 |
|
| Entry: PS51051 |
General information about the entry
| Entry name [info] | DSL |
| Accession [info] | PS51051 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2004 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 22-FEB-2023 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51051 |
| Associated ProRule [info] | PRU00377 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | DSL domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=45; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=41; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.8295677; R2=0.0097802; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2493.5966797; R2=2.9556451; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=764; H_SCORE=4752; N_SCORE=10.3; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=376; H_SCORE=3605; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='I'; M= -7,-17,-19,-25,-25, 5,-28,-22, 24,-21, 6, 7,-10,-25,-22,-20,-11, -4, 24,-25, -5,-25; /M: SY='K'; M= -4,-11,-21,-13,-10,-15,-10,-18, -7, 1, -9, -4, -8,-17,-10, -4, -2, 1, 1,-25,-12,-10; /M: SY='C'; M=-10,-15, 90,-26,-27,-18,-28,-26,-21,-27,-17,-16,-12,-36,-26,-27, -9, -9, -8,-46,-26,-27; /M: SY='B'; M= -4, 14,-24, 14, 4,-20,-13, -4,-16, -1,-18,-14, 10,-14, -2, -7, 0, -5,-15,-25, -7, 0; /M: SY='R'; M=-12, 1,-28, 5, 19,-25,-18, -5,-27, 14,-22,-16, 0, 0, 8, 21, 0, -4,-23,-27,-16, 11; /M: SY='N'; M=-12, 14,-22, 3, -5, -8,-13, 12,-12, -6,-14, -9, 25,-21, 0, -4, -1, -1,-20,-22, 4, -4; /M: SY='W'; M=-19,-31,-39,-31,-25, 18,-25, -8, -8,-17, -5, -8,-31,-30,-16,-16,-31,-20,-18, 83, 48,-20; /M: SY='Y'; M=-19,-16,-27,-19,-14, 24,-26, 20,-13, -6, -6, -2, -9,-25,-11, 1,-16,-12,-13, -1, 31,-14; /M: SY='G'; M= -1, -8,-28, -9,-15,-29, 52,-17,-35,-16,-27,-17, 0,-18,-11,-16, 2,-12,-27,-21,-26,-13; /M: SY='H'; M= -7, -1,-25, -2, 10,-15, -8, 12,-22, -4,-14,-10, 3,-15, 1, 0, -2, -9,-20,-26, -8, 4; /M: SY='H'; M= -5, 1,-25, 2, 1,-22, -9, 11,-25, 6,-22,-11, 3,-15, 6, 9, 2, -6,-19,-24, -5, 2; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='E'; M= -3, 14,-24, 19, 21,-28, -4, -5,-29, 1,-24,-20, 8, -9, 4, -2, 8, -4,-23,-32,-20, 12; /M: SY='K'; M=-10, 1,-25, -1, -1,-21,-19, 5,-16, 11,-19, -7, 4,-15, 1, 8, -3, -4,-11,-27, -7, -2; /M: SY='F'; M=-11,-21,-21,-27,-20, 41,-24, -1, -5,-22, 3, -1,-14,-26,-23,-16,-11, -7, -5, 0, 25,-20; /M: SY='C'; M=-10,-18,105,-27,-25,-22,-29,-26,-29,-26,-20,-18,-18,-37,-21,-26, -9,-10,-12,-47,-28,-23; /M: SY='D'; M=-14, 11,-19, 12, 2,-25,-19, 2,-20, 8,-20,-12, 7,-16, -1, 3, -7,-10,-17,-30,-10, -1; /M: SY='P'; M= -6, 4,-30, 12, 18,-31,-15, -8,-26, 2,-25,-18, -3, 23, 7, -7, 0, -7,-26,-30,-21, 11; /M: SY='R'; M=-15, 7,-28, 10, 12,-25,-16, 7,-30, 16,-24,-15, 9,-14, 8, 30, -2, -8,-23,-28,-12, 8; /M: SY='D'; M= -7, 8,-25, 12, 5,-20,-15, -7,-21, -3,-16,-13, 1, -5, 4, -7, 1, -2,-18,-27,-12, 4; /M: SY='D'; M= 11, 24,-20, 27, 5,-29, -5, -7,-25, -4,-22,-20, 11,-11, -4,-13, 5, -5,-17,-32,-20, 0; /M: SY='H'; M= -4, -9,-22,-13, -7,-10,-18, 9,-12, -4,-10, -4, -3,-17, -3, 3, -1, -2, -9,-24, -3, -7; /M: SY='F'; M= -9, -9,-21,-15,-11, 11,-19, 7,-13, -8, -8, -5, -2,-20,-11, -2, -5, -3,-11,-17, 6,-11; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='G'; M= 3,-11,-15,-14,-14,-12, 12,-14, -4,-13, -7, -1, -7,-14,-12,-14, -1, -6, 0,-17,-13,-14; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='H'; M= -8, 0,-21, -2, -5,-17, 11, 25,-23, -6,-18, -8, 8,-14, -2, 0, -3,-12,-21,-19, -5, -5; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='Y'; M=-17,-18,-29,-21,-14, 17,-25, -3,-11, 4, -8, -1,-14,-24, -9, 8,-18,-12,-12, 14, 29,-12; /M: SY='R'; M= -9, -9,-23, -8, 2,-16,-20, -3,-14, 7,-11, -6, -6,-17, 0, 17, -3, -2, -6,-26,-10, 0; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='D'; M=-13, 36,-24, 40, 11,-31, -8, 1,-29, -1,-28,-23, 27,-13, 3, -6, 7, 0,-26,-38,-19, 7; /M: SY='E'; M= -6, -1,-28, 3, 12,-20,-18, -3,-19, 2,-19,-12, -3, 3, 5, -4, -3, -8,-19,-25,-12, 8; /M: SY='Q'; M=-13, 14,-27, 15, 8,-28,-15, 7,-21, 7,-18, -6, 10,-14, 16, 3, -4, -9,-23,-28,-10, 12; /M: SY='G'; M= -2, -4,-30, -2,-16,-31, 62,-18,-40,-18,-30,-21, 2,-19,-18,-19, 0,-19,-30,-22,-29,-17; /M: SY='N'; M= -7, 10,-24, 7, -1,-25, 2, -5,-23, 1,-24,-14, 14,-16, 4, 1, 4, -2,-20,-29,-17, 1; /M: SY='L'; M=-14,-20,-26,-22,-13, 4,-26,-11, 0, -4, 8, 7,-17,-16,-10, 2,-19,-10, -4,-12, 6,-13; /M: SY='G'; M= -3, -9,-21,-11,-11,-19, 6,-16,-18, -2,-18,-11, -4,-18,-10, 2, 4, 3, -6,-26,-17,-11; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='L'; M= -6,-12,-23,-13,-10, -8,-20, -3, 0,-18, 13, 6,-12, -8,-10,-15,-16, -9, -6,-25, -7,-11; /M: SY='P'; M=-11, -5,-34, 0, 11,-26,-21,-12,-13, -6,-20,-14, -6, 35, 1,-13, -7, -9,-21,-29,-21, 3; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='W'; M=-17,-32,-37,-34,-26, 19,-24,-21,-10,-16, -7,-10,-31,-29,-21,-16,-30,-20,-15, 82, 28,-20; /M: SY='T'; M= -4, -4,-10, -8, -1,-18,-17, -1,-17, -2,-14, -5, -2,-14, 4, 3, 7, 11,-11,-29,-10, 1; /M: SY='G'; M= -1, -5,-29, -7,-18,-29, 63,-17,-38,-18,-30,-20, 6,-20,-18,-18, 1,-18,-30,-22,-29,-18; /M: SY='P'; M= -9, 3,-30, 9, 2,-27, -8,-12,-24, -6,-25,-19, 0, 25, -6,-12, 0, -6,-24,-32,-23, -4; /M: SY='B'; M=-15, 16,-28, 16, 4,-18,-14, 6,-22, 1,-18,-14, 13,-17, -1, -2, -7,-10,-23,-16, -4, 1; /M: SY='C'; M=-10,-14,106,-25,-27,-20,-27,-26,-29,-27,-21,-20,-12,-38,-27,-27, -8, -9,-12,-49,-29,-27; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 23 in 23 different sequences |
| Number of true positive hits | 23 in 23 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 3 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 88.46 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | V_Lesaux |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | DSL |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
23 sequences
APX1_CAEEL (P41990 ), DLL1_HUMAN (O00548 ), DLL1_MOUSE (Q61483 ), DLL1_RAT (P97677 ), DLL4_HUMAN (Q9NR61 ), DLL4_MOUSE (Q9JI71 ), DLL4_RAT (D3ZHH1 ), DLLA_DANRE (Q6DI48 ), DLLB_DANRE (O57409 ), DLLC_DANRE (Q9IAT6 ), DLLD_DANRE (Q8UWJ4 ), DL_DROME (P10041 ), DSL1_CAEEL (O45201 ), JAG1A_DANRE (Q90Y57 ), JAG1B_DANRE (Q90Y54 ), JAG1_HUMAN (P78504 ), JAG1_MOUSE (Q9QXX0 ), JAG1_RAT (Q63722 ), JAG2_HUMAN (Q9Y219 ), JAG2_MOUSE (Q9QYE5 ), JAG2_RAT (P97607 ), LAG2_CAEEL (P45442 ), SERR_DROME (P18168 )» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
3 sequences
DLL3_HUMAN (Q9NYJ7 ), DLL3_MOUSE (O88516 ), DLL3_RAT (O88671 ) |
| PDB [Detailed view] |
16 PDB
2KB9; 2VJ2; 4CBZ; 4CC0; 4CC1; 4XBM; 4XL1; 4XLW; 5BO1; 5MVX; 5MW5; 5MW7; 5MWF; 5UK5; 7ALK; 7ALT » more |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission