,-18,  7,-26,-17, 16,-23, 22, 12,-20,-24,-17,-18,-20,-10,  8,-17,  2,-18;
/M: SY='N';  M= -3,  2,-23, -1,  0,-19, -6, -3,-19, -3,-19,-13,  7, -8, -1, -3,  4, -1,-17,-27,-12, -2;
/M: SY='Q';  M= -8, -2,-26, -2,  7,-24,-17, -5,-19,  6,-17, -8, -1, -1, 11,  7, -1, -1,-18,-26,-14,  7;
/M: SY='L';  M= -7,-17,-24,-20,-13, -2,-25,-14,  5,-14,  9,  5,-16,-20,-11,-13,-14, -5,  2,-12, -1,-12;
/M: SY='P';  M= -6,-11,-27,-10, -3,-18,-20,-11, -9, -3,-11, -4,-10, 10,  0, -5, -7, -6,-12,-24,-12, -3;
/M: SY='L';  M= -7,-22,-15,-25,-18,  5,-25,-18,  9,-22, 26, 11,-21,-25,-17,-17,-18, -3,  5,-20, -1,-17;
/M: SY='P';  M=-10,-18,-38, -8,  0,-29,-20,-19,-19, -8,-27,-18,-18, 77,-10,-17,-10,-10,-27,-30,-28, -9;
/M: SY='A';  M= 18,-19, -1,-26,-18, -3,-16,-21,  1,-18,  3, -1,-17,-21,-18,-21, -5, -4,  6,-20, -9,-18;
/M: SY='I';  M= -6,-29,-23,-35,-26,  4,-33,-26, 34,-27, 25, 18,-24,-24,-21,-24,-20, -8, 26,-21, -2,-26;
/M: SY='L';  M=  6,-23,-14,-28,-20,  1,-23,-23, 15,-22, 17,  7,-21,-23,-19,-21,-12, -5, 15,-22, -7,-20;
/M: SY='H';  M=-11,-12,-26,-12, -4, -2,-23,  3, -7,-10, -1, -2,-10,-17, -6, -6,-12, -9, -8,-14,  3, -6;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='L';  M= -5,-14,-12,-16,-12,  5,-16,-11,  7,-13, 13,  6,-14,-16,-10,-10,-13, -6,  4, -3,  3,-11; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
/M: SY='W';  M=-10,  2,-22,  4,  2,-12, -8, -5,-18,  1,-16,-13,  0,-11, -1,  0, -8, -9,-18, 13, -2,  1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='D';  M= -8, 12,-23, 14,  7,-22, -6, -2,-23,  5,-21,-14, 11,-10,  2,  3,  0, -5,-19,-26,-13,  4; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='N';  M= -9,  5,-27,  5,  1,-20,  5, -6,-23, -5,-18,-12,  6,-15,  2, -7, -3,-11,-22,-23,-13,  1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='G';  M= -6,  5,-25,  4, -2,-26, 12, -5,-27, -3,-23,-15, 10,-15,  0, -4,  1, -9,-23,-27,-18, -1;
/M: SY='H';  M= -8, -2,-25, -3,  0,-22, -9, 42,-25, -5,-20, -6,  5,-17,  8,  1,  0, -9,-23,-27,  1,  2;
/M: SY='F';  M=-12,-27,-20,-33,-25, 36,-27,-17,  0,-23,  4, -2,-22,-21,-26,-20,-19,-11, -4, 16, 22,-24;
/M: SY='V';  M= -1,-25,-15,-29,-24,  3,-22,-24, 16,-21,  8,  6,-22,-25,-22,-20,-12, -6, 21,-18, -3,-24;
/M: SY='V';  M= -5,-29,-16,-32,-27,  2,-32,-28, 31,-25, 21, 14,-27,-27,-25,-23,-17, -4, 34,-25, -5,-27;
/M: SY='L';  M= -3,-27,-16,-30,-23,  3,-29,-24, 23,-25, 27, 14,-25,-26,-21,-21,-19, -6, 21,-23, -4,-23;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='Y';  M= -3, -7,-24, -8, -2, -9,-11, -7,-10, -6,-10, -8, -7,-16, -6, -8, -4, -5, -9,-11,  1, -5; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='K';  M= -4,  1,-25,  1,  5,-24, -5, -7,-24, 11,-21,-12,  3,-14,  2,  9, -1, -7,-18,-25,-15,  3;
/M: SY='V';  M= -1,-12,-17,-16,-12, -9,-20,-17,  4,-12, -1,  1,-11,-17,-12,-14, -6, -2,  6,-23, -7,-14;
/M: SY='D';  M= -7, 11,-24, 13,  9,-24, -9, -5,-24,  3,-22,-16,  9, -9,  1,  0,  4,  1,-19,-30,-15,  4;
/M: SY='K';  M= -4,  7,-26,  7,  6,-27,  2, -5,-28, 10,-26,-16,  8,-13,  1,  4,  1, -7,-22,-27,-17,  3;
/M: SY='N';  M= -7, 12,-26, 12,  7,-27,  0, -3,-26,  3,-24,-16, 13,-11,  3,  0,  2, -7,-23,-30,-18,  4;
/M: SY='R';  M=-10,  0,-26, -1,  4,-20,-13,  3,-22,  9,-19, -9,  3,-15,  9, 11, -2, -6,-19,-21, -7,  5;
/M: SY='V';  M= -2,-25,-17,-29,-24,  9,-26,-20, 15,-21, 11,  6,-23,-25,-22,-20,-14, -5, 17,-10,  6,-23;
/M: SY='L';  M= -6,-18,-20,-21,-14,  1,-25,-13,  5,-13, 11,  5,-15,-22,-12, -9,-11,  1,  5,-18,  1,-14;
/M: SY='I';  M= -5,-28,-18,-33,-27,  2,-32,-27, 32,-26, 19, 14,-24,-25,-23,-24,-16, -5, 29,-23, -4,-27;
/M: SY='M';  M=  0,-15,-21,-18,-10, -8,-18, -7,  2,-12,  4,  5,-12,-20,  0,-11, -7, -5, -1,-18,  0, -6;
/M: SY='D';  M=-15, 21,-24, 30, 10,-22,-15, -2,-25, -2,-19,-18,  8,-15, -1, -4, -2, -7,-19,-31,-12,  4;
/M: SY='P';  M= -3,-17,-34,-10, -1,-26,-17,-19,-17,-10,-25,-17,-17, 66, -9,-19, -5, -6,-23,-30,-27, -9;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='A';  M=  7,  1,-21,  1,  4,-24, -1,-10,-21, -3,-19,-14,  1,-10,  0, -9,  7, -1,-15,-27,-18,  2;
/M:         M= -7, -3,-25, -4, -3,-17, -4, -7,-13, -6,-12, -6, -1,-16, -5, -7, -4, -7,-10,-25,-12, -5;
/M: SY='G';  M=  0, -7,-25, -8, -8,-24, 23,-14,-25, -7,-20,-13, -1,-15, -7, -8,  1,-10,-19,-24,-21, -8;
/M: SY='P';  M= -6,-11,-25,-10, -1,-17,-21,-14,-11,  0,-13, -8, -9,  7, -3,  0, -6, -4,-10,-25,-14, -4;
/M: SY='V';  M= -7,-13,-19,-14, -4,-10,-24,-10, -1, -6, -2, -1,-11,-19, -3, -3, -7, -3,  1,-22, -4, -5;
/M: SY='R';  M= -6,-10,-23,-13, -5,-13,-21,-12,-10,  7,-10, -4, -7,-17, -3, 10, -5,  0, -5,-17, -7, -5;
/M: SY='L';  M=-10,-26,-21,-28,-19,  6,-30,-16, 19,-22, 25, 16,-24,-26,-16,-17,-22, -9, 12,-15,  5,-19;
/M: SY='S';  M= -1,  4,-21,  5,  1,-23, -7,-11,-22, -4,-27,-19,  7,  7, -3, -7, 16,  9,-17,-34,-20, -2;
/M: SY='L';  M=-10,-14,-25,-15, -7, -5,-24, -7, -2, -6,  2,  0,-11,-13, -4, -2,-12, -6, -5,-17,  1, -7;
/M: SY='E';  M= -1, 10,-23, 13, 16,-25,-12, -4,-22,  0,-19,-16,  5,-10,  7, -6,  6, -2,-19,-28,-16, 11;
/M: SY='E';  M= -7,  7,-26, 13, 31,-27,-15, -3,-25,  5,-19,-16,  0, -5, 12,  0,  2, -5,-22,-29,-17, 21;
/M: SY='F';  M=-13,-29,-21,-35,-25, 40,-28,-21, 11,-29, 24,  9,-24,-27,-29,-21,-22,-10,  7, -7, 12,-25;
/M: SY='E';  M= -3, -1,-24, -1, 13,-17,-12, -7,-16,  0, -9, -7, -2,-12,  3, -5, -2, -6,-15,-25,-12,  8;
/M: SY='E';  M=  2,  5,-23,  6, 11,-26,-11, -5,-23,  8,-22,-14,  4, -8,  6,  1,  5, -1,-18,-28,-16,  8;
/M: SY='R';  M= -9, -4,-20, -6,  1,-17,-16,  2,-14, -2, -9, -5, -1,-17,  2,  4, -5, -6,-13,-27, -9,  0;
/M: SY='W';  M=-15,-27,-33,-30,-23, 22,-24,-14, -6,-18, -6, -7,-24,-25,-19,-17,-23,-15,-12, 57, 32,-20;
/M: SY='S';  M=  1,  0,-18, -2, -3,-18, -9,-10,-15, -8,-17,-12,  2, -9, -3, -8, 13, 12, -9,-31,-14, -4;
/M: SY='G';  M= -5,  0,-28, -1, -6,-24, 32,-10,-30, -9,-25,-17,  6,-18, -9, -9,  1,-13,-26,-22,-19, -8;
/M: SY='Y';  M=-10,-13,-23,-13, -4, -7,-22,-10, -2, -4, -3, -1,-12,-19, -6, -2,-10, -5, -1,-18,  1, -6;
/M: SY='I';  M=  3,-23,-18,-28,-21,  0,-22,-22, 16,-22, 14,  8,-20,-22,-19,-22,-13, -6, 13,-17, -4,-21;
/M: SY='L';  M= -8,-25,-21,-29,-20,  6,-29,-22, 19,-24, 20, 12,-22,-24,-18,-21,-19, -8, 13,-13,  0,-20;
/M: SY='L';  M= -9,-19,-17,-21,-11,  6,-25,-17,  4,-16, 15,  5,-18,-23,-13,-12,-13, -3,  3,-20, -2,-12;
/M: SY='V';  M= -5,-24,-11,-27,-20,  3,-27,-20, 12,-19, 11,  6,-22,-22,-20,-15,-14, -6, 16,-22, -4,-21;
/I:         E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_06 which contains 572'619 sequence entries.

Total number of hits	41 in 41 different sequences
Number of true positive hits	41 in 41 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Archaea, Bacteriophages, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	V_Lesaux
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Peptidase C39
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

41 sequences

COMA_STRPN  (Q03727), COMA_STRR6  (P59653), CVAB_ECOLX  (P22520),

CYAB_BORP1  (P0DKX6), CYAB_BORPE  (P0DKX5), FAPD_PSEAE  (Q9I2F1), 
FAPD_PSEFL  (P0DXF6), HLYB3_ECOLX (Q47258), HLYBC_ECOLX (P10089), 
HLYBP_ECOLX (P08716), HLYB_ECO57  (Q46717), HLYB_ECOL6  (Q8FDZ8), 
HLYB_PROVU  (P11599), LAGD_LACLL  (P59852), LCN3_LACLL  (P37608), 
LCNCL_LACLA (Q9CJB8), LCNC_LACLL  (Q00564), LKB13_MANHA (Q93FH2), 
LKB14_MANHA (P0C087), LKB16_MANHA (Q93FH3), LKB1A_MANHA (P16532), 
LKB1B_MANHA (Q93FH6), LKB2A_MANHA (Q93FH0), LKB2B_MANHA (Q93FG6), 
LKTB7_MANHA (P0C086), LKTB_BIBTR  (Q933E0), LKTB_MANGL  (Q933I3), 
LKTB_PASSP  (P55122), LTXB_AGGAC  (P23702), MCHF_ECOLX  (Q9EXN5), 
MESD_LEUME  (Q10418), PAXB_PASAE  (Q9RCG7), PEDD_PEDAC  (P36497), 
RTX1B_ACTPL (P26760), RTX3B_ACTPL (Q04473), SUNT_BACSU  (P68579), 
SUNT_BPSPB  (P68580), Y049_METTM  (Q50770), Y1463_METTH (Q50500), 
Y390_MYCGE  (Q49430), Y571_MYCPN  (P75207)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

6 PDB

3ZUA; 7SGR; 8DCK; 8HF4; 8HF5; 8K7A