PROSITE entry PS51032
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | AP2_ERF |
| Accession [info] | PS51032 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-NOV-2004 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51032 |
| Associated ProRule [info] | PRU00366 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | AP2/ERF domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=59; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=54; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.0207132; R2=0.0131758; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3659.0209961; R2=3.5366492; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=568; H_SCORE=5668; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=416; H_SCORE=5130; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='R'; M=-10,-12,-29,-14,-10,-20, -1, -8,-13, 6,-14, -1, -5,-18, -4, 8,-10,-13,-11,-21,-11, -9; /M: SY='Y'; M=-18,-19,-29,-19,-17, 22,-28, 19, -4,-13, 0, 0,-17,-19,-11,-11,-19,-11,-12, 13, 54,-18; /M: SY='R'; M=-15, -9,-28, -9, 1,-21,-21, -6,-25, 32,-21, -8, -3,-18, 7, 50,-10, -9,-14,-21,-10, 1; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='V'; M= 0,-27,-12,-28,-27, -2,-28,-28, 26,-20, 6, 8,-25,-27,-26,-20, -5, 1, 42,-30,-10,-27; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='R'; M=-15,-10,-27,-11, -5,-19,-11, -6,-25, 17,-18,-10, -2,-20, 2, 46, -6, -5,-14,-22,-12, -5; /M: SY='R'; M=-16, -5,-31, -4, 9,-25,-20, 5,-28, 24,-23,-10, -1, -8, 14, 39, -8,-11,-23,-22,-10, 8; /M: SY='R'; M=-19, -8,-30, -8, 0,-17,-21, 19,-26, 19,-19, -7, -1,-20, 11, 42,-10,-12,-21,-16, 5, 1; /M: SY='P'; M=-12, -5,-33, 2, 10,-28,-20,-10,-23, 7,-21,-14, -8, 26, 4, 3, -9,-10,-24,-27,-19, 5; /M: SY='W'; M= -6,-15,-34,-19,-17, -7, -4,-10,-22,-14,-22,-17, -9,-23,-12,-14,-14,-16,-25, 56, 6,-13; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='G'; M= -4, -3,-30, -1,-14,-30, 52, -5,-39,-17,-29,-19, 3,-19,-15,-17, -1,-19,-30,-23,-23,-15; /M: SY='R'; M=-12, -7,-29, -7, 1,-22,-12, -9,-25, 28,-18, -8, -3,-16, 4, 32,-11,-11,-18,-20,-11, 1; /M: SY='W'; M=-20,-37,-40,-40,-30, 33,-23,-27,-13,-23,-10,-13,-33,-30,-27,-20,-33,-23,-20,104, 30,-23; /M: SY='A'; M= 13, -5,-19, -6, -3,-17, -8,-12,-10, -8,-11, -8, -9,-15, -5,-14, 0, -5, -2,-20, -9, -5; /M: SY='A'; M= 34, -9, 1,-17, -9,-21, -5,-19,-15, -5,-15,-12, -8,-13, -9,-15, 8, 0, -4,-25,-20, -9; /M: SY='E'; M=-12, 6,-30, 12, 43,-30,-20, 11,-28, 10,-20,-14, 1, -5, 26, 7, -2,-11,-29,-27,-14, 33; /M: SY='I'; M= -8,-28,-27,-35,-28, -2,-26,-28, 35,-28, 16, 15,-20,-22,-21,-27,-18,-10, 23,-21, -4,-28; /M: SY='R'; M=-19,-19,-36,-19,-11, -9,-14, -8,-26, 10,-19,-13,-13,-23, -2, 33,-18,-16,-23, 31, 6, -8; /M: SY='D'; M=-10, 15,-23, 17, 10,-23,-14, 5,-20, -1,-20,-15, 13,-15, 0, -1, 3, -4,-14,-34,-14, 4; /I: I=-3; MD=-17; /M: SY='P'; M= -8,-16,-30, -9, -1,-23,-17,-17,-14, -3,-22,-14,-16, 57, -8,-12, -8, -8,-18,-24,-22, -8; D=-3; /I: I=-3; MD=-17; /M: SY='A'; M= 1, -6,-16,-13,-11, -4, -5,-11, -2,-10, -7, -4, 1,-14, -9, -7, 0, -3, -3,-17, -8,-11; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='R'; M= -6, -1,-19, -2, 5,-18, -8, -5,-18, 11,-15, -8, 0, -9, 8, 13, 0, 2,-14,-17,-10, 6; D=-3; /I: I=-3; DM=-17; /M: SY='K'; M= -4, 0,-24, -4, -1,-23, -7, 1,-26, 15,-24,-11, 5,-14, 2, 15, 1, -2,-18,-25,-11, -1; /I: I=-6; MD=-29; /M: SY='D'; M= -5, 6,-21, 9, 3,-23, 2, 3,-24, 4,-18,-11, 4,-11, 5, 5, -2, -9,-19,-19,-11, 3; D=-6; /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='K'; M= 2, -8,-19, -9, -2,-17,-15,-12,-13, 14,-12, -6, -6,-14, -1, 10, -2, -3, -5,-22,-11, -2; D=-6; /I: I=-6; DM=-29; /M: SY='R'; M=-19, -5,-30, -3, 3,-23,-19, 1,-30, 26,-21,-11, 1,-18, 14, 58, -8,-10,-22,-21,-11, 5; /M: SY='L'; M= -6,-21,-20,-23,-18, -5,-17,-21, 7,-14, 12, 6,-19,-24,-17, -9,-14, -3, 12,-23, -8,-18; /M: SY='W'; M=-17,-29,-41,-29,-22, 7,-20,-16,-18,-12,-18,-16,-27,-27,-13, -7,-26,-20,-24, 93, 29,-16; /M: SY='L'; M=-10,-27,-22,-27,-16, 4,-30,-17, 18,-26, 40, 18,-26,-27,-11,-17,-26,-10, 7,-20, -1,-14; /M: SY='G'; M= -2,-10,-30,-10,-18,-29, 61,-18,-39,-15,-29,-19, 0,-20,-17,-11, -1,-19,-29,-20,-28,-18; /M: SY='T'; M= 11, -2,-10,-11, -9,-13,-14,-19,-11,-10,-12,-11, -1,-10, -9,-12, 20, 37, -1,-29,-13, -9; /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-30,-25, 56,-30, -1, 0,-20, 5, 0,-20,-30,-25,-15,-20,-10, -5, 20, 54,-25; /M: SY='P'; M=-10, 8,-29, 18, 13,-28,-15,-10,-25, -6,-23,-20, -1, 23, -2,-13, 1, -5,-24,-34,-22, 4; /M: SY='T'; M= 1, 3,-11, -2, -6,-14,-15,-16,-14, -9,-16,-14, 4,-10, -7,-10, 23, 39, -4,-33,-13, -6; /M: SY='E'; M= 11, -1,-23, 0, 19,-24,-13,-10,-18, -3,-12,-12, -7, 0, 6,-10, 0, -6,-16,-25,-18, 12; /M: SY='E'; M= -7, 9,-28, 17, 40,-28,-19, 6,-25, 3,-18,-16, 1, -5, 13, -4, -1,-10,-24,-30,-15, 26; /M: SY='A'; M= 11, -3,-21, -4, 9,-23, -5, -8,-15, -4,-11, -2, -6,-10, 5,-10, 0, -7,-13,-24,-17, 7; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='R'; M=-15, -3,-28, 0, 8,-21,-21, 6,-21, 10,-13, -8, -2,-17, 9, 27, -8,-10,-16,-25, -9, 6; /M: SY='A'; M= 37, -7,-10,-16, -9,-18, -4,-19,-11,-10,-11,-11, -6,-10, -9,-17, 14, 12, -1,-24,-18, -9; /M: SY='Y'; M=-20,-17,-29,-18,-17, 26,-28, 31, -6,-12, -3, 0,-14,-28, -9, -9,-18,-12,-13, 17, 64,-17; /M: SY='D'; M=-12, 40,-28, 53, 16,-37, -9, 0,-34, 0,-27,-25, 19,-11, 4, -9, 2, -8,-27,-37,-19, 10; /M: SY='V'; M= 3,-15,-16,-16,-15, -6,-22,-19, 6,-12, 6, 2,-17,-22,-16,-14, -8, 0, 14,-23, -6,-16; /M: SY='A'; M= 42, -8,-12,-17, -7,-21, -2,-18,-13, -5,-13,-11, -8,-10, -7,-15, 11, 1, -3,-22,-19, -7; /M: SY='A'; M= 24,-14,-15,-20,-11, -9,-11,-19, -6, -4, -5, -5,-13,-15,-12,-12, -1, -3, 2,-18,-12,-11; /M: SY='L'; M=-10,-27,-24,-30,-21, 16,-27,-17, 8,-21, 22, 7,-24,-27,-19,-13,-23,-11, 2, 4, 11,-20; /M: SY='K'; M= -6, -3, -4, -4, 12,-26,-20,-10,-28, 18,-22,-14, -4,-14, 4, 15, -6, -9,-19,-27,-17, 7; /M: SY='F'; M=-16,-28,-23,-32,-24, 36,-31,-12, 12,-25, 22, 9,-23,-29,-24,-19,-23,-10, 4, 1, 28,-24; /M: SY='R'; M=-18, -4,-34, -1, -5,-18,-10, 8,-31, 3,-23,-15, -3,-20, -1, 18,-14,-17,-26, 10, 0, -4; /M: SY='G'; M= 4, -8,-27, -8, -7,-28, 35,-14,-32, -9,-24,-16, -2,-16, -5, -7, 1,-14,-24,-21,-24, -6; /M: SY='R'; M=-10,-16,-26,-14, -7,-16,-13,-12,-14, 0, -9, -7,-10, -2, -5, 15, -7, -7,-11,-25,-14, -9; /M: SY='D'; M= -4, 15,-23, 19, 4,-25,-10, -6,-25, 3,-19,-16, 9,-14, -1, 4, 2, -5,-18,-31,-16, 1; /M: SY='A'; M= 15, -8,-20,-12, -8,-21, 3, -4,-20, -8,-18,-12, -3, -6, -7, -7, 6, -1,-13,-25,-16, -9; /M: SY='V'; M= 2,-20, -7,-23,-15,-12,-24,-21, 5,-13, 3, 2,-19,-14,-11,-15,-10, -6, 9,-26,-12,-14; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='L'; M= -5,-19,-18,-23,-19, -1,-20,-22, 10,-22, 20, 7,-18,-22,-18,-18,-10, 8, 9,-24, -6,-19; /M: SY='N'; M= -8, 33,-20, 17, 1,-21, -2, 7,-21, 3,-30,-19, 51,-18, 1, 2, 11, 1,-27,-38,-19, 1; /M: SY='F'; M=-12,-23,-21,-31,-21, 46,-19,-16, -8,-20, 1, -3,-15,-25,-24,-11,-14,-10, -6, 0, 15,-20; /M: SY='P'; M= 1, -5,-29, 1, 11,-29,-14,-12,-21, -4,-24,-17, -7, 33, 3,-12, 1, -5,-23,-29,-23, 5; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 238 in 212 different sequences |
| Number of true positive hits | 238 in 212 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 1 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 99.58 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 2 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | N_Hulo |
| Feature key [info] | DNA_BIND |
| Feature description [info] | AP2/ERF |
| Version [info] | 6 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
212 sequences
ABI4_ARATH (A0MES8), ABI4_ORYSJ (C7J2Z1), ABR1_ARATH (Q9FGF8), AIL1_ARATH (Q1PFE1), AIL5_ARATH (Q6PQQ3), AIL6_ARATH (Q52QU2), AIL7_ARATH (Q6J9N8), ANT_ARATH (Q38914), AP21_ORYSI (B8AXC3), AP21_ORYSJ (Q2TQ34), AP22_ORYSI (B8AMA9), AP22_ORYSJ (Q84TB5), AP23_ORYSI (B8B8J2), AP23_ORYSJ (Q8H443), AP24_ORYSI (B8B0I8), AP24_ORYSJ (A0A0N7KMH0), AP2L1_ARATH (Q94AN4), AP2L3_ARATH (A0JPZ8), AP2L4_ARATH (Q8GWK2), AP2_ARATH (P47927), APL25_ORYSI (B8AVJ9), APL25_ORYSJ (A0A0N7KJT8), BBM1_BRANA (Q8L3U3), BBM2_BRANA (Q8LSN2), BBM_ARATH (Q6PQQ4), CRF1_ARATH (O82503), CRF2_ARATH (Q9SUQ2), CRF3_ARATH (Q9FK12), CRF4_ARATH (Q9SUE3), CRF5_ARATH (O82339), CRF6_ARATH (Q9M374), CRL5_ORYSJ (Q84Z02), DRE1A_ARATH (Q9M0L0), DRE1A_ORYSI (A2Z389), DRE1A_ORYSJ (Q64MA1), DRE1B_ARATH (P93835), DRE1B_ORYSI (Q8GUW4), DRE1B_ORYSJ (Q3T5N4), DRE1C_ARATH (Q9SYS6), DRE1C_ORYSI (A2Y8S6), DRE1C_ORYSJ (Q9LWV3), DRE1D_ARATH (Q9FJ93), DRE1D_ORYSI (Q6REU5), DRE1D_ORYSJ (Q6J1A5), DRE1E_ARATH (Q9SGJ6), DRE1E_ORYSI (A2XWL6), DRE1E_ORYSJ (Q8H273), DRE1F_ARATH (Q9LN86), DRE1F_ORYSI (A2WZI4), DRE1F_ORYSJ (Q8S9Z5), DRE1G_ORYSI (A2X899), DRE1G_ORYSJ (Q6EP77), DRE1H_ORYSI (A2Z388), DRE1H_ORYSJ (Q0J090), DRE1I_ORYSJ (Q0J3Y6), DRE1J_ORYSI (A2YXQ7), DRE1J_ORYSJ (Q0J3Y7), DRE1_PSEMZ (P85955), DRE2A_ARATH (O82132), DRE2A_ORYSI (A2WL19), DRE2A_ORYSJ (Q0JQF7), DRE2B_ARATH (O82133), DRE2B_ORYSJ (Q5W6R4), DRE2C_ARATH (Q8LFR2), DRE2C_ORYSJ (Q84ZA1), DRE2D_ARATH (Q9LQZ2), DRE2D_ORYSJ (Q65WX1), DRE2E_ARATH (O80917), DRE2E_ORYSJ (Q10R18), DRE2F_ARATH (Q9SVX5), DRE2G_ARATH (P61827), DRE2H_ARATH (Q9SIZ0), DREB3_ARATH (Q9LYD3), EF100_ARATH (O80337), EF101_ARATH (O80338), EF102_ARATH (O80341), EF103_ARATH (Q8VZ91), EF104_ARATH (Q9FKG1), EF105_ARATH (Q8VY90), EF106_ARATH (Q9LY05), EF107_ARATH (Q9FKG2), EF109_ARATH (Q9SZ06), EF110_ARATH (Q70II3), EF112_ARATH (P93007), EF113_ARATH (Q9LYU3), EF114_ARATH (Q9FH54), EF115_ARATH (Q9LY29), EF116_ARATH (Q8GW17), EF117_ARATH (Q9M9B2), EF118_ARATH (Q9CA27), EF119_ARATH (Q9LUA2), EF120_ARATH (Q9SK67), EF121_ARATH (Q9FGC9), EF122_ARATH (Q38Q40), ERB46_MAIZE (B6T5Z6), ERF03_ARATH (Q94AW5), ERF08_ARATH (O22174), ERF10_ARATH (Q9FH94), ERF11_ARATH (Q9SNE1), ERF12_ARATH (Q9SFE4), ERF13_ARATH (Q9CAP4), ERF14_ARATH (Q9LPE8), ERF15_ARATH (Q6NLD5), ERF16_ARATH (Q9C591), ERF17_ARATH (Q84QC2), ERF18_ARATH (Q9S7L5), ERF19_ARATH (O80542), ERF1_ORYSJ (Q6K7E6), ERF1_SOLLC (Q84XB3), ERF1_TOBAC (Q40476), ERF20_ARATH (Q9C9I8), ERF21_ARATH (Q9C9I2), ERF22_ARATH (Q9LQ28), ERF23_ARATH (Q1ECI2), ERF24_ARATH (Q9SJR0), ERF25_ARATH (Q9FJ90), ERF26_ARATH (Q9CAN9), ERF27_ARATH (Q38Q39), ERF2_NICSY (Q9LW50), ERF2_TOBAC (Q40479), ERF34_ARATH (Q8LBQ7), ERF35_ARATH (Q9M210), ERF36_ARATH (Q9LU18), ERF37_ARATH (O80654), ERF38_ARATH (Q9ZQP3), ERF39_ARATH (Q9SUK8), ERF3_TOBAC (Q9SXS8), ERF42_ARATH (Q52QU1), ERF43_ARATH (Q9M080), ERF4_NICSY (Q9LW49), ERF4_TOBAC (Q40477), ERF53_ARATH (Q9SKT1), ERF54_ARATH (Q9M0J3), ERF55_ARATH (Q9SKW5), ERF56_ARATH (Q9SIE4), ERF57_ARATH (Q9FJQ2), ERF5_NICSY (Q9LW48), ERF5_TOBAC (Q40478), ERF60_ARATH (O65665), ERF61_ARATH (Q9C7W2), ERF62_ARATH (Q9SVQ0), ERF69_ARATH (Q8W4I5), ERF70_ARATH (Q9C995), ERF71_ARATH (O22259), ERF73_ARATH (Q8H0T5), ERF76_ARATH (Q9C5I3), ERF77_ARATH (Q9ZWA2), ERF78_ARATH (O80340), ERF79_ARATH (Q9MAI5), ERF80_ARATH (Q9FE67), ERF81_ARATH (Q94ID6), ERF82_ARATH (O80339), ERF83_ARATH (Q9LDE4), ERF84_ARATH (Q9M8M5), ERF86_ARATH (Q6J9Q2), ERF87_ARATH (Q9FZ90), ERF88_ARATH (Q3E703), ERF91_ARATH (O49515), ERF92_ARATH (Q8LDC8), ERF93_ARATH (Q8VYM0), ERF94_ARATH (Q9LND1), ERF95_ARATH (Q9LTC6), ERF96_ARATH (Q9LSX0), ERF97_ARATH (P93822), ERF98_ARATH (Q9LTC5), ERF99_ARATH (Q8L9K1), ERFC3_SOLLC (A0A3Q7I5Y9), ERFL1_ARATH (Q56XP9), ERN1_LOTJA (A0A1X9PY88), ERN1_MEDTR (A2Q5W1), ERN2_MEDTR (A9Y0K8), ERN3_MEDTR (A9Y0K9), ESR1_ARATH (Q9SAD4), ESR2_ARATH (Q9FYK5), FZP_ORYSJ (Q8H3Q1), LEP_ARATH (Q9M644), PLET1_ARATH (Q5YGP8), PLET2_ARATH (Q5YGP7), PTI5_SOLLC (O04681), PTI6_SOLLC (O04682), PZ02_LUPPO (P16146), RA210_ARATH (Q9SW63), RA211_ARATH (Q6J9S1), RA212_ARATH (Q9SSA8), RA213_ARATH (Q9LM15), RAP21_ARATH (Q8LC30), RAP22_ARATH (Q9LUM4), RAP23_ARATH (P42736), RAP24_ARATH (Q8H1E4), RAP26_ARATH (Q7G1L2), RAP27_ARATH (Q9SK03), RAP29_ARATH (Q8W3M3), RAV1_ARATH (Q9ZWM9), RAV2_ARATH (P82280), RAVL1_ARATH (Q9C6M5), RAVL2_ARATH (Q9C6P5), RAVL3_ARATH (Q9C688), RAVL4_ARATH (Q9LS06), SHN2_ARATH (Q9LFN7), SHN3_ARATH (Q3E958), SMOS1_ORYSJ (X5HYT8), SMZ_ARATH (Q6PV68), SNZ_ARATH (Q6PV67), TINY_ARATH (Q39127), TOE2_ARATH (Q9LVG2), TOE3_ARATH (Q9FH95), WIN1_ARATH (Q9XI33), WRI1_ARATH (Q6X5Y6), Y1407_ORYSJ (Q9AWS7), Y1410_ORYSJ (Q9AWS0), Y1934_ORYSJ (Q8RZX9), Y5498_ORYSJ (Q6L4H4)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
1 sequence
AP2A_PLAF7 (Q8I1N6) |
| PDB [Detailed view] |
7 PDB
1GCC; 2GCC; 3GCC; 5WX9; 7ET4; 7ET5; 7WQ5 |