PROSITE logo

PROSITE entry PS51031


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry

Entry name [info] BESS
Accession [info] PS51031
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-OCT-2004 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE;
29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51031
Associated ProRule [info] PRU00371

Name and characterization of the entry

Description [info] BESS domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=40;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=36;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0466623; R2=0.0221417; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1843.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=337; H_SCORE=1843; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=202; H_SCORE=1843; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='E';  M= -8,  2,-25,  0,  5,-19,-11, -7,-18,  2,-13, -9,  5, -8,  0,  4, -3, -4,-17,-28,-15,  2;
/M: SY='D';  M=-13, 33,-26, 44, 14,-29,-12,  0,-30, -3,-24,-23, 14,-11, -2,-10,  1, -4,-22,-35,-16,  6;
/M: SY='E';  M=  5, -1,-22,  1, 10,-22, -8,-12,-21, -3,-22,-17, -3,  5, -2,-10,  8, -1,-16,-29,-19,  4;
/M: SY='D';  M=-17, 28,-21, 37,  8,-23,-15, -3,-25, -6,-19,-18, 12,-15, -4,-11, -4, -9,-21,-32,-11,  2;
/M: SY='Q';  M=-10,  2,-24,  3,  3,-14,-19,  2,-16, -1,-11, -6, -1,-16,  6,  0, -2,  0,-15,-19,  3,  3;
/M: SY='L';  M= -3,-11,-21,-14, -7, -2,-14,  0, -4,-14,  5,  2, -7,-21, -8,-12, -7, -6, -7,-19,  3, -8;
/M: SY='F';  M=-20,-28,-22,-36,-28, 71,-30,-13,  0,-26,  8,  0,-20,-30,-34,-18,-20,-10, -2, 14, 39,-28;
/M: SY='F';  M= -8,-24, -2,-28,-22, 17,-17,-20, -2,-27, 15,  2,-19,-28,-24,-20,-15, -8, -1,-18, -1,-22;
/M: SY='L';  M=-10,-11,-24,-11, -4,-10,-24,-11,  1, -7, 12,  9,-13,-19, -3, -4,-16,-10, -3,-23, -6, -4;
/M: SY='S';  M=  7, -4,-12, -5, -5,-17, -3,-13,-13,-12,-23,-13,  5,-12, -4,-12, 30, 18, -5,-36,-17, -5;
/M: SY='L';  M= -7,-27,-22,-32,-22,  5,-30,-21, 25,-25, 28, 19,-24,-25,-16,-21,-21, -9, 17,-19, -1,-20;
/M: SY='V';  M=  0,-17, -9,-21,-16, -8,-18,-10,  1,-13,  3,  4,-15,-22,-13,-12, -9, -4,  6,-24, -6,-16;
/M: SY='P';  M= -4,-11,-32, -4,  0,-26,-17,-17,-17, -8,-21,-16,-13, 47, -8,-14, -6, -8,-21,-29,-24, -7;
/M: SY='Y';  M=-10, -2,-24, -2,  0, -6,-20,  5,-13, -5, -8, -2, -4,-17,  3, -6, -5, -2,-13,-16,  8,  1;
/M: SY='M';  M= -8,-27,-20,-32,-24,  3,-29,-19, 28,-23, 28, 29,-25,-25,-17,-19,-21, -8, 22,-22, -2,-21;
/M: SY='R';  M=-11, -2,-29, -3,  7,-27,-18, -3,-27, 32,-24, -9,  2,-14, 17, 37, -7, -9,-21,-21,-11, 10;
/M: SY='Q';  M= -3,  2,-21, -1,  5,-24, -9,  1,-22,  4,-22,-12,  7,-12, 11,  6, 10,  5,-18,-28,-13,  7;
/M: SY='M';  M= -9,-25,-19,-30,-21,  5,-25,-12, 21,-20, 33, 38,-25,-25,-12,-15,-24, -9, 13,-21, -1,-16;
/M: SY='P';  M= -3,  1,-19,  1, -3,-24, -6,-12,-22, -7,-25,-18,  4, 15, -7,-10,  7,  4,-20,-32,-22, -7;
/M: SY='P';  M= -3,-13,-27,-11, -3,-16,-13,-13,-11, -8, -9, -4,-13, 12, -5, -8, -8, -8,-12,-24,-16, -6;
/M: SY='R';  M= -4,  0,-24,  1,  6,-20,-16, -5,-21, 11,-19,-11, -1,-13,  3, 12, -2, -6,-14,-24,-11,  4;
/M: SY='Q';  M= -8, -5,-25, -5,  8,-19,-19,  0,-16,  3,-11, -5, -3,-14, 17,  9, -2, -6,-17,-23, -8, 12;
/M: SY='R';  M= -4,  0,-26, -4,  3,-24,-15, -5,-25, 26,-23,-11,  6,-15,  8, 32, -4, -7,-19,-22,-13,  4;
/M: SY='L';  M= -2,-16,-21,-18, -7, -9,-18,-13,  0, -7,  7,  7,-13,-19, -6, -2,-10, -5,  0,-23, -9, -8;
/M: SY='R';  M=-14, -3,-28, -1, 10,-14,-22,  3,-19, 12,-12, -7, -4,-15,  3, 13,-11,-11,-17,-19, -1,  5;
/M: SY='F';  M=  2,-24,-17,-30,-23, 18,-17,-21,  8,-21,  8,  7,-19,-24,-24,-20,-11, -7, 12,-13,  1,-23;
/M: SY='R';  M=-14, -3,-30, -2, 10,-27,-20,  0,-29, 36,-25, -9,  0,-13, 15, 38, -9,-10,-22,-21, -9, 10;
/M: SY='I';  M= -2,-14,-20,-18,-12, -9,-20,-10,  5,-11, -5,  4, -8,-17, -3,-10,  1,  0,  5,-25, -6, -9;
/M: SY='K';  M= -7, -2,-29, -1, 15,-27,-13, -2,-28, 20,-23,-12, -2,-11, 12, 18, -6,-11,-23,-16,-11, 13;
/M: SY='I';  M= -8,-27,-14,-34,-27,  6,-32,-25, 29,-24, 15, 17,-23,-25,-22,-23,-16, -5, 26,-22, -2,-26;
/M: SY='M';  M= -5,-17,-22,-21,-11, -6,-17, -7,  3,-11,  8, 16,-15,-20,  2, -8,-11, -8, -2,-17,  0, -5;
/M: SY='Q';  M= -8,  7,-26,  5,  9,-25,-12,  1,-21, 10,-21,-11,  9,-14, 16, 10,  0, -7,-22,-24,-10, 11;
/M: SY='L';  M= -7,-28,-16,-32,-24,  4,-32,-22, 26,-26, 28, 17,-25,-26,-20,-23,-22, -9, 18,-20,  1,-24;
/M: SY='L';  M= -9,-30,-22,-33,-24,  6,-33,-24, 30,-29, 38, 19,-27,-27,-21,-23,-25, -9, 19,-21, -1,-24;
/M:         M= -8, -2,-18, -1, -1,-13,-13,-11,-15, -4,-11, -8, -3,-16, -5, -3,  0, -1,-10,-27,-11, -3;
/M: SY='E';  M=-10, 16,-27, 23, 26,-30,-12, -2,-28,  8,-24,-16,  7, -8, 11,  0,  3, -6,-24,-31,-17, 18;
/M: SY='L';  M= -5,-15,-21,-19, -6,  5,-24,-11,  3,-14,  6,  5,-14,-18, -8,-13, -9, -1,  0,-15,  5, -8;
/M: SY='E';  M=-11, -9,-19, -8,  6,-11,-23,-10,-10, -1, -1, -1,-10,-17,  1,  0,-11, -9, -9,-23, -8,  3;
/M: SY='Q';  M=-13, -5,-28, -3,  1,-12,-23, -2, -9, -5, -3, -4, -7,-10,  2, -2,-11, -8,-13,-19,  1,  0;
/M: SY='R';  M= -8,  0,-25,  0,  6,-20,-17, -7,-20,  8,-17,-11,  2, -7,  6,  9, -1, -2,-18,-25,-13,  5;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_05 which contains 572'214 sequence entries.


Total number of hits 2 in 2 different sequences
Number of true positive hits 2 in 2 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] BESS
Version [info] 5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
2 sequences

ADF1_DROME  (P05552), SUV37_DROME (P20193)