PROSITE entry PS51089
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | HP |
| Accession [info] | PS51089 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-MAR-2005 CREATED;
07-APR-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51089 |
| Associated ProRule [info] | PRU00595 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Headpiece (HP) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=66; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=61; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8546170; R2=0.0116594; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4936.3813477; R2=2.4808125; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=699; H_SCORE=6670; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=399; H_SCORE=5926; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='E'; M= -5, -2,-22, -1, 4,-13,-17, -6,-13, -4,-10, -4, -4,-11, 0, -5, 0, -1,-10,-26, -9, 2; /M: SY='E'; M= -7, -6,-21, -5, 2,-13,-17,-10,-10, -7, -4, -5, -7, -9, -5, -8, -5, -1,-11,-23, -7, -2; /M: M= -6, -8,-16, -7, 0,-21, -5,-15,-17, -7,-17,-12, -5, -4, -7, -7, -1, -6,-14,-29,-19, -5; /M: M= -6, -4,-17, -8, -4,-14,-14, -3,-15, -4,-11, -8, 0,-12, 0, -2, -3, -2,-15,-23, -5, -3; /M: SY='K'; M= -5, -5,-26, -6, 4,-25,-14,-11,-19, 11,-19, -9, -4, -1, 7, 5, -2, 1,-16,-24,-14, 4; /M: SY='T'; M= -5,-13,-23,-19,-12, -6,-22,-17, 3,-10, -4, -1,-10,-16, -9,-10, -3, 7, 2,-16, -2,-12; /M: SY='Y'; M=-19,-23,-27,-26,-22, 40,-30, 6, 1,-17, 5, 1,-20,-27,-19,-14,-20,-10, -6, 17, 55,-22; /M: SY='P'; M= -7,-10,-31, -4, 0,-26,-17,-17,-20, -8,-27,-19,-10, 53, -7,-13, 1, 3,-23,-31,-24, -7; /M: SY='Y'; M=-12,-22,-24,-22,-17, 14,-27, 0, 4,-13, 15, 5,-21,-28,-12, -7,-19, -9, -2, 2, 34,-17; /M: SY='E'; M= -4, 11,-25, 19, 35,-28,-15, -1,-27, 2,-19,-18, 2, -5, 10, -5, 3, -5,-23,-31,-18, 22; /M: SY='R'; M=-10,-11,-23,-11, 2,-11,-23, -7, -5, 0, -3, 5,-11,-18, 5, 6, -9, -8, -3,-23, -8, 3; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 48, 20,-30,-30,-20,-20,-29,-10, 12,-20, 0,-20; /M: SY='M'; M= -8,-14,-23,-19,-11,-11,-25,-14, 4, 1, 3, 9,-11,-19, -4, 2,-13, -6, 4,-22, -6, -9; /M: SY='T'; M= 2, -2,-19, -7, -3,-18,-14, -5,-10, -3,-13, -7, 1,-15, -1, -5, 4, 6, -5,-27,-12, -2; /I: I=-4; MD=-21; /M: SY='K'; M= -8, 3,-23, 3, 4,-23,-15, -9,-22, 13,-20,-12, 1, -9, 5, 12, 2, 7,-15,-26,-12, 4; D=-4; /I: I=-4; MD=-21; /M: SY='S'; M= 5, 1,-18, -4, -3,-19, -8,-10,-14, -7,-20,-12, 6, 6, -2,-10, 12, 10,-13,-30,-18, -3; D=-4; /I: I=-4; MD=-21; /M: SY='S'; M= -1, 1,-16, 0, 1,-14,-11, -6,-11, -1,-12, -9, 2, -9, -1, 0, 4, 2, -8,-21, -9, -1; D=-4; /I: I=-4; MD=-21; /M: SY='D'; M= -7, 10,-19, 12, 11,-19, -2, -1,-18, 2,-16,-10, 9, -8, 4, 0, -1, -7,-17,-21,-13, 7; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='L'; M=-10,-26,-26,-24,-14, -3,-27,-19, 8,-20, 24, 8,-25, 0,-15,-15,-23,-10, -1,-22, -8,-16; /M: SY='P'; M= -5,-22,-32,-15, -7,-23,-21,-22, -9,-13,-19,-13,-22, 58,-14,-20,-10, -8,-12,-29,-25,-14; /M: SY='E'; M= 0, -1,-24, 0, 13,-20,-15,-10,-21, 2,-20,-15, -1, 6, 1, -3, 4, 2,-18,-27,-17, 6; /M: SY='G'; M= -7, 12,-29, 18, 0,-32, 34,-11,-38,-11,-29,-23, 9,-15, -9,-14, 2,-14,-29,-28,-25, -5; /M: SY='V'; M= -4,-30,-17,-33,-30, 0,-33,-29, 36,-23, 14, 16,-26,-26,-25,-23,-14, -4, 41,-26, -6,-29; /M: SY='D'; M=-19, 48,-29, 65, 20,-38,-10, 1,-38, 0,-30,-29, 22,-10, 0, -9, 1, -9,-30,-40,-20, 10; /M: SY='P'; M=-10,-17,-29,-15, -7,-11,-21,-11,-13, -1,-15, -7,-13, 20, -8, 2, -9, -7,-12,-23,-12,-10; /M: SY='T'; M= 3, -5,-10,-11, -7,-14,-16,-16,-12, -4,-10, -7, -3,-13, -5, -4, 11, 21, -5,-28,-12, -6; /M: SY='R'; M=-15, -4,-22, -7, 1,-23,-20, -2,-26, 27,-22, -9, 3,-18, 7, 42, -9,-10,-19,-23,-10, 1; /M: SY='R'; M=-13,-18,-25,-18, -8, -7,-25,-12, -6, 5, 12, 5,-15,-23, -5, 18,-20,-10, -5,-20, -5, -8; /M: SY='E'; M=-11, 11,-30, 21, 56,-30,-20, 5,-30, 9,-20,-19, 1, -1, 19, 0, 0,-10,-30,-30,-18, 37; /M: SY='T'; M= 0,-10,-19,-15,-10, -6,-19,-14, -3, -7, -3, -2, -6,-18, -9, -1, -2, 2, 1,-23, -9,-10; /M: SY='Y'; M=-20,-15,-30,-15,-15, 17,-27, 41, -8,-10, -5, 0,-12,-27, -5, -7,-17,-13,-15, 14, 64,-15; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='S'; M= 7, 1,-12, -2, -2,-18, -5, -8,-18, -9,-25,-17, 9, -8, -2,-10, 30, 22,-10,-37,-17, -3; /M: SY='D'; M=-10, 23,-27, 33, 16,-31,-12, 2,-30, -1,-25,-21, 9, -2, 3, -7, 3, -6,-24,-35,-17, 8; /M: SY='E'; M= -6, 9,-26, 17, 29,-26,-17, -6,-21, 1,-16,-16, 0, -8, 7, -6, 1, -7,-17,-31,-17, 18; /M: SY='D'; M=-14, 26,-29, 40, 37,-34,-16, -1,-32, 4,-23,-23, 8, -6, 10, -5, 0,-10,-27,-34,-19, 24; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-39,-30, 78,-30,-19, 0,-29, 10, 0,-20,-30,-39,-20,-20,-10, 0, 11, 32,-30; /M: SY='Q'; M= -7, -5,-25, -4, 12,-23,-20, 0,-15, 8,-13, -3, -5,-13, 16, 7, -4, -6,-13,-23, -9, 13; /M: SY='E'; M= -1, 3,-22, 5, 15,-20,-14, -5,-21, 1,-17,-14, 0,-10, 4, -2, 5, 0,-16,-28,-13, 9; /M: SY='V'; M= 2,-22,-18,-27,-21, -7,-27,-25, 19,-12, 5, 6,-19,-21,-18,-14, -9, -2, 25,-24, -9,-21; /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27, 62,-30,-20, 5,-30, 19, 6,-22,-30,-34,-20,-22,-10, 3, 2, 22,-27; /M: SY='G'; M= -2, -1,-25, -2, -8,-29, 35,-14,-34, -5,-28,-18, 5,-17, -8, -9, 1,-14,-26,-24,-24, -8; /M: SY='M'; M=-10,-21, -8,-29,-20, -4,-24, -9, 16,-11, 13, 40,-19,-22, -6,-12,-18,-10, 10,-23, -4,-14; /M: SY='T'; M= 5, 0,-14, -3, 3,-18,-12,-14,-17, -6,-20,-15, 2, -4, -2, -9, 22, 25, -9,-33,-16, 0; /M: SY='R'; M=-14,-10,-29,-11, -1,-16,-23, -8,-19, 26,-17, -6, -5,-13, 3, 34,-12,-10,-13,-18, -6, -2; /M: SY='E'; M= -2, 4,-23, 7, 21,-23,-12, -1,-21, -1,-20,-14, 2, -8, 9, -6, 9, -1,-19,-29,-13, 15; /M: SY='E'; M= 0, 5,-26, 9, 39,-27,-16, -4,-22, 4,-17,-16, -1, -4, 14, -4, 3, -7,-22,-28,-19, 26; /M: SY='F'; M=-20,-30,-22,-38,-29, 72,-30,-17, 0,-28, 10, 0,-21,-30,-36,-19,-21,-11, -1, 15, 33,-29; /M: SY='Y'; M= -9, 0,-25, 1, -2, -4,-17, 5,-13, -5,-11, -9, -3,-19, -1, -8, -5, -5,-15, -6, 22, -3; /M: SY='K'; M= 5, -1,-23, -4, 6,-26,-12, -7,-23, 19,-22,-11, 2,-11, 8, 15, 1, -5,-16,-23,-15, 7; /M: SY='L'; M=-10,-24,-21,-27,-17, 3,-27,-14, 16,-22, 35, 24,-24,-25,-10,-16,-23, -7, 7,-20, -1,-13; /M: SY='P'; M= -3,-17,-35,-10, 0,-29,-18,-19,-20, -5,-28,-18,-17, 69, -8,-16, -8, -9,-25,-28,-27, -8; /M: SY='K'; M= 0, -7,-23, -9, 0,-20,-13,-14,-16, 8,-11, -7, -6, -9, -1, 3, -3, -1,-11,-23,-13, -1; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='K'; M=-11, -2,-24, -3, 7,-28,-20, -9,-30, 44,-28,-10, -1,-13, 8, 33,-10,-10,-20,-21,-11, 7; /M: SY='Q'; M=-13, -4,-29, -4, 11,-31,-20, 4,-24, 19,-20, -5, 0,-14, 36, 31, -3, -7,-25,-20,-10, 22; /M: SY='N'; M=-10, 16,-23, 10, 2,-21,-13, -1,-13, 0,-16, -9, 19,-17, 4, -1, 0, -2,-15,-32,-14, 2; /M: SY='N'; M=-11, 13,-27, 11, 13,-26,-12, 1,-23, 11,-20, -9, 14,-13, 12, 8, -2, -8,-24,-28,-15, 13; /M: SY='L'; M= -6,-25,-21,-27,-15, 4,-27,-16, 16,-24, 33, 17,-24,-25,-13,-18,-22, -9, 8,-20, -2,-15; /M: SY='K'; M=-11, -1,-30, -1, 9,-29,-20, -9,-30, 48,-29,-10, 0,-11, 10, 34,-10,-10,-20,-20,-10, 9; /M: SY='K'; M=-10, -5,-27, -7, 2,-23,-21, -7,-19, 30,-21, -5, -3,-14, 5, 24, -8, -6,-12,-22, -8, 2; /M: SY='K'; M= -2, 3,-25, 5, 17,-29,-15, -5,-25, 18,-23,-13, 1, -9, 15, 11, 2, -5,-20,-25,-15, 15; /M: SY='L'; M= -4,-16,-20,-19,-13, -2,-23,-11, 0, -5, 5, 3,-13,-23,-12, -2,-13, -7, 5,-21, -4,-13; /M: SY='G'; M= -7, -2,-29, -2, -7,-23, 21, -6,-30, -2,-23,-14, 2,-18, -4, -5, -4,-14,-25,-20,-14, -6; /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21, 15,-30,-20, 19,-30, 47, 19,-29,-30,-21,-20,-29,-10, 9,-18, 2,-21; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-39,-30, 78,-30,-18, 0,-29, 10, 0,-20,-30,-39,-20,-20,-10, 0, 11, 32,-30; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 38 in 38 different sequences |
| Number of true positive hits | 38 in 38 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | N_Hulo |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | HP |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
38 sequences
ABLM1_HUMAN (O14639), ABLM1_MOUSE (Q8K4G5), ABLM2_HUMAN (Q6H8Q1), ABLM2_MOUSE (Q8BL65), ABLM2_RAT (Q6KC51), ABLM3_HUMAN (O94929), ABLM3_MOUSE (Q69ZX8), AVIL_HUMAN (O75366), AVIL_MOUSE (O88398), AVIL_RAT(Q9WU06), DEMA_BOVIN (Q08DM1), DEMA_HUMAN (Q08495), DEMA_MOUSE (Q9WV69), DEMA_PONAB (Q5R4B6), QUAI_DROME (Q23989), SVIL_BOVIN (O46385), SVIL_HUMAN (O95425), SVIL_MOUSE (Q8K4L3), TALB_DICDI (Q54K81), VILB_DICDI (P36418), VILD_DICDI (Q8WQ85), VILI1_ARATH (O81643), VILI2_ARATH (O81644), VILI3_ARATH (O81645), VILI4_ARATH (O65570), VILI5_ARATH (Q9LVC6), VILI_BOVIN (Q3SZP7), VILI_CHICK (P02640), VILI_HUMAN (P09327), VILI_MOUSE (Q62468), VILI_PIG(Q29261), VILL_HUMAN (O15195), VILL_MOUSE (Q91YD6), VLN2_ORYSJ (Q10L71), VLN3_ORYSJ (Q67U26), VLN4_ORYSI (B8ATT7), VLN4_ORYSJ (Q0JAD9), VLN5_ORYSJ (Q0J716)» more
|
| PDB [Detailed view] |
39 PDB
1QQV; 1QZP; 1UJS; 1UNC; 1UND; 1VII; 1WY3; 1WY4; 1YRF; 1YRI; 1YU5; 1YU7; 1YU8; 1ZV6; 2F4K; 2JM0; 2K6M; 2K6N; 2L3X; 2PPZ; 2RJV; 2RJW; 2RJX; 2RJY; 3MYA; 3MYC; 3MYE; 3NKJ; 3TJW; 3TRV; 3TRW; 3TRY; 4CZ3; 4CZ4; 5I1N; 5I1O; 5I1P; 5I1S; 5VNT » more |