PROSITE entry PS51019
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | REELIN |
Accession [info] | PS51019 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-SEP-2004 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC51019 |
Associated ProRule [info] | PRU00363 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | Reelin domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=168; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=163; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.2636361; R2=0.0198973; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=289; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=163; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='F'; M= -1,-20,-20,-24,-18, 9,-23,-11, 5,-17, 4, 1,-16,-18,-16,-14, -8, -2, 5,-13, 8,-18; /M: SY='A'; M= 9,-12,-18,-15,-13,-10,-11,-18, -1,-15, 3, -2,-13,-16,-14,-17, -3, 0, 2,-23,-10,-14; /M: SY='V'; M= -3,-16, -2,-18,-15, -7,-24,-21, 0,-16, 4, -2,-17,-16,-17,-16,-10, -1, 5,-28,-12,-17; /M: SY='A'; M= 4,-11,-20,-12, -9,-11, -3,-15, -7,-16, 1, -4,-11,-19,-13,-16, -5, -5, -2,-24,-13,-11; /M: SY='V'; M= 0,-17,-19,-20,-16, -1,-22,-13, 6,-14, 4, 3,-16,-19,-13,-13, -7, 2, 8,-16, 4,-15; /M: SY='A'; M= 5,-17,-15,-21,-17, -4,-15,-15, 4,-18, 4, 0,-15,-21,-15,-19, -6, -4, 4,-17, 1,-17; /M: M= -3,-16,-23,-14,-10, -3,-14,-17, -6,-16, -3, -6,-15, -3,-15,-17, -7, -6, -5,-16, -8,-13; /M: SY='R'; M= -8,-17,-17,-17,-12,-14,-20,-17, -5, -3, -8, -3,-14, -3,-10, 3, -6, -2, 1,-27,-14,-13; /M: SY='S'; M= 3, -4,-12, -8, -9, -9, -9, -9,-13,-13,-12, -9, -3,-18, -9,-13, 4, 2, -6,-25,-10, -9; /M: SY='A'; M= 13, -7,-19,-13,-12,-19, 12,-15,-14,-13,-16, -9, 0,-14,-10,-14, 8, -3,-10,-25,-19,-11; /M: SY='P'; M= 3,-14,-21,-13, -6,-13,-17,-11,-13, -6,-15,-11,-13, 13, -8,-11, -3, -4,-13,-18, -3, -9; /M: SY='P'; M= -3,-11,-23,-11, -6,-10,-16,-14,-13, -8,-16,-10, -9, 13, -8, -7, 2, 2,-10,-25,-14, -8; /M: SY='E'; M= -4, 1,-22, -1, 7, -8,-12, -9,-16, -6,-14,-13, 3,-15, -4, -7, 1, -3,-14,-19,-10, 2; /M: SY='G'; M= 2, -7,-21, -9,-11,-10, 12,-16,-20,-14,-12,-12, -3,-18,-14,-13, 1, -5,-14,-21,-14,-12; /M: SY='Y'; M= -7,-16,-18,-19,-13, 1,-20,-10, -5, -4, -2, -1,-14,-22, -9, -3,-11, -5, -2,-11, 9,-12; /M: SY='C'; M= -7,-20, 65,-26,-25,-14,-24,-27,-17,-25,-14,-13,-19,-26,-26,-25, -7, -7, -2,-41,-24,-26; /M: SY='T'; M= -1, 5,-14, 3, -4,-19,-14,-14,-15, -8,-18,-14, 4, -6, -7,-11, 13, 18, -7,-33,-16, -6; /M: SY='R'; M= -7, -8,-26,-12, -8,-19, -5, 2,-17, 2,-16, -4, -1,-18, 0, 12, -5, -8,-14,-20, -9, -6; /M: SY='A'; M= 6, -9,-20,-13, -9,-16,-15, 6, -4, -9, -8, 3, -5,-16, -2, -9, -1, -5, -2,-25, -6, -7; /M: SY='P'; M= -9,-15,-11,-13, -8,-21, -9,-18,-19,-14,-15,-13,-13, 20,-13,-14,-10,-10,-20,-30,-23,-12; /M: SY='E'; M= -4, -5,-27, -4, 8,-24,-11, -4,-23, 3,-21,-13, -2, 5, 7, 6, -1, -5,-22,-24,-14, 5; /M: SY='G'; M= -2, -5,-21, -8, -9,-11, 3, -1,-16,-15,-10, -8, 1,-19,-10,-13, 1, -5,-12,-26,-10,-10; /M: SY='Q'; M= 2, -7,-22, -9, 5,-18,-17, 2, -9, -6, -6, 3, -8, -9, 7, -8, -2, -3, -9,-25,-10, 5; /M: SY='G'; M= -1, -8, -4,-12,-13,-21, 8,-17,-21,-12,-20,-14, -2,-11,-13,-12, 1, -5,-16,-29,-22,-14; /M: SY='G'; M= -3, 0,-24, 0, -5,-21, 2, -6,-21, -9,-21,-14, 2, -2, -6,-11, 2, -5,-17,-28,-17, -7; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='D'; M= -5, 11,-18, 15, 6,-21, 2, 3,-21, -3,-17,-13, 7, -8, 2, -6, 2, -5,-18,-21,-11, 4; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='H'; M= 4, -6,-20, -7, -4,-19, 1, 8,-19, -7,-18, -9, -2, 1, -2, -7, 2, -4,-16,-22,-11, -5; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='R'; M= -4, -6,-25,-10,-10,-19, 5,-11,-19, 3,-19,-10, 2,-19, -7, 9, -3, -7,-13,-22,-13,-10; /M: SY='S'; M= -3, -2,-22, 0, 3,-21, -8, 3,-20, -5,-19,-12, 0, -8, -2, -3, 5, -2,-14,-30,-13, -1; /M: SY='P'; M= -7,-11,-28, -9, 3,-22,-20,-11,-10, -4,-12, -5,-11, 15, 5, -5, -6, -6,-13,-26,-16, 2; /M: SY='P'; M= -4,-12,-28,-10, -4,-25, 3,-12,-16,-10,-16, -7,-10, 6, 2,-12, -4,-10,-17,-24,-19, -2; /M: SY='Q'; M= -8, 6,-25, 8, 8,-21,-18, -4,-14, -2,-13, -9, 3,-13, 10, -5, 0, -1,-15,-25, -8, 8; /M: SY='S'; M= 2, 3,-14, -1, -5,-16,-10, -9,-11, -9,-17,-12, 7,-15, -7,-10, 15, 14, -3,-34,-15, -7; /M: SY='N'; M= -1, 1,-22, -1, 3,-19, -5,-10,-16, -6,-14,-12, 4, -8, -4, -8, 3, 0,-14,-29,-18, -1; /M: SY='F'; M= -3,-18,-23,-23,-16, 12,-22,-17, -1,-17, -2, -4,-13, -1,-18,-17, -8, -3, -4,-13, 2,-17; /M: SY='P'; M= -4,-13,-27,-10, -2,-21,-17,-16,-12, -4,-20,-11,-10, 26, -5, -8, 1, -1,-12,-29,-19, -6; /M: SY='Y'; M=-14,-22,-26,-23,-18, 13,-29, 4, 6,-20, 15, 7,-19,-19,-14,-15,-20, -9, -2, -6, 25,-18; /M: SY='Q'; M= -8, -5,-24, -5, 2,-16,-19, 5,-14, 1,-13, -6, -1,-15, 6, 4, 2, 1,-13,-24, -2, 2; /M: SY='I'; M= -5,-27,-21,-32,-26, -2,-32,-27, 35,-25, 13, 13,-20,-23,-21,-24,-11, -4, 31,-25, -5,-26; /M: SY='T'; M= 4, 1,-19, -3, 2,-16,-16,-12, -8, -8,-10, -8, 0,-12, -4,-12, 6, 9, -5,-27,-12, -2; /M: SY='G'; M= 1, -9,-21, -8,-12,-19, 12,-20,-14,-15,-13,-10, -8,-15,-16,-17, 1, -2, -4,-26,-19,-14; /M: SY='N'; M= -3, 14,-20, 13, 3,-24, -3, -5,-18, -6,-23,-16, 16,-14, 0, -9, 12, 1,-15,-35,-18, 1; /M: SY='P'; M= -4, -8,-28, -5, 0,-27,-14,-15,-19, -3,-24,-15, -8, 32, -1,-10, 1, 1,-19,-29,-21, -2; /M: SY='E'; M= -5, 7,-21, 7, 14,-23,-15, -7,-22, 8,-22,-13, 6, -9, 7, 1, 10, 10,-17,-30,-15, 10; /M: SY='T'; M= -5,-10,-14,-14,-13, -6,-11, -8,-10,-11,-12, -7, -6,-19,-10,-11, 3, 8, -4,-21, 0,-12; /M: SY='Y'; M=-15,-25,-24,-27,-24, 31,-30, -1, 9,-17, 6, 4,-22,-30,-21,-15,-18, -8, 7, 10, 46,-24; /M: SY='K'; M= -7,-10,-23,-13,-11,-15,-13,-12, -6, 1,-11, -4, -6,-21, -8, 0, -8, -6, 1,-19,-10,-10; /M: SY='P'; M= 0,-16,-32,-11, -2,-27,-13,-17,-19, -9,-24,-16,-15, 53, -7,-15, -4, -7,-23,-28,-26, -8; /M: SY='G'; M= -2, -4,-30, -3,-10,-30, 56,-16,-38,-16,-29,-20, 3,-18,-15,-17, 0,-18,-30,-22,-28,-12; /M: SY='Q'; M= -9, 8,-26, 11, 16,-29,-17, 6,-21, 2,-20,-10, 5,-10, 22, 0, 4, -1,-22,-29,-12, 18; /M: SY='E'; M= -6, -3,-24, -3, 9,-23,-14, -8,-16, 0,-18, -9, -1, -1, 9, 0, 4, 3,-16,-28,-15, 8; /M: SY='Y'; M=-14,-25,-26,-28,-24, 18,-32, -3, 18,-19, 12, 12,-22,-27,-16,-17,-20, -9, 8, 4, 38,-23; /M: SY='R'; M= -7, 5,-24, 2, 6,-23,-11, 6,-25, 9,-22,-12, 9,-14, 7, 13, 3, 0,-20,-28,-11, 5; /M: SY='V'; M= -2,-29,-14,-30,-28, 0,-26,-28, 28,-22, 13, 11,-28,-29,-27,-21,-13, -3, 40,-27, -9,-28; /M: SY='T'; M= 2, -2,-14, -5, -7,-14,-15,-11,-10,-11,-11, -9, -1,-14, -6,-11, 15, 22, -1,-32,-12, -7; /M: SY='L'; M= -9,-29,-23,-33,-24, 4,-33,-24, 31,-29, 32, 18,-24,-25,-19,-24,-22, -8, 19,-21, -1,-24; /M: SY='S'; M= -2, -5,-19, -6, -2,-15,-11, -4,-15, -3,-17,-10, 1,-15, 2, 0, 12, 7,-10,-26, -7, -1; /M: SY='G'; M= 9, -9,-19,-11,-14,-26, 34,-19,-29,-16,-25,-18, -3, -9,-15,-19, 6, -7,-20,-24,-26,-15; /M: SY='S'; M= -4, -4,-23, -6, -3,-11,-15, -2,-16, -5,-18,-11, 1, -5, -4, -7, 3, 0,-13,-20, -8, -4; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='P'; M= -5, -2,-22, -2, 3,-20,-13, -8,-18, 3,-21,-13, 3, 7, 2, 5, 6, 4,-16,-27,-16, 1; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='P'; M= -3, -3,-17, -3, 0,-15, -4, -9,-12, -4,-15,-10, -1, 9, -5, -7, 2, 1,-10,-20,-14, -3; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='D'; M= -4, 4,-17, 5, -2,-15,-12, -3, -9, -6, -9, -5, 2,-12, -2, -8, 3, 2, -6,-24, -8, -2; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='Y'; M= -8,-12,-20,-13, -8, 1,-20, -4, -5, -3, -6, -3,-11,-18, -7, -3, -6, 0, -3, -4, 11, -8; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='F'; M=-18,-29,-21,-38,-28, 64,-29,-17, 5,-27, 13, 8,-20,-29,-33,-19,-20,-10, 2, 5, 26,-27; /M: SY='R'; M=-11, -3,-26, -2, 0,-22,-16, -7,-21, 15,-18,-10, 0,-16, 4, 28, -4, -5,-14,-24,-12, 0; /M: SY='G'; M= 0, -8,-28, -8,-14,-29, 57,-14,-38,-18,-29,-19, 1,-18,-16,-18, 3,-16,-28,-22,-27,-15; /M: SY='F'; M=-16,-29,-21,-37,-28, 55,-31,-19, 9,-28, 15, 5,-22,-29,-33,-20,-20, -9, 7, 2, 24,-28; /M: SY='L'; M= -9,-21,-18,-26,-19, 9,-26,-16, 11,-19, 21, 16,-20,-24,-16,-12,-15, 2, 9,-18, 2,-18; /M: SY='L'; M= -8,-29, -8,-32,-24, 3,-31,-24, 23,-28, 30, 16,-27,-29,-22,-22,-22, -8, 19,-24, -4,-24; /M: SY='Q'; M= -3, -7,-23, -9, 6,-23,-21, -7, -5, -4, -8, -1, -6,-12, 19, -5, 0, 1, -9,-24,-11, 12; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='A'; M= 28,-10,-13,-16,-10,-16, 3,-17,-10,-11, -9, -8, -9, -7,-11,-17, 6, 0, -3,-19,-17,-11; D=-12; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='R'; M=-13,-10,-21, -9, 0, -7,-18, -5,-12, 6, 1, -2, -7,-17, 0, 24,-12, -8,-10,-16, -5, -2; D=-12; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='K'; M= -3, 2,-18, 2, 4,-12,-12, -4,-13, 6,-11, -7, -1,-10, 2, 2, -4, -5,-10,-14, -3, 3; D=-12; /I: I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25; /M: SY='E'; M= 1, 1,-21, 0, 7,-19, 3, 0,-22, -4,-17,-13, 2,-10, -1, -5, 0, -6,-19,-15,-12, 3; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='D'; M= -5, 13,-24, 15, 13,-24, -3, -4,-27, -1,-23,-19, 12,-11, 3, -2, 7, -2,-23,-31,-18, 8; /M: SY='N'; M= -9, 7,-25, 1, -3,-22, -6, -4,-21, 4,-24,-14, 16, -6, -2, 6, 2, 0,-21,-29,-16, -4; /M: SY='D'; M= -3, -1,-25, 2, 2,-20,-11,-13,-13, -7,-11,-10, -3, -3, -5,-10, -2, -4,-12,-28,-16, -3; /M: SY='A'; M= 1, -8,-21,-10, -9,-19, -4,-15, -8, -8,-14, -8, -4,-10, -8,-10, 1, -4, -2,-28,-17, -9; /M: SY='G'; M= -4, 1,-24, 1, -3,-21, 6, -2,-23, -8,-19,-12, 4,-16, -2, -6, 2, -7,-18,-27,-15, -3; /M: SY='S'; M= 0, -6,-17, -7, -6,-21, 2,-15,-22, -4,-23,-14, -2, -5, -5, -8, 7, 1,-16,-27,-18, -6; /M: SY='E'; M= -7, -1,-27, 1, 8,-13,-14, -8,-18, -5,-17,-14, -2, -2, 0, -7, -2, -7,-18,-18,-10, 4; /M: M= -5, -6,-25, -7, 0,-14,-14, -9,-12, -6,-13, -9, -6,-15, -3, -5, -4, -3,-10,-11, -8, -2; /M: SY='G'; M= -4, -3,-24, -2, -7,-17, 3,-13,-18, -9,-16,-12, -4,-18, -6, -9, -2, -8,-13,-15,-13, -6; /M: SY='P'; M= -4, -7,-24, -7, -7,-15,-15, -6, -9,-13,-15, -9, -6, 2, -7,-15, 2, 0, -8,-26, -9, -9; /M: SY='A'; M= 1,-16,-22,-17,-11, -1, -9,-16, -7,-15, -5, -2,-14, -5,-14,-17, -7, -8, -5,-19, -9,-12; /M: SY='G'; M= -3, 1,-23, 0, -7,-22, 15,-13,-22,-10,-18,-14, 5,-17, -9,-10, 3, -4,-17,-27,-19, -8; /M: SY='N'; M= -7, 0,-23, 0, -7,-17, -6,-12,-18, -7,-15,-13, 2,-15, -8, -3, 2, 2,-13,-20,-13, -8; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='F'; M= -9,-15,-14,-21,-15, 29,-17,-12, -1,-12, 2, -1,-10,-16,-17, -6, -9, -4, -1, 3, 11,-15; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='Q'; M= -7, 2,-21, 5, 9,-22, -9, -2,-17, 3,-13, -7, 0, -7, 14, 3, -1, -5,-16,-20,-11, 11; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='L'; M=-10, -9,-21, -9, -7, 0,-21,-10, 4,-15, 7, 1, -8,-14,-11,-14,-11, -7, -1,-20, -3,-10; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: M= 0, -9,-19,-11, -6, -7,-12,-10, -3, -9, -6, -2, -7,-10, -5, -9, 0, -3, -3,-19, -6, -6; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='D'; M= -8, 7,-25, 9, 3,-24,-11, -2,-16, -4,-20,-12, 6, -9, 6, -7, 3, -3,-15,-29,-12, 3; /M: SY='D'; M= -7, 6,-24, 9, 7,-21,-10, -6,-17, -6,-13,-12, 3,-11, 2, -9, 0, -4,-16,-28,-12, 4; /M: SY='E'; M= -4, -2,-23, -1, 5,-20,-15, -4,-14, -3,-10, -7, -2,-13, 4, -4, 1, 0,-12,-27,-11, 4; /M: SY='E'; M=-10, 0,-27, 3, 8,-17,-20,-10,-12, -5, -3, -7, -5, -9, 0, -8,-11,-10,-15,-20,-11, 4; /M: SY='T'; M= -7, -7, 1,-13,-13, -7,-18,-16,-10,-14, -4, -5, -5,-21,-12,-11, 0, 13, -4,-28,-10,-13; /M: SY='Q'; M= -7, -5,-18, -9, -4,-23, -6,-10,-18, 0,-18, -8, 0,-15, 6, 4, 3, 5,-15,-25,-14, 0; /M: SY='F'; M=-12,-10, -4,-14, -7, 7,-16,-13,-16,-12,-10, -8, -7,-17,-12,-12, -8, -9,-14,-19, -5, -8; /M: SY='P'; M= -8, 0, -8, -1, 0,-22,-16, -7,-18, -6,-19, -7, -1, 3, -1,-10, 2, 1,-16,-33,-17, -2; /M: SY='S'; M= -5, 3,-23, 2, -2,-14, 0,-12,-19,-11,-19,-15, 4, -9, -7,-13, 5, 0,-16,-26,-14, -5; /M: SY='N'; M= -7, 5,-18, 0, -5,-20, -8, -7,-15, -2,-19, -9, 11,-11, -3, 0, 1, -3,-14,-30,-16, -5; /M: SY='C'; M= 0,-12, 40,-18,-12,-20,-18,-13,-22,-14,-16,-13,-12,-25, -9,-15, -4, -7,-11,-33,-17,-11; /M: SY='P'; M= -6, -7,-18, -7, -6,-22,-11,-14,-10,-12,-18,-11, -3, 8, -6,-15, -1, -6,-12,-31,-20, -8; /M: SY='S'; M= -1, 4,-16, -2, -8,-15,-12, -6, -9,-10,-16,-11, 10,-13, -8,-10, 11, 10, -3,-34,-15, -8; /M: SY='A'; M= 16,-10,-15,-16,-11,-15, -9, -3, -6,-13, -8, -2, -7,-15, -8,-15, 6, 3, 1,-26,-11,-11; /M: SY='V'; M= 5,-22,-15,-26,-21, -3,-24,-24, 15,-12, 4, 6,-21,-23,-20,-15, -8, -1, 26,-24, -9,-21; /M: SY='T'; M= -1, -1,-15, -4, 1,-16,-14, -8,-17, -3,-18,-11, 3,-11, -1, -1, 19, 24, -9,-32,-12, -1; /M: SY='H'; M=-14, 4,-29, 4, 11,-22,-18, 56,-26, -1,-20, -6, 9,-15, 14, 1, -5,-14,-28,-27, 7, 10; /M: SY='S'; M= 12, -5,-15, -9, -6,-18,-11,-16,-11, -5,-16,-11, -3, -8, -5, -9, 14, 14, -3,-29,-15, -6; /M: SY='N'; M= -8, 12,-22, 8, 1,-21,-12, -2,-16, -1,-21,-14, 17,-11, -1, -2, 7, 4,-15,-33,-14, -2; /M: SY='T'; M= -4, 2,-23, 2, 2,-21,-13, -5,-19, -2,-18,-13, 2, 0, -3, -5, 4, 5,-14,-30,-15, -2; /M: SY='R'; M= -8, -2,-22, -6, -1,-11,-11, -8,-16, 0,-11, -9, 5,-17, -3, 8, 0, 0,-14,-26,-11, -3; /M: SY='P'; M=-10, 0,-30, 8, 6,-27,-16,-10,-25, 5,-24,-17, -4, 20, -1, 5, -4, -7,-22,-29,-20, 0; /M: SY='K'; M=-11, -6,-28, -6, 3,-23,-21,-10,-23, 32,-19, -5, -4, -9, 5, 27,-10, -6,-16,-21,-10, 3; /M: SY='T'; M= -6, 0,-20, -4, 1,-19,-20, -9,-12, -2,-10, -6, 0,-13, 9, -1, 6, 17,-10,-27,-10, 4; /M: SY='R'; M= -8, 2,-25, 2, 10,-22,-11, 4,-24, 5,-20,-12, 4,-13, 10, 12, 2, -1,-21,-25,-10, 8; /M: SY='I'; M= -3,-28,-20,-34,-27, 0,-32,-27, 35,-25, 19, 16,-24,-24,-22,-24,-16, -6, 32,-23, -5,-27; /M: SY='Q'; M= -3, 2,-22, 1, 8,-25,-16, 0,-19, 4,-19,-10, 2,-10, 13, 0, 8, 7,-16,-28,-11, 10; /M: SY='F'; M=-10,-29,-17,-33,-27, 29,-30,-21, 17,-24, 19, 13,-25,-29,-28,-19,-19, -7, 20,-12, 9,-26; /M: SY='F'; M=-10,-10,-22,-13,-11, 8,-21,-12, -3,-14, -3, 1, -8,-16,-13,-13, -6, 0, -3,-12, 3,-11; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='V'; M= -6,-10,-21,-15,-12,-13,-25,-18, 7, -3, -5, 1, -7,-17, -8, -8, -4, 5, 10,-26, -8,-11; /M: SY='A'; M= 41,-11,-13,-19,-10,-20, -3,-20,-10,-10,-12,-10,-11, -2,-10,-20, 8, 0, -1,-22,-21,-10; /M: SY='P'; M=-10,-17,-40, -7, 1,-30,-20,-19,-21,-10,-30,-20,-18, 86,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30, -9; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='P'; M= 2, -2,-22, 1, 10,-23,-12,-10,-18, 3,-20,-14, -2, 11, 2, -5, 3, -3,-16,-25,-18, 5; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='D'; M= 1, 8,-21, 9, 0,-22, -4, -9,-19, -7,-21,-17, 6, -1, -6,-12, 7, 0,-15,-28,-16, -4; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='G'; M= 0,-10,-24,-11,-12,-11, 19,-16,-22,-14,-13,-11, -5,-19,-14,-13, -1, -8,-16,-19,-13,-13; /M: SY='S'; M= -1, -7,-12, -8, -4,-18,-15,-12,-12, -8,-17,-11, -3, -5, -4, -8, 12, 10, -5,-33,-16, -5; /M: SY='G'; M= -4, 1,-30, 4, -9,-31, 49,-15,-39,-12,-30,-21, 4,-17,-14,-15, 0,-17,-30,-24,-27,-11; /M: SY='C'; M=-11, -2, 45, -7, -7,-24,-22, -3,-28,-14,-21,-16, -1,-26, -5,-14, -4, -8,-19,-40,-19, -6; /M: SY='V'; M= 0,-28,-15,-31,-29, -1,-31,-29, 32,-22, 11, 11,-26,-26,-26,-22,-11, -1, 42,-27, -8,-29; /M: SY='Q'; M= -5,-11,-21,-14, -7,-13,-21,-10, 0, -5, -4, 0, -6,-19, 3, -3, -2, -1, 0,-23, -5, -4; /M: SY='F'; M=-16,-30,-21,-37,-28, 53,-31,-21, 11,-30, 20, 7,-23,-29,-33,-21,-22,-10, 7, -1, 19,-28; /M: SY='R'; M=-10, -9,-23,-12, -6,-12,-19, -7,-10, 10, -8, 2, -4,-19, -1, 18, -7, -3, -6,-22, -6, -5; /M: SY='A'; M= 44,-12, -5,-21,-12,-19, -3,-21, -8,-11, -9, -9,-12,-13,-12,-20, 8, 0, 3,-22,-20,-12; /M: SY='T'; M= 1, -2,-12,-10,-10,-11,-14,-17,-10,-10,-11, -6, 0,-11, -8,-10, 19, 37, -2,-30,-11, -9; /M: SY='V'; M= 0,-28,-17,-33,-28, 2,-31,-29, 32,-23, 12, 11,-25,-25,-26,-23,-12, -4, 37,-24, -6,-28; /M: SY='V'; M= 7,-20,-14,-23,-20, -5,-22,-20, 12,-12, 1, 4,-19,-22,-17,-15, -4, 2, 23,-21, -3,-19; /M: SY='Q'; M=-11, 0,-28, 2, 21,-27,-21, 10,-20, 9,-15, -5, -2,-11, 29, 5, -4, -8,-24,-22, -6, 24; /M: SY='H'; M= -5, 2,-23, -1, 0,-22, -8, 9,-24, 7,-23,-10, 7,-15, 2, 9, 5, -1,-18,-28,-10, 0; /M: SY='R'; M=-13,-11,-30,-10, -4, -9, -3, -4,-23, 5,-18,-11, -6,-13, -2, 11, -9,-12,-21,-10, 3, -5; /M: SY='Q'; M= -5, -2,-25, -3, -2,-17,-16, -5,-11, -1,-12, -6, -2,-16, 1, -2, -4, -5, -9,-23, -6, -2; /M: SY='V'; M= -2,-22,-21,-25,-17, -8,-29,-23, 23,-16, 6, 8,-19,-20,-13,-18,-10, -3, 24,-25, -8,-17; /M: SY='W'; M=-19,-29,-32,-33,-26, 37,-28,-11, -2,-21, -1, -4,-25,-29,-23,-18,-24,-15, -9, 50, 42,-24; /M: SY='W'; M=-19,-32,-34,-37,-28, 38,-24,-20,-11,-23, -7,-10,-27,-29,-27,-19,-26,-18,-16, 73, 29,-23; /M: SY='V'; M= 0,-17,-17,-20,-11,-11,-23,-15, 9, -7, 3, 11,-18,-20, -5, -9, -8, -3, 15,-25, -9, -8; /M: SY='D'; M=-12, 22,-29, 32, 9,-34, 8, -7,-37, 5,-30,-23, 10,-12, -2, -4, 0,-11,-27,-31,-20, 3; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='D'; M= -6, 3,-20, 7, 3,-17,-17, -7, -3, -9, -8, -7, -2,-12, -5,-12, -2, -5, -1,-26,-10, -2; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='G'; M= -4, -6,-26, -3, -4,-25, 28,-13,-29,-10,-24,-17, -2, 4, -9,-11, -1,-12,-24,-21,-23, -8; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='S'; M= 5, -8,-20,-11, -8,-11, -6,-15,-13,-10,-19,-12, -1, -1,-10,-11, 9, 1, -9,-27,-15,-10; /M: SY='L'; M= -7,-25,-20,-26,-17, 1,-29,-20, 17,-22, 29, 13,-24,-25,-15,-15,-20, -6, 12,-22, -4,-17; /M: SY='T'; M= 3, -8,-17,-12, -8,-12,-16,-18,-10, -7,-15,-10, -4, -1, -9, -8, 11, 18, -4,-27,-13, -9; /M: SY='K'; M= -6,-11,-22,-12, -4,-18,-23,-14, -6, 11, -8, -1,-10,-17, 2, 4, -6, -2, 1,-24, -9, -1; /M: SY='R'; M=-10, -6,-28, -5, 4,-24,-18, -8,-15, 9,-17, -7, -4, -5, 8, 12, -6, -7,-13,-25,-14, 4; /M: SY='I'; M= -8,-23,-23,-26,-20, -1,-27,-21, 19,-22, 14, 11,-19, -9,-18,-20,-16, -6, 13,-24, -7,-21; /M: SY='C'; M= -1,-16, 68,-23,-23,-17,-24,-25,-19,-22,-11,-13,-16,-32,-23,-24, -8, -8, -4,-40,-23,-23; /M: SY='E'; M= -5, -4,-26, 0, 23,-20,-19, -7,-18, 2,-13,-12, -6, -2, 7, 2, -3, -7,-17,-26,-15, 14; /M: SY='Q'; M=-11, -4,-30, -1, 13,-27,-17, 3,-19, 3,-16, -7, -4, 0, 17, 5, -5,-10,-22,-25,-12, 13; /M: SY='D'; M= -8, 6,-24, 8, 4,-18, -2, -9,-22, -2,-19,-14, 4,-15, -4, -6, 0, -7,-16,-27,-15, 1; /M: SY='A'; M= 4, -8,-21,-10, -9,-17,-12,-17, -7,-11,-10, -6, -8, 1,-10,-12, 1, 4, -4,-27,-16,-11; /M: SY='D'; M= -5, 11,-21, 12, -1,-21,-14,-12,-17, -8,-18,-16, 6, 0, -8,-12, 7, 10,-11,-34,-17, -5; /M: SY='A'; M= 5, -9,-21,-10, -5,-10,-12,-15,-13, -9,-11, -9, -9, -2, -8,-13, -1, 0, -9,-21,-11, -7; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='E'; M= 1, -2,-24, 0, 7,-22,-16,-12,-14, 2,-15,-11, -5, -1, -2, -4, -2, -5,-10,-28,-17, 1; /M: SY='A'; M= 9, 1,-22, 1, -1,-25, -1,-13,-21, -3,-20,-15, 1, 1, -6,-10, 3, -4,-16,-27,-20, -4; /M: SY='T'; M= 3,-10,-18,-13, -8,-13,-13,-16, -7,-11, -9, -6,-10, -5, -9,-13, 5, 12, -1,-25,-10, -9; /M: SY='Q'; M= 0, 1,-19, -1, 4,-23,-16, -8,-13, -1,-15, -8, -1,-12, 11, -4, 8, 10, -9,-28,-13, 8; /M: SY='E'; M= -5, 0,-27, 4, 6,-21,-14, -1,-20, -1,-20,-13, -3, 2, 1, -7, -2, -8,-18,-25,-11, 3; /M: SY='P'; M= -9,-10,-32, -4, 11,-23,-20,-11,-20, 2,-21,-13,-11, 34, 0, -6, -5, -6,-23,-26,-17, 3; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 26 in 26 different sequences |
Number of true positive hits | 26 in 26 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 0 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | CJA_Sigrist |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | Reelin |
Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
26 sequences
DFP11_HYPCU (O96382), DFP11_SAMRI (Q765V4), DFP1_ANTMY (Q0Q029), DFP1_LONON (Q5MGQ0), DFP2_ANTMY (P0C963), DFP3_ANTMY (Q0Q028), DFP_BOMMO (Q008X1), DFP_DROME (Q9V3Y3), DFP_LOCMI (Q25313), DFP_MANSE (Q86RS3), FRRS1_BOVIN (A2VE04), FRRS1_DANRE (A4QP81), FRRS1_DROME (Q8MSU3), FRRS1_HUMAN (Q6ZNA5), FRRS1_MOUSE (Q8K385), FRRS1_XENLA (Q6INU7), RELD1_HUMAN (A0A1B0GV85), RELN_HUMAN (P78509), RELN_MOUSE (Q60841), RELN_RAT(P58751), SPON1_BOVIN (Q9GLX9), SPON1_CHICK (Q9W770), SPON1_HUMAN (Q9HCB6), SPON1_MOUSE (Q8VCC9), SPON1_RAT (P35446), SPON1_XENLA (P35447)» more
|
PDB [Detailed view] |
3 PDB
2ZOT; 2ZOU; 3COO |