PROSITE entry PS51031
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | BESS |
| Accession [info] | PS51031 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-OCT-2004 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 08-NOV-2023 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51031 |
| Associated ProRule [info] | PRU00371 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | BESS domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0466623; R2=0.0221417; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1843.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=337; H_SCORE=1843; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=202; H_SCORE=1843; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='E'; M= -8, 2,-25, 0, 5,-19,-11, -7,-18, 2,-13, -9, 5, -8, 0, 4, -3, -4,-17,-28,-15, 2; /M: SY='D'; M=-13, 33,-26, 44, 14,-29,-12, 0,-30, -3,-24,-23, 14,-11, -2,-10, 1, -4,-22,-35,-16, 6; /M: SY='E'; M= 5, -1,-22, 1, 10,-22, -8,-12,-21, -3,-22,-17, -3, 5, -2,-10, 8, -1,-16,-29,-19, 4; /M: SY='D'; M=-17, 28,-21, 37, 8,-23,-15, -3,-25, -6,-19,-18, 12,-15, -4,-11, -4, -9,-21,-32,-11, 2; /M: SY='Q'; M=-10, 2,-24, 3, 3,-14,-19, 2,-16, -1,-11, -6, -1,-16, 6, 0, -2, 0,-15,-19, 3, 3; /M: SY='L'; M= -3,-11,-21,-14, -7, -2,-14, 0, -4,-14, 5, 2, -7,-21, -8,-12, -7, -6, -7,-19, 3, -8; /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28, 71,-30,-13, 0,-26, 8, 0,-20,-30,-34,-18,-20,-10, -2, 14, 39,-28; /M: SY='F'; M= -8,-24, -2,-28,-22, 17,-17,-20, -2,-27, 15, 2,-19,-28,-24,-20,-15, -8, -1,-18, -1,-22; /M: SY='L'; M=-10,-11,-24,-11, -4,-10,-24,-11, 1, -7, 12, 9,-13,-19, -3, -4,-16,-10, -3,-23, -6, -4; /M: SY='S'; M= 7, -4,-12, -5, -5,-17, -3,-13,-13,-12,-23,-13, 5,-12, -4,-12, 30, 18, -5,-36,-17, -5; /M: SY='L'; M= -7,-27,-22,-32,-22, 5,-30,-21, 25,-25, 28, 19,-24,-25,-16,-21,-21, -9, 17,-19, -1,-20; /M: SY='V'; M= 0,-17, -9,-21,-16, -8,-18,-10, 1,-13, 3, 4,-15,-22,-13,-12, -9, -4, 6,-24, -6,-16; /M: SY='P'; M= -4,-11,-32, -4, 0,-26,-17,-17,-17, -8,-21,-16,-13, 47, -8,-14, -6, -8,-21,-29,-24, -7; /M: SY='Y'; M=-10, -2,-24, -2, 0, -6,-20, 5,-13, -5, -8, -2, -4,-17, 3, -6, -5, -2,-13,-16, 8, 1; /M: SY='M'; M= -8,-27,-20,-32,-24, 3,-29,-19, 28,-23, 28, 29,-25,-25,-17,-19,-21, -8, 22,-22, -2,-21; /M: SY='R'; M=-11, -2,-29, -3, 7,-27,-18, -3,-27, 32,-24, -9, 2,-14, 17, 37, -7, -9,-21,-21,-11, 10; /M: SY='Q'; M= -3, 2,-21, -1, 5,-24, -9, 1,-22, 4,-22,-12, 7,-12, 11, 6, 10, 5,-18,-28,-13, 7; /M: SY='M'; M= -9,-25,-19,-30,-21, 5,-25,-12, 21,-20, 33, 38,-25,-25,-12,-15,-24, -9, 13,-21, -1,-16; /M: SY='P'; M= -3, 1,-19, 1, -3,-24, -6,-12,-22, -7,-25,-18, 4, 15, -7,-10, 7, 4,-20,-32,-22, -7; /M: SY='P'; M= -3,-13,-27,-11, -3,-16,-13,-13,-11, -8, -9, -4,-13, 12, -5, -8, -8, -8,-12,-24,-16, -6; /M: SY='R'; M= -4, 0,-24, 1, 6,-20,-16, -5,-21, 11,-19,-11, -1,-13, 3, 12, -2, -6,-14,-24,-11, 4; /M: SY='Q'; M= -8, -5,-25, -5, 8,-19,-19, 0,-16, 3,-11, -5, -3,-14, 17, 9, -2, -6,-17,-23, -8, 12; /M: SY='R'; M= -4, 0,-26, -4, 3,-24,-15, -5,-25, 26,-23,-11, 6,-15, 8, 32, -4, -7,-19,-22,-13, 4; /M: SY='L'; M= -2,-16,-21,-18, -7, -9,-18,-13, 0, -7, 7, 7,-13,-19, -6, -2,-10, -5, 0,-23, -9, -8; /M: SY='R'; M=-14, -3,-28, -1, 10,-14,-22, 3,-19, 12,-12, -7, -4,-15, 3, 13,-11,-11,-17,-19, -1, 5; /M: SY='F'; M= 2,-24,-17,-30,-23, 18,-17,-21, 8,-21, 8, 7,-19,-24,-24,-20,-11, -7, 12,-13, 1,-23; /M: SY='R'; M=-14, -3,-30, -2, 10,-27,-20, 0,-29, 36,-25, -9, 0,-13, 15, 38, -9,-10,-22,-21, -9, 10; /M: SY='I'; M= -2,-14,-20,-18,-12, -9,-20,-10, 5,-11, -5, 4, -8,-17, -3,-10, 1, 0, 5,-25, -6, -9; /M: SY='K'; M= -7, -2,-29, -1, 15,-27,-13, -2,-28, 20,-23,-12, -2,-11, 12, 18, -6,-11,-23,-16,-11, 13; /M: SY='I'; M= -8,-27,-14,-34,-27, 6,-32,-25, 29,-24, 15, 17,-23,-25,-22,-23,-16, -5, 26,-22, -2,-26; /M: SY='M'; M= -5,-17,-22,-21,-11, -6,-17, -7, 3,-11, 8, 16,-15,-20, 2, -8,-11, -8, -2,-17, 0, -5; /M: SY='Q'; M= -8, 7,-26, 5, 9,-25,-12, 1,-21, 10,-21,-11, 9,-14, 16, 10, 0, -7,-22,-24,-10, 11; /M: SY='L'; M= -7,-28,-16,-32,-24, 4,-32,-22, 26,-26, 28, 17,-25,-26,-20,-23,-22, -9, 18,-20, 1,-24; /M: SY='L'; M= -9,-30,-22,-33,-24, 6,-33,-24, 30,-29, 38, 19,-27,-27,-21,-23,-25, -9, 19,-21, -1,-24; /M: M= -8, -2,-18, -1, -1,-13,-13,-11,-15, -4,-11, -8, -3,-16, -5, -3, 0, -1,-10,-27,-11, -3; /M: SY='E'; M=-10, 16,-27, 23, 26,-30,-12, -2,-28, 8,-24,-16, 7, -8, 11, 0, 3, -6,-24,-31,-17, 18; /M: SY='L'; M= -5,-15,-21,-19, -6, 5,-24,-11, 3,-14, 6, 5,-14,-18, -8,-13, -9, -1, 0,-15, 5, -8; /M: SY='E'; M=-11, -9,-19, -8, 6,-11,-23,-10,-10, -1, -1, -1,-10,-17, 1, 0,-11, -9, -9,-23, -8, 3; /M: SY='Q'; M=-13, -5,-28, -3, 1,-12,-23, -2, -9, -5, -3, -4, -7,-10, 2, -2,-11, -8,-13,-19, 1, 0; /M: SY='R'; M= -8, 0,-25, 0, 6,-20,-17, -7,-20, 8,-17,-11, 2, -7, 6, 9, -1, -2,-18,-25,-13, 5; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 2 in 2 different sequences |
| Number of true positive hits | 2 in 2 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | BESS |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
2 sequences
ADF1_DROME (P05552), SUV37_DROME (P20193)
|