Home  |  Contact
Entry: PS51078

General information about the entry

Entry name [info] ICLR_ED
Accession [info] PS51078
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-FEB-2005 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE;
22-APR-2020 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC00807
Associated ProRule [info] PRU00394

Name and characterization of the entry

Description [info] IclR effector binding domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=184;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=179;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9659883; R2=0.0176867; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=10567.5791016; R2=10.6514912; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=466; H_SCORE=15531; N_SCORE=10.2; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=257; H_SCORE=13305; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='K';  M= -4, -5,-26, -5,  6,-25,-13, -5,-25, 24,-22,-10, -2,-13,  5, 23, -6, -9,-16,-22,-12,  4;
/M: SY='L';  M= -6,-20,-18,-25,-21, 10,-26,-18, 14,-22, 20,  8,-17,-27,-21,-18,-15, -3, 14,-20,  0,-21;
/M: SY='L';  M=-11,-28,-21,-31,-24, 19,-31,-18, 17,-22, 20, 10,-24,-28,-23,-14,-20, -8, 15,-12, 10,-24;
/M: SY='E';  M= -9,  1,-26,  2, 21,-24,-17, -2,-24, 12,-18,-11,  2,-11, 14, 21,  0, -4,-21,-26,-15, 16;
/M: SY='L';  M=-10,-28,-19,-29,-21, 11,-29,-18, 18,-25, 36, 18,-28,-29,-20,-16,-25, -9, 13,-18,  3,-21;
/M: SY='G';  M=  7, -8,-24, -9,-15,-27, 49,-18,-33,-17,-28,-19,  1,-17,-15,-18,  9,-10,-23,-24,-27,-15;
/M: SY='S';  M=  3, -5,-14, -7,  0,-23, -1, -1,-22, -6,-19,-11, -2,-15,  2, -4,  5, -3,-15,-27,-15,  0;
/M: SY='S';  M=  4, -6,-19, -9, -1,-13, -8, -7,-17, -4,-14,-10, -2,-14, -2, -4,  7,  4,-12,-24,-10, -2;
/M: SY='Y';  M=  5,-20,-19,-25,-19, 17,-20,-10,  0,-13,  1, -2,-18,-23,-18,-15, -9, -6,  3, -2, 20,-19;
/M: SY='L';  M= -4,-24,-19,-26,-17,  2,-25,-19, 12,-22, 30, 12,-22,-25,-16,-13,-18, -6,  8,-22, -4,-17;
/M: SY='D';  M= -2,  6,-23,  9,  7,-27, -8,  5,-26,  3,-24,-14,  5,-12,  9,  5,  7, -4,-20,-29,-13,  7;
/M: SY='R';  M= -8, -2,-22, -3,  3,-20,-14,  1,-21,  8,-20,-11,  5,-16,  6, 20,  6, -1,-15,-29,-12,  3;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='L';  M= -9,-16,-22,-19,-11, -2,-24, -3,  1, -9,  8,  7,-13,-21, -2, -1,-13, -6, -2,-15,  4, -8; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='D';  M=-15, 23,-30, 29, 10,-28,-11,  1,-29,  0,-27,-22, 14,  1, -1, -7, -3,-10,-28,-21,-15,  4; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-29;
/M: SY='L';  M= -5,-28,-23,-33,-24,  3,-31,-24, 30,-28, 32, 17,-25,-25,-20,-24,-22, -9, 19,-20, -2,-24;
/M: SY='R';  M= -4,-16,-24,-18,-10,-11,-17,-15, -8, -2, -8, -5,-11, -6, -8,  7, -7, -6, -4,-22,-11,-11;
/M: SY='E';  M=  0, -1,-23,  0,  8,-23,-17, -5,-15,  5,-16, -9, -3,-12,  5,  2,  0, -4,-10,-26,-13,  6;
/M: SY='V';  M= -4,-21,-21,-23,-15, -7,-24,-18,  9,-12,  6,  5,-17,-22, -9, -7,-10, -5, 11,-18, -7,-13;
