Home  |  Contact
Entry: PS51057

General information about the entry

Entry name [info] PAIRED_2
Accession [info] PS51057
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-JAN-2005 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE;
18-SEP-2019 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC00034
Associated ProRule [info] PRU00381

Name and characterization of the entry

Description [info] Paired DNA-binding domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=127;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=122;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8596778; R2=0.0108799; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-437.4077759; R2=14.8252430; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.1%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=868; H_SCORE=12431; N_SCORE=11.3; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=427; H_SCORE=5893; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='G';  M= -1,-10, -7,-13,-20,-26, 43,-21,-34,-20,-26,-18, -3,-21,-20,-20,  2, -8,-23,-26,-27,-20;
/M: SY='H';  M=-14,-10,-30,-12, -2,-15,-26, 24, -3, -7, -8,  5, -5,-18, 19, -5,-10,-12,-13,-15, 13,  5;
/M: SY='G';  M= 12, -6,-19, -8,-11,-25, 33,-16,-28,-15,-27,-18,  2,-15,-11,-16, 16, -2,-18,-27,-25,-11;
/M: SY='G';  M= -3, -5,-25, -3,  1,-26, 21,-10,-32, -3,-26,-18,  2,-15, -3,  4,  7, -7,-23,-26,-22, -2;
/M: SY='V';  M= -2,-28,-12,-30,-28,  0,-28,-23, 28,-18, 12, 22,-28,-28,-23,-18,-12, -2, 41,-28, -8,-25;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='V';  M= -2,-30,-12,-30,-28,  2,-30,-28, 28,-22, 19, 12,-30,-30,-28,-20,-15, -2, 41,-28, -8,-28;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='V';  M= -2,-30,-14,-32,-30,  0,-32,-30, 34,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 46,-28, -8,-30;
/M: SY='N';  M= -9, 33,-21, 16, -3,-21,  9,  6,-23, -3,-30,-20, 52,-20, -3, -3,  9, -3,-30,-37,-21, -3;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='D';  M=-14, 28,-24, 29,  3,-21,-11, -1,-19, -7,-11,-15, 23,-18, -5, -9, -3, -6,-21,-35,-15, -1;
/M: SY='H';  M= -2,  4,  3,  5, -5,-23,-15,  9,-22,-12,-19,-13,  0,-19, -8,-14,  2, -6,-11,-35,-12, -7;
/M: SY='V';  M= -4,-19,-17,-26,-23, -4,-30,-26, 23,-20,  6,  6,-15,-19,-19,-20, -3, 15, 24,-26, -6,-23;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='Q';  M=-12,-13,-26,-13,  2,-18,-24, -3, -7, -1,  5,  6,-11,-19, 23,  9,-13,-10,-14,-20, -6, 12;
/M: SY='R';  M=-14, -4,-30, -4,  8,-28,-20, -1,-28, 32,-23, -8,  0,-14, 22, 42, -8,-10,-22,-20,-10, 13;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='E';  M=-14, 12,-30, 21, 39,-29,-18,  0,-32, 13,-22,-19,  3, -6, 14, 15, -2,-10,-28,-29,-18, 26;
/M: SY='L';  M=-10,-28,-20,-30,-20,  8,-28,-16, 20,-26, 44, 28,-28,-28,-16,-18,-28,-10, 10,-20,  0,-18;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='H';  M=  3,-14,-19,-16, -9,-13,-20, 11, -2,-13,  1,  4,-12,-20, -1,-11, -8, -8,  2,-25, -3, -6;
/M: SY='S';  M=  2, -8,  8,-10, -6,-18,-12,-13,-16,-14,-15,-12, -2,-18, -2,-13, 17,  7, -9,-37,-18, -4;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='V';  M=  3,-25,-15,-30,-25, -3,-25,-22, 25,-18, 11, 20,-23,-23,-19,-19,-11, -4, 31,-25, -7,-23;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='D';  M=-16, 33,-26, 49,  9,-32,-14, -6,-25, -4,-22,-22,  9,-14, -6,-12, -2, -8,-13,-38,-18,  2;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='Q';  M=-10,-11,-30,-15,  2,-25,-27, -5,  6, -5, -5,  7, -7,-14, 31, -5, -7,-10, -8,-20, -6, 14;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='R';  M=-15,-10,-28,-10,  2,-20,-22, -4,-20, 22,-11, -4, -5,-18, 12, 38,-12,-10,-16,-20, -8,  4;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='H';  M=-16, 15,-26,  7,  0,-20,-13, 67,-26, -6,-24, -7, 28,-20,  6,  0, -3,-13,-30,-34,  5,  0;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='G';  M=  5,  2,-21, -5,-13,-23, 30,-14,-26,-13,-24,-17, 11,-17,-13,-14,  7, -1,-20,-26,-23,-13;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='Y';  M=-20,-22,-28,-23,-22, 38,-30, 13,  0,-13,  2,  0,-20,-30,-15,-12,-20,-10, -8, 27, 72,-22;
/M: SY='Y';  M=-16, -7,-28,-10, -9,  8,-23, 16, -7, -4, -9, -3, -4,-24,  6, -4,-11, -8,-17,  9, 46, -4;
/M: SY='E';  M=-12,  5,-30, 13, 46,-28,-20,  0,-30, 15,-20,-18,  0, -5, 18, 16, -2,-10,-28,-28,-18, 31;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='S';  M=  8, -7,-10, -7, -7,-15, -7,-15, -8,-12,-21,-13,  1,-15, -7,-12, 28, 15,  4,-38,-18, -7;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-28,-38,-28,  2,-38,-28, 43,-30, 27, 20,-22,-22,-20,-28,-22,-10, 25,-20,  0,-28;
/M: SY='R';  M=-15, -7,-28, -5, 12,-19,-22, -4,-22, 18,-10, -8, -5,-16,  8, 36,-11,-10,-18,-22,-11,  7;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='G';  M= -5, -8,-30, -8,-10,-29, 37,-15,-36,  3,-29,-16,  0,-18, -9,  4, -4,-16,-26,-20,-23,-10;
/M: SY='A';  M= 16,-15,-15,-17,-17,-16,  7,-21, -6,-15,-12, -8,-11,-19,-17,-18,  6, -1,  7,-26,-19,-17;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='P';  M= -8,-17,-35,-10, -2,-27,-20,-20,-18,-10,-27,-18,-17, 73,-10,-18, -5,  0,-25,-30,-27,-10;
/M: SY='R';  M=-15, -5,-30, -5,  5,-25,-20, -5,-30, 40,-25,-10,  0,-15, 10, 51,-10,-10,-20,-20,-10,  5;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='V';  M= -2,-30,-12,-30,-28,  2,-30,-28, 28,-22, 19, 12,-30,-30,-28,-20,-15, -2, 41,-28, -8,-28;
/M: SY='A';  M= 32, -6,-10,-16,-10,-16, -7,-20,-10,-10,-10,-10, -6,-10,-10,-16, 14, 18,  0,-24,-16,-10;
/M: SY='T';  M=  2,  0,-10, -8, -8,-12,-16,-18,-12,-10,-14,-12,  2,-10, -8,-10, 24, 44, -2,-32,-12, -8;
/M: SY='P';  M= -2,-19,-36,-11, -1,-29,-17,-20,-19,-10,-27,-19,-19, 77,-10,-20, -7, -9,-26,-29,-29,-10;
/M: SY='E';  M= -8,  5,-27,  6, 20,-25,-17, -8,-23,  5,-23,-17,  4, 15,  4, -3,  2,  2,-24,-30,-20, 11;
/M: SY='V';  M= -2,-30,-14,-32,-30,  0,-32,-30, 34,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 46,-28, -8,-30;
/M: SY='V';  M= -2,-22,-14,-19,-11, -6,-28,-24, 17,-14,  4,  4,-24,-24,-19,-16, -8, -2, 33,-30,-12,-15;
/M: SY='K';  M=  9, -1,-18, -5,  5,-22,-13,-13,-20, 11,-20,-12, -1, -9,  1,  1,  9,  9,-11,-26,-15,  3;
/M: SY='R';  M=-16, -4,-30, -4,  4,-24,-20, 11,-30, 32,-24, -8,  2,-16, 10, 43,-10,-12,-22,-22, -5,  4;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='A';  M=  9,  1,-21,  0, -4,-21,-12,-13,-11, -5,-13,-11, -1,-13, -5, -5,  4, -3, -6,-27,-15, -6;
/M: SY='Q';  M=-13,  9,-30, 15, 29,-34,-18,  4,-28, 12,-22,-13,  3, -9, 30, 14, -2,-10,-28,-26,-15, 29;
/M: SY='L';  M=-14,-26,-24,-26,-20, 18,-30, -4, 12,-22, 31, 12,-26,-30,-16,-16,-26,-10,  2, -1, 31,-20;
/M: SY='K';  M=-12, -2,-30, -2,  8,-28,-20, -8,-30, 46,-28,-10,  0,-12, 10, 38,-10,-10,-20,-20,-10,  8;
/M: SY='R';  M=-10, -3,-30, -1, 11,-29,  1, -5,-31, 16,-24,-12,  0,-13, 12, 20, -4,-12,-26,-22,-16, 10;
/M: SY='E';  M= -8,  6,-30, 13, 44,-31, -6, -2,-30,  5,-22,-18,  0, -4, 18, -2,  0,-12,-30,-27,-20, 31;
/M: SY='C';  M=-12, 20, 30,  9, -8,-23,-13, -6,-27,-11,-26,-22, 25,-26,-11,-13,  1, -5,-23,-44,-24, -9;
/M: SY='P';  M= -7,-17,-35, -8,  0,-28,-17,-18,-20,-10,-30,-20,-15, 73, -8,-18, -2, -5,-27,-32,-28, -8;
/M: SY='G';  M= 15, -6,-16, -9,-10,-22, 20,-17,-23,-13,-23,-17,  1,-13,-10,-16, 18,  6,-13,-28,-22,-10;
/M: SY='I';  M=-10,-27,-25,-35,-25,  2,-32,-20, 35,-25, 27, 31,-22,-22,-15,-22,-22,-10, 20,-20,  0,-22;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='A';  M= 42, -8,-10,-16, -8,-20,  0,-18,-12,-10,-14,-12, -6,-10, -8,-18, 16,  4, -2,-24,-20, -8;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='R';  M=-18, -8,-30, -8,  5,-25,-20,  2,-28, 25,-20, -8,  0,-18, 22, 56, -8,-10,-22,-20,-10,  9;
/M: SY='D';  M=-16, 21,-30, 32, 30,-32,-16,  0,-34, 11,-24,-22,  8, -9, 10, 12, -2,-10,-28,-32,-18, 19;
/M: SY='R';  M=-14, -4,-30, -4, 10,-30,-20,  2,-26, 26,-22, -6,  0,-14, 30, 38, -6,-10,-24,-20,-10, 18;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='L';  M=-10,-23,  9,-27,-18, -7,-30,-19,  8,-23, 16,  7,-21,-27, -9,-19,-18,-10,  3,-27, -9,-14;
/M: SY='A';  M= 19, -5,-20,-10,  3,-28,-10, -9,-17,  9,-17, -7, -5,-10, 15,  0,  3, -5,-13,-20,-15,  9;
/M: SY='E';  M=-12, 14,-30, 24, 47,-33,-18,  2,-30,  8,-22,-18,  3, -3, 24,  0,  0,-10,-30,-30,-18, 35;
/M: SY='G';  M= -5, -3,-29, -6,-14,-27, 46,-13,-36, -9,-28,-18,  8,-20,-12, -2,  0,-16,-28,-23,-25,-14;
/M: SY='V';  M= -7,-30,-14,-32,-28, 19,-30,-26, 21,-24, 19, 10,-28,-30,-30,-20,-17, -4, 30,-19,  1,-28;
/M: SY='C';  M=  3,-18, 93,-28,-26,-20,-24,-28,-26,-26,-18,-18,-18,-34,-26,-28, -6, -8, -8,-44,-28,-26;
/M: SY='D';  M=-13, 32,-23, 41,  9,-29,-14, -7,-29, -4,-23,-23, 13,-10, -4,-10,  7, 12,-19,-36,-16,  3;
/M: SY='P';  M=-10,  2,-31,  1,  6,-30,-15, -4,-22,  6,-28,-14,  7, 25, 12, -1, -3, -8,-28,-29,-20,  7;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='D';  M=-11, 20,-20, 30,  6,-18, -9,  1,-22, -3,-19,-17,  8,-11, -2, -8,  4, -3,-17,-21, -1,  2; D=-5;
/I:         I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='N';  M= -4, 11,-15,  5,  1,-17, -7, -3,-17,  9,-22,-12, 19,-11,  1,  4,  9,  6,-15,-26,-12,  1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='V';  M= -1,-17,-11,-20,-19, -2,-23,-21, 17,-15,  5,  5,-15,-18,-18,-15, -2, 10, 25,-22, -7,-19; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='V';  M= -2,-24,-13,-27,-26, -2,-30,-28, 25,-20,  7,  7,-22,-24,-24,-20, -5,  9, 36,-28, -8,-26;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='N';  M= -3, 25,-16, 13,  0,-20,  0,  3,-20, -4,-30,-20, 42,-16,  0, -4, 21,  7,-23,-40,-20,  0;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='I';  M= -6,-30,-21,-34,-28,  2,-34,-28, 36,-26, 23, 16,-26,-26,-24,-24,-18, -6, 33,-24, -4,-28;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-21,-31,-21,  9,-31,-21, 23,-30, 47, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 12,-20,  0,-21;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='N';  M=  7, 14,-19,  1, -8,-21, 13, -6,-21, -8,-23,-17, 25,-17, -8,-10,  9,  1,-20,-30,-21, -8;
/M: SY='S';  M= -2,-11,-19,-11, -5,-12,-16,-14, -8, -2, -1, -3, -7,-17, -5, -3,  2,  1, -5,-28,-10, -5;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2019_08 which contains 560'823 sequence entries.


Total number of hits 58 in 58 different sequences
Number of true positive hits 58 in 58 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] window20
Author [info] PS_Langendijk_Genevaux
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DNA_BIND
Feature description [info] Paired
Version [info] 5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
58 sequences

GSBN_DROME  (P09083    ), GSB_DROME   (P09082    ), PAX1_CHICK  (P47236    ), 
PAX1_HUMAN  (P15863    ), PAX1_MOUSE  (P09084    ), PAX2A_DANRE (Q90268    ), 
PAX2A_XENLA (O57685    ), PAX2B_XENLA (O57682    ), PAX2_HUMAN  (Q02962    ), 
PAX2_MOUSE  (P32114    ), PAX3A_XENLA (Q645N4    ), PAX3B_XENLA (Q0IH87    ), 
PAX3_HUMAN  (P23760    ), PAX3_MOUSE  (P24610    ), PAX3_XENTR  (Q28DP6    ), 
PAX4_HUMAN  (O43316    ), PAX4_MOUSE  (P32115    ), PAX4_RAT    (O88436    ), 
PAX5_HUMAN  (Q02548    ), PAX5_MOUSE  (Q02650    ), PAX5_XENLA  (Q9YH95    ), 
PAX6_BOVIN  (Q1LZF1    ), PAX6_COTJA  (P47238    ), PAX6_DANRE  (P26630    ), 
PAX6_DROME  (O18381    ), PAX6_HUMAN  (P26367    ), PAX6_MOUSE  (P63015    ), 
PAX6_ORYLA  (O73917    ), PAX6_RAT    (P63016    ), PAX6_XENLA  (P55864    ), 
PAX7_HUMAN  (P23759    ), PAX7_MOUSE  (P47239    ), PAX8_CANLF  (P47240    ), 
PAX8_HUMAN  (Q06710    ), PAX8_MOUSE  (Q00288    ), PAX8_PONAB  (Q5R9M8    ), 
PAX8_RAT    (P51974    ), PAX8_XENLA  (Q9PUK5    ), PAX8_XENTR  (A0JMA6    ), 
PAX9_CALGO  (Q2VL59    ), PAX9_CALJA  (Q2VL58    ), PAX9_CHICK  (P55166    ), 
PAX9_DAUMA  (Q2VL53    ), PAX9_HUMAN  (P55771    ), PAX9_LEMCA  (Q2VL52    ), 
PAX9_LEORO  (Q2VL57    ), PAX9_LEPED  (Q2VL51    ), PAX9_MACMU  (Q2VL61    ), 
PAX9_MOUSE  (P47242    ), PAX9_PANTR  (Q2VL62    ), PAX9_PERPO  (Q2VL54    ), 
PAX9_PROCO  (Q2VL50    ), PAX9_RAT    (Q2L4T2    ), PAX9_SAGOE  (Q2VL56    ), 
PAX9_SAIBB  (Q2VL60    ), POXM_DROME  (P23757    ), POXN_DROME  (P23758    ), 
PRD_DROME   (P06601    )
» more

PDB
[Detailed view]
5 PDB

1K78; 1MDM; 1PDN; 2K27; 6PAX

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission