 |
|
| Entry: PS51057 |
General information about the entry
| Entry name [info] | PAIRED_2 |
| Accession [info] | PS51057 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JAN-2005 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 18-SEP-2019 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00034 |
| Associated ProRule [info] | PRU00381 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Paired DNA-binding domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=127; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=122; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8596778; R2=0.0108799; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-437.4077759; R2=14.8252430; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.1%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=868; H_SCORE=12431; N_SCORE=11.3; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=427; H_SCORE=5893; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='G'; M= -1,-10, -7,-13,-20,-26, 43,-21,-34,-20,-26,-18, -3,-21,-20,-20, 2, -8,-23,-26,-27,-20; /M: SY='H'; M=-14,-10,-30,-12, -2,-15,-26, 24, -3, -7, -8, 5, -5,-18, 19, -5,-10,-12,-13,-15, 13, 5; /M: SY='G'; M= 12, -6,-19, -8,-11,-25, 33,-16,-28,-15,-27,-18, 2,-15,-11,-16, 16, -2,-18,-27,-25,-11; /M: SY='G'; M= -3, -5,-25, -3, 1,-26, 21,-10,-32, -3,-26,-18, 2,-15, -3, 4, 7, -7,-23,-26,-22, -2; /M: SY='V'; M= -2,-28,-12,-30,-28, 0,-28,-23, 28,-18, 12, 22,-28,-28,-23,-18,-12, -2, 41,-28, -8,-25; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='V'; M= -2,-30,-12,-30,-28, 2,-30,-28, 28,-22, 19, 12,-30,-30,-28,-20,-15, -2, 41,-28, -8,-28; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='V'; M= -2,-30,-14,-32,-30, 0,-32,-30, 34,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 46,-28, -8,-30; /M: SY='N'; M= -9, 33,-21, 16, -3,-21, 9, 6,-23, -3,-30,-20, 52,-20, -3, -3, 9, -3,-30,-37,-21, -3; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='D'; M=-14, 28,-24, 29, 3,-21,-11, -1,-19, -7,-11,-15, 23,-18, -5, -9, -3, -6,-21,-35,-15, -1; /M: SY='H'; M= -2, 4, 3, 5, -5,-23,-15, 9,-22,-12,-19,-13, 0,-19, -8,-14, 2, -6,-11,-35,-12, -7; /M: SY='V'; M= -4,-19,-17,-26,-23, -4,-30,-26, 23,-20, 6, 6,-15,-19,-19,-20, -3, 15, 24,-26, -6,-23; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='Q'; M=-12,-13,-26,-13, 2,-18,-24, -3, -7, -1, 5, 6,-11,-19, 23, 9,-13,-10,-14,-20, -6, 12; /M: SY='R'; M=-14, -4,-30, -4, 8,-28,-20, -1,-28, 32,-23, -8, 0,-14, 22, 42, -8,-10,-22,-20,-10, 13; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='E'; M=-14, 12,-30, 21, 39,-29,-18, 0,-32, 13,-22,-19, 3, -6, 14, 15, -2,-10,-28,-29,-18, 26; /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20, 8,-28,-16, 20,-26, 44, 28,-28,-28,-16,-18,-28,-10, 10,-20, 0,-18; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='H'; M= 3,-14,-19,-16, -9,-13,-20, 11, -2,-13, 1, 4,-12,-20, -1,-11, -8, -8, 2,-25, -3, -6; /M: SY='S'; M= 2, -8, 8,-10, -6,-18,-12,-13,-16,-14,-15,-12, -2,-18, -2,-13, 17, 7, -9,-37,-18, -4; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='V'; M= 3,-25,-15,-30,-25, -3,-25,-22, 25,-18, 11, 20,-23,-23,-19,-19,-11, -4, 31,-25, -7,-23; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='D'; M=-16, 33,-26, 49, 9,-32,-14, -6,-25, -4,-22,-22, 9,-14, -6,-12, -2, -8,-13,-38,-18, 2; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='Q'; M=-10,-11,-30,-15, 2,-25,-27, -5, 6, -5, -5, 7, -7,-14, 31, -5, -7,-10, -8,-20, -6, 14; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='R'; M=-15,-10,-28,-10, 2,-20,-22, -4,-20, 22,-11, -4, -5,-18, 12, 38,-12,-10,-16,-20, -8, 4; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='H'; M=-16, 15,-26, 7, 0,-20,-13, 67,-26, -6,-24, -7, 28,-20, 6, 0, -3,-13,-30,-34, 5, 0; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='G'; M= 5, 2,-21, -5,-13,-23, 30,-14,-26,-13,-24,-17, 11,-17,-13,-14, 7, -1,-20,-26,-23,-13; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-22, 38,-30, 13, 0,-13, 2, 0,-20,-30,-15,-12,-20,-10, -8, 27, 72,-22; /M: SY='Y'; M=-16, -7,-28,-10, -9, 8,-23, 16, -7, -4, -9, -3, -4,-24, 6, -4,-11, -8,-17, 9, 46, -4; /M: SY='E'; M=-12, 5,-30, 13, 46,-28,-20, 0,-30, 15,-20,-18, 0, -5, 18, 16, -2,-10,-28,-28,-18, 31; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='S'; M= 8, -7,-10, -7, -7,-15, -7,-15, -8,-12,-21,-13, 1,-15, -7,-12, 28, 15, 4,-38,-18, -7; /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28, 2,-38,-28, 43,-30, 27, 20,-22,-22,-20,-28,-22,-10, 25,-20, 0,-28; /M: SY='R'; M=-15, -7,-28, -5, 12,-19,-22, -4,-22, 18,-10, -8, -5,-16, 8, 36,-11,-10,-18,-22,-11, 7; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='G'; M= -5, -8,-30, -8,-10,-29, 37,-15,-36, 3,-29,-16, 0,-18, -9, 4, -4,-16,-26,-20,-23,-10; /M: SY='A'; M= 16,-15,-15,-17,-17,-16, 7,-21, -6,-15,-12, -8,-11,-19,-17,-18, 6, -1, 7,-26,-19,-17; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='P'; M= -8,-17,-35,-10, -2,-27,-20,-20,-18,-10,-27,-18,-17, 73,-10,-18, -5, 0,-25,-30,-27,-10; /M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5, 5,-25,-20, -5,-30, 40,-25,-10, 0,-15, 10, 51,-10,-10,-20,-20,-10, 5; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='V'; M= -2,-30,-12,-30,-28, 2,-30,-28, 28,-22, 19, 12,-30,-30,-28,-20,-15, -2, 41,-28, -8,-28; /M: SY='A'; M= 32, -6,-10,-16,-10,-16, -7,-20,-10,-10,-10,-10, -6,-10,-10,-16, 14, 18, 0,-24,-16,-10; /M: SY='T'; M= 2, 0,-10, -8, -8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12, 2,-10, -8,-10, 24, 44, -2,-32,-12, -8; /M: SY='P'; M= -2,-19,-36,-11, -1,-29,-17,-20,-19,-10,-27,-19,-19, 77,-10,-20, -7, -9,-26,-29,-29,-10; /M: SY='E'; M= -8, 5,-27, 6, 20,-25,-17, -8,-23, 5,-23,-17, 4, 15, 4, -3, 2, 2,-24,-30,-20, 11; /M: SY='V'; M= -2,-30,-14,-32,-30, 0,-32,-30, 34,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 46,-28, -8,-30; /M: SY='V'; M= -2,-22,-14,-19,-11, -6,-28,-24, 17,-14, 4, 4,-24,-24,-19,-16, -8, -2, 33,-30,-12,-15; /M: SY='K'; M= 9, -1,-18, -5, 5,-22,-13,-13,-20, 11,-20,-12, -1, -9, 1, 1, 9, 9,-11,-26,-15, 3; /M: SY='R'; M=-16, -4,-30, -4, 4,-24,-20, 11,-30, 32,-24, -8, 2,-16, 10, 43,-10,-12,-22,-22, -5, 4; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='A'; M= 9, 1,-21, 0, -4,-21,-12,-13,-11, -5,-13,-11, -1,-13, -5, -5, 4, -3, -6,-27,-15, -6; /M: SY='Q'; M=-13, 9,-30, 15, 29,-34,-18, 4,-28, 12,-22,-13, 3, -9, 30, 14, -2,-10,-28,-26,-15, 29; /M: SY='L'; M=-14,-26,-24,-26,-20, 18,-30, -4, 12,-22, 31, 12,-26,-30,-16,-16,-26,-10, 2, -1, 31,-20; /M: SY='K'; M=-12, -2,-30, -2, 8,-28,-20, -8,-30, 46,-28,-10, 0,-12, 10, 38,-10,-10,-20,-20,-10, 8; /M: SY='R'; M=-10, -3,-30, -1, 11,-29, 1, -5,-31, 16,-24,-12, 0,-13, 12, 20, -4,-12,-26,-22,-16, 10; /M: SY='E'; M= -8, 6,-30, 13, 44,-31, -6, -2,-30, 5,-22,-18, 0, -4, 18, -2, 0,-12,-30,-27,-20, 31; /M: SY='C'; M=-12, 20, 30, 9, -8,-23,-13, -6,-27,-11,-26,-22, 25,-26,-11,-13, 1, -5,-23,-44,-24, -9; /M: SY='P'; M= -7,-17,-35, -8, 0,-28,-17,-18,-20,-10,-30,-20,-15, 73, -8,-18, -2, -5,-27,-32,-28, -8; /M: SY='G'; M= 15, -6,-16, -9,-10,-22, 20,-17,-23,-13,-23,-17, 1,-13,-10,-16, 18, 6,-13,-28,-22,-10; /M: SY='I'; M=-10,-27,-25,-35,-25, 2,-32,-20, 35,-25, 27, 31,-22,-22,-15,-22,-22,-10, 20,-20, 0,-22; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='A'; M= 42, -8,-10,-16, -8,-20, 0,-18,-12,-10,-14,-12, -6,-10, -8,-18, 16, 4, -2,-24,-20, -8; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='R'; M=-18, -8,-30, -8, 5,-25,-20, 2,-28, 25,-20, -8, 0,-18, 22, 56, -8,-10,-22,-20,-10, 9; /M: SY='D'; M=-16, 21,-30, 32, 30,-32,-16, 0,-34, 11,-24,-22, 8, -9, 10, 12, -2,-10,-28,-32,-18, 19; /M: SY='R'; M=-14, -4,-30, -4, 10,-30,-20, 2,-26, 26,-22, -6, 0,-14, 30, 38, -6,-10,-24,-20,-10, 18; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='L'; M=-10,-23, 9,-27,-18, -7,-30,-19, 8,-23, 16, 7,-21,-27, -9,-19,-18,-10, 3,-27, -9,-14; /M: SY='A'; M= 19, -5,-20,-10, 3,-28,-10, -9,-17, 9,-17, -7, -5,-10, 15, 0, 3, -5,-13,-20,-15, 9; /M: SY='E'; M=-12, 14,-30, 24, 47,-33,-18, 2,-30, 8,-22,-18, 3, -3, 24, 0, 0,-10,-30,-30,-18, 35; /M: SY='G'; M= -5, -3,-29, -6,-14,-27, 46,-13,-36, -9,-28,-18, 8,-20,-12, -2, 0,-16,-28,-23,-25,-14; /M: SY='V'; M= -7,-30,-14,-32,-28, 19,-30,-26, 21,-24, 19, 10,-28,-30,-30,-20,-17, -4, 30,-19, 1,-28; /M: SY='C'; M= 3,-18, 93,-28,-26,-20,-24,-28,-26,-26,-18,-18,-18,-34,-26,-28, -6, -8, -8,-44,-28,-26; /M: SY='D'; M=-13, 32,-23, 41, 9,-29,-14, -7,-29, -4,-23,-23, 13,-10, -4,-10, 7, 12,-19,-36,-16, 3; /M: SY='P'; M=-10, 2,-31, 1, 6,-30,-15, -4,-22, 6,-28,-14, 7, 25, 12, -1, -3, -8,-28,-29,-20, 7; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='D'; M=-11, 20,-20, 30, 6,-18, -9, 1,-22, -3,-19,-17, 8,-11, -2, -8, 4, -3,-17,-21, -1, 2; D=-5; /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='N'; M= -4, 11,-15, 5, 1,-17, -7, -3,-17, 9,-22,-12, 19,-11, 1, 4, 9, 6,-15,-26,-12, 1; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='V'; M= -1,-17,-11,-20,-19, -2,-23,-21, 17,-15, 5, 5,-15,-18,-18,-15, -2, 10, 25,-22, -7,-19; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='V'; M= -2,-24,-13,-27,-26, -2,-30,-28, 25,-20, 7, 7,-22,-24,-24,-20, -5, 9, 36,-28, -8,-26; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='N'; M= -3, 25,-16, 13, 0,-20, 0, 3,-20, -4,-30,-20, 42,-16, 0, -4, 21, 7,-23,-40,-20, 0; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='I'; M= -6,-30,-21,-34,-28, 2,-34,-28, 36,-26, 23, 16,-26,-26,-24,-24,-18, -6, 33,-24, -4,-28; /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21, 9,-31,-21, 23,-30, 47, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 12,-20, 0,-21; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='N'; M= 7, 14,-19, 1, -8,-21, 13, -6,-21, -8,-23,-17, 25,-17, -8,-10, 9, 1,-20,-30,-21, -8; /M: SY='S'; M= -2,-11,-19,-11, -5,-12,-16,-14, -8, -2, -1, -3, -7,-17, -5, -3, 2, 1, -5,-28,-10, -5; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 58 in 58 different sequences |
| Number of true positive hits | 58 in 58 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | window20 |
| Author [info] | PS_Langendijk_Genevaux |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DNA_BIND |
| Feature description [info] | Paired |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
58 sequences
GSBN_DROME (P09083 ), GSB_DROME (P09082 ), PAX1_CHICK (P47236 ), PAX1_HUMAN (P15863 ), PAX1_MOUSE (P09084 ), PAX2A_DANRE (Q90268 ), PAX2A_XENLA (O57685 ), PAX2B_XENLA (O57682 ), PAX2_HUMAN (Q02962 ), PAX2_MOUSE (P32114 ), PAX3A_XENLA (Q645N4 ), PAX3B_XENLA (Q0IH87 ), PAX3_HUMAN (P23760 ), PAX3_MOUSE (P24610 ), PAX3_XENTR (Q28DP6 ), PAX4_HUMAN (O43316 ), PAX4_MOUSE (P32115 ), PAX4_RAT (O88436 ), PAX5_HUMAN (Q02548 ), PAX5_MOUSE (Q02650 ), PAX5_XENLA (Q9YH95 ), PAX6_BOVIN (Q1LZF1 ), PAX6_COTJA (P47238 ), PAX6_DANRE (P26630 ), PAX6_DROME (O18381 ), PAX6_HUMAN (P26367 ), PAX6_MOUSE (P63015 ), PAX6_ORYLA (O73917 ), PAX6_RAT (P63016 ), PAX6_XENLA (P55864 ), PAX7_HUMAN (P23759 ), PAX7_MOUSE (P47239 ), PAX8_CANLF (P47240 ), PAX8_HUMAN (Q06710 ), PAX8_MOUSE (Q00288 ), PAX8_PONAB (Q5R9M8 ), PAX8_RAT (P51974 ), PAX8_XENLA (Q9PUK5 ), PAX8_XENTR (A0JMA6 ), PAX9_CALGO (Q2VL59 ), PAX9_CALJA (Q2VL58 ), PAX9_CHICK (P55166 ), PAX9_DAUMA (Q2VL53 ), PAX9_HUMAN (P55771 ), PAX9_LEMCA (Q2VL52 ), PAX9_LEORO (Q2VL57 ), PAX9_LEPED (Q2VL51 ), PAX9_MACMU (Q2VL61 ), PAX9_MOUSE (P47242 ), PAX9_PANTR (Q2VL62 ), PAX9_PERPO (Q2VL54 ), PAX9_PROCO (Q2VL50 ), PAX9_RAT (Q2L4T2 ), PAX9_SAGOE (Q2VL56 ), PAX9_SAIBB (Q2VL60 ), POXM_DROME (P23757 ), POXN_DROME (P23758 ), PRD_DROME (P06601 )» more
|
| PDB [Detailed view] |
5 PDB
1K78; 1MDM; 1PDN; 2K27; 6PAX |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission