PROSITE entry PS50999

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	COX2_TM
Accession [info]	PS50999
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-JUN-2004 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 08-NOV-2023 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00075

Name and characterization of the entry

Description [info]

Cytochrome oxidase subunit II transmembrane region profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=95;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=90;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.7467759; R2=0.0142222; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3934.6208496; R2=4.2706046; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=405; H_SCORE=5664; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=264; H_SCORE=5062; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-40; I=-40; B1=-400; E1=-400; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='M';  M= -4,-17,-12,-24,-17, -4,-17,-11,  6,-13,  9, 21,-15,-20,-10,-12,-13, -7,  5,-23, -7,-14;
/M: SY='A';  M=  7,-11,-14,-14, -9,-16,-10,-17, -9,-15, -9, -8, -8,  4,-11,-17,  2,  0, -9,-29,-18,-11;
/M: SY='T';  M= -5, -2,-19, -7, -5, -7, -8, -2,-15,-10,-13, -9,  4,-16, -6, -8,  5,  8,-12,-25, -7, -6;
/M: SY='W';  M= -8,-19,-31,-18,-13,-11, -3,-16,-23,-12,-23,-17,-16,  3,-13,-15,-14,-16,-25, 25, -4,-12;
/M: SY='W';  M= -3,-18, -1,-20,-15,-11, -9,-18,-17,-15,-15,-11,-15,-18,-13,-17, -7, -9,-13,  5, -6,-14;
/I:         I=-12; MD=-32;
/M: SY='N';  M= -8, 10,-24,  7,  4,-24,  1,  0,-23, -2,-22,-11, 13,-15, 13, -3,  2, -8,-25,-26,-15,  9; D=-12;
/I:         I=-12; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='L';  M= -8,-21,-17,-25,-18,  5,-25,-13,  9,-20, 16, 11,-17,-24,-13,-14,-15, -5,  4,-16,  0,-16;
/M: SY='N';  M= -4,  1,-22, -4,-10,-12,  7, -4,-18,-12,-18,-11,  8,-16, -9,-12,  5,  0,-17,-22, -6,-11;
/M: SY='F';  M=-11,-26,-19,-31,-22, 33,-28,-13,  7,-26, 20,  7,-20,-27,-25,-18,-18, -6,  5,-10, 11,-22;
/M: SY='Q';  M= -9,-11,-26,-12,  1,-19,-15, -3, -8, -7,  2,  5,-10,-18, 23, -3,-10,-11,-16,-19, -8, 12;
/M: SY='D';  M=-16, 30,-24, 40, 12,-28,-13, -3,-30, -3,-23,-22, 14, -7, -2, -9, -3, -9,-26,-35,-17,  5;
/M: SY='P';  M= 10,-13,-23,-12, -6,-21, -6,-17,-13,-12,-19,-12, -9, 22, -8,-17,  7,  0,-13,-28,-22, -9;
/M: SY='A';  M= 17, -2,-17, -9, -5,-20, -8, -7,-15, -1,-18, -9,  2, -6, -4, -8,  7,  1, -9,-26,-15, -5;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='S';  M=  5, -3,-16, -5, -8,-21, 18,-14,-25,-13,-26,-18,  5,-13, -8,-13, 24, 12,-15,-32,-21, -8;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='P';  M= -2,-15,-33, -9,  3,-24,-13,-17,-19,-10,-22,-17,-15, 52, -8,-17, -6, -9,-24,-27,-25, -6;
/M: SY='I';  M= -8,-18,-21,-22,-17, -2,-28,-18, 17,-18, 12, 10,-15,-22,-11,-16,-12, -3, 14,-23, -3,-15;
/M: SY='M';  M=  5,-12,-20,-17, -5,-12, -9, -4, -2, -8,  0, 19,-12,-15,  1,-11, -6, -7, -4,-20, -7, -2;
/M: SY='E';  M=-10,  8,-29, 15, 37,-29,-19,  2,-26,  6,-19,-14,  0, -3, 19, -1,  0, -8,-26,-28,-15, 28;
/M: SY='Q';  M=-10, -2,-25, -1,  8,-24, -1, -4,-25,  2,-18, -9, -3,-15,  9,  0, -6,-13,-24,-16,-10,  8;
/M: SY='I';  M= -7,-21,-21,-25,-18, -1,-27,-17, 18,-20, 18, 16,-18,-23,-10,-17,-14, -6, 12,-23, -4,-15;
/M: SY='I';  M=-10,-15,-23,-17,-16, -1,-27,-11, 12,-16,  8,  9,-14,-22,-12,-15,-13, -5,  9,-19,  4,-16;
/M: SY='Y';  M=-13, -5,-25, -6, -5,  0,-18, -3,-12,-11, -8, -8, -4,-19, -9, -9, -9, -8,-13, -6,  4, -7;
/M: SY='F';  M=-15,-28,-21,-33,-24, 41,-29,-18, 10,-29, 27,  9,-22,-29,-28,-19,-24,-10,  4, -5, 16,-24;
/M: SY='H';  M=-16, -6,-27, -9, -9, -8,-23, 49,-10,-14, -9,  4,  1,-20, -2, -8,-11,-12,-13,-24, 14, -8;
/M: SY='D';  M= -7, 22,-24, 27,  4,-26, -6,  3,-24, -7,-21,-18, 15,-15, -4,-10,  3, -6,-20,-34,-14, -1;
/M: SY='H';  M=-16, -7,-24,-11,-11, 12,-23, 23,-10,-16, -2, -1, -2,-23,-10,-10,-12, -9,-12,-16, 15,-11;
/M: SY='V';  M=  4,-14,-16,-20,-17, -6,-14,-19,  6,-17,  0,  2, -9,-19,-14,-17,  2,  6,  9,-26,-10,-16;
/M: SY='L';  M= -9,-23,-14,-29,-21,  4,-27,-16, 18,-22, 27, 26,-22,-24,-14,-17,-19, -3, 11,-22, -2,-18;
/M: SY='M';  M= -8,-21,-19,-27,-21, 14,-21,-12, 10,-18, 13, 22,-18,-23,-15,-15,-12, -2,  7,-15,  6,-17;
/M: SY='I';  M= -9,-27,-23,-33,-26, 13,-33,-21, 28,-26, 20, 13,-23,-25,-22,-23,-19, -8, 20,-13,  9,-26;
/M: SY='L';  M= -5,-25,-21,-30,-22,  6,-23,-19, 18,-24, 26, 19,-23,-25,-18,-20,-20, -8, 12,-19, -2,-20;
/M: SY='V';  M= -3,-22,-11,-29,-23,  7,-28,-24, 16,-23, 11,  6,-18,-23,-22,-21,-10,  3, 18,-22, -3,-23;
/M: SY='L';  M=  0,-24,-20,-29,-22,  3,-18,-21, 16,-23, 17, 14,-20,-23,-19,-21,-15, -8, 14,-19, -5,-21;
/M: SY='I';  M= -8,-29,-24,-37,-29,  1,-36,-28, 42,-27, 20, 20,-23,-23,-21,-26,-18, -8, 32,-22, -2,-28;
/M: SY='T';  M= -5,-18,-17,-20,-15,  0,-23,-20,  2,-19,  3, -2,-15, -5,-17,-17, -2,  8,  4,-25, -8,-16;
/M: SY='V';  M=  0,-21,-12,-26,-22, -2,-19,-23, 14,-21,  6,  6,-17,-23,-20,-20, -6,  0, 18,-25, -9,-22;
/M: SY='F';  M= -9,-27,-20,-32,-25, 19,-27,-23, 17,-25, 19, 10,-23,-23,-25,-21,-17, -6, 16,-16,  2,-25;
