PROSITE logo

PROSITE entry PS51053


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry

Entry name [info] SERTA
Accession [info] PS51053
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-JAN-2005 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE;
29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51053
Associated ProRule [info] PRU00396

Name and characterization of the entry

Description [info] SERTA domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0283349; R2=0.0138353; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2580.4648438; R2=2.0314844; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=468; H_SCORE=3531; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=324; H_SCORE=3239; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='Y';  M=-14,-20,-30,-19,-12,  4,-28,  0,  3,-13,  3,  2,-19, -8, -3,-12,-17,-10, -8,  0, 29,-11;
/M: SY='R';  M=  1, -6,-20,-11, -2,-12,-15,-10,-17,  5,-16, -9, -2,-14,  5,  7,  5,  5,-12,-21, -8,  1;
/M: SY='E';  M= -7, -4,-21,  1,  8,-13,-20,-12, -6,-11,  3, -5, -9,-16, -5,-12, -4, -4, -3,-30,-13,  1;
/M: SY='Q';  M= -1, -2,-24, -2, 15,-19,-19,  1,-17,  1,-14, -8, -5,-11, 19, -3,  1, -1,-18,-16,  0, 16;
/M: SY='R';  M=-14, -7,-27, -7,  3,-23,-17,  0,-27, 21,-22,-10,  2,-17, 17, 48, -1, -5,-20,-23,-12,  6;
/M: SY='Q';  M=  0, -5,-23, -6,  7,-27,-16, -3,-15,  5,-13, -3, -4,-13, 25,  3,  2, -4,-17,-23,-11, 16;
/M: SY='S';  M=  4, -3,-18, -6, -2,-20,-11,  1,-21,  4,-21,-12,  2,-13,  1,  6, 13,  9,-12,-29,-11, -2;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-25,-35,-25,  5,-35,-25, 36,-30, 34, 20,-25,-25,-20,-25,-25,-10, 21,-20,  0,-25;
/M: SY='F';  M=-14,-27,-21,-30,-20, 28,-29,-17,  7,-22, 28, 10,-23,-29,-22, -8,-24,-10,  3,-11,  8,-20;
/M: SY='B';  M=-16, 22,-27, 22,  6,-23,-12,  7,-25,  5,-24,-16, 21,-17,  9,  9, -1, -7,-26,-26, -6,  6;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-23,-33,-23,  4,-31,-18, 30,-25, 33, 30,-24,-24,-15,-21,-24,-10, 16,-20,  0,-21;
/M: SY='S';  M=  7, -3,  9, -4, -4,-20, -4,-13,-21,-13,-29,-20,  6,-14, -4,-13, 33, 16,-10,-41,-21, -4;
/M: SY='L';  M=  0,-26,-17,-29,-20,  3,-24,-19, 17,-23, 31, 19,-26,-26,-17,-19,-20, -7, 15,-22, -4,-19;
/M: SY='M';  M=-13, -7,-23, -5, -4, -1,-23,  5, -4,-13,  3,  7,-10,-20, -9,-12,-13,-10, -2,-23,  0, -7;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='L';  M= -8,-29,-18,-30,-22,  7,-29,-19, 22,-26, 39, 24,-29,-29,-19,-19,-25, -8, 16,-22, -2,-20;
/M: SY='Q';  M=-10, -2,-27,  0, 13,-21,-19, 19,-21,  6,-19, -7,  0,-13, 22,  3, -1, -8,-23,-18,  6, 16;
/M: SY='R';  M=-17, -6,-26,-10, -6, -5,-19, 12,-18,  4, -8, -5,  5,-23, -1, 26,-11,-10,-17,-21, -1, -6;
/M: SY='S';  M= -7,-14, -1,-20,-16, -2,-22, -2, -2,-21, -9, -4, -6,-21,-13,-18,  2, -2, -2,-28, -3,-16;
/M: SY='R';  M=-15, -7,-27, -4, -3,-14,-22,  6,-16,  5, -1, -1, -6,-21,  0, 17,-15,-11,-13,-24, -4, -4;
/M: SY='Q';  M=-11,  5,-30, 11,  5,-31, -3, -4,-23, -3,-20, -6, -1,  3, 12, -8, -4,-12,-24,-27,-18,  8;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='L';  M= -6,-16,-18,-15, -7, -8,-19,-12,  4,-12,  8,  4,-16,  0, -3,-10,-12, -6,  0,-18, -8, -6; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='S';  M=  0, -8,-17, -9, -6,-17,-13,-14,-13, -5,-20,-13, -2, -3, -5,  0, 16, 14, -4,-33,-17, -7;
/M: SY='E';  M=  0,  7,-27, 14, 49,-28,-17, -3,-27,  7,-18,-18, -2, -2, 15, -3,  2, -8,-25,-28,-20, 32;
/M: SY='P';  M=  0,-17,-31,-12, -2,-27,-18,-17,-13, -8,-21,-13,-17, 49, -3,-16, -6, -7,-17,-27,-24, -6;
/M: SY='N';  M= -4, 17,-18, 14,  1,-17, -5,  1,-21, -6,-27,-19, 22,-15, -1, -7, 19,  6,-19,-32, -9, -1;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='R';  M=-17,-11, -9,-13, -4,-17,-23,  0,-24, 13,-17, -8, -5,-23, 10, 36,-10,-10,-19,-18, -1, -1;
/M: SY='R';  M=-18, -7,-30, -7,  2,-22,-20, 13,-30, 27,-22, -8,  2,-18, 10, 53,-10,-12,-22,-22, -5,  2;
/M: SY='S';  M=  1, -5,-15, -6, -5,-14,-11,  5,-14,-13,-13, -9,  2,-15, -3,-10, 18, 14, -9,-34, -9, -5;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='L';  M=-10,-29,  0,-30,-21,  6,-30,-21, 13,-30, 40, 14,-29,-31,-21,-21,-27,-10,  7,-24, -4,-21;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-27,-38,-30,  0,-38,-30, 47,-28, 18, 18,-22,-22,-22,-28,-18, -8, 33,-22, -2,-30;
/M: SY='N';  M= -2,  8,  0, -3,-10,-17,-12,  9,-14,-10,-18,-11, 18,-23, -8,-10,  1, -5,-11,-35,-13,-10;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='T';  M= -3, -7,-13,-15,-13, -6,-21,-17, -2,-12,  2,  4, -7,-14,-10,-11,  8, 34,  3,-27, -7,-11;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-20,-29,-21, 10,-29,-13, 19,-23, 34, 20,-27,-29,-18,-17,-25, -9, 13,-14, 10,-20;
/M: SY='R';  M=-14, -7, -8, -9,  1,-26,-21, -5,-28, 23,-22,-10, -3,-19, 12, 36, -8,-10,-20,-24,-13,  5;
/M: SY='R';  M=-17, -7,-30, -7,  6,-26,-20,  3,-27, 24,-20, -7,  0,-17, 25, 52, -7,-10,-23,-20,-10, 12;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-27,-37,-27,  3,-37,-27, 41,-30, 29, 20,-23,-23,-20,-27,-23,-10, 24,-20,  0,-27;
/M: SY='Q';  M=-12, 12,-29, 12, 15,-35,-16, 19,-24,  5,-23, -7, 12,-13, 38,  5,  0,-10,-30,-27, -9, 26;
/M: SY='E';  M=  7,  5,-24,  7, 15,-27, -2, -8,-26,  2,-19,-17,  0, -9,  2, -1,  2, -8,-19,-26,-20,  8;
/M: SY='E';  M=  3,  5,-24, 11, 40,-27,-14, -5,-25,  4,-20,-18,  0, -3, 12, -5,  8, -4,-22,-30,-20, 26;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-22,-32,-22,  5,-30,-17, 27,-24, 34, 32,-25,-25,-14,-20,-25,-10, 15,-20,  0,-20;
/M: SY='R';  M= -3, -7,-24, -9,  3,-19,-19,-11,-15, 12,-14, -8, -4,-13,  2, 18, -3,  0,-10,-23,-12,  1;
/M: SY='Q';  M= -4,-13,-26,-14, -1,-20,-19, -6, -9, -1, -4,  4,-11, -1, 13,  3, -9, -9,-14,-22,-12,  5;
/M: SY='E';  M=  7,  8,-24, 12, 28,-29,-12, -5,-24,  2,-18,-16,  0, -6, 12, -7,  3, -7,-21,-27,-19, 20;
/M: SY='G';  M= 10, -5,-25, -8, -7,-26, 15,-15,-25, -3,-24,-16,  1,  2, -9,-11,  1, -9,-20,-24,-23, -9;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_03 which contains 571'609 sequence entries.


Total number of hits 10 in 10 different sequences
Number of true positive hits 10 in 10 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] SERTA
Version [info] 5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
10 sequences

CDCA4_HUMAN (Q9BXL8), CDCA4_MOUSE (Q9CWM2), SRTD1_HUMAN (Q9UHV2), 
SRTD1_MOUSE (Q9JL10), SRTD2_HUMAN (Q14140), SRTD2_MOUSE (Q9JJG5), 
SRTD3_HUMAN (Q9UJW9), SRTD3_MOUSE (Q9ERC3), SRTD4_HUMAN (Q9NUC0), 
SRTD4_MOUSE (A7DTG3)
» more