PROSITE entry PS51094

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	PTS_EIIA_TYPE_2
Accession [info]	PS51094
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-APR-2005 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC00528
Associated ProRule [info]	PRU00417

Name and characterization of the entry

Description [info]

PTS_EIIA type-2 domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=142;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=137;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2586741; R2=0.0250971; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7813.5551758; R2=7.6134300; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=309; H_SCORE=10166; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=169; H_SCORE=9100; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D';  M= -9,  7,-25, 10, 10,-19,-15, -3,-20,  1,-16,-10,  2,-10,  4, -2,  0, -4,-17,-27,-11,  6;
/M: SY='L';  M= -8,-20,-22,-23,-15,  5,-26,-13, 11,-18, 16, 10,-18,-22,-12,-15,-16, -7,  5,-17,  3,-15;
/M: SY='L';  M=-10,-26,-20,-31,-23, 13,-31,-21, 21,-26, 27, 15,-23,-26,-21,-21,-22, -7, 13,-17,  3,-23;
/M: SY='S';  M= -5,  3,-21,  1,  2,-17,-14, -6,-18, -1,-18,-12,  4, -7, -1, -2,  6,  6,-14,-29,-12,  0;
/M: SY='E';  M= -5, -3,-25, -3,  5,-22,-17, -8,-17,  5,-18,-11, -2,  4,  1,  0, -2, -4,-15,-27,-15,  2;
/M: SY='E';  M= -7, 11,-25, 14, 15,-24, -7, -3,-25,  1,-21,-17,  8, -9,  4, -4,  3, -5,-22,-30,-16,  9;
/M:         M= -7, -5,-15, -9, -8, -7,-17, -5, -8,-11, -2, -3, -2,-21, -7, -7, -5, -1, -8,-24, -6, -8;
/M: SY='I';  M= -8,-25,-21,-31,-25,  3,-32,-25, 30,-23, 14, 14,-19,-23,-20,-22,-14, -5, 24,-21, -1,-25;
/M:         M= -9,-13,-21,-16, -9,  0,-22, -7, -4, -7, -2,  0, -9,-20, -6, -2, -8, -4, -3,-19, -1, -9;
/M: SY='L';  M= -8,-21,-20,-23,-16,  4,-25,-15,  8,-18, 16,  9,-18,-19,-14,-13,-15, -5,  5,-19, -2,-15;
/M: SY='N';  M= -8, 10,-22,  8,  2,-20, -7, -1,-19, -3,-17,-12, 11,-15, -1, -4, -1, -6,-18,-28,-13,  0;
/M: SY='L';  M= -4,-12,-20,-12, -6,-10,-21,-12, -1,-11,  2,  0,-12,-16, -5,-10, -7, -4,  0,-24, -8, -6;
/M: SY='E';  M= -5,  4,-23,  5,  9,-23,-14,  1,-20,  2,-19,-12,  4,-10,  7,  0,  4, -1,-17,-28,-12,  7;
/M: SY='A';  M= 11,-14,-12,-18,-12, -8,-11,-18, -6,-11, -7, -6,-12,-15,-13,-15, -3, -4,  1,-20,-11,-12;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='S';  M= -3,  2,-21,  0,  3,-20,-11, -7,-17,  0,-17,-11,  4,-10,  0, -2,  5,  4,-13,-28,-14,  1;
/M: SY='B';  M= -4, 18,-17, 17,  3,-23, -6, -4,-23, -5,-25,-19, 18,-12, -1, -7, 18, 12,-17,-37,-17,  1;
/M: SY='K';  M=-11,-12,-32,-12, -2,-16,-20,-12,-21, 19,-21, -9,-10,-14,  3, 12,-14,-12,-18, 14,  0,  1;
/M: SY='E';  M= -7,  4,-26,  7, 20,-24,-17, -2,-23, 10,-19,-12,  2, -9, 12,  6, -2, -6,-21,-25,-13, 16;
/M: SY='E';  M= -6,  9,-26, 14, 27,-29,-15, -1,-26,  7,-21,-15,  3, -7, 15,  4,  2, -6,-24,-28,-16, 21;
/M: SY='A';  M= 19,-19,-14,-25,-18, -7,-15,-22,  8,-17,  5,  2,-18,-19,-17,-20, -4, -2, 14,-20,-11,-18;
/M: SY='I';  M=-11,-28,-24,-34,-25, 13,-34,-23, 29,-27, 23, 15,-22,-25,-22,-23,-21, -9, 19,-16,  4,-25;
/M: SY='E';  M= -8,  3,-26,  6, 16,-25,-17,  0,-24, 11,-19,-12,  1,-11, 11, 11, -2, -5,-20,-25,-12, 13;
/M: SY='E';  M= -7,-10,-22,-11,  1, -7,-21, -7, -7, -5, -3, -2, -9,-17,  0, -5, -8, -6, -8,-18, -3,  0;
/M: SY='L';  M=  6,-21,-15,-27,-19, -4,-18,-20, 12,-20, 14, 12,-19,-21,-15,-20,-10, -4, 11,-22, -8,-18;
/M: SY='A';  M= 12,-13, -7,-18,-15,-15, -1,-20, -8,-15,-10, -7, -9,-18,-15,-18,  3,  0,  0,-26,-17,-15;
/M: SY='E';  M= -5,  9,-24, 11, 13,-27,-12, -2,-23,  6,-19,-13,  6,-11, 10,  2,  2, -4,-20,-28,-15, 11;
/M: SY='M';  M= -6,-13,-23,-14, -6,-13,-22,-11, -3, -5, -2,  1,-11, -5, -4, -6,-10, -7, -5,-23, -8, -7;
/M: SY='L';  M= -4,-27,-18,-29,-20,  7,-27,-20, 17,-26, 35, 17,-26,-26,-19,-20,-22, -8, 11,-20, -2,-19;
/M: SY='V';  M=  0,-11,-20,-13, -5,-10,-19,-13,  0,-11,  0, -1,-11,-17, -8,-12, -6, -4,  3,-23, -7, -7;
/M: SY='E';  M= -2,  6,-24,  8, 15,-26,-14, -4,-22,  8,-19,-13,  3,-10,  9,  2,  0, -5,-18,-27,-14, 11;
/M: SY='N';  M= -1,  2,-20, -1,  2,-21,-12, -4,-16,  1,-15, -9,  5,-15,  4, -1,  2, -2,-14,-27,-13,  3;
/M: SY='G';  M= -5, -4,-28, -4, -8,-23, 27, -6,-28,-10,-22,-14,  2,-17, -8,-10, -2,-13,-24,-22,-18, -9;
/M: SY='Y';  M= -3,-15,-19,-18,-14, -2,-17, -9, -1,-10, -2,  0,-11,-18,-11,-10, -9, -6, -1,-14,  5,-14;
/M: SY='V';  M=  0,-23,-15,-27,-22, -4,-27,-24, 22,-20, 11,  9,-21,-23,-20,-20,-10, -3, 26,-26, -8,-22;
/M: SY='E';  M= -4,  7,-22,  7,  8,-21,-14, -6,-20,  1,-18,-14,  4, -9,  0, -3,  6,  5,-15,-29,-14,  4;
/M: SY='D';  M= -6,  9,-26, 13, 11,-25,-12, -5,-24, -2,-24,-18,  5,  8,  1, -7,  3, -3,-22,-31,-18,  5;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='E';  M= -1,  8,-21, 10, 11,-26, -4, -5,-25,  0,-22,-16,  7,-11,  4, -3,  7, -1,-20,-30,-18,  8;
/M: SY='Y';  M=-15,-25,-24,-28,-23, 31,-30, -5,  9,-19, 10,  6,-22,-28,-20,-16,-20, -9,  5,  7, 38,-23;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='I';  M= -5,-19,-20,-23,-15,  3,-26,-15,  7,-13,  7,  4,-16,-19,-15,-13,-12, -4,  7,-17,  1,-16;
/M: SY='E';  M= -7, 13,-27, 18, 23,-29,-14,  0,-26,  7,-22,-16,  6, -7, 13,  1,  1, -7,-24,-29,-16, 18;
/M: SY='A';  M= 13, -2,-15, -4, -2,-22, -2,-12,-19, -5,-16,-12, -1,-13, -4, -9,  5, -3,-12,-26,-18, -4;
/M: SY='I';  M= -7,-27,-21,-33,-24,  4,-30,-20, 28,-24, 26, 24,-24,-24,-17,-21,-21, -8, 20,-19, -1,-22;
/M: SY='L';  M=-10,-23,-23,-26,-17,  5,-28,-16, 14,-17, 16, 11,-20,-23,-14,-14,-19, -9,  9,-13,  3,-16;
/M: SY='E';  M= -1,  5,-24,  6, 16,-25,-14, -2,-23,  9,-19,-12,  3,-10, 10,  3,  1, -5,-19,-26,-13, 13;
/M: SY='R';  M=-16, -7,-26, -8, -1,-20,-18, -1,-26, 22,-20,-10,  2,-19,  8, 53, -5, -7,-18,-23,-11,  0;
/M: SY='E';  M= -9,  4,-27, 11, 40,-22,-21, -2,-21,  3,-14,-15, -3, -6, 11, -3, -2, -7,-20,-28,-14, 25;
/M: SY='E';  M=  0,  1,-24,  1, 13,-25,-13, -5,-22, 13,-20,-11,  1,-10, 10,  7,  1, -5,-18,-25,-14, 11;
/M: SY='E';  M= -7, -6,-24, -6,  6,-15,-21, -8, -5, -3,  0,  2, -7,-15,  5, -5, -7, -5, -7,-25, -9,  5;
/M: SY='G';  M= -3,-11,-21,-15,-15, -3,  4,-12,-12,-16,-11, -6, -4,-19,-13,-15,  1, -4, -9,-18, -5,-14;
/M: SY='S';  M=  2, -5,-21, -5, -6,-22,  8,-13,-22,-11,-26,-17,  2,  6, -8,-14, 14,  4,-18,-31,-21, -8;
/M: SY='T';  M= -2, -8,-16,-13,-11,-11,-20,-19, -6,-12, -9, -7, -7,  2,-11,-13,  9, 29, -1,-28,-11,-12;
/M: SY='G';  M= -2,-15,-22,-17,-19, -5, 14,-10,-15,-17,-13, -9,-10,-23,-16,-17, -6,-11,-12, -6,  6,-19;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='I';  M=-10,-24,-24,-27,-19,  6,-29,-20, 20,-23, 17, 12,-20,-15,-18,-21,-18, -8, 12,-18, -1,-20; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='G';  M=  3, -7,-25, -8, -9,-24, 31,-14,-27,-13,-21,-14, -1,-12,-11,-15,  1,-12,-21,-23,-22,-10;
/M: SY='N';  M= -9,  8,-24,  6,  6,-21,-12, -1,-20, -2,-21,-14, 10,  3,  0, -6,  1, -3,-21,-30,-14,  2;
/M: SY='G';  M= -3, -5,-26, -7,-11,-21, 32, -8,-29,-12,-23,-15,  2,-18,-11,-12,  0,-12,-24,-21,-17,-12;
/M: SY='I';  M= -7,-29,-22,-35,-28,  7,-34,-26, 34,-26, 20, 17,-24,-25,-23,-24,-18, -7, 29,-19,  0,-27;
/M: SY='A';  M= 45,-11,-11,-20,-11,-18,  0,-19, -9,-11, -9, -9,-10,-11,-10,-20,  8, -1,  0,-19,-18,-11;