/M: SY='A';  M= 38,-11, -4,-20,-12,-18, -5,-21, -8,-12,-10, -9,-11,-13,-12,-19,  9,  3,  3,-24,-19,-12;
/M: SY='R';  M= -6, -6,-26, -7, -1,-18,-13,  2,-22, 10,-16, -7, -2,-17,  7, 20, -5, -9,-17,-21, -8,  1;
/M: SY='P';  M= -7,-15,-32, -9, -4,-24,-16,-18,-14,-10,-23,-15,-13, 48,-10,-14, -4, -6,-17,-30,-24,-10;
/M: SY='Y';  M=-14,-22,-28,-25,-18,  7,-28,  2,  4,-17,  1,  3,-17,-19,-13,-12,-18,-12,  0, -1, 12,-17;
/M: SY='L';  M= -9,-25,-19,-29,-19,  5,-26,-13, 18,-22, 36, 33,-25,-25,-12,-16,-24, -7,  9,-21, -1,-16;
/M: SY='E';  M= -9, 10,-26, 13, 14,-27,-10, -4,-26,  7,-21,-15,  5,-12,  8,  9,  0, -4,-20,-28,-16, 10;
/M: SY='E';  M= -5, 11,-26, 16, 22,-28,-14, -3,-25,  6,-18,-15,  4,-10, 10,  5, -1, -8,-22,-28,-17, 15;
/M: SY='L';  M= -9,-30,-21,-31,-22,  8,-31,-22, 24,-29, 45, 19,-29,-29,-21,-21,-28, -9, 14,-21, -1,-22;
/M: SY='M';  M=  5,-10,-10,-16, -9,-13,-13, -9, -3, -9, -3, 10, -7,-17, -2, -8,  1, -2, -2,-27,-12, -5;
/M: SY='E';  M= -1,  2,-24,  3, 11,-22,-16, -8,-18,  5,-12,-11, -1,-12,  2,  6, -4, -8,-14,-26,-14,  6;
/M: SY='R';  M= -2, -4,-24, -5, 10,-23,-17, -7,-19, 11,-14, -8, -3,-12, 12, 13,  0, -2,-16,-24,-13, 10;
/M: SY='T';  M=  1, -7,-11,-13,-12, -9,-18,-20, -3,-13, -7, -7, -5,-15,-12,-12, 16, 31,  7,-31,-11,-12;
/M: SY='G';  M= -3, -7,-27, -7,-11,-26, 39, -9,-31,-11,-26,-16,  1,-19,-12,-11,  0,-15,-22,-24,-22,-12;
/M: SY='E';  M= -6, -4,-29,  1, 30,-19,-20, -8,-19, -1, -8,-12,-10, -9,  8, -7, -9,-12,-21, -6,-11, 20;
/M: SY='T';  M=  3, -5,-15,-11,-10,-12,-17, -9, -8,-11, -9, -8, -2, -7,-10,-12, 10, 22, -2,-29,-11,-10;
/M: SY='V';  M=  4,-22, 12,-28,-25, -4,-25,-27,  9,-21,  0,  0,-21,-26,-25,-22, -5,  2, 22,-29,-12,-25;
/M: SY='H';  M=-13, 12,-24,  7, -2,-17,-14, 41,-20, -7,-20, -9, 20,-20,  1, -4,  0, -6,-20,-31,  3, -3;
/M: SY='L';  M= -4,-27,-18,-30,-21,  8,-27,-19, 19,-24, 33, 21,-26,-26,-18,-19,-22, -8, 15,-20, -1,-20;
/M: SY='A';  M= 12,-11,-17,-16,-15,-11, 11,-20,-13,-16,-14,-11, -6,-17,-16,-18,  8,  2, -5,-23,-16,-15;
/M: SY='V';  M=  3,-19,-14,-23,-19, -5,-23,-23, 14,-19,  7,  4,-16,-21,-18,-18, -1,  9, 19,-27, -9,-19;
/M: SY='L';  M= -9,-23,-22,-24,-16,  0,-26,-14,  8,-11, 22, 12,-20,-25,-12,  1,-20, -9,  6,-19, -1,-15;
/M: SY='D';  M=-13, 25,-26, 36, 20,-30,-12,  8,-30, -1,-25,-21, 13,-10,  4, -7,  4, -6,-23,-36,-15, 11;
/M: SY='G';  M= -4,  3,-26,  5,  5,-29, 17, -9,-27, -7,-24,-16,  4,-14,  2,-10,  4, -9,-22,-27,-22,  3;
/M: SY='D';  M=-14, 21,-27, 29,  5,-24, -6,  2,-27, -5,-23,-18, 11,-15, -1, -7,  0, -8,-22,-29,-10,  1;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='E';  M= -4,  4,-19,  9, 26,-23,-11,  1,-26, -1,-20,-17,  0, -9,  6, -7,  4, -6,-23,-27,-11, 16;
/M: SY='A';  M= 15,-18,-16,-24,-18,-10,-10,-20,  8,-17,  1,  6,-15,-18,-15,-20, -2, -3, 13,-24,-13,-17;
/M: SY='V';  M= -5,-27,-17,-30,-26,  3,-31,-24, 27,-23, 19, 12,-25,-26,-23,-21,-15, -1, 30,-23, -1,-26;
/M: SY='Y';  M=-15,-24,-26,-25,-22, 20,-30,  0, 10,-16,  7,  4,-22,-23,-16,-15,-19, -8,  4,  7, 43,-22;
/M: SY='I';  M= -8,-29,-23,-34,-27,  0,-34,-27, 35,-23, 17, 15,-23,-24,-21,-19,-17, -7, 31,-23, -4,-27;
/M: SY='D';  M=  2,  9,-24, 14, 12,-24, -8,  3,-23, -5,-16,-15,  1,-11,  0,-11,  1, -8,-18,-27,-11,  5;
/M: SY='K';  M=-11, -1,-29, -2,  9,-29,-20,  2,-26, 30,-24, -7,  1,-12, 21, 25, -5, -6,-22,-21, -8, 15;
/M: SY='V';  M= -2,-20,-15,-22,-20, -3,-24,-22, 17,-20,  9,  5,-16,-24,-19,-18, -4,  4, 23,-29, -9,-20;
/M: SY='E';  M=-10,  4,-29, 11, 30,-20,-19,  5,-26,  4,-18,-15, -1, -5, 10,  1, -3,-10,-25,-24, -9, 19;
/M: SY='S';  M= -1, -9, -6,-11,-10,-18, -1,-16,-19,-10,-19,-14, -3,-13, -9, -5, 11,  8,-10,-32,-19,-11;
/M: SY='T';  M= -6,-10,-23,-11, -1,-11,-20, -9,-13, -1,-12, -7, -8,  1, -5, -1, -2,  3,-10,-24,-10, -4;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='Q';  M= -8,  3,-25,  5, 10,-24,-16, 10,-24,  6,-19,-10,  2,-13, 12,  8,  1, -4,-20,-26, -7, 10;
/M: SY='S';  M= -3, -1,-24,  0, -1,-22, -3,-11,-21, -4,-19,-12,  0,  1, -4, -2,  3, -1,-17,-28,-19, -4;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='I';  M= -4,-24,-20,-28,-23,  0,-20,-19, 19,-22, 16, 16,-21,-24,-17,-20,-14, -7, 17,-21, -2,-21;
/M: SY='R';  M=-11,-10,-27,-10, -4,-20,-10, -2,-23,  9,-20, -8, -1, -8,  2, 28, -1, -6,-17,-25,-13, -4;
/M: SY='M';  M= -3,-18,-18,-24,-17,  0,-23, -7,  9,-15,  8, 16,-16,-21,-10,-14, -9,  0, 11,-22, -2,-14;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M:         M= -7,-13,-17,-13,-11, -2,-16, -9,-13, -6,-10, -8,-10,-13,-12,  0, -8, -8, -7,-18, -2,-13;
/M: SY='S';  M= 11,-10,-13,-14, -9, -8, -9,-13, -6,-13, -6, -1, -5,-15, -7,-14, 13, 10, -2,-28,-12, -8;
/M: SY='R';  M=-14,-10,-31, -8,  3,-18,-19,  5,-22,  9,-19, -7, -6,  1,  4, 18, -9,-10,-21,-14, -5,  0;
/M: SY='I';  M= -7,-27,-23,-30,-22,  0,-33,-24, 29,-23, 16, 12,-24,-19,-20,-22,-17, -7, 25,-22, -2,-23;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='R';  M= -6, -5,-24, -9, -5,-21, -3, -7,-22,  9,-18, -6,  1,-16,  2, 19,  0, -1,-16,-23,-14, -3;
/M: SY='R';  M=-12, -7,-25, -8,  0,-21,-18,  1,-22, 18,-19, -5, -1,-17, 10, 35, -2, -5,-14,-24, -9,  2;
/M: SY='L';  M= -1,-21,-18,-25,-16,  5,-22,-17, 10,-21, 23, 11,-19,-24,-14,-17,-15, -6,  7,-20, -3,-15;
/M: SY='P';  M= -9,-14,-36, -5,  4,-28,-19,-17,-20, -6,-26,-18,-15, 66, -7,-16, -7, -8,-27,-30,-26, -5;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='L';  M= -3,-25,-18,-27,-18,  6,-24,-18, 14,-23, 31, 14,-24,-20,-17,-18,-20, -8,  8,-18, -2,-18; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='H';  M=-19, -8,-29, -8, -8, -2,-24, 66,-17,-11, -9,  1, -2,-24,  2, -5,-15,-16,-21,-11, 37, -8;
/M: SY='C';  M= 12,-11, 17,-17,-11,-20,-13,-18,-18, -6,-17,-13, -7,-19,-10, -6,  5, -2, -7,-31,-19,-11;
/M: SY='T';  M=  3, -2,-13, -7, -6,-16, -9,-17,-16,-11,-19,-15,  2, -3, -7,-11, 23, 31, -7,-33,-16, -7;
/M: SY='A';  M= 26, -9,-17,-13,-10,-23, 15,-18,-20,-12,-20,-15, -5, -4,-10,-18, 12, -2,-11,-25,-23,-10;
/M: SY='I';  M= -1,-16,-12,-22,-18, -4,-21,-15, 10,-18,  4,  7,-11,-21,-13,-18, -4,  0,  8,-23, -3,-17;
/M: SY='G';  M= -1, -9,-30, -9,-18,-31, 65,-18,-39,-18,-29,-19,  0,-19,-16,-18,  0,-19,-30,-20,-29,-17;
/M: SY='K';  M= -6, -4,-28, -5,  5,-25,-19,-10,-25, 37,-22, -8, -3,-13,  6, 27,-10, -9,-16,-20,-10,  5;
/M: SY='V';  M= 15,-17, -6,-23,-18,-11,-17,-24,  8,-17, -3, -2,-14,-19,-17,-20,  3,  4, 16,-27,-14,-18;
/M: SY='L';  M=-11,-27,-24,-30,-23, 11,-30,-19, 18,-25, 26, 11,-25,-27,-20,-20,-23, -6,  9, -3, 10,-22;
/M: SY='L';  M= -8,-27,-19,-29,-20,  6,-28,-19, 20,-26, 39, 20,-27,-28,-18,-19,-23, -7, 13,-22, -2,-19;
/M: SY='A';  M= 40, -9,-11,-17, -9,-18, -1,-16,-11,-10,-13,-11, -7,-11, -8,-18, 13,  3, -2,-21,-15, -9;
/M: SY='W';  M=-12,-23,-29,-26,-19, 19,-22, -6,-10,-17, -9, -8,-19,-19,-16,-15,-16,-11,-12, 33, 20,-16;
/M: SY='L';  M= -6,-17,-12,-20,-15, -1,-20,-15,  1,-15, 11,  8,-17,-23,-12,-12,-15, -9,  1,-21, -5,-13;
/M: SY='P';  M= -6,  2,-30, 10,  6,-29, -5, -7,-27, -7,-27,-20, -2, 25, -4,-14,  1, -5,-25,-31,-22, -1;
/M: SY='E';  M= -5,  4,-26, 10, 24,-26,-18, -7,-23,  5,-19,-16, -2,  1,  6,  3,  0, -4,-19,-29,-18, 14;
/M: SY='E';  M=  1,  8,-25, 12, 25,-29,-15, -5,-25,  9,-20,-15,  1, -6, 13, -1,  2, -4,-21,-27,-17, 19;
/M: SY='E';  M=-10,  6,-26, 12, 22,-24,-19,  3,-20,  2,-17,-12, -1,-11, 12, -1, -1, -7,-16,-27,-10, 16;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='L';  M= -8,-20,-20,-20,-11, -7,-25,-13,  6, -9, 13,  8,-18,-23, -2,  0,-14, -7,  8,-21, -6, -7; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='K';  M= -5,  0,-24, -1,  6,-22,-13, -8,-17,  8,-18, -8,  1,-12,  5,  6,  1, -1,-14,-26,-13,  5;
/M: SY='E';  M=  0,  3,-22,  4, 21,-22,-13, -4,-22,  5,-20,-15,  3, -9,  9,  2,  8,  0,-19,-26,-13, 14;
/M: SY='Y';  M=-11,-28,-28,-31,-24, 15,-29,-13, 14,-22, 16,  7,-25,-27,-18,-20,-24,-12,  3, 16, 25,-22;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-24,-33,-23, 10,-31,-23, 23,-29, 34, 16,-26,-26,-21,-23,-25,-10, 12,-10,  2,-23;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M: SY='E';  M=  0,  0,-24,  2, 20,-23, -6, -3,-23,  4,-17,-13, -2, -8,  5,  0,  1, -7,-19,-25,-16, 13; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='R';  M= -7, -6,-25, -8,  2,-22,-10, -4,-18, 11,-15, -3, -3,-13, 12, 19, -4, -6,-15,-19,-11,  6; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='V';  M=  5,-15,-15,-18,-14, -2,-18, -8,  3,-12,  5,  2,-15,-19,-12,-12, -7,  0,  7,-15,  3,-14; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='G';  M= -2,  1,-25,  5,  5,-26, 12,-11,-25, -4,-21,-16, -1, -7, -3,-10,  0, -8,-19,-24,-20,  1; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='L';  M=-10,-25,-22,-26,-18,  8,-24,-16,  9,-20, 23, 10,-23,-25,-15,-12,-21, -9,  2,  1,  5,-16; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='K';  M= -9, -6,-26, -5,  5,-23,-20, -5,-16, 14,-18, -7, -5,  1,  9,  9, -5, -4,-14,-22,-10,  6; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='P';  M=  4,-11,-25,-11, -1,-23,-13,-11,-18,  2,-19,-11, -9, 19,  3,  6, -2, -5,-17,-22,-18, -2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='F';  M= -4,-16,-22,-20,-14,  9,-14,  1,-11,-11, -1, -2,-10,-22,-13, -4,-11, -8, -8,-13,  6,-14;
/M: SY='T';  M=  0,  1,-12, -6, -9,-11,-19,-19,-10,-11, -7, -9, -1,-12,-10,-11, 14, 38, -1,-29,-10, -9;
/M: SY='P';  M=-11,  4,-31, 14,  7,-30,-15, -5,-25, -2,-26,-19, -1, 25,  0, -4, -1, -7,-24,-32,-20,  1;
/M: SY='N';  M= -9,  6,-24,  3,  0,-16,-10,  8,-22,  4,-19,-12, 11,-17,  0, 10, -1, -2,-20,-22, -2, -2;
/M: SY='T';  M= -2,  1,-13, -7, -2,-14,-20,-16,-12, -7,-12,-10,  0, -9, -3, -8, 17, 41, -5,-29,-11, -2;
/M: SY='I';  M= -9,-28,-24,-33,-25,  6,-34,-25, 31,-25, 25, 16,-23,-24,-21,-22,-21, -9, 22,-20,  0,-25;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='T';  M=  4, -7, -4,-13,-12,-11,-14,-12, -8,-12, -9, -7, -5,-15,-12,-13, 10, 22,  3,-28,-11,-12; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='D';  M=-11, 22,-23, 31, 17,-26,-10,  4,-28,  2,-22,-19, 12, -9,  4,  0,  4, -3,-22,-31,-14, 10; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='P';  M= -7,-13,-31,-10,  0,-22,-19,-14,-15,  2,-18, -9,-12, 30, -3, -1, -7, -6,-17,-26,-18, -5;
/M: SY='E';  M=-12,  2,-30, 10, 18,-25,-20, -3,-21,  0,-14,-13, -5,  8,  4, -4, -7,-10,-21,-29,-16, 10;
/M: SY='A';  M=  4, -8,-19,-11, -2,-17,-13, -9,-11, -4, -9, -6, -5,-14, -1, -3,  3,  3, -6,-25,-12, -2;
/M: SY='L';  M=-13,-29,-21,-32,-22, 27,-30,-16, 14,-27, 35, 16,-26,-30,-23,-19,-26,-10,  6, -9, 13,-22;
/M: SY='L';  M=-10,-15,-24,-16, -3, -1,-24, -6, -5, -3,  7,  5,-13,-20, -6,  2,-16,-10, -6,-18, -2, -5;
/M: SY='E';  M=  3,  2,-24,  5, 20,-26,-13,  3,-25,  7,-21,-14,  0, -5,  7,  1,  2, -6,-20,-27,-14, 12;
/M: SY='E';  M= -2,  4,-15,  7, 19,-24,-18, -9,-18, -2,-15,-14, -3,-10,  3, -6, -1, -5,-13,-30,-17, 10;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-22,-32,-22,  8,-32,-22, 26,-30, 44, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 14,-20,  0,-22;
/M: SY='A';  M= 15,  3,-21,  4, 12,-28, -9, -8,-20, -2,-18,-14, -2, -3,  8,-10,  6, -4,-16,-26,-19, 10;
/M: SY='Q';  M= -2, -2,-25, -2,  5,-25,-18, -2,-16,  9,-15, -6, -3,-13, 11,  8, -4, -8,-13,-23,-11,  7;
/M: SY='V';  M=  7,-19,-17,-27,-21, -6,-25,-26, 19,-19,  5,  5,-16,-18,-18,-21, -2,  9, 22,-25, -9,-21;
/M: SY='R';  M=-19, -9,-30, -9,  1,-21,-20,  0,-29, 30,-20, -9,  0,-19, 13, 65, -9,-10,-21,-20,-10,  2;
/M: SY='Q';  M= -1, -4,-26, -5, 12,-26,-18, -5,-20, 14,-14, -6, -4,-12, 18, 14, -4, -8,-18,-21,-12, 14;
/M: SY='R';  M=-11, -5,-26, -4, 12,-23,-19, -2,-21, 10,-14, -7, -2,-14, 18, 24, -2, -4,-19,-24,-12, 13;
/M: SY='G';  M= -2, -7,-30, -6,-17,-30, 62,-18,-40,-17,-30,-20,  1,-20,-18,-15,  0,-19,-30,-21,-29,-18;
/M: SY='Y';  M=-16,-24,-32,-25,-22, 22,-26,  5, -3,-13, -4, -4,-24,-29,-13,-13,-22,-13,-11, 50, 60,-20;
/M: SY='A';  M= 28, -9,  2,-16,-12,-21,  6,-20,-18,-14,-17,-14, -6,-15,-12,-19, 11,  1, -7,-27,-22,-12;
/M: SY='V';  M= -5,-22,-20,-24,-15,  1,-28,-16, 16,-17, 11, 10,-21,-23,-13,-16,-13, -6, 17,-18,  2,-15;
/M: SY='D';  M=-13, 32,-25, 42, 11,-32, -3, -3,-31, -4,-27,-24, 18,-13, -3,-10,  5, -6,-23,-37,-20,  4;
/M: SY='B';  M=-12,  7,-23,  6, -4,-13,-17,  6,-12, -5, -7, -5,  7,-20, -5, -4, -6, -5,-12,-27, -3, -5;
/M: SY='E';  M= -9,  6,-29, 11, 35,-28, -9,  6,-29,  5,-22,-16,  4, -7, 15,  3,  1,-10,-28,-29,-16, 24;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='E';  M=-11, 15,-30, 26, 50,-32,-14, -1,-32,  7,-22,-22,  3, -2, 15, -2,  0,-10,-30,-31,-20, 33;
/M: SY='H';  M=-13,  4,-25,  1, -1,-15,-16, 16,-17, -2,-13, -6, 10,-19,  8,  5, -3, -4,-19,-23,  1,  2;
/M: SY='E';  M= -6, -1,-26,  4, 28,-18,-19, -1,-20, -1,-14,-14, -5, -9,  7, -6, -1, -5,-19,-16, -8, 17;
/M: SY='E';  M= -5,-10,-26,-10,  4,-12,-22, -7, -5, -8, -4, -4,-11, -3,  1,-11, -9, -8,-10,-18, -2,  1;
/M: SY='G';  M= -4, -1,-29,  1, -4,-30, 44,-14,-37, -9,-29,-20,  4,-16,-10,-12,  0,-16,-29,-23,-26, -7;
/M: SY='V';  M= -2,-27,-17,-31,-25,  1,-30,-25, 27,-23, 20, 15,-25,-25,-22,-21,-15, -2, 29,-25, -6,-25;
/M: SY='R';  M= -1, -6,-20,-11, -8,-15,-15, -9,-11,  3,-13, -6,  1,-18, -3, 17,  3,  2, -4,-26,-13, -7;
/M: SY='C';  M=  6,-12, 51,-18,-16,-20,-16,-13,-24,-20,-20,-16, -8,-25,-16,-21,  6, -2,-10,-40,-22,-16;
/M: SY='I';  M= -4,-29,-22,-35,-28,  0,-34,-28, 37,-26, 20, 16,-24,-24,-22,-25,-17, -7, 31,-23, -4,-28;
/M: SY='A';  M= 35, -5,-14,-10, -8,-23,  9,-18,-17,-11,-15,-13, -5,-11,-10,-19,  9, -3, -7,-23,-21, -9;
/M: SY='A';  M= 22,-17,-11,-22,-17,-11,-13,-22,  6,-14, -3,  0,-16,-18,-16,-18,  5,  2, 18,-26,-15,-16;
/M: SY='P';  M= -1,-19,-29,-12, -3,-28,-18,-20,-19,-11,-27,-19,-19, 70,-11,-20, -7, -9,-25,-29,-29,-11;
/M: SY='I';  M= -6,-30,-21,-35,-29,  1,-35,-29, 40,-26, 18, 16,-25,-25,-24,-25,-17, -6, 37,-24, -4,-29;
/M: SY='F';  M=-18,-24,-26,-27,-20, 36,-27, -2, -4,-16,  5,  0,-18,-24,-20, -6,-20,-11, -7,  8, 29,-20;
/M: SY='D';  M=-14, 39,-26, 47, 11,-33, -1,  0,-34, -2,-30,-26, 27,-13, -2, -8,  5, -6,-29,-38,-21,  5;
/M: SY='H';  M= -3, -4,-26, -4,  6,-18,-17, 13,-16, -3,-14, -6, -4, -6,  4, -2, -4, -9,-17,-22, -2,  3;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='H';  M= -5, -3,-21, -6, -3,-11, -9,  4,-16, -5,-16, -8,  3,-16,  3, -2,  3,  0,-14,-21, -4,  0; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='G';  M= -6, -4,-28, -6,-10,-25, 30, -6,-32, -7,-27,-17,  6,-10, -9,  0, -1,-13,-26,-23,-22,-11; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-29;
/M: SY='R';  M= -5, -8,-23, -8,  3,-17,-14, -8,-13,  3,-13, -5, -7,-11,  2,  5, -1, -2, -9,-24,-10,  1;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='V';  M= -4,-23,-19,-24,-20, -6,-27,-25, 18,-18,  4,  4,-22, -2,-20,-19, -9,  0, 21,-26,-11,-22; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='I';  M=  0,-17,-19,-24,-21, -3,-25,-22, 18,-19,  5,  4,-12,-16,-19,-20, -7,  0, 17,-25, -8,-21;
/M: SY='A';  M= 23,-13,-18,-19,-15,-12,  9,-14,-13,-14, -8, -8,-11,-17,-13,-18,  0, -7, -7,-12, -5,-15;
/M: SY='A';  M= 25,-11, -6,-18,-14,-20, 11,-19,-16,-14,-14, -8, -8,-15,-12,-19,  6, -2, -7,-24,-21,-13;
/M: SY='I';  M= -7,-30,-20,-33,-26,  4,-33,-26, 31,-27, 30, 17,-27,-27,-23,-23,-21, -7, 27,-23, -3,-26;
/M: SY='S';  M=  5,  6,-14,  2, -3,-21,  6, -8,-22, -9,-29,-19, 18,-13, -3, -9, 29, 14,-15,-37,-21, -3;
/M: SY='I';  M= -6,-29,-16,-35,-27,  0,-34,-27, 33,-27, 22, 15,-24,-25,-22,-26,-19, -8, 25,-23, -4,-27;
/M: SY='S';  M=  9,-11,-10,-13,-12,-12,-11,-17, -1,-13,-12, -5, -6,-17,-11,-14, 18, 12, 11,-33,-15,-11;
/M: SY='G';  M=  2,-12,-25,-13,-16,-16, 28,-17,-24,-17,-19,-14, -6,-10,-16,-18,  1, -7,-19,-18,-15,-17;
/M: SY='P';  M= -4,-11,-27, -8, -3,-21,-17, -8,-12,-11,-15, -7,-11, 26, -4,-14, -2, -3,-14,-29,-17, -6;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='A';  M= 12, -7,-14,-11, -9,-15,-12,-17, -7, -9,-11, -9, -6, -8, -9,-11,  9, 11,  2,-27,-15,-10; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='S';  M= -3, -7,-20, -8, -3,-13, -7,-11, -6,-10,-11, -8, -2,-15, -6, -9,  6,  0, -4,-26,-10, -5; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-29;
/M: SY='R';  M=-11,-12,-27,-12, -2,-20,-20, -6,-21, 19,-18, -8, -5,-11,  6, 42, -8, -8,-13,-22,-12, -2;
/M: SY='M';  M= -9,-26,-19,-30,-24,  9,-28,-12, 21,-21, 21, 22,-24,-27,-18,-17,-19, -8, 20,-18,  5,-22;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='T';  M= -2, -1, -9, -6, -6,-16,-17,-14,-11, -6,-14,-10,  2,-14, -4, -8, 12, 20, -6,-31,-13, -5;
/M: SY='E';  M= -8,  3,-30,  9, 24,-30, -6, -6,-30,  8,-23,-17, -1,  1,  9,  5, -3,-11,-26,-26,-20, 15;
/M: SY='E';  M=  0,  8,-25, 13, 25,-28,-14, -4,-22,  1,-20,-16,  2, -3, 12, -6,  4, -6,-20,-30,-19, 18;
/M: SY='R';  M= -1, -4,-25, -4,  1,-18, -7, -6,-21,  9,-18,-11, -2,-16, -1, 12, -4, -8,-15,-18, -7, -2;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='L';  M= -5,-22,-20,-24,-15,  1,-26,-19, 10,-15, 18,  8,-20,-24,-15, -8,-16, -5, 11,-21, -4,-16;
/M: SY='E';  M= -4,  5,-22,  7, 11,-22,-17, -4,-17, -3,-17,-13,  0, -4,  0, -8,  4,  5,-12,-30,-14,  4;
/M: SY='E';  M=-10,  7,-26,  8, 15,-19,-12, -2,-25,  6,-21,-15,  6,-12,  7,  6,  2, -4,-22,-25,-10, 10;
/M: SY='L';  M=-14,-22,-19,-24,-16,  7,-28, -4,  3,-18, 14,  7,-19,-26, -9,-10,-21,-12, -3, -5, 13,-13;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='L';  M= -3,-17,-22,-17,-14,-12, -3,-18, -7,-10,  1, -2,-14,-16,-14, -8, -9, -6, -2,-23,-13,-14;
/M: SY='P';  M=  2, -7,-27, -5,  6,-24,-13,-16,-16, -5,-18,-14,-10, 20, -5,-13, -2, -3,-15,-27,-21, -1;
/M: SY='M';  M= -2,-16,-23,-20,-10,-11,-22, -8,  5,-11,  7, 11,-15,-13,  0,-11,-11, -6,  0,-22, -6, -6;
/M: SY='L';  M= -4,-29,-17,-30,-23,  5,-29,-23, 22,-26, 34, 15,-29,-29,-22,-20,-22, -7, 22,-23, -4,-23;
/M: SY='R';  M= -8,-10,-27,-12, -1,-20,-22, -4,-12, 11,-10, -2, -5,-16, 11, 20, -8, -7,-11,-21, -8,  3;
/M: SY='E';  M=  6,  8,-22,  7, 13,-26,-10, -6,-23,  6,-20,-15,  6,-10,  7,  1,  5, -3,-18,-27,-17, 10;
/M: SY='A';  M= 20,-12, 10,-20,-15,-16,-13,-22, -8,-12,-10, -9,-11,-17,-14,-18,  6,  6,  4,-29,-18,-15;
/M: SY='A';  M= 40, -9,-11,-17,-10,-20,  3,-19,-13,-11,-13,-11, -7,-11,-10,-19, 12,  4, -3,-22,-20,-10;
/M: SY='R';  M= -5, -2,-26, -3, 10,-24,-17, -4,-24, 20,-19,-10,  1,-13, 12, 27, -5, -8,-19,-22,-13, 10;
/M: SY='E';  M=  0, 10,-25, 13, 21,-29,-13, -4,-26,  8,-22,-16,  4, -8, 13,  3,  3, -6,-22,-28,-17, 16;
/M: SY='I';  M= -8,-30,-23,-35,-27,  3,-34,-26, 37,-27, 26, 20,-25,-25,-21,-24,-21, -8, 28,-22, -2,-26;
/M: SY='S';  M=  5, -1, -4, -2,  2,-20, -6,-11,-21, -8,-26,-19,  6,-12, -1, -7, 30, 17,-11,-38,-19,  0;
/M: SY='R';  M=-13,  1,-27,  1, 10,-19,-19,  4,-21, 12,-16,-10,  3,-15,  7, 20, -5, -6,-18,-24, -6,  6;
/M: SY='A';  M=  9, -5,-22, -7,  0,-23, -3,-10,-16, -2,-11, -6, -5,-14,  4, -5,  0, -7,-13,-23,-15,  1;
/M: SY='L';  M= -9,-29,-20,-30,-22,  9,-30,-19, 22,-27, 41, 19,-29,-29,-20,-20,-26, -9, 15,-19,  2,-21;
/M: SY='G';  M=  2,-11,-27,-11,-14,-20, 47,-18,-32,-18,-22,-16, -3,-19,-17,-18, -2,-16,-24,-19,-23,-15;
/M: SY='W';  M= -6,-13,-28,-13,-15, -1, -4,-10,-17,-12,-12,-11,-12,-22,-13,-11, -9, -9,-16, 16, 12,-14;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Post-processing [info]

PROMOTED_BY PS51077

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2020_02 which contains 562'253 sequence entries.


Total number of hits 34 in 34 different sequences
Number of true positive hits 34 in 34 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] PS_Langendijk_Genevaux
Taxonomic range [info] Archaea, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] IclR-ED
Version [info] 6

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
34 sequences

ALLR_ECO57  (P0ACN6    ), ALLR_ECOK1  (A1A8H2    ), ALLR_ECOL5  (Q0TKD5    ), 
ALLR_ECOL6  (P0ACN5    ), ALLR_ECOLI  (P0ACN4    ), ALLR_ECOUT  (Q1RF28    ), 
ALLR_KLEPN  (Q765S0    ), ALLR_SALCH  (Q57S48    ), ALLR_SALPA  (Q5PCF5    ), 
ALLR_SALTI  (Q8Z8R2    ), ALLR_SALTY  (Q8ZR86    ), ARCR_HALS3  (B0R9X6    ), 
BHCR_PARDP  (A1B8Z4    ), GYLR_STRCO  (P15360    ), GYLR_STRGR  (P22866    ), 
ICLR_ECOLI  (P16528    ), ICLR_SALTY  (P17430    ), KDGR_DICCH  (P37728    ), 
KDGR_ECOLI  (P76268    ), KIPR_BACSU  (P42968    ), MHPR_ECOLI  (P77569    ), 
PCAR_PSEPU  (Q52154    ), PCAU_ACIAD  (O83046    ), POBR_ACIAD  (Q43992    ), 
RHMR_ECOLI  (P77732    ), SAUR_CUPNH  (Q0K846    ), SRPS_PSEPU  (Q9R9U0    ), 
TSAQ_COMTE  (Q6XL52    ), TTGV_PSEPT  (Q93PU6    ), XACR_HALVD  (D4GP42    ), 
XYNR_ECOLI  (P77300    ), Y1032_HAEIN (P44996    ), YIAJ_ECOLI  (P37671    ), 
YJHI_ECOLI  (P39360    )
» more

PDB
[Detailed view]
10 PDB

1TD5; 1TF1; 1YSP; 1YSQ; 2O99; 2O9A; 2XRN; 2XRO; 5HPF; 5HPI

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission