PROSITE logo
Due to maintenance work, this service will be unavailable Tuesday 16 between 06:00 and 06:30 - CEST. Apologies for the inconvenience.

PROSITE entry PS51051


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry

Entry name [info] DSL
Accession [info] PS51051
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-DEC-2004 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE;
29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51051
Associated ProRule [info] PRU00377

Name and characterization of the entry

Description [info] DSL domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.8295677; R2=0.0097802; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2493.5966797; R2=2.9556451; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=764; H_SCORE=4752; N_SCORE=10.3; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=376; H_SCORE=3605; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='I';  M= -7,-17,-19,-25,-25,  5,-28,-22, 24,-21,  6,  7,-10,-25,-22,-20,-11, -4, 24,-25, -5,-25;
/M: SY='K';  M= -4,-11,-21,-13,-10,-15,-10,-18, -7,  1, -9, -4, -8,-17,-10, -4, -2,  1,  1,-25,-12,-10;
/M: SY='C';  M=-10,-15, 90,-26,-27,-18,-28,-26,-21,-27,-17,-16,-12,-36,-26,-27, -9, -9, -8,-46,-26,-27;
/M: SY='B';  M= -4, 14,-24, 14,  4,-20,-13, -4,-16, -1,-18,-14, 10,-14, -2, -7,  0, -5,-15,-25, -7,  0;
/M: SY='R';  M=-12,  1,-28,  5, 19,-25,-18, -5,-27, 14,-22,-16,  0,  0,  8, 21,  0, -4,-23,-27,-16, 11;
/M: SY='N';  M=-12, 14,-22,  3, -5, -8,-13, 12,-12, -6,-14, -9, 25,-21,  0, -4, -1, -1,-20,-22,  4, -4;
/M: SY='W';  M=-19,-31,-39,-31,-25, 18,-25, -8, -8,-17, -5, -8,-31,-30,-16,-16,-31,-20,-18, 83, 48,-20;
/M: SY='Y';  M=-19,-16,-27,-19,-14, 24,-26, 20,-13, -6, -6, -2, -9,-25,-11,  1,-16,-12,-13, -1, 31,-14;
/M: SY='G';  M= -1, -8,-28, -9,-15,-29, 52,-17,-35,-16,-27,-17,  0,-18,-11,-16,  2,-12,-27,-21,-26,-13;
/M: SY='H';  M= -7, -1,-25, -2, 10,-15, -8, 12,-22, -4,-14,-10,  3,-15,  1,  0, -2, -9,-20,-26, -8,  4;
/M: SY='H';  M= -5,  1,-25,  2,  1,-22, -9, 11,-25,  6,-22,-11,  3,-15,  6,  9,  2, -6,-19,-24, -5,  2;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='E';  M= -3, 14,-24, 19, 21,-28, -4, -5,-29,  1,-24,-20,  8, -9,  4, -2,  8, -4,-23,-32,-20, 12;
/M: SY='K';  M=-10,  1,-25, -1, -1,-21,-19,  5,-16, 11,-19, -7,  4,-15,  1,  8, -3, -4,-11,-27, -7, -2;
/M: SY='F';  M=-11,-21,-21,-27,-20, 41,-24, -1, -5,-22,  3, -1,-14,-26,-23,-16,-11, -7, -5,  0, 25,-20;
/M: SY='C';  M=-10,-18,105,-27,-25,-22,-29,-26,-29,-26,-20,-18,-18,-37,-21,-26, -9,-10,-12,-47,-28,-23;
/M: SY='D';  M=-14, 11,-19, 12,  2,-25,-19,  2,-20,  8,-20,-12,  7,-16, -1,  3, -7,-10,-17,-30,-10, -1;
/M: SY='P';  M= -6,  4,-30, 12, 18,-31,-15, -8,-26,  2,-25,-18, -3, 23,  7, -7,  0, -7,-26,-30,-21, 11;
/M: SY='R';  M=-15,  7,-28, 10, 12,-25,-16,  7,-30, 16,-24,-15,  9,-14,  8, 30, -2, -8,-23,-28,-12,  8;
/M: SY='D';  M= -7,  8,-25, 12,  5,-20,-15, -7,-21, -3,-16,-13,  1, -5,  4, -7,  1, -2,-18,-27,-12,  4;
/M: SY='D';  M= 11, 24,-20, 27,  5,-29, -5, -7,-25, -4,-22,-20, 11,-11, -4,-13,  5, -5,-17,-32,-20,  0;
/M: SY='H';  M= -4, -9,-22,-13, -7,-10,-18,  9,-12, -4,-10, -4, -3,-17, -3,  3, -1, -2, -9,-24, -3, -7;
/M: SY='F';  M= -9, -9,-21,-15,-11, 11,-19,  7,-13, -8, -8, -5, -2,-20,-11, -2, -5, -3,-11,-17,  6,-11;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='G';  M=  3,-11,-15,-14,-14,-12, 12,-14, -4,-13, -7, -1, -7,-14,-12,-14, -1, -6,  0,-17,-13,-14; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='H';  M= -8,  0,-21, -2, -5,-17, 11, 25,-23, -6,-18, -8,  8,-14, -2,  0, -3,-12,-21,-19, -5, -5; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='Y';  M=-17,-18,-29,-21,-14, 17,-25, -3,-11,  4, -8, -1,-14,-24, -9,  8,-18,-12,-12, 14, 29,-12;
/M: SY='R';  M= -9, -9,-23, -8,  2,-16,-20, -3,-14,  7,-11, -6, -6,-17,  0, 17, -3, -2, -6,-26,-10,  0;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='D';  M=-13, 36,-24, 40, 11,-31, -8,  1,-29, -1,-28,-23, 27,-13,  3, -6,  7,  0,-26,-38,-19,  7;
/M: SY='E';  M= -6, -1,-28,  3, 12,-20,-18, -3,-19,  2,-19,-12, -3,  3,  5, -4, -3, -8,-19,-25,-12,  8;
/M: SY='Q';  M=-13, 14,-27, 15,  8,-28,-15,  7,-21,  7,-18, -6, 10,-14, 16,  3, -4, -9,-23,-28,-10, 12;
/M: SY='G';  M= -2, -4,-30, -2,-16,-31, 62,-18,-40,-18,-30,-21,  2,-19,-18,-19,  0,-19,-30,-22,-29,-17;
/M: SY='N';  M= -7, 10,-24,  7, -1,-25,  2, -5,-23,  1,-24,-14, 14,-16,  4,  1,  4, -2,-20,-29,-17,  1;
/M: SY='L';  M=-14,-20,-26,-22,-13,  4,-26,-11,  0, -4,  8,  7,-17,-16,-10,  2,-19,-10, -4,-12,  6,-13;
/M: SY='G';  M= -3, -9,-21,-11,-11,-19,  6,-16,-18, -2,-18,-11, -4,-18,-10,  2,  4,  3, -6,-26,-17,-11;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='L';  M= -6,-12,-23,-13,-10, -8,-20, -3,  0,-18, 13,  6,-12, -8,-10,-15,-16, -9, -6,-25, -7,-11;
/M: SY='P';  M=-11, -5,-34,  0, 11,-26,-21,-12,-13, -6,-20,-14, -6, 35,  1,-13, -7, -9,-21,-29,-21,  3;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='W';  M=-17,-32,-37,-34,-26, 19,-24,-21,-10,-16, -7,-10,-31,-29,-21,-16,-30,-20,-15, 82, 28,-20;
/M: SY='T';  M= -4, -4,-10, -8, -1,-18,-17, -1,-17, -2,-14, -5, -2,-14,  4,  3,  7, 11,-11,-29,-10,  1;
/M: SY='G';  M= -1, -5,-29, -7,-18,-29, 63,-17,-38,-18,-30,-20,  6,-20,-18,-18,  1,-18,-30,-22,-29,-18;
/M: SY='P';  M= -9,  3,-30,  9,  2,-27, -8,-12,-24, -6,-25,-19,  0, 25, -6,-12,  0, -6,-24,-32,-23, -4;
/M: SY='B';  M=-15, 16,-28, 16,  4,-18,-14,  6,-22,  1,-18,-14, 13,-17, -1, -2, -7,-10,-23,-16, -4,  1;
/M: SY='C';  M=-10,-14,106,-25,-27,-20,-27,-26,-29,-27,-21,-20,-12,-38,-27,-27, -8, -9,-12,-49,-29,-27;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_03 which contains 571'609 sequence entries.


Total number of hits 23 in 23 different sequences
Number of true positive hits 23 in 23 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 3
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 88.46 %

Comments [info]

Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] V_Lesaux
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] DSL
Version [info] 5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
23 sequences

APX1_CAEEL  (P41990), DLL1_HUMAN  (O00548), DLL1_MOUSE  (Q61483), 
DLL1_RAT(P97677), DLL4_HUMAN  (Q9NR61), DLL4_MOUSE  (Q9JI71), 
DLL4_RAT(D3ZHH1), DLLA_DANRE  (Q6DI48), DLLB_DANRE  (O57409), 
DLLC_DANRE  (Q9IAT6), DLLD_DANRE  (Q8UWJ4), DL_DROME(P10041), 
DSL1_CAEEL  (O45201), JAG1A_DANRE (Q90Y57), JAG1B_DANRE (Q90Y54), 
JAG1_HUMAN  (P78504), JAG1_MOUSE  (Q9QXX0), JAG1_RAT(Q63722), 
JAG2_HUMAN  (Q9Y219), JAG2_MOUSE  (Q9QYE5), JAG2_RAT(P97607), 
LAG2_CAEEL  (P45442), SERR_DROME  (P18168)
» more

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
3 sequences

DLL3_HUMAN  (Q9NYJ7), DLL3_MOUSE  (O88516), DLL3_RAT(O88671)

		
PDB
[Detailed view]
16 PDB

2KB9; 2VJ2; 4CBZ; 4CC0; 4CC1; 4XBM; 4XL1; 4XLW; 5BO1; 5MVX; 5MW5; 5MW7; 5MWF; 5UK5; 7ALK; 7ALT
» more