/M: SY='I';  M=-10,-29,-24,-36,-26,  5,-34,-24, 36,-27, 25, 23,-23,-23,-19,-24,-21, -9, 23,-19,  1,-25;
/M: SY='P';  M= -8,-20,-37,-13, -3,-23,-20,-20,-16,-11,-24,-17,-20, 74,-12,-20,-10, -9,-25,-27,-25,-11;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20, 99,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='A';  M= 18,-11, -8,-17,-14,-19,  7,-21,-16,-15,-14,-12, -8, -9,-14,-19,  6,  2, -8,-25,-21,-14;
/M: SY='R';  M=-10, -3,-26, -3,  2,-20,-18, -7,-18, 14,-16, -6, -2,-14,  4, 20, -5, -4,-13,-23,-10,  2;
/M: SY='P';  M= -3, -7,-22, -8, -6,-16,-14,-12,-10,-11,-13, -9, -5,  6, -8,-13,  3,  3, -9,-29,-15, -8;
/M: SY='E';  M= -4,  6,-25,  9, 18,-24,-13, -5,-22,  2,-20,-15,  3, -3,  6, -3,  2, -5,-20,-29,-17, 12;
/M: SY='A';  M=  1,  0,-19, -1, -1,-16, -8, -3,-17, -6,-14,-10,  0,-15, -3, -9,  1, -3,-13,-23, -8, -3;
/M: SY='V';  M= -1,-16,-16,-19,-17,-11, -8,-19,  2,-14, -3, -1,-13,-21,-16,-13, -6, -6,  8,-25,-12,-18;
/M: SY='T';  M= -3, -3,-20, -5, -4,-16,-17,-13, -7,  0, -9, -6, -3,-15, -6, -4, -2,  1, -1,-27,-12, -5;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='K';  M= -8,  1,-26,  2, 11,-25,-15,  1,-23, 14,-20,-10,  2,-12, 11, 13, -1, -5,-19,-25,-11, 10;
/M: SY='P';  M= -2, -6,-23, -7, -3,-17,-16,-13,-10,-10,-13,-10, -5, 11, -7,-13,  2,  4,-10,-29,-16, -7;
/M: SY='A';  M=  5,-13,-16,-17,-15,-10,  2,-16,-12,-12,-10, -7, -8,-19,-14,-12, -1, -4, -4,-21,-12,-14;
/M: SY='I';  M= -5,-26,-19,-32,-25,  6,-25,-23, 23,-24, 15, 15,-22,-24,-22,-22,-16, -7, 21,-19, -2,-24;
/M: SY='A';  M= 13,-13,-11,-18,-13,-11,-10,-18, -3,-13, -7, -5,-10,-17,-11,-14,  6,  3,  4,-25,-12,-12;
/M: SY='I';  M= -9,-29,-20,-34,-26, 19,-31,-23, 22,-25, 19, 13,-24,-25,-25,-21,-19, -7, 21,-14,  4,-26;
/M: SY='V';  M=  2,-20,-13,-25,-21, -2,-11,-20,  5,-20,  5,  3,-16,-23,-19,-19, -9, -4,  8,-21, -6,-21;
/M: SY='R';  M= -9, -9,-24,-12, -5,-15,-22, -7, -8,  4,-10, -2, -6,-17,  3, 10, -5,  0, -5,-22, -6, -3;
/M: SY='L';  M= -8,-20,-15,-24,-18,  8,-25,-16,  9,-22, 21,  8,-17,-24,-18,-17,-15, -5,  5,-20,  0,-18;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='E';  M= -5,  5,-26,  8, 13,-27,-14, -5,-25, 11,-24,-15,  3,  2,  7,  5,  1, -4,-21,-28,-16,  9; D=-13;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='E';  M= -5,  7,-25,  7, 17,-27,-14, -1,-24, 11,-22,-13,  6, -9, 14,  6,  2, -3,-22,-27,-14, 15;
/M: SY='P';  M= -2,-13,-32, -8, -6,-27,  9,-18,-24,-12,-26,-18, -9, 33,-11,-18, -2,-10,-24,-27,-26,-11;
/M: SY='V';  M= -5,-28,-19,-33,-27,  3,-32,-26, 32,-24, 17, 15,-25,-25,-23,-22,-15, -5, 33,-23, -3,-27;
/M: SY='D';  M= -8,  9,-25, 13, 10,-21,-16, -4,-20,  0,-17,-13,  3, -7,  1, -5,  0, -3,-17,-27,-10,  5;
/M: SY='W';  M=-17,-30,-30,-35,-27, 41,-25,-19, -4,-23,  1, -4,-25,-28,-27,-18,-24,-15, -8, 48, 29,-24;
/M: SY='D';  M= -7,  7,-26, 10,  4,-25,  7, -5,-27, -4,-22,-16,  6,-12, -2, -8,  0, -9,-23,-27,-18,  1;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='S';  M=  5,  4,-18,  4,  3,-22, -1, -3,-19, -5,-19,-13,  6,-10,  1, -8, 10,  0,-15,-27,-16,  2; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='M';  M= -6, -7,-18, -7, -2, -8,-15, -8,  0, -6,  2,  6, -8, -7, -3, -8, -8, -6, -3,-18, -7, -3; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='D';  M= -9, 17,-20, 25,  9,-22, -5, -2,-20, -1,-16,-14,  6, -7,  1, -6, -1, -7,-17,-23,-12,  5; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='G';  M= -6,  8,-23,  8,  1,-22, 11, -5,-25, -3,-22,-15, 11,-10, -3, -6,  1, -8,-22,-24,-17, -2; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='E';  M= -9,  6,-26,  8, 14,-26,-14,  0,-22,  7,-19,-11,  4,-11, 12,  4, -2, -8,-20,-26,-12, 12;
/M: SY='P';  M= -8, -6,-29, -2,  4,-23,-19,-12,-16, -3,-17,-12, -8, 22, -3, -8, -5, -5,-18,-27,-18, -2;
/M: SY='V';  M=  6,-24,-12,-28,-25, -5,-25,-27, 22,-19,  6,  7,-23,-23,-23,-21, -7,  0, 33,-27,-11,-24;
/M: SY='D';  M=-12,  9,-27, 11,  7,-23,-16,  9,-25, 10,-22,-12,  8,-14,  9, 10, -2, -6,-22,-25, -5,  7;
/M: SY='L';  M= -8,-26,-17,-29,-22,  7,-29,-20, 20,-23, 25, 15,-24,-27,-20,-18,-19, -6, 17,-20,  0,-22;
/M: SY='I';  M= -4,-27,-18,-31,-25,  8,-29,-24, 24,-23, 16, 12,-23,-25,-23,-21,-15, -5, 24,-20, -2,-24;
/M: SY='F';  M=-13,-28,-20,-36,-27, 36,-32,-23, 18,-27, 16,  9,-21,-27,-29,-21,-20, -9, 13, -8, 12,-27;
/M: SY='L';  M=  0,-21,-13,-25,-20, -1,-12,-18,  6,-20, 11, 11,-18,-22,-17,-18,-11, -5,  7,-22, -8,-19;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-23,-34,-24, 10,-32,-22, 29,-28, 32, 20,-25,-25,-20,-23,-24, -9, 17,-18,  2,-24;
/M: SY='A';  M= 23,-15,-11,-22,-15, -8, -5,-20, -5,-17,  0, -4,-13,-17,-15,-20,  0, -2,  0,-20,-13,-15;
/M: SY='A';  M= 14,-18,-16,-23,-17,-10,-12,-21,  5,-17,  1,  2,-15,-13,-15,-20, -2, -2,  9,-24,-13,-17;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='P';  M= -5,-11,-27, -9, -3,-22,-18,-16,-12, -1,-19,-11, -9, 22, -6, -6, -2, -2,-12,-28,-18, -7;
/M: SY='D';  M= -7, 18,-25, 22, 18,-28,-10, -1,-27,  3,-23,-18, 12,-10,  6, -3,  4, -5,-23,-31,-16, 12;
/M: SY='B';  M= -3, 14,-23, 13,  6,-26, -1, -4,-25,  2,-25,-18, 14,-10,  1, -3,  6, -3,-22,-31,-18,  3;
/M: SY='E';  M= -2,  7,-23,  8, 12,-25, -9, -2,-22, -1,-19,-14,  5, -8,  4, -5,  3, -4,-19,-29,-16,  7;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='S';  M=  1,  2,-14,  0,  0,-18, -5, -7,-17, -3,-18,-12,  4,-10, -1, -5,  7,  3,-13,-25,-13, -1; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='B';  M= -2,  7,-15,  7,  6,-16, -4,  2,-15,  0,-13, -9,  6, -8,  3, -2,  2, -3,-13,-18, -9,  4; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='H';  M=-15, -5,-27, -6, -1,-14,-20, 55,-19, -9,-11,  1,  1,-19,  9, -3, -9,-14,-21,-24, 12,  1;
/M: SY='L';  M= -7,-22,-21,-25,-16,  0,-26,-17, 15,-21, 25, 13,-20,-23,-13,-16,-17, -5,  8,-22, -4,-16;
/M: SY='E';  M= -7,  4,-26,  5, 13,-25,-15, -4,-22, 11,-20,-11,  2, -9,  9,  6, -1, -5,-19,-26,-13, 11;
/M: SY='I';  M=  4,-21,-18,-27,-20,  0,-22,-21, 15,-20, 14,  9,-19,-21,-17,-20,-11, -3, 14,-20, -4,-19;
/M: SY='L';  M=-10,-28,-21,-31,-22, 12,-30,-19, 21,-27, 35, 18,-26,-27,-20,-20,-25, -9, 12,-16,  5,-22;
/M: SY='S';  M=  6, -3,-19, -4,  1,-21, -6, -9,-18, -3,-19,-11,  1, -9,  5, -4, 12,  3,-13,-28,-15,  2;
/M: SY='Q';  M= -6,  1,-23,  0,  9,-21,-16, -1,-21,  7,-18, -9,  2,-13, 13,  6,  0, -4,-19,-22, -9, 11;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-22,-33,-24, 10,-33,-23, 28,-29, 34, 18,-26,-27,-21,-23,-24, -9, 18,-19,  1,-24;
/M: SY='A';  M= 15,-10,-13,-16,-11,-10,-10,-16, -4,-12, -8, -3, -6,-15, -9,-14, 11,  9,  2,-25,-12,-10;
/M: SY='R';  M= -7, -1,-24, -1,  5,-20,-14, -4,-18,  5,-16,-10,  2,-14,  5,  9,  1, -1,-15,-26,-11,  4;
/M: SY='L';  M= -4,-19,-19,-22,-15,  0,-23,-16,  7,-13, 10,  6,-15,-21,-13,-10,-12, -5,  6,-19, -3,-14;
/M: SY='L';  M= -8,-26,-17,-31,-22, 16,-28,-21, 15,-26, 27, 12,-23,-27,-22,-20,-20, -7, 10,-17,  2,-22;
/M:         M= -4, -5,-20, -6, -3,-16,-13,-10, -6, -7, -8,  0, -3,-16, -1, -7,  0, -2, -6,-27,-12, -3;
/M: SY='D';  M=-12, 23,-25, 27, 14,-28,-11,  3,-28,  4,-24,-18, 17,-12,  6,  0,  2, -5,-25,-33,-16, 10;
/M: SY='E';  M= -9,  8,-28, 14, 17,-27,-16, -5,-24,  7,-22,-16,  3,  2,  5,  1, -1, -6,-21,-30,-17, 10;
/M: SY='E';  M= -6, 13,-26, 17, 18,-28, -9, -3,-25,  2,-21,-17,  7, -8,  5, -4,  2, -5,-22,-30,-17, 11;
/M: SY='F';  M= -6,-11,-20,-16,-12,  7,-21,-11, -1,-13,  0, -1, -6,-21,-14,-10, -8, -4,  0,-18, -1,-13;
/M: SY='V';  M= -7,-17,-18,-21,-14, -5,-24,-15,  6,-10,  4,  5,-14,-22,-10, -3,-11, -5,  8,-22, -5,-14;
/M: SY='E';  M= -5,  6,-24,  6, 16,-25,-15, -3,-20,  7,-18,-11,  4,-10, 11,  3,  2, -2,-18,-28,-14, 13;
/M: SY='K';  M= -2, -1,-24, -1,  7,-24,-13, -6,-21, 12,-18, -9,  0,-13, 10, 11, -2, -6,-17,-23,-12,  7;
/M: SY='L';  M= -9,-27,-20,-30,-20,  8,-30,-21, 21,-27, 37, 17,-26,-27,-19,-20,-25, -8, 12,-20, -1,-20;
/M: SY='L';  M= -6,-13,-21,-16, -8, -6,-21,-11, -3, -5,  1,  1, -9,-19, -6,  0, -9, -5, -3,-21, -4, -8;
/M: SY='Q';  M= -1,  3,-21,  1,  5,-22,-12, -1,-18,  3,-17, -9,  5,-13,  6,  1,  3, -1,-16,-27,-12,  5;
/M: SY='A';  M= 15, -8, -7,-14, -9,-14,-12,-16, -8,-12, -8, -7, -8,-15, -9,-15,  4,  4, -2,-25,-12, -9;
/M: SY='E';  M= -4,  3,-23,  2,  6,-25, -8, -7,-23,  6,-23,-14,  5, -6,  6,  4,  4,  1,-19,-27,-16,  5;
/M: SY='B';  M= -5, 14,-18, 13,  3,-22, -8, -6,-21, -4,-23,-18, 14,-12, -2, -6, 14, 11,-16,-34,-16,  0;
/M: SY='E';  M= -2, -7,-24, -6,  2,-13,-16,-12,-13, -2,-14,-10, -7, -1, -5, -6, -3, -3,-10,-22, -9, -3;
/M: SY='E';  M= -5,  9,-25, 13, 20,-27,-15, -3,-24,  5,-20,-14,  4, -8, 12,  0,  2, -4,-21,-28,-15, 16;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='E';  M= -5,  9,-24, 14, 25,-28,-14, -4,-23,  6,-19,-15,  2, -7, 11, -1,  0, -7,-20,-27,-16, 18; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='I';  M= -6,-29,-20,-34,-26, 12,-32,-25, 28,-26, 22, 14,-24,-26,-24,-23,-18, -7, 24,-19,  0,-26;
/M: SY='Y';  M=-10,-19,-23,-22,-15,  5,-26, -6,  6,-13,  9,  7,-17,-23,-10,-11,-16, -8,  2, -9, 13,-14;
/M: SY='E';  M=  2,  5,-22,  3, 11,-25,-12, -4,-21,  4,-19,-12,  4,-11, 10,  1,  5, -1,-18,-26,-15, 10;
/M: SY='L';  M= -8,-25,-20,-29,-22,  7,-30,-18, 20,-22, 21, 13,-22,-25,-18,-18,-19, -7, 15,-16,  4,-21;
/M: SY='L';  M= -9,-29,-21,-34,-25, 15,-31,-23, 24,-28, 30, 17,-25,-26,-22,-22,-23, -9, 16,-16,  3,-24;
/M: SY='E';  M= -4,  4,-21,  3,  5,-21,-13, -6,-16,  2,-15, -9,  4,-13,  3, -2,  2,  0,-13,-28,-13,  4;
/M: SY='E';  M= -6,  5,-26,  6, 12,-25, -7, -2,-24,  7,-22,-13,  6,-11,  8,  4,  1, -6,-21,-26,-14,  9;
/M:         M= -4, -8,-23,-11, -5,-10,-16, -8, -7, -5, -9, -4, -7,-16, -5, -7, -5, -5, -6,-15, -2, -6;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_02 which contains 571'282 sequence entries.

Total number of hits	70 in 70 different sequences
Number of true positive hits	70 in 70 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	1

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	V_Lesaux
Taxonomic range [info]	Archaea, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	1
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	PTS EIIA type-2
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

70 sequences

FRVR_ECOLI  (P32152), LICR_BACSU  (P46321), MANR_BACSU  (O31644),

MNGA_ECOLI  (P54745), MTLR_BACSU  (P96574), MTLR_STRMU  (Q02425), 
PTF3A_BACSU (P71012), PTF3A_MYCGE (P47308), PTF3A_MYCPN (P75039), 
PTFAH_ECO57 (P69812), PTFAH_ECOLI (P69811), PTFAH_HAEIN (P44715), 
PTFAH_SALTI (Q8Z591), PTFAH_SALTY (P17127), PTFAH_VIBCH (Q9KM70), 
PTFAX_RHOCA (P23388), PTFAX_XANCP (P45597), PTFA_HALVD  (D4GYE4), 
PTFLA_ECOLI (P32155), PTFX1_ECOLI (P77439), PTFX2_ECOLI (P32670), 
PTFX_ECO57  (Q8XBQ8), PTFX_ECOL6  (Q8FFD8), PTFX_SHIFL  (Q83QP3), 
PTKA_ECO57  (P69814), PTKA_ECOL6  (P69813), PTKA_ECOLI  (P69828), 
PTM3C_BUCAI (P57635), PTM3C_BUCAP (Q8K911), PTM3C_BUCBP (Q89A36), 
PTM3C_ECOLI (P00550), PTM3C_KLEPN (Q9XBM7), PTM3C_PASMU (Q9CLY8), 
PTM3C_VIBCH (Q9KKQ7), PTMA_BACSU  (C0H3V2), PTMA_ECO57  (P69825), 
PTMA_ECOLI  (P69824), PTMA_ENTFA  (P27547), PTMA_GEOSE  (Q45420), 
PTMA_HALH5  (Q9K680), PTMA_MYCPN  (P75145), PTMA_STAAC  (Q5HE46), 
PTMA_STAAM  (P0A0D7), PTMA_STAAN  (P0A0D8), PTMA_STAAR  (Q6GER9), 
PTMA_STAAS  (Q6G7F4), PTMA_STAAW  (P0A0D9), PTMA_STACT  (P17876), 
PTMA_STRMU  (Q02420), PTN3B_BACSU (O31645), PTSN_BRADU  (P30335), 
PTSN_ECOLI  (P69829), PTSN_HAEIN  (P45072), PTSN_KLEOX  (P17162), 
PTSN_PSEAE  (Q9HVV4), PTSN_PSEPU  (P33670), PTSN_SHIFL  (P69815), 
SGCA_ECOLI  (P39363), ULAC_ECO57  (P69821), ULAC_ECOL6  (Q8FAJ0), 
ULAC_ECOLI  (P69820), ULAC_MYCPN  (P75292), ULAC_SALCH  (Q57GJ7), 
ULAC_SALPA  (Q5PJ64), ULAC_SALTI  (Q8Z170), ULAC_SALTY  (Q8ZK88), 
ULAC_SHIBS  (Q31TC6), ULAC_SHIDS  (Q328K2), ULAC_SHIFL  (Q83P28), 
ULAC_SHISS  (Q3YUF3)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
'Partial' sequences

1 sequence

PTMA_STAAU  (P0A0E0)

PDB
[Detailed view]

5 PDB

1A3A; 1A6J; 1J6T; 2FEW; 2OQ3