 |
|
| Entry: PS51044 |
General information about the entry
| Entry name [info] | ZF_SP_RING |
| Accession [info] | PS51044 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2004 CREATED;
26-FEB-2020 DATA UPDATE; 26-FEB-2020 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51044 |
| Associated ProRule [info] | PRU00452 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Zinc finger SP-RING-type profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=78; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=73; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6787088; R2=0.0259866; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3461.2751465; R2=3.0958207; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=378; H_SCORE=4631; N_SCORE=12.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=148; H_SCORE=3919; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-10; D=-30; I=-30; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='E'; M= -4, 2,-27, 4, 8,-22, 6, -6,-28, -5,-28,-20, 5,-15, -1,-10, 7, -8,-22,-25,-15, 4; /M: SY='D'; M=-15, 24,-34, 38, 29,-30,-15, -5,-30, 0,-34,-24, 5,-11, 8, -6, -1,-10,-26,-35,-25, 20; /M: SY='D'; M= -7, 5,-20, 10, 7,-25, -8,-11,-20, -7,-24,-16, 1,-11, 0,-13, 3, -7,-16,-31,-22, 4; /M: SY='D'; M=-11, 17,-26, 29, 11,-26, -7,-13,-21,-10,-28,-19, 0,-13, -2,-17, -2, -9,-17,-33,-25, 5; /M: SY='I'; M= -5,-30, -4,-30,-25, -6,-34,-29, 26,-23, 16, 11,-28,-25,-22,-26,-17, -3, 25,-26,-11,-24; /M: SY='V'; M= 1,-15,-16,-15, -4,-15,-22,-17, 4,-11, -2, 2,-14,-18, -6,-14, -6, -6, 8,-28,-15, -4; /M: SY='V'; M= -3,-15,-16,-12, -4,-14,-25,-19, 6,-12, -1, 2,-16,-18, -7,-16, -7, -2, 8,-27,-15, -5; /M: SY='T'; M= -1, -2,-18, 2, -1,-22, -6,-16,-16,-10,-18,-14, -2,-13, -7,-14, 7, 10,-11,-27,-22, -4; /M: SY='E'; M= -2, 2,-22, 1, 7,-25,-12, -7,-22, 2,-20,-11, 5,-13, 5, 2, 7, 2,-17,-29,-20, 6; /M: SY='E'; M= 1,-12,-19,-10, 3,-15,-19,-10,-10, -5, -9, -7,-10,-16, 0, -8, 0, -3, -6,-23, -9, 1; /M: M= -4,-14,-17,-15, -8,-16,-20,-16, -4, -1, -7, -3,-11,-13, -7, -9, -1, -3, 0,-27,-12, -8; /M: SY='I'; M= -7,-28,-13,-28,-21, -3,-33,-25, 22,-20, 14, 12,-27,-24,-15,-24,-18, -7, 22,-24, -7,-19; /M: SY='S'; M= -2, 2,-17, 1, 1,-19, -9, -7,-21, 4,-21,-13, 8,-12, 0, -7, 20, 6,-19,-26,-13, 0; /M: SY='L'; M= -9,-38,-10,-38,-29, -1,-39,-30, 23,-21, 36, 18,-30,-29,-21,-22,-20, -9, 14,-22,-10,-29; /M: SY='K'; M=-11, 2,-29, -4, 10,-27,-17, -4,-25, 14,-19,-10, 9,-15, 12, 12, 0, -2,-20,-29,-18, 10; /M: SY='C'; M= -1,-19, 67,-17,-30,-21,-25,-26,-13,-25,-14,-12,-22,-26,-24,-27, -4, -8,-13,-23,-21,-23; /M: SY='P'; M=-11,-16,-30,-10, -7,-36,-20,-10,-30, -4,-29,-19,-15, 54, -7,-14, -9,-11,-21,-37,-25, -7; /M: SY='L'; M=-11,-35,-11,-35,-29, 3,-39,-28, 26,-24, 29, 17,-29,-30,-23,-24,-19,-11, 16,-21, -8,-29; /M: SY='T'; M= 5, -5,-11, -5, -6,-21, -6,-15,-16, -6,-16,-11, 5,-11, -6,-11, 24, 27,-11,-25,-21, -6; /M: SY='Y'; M=-12,-22,-21,-25,-16, 7,-22, -7,-10, -8, -5, -5,-15,-26,-11, -6,-12, -9,-11, -8, 10,-16; /M: SY='S'; M= 0,-11,-17,-13, -7,-19,-14,-15,-12, 2, -8, -2, -7,-16, -4, 0, 3, -2,-10,-26,-19, -7; /M: SY='R'; M= -9,-10,-28,-17, -1,-30,-20, -5,-28, 18,-20,-11, -2, -9, 6, 33, -7, -4,-24,-30,-21, -1; /M: SY='M'; M=-10,-31,-10,-31,-26, 0,-36,-26, 25,-20, 23, 28,-26,-26,-16,-20,-16,-10, 19,-20,-10,-22; /M: SY='K'; M= -9, -4,-29, -8, 12,-26,-21, -9,-24, 27,-15, -8, -3,-13, 10, 14, -2, -9,-18,-28,-18, 11; /M: SY='I'; M=-10,-23,-15,-23,-16, -2,-33,-17, 14,-17, 6, 2,-21,-24,-16,-20,-14, -4, 11,-20, 0,-17; /M: SY='P'; M= -4,-20,-26,-11,-10,-38,-18,-20,-28,-10,-28,-19,-20, 60,-10,-19, -8, -9,-18,-39,-29,-10; /M: SY='V'; M= 2,-25, 3,-25,-21,-12,-16,-22, 5,-20, -4, -3,-23,-21,-19,-25,-11, -3, 13,-22, -8,-20; /M: SY='R'; M= -5, -9,-27,-18, 1,-29,-18, -4,-28, 24,-19,-10, -2,-17, 8, 37, -6, -9,-25,-30,-20, 1; /M: SY='G'; M= 2, -6,-15, -8,-13,-20, 22,-14,-27,-13,-27,-19, 4,-18,-13,-16, 12, -7,-23,-23,-21,-13; /M: M= -8,-12,-13,-15, -8,-15,-22, -2, -7, -3, -7, -1, -6,-20, -6, -6, -3, -8, -7,-26,-11, -7; /M: SY='N'; M=-13, -1,-24, -4, -3,-11,-17, 3,-22, 1,-21,-14, 4,-12, -4, -6, -1, -3,-19,-21, -3, -4; /M: SY='C'; M= 0,-30, 90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30; /M: SY='K'; M= -5, -6,-24, -7, 4,-27,-14,-11,-23, 11,-20,-11, -2, -5, 5, 5, 4, 0,-16,-29,-20, 4; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30,-10, 0,-10,-20, 80,-30,-10,-30,-20, 10,-20, 0, 0,-10,-20,-30,-20, 20, 0; /M: SY='I'; M=-10,-29,-14,-30,-25, 4,-33,-23, 16,-21, 16, 11,-24,-22,-20,-23,-17, -9, 12,-20, -5,-24; /I: I=-8; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='Q'; M= -5, -3,-24, -4, 10,-26,-11, -4,-25, 6,-18, -4, -1,-11, 30, 8, 0, -6,-17,-20,-12, 16; D=-8; /I: I=-8; DM=-27; /M: SY='C'; M= 0,-27, 72,-27,-34,-17,-27,-27, -5,-26, -7, -7,-27,-26,-26,-27,-10, -8, -5,-19,-17,-26; D=-8; /I: I=-8; DM=-27; /M: SY='F'; M=-18,-30,-18,-30,-28, 48,-30,-12, 2,-26, 4, 10,-28,-36,-24,-26,-18,-18, -6, 6, 22,-26; /M: SY='D'; M=-18, 34,-32, 52, 26,-30,-12, -8,-30, -6,-38,-28, 8,-10, 4,-16, 0,-10,-28,-38,-28, 16; /M: SY='L'; M= -2,-29,-13,-30,-22, -5,-21,-24, 3,-12, 15, 6,-22,-25,-16,-15,-12,-10, 0,-20,-12,-22; /M: SY='E'; M= -3, -6,-16, -3, 7,-22,-19,-13,-16, -1,-12, -7, -7,-14, 3, -5, 1, 1,-11,-26,-19, 5; /M: SY='S'; M= 10, -8,-12, -8, -2,-19, -7,-13,-16, -5,-15,-10, -1,-13, -4,-10, 16, 7,-12,-22,-17, -3; /M: SY='Y'; M=-17,-30,-18,-30,-25, 35,-31, -2, 3,-25, -1, -2,-26,-33,-21,-26,-20,-17, -1, 6, 38,-25; /M: SY='L'; M= -8,-34,-10,-34,-27, -2,-37,-29, 24,-21, 26, 17,-27,-27,-20,-22,-17, -6, 19,-23,-11,-26; /M: SY='Q'; M= -9, 0,-27, 3, 17,-24,-21, -7,-19, 5,-17, -5, -3,-13, 19, -1, 0, -5,-13,-26,-16, 18; /M: SY='M'; M= -8,-25,-15,-25,-18, -2,-21,-12, 1,-15, 5, 7,-18,-23, -7,-16,-10,-11, 0,-12, 4,-15; /M: SY='N'; M= -5, -3, 0, -9, -8,-23,-15, -9,-18, -7,-14, -8, 8,-19, 1, -8, 4, -1,-16,-27,-17, -4; /M: SY='K'; M= -3, -5,-14, -8, 6,-25,-18, -5,-22, 7,-18,-11, -3,-16, 5, 5, 0, -8,-18,-28,-17, 6; /M: SY='Q'; M= -9, -1,-32, -3, 16,-30,-12, -4,-31, 16,-24,-11, 0,-13, 21, 16, -2,-11,-23,-26,-18, 17; /M: SY='T'; M= -1, -9,-18,-11, -3,-23,-15,-13,-15, 2,-13, -7, -3,-13, 3, 1, 5, 11, -8,-25,-18, -1; /M: SY='P'; M= -9, 0,-29, -1, -4,-33, -2, -9,-31, -3,-29,-19, 8, 12, -3, -6, -1, -9,-24,-34,-25, -4; /M: SY='T'; M= -1,-11,-17,-14, -8,-20,-11,-16,-11, -2, -8, -5, -4,-15, -4, -8, 3, 6, -6,-25,-18, -7; /I: I=-7; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='W'; M=-23,-38,-18,-38,-28, 7,-18,-20,-28,-28,-19,-10,-38,-37,-19,-28,-26,-18,-27, 96, 16,-28; /M: SY='N'; M=-14, 7,-28, -3, 3,-27,-14, 0,-24, 6,-19, -9, 22,-18, 13, 9, 0, -6,-21,-31,-16, 5; /M: SY='C'; M= 0,-30, 90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30; /M: SY='P'; M= -9,-19,-28,-10,-10,-38,-20,-20,-28,-10,-28,-19,-18, 63,-10,-19, -8, -5,-18,-38,-29,-10; /M: SY='V'; M= -5,-29,-11,-30,-22, -6,-33,-22, 28,-22, 13, 9,-27,-24,-21,-27,-19, -5, 29,-28, -8,-22; /M: SY='C'; M= 0,-30, 90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30; /M: SY='S'; M= -2, 4,-19, 4, -1,-22, -3, -6,-21, -6,-21,-14, 9,-14, -2,-10, 14, 3,-19,-29,-19, -2; /M: SY='K'; M= -3, -1,-26, -3, 8,-23, -7, -9,-26, 14,-22,-14, -1,-13, 5, 2, 1, -9,-18,-27,-18, 7; /M: SY='P'; M= -5, -8,-23, -8, -2,-21,-16,-10,-20, -4,-19,-13, -3, 5, -3,-10, 0, -1,-13,-27,-14, -2; /M: SY='V'; M= 4,-29, -3,-29,-22, -6,-26,-23, 13,-18, 11, 10,-25,-22,-16,-20,-11, -7, 14,-22, -8,-20; /M: SY='K'; M= -5,-11,-23,-12, -4,-21,-14,-12,-19, 2,-16,-10, -6, -5, -3, 1, 2, -2,-16,-27,-18, -5; /M: SY='Y'; M=-14,-30,-18,-28,-24, 6,-32,-14, 5,-22, 4, 0,-26,-10,-20,-24,-18,-14, 2,-14, 9,-24; /M: SY='E'; M= -6, 7,-25, 11, 12,-26,-10,-10,-22, 4,-24,-16, 3,-12, 1, -7, 5, -2,-15,-31,-22, 8; /M: SY='D'; M=-13, 13,-28, 15, 9,-25,-11, 4,-26, -4,-26,-17, 10,-14, 6, -5, 1, -6,-24,-30,-17, 7; /M: SY='L'; M= -9,-36,-10,-36,-29, -1,-39,-29, 25,-22, 32, 19,-29,-29,-21,-22,-19, -9, 16,-22,-10,-28; /M: SY='V'; M= -1,-23, -9,-24,-15, -6,-25, -7, 3,-16, -2, -3,-19,-22,-13,-14,-11, -9, 4,-20, 2,-15; /M: SY='I'; M= -8,-32,-10,-32,-28, -2,-38,-30, 34,-26, 21, 12,-30,-28,-26,-28,-20, -8, 29,-28,-10,-28; /M: SY='D'; M=-17, 33,-23, 47, 14,-29, -9, -9,-28, -9,-36,-27, 13,-12, -1,-18, 3, -8,-28,-38,-28, 6; /M: SY='E'; M= -3, -2,-24, 4, 7,-22,-11, -8,-24, -4,-24,-17, -5, -4, 1, -7, 0, -6,-18,-26,-14, 4; /M: SY='Y'; M=-17,-24,-20,-26,-20, 23,-27, 1, -8,-17, -5, -5,-15,-30,-14,-14,-15,-13,-11, 2, 30,-20; /M: SY='F'; M=-10,-27,-15,-27,-20, 13,-29,-13, 4,-18, 7, 9,-22,-26,-12,-18,-13, -7, 2, -7, 10,-18; /M: SY='Q'; M=-12,-16,-14,-18, -9,-13,-23,-12,-14, -5, -7, -2,-11,-22, 3, -9, -7, -7,-12, -3, -4, -6; /M: SY='E'; M= -9, 3,-28, 7, 10,-17,-10, -6,-25, 0,-25,-17, -2,-16, 1, -2, -2,-11,-22,-25,-13, 5; /M: SY='I'; M= -9,-29,-12,-30,-24, -4,-33,-26, 18,-18, 13, 8,-27,-27,-20,-22,-17,-10, 14,-13, -8,-23; /M: SY='L'; M= -8,-36,-10,-36,-28, -2,-38,-29, 22,-21, 31, 16,-28,-28,-21,-22,-18, -5, 15,-23,-11,-28; /M: SY='S'; M= 5, 2,-21, 0, 9,-26, -3, -7,-24, 3,-23,-15, 8,-13, 2, -3, 11, -3,-17,-31,-21, 6; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 29 in 29 different sequences |
| Number of true positive hits | 29 in 29 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 3 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 90.62 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | window20 |
| Author [info] | N_Hulo |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | ZN_FING |
| Feature description [info] | SP-RING-type |
| Version [info] | 6 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
29 sequences
GEI17_CAEEL (Q94361 ), NSE2_BOVIN (Q32KY9 ), NSE2_HUMAN (Q96MF7 ), NSE2_MOUSE (Q91VT1 ), NSE2_RAT (Q4V8A0 ), NSE2_YEAST (P38632 ), PIAL1_ARATH (A0A0A7EPL0), PIAL2_ARATH (F4JYG0 ), PIAS1_HUMAN (O75925 ), PIAS1_MOUSE (O88907 ), PIAS2_HUMAN (O75928 ), PIAS2_MOUSE (Q8C5D8 ), PIAS2_RAT (Q6AZ28 ), PIAS3_HUMAN (Q9Y6X2 ), PIAS3_MOUSE (O54714 ), PIAS3_RAT (O70260 ), PIAS4_HUMAN (Q8N2W9 ), PIAS4_MOUSE (Q9JM05 ), PIS4A_DANRE (F1R4C4 ), PLI1_SCHPO (O94451 ), SIZ1_ARATH (Q680Q4 ), SIZ1_ORYSJ (Q6L4L4 ), SIZ1_YEAST (Q04195 ), SIZ2_ORYSJ (Q6ASW7 ), SIZ2_YEAST (Q12216 ), ZMIZ1_HUMAN (Q9ULJ6 ), ZMIZ1_MOUSE (Q6P1E1 ), ZMIZ2_HUMAN (Q8NF64 ), ZMIZ2_MOUSE (Q8CIE2 )» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
3 sequences
NSE2_ARATH (Q8GYH7 ), NSE2_SCHPO (Q4PIR3 ), NSE2_XENLA (Q7ZXH2 ) |
| PDB [Detailed view] |
6 PDB
2YU4; 3HTK; 3I2D; 4FO9; 4MVT; 5JNE |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission