PROSITE entry PS51087
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | APAG |
Accession [info] | PS51087 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-MAR-2005 CREATED;
07-APR-2021 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC51087 |
Associated ProRule [info] | PRU00412 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | ApaG domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=125; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=120; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1620402; R2=0.0129421; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=11003.5087891; R2=6.0960937; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=529; H_SCORE=14228; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=336; H_SCORE=13052; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='R'; M= -7, -6,-21,-10, -7,-15,-16, -8,-10, 4,-13, 1, -1, -8, -2, 8, 0, 3, -6,-28,-12, -6; /M: SY='A'; M= 7, -2,-17, -7, -4,-14,-16,-15, -4,-11, -4, -6, -3,-14, -9,-14, 2, 7, 0,-27,-13, -7; /M: SY='T'; M= -3, -4,-19, -7, -5,-15,-16,-15,-12, -7,-12,-10, -1, 3, -7, -9, 9, 16,-10,-31,-15, -7; /M: SY='T'; M= -2, -2,-18, -5, -6,-16,-16,-16,-10, -9,-16,-11, 0, -4, -6, -7, 15, 22, -5,-32,-14, -8; /M: SY='P'; M= -9, -3,-29, -2, 1,-17, -7, -4,-21, -4,-24,-16, 2, 14, -4, -5, -1, -7,-24,-22, -8, -4; /M: SY='D'; M=-15, 24,-26, 30, 9,-21,-13, -2,-29, 4,-24,-19, 15,-14, 2, 2, 0, -7,-24,-30,-12, 5; /M: SY='I'; M= -9,-30,-24,-37,-29, 10,-36,-28, 38,-28, 19, 16,-23,-24,-24,-26,-19, -8, 29,-18, 2,-29; /M: SY='E'; M=-10, 3,-12, 3, 15,-24,-20, -7,-24, 4,-18,-14, 0,-11, 9, 8, 3, 7,-18,-29,-15, 11; /M: SY='V'; M= -2,-30,-14,-32,-30, 0,-32,-30, 34,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 46,-28, -8,-30; /M: SY='T'; M= 7, -2,-13, -6, -1,-18,-12,-13,-13, -8,-17,-12, 0,-11, 0, -9, 21, 22, -4,-32,-15, 0; /M: SY='V'; M= 5,-28,-12,-30,-28, -2,-27,-29, 27,-20, 9, 9,-27,-27,-27,-21, -9, -1, 42,-28,-10,-28; /M: SY='Q'; M= -5, -8,-22, -9, 1,-18,-20,-11, -6, 1, -9, -3, -6,-14, 7, -2, 1, 1, -5,-26,-10, 4; /M: SY='P'; M= -2,-14,-21,-13, -9,-17,-19,-20, -7,-12,-17,-11,-12, 23,-13,-16, 6, 12, -2,-32,-19,-13; /M: SY='R'; M=-11,-16,-22,-19,-10, 4,-24, -4, -3, -7, -5, -2,-10,-21,-10, 5, -7, -6, 2,-20, 0,-12; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-28,-22,-20, 35,-29, 20, -3,-14, 0, 0,-17,-29,-14,-11,-19,-11,-10, 20, 64,-20; /M: SY='L'; M= -8,-29,-21,-33,-25, 4,-31,-22, 30,-26, 31, 22,-26,-26,-20,-21,-22, -8, 23,-22, -2,-23; /M: SY='P'; M=-10, -1,-34, 8, 20,-31, -9,-11,-28, 1,-27,-20, -6, 32, 1, -9, -5,-11,-29,-29,-24, 9; /M: SY='E'; M= 2, 0,-23, 2, 24,-24,-14, 5,-19, 0,-15, -6, -2, -8, 12, -5, 3, -6,-18,-28,-14, 17; /M: SY='Q'; M=-11, -3,-29, -2, 18,-32,-21, 5,-18, 8,-13, -1, -3,-12, 42, 12, -4,-10,-25,-21,-10, 30; /M: SY='S'; M= 8, 1,-12, 2, 7,-21, -2, -9,-21, -8,-29,-20, 9, -9, 2, -9, 36, 17,-12,-39,-20, 4; /M: SY='S'; M= -1, 10,-20, 9, -1,-21,-11, -9,-16, -4,-19,-15, 9,-13, -3, -3, 11, 5,-11,-32,-16, -3; /M: SY='P'; M=-10,-18,-35,-11, -1,-27,-21,-16,-16, -5,-24,-14,-17, 57, -3, -9, -9, -9,-21,-28,-24, -6; /M: SY='D'; M=-12, 18,-26, 20, 17,-23,-13, 14,-25, 0,-23,-16, 16,-13, 10, -3, 2, -7,-26,-27, -4, 12; /I: I=-6; MD=-29; /M: SY='E'; M= -8, 14,-24, 18, 23,-27,-11, -1,-24, 2,-23,-18, 11, 3, 10, -4, 5, -4,-25,-30,-18, 16; D=-6; /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='E'; M= -7, 5,-26, 7, 8,-26, 5, 6,-26, -5,-24,-15, 8, -2, 4, -7, 2, -9,-26,-27,-16, 5; D=-6; /I: I=-6; DM=-29; /M: SY='R'; M=-15,-12,-12,-13, -6,-14,-23, 6,-19, 9,-15, -6, -7,-23, 3, 25,-10,-10,-12,-20, 1, -5; /M: SY='Y'; M=-19,-16,-29,-17,-14, 21,-28, 25, -5, -9, -4, 0,-15,-27, -3, -8,-17,-11,-14, 17, 61,-12; /M: SY='V'; M= -5,-30,-18,-33,-27, 19,-27,-25, 14,-23, 12, 5,-27,-29,-28,-20,-17, -7, 20, 1, 4,-26; /M: SY='F'; M=-20,-33,-29,-40,-30, 60,-27,-23, -6,-27, 1, -6,-26,-30,-34,-20,-26,-16, -9, 51, 30,-27; /M: SY='A'; M= 24, -9,-15,-17,-10,-18, -1,-15,-12, -6,-11, -4, -7,-13, -7, -7, 7, 3, -4,-22,-16, -9; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='T'; M= -9, -3, -4,-11, -9, -7,-20,-13,-18, 1,-15,-11, 2,-18, -8, 6, 3, 15,-10,-26, -9, -9; /M: SY='I'; M= -7,-30,-25,-37,-30, 0,-37,-30, 45,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 35,-23, -3,-30; /M: SY='R'; M= -9, -6,-20,-10, -5,-15,-21,-12,-17, 11,-15, -9, -2,-15, -2, 24, 3, 17, -6,-25,-10, -5; /M: SY='I'; M= -9,-30,-27,-38,-29, 1,-38,-29, 45,-29, 23, 19,-22,-22,-21,-28,-20, -9, 29,-21, -1,-29; /M: SY='E'; M= -8, -2,-25, -1, 15,-18,-21, -5,-16, 6,-15,-10, -2,-10, 8, 4, 2, 4,-15,-22, -5, 10; /M: SY='N'; M=-10, 34,-20, 15, -2,-18, -2, 9,-16, -1,-25,-12, 52,-20, 0, -1, 7, -1,-26,-38,-18, -1; /M: SY='T'; M= -1, 1,-17, -7, -7,-11,-14,-11, -8, -6, -4, -6, 7,-18, -7, -7, 3, 8, -8,-29,-12, -7; /M: SY='G'; M= -1, 0,-24, 2, -8,-27, 31,-15,-32, -8,-28,-19, 4,-15,-10,-11, 8, -4,-22,-27,-23, -9; /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='S'; M= -3, 9,-22, 11, 13,-27, -3, -3,-26, 0,-26,-18, 11,-11, 9, 0, 15, 2,-22,-33,-19, 11; /M: SY='D'; M= -3, 3,-20, 5, -2,-20,-17, -3,-13, -4,-12, -8, -2,-16, -2, -7, 2, 2, -5,-30,-11, -3; /M: SY='P'; M= 10,-13,-21,-13, -7,-20,-13,-19,-11,-11,-19,-13,-11, 25,-10,-17, 7, 5, -7,-29,-22,-10; /M: SY='A'; M= 17,-21, -3,-28,-21,-10,-17,-26, 4,-18, -4, -4,-20,-21,-19,-22, -5, -5, 12, -9,-11,-20; /M: SY='Q'; M=-12, -2,-30, -2, 14,-34,-20, 4,-24, 23,-22, -4, 0,-12, 40, 25, -4,-10,-26,-20,-10, 26; /M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-30,-21, 9,-30,-21, 21,-29, 47, 19,-30,-30,-21,-20,-28, -9, 13,-21, -1,-21; /M: SY='L'; M=-11,-16,-24,-16,-11, -5,-27,-15, 11,-15, 18, 13,-17,-22,-10, -8,-18, -9, 6,-23, -5,-12; /M: SY='S'; M= 9, 2,-15, 0, 3,-21, 2,-10,-21, -8,-26,-18, 9,-10, -1,-10, 26, 12,-14,-35,-20, 1; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='H'; M=-20, -5,-30, -5, -5, -7,-23, 80,-22,-10,-15, 0, 2,-23, 5, -3,-13,-17,-25,-15, 35, -5; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='R'; M=-10,-12,-23,-16, -8,-13,-24,-10, 1, -4, 0, 3, -7,-20, 3, 6, -8, -2, -1,-24, -8, -4; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='T'; M= -3, -6,-13,-16,-14, 1,-23,-21, -2,-14, -5, -6, -4,-13,-14,-13, 11, 37, 3,-25, -5,-14; /M: SY='D'; M=-11, 37,-23, 43, 11,-31, -5, 0,-31, -2,-30,-25, 28,-13, 0, -7, 11, -1,-26,-40,-20, 5; /M: SY='G'; M= 15,-13,-21,-16,-13,-16, 16,-13,-16,-14,-10, -8, -9,-18, -9,-17, -2,-10,-12,-15,-10,-12; /M: SY='N'; M=-10, 18,-24, 16, 8,-23,-11, -2,-22, 7,-20,-15, 20,-15, 1, 1, 2, -4,-21,-33,-16, 5; /M: SY='G'; M= -1, -8,-30, -7,-13,-30, 62,-18,-39,-17,-29,-20, 0,-18,-17,-18, 0,-19,-30,-21,-29,-15; /M: SY='K'; M=-12, 4,-28, 6, 13,-29,-19, -4,-27, 25,-24,-11, 2,-11, 16, 23, -3, -3,-21,-24,-12, 14; /M: SY='V'; M= -4,-18,-17,-18,-11, -9,-26,-20, 9, -7, 3, 4,-19,-22,-10, -9, -8, -1, 20,-27,-10,-10; /M: SY='E'; M=-10, 10,-25, 12, 29,-17,-17, -2,-24, 1,-19,-16, 7, -8, 10, -3, 3, -2,-23,-28,-13, 20; /M: SY='E'; M= -9, 5,-26, 10, 38,-20,-21, -2,-23, 4,-16,-16, -2, -5, 11, -3, 2, 2,-22,-25, -9, 24; /M: SY='V'; M= -1,-30,-12,-31,-30, 0,-31,-30, 32,-21, 11, 11,-29,-29,-29,-21,-11, -1, 48,-29, -9,-30; /M: SY='R'; M= -6, -4,-25, -6, 8,-24,-18, -3,-22, 12,-17, -8, -1,-13, 18, 25, 1, 1,-18,-23,-12, 11; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='P'; M= -2,-11,-27, -7, 10,-21,-19,-13,-14, -3,-12,-11,-13, 17, -3, -5, -6, -8,-13,-27,-19, 2; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='V'; M= -2,-30,-14,-32,-30, 0,-32,-30, 34,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 46,-28, -8,-30; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='E'; M=-10, -2,-27, 4, 31,-23,-22, -3,-18, 5,-10, -9, -6,-10, 16, 5, -5, -9,-18,-26,-14, 23; /M: SY='Q'; M=-10, -2,-28, -3, 17,-25,-21, 4,-18, 5,-16, -3, -2,-11, 41, 5, -1, -6,-25,-19, -7, 30; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='V'; M= -9,-16,-21,-19,-14, -6,-25,-17, 6, -5, 8, 5,-12,-23,-12, 2,-13, -3, 9,-24, -7,-14; /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25, 5,-35,-25, 36,-30, 34, 20,-25,-25,-20,-25,-25,-10, 21,-20, 0,-25; /M: SY='S'; M= 10, -1,-20, -2, 2,-25, -8, -9,-21, 3,-23,-14, 0, -4, 6, 1, 11, 1,-14,-28,-18, 3; /M: SY='P'; M= -8,-16,-36, -8, 1,-29,-18,-18,-21, -3,-30,-19,-15, 68, -7,-13, -5, -7,-27,-30,-27, -7; /M: SY='G'; M= -2, -4,-29, -5,-10,-29, 55,-16,-38,-15,-29,-20, 4,-18,-14,-16, 1,-18,-30,-22,-28,-12; /M: SY='E'; M= -5, 5,-27, 9, 27,-30,-17, 0,-24, 8,-19,-12, 0, -7, 24, 7, 1, -5,-24,-26,-15, 25; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='T'; M= 7, -6,-15, -9, 2,-17,-17,-15, -7, -7,-10, -7, -7,-12, -1,-10, 8, 12, 2,-28,-14, 0; /M: SY='F'; M=-20,-24,-25,-29,-24, 52,-29, 6, -2,-20, 4, 0,-18,-29,-24,-14,-19,-11, -6, 16, 50,-24; /M: SY='E'; M= -9, 3,-27, 5, 27,-28,-20, -2,-24, 13,-19,-11, 0, -7, 23, 10, 1, 0,-23,-25,-14, 25; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='T'; M= -1, 10,-13, 5, -3,-17,-12,-12,-17, -8,-19,-16, 11,-11, -5, -9, 22, 31, -9,-35,-15, -4; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='G'; M= 1,-12,-12,-15,-19,-16, 32, -8,-30,-20,-22,-15, -4,-22,-19,-19, -3,-16,-22,-21,-17,-19; /M: SY='C'; M= 5,-16, 25,-23,-21,-11,-23,-26, -3,-18, -7, -7,-16,-24,-21,-20, 1, 11, 12,-34,-17,-21; /M: SY='P'; M= -5,-17,-22,-17,-13, -9,-23,-18, 1,-14,-10, -6,-15, 10,-14,-17, 0, 8, 4,-24, -6,-16; /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-33,-24, 15,-32,-23, 24,-29, 37, 17,-27,-28,-23,-22,-25, -9, 16,-18, 2,-24; /M: SY='D'; M= -7, 15,-24, 18, 9,-28, -4, -5,-26, -4,-26,-19, 11, -3, 4, -8, 9, 2,-23,-33,-20, 6; /M: SY='T'; M= 10, -5,-10,-14,-12,-11,-17,-21, -6,-11, -8, -8, -5,-12,-12,-13, 15, 34, 5,-28,-12,-12; /M: SY='P'; M= -5,-11,-27, -7, 2,-21,-17,-15,-17, -7,-18,-14, -9, 30, -5, -8, 3, 3,-18,-31,-20, -3; /M: SY='S'; M= -1,-11,-18,-13, -8, -9,-16,-15, -5,-14,-11, -7, -6, -5, -5,-13, 11, 9, -3,-29,-12, -7; /M: SY='G'; M= 4,-10,-29,-11,-19,-29, 65,-20,-38,-19,-29,-19, -1,-19,-19,-20, 1,-19,-28,-20,-29,-19; /M: SY='T'; M= -8,-10,-22,-15,-10, -9,-23, 0, -2, -8, -8, -1, -5,-17, -2, -3, 1, 7, -1,-21, 3, -8; /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20, 0,-20, 0, 20,-10, 20, 60,-20,-20, 0,-10,-20,-10, 10,-20, 0,-10; /M: SY='Q'; M=-12,-10,-29, -9, 9,-13,-23, -3,-14, 1,-13, -6,-11,-16, 17, 3, -9,-11,-16, 1, 1, 13; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='H'; M=-12, -3,-23, -6, -4,-13,-20, 29,-21, 1,-17, -6, 2,-17, 2, 7, 0, 4,-17,-22, 9, -4; /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21, 35,-30, 16, 0,-12, 1, 0,-20,-30,-13,-11,-20,-10, -9, 28, 75,-21; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='H'; M=-13, -2,-27, 1, 8,-14,-15, 13,-21, -2,-15, -8, -2,-16, 6, 3, -6,-12,-18,-23, -4, 6; /M: SY='F'; M=-14,-24, -8,-34,-25, 33,-25,-11, 7,-20, 12, 27,-20,-26,-20,-16,-19,-10, 4,-10, 10,-20; /M: SY='L'; M= -7,-20,-21,-20,-10, -1,-18,-18, 9,-17, 11, 8,-19,-22,-15,-16,-14, -8, 10,-22, -7,-12; /M: SY='B'; M= 0, 7,-23, 6, -5,-20, 5, -6,-24, -5,-21,-16, 7,-16, -6, -4, 4, -3,-18,-23,-10, -7; /M: SY='E'; M= -7, 7,-28, 15, 31,-20,-17, -6,-26, 0,-19,-19, -2, 4, 4, -8, -2, -9,-24,-27,-16, 18; /M: SY='D'; M=-10, 18,-27, 22, 14,-25,-10, -4,-28, 3,-27,-22, 13,-12, 3, -3, 4, -5,-25,-17,-14, 9; /M: SY='G'; M= -1, -3,-28, -1,-14,-30, 54,-17,-38,-17,-30,-21, 3,-18,-16,-18, 4,-15,-28,-24,-28,-15; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='E'; M= -6, -2,-24, -2, 14,-23,-20,-10,-15, 11,-17, -9, -3,-10, 9, 3, 1, 0,-11,-26,-13, 11; /M: SY='H'; M= -8,-12,-24,-11, -3,-15,-22, 4, -7,-10, -9, -5, -8, 0, -5, -7, -3, -1, -6,-29, -8, -7; /M: SY='F'; M=-13,-28,-19,-38,-28, 70,-27,-20, -1,-28, 8, -1,-19,-28,-37,-20,-17, -9, 0, 7, 25,-28; /M: SY='D'; M= -8, 21,-23, 24, 18,-28,-10, -1,-26, 0,-25,-20, 17,-10, 9, -4, 11, 3,-23,-35,-18, 13; /M: SY='V'; M= 11,-25,-12,-29,-25, -5,-24,-28, 22,-19, 6, 6,-25,-25,-25,-21, -6, -1, 37,-27,-11,-25; /M: SY='E'; M= -6, 0,-27, 3, 8,-22,-18,-10,-15, -2,-14, -7, -5, 7, 0, -4, -4, -4,-15,-28,-16, 2; /M: SY='I'; M= -9,-30,-28,-39,-30, 0,-39,-30, 48,-29, 19, 19,-21,-21,-21,-29,-19, -9, 32,-21, -1,-30; /M: SY='P'; M= 5,-16,-32,-12, -2,-28,-15,-19,-18, -6,-25,-17,-16, 59, -9,-17, -5, -8,-22,-27,-26, -9; /M: SY='P'; M= -6,-13,-32, -6, 9,-26,-19,-15,-18, -3,-22,-16,-14, 44, -4, -7, -7, -8,-20,-28,-24, -1; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='R'; M= -9,-11,-22,-11, -7,-10,-17, 5,-14, 0,-12, -6, -4,-20, -1, 15, 2, -1, -8,-22, 1, -7; /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20, 9,-29,-18, 20,-28, 47, 24,-29,-29,-18,-19,-29,-10, 10,-20, 0,-19; /M: SY='A'; M= 13, 8,-20, 9, 5,-24,-10,-12,-15, -7,-15,-14, 0,-10, -4,-15, 5, -3, -9,-29,-18, 0; /M: SY='V'; M= 6,-15, 0,-20,-17,-11,-17,-20, 3,-16, -6, 0,-11,-20,-14,-18, 7, 6, 12,-32,-14,-16; /M: SY='P'; M= -4,-12,-35, -8, -1,-28,-16,-17,-19, -9,-28,-19,-10, 68, -9,-18, -6, -8,-27,-30,-28, -9; /M: SY='R'; M= -9,-11,-26,-12, -9,-14, -3,-11,-19, -1,-12, -9, -8, -8, -8, 4, -6, -1,-15,-17, -5,-10; /M: SY='L'; M= 2,-10,-20,-14,-14, -2,-12,-19, -2,-19, 4, -2,-11,-19,-16,-18, -5, 1, -1,-21, -8,-15; /M: SY='L'; M=-11,-16,-25,-15, 1, -6,-27,-14, 2, -7, 17, 5,-17,-20, -5, -2,-19,-10, -3,-22, -6, -3; /M: SY='H'; M=-15, -5,-26, -6, -3,-18,-21, 45,-22, 2,-17, -3, 2,-19, 4, 12, -7, -8,-16,-27, 5, -3; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 190 in 190 different sequences |
Number of true positive hits | 190 in 190 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 0 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | PS_Langendijk_Genevaux |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | ApaG |
Version [info] | 7 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
190 sequences
APAG_ACIF2 (B7J8G8), APAG_ACIF5 (B5ENR7), APAG_ACISJ (A1W2Y8), APAG_AFIC5 (B6JD70), APAG_AGRFC (Q8UI68), APAG_ALLAM (B9JQX3), APAG_ANAD2 (B8JAJ1), APAG_ANADE (Q2IGT4), APAG_ANASK (B4UHA8), APAG_AROAE (Q5P714), APAG_AZOC5 (A8ILE7), APAG_AZOSB (A1K3W2), APAG_AZOVD (C1DIX0), APAG_BDEBA (Q6MK56), APAG_BEII9 (B2III9), APAG_BORBR (Q7WEL1), APAG_BORPA (Q7W393), APAG_BORPE (Q7VU61), APAG_BRADU (Q89VE6), APAG_BRASB (A5EA34), APAG_BRASO (A4Z2J6), APAG_BRUA1 (B2S946), APAG_BRUA2 (Q2YPH0), APAG_BRUA4 (A6WVX4), APAG_BRUAB (Q57F54), APAG_BRUC2 (A9M7Z1), APAG_BRUMB (C0RH21), APAG_BRUME (Q8YFA4), APAG_BRUSI (B0CJT2), APAG_BRUSU (Q8G2L5), APAG_CAUVC (Q9A655), APAG_CHRSD (Q1QZ30), APAG_CHRVO (Q7NW07), APAG_CITK8 (A8ALQ0), APAG_CROS8 (A7MIB1), APAG_DECAR (Q47AB8), APAG_DEIRA (Q9RXS8), APAG_ECO24 (A7ZHE3), APAG_ECO27 (B7UI98), APAG_ECO45 (B7MAH5), APAG_ECO55 (B7L4H3), APAG_ECO57 (P62674), APAG_ECO5E (B5YZ88), APAG_ECO7I (B7NHF6), APAG_ECO81 (B7MNQ9), APAG_ECO8A (B7M0E7), APAG_ECOBW (C4ZPX6), APAG_ECODH (B1XC51), APAG_ECOHS (A7ZW02), APAG_ECOK1 (A1A799), APAG_ECOL5 (Q0TLT7), APAG_ECOL6 (P62673), APAG_ECOLC (B1IRC6), APAG_ECOLI (P62672), APAG_ECOLU (B7N7S5), APAG_ECOSE (B6HZ31), APAG_ECOSM (B1LFY6), APAG_ECOUT (Q1RGE7), APAG_EDWI9 (C5B7P0), APAG_ENT38 (A4W6F6), APAG_ERWT9 (B2VGP5), APAG_ESCF3 (B7LVU4), APAG_KLEP3 (B5Y1Z5), APAG_MARMM (Q0ASF3), APAG_METC4 (B7L060), APAG_METCA (Q60C69), APAG_METEP (A9VZN6), APAG_METFK (Q1GXY8), APAG_METNO (B8IN72), APAG_METPB (B1ZJ42), APAG_METRJ (B1LXV0), APAG_METS4 (B0UC46), APAG_METSB (B8ELJ0), APAG_NITEC (Q0AHS7), APAG_NITEU (Q82UC1), APAG_NITMU (Q2Y6G0), APAG_PARL1 (A7HQ48), APAG_PARM1 (Q2VZE7), APAG_PECAS (Q6D0D9), APAG_PECCP (C6DEY7), APAG_PHOLL (Q7N8V8), APAG_PHOPR (Q6LV42), APAG_PROMH (B4F2I3), APAG_PSEA7 (A6UZ95), APAG_PSEA8 (B7V4H7), APAG_PSEAB (Q02TH2), APAG_PSEAE (Q9I5U6), APAG_PSEE4 (Q1IG21), APAG_PSEF5 (Q4K4X4), APAG_PSEFS (C3K328), APAG_PSEMY (A4XZJ5), APAG_PSEP1 (A5VXJ4), APAG_PSEPF (Q3K5T1), APAG_PSEPG (B0KJ92), APAG_PSEPK (Q88QT7), APAG_PSEPW (B1JE08), APAG_PSESM (Q88A47), APAG_RALN1 (Q8XVF3), APAG_RHIE6 (B3PNM4), APAG_RHIEC (Q2KCU6), APAG_RHILO (Q98BB4), APAG_RHILW (B5ZNW9), APAG_RHIME (Q92S97), APAG_RHOCS (B6IPQ9), APAG_RHOPA (Q6N0J2), APAG_RHOPT (B3QCE1), APAG_SALA4 (B5F770), APAG_SALAR (A9MQG3), APAG_SALCH (Q57TH1), APAG_SALDC (B5FI33), APAG_SALEP (B5R1S7), APAG_SALG2 (B5RGC1), APAG_SALHS (B4TJ46), APAG_SALNS (B4T6L5), APAG_SALPA (Q5PDE0), APAG_SALPB (A9MYM3), APAG_SALPK (B5BL26), APAG_SALSV (B4TWT5), APAG_SALTI (Q8Z9J8), APAG_SALTY (Q56017), APAG_SERP5 (A8G9N9), APAG_SHEB2 (B8EB36), APAG_SHEB5 (A3D187), APAG_SHEB8 (A6WK58), APAG_SHEB9 (A9L437), APAG_SHEDO (Q12K58), APAG_SHEFN (Q07YJ7), APAG_SHEHH (B0TV51), APAG_SHELP (A3QBA2), APAG_SHEON (Q8EB92), APAG_SHEPA (A8H0V1), APAG_SHEPC (A4Y434), APAG_SHEPW (B8CSX6), APAG_SHESA (A0L065), APAG_SHESH (A8FRV1), APAG_SHESM (Q0HLT3), APAG_SHESR (Q0HS05), APAG_SHESW (A1RMU9), APAG_SHEWM (B1KGH8), APAG_SHIB3 (B2U258), APAG_SHIBS (Q326I3), APAG_SHIDS (Q32K44), APAG_SHIF8 (Q0T8E5), APAG_SHIFL (P62675), APAG_SHISS (Q3Z5V9), APAG_SINFN (C3MFB9), APAG_SINMW (A6U5R0), APAG_SODGM (Q2NVX7), APAG_STRMK (B2FPG4), APAG_THIDA (Q3SGR3), APAG_VIBA3 (B7VIE1), APAG_VIBC1 (A7MWC5), APAG_VIBC3 (A5F8N1), APAG_VIBCH (Q9KUS3), APAG_VIBCM (C3LRH3), APAG_VIBPA (Q87ST7), APAG_VIBVU (Q8DED1), APAG_VIBVY (Q7MP87), APAG_WOLPM (Q73G26), APAG_WOLWR (C0R462), APAG_XANAC (Q8PP26), APAG_XANC8 (Q4UR38), APAG_XANCB (B0RUI4), APAG_XANCP (Q8PCE4), APAG_XANE5 (Q3BX83), APAG_XANOM (Q2NZI3), APAG_XANOP (B2SPT2), APAG_XANOR (Q5GWB8), APAG_XANP2 (A7ICI5), APAG_XYLF2 (B2I5R5), APAG_XYLFA (Q9PBJ5), APAG_XYLFM (B0U354), APAG_XYLFT (Q87C84), APAG_YERE8 (A1JJF3), APAG_YERP3 (A7FMC2), APAG_YERPA (Q1C0H6), APAG_YERPB (B2K486), APAG_YERPE (Q8ZIK6), APAG_YERPG (A9QZZ1), APAG_YERPN (Q1CMT3), APAG_YERPP (A4TQD9), APAG_YERPS (Q66EQ9), APAG_YERPY (B1JKY4), FBX3_BOVIN (A6H7H7), FBX3_HUMAN (Q9UK99), FBX3_MOUSE (Q9DC63), FBX3_RAT(D4ABP9), PDIP2_HUMAN (Q9Y2S7), PDIP2_MOUSE (Q91VA6), SKI16_ARATH (Q9LND7)» more
|
PDB [Detailed view] |
7 PDB
1TZA; 1XQ4; 1XVS; 2F1E; 5HDW; 6Z9C; 6ZLX |