/M: SY='V';  M= -3,-28,-14,-31,-28,  7,-31,-28, 27,-22, 11,  9,-26,-28,-28,-21,-11,  1, 39,-25, -5,-28;
/M: SY='M';  M= -2,-15,-15,-20,-14, -2,-12,-14,  0,-17,  2,  7,-11,-19,-10,-15, -3,  0, -1,-22, -7,-12;
/M: SY='Y';  M= -9,-20,-26,-23,-20, 10,-17, -8, -3,-16, -1, -2,-19,-24,-15,-15,-13, -3, -6, 19, 27,-18;
/M: SY='I';  M= -4,-25,-22,-31,-21,  2,-28,-20, 25,-22, 19, 20,-21,-22,-16,-21,-16, -8, 18,-20, -3,-20;
/M: SY='L';  M=-11,-25,-22,-30,-23, 16,-23,-18, 15,-24, 21, 15,-21,-25,-20,-20,-19, -7,  8,-13,  7,-22;
/M: SY='F';  M= -9,-24,-12,-30,-24, 24,-24,-21,  8,-24, 10,  4,-19,-26,-26,-20,-13, -3, 10,-14,  6,-24;
/M: SY='Y';  M= -1,-12,-19,-15,-12, -3,-19,-10, -1,-10, -3, -2, -8,-20, -9, -8, -1,  2,  1,-18,  3,-12;
/M: SY='I';  M= -3,-24,-13,-30,-23,  4,-26,-21, 15,-22, 15, 14,-22,-24,-18,-20,-16, -4, 12,-12, -2,-21;
/M: SY='L';  M= -7,-22,-16,-25,-18,  2,-27,-20, 11,-15, 16,  9,-20,-24,-16,-12,-16, -4, 10,-21, -3,-18;
/M: SY='Y';  M= -9,-21,-24,-26,-20, 12,-25,-14,  6,-16,  4,  3,-17,-23,-16,-13,-12, -2,  3,  5, 15,-19;
/M: SY='R';  M=-11,  4,-23, -1,  0,-19,-14,  1,-22, 10,-20,-12, 12,-15,  4, 22,  3,  3,-18,-28,-12,  0;
/M: SY='Y';  M= -6,-10,-23,-15, -8, 12,-19, -7,-13,  1,-11, -7, -7,-19,-10, -3, -6, -4,-10, -6, 14, -9;
/M: SY='R';  M=-11, -7,-22,-11, -8,  1,-19, -2,-10, -6, -4, -5, -1,-22, -6,  6, -5, -3,-10,-19,  2, -8;
/M: SY='N';  M= -8,  0,-22, -4, -3,-12,-15, -2,-13,  0,-14, -8,  5,-17,  0,  5,  2,  2,-11,-22, -2, -3;
/M: SY='N';  M=-10,  3,-23, -3, -3,-11,-14,  7,-18,  7,-20,-10, 12,-18, -1, 10,  0, -3,-16,-24, -3, -3;
/I:         I=-4; MD=-12;
/M: SY='R';  M= -5,  1,-24, -2,  0,-22,-13, -7,-23, 16,-22,-12,  6, -9,  3, 20,  0, -2,-17,-25,-14,  0; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-12;
/M: SY='N';  M=  1,  3,-13,  0, -4,-13,  2, -5,-10, -5,-11, -7,  6,-11, -4, -7,  3, -1, -8,-19,-11, -4; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-12;
/M: SY='P';  M= -2, -1,-16,  1,  3,-15, -8, -8,-12,  3,-13, -8, -2,  6, -1, -2,  0, -1,-10,-16,-11,  0; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='P';  M= -4, -4,-17, -3, -2,-12, -5, -2,-12, -3,-12, -8, -3, 11, -4, -6, -2, -3,-12,-14, -7, -4; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-12;
/M: SY='P';  M= -1, -7,-18, -5,  0,-14,-11, -8,-11,  5,-12, -7, -7, 16,  0, -2, -4, -5,-12,-13, -9, -1; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-12;
/M: SY='Y';  M=-13,  0,-27, -2, -1, -6,-18,  5,-18,  2,-18,-10,  4,-10,  1,  3, -5, -6,-20,-14,  8, -2;
/M: SY='F';  M=-11,-26,-25,-31,-23, 11,-27,-21, 11,-20, 10,  8,-23,-25,-19,-18,-19, -7,  7, 11,  6,-21;
/M:         M= -5, -9, -7,-12, -5, -9,-20, -6, -5,-13,  0,  0, -7,-20, -8,-12, -4,  0, -3,-29, -9, -7;
/M: SY='H';  M=-14, 11,-29, 15, 11,-28, -2, 36,-33, -4,-24,-13, 11,-14,  6, -4, -4,-15,-30,-30, -6,  7;
/M: SY='G';  M=  3,  3,-20, -2, -9,-21, 19, -9,-23,-10,-25,-17, 14,-17, -8,-10, 12, -2,-18,-28,-19, -9;
/M: SY='Q';  M= -7,  1,-23, -3,  5,-24,-18,  6,-16,  2,-15, -5,  4,-13, 20,  2,  3,  5,-17,-26, -8, 12;
/M:         M= -8,-10,-24,-12, -1, -4,-22,-14,-10, -1, -7, -5, -8, -5, -6, -3, -7,  0,-10,-20, -6, -4;
/M: SY='I';  M= -8,-29,-24,-35,-27,  1,-31,-26, 35,-28, 25, 18,-23,-24,-21,-25,-21, -9, 24,-21, -3,-26;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='I';  M= -2,-23,-20,-31,-23,  4,-28,-23, 23,-23, 16, 13,-19,-21,-18,-22,-12,  0, 18,-20, -2,-22;
/M: SY='I';  M= -3,-26,-21,-32,-24,  2,-30,-26, 27,-24, 16, 11,-22,-22,-21,-23,-14, -3, 23,-17, -3,-24;
/M: SY='W';  M=-17,-37,-37,-38,-29,  6,-23,-29,-10,-20,-14,-14,-36,-30,-21,-19,-34,-24,-16,108, 21,-22;
/M: SY='T';  M= -3, -7,-17,-15,-13, -7,-19,-21,-12,-12,-13,-12, -7,-14,-11,-12, 10, 35, -6,  1, -3,-11;
/M: SY='I';  M= -1,-23,-20,-29,-25, -4,-24,-27, 25,-22,  9,  8,-19,-21,-21,-23, -9,  1, 25,-24, -8,-25;
/M: SY='I';  M= -6,-27,-21,-33,-26,  9,-32,-25, 28,-26, 19, 13,-21,-23,-22,-23,-15, -4, 23,-19,  0,-25;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='A';  M= 19,-17,-15,-26,-18,-11,-17,-22, 12,-17,  1,  4,-13,-15,-13,-22,  0,  0, 11,-23,-12,-17;
/M: SY='I';  M= -9,-29,-22,-34,-25, 12,-32,-24, 28,-27, 27, 16,-24,-26,-22,-23,-20, -8, 20,-18,  2,-25;
/M: SY='I';  M= -9,-28,-26,-36,-27,  1,-36,-27, 41,-27, 21, 20,-21,-21,-19,-26,-18, -6, 27,-21, -1,-27;
/M: SY='L';  M= -8,-29,-20,-31,-22,  7,-31,-22, 25,-28, 39, 18,-28,-28,-21,-21,-25, -8, 17,-22, -2,-22;
/M: SY='I';  M= -7,-29,-21,-34,-27,  4,-34,-27, 34,-26, 22, 16,-24,-25,-22,-24,-18, -7, 29,-22, -2,-27;
/M: SY='F';  M= -4,-24,-20,-31,-23, 22,-22,-21, 10,-24, 12,  7,-18,-23,-23,-20,-14, -5,  7, -9,  6,-23;
/M: SY='I';  M= -9,-28,-24,-33,-23,  3,-34,-23, 32,-27, 30, 19,-23,-24,-17,-23,-22, -8, 19,-21, -1,-22;
/M: SY='A';  M= 34,-12,-12,-19,-13,-18,  4,-20,-11,-12,-12, -9,-10,-13,-12,-19,  7, -2, -2,-17,-18,-12;
/M: SY='V';  M= -6,-28,-18,-31,-24, 16,-30,-23, 20,-24, 20, 11,-25,-27,-25,-20,-18, -6, 21,-16,  3,-24;
/M: SY='P';  M=-11,-22,-35,-16, -7,-11,-23,-18,-11,-14,-17,-12,-21, 56,-15,-20,-13,-10,-19,-21,-14,-15;
/M: SY='S';  M=  8, -1,-10, -3, -3,-18, -5,-12,-17,-10,-25,-17,  7,-11, -3,-10, 35, 25, -7,-38,-18, -3;
/M: SY='F';  M=-13,-30,-23,-34,-25, 26,-29,-20, 12,-26, 21,  9,-27,-29,-25,-20,-25,-11,  8,  9, 14,-24;
/M: SY='R';  M= -7, -4,-26, -5,  2,-22,-18, -1,-17, 11,-16, -6, -1,-10,  8, 15, -4, -6,-15,-24,-10,  3;
/M: SY='L';  M= -7,-20,-21,-24,-19,  2,-25,-18, 15,-22, 18,  8,-16,-23,-16,-19,-12,  1,  9,-20,  2,-19;
/M: SY='L';  M= -7,-23,-14,-26,-19,  6,-27,-20, 12,-25, 29, 11,-22,-26,-19,-19,-17,  1,  8,-21, -1,-19;
/M: SY='Y';  M=-19,-15,-28,-17,-15, 20,-27, 27, -6,-11, -2,  0,-12,-27, -7, -7,-17,-11,-13, 11, 53,-14;
/M: SY='L';  M= -7,-12,-22,-14,-10, -5,-21, -8,  2,-10,  9,  6,-10,-21, -8, -7,-12, -6, -2,-21, -1,-10;
/M: SY='M';  M= -8,-20,-13,-25,-18,  2,-25,-12, 12,-19, 21, 22,-19,-24,-11,-16,-17, -4,  6,-21,  0,-15;
/M: SY='D';  M=-10, 31,-28, 44, 18,-36, -3, -3,-35, -1,-26,-24, 12,-10,  2,-10,  1,-10,-27,-34,-21, 10;
/M: SY='E';  M= -9,  5,-31, 14, 34,-29,-13, -6,-28,  4,-21,-19, -3, 12,  8, -5, -3,-10,-27,-29,-21, 20;
/M: SY='I';  M= -5,-21,-21,-25,-18, -3,-28,-19, 17,-12,  7, 10,-18,-21,-13,-14,-11, -3, 17,-21, -1,-17;
/M: SY='N';  M= -8,  4,-26,  0, -2,-17,-15, -6,-13,  4,-19, -8,  8, -6, -2,  0, -2, -6,-15,-27,-12, -3;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2023_05 which contains 570'420 sequence entries.

Total number of hits	344 in 344 different sequences
Number of true positive hits	344 in 344 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	N_Hulo
Taxonomic range [info]	Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	1
Version [info]	6

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

344 sequences

COX1_ACACA  (Q37370), COX1_DICCI  (Q2LCQ6), COX1_DICDI  (O21042),

COX2_ACHDO  (P29870), COX2_ACOIG  (Q38S50), COX2_ACOWI  (P50672), 
COX2_ADABI  (P29871), COX2_AEDAE  (P50692), COX2_AILFU  (Q3L6W7), 
COX2_AILME  (Q2Y0B9), COX2_ALBCA  (P48889), COX2_ALBTU  (Q09334), 
COX2_ALKPO  (Q04441), COX2_ALLMI  (O47870), COX2_ALOPA  (P98024), 
COX2_AMICA  (P29655), COX2_ANAPL  (P98019), COX2_ANIIM  (Q38S38), 
COX2_ANOGA  (P34840), COX2_ANOQU  (P33505), COX2_ANTAM  (Q37369), 
COX2_AOTNI  (Q7IC90), COX2_APIFL  (P50267), COX2_APIKO  (P50268), 
COX2_APILI  (P20375), COX2_APOMY  (Q38S35), COX2_APOSM  (Q38S29), 
COX2_APOSY  (P50673), COX2_APTAU  (O03889), COX2_ARATH  (P93285), 
COX2_ARTSF  (Q37706), COX2_ARVSO  (Q38S26), COX2_ASCSU  (P24882), 
COX2_ATEMI  (Q7J6G4), COX2_ATRSP  (P29656), COX2_BACP3  (Q03438), 
COX2_BACSU  (P24011), COX2_BALBO  (Q599A0), COX2_BALMU  (P41294), 
COX2_BALPH  (P24986), COX2_BATGR  (Q38S23), COX2_BERBO  (Q38S20), 
COX2_BETVU  (P98012), COX2_BISBI  (Q37416), COX2_BISBO  (P68296), 
COX2_BOSGA  (P68295), COX2_BOSIN  (P68553), COX2_BOSJA  (P68294), 
COX2_BOSMU  (P68554), COX2_BOSTR  (Q37419), COX2_BOVIN  (P68530), 
COX2_BRAFL  (O47428), COX2_BRAHY  (Q9GCE7), COX2_BRALA  (O79417), 
COX2_BREAN  (P43369), COX2_BRECS  (P43370), COX2_BRENA  (P43372), 
COX2_BUBDE  (P50678), COX2_CAEBR  (Q8HEC3), COX2_CAEEL  (P24894), 
COX2_CAERE  (Q8SEM9), COX2_CAIMO  (P50666), COX2_CALGO  (P50661), 
COX2_CANAD  (O47667), COX2_CANAL  (Q9B8D8), COX2_CANAU  (O47669), 
COX2_CANGA  (P43373), COX2_CANLA  (P67781), COX2_CANLF  (P67780), 
COX2_CANLU  (P67782), COX2_CANME  (O47671), COX2_CANSI  (P98031), 
COX2_CAPHI  (Q37430), COX2_CARAU  (O78682), COX2_CARSF  (P98046), 
COX2_CASBE  (O03890), COX2_CAVAP  (P50683), COX2_CEPBA  (P98043), 
COX2_CERGA  (P98020), COX2_CERSI  (O03851), COX2_CERSP  (Q03736), 
COX2_CERTH  (O47672), COX2_CHEME  (P98027), COX2_CHICK  (P18944), 
COX2_CHLAE  (P26455), COX2_CHOBI  (P98025), COX2_CHOCR  (P48869), 
COX2_CHOFU  (P84288), COX2_CHOOC  (P84289), COX2_CHOPI  (P84290), 
COX2_CHORO  (P98030), COX2_CHRBR  (O47670), COX2_CONPN  (Q38S17), 
COX2_CORGL  (Q8NNK2), COX2_COTJA  (P50684), COX2_CRABU  (P50685), 
COX2_CRACA  (P50662), COX2_CTEFE  (P29872), COX2_CULQU  (P50693), 
COX2_CUOAL  (O47668), COX2_CYACA  (P48870), COX2_CYBMR  (P47918), 
COX2_CYBSA  (P06029), COX2_CYPCA  (P24987), COX2_DACMI  (Q38S14), 
COX2_DAMPP  (P50679), COX2_DANRE  (Q9MIY7), COX2_DASNO  (P50687), 
COX2_DAUCA  (P27168), COX2_DAUMA  (P98032), COX2_DEBHA  (A9RAG1), 
COX2_DEKBR  (P43374), COX2_DESAU  (Q38S65), COX2_DIDVI  (P41311), 
COX2_DROAI  (Q85TA0), COX2_DROAL  (P84201), COX2_DROAM  (P29856), 
COX2_DROAT  (P84202), COX2_DROAZ  (P84287), COX2_DROBF  (P29859), 
COX2_DROLO  (P29860), COX2_DROME  (P00408), COX2_DROMI  (P67797), 
COX2_DRONO  (O03891), COX2_DRONR  (P67795), COX2_DROPE  (P67798), 
COX2_DROPS  (P67799), COX2_DROSI  (P50253), COX2_DROSU  (P29865), 
COX2_DROTO  (P67796), COX2_DROYA  (P00409), COX2_DUGDU  (Q8W9N3), 
COX2_EENNA  (P43375), COX2_ELEMA  (Q2I3H1), COX2_EMEND  (P13588), 
COX2_EQUAS  (P92478), COX2_EREGS  (Q7YFV7), COX2_EULMA  (P98033), 
COX2_EXERO  (P29873), COX2_FELCA  (P48890), COX2_FORLA  (P34189), 
COX2_GADMO  (Q37741), COX2_GALME  (P29874), COX2_GALSE  (P50688), 
COX2_GALVR  (P50686), COX2_GAZSP  (P50680), COX2_GEOCP  (P50689), 
COX2_GEOSD  (P29657), COX2_GERGE  (Q38S62), COX2_GERRO  (Q38S56), 
COX2_GERVA  (Q37476), COX2_GOMVA  (P29658), COX2_GORBE  (Q37472), 
COX2_GORGO  (P26456), COX2_HALGR  (P38596), COX2_HAPGR  (P98034), 
COX2_HIPAM  (Q9ZZY8), COX2_HORSE  (P48660), COX2_HUMAN  (P00403), 
COX2_HYBUN  (Q38S11), COX2_HYLLA  (Q96127), COX2_HYLPR  (Q38S08), 
COX2_KAZEX  (P43377), COX2_KLULA  (P20387), COX2_LACK1  (Q9XLW8), 
COX2_LACTC  (P43376), COX2_LAGLA  (P98036), COX2_LASSP  (P29875), 
COX2_LATCH  (O03848), COX2_LEGFO  (Q38S05), COX2_LEMBA  (Q38S02), 
COX2_LEMCA  (P98035), COX2_LEOSA  (Q38S00), COX2_LEPOC  (P29659), 
COX2_LOCMI  (P14573), COX2_LOPFL  (Q38S47), COX2_LOXAF  (Q9TA26), 
COX2_LUMTE  (Q37545), COX2_LYCCU  (O47676), COX2_LYCGR  (O48267), 
COX2_LYCGY  (O47677), COX2_LYCPI  (O47674), COX2_LYCSE  (O47678), 
COX2_LYCSM  (O79549), COX2_LYCVE  (Q7J6G2), COX2_MACCA  (Q37548), 
COX2_MACFA  (P11948), COX2_MACMU  (P98038), COX2_MAIZE  (P00412), 
COX2_MALLO  (Q38RZ7), COX2_MALTY  (Q37547), COX2_MAMPR  (Q38PR9), 
COX2_MANLE  (P98037), COX2_MARPO  (P26857), COX2_MAXBA  (Q38RZ2), 
COX2_MAXSU  (Q38RY9), COX2_MEGAT  (P29660), COX2_MERSH  (Q38S59), 
COX2_METSE  (O47496), COX2_MICNA  (Q38S41), COX2_MICPE  (P24988), 
COX2_MICTV  (Q7IKU8), COX2_MOUSE  (P00405), COX2_MYTED  (Q00227), 
COX2_MYXGL  (Q9G2X2), COX2_NEUCR  (P00411), COX2_NIVCU  (Q38RY6), 
COX2_NOTPE  (O03892), COX2_NYCCO  (P98039), COX2_NYCPR  (O47675), 
COX2_OENBE  (P05490), COX2_OENHY  (Q38RY0), COX2_ONCFA  (P29876), 
COX2_ONCMY  (P48171), COX2_ORNAN  (Q37718), COX2_ORYSJ  (P04373), 
COX2_OSPRO  (P92662), COX2_PANPA  (P26457), COX2_PANTR  (P50690), 
COX2_PAPAN  (P68297), COX2_PAPHA  (P68298), COX2_PARDE  (P08306), 
COX2_PARLI  (P12701), COX2_PATPE  (Q37411), COX2_PEA(P08744), 
COX2_PELSU  (O79673), COX2_PERAM  (P29877), COX2_PERFA  (Q37595), 
COX2_PETMA  (Q37604), COX2_PHOVI  (Q00528), COX2_PHYHA  (Q37596), 
COX2_PHYME  (Q02212), COX2_PIG(P50667), COX2_PISOC  (P25002), 
COX2_PNECA  (P29163), COX2_PODAN  (P20682), COX2_POLOR  (Q96183), 
COX2_POLSX  (P29661), COX2_PONAB  (P92693), COX2_PONPY  (Q37605), 
COX2_PRAJA  (Q38RX1), COX2_PRATA  (Q38RW8), COX2_PRATU  (Q38RW5), 
COX2_PROTA  (P98042), COX2_RABIT  (P98049), COX2_RAT(P00406), 
COX2_RHAPU  (Q38RV6), COX2_RHEAM  (O03893), COX2_RHIDA  (Q37643), 
COX2_RHISA  (O99819), COX2_RHIUN  (Q96190), COX2_RHYIS  (Q38RV3), 
COX2_RICBR  (Q1RI44), COX2_RICCN  (Q92I65), COX2_RICFE  (Q4ULU3), 
COX2_RICPR  (Q9ZDC6), COX2_ROULE  (Q37649), COX2_RUSUN  (Q37440), 
COX2_SALSA  (Q37677), COX2_SCAPL  (P29662), COX2_SCHGR  (P29878), 
COX2_SCHPO  (P21534), COX2_SCICA  (P50691), COX2_SCYCA  (O79404), 
COX2_SHEEP  (O78750), COX2_SIMVI  (P98021), COX2_SITGR  (P29879), 
COX2_SOYBN  (P05491), COX2_SPEVE  (O47679), COX2_SQUAC  (Q9ZZ51), 
COX2_STRCA  (O21400), COX2_STRPU  (P15545), COX2_SUNME  (Q38RU7), 
COX2_SYMST  (P29880), COX2_SYMSY  (P25312), COX2_SYNCA  (P50675), 
COX2_SYNY3  (Q06474), COX2_TACSP  (Q37691), COX2_TAMAM  (Q7IZ21), 
COX2_TAMBU  (Q7IZ16), COX2_TAMCA  (Q7IZ15), COX2_TAMCI  (Q7IZ14), 
COX2_TAMDO  (Q7IZ11), COX2_TAMMR  (Q7IZ08), COX2_TAMPL  (Q7IZ01), 
COX2_TAMQA  (Q9G5S9), COX2_TAMRF  (Q9G1N5), COX2_TAMSO  (Q9G0U1), 
COX2_TAMTO  (Q9G185), COX2_TATEM  (Q38S53), COX2_TETNG  (Q4JQI4), 
COX2_THEGE  (P98044), COX2_THEVL  (P98054), COX2_TINMA  (O03895), 
COX2_TRAIM  (Q37685), COX2_TRIRU  (Q01556), COX2_TUPGL  (Q37684), 
COX2_UROCA  (Q38RU4), COX2_UROCI  (O48276), COX2_USTMA  (Q0H8Y7), 
COX2_VANPO  (A6H4Q5), COX2_VARVI  (P98047), COX2_VIGUN  (P32646), 
COX2_VULCO  (Q539C6), COX2_VULMA  (O47680), COX2_VULVU  (O47681), 
COX2_VULZE  (O47673), COX2_WHEAT  (P00413), COX2_WICCA  (P48871), 
COX2_XENLA  (P00407), COX2_YARLI  (Q9B6D5), COX2_YEAST  (P00410), 
COX2_YPOMA  (P98048), COX2_ZANCU  (Q3T4C0), COX2_ZELHI  (Q38RU1), 
COX2_ZOOAN  (P29881), COXT_SOYBN  (Q02226), CYOA_BUCAI  (P57544), 
CYOA_BUCAP  (Q8K993), CYOA_BUCBP  (Q89AA3), CYOA_ECOL6  (P0ABJ2), 
CYOA_ECOLI  (P0ABJ1), CYOA_PSEAE  (Q9I427), CYOA_PSEPU  (Q9WWR1), 
M1280_ARATH (P92559), QOX2_ACEAC  (P50653), QOX2_BACAN  (Q81V01), 
QOX2_BACC1  (Q73DE0), QOX2_BACCR  (Q81HT3), QOX2_BACSH  (E0TW67), 
QOX2_BACSU  (P34957), QOX2_STAA3  (Q2FI17), QOX2_STAA8  (Q2FZJ9), 
QOX2_STAAB  (Q2YX14), QOX2_STAAC  (Q5HH23), QOX2_STAAM  (Q99V36), 
QOX2_STAAN  (Q7A698), QOX2_STAAR  (Q6GI23), QOX2_STAAS  (Q6GAF2), 
QOX2_STAAW  (Q7A181), QOX2_STAEQ  (Q5HQA9), QOX2_STAES  (Q8CPP6), 
QOX2_STAHJ  (Q4L565), QOX2_STAS1  (Q49WI4)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

127 PDB

1AR1; 1FFT; 1M56; 1M57; 1OCC; 1OCO; 1OCR; 1OCZ; 1QLE; 1V54; 1V55; 2DYR; 2DYS; 2EIJ; 2EIK; 2EIL; 2EIM; 2EIN; 2GSM; 2OCC; 2Y69; 2YBB; 2ZXW; 3ABK; 3ABL; 3ABM; 3AG1; 3AG2; 3AG3; 3AG4; 3ASN; 3ASO; 3DTU; 3EHB; 3FYE; 3FYI; 3HB3; 3WG7; 3X2Q; 5B1A; 5B1B; 5B3S; 5GPN; 5IY5; 5J4Z; 5J7Y; 5LUF; 5W97; 5WAU; 5WEH; 5X19; 5X1B; 5X1F; 5XDQ; 5XDX; 5XTH; 5XTI; 5Z62; 5Z84; 5Z85; 5Z86; 5ZCO; 5ZCP; 5ZCQ; 6CI0; 6GIQ; 6HU9; 6J8M; 6JUW; 6JY3; 6JY4; 6KOB; 6KOC; 6KOE; 6NKN; 6NMF; 6NMP; 6T0B; 6T15; 6WTI; 6YMX; 6YMY; 7ATE; 7ATN; 7AU3; 7AU6; 7COH; 7CP5; 7CUB; 7CUQ; 7CUW; 7D5W; 7D5X; 7DGQ; 7DGR; 7DGS; 7DKF; 7EV7; 7N9Z; 7O37; 7O3C; 7O3E; 7Q21; 7QHM; 7QHO; 7THU; 7TIE; 7TIH; 7TII; 7VUW; 7VVR; 7W3E; 7XMA; 7Y44; 7YPY; 7Z10; 8C8Q; 8D4T; 8DH6; 8E7S; 8EC0; 8F68; 8F6C; 8GVM; 8H8R; 8H8S; 8IJN
» more