PROSITE entry PS51074
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | DPH_MB |
| Accession [info] | PS51074 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JAN-2005 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51074 |
| Associated ProRule [info] | PRU00456 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | DPH-type metal-binding (MB) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=57; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=52; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5419047; R2=0.0187807; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2564.2028809; R2=1.9955882; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=451; H_SCORE=3464; N_SCORE=11.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=211; H_SCORE=2985; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='F'; M= -7,-19,-17,-21,-20, 2,-10,-16, -3,-20, -9, -6,-14,-25,-19,-22, -9, -7, -1,-11, -1,-20; /M: SY='Y'; M= -8,-18,-17,-17,-13, 0,-24, -2, -5,-15, -1, -4,-14,-23,-11,-16,-11,-12, -6,-14, 9,-14; /M: SY='D'; M= -8, 16,-25, 27, 15,-26,-13,-11,-23, -5,-26,-19, 1,-12, 1,-11, 2, -6,-21,-34,-24, 8; /M: SY='E'; M= -8, -5,-27, 0, 18,-20,-24, -8,-10, -3,-13, -8, -8,-15, 6, -9, -4, -6, -5,-28,-15, 14; /M: SY='I'; M= -6,-26,-13,-27,-21, -1,-31,-21, 21,-21, 8, 6,-24,-24,-18,-25,-15, -5, 21,-23, -4,-20; /M: SY='E'; M= -7, 6,-23, 8, 16,-25,-15, -2,-25, 4,-25,-16, 5,-13, 6, -1, 7, -2,-21,-29,-17, 12; /M: SY='L'; M= -9,-31,-13,-31,-23, -4,-36,-26, 18,-17, 24, 12,-25,-27,-18,-18,-16, -9, 11,-25,-12,-23; /M: SY='E'; M=-11, 17,-32, 26, 28,-29,-15, -5,-27, 4,-30,-21, 4,-11, 9, -5, 1, -8,-22,-34,-23, 20; /M: SY='D'; M=-14, 23,-31, 38, 22,-29,-14,-10,-28, -6,-33,-24, 3, -4, 3,-15, -1,-10,-24,-37,-27, 13; /M: SY='F'; M=-14,-28,-15,-29,-24, 21,-30,-16, 4,-18, 10, 18,-21,-29,-15,-17,-14,-11, -1, -6, 5,-20; /M: SY='E'; M= -8, 3,-29, 8, 23,-24,-18, -7,-21, 5,-22,-13, 0,-12, 10, -4, 3, -2,-14,-28,-18, 19; /I: I=-4; MD=-23; /M: SY='Y'; M=-15,-25,-19,-25,-21, 17,-19, -8, -7,-21, -8, -4,-22,-29,-17,-21,-17,-15, -8, 13, 20,-21; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='D'; M= -9, 11,-26, 15, 12,-26,-13, -6,-21, -4,-25,-18, 9,-11, 1, -8, 3, -3,-18,-34,-21, 7; /M: SY='E'; M= -5, -1,-29, 3, 18,-24,-13, -5,-25, 2,-23,-15, -3, -8, 9, -4, -2,-10,-17,-26,-14, 14; /M: SY='D'; M= -8, 10,-31, 18, 15,-28, 4, -8,-30, -5,-32,-23, 2,-13, 3,-11, 1, -9,-23,-29,-24, 10; /M: SY='E'; M= -8, -4,-24, -2, 7,-21,-18,-12,-14, 2,-11, -5, -4,-15, 2, -6, 0, -2,-10,-27,-18, 5; /M: SY='E'; M=-12, 1,-25, 3, 8,-21,-13, -7,-23, -2,-22,-14, -2,-17, 4, -6, -5,-11,-19,-22,-16, 6; /M: SY='T'; M= 0, -8,-13, -6, -5,-19,-11,-17,-11, -8,-13, -8, -5,-14, -7,-14, 7, 8, -6,-26,-19, -6; /M: SY='Y'; M=-19,-32,-18,-32,-26, 34,-30, -5, -3,-25, 0, -2,-28,-35,-21,-26,-21,-18, -8, 19, 35,-26; /M: SY='F'; M=-10,-21,-16,-20,-18, 12,-25, -7, -2,-18, -2, -2,-17,-25,-15,-19, -8, -5, -4, -8, 12,-18; /M: SY='Y'; M=-14,-25,-18,-26,-14, 10,-29, 1, -6,-10, -3, 1,-18,-25, -7,-11,-16,-14, -5, -1, 27,-14; /M: SY='P'; M= -9, -6,-24, 1, -5,-23,-16,-13,-24,-10,-25,-17, -7, 21, -7,-17, -2, -3,-18,-30,-18, -6; /M: SY='C'; M= 0,-30, 90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30; /M: SY='P'; M=-10,-15,-30,-15, -5,-35,-20,-10,-30, 4,-25,-15,-10, 27, 0, 14,-10,-10,-25,-35,-25, -5; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='C'; M= 0,-30, 90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30; /M: SY='G'; M= 0, -9,-29, -9,-14,-29, 47,-17,-37,-16,-36,-25, 0,-18,-11,-16, 1,-17,-28,-21,-27,-13; /M: SY='D'; M=-11, 11,-26, 19, 2,-18, 0, -7,-24,-13,-29,-22, 3,-16, -7,-18, -1,-11,-22,-28,-17, -3; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: M= -9,-11,-24,-13, -8,-12, -5,-10,-19, -4,-17,-12, -6,-20, -7, -5, -5, -8,-16,-18, -8, -9; /M: SY='F'; M=-19,-30,-19,-30,-28, 51,-31, -6, 0,-28, 0, -1,-28,-38,-26,-28,-20,-19, -8, 10, 35,-28; /M: SY='E'; M= -5, -5,-19, -4, 6,-21,-20,-10,-10, -2,-13, -7, -5,-15, 3, -8, -1, -4, -6,-29,-16, 5; /M: SY='I'; M= -9,-32,-12,-32,-27, 4,-32,-27, 21,-24, 19, 10,-28,-28,-24,-26,-19, -8, 17,-20, -6,-27; /M: SY='T'; M= 0, -4,-16, -4, -4,-23,-12,-14,-18, -4,-17,-12, 3, -2, -5,-10, 14, 17,-13,-29,-21, -4; /M: SY='E'; M= -6, -5,-28, -2, 18,-24,-22,-10,-18, 8,-14, -9, -7,-10, 7, -2, -2, -8,-12,-29,-18, 14; /M: SY='D'; M=-11, 19,-31, 28, 27,-29,-12, -4,-28, 1,-31,-21, 8,-11, 9, -6, 4, -7,-24,-34,-23, 20; /M: SY='D'; M=-11, 13,-27, 23, 16,-24,-17, -8,-20, -5,-22,-16, 0,-13, 2,-12, -3, -9,-17,-32,-21, 10; /M: SY='L'; M= -7,-27, -9,-27,-19, -5,-31,-22, 7,-16, 17, 10,-22,-25,-10,-16,-13, -8, 3,-20, -8,-18; /M: SY='E'; M=-10, -1,-29, 3, 11,-22,-10, -7,-24, -3,-23,-15, -4,-13, 5, -5, -5,-12,-19,-25,-15, 8; /M: SY='E'; M=-10, 8,-31, 10, 22,-27,-13, -3,-26, 4,-24,-15, 7,-13, 13, -1, 2, -6,-21,-29,-19, 18; /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='G'; M= -5,-10,-25, -8, -6,-14, 7, -6,-23,-13,-24,-17, -6,-16, -9,-16, -4,-13,-17,-18, -6, -8; /M: SY='E'; M= -7, -1,-27, 3, 18,-19,-19, -5,-19, 0,-20,-12, -3,-14, 9, -5, 2, -2,-13,-23,-10, 15; /M: SY='V'; M= -6,-10,-19, -6, -3,-16,-20,-20, 3,-13, -5, -4,-13,-18,-10,-20, -9, -4, 7,-30,-17, -6; /M: SY='I'; M= -7,-31, -2,-31,-27, -3,-36,-28, 28,-25, 16, 9,-30,-27,-25,-28,-19, -8, 25,-26, -7,-27; /M: SY='V'; M= 6,-24,-10,-24,-16, -9,-20,-20, 4,-15, 0, -1,-21,-11,-14,-20, -6, -1, 10,-24, -8,-16; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='Q'; M= -6, -6,-21, -5, 8,-24,-17, -9,-16, 1,-16, -6, -6, -8, 13, -2, -2, -5, -9,-25,-15, 10; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='C'; M= 0,-30, 90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30; /M: SY='P'; M= -4, -3,-25, 3, -2,-30, 0,-14,-27, -8,-28,-17, -3, 10, -3,-14, 2, -7,-21,-31,-25, -3; /M: SY='S'; M= 8, -4,-14, -3, -1,-15, -3,-12,-18, -5,-19,-12, 0,-13, -4,-12, 22, 4,-16,-26,-17, -2; /M: SY='C'; M= -1,-28, 80,-29,-37,-21,-29,-28,-12,-26,-11,-10,-28,-29,-27,-23,-10,-10,-12,-21,-20,-28; /M: SY='S'; M= 7, -3,-11, -3, -3,-13, -3,-10,-18, -3,-18, -9, 6,-12, -3,-12, 34, 9,-18,-26,-16, -3; /M: SY='L'; M= -8,-36,-10,-36,-27, -2,-36,-28, 19,-19, 32, 16,-27,-28,-19,-20,-15, -8, 11,-22,-11,-27; /M: SY='W'; M=-11,-25,-11,-25,-20, -7,-25,-21, -4,-16, -4, 1,-22,-18,-15,-20,-10, -5, -3, 5, -6,-19; /M: SY='I'; M= -7,-26,-11,-24,-22, -6,-34,-28, 24,-23, 16, 8,-25,-25,-22,-26,-16, -6, 21,-28,-12,-23; /M: SY='K'; M=-12, -8,-25,-11, 6,-20,-22, -6,-24, 14,-19,-10, -7,-17, 7, 9, -6, -8,-18,-13, -9, 5; /M: SY='V'; M= -2,-29,-10,-29,-21, -8,-30,-28, 24,-19, 13, 10,-26,-22,-19,-26,-14, -1, 28,-28,-11,-21; /M: SY='I'; M=-11,-14,-13,-17,-14,-14,-27,-19, 3, -9, 0, -1,-11,-23,-12,-13,-11, -6, 2,-24,-14,-14; /M: SY='Y'; M=-16,-22,-22,-23,-15, 15,-27, 7,-13,-14,-12, -8,-17,-19, -8,-14,-15,-14,-12, 0, 30,-14; /M: SY='D'; M= -9, 9,-26, 14, 8,-19, -8, -6,-23, -7,-26,-18, 5,-15, 1,-13, 1, -7,-19,-27,-14, 5; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 40 in 40 different sequences |
| Number of true positive hits | 40 in 40 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | window20 |
| Author [info] | N_Hulo |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | DPH-type MB |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
40 sequences
DJC24_BOVIN (Q0VBY7), DJC24_HUMAN (Q6P3W2), DJC24_MOUSE (Q91ZF0), DPH3B_HUMAN (Q9H4G8), DPH3_ASPFU (Q4WPU8), DPH3_BOVIN (Q1LZC9), DPH3_CAEEL (Q21102), DPH3_CANGA (Q6FXS6), DPH3_CRIGR (Q6VUC1), DPH3_CRYNB (P0CN23), DPH3_CRYNJ (P0CN22), DPH3_DEBHA (Q6BTW5), DPH3_DROME (Q9VGQ9), DPH3_EMENI (P0C0V4), DPH3_ENCCU (Q8STR6), DPH3_EREGS (Q74Z32), DPH3_GIBZE (Q4I9U7), DPH3_HUMAN (Q96FX2), DPH3_KLULA (Q6CMG4), DPH3_MACFA (Q4R312), DPH3_MOUSE (Q8K0W9), DPH3_NEUCR (Q7SC15), DPH3_PONAB (Q5R7N8), DPH3_SCHPO (Q9UT33), DPH3_USTMA (Q4P8G2), DPH3_YARLI (Q6C0G3), DPH3_YEAST (Q3E840), DPH4_ASPFU (Q4WPF7), DPH4_CANAL (Q5AD49), DPH4_CANGA (Q6FWM1), DPH4_DEBHA (Q6BPC1), DPH4_DICDI (Q54CI5), DPH4_EMENI (P0C0V5), DPH4_EREGS (Q752D7), DPH4_GIBZE (Q4I7G0), DPH4_KLULA (Q6CUQ9), DPH4_NEUCR (Q7SEK8), DPH4_SCHPO (Q9UUG3), DPH4_YARLI (Q6C6T1), DPH4_YEAST (P47138)» more
|
| PDB [Detailed view] |
9 PDB
1WGE; 1YOP; 1YWS; 2JR7; 2L6L; 4D4O; 4D4P; 4X33; 5AX2 |