PROSITE entry PS51096
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | PTS_EIIA_TYPE_4 |
| Accession [info] | PS51096 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-APR-2005 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00528 |
| Associated ProRule [info] | PRU00419 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | PTS_EIIA type-4 domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=125; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=120; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0162551; R2=0.0188352; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6478.1601562; R2=5.5788145; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=345; H_SCORE=8403; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=239; H_SCORE=7811; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='M'; M= -7, -9,-22,-14, -8,-11,-14, -4, -2, -1, -1, 21, -7,-14, 1, -1, -8, -3, -4,-24, -7, -4; /M: SY='V'; M= -7,-21,-17,-25,-19, -5,-29,-20, 16,-13, 6, 8,-18,-19,-15,-11,-13, -5, 17,-23, -4,-19; /M: SY='G'; M= 1, -3,-26, -5, -7,-25, 26, -5,-30, -5,-25,-15, 4,-16, -7, -8, 1,-12,-24,-22,-17, -7; /M: SY='I'; M= -5,-28,-22,-35,-27, 6,-32,-26, 30,-26, 18, 13,-23,-24,-22,-24,-18, -8, 23,-15, 1,-26; /M: SY='I'; M= -7,-30,-20,-33,-27, 4,-33,-26, 33,-26, 22, 16,-26,-26,-24,-23,-18, -6, 32,-22, -2,-27; /M: SY='I'; M= -8,-30,-22,-35,-27, 6,-34,-27, 35,-28, 26, 17,-25,-26,-23,-24,-21, -8, 27,-21, -1,-27; /M: SY='V'; M= 8,-21,-11,-25,-22, -7,-18,-24, 14,-19, 4, 4,-18,-22,-20,-20, -4, 0, 21,-26,-12,-21; /M: SY='S'; M= 14, -4, -9, -9, -8,-18, 2,-15,-17,-12,-20,-14, 1,-12, -7,-14, 22, 16, -7,-31,-19, -7; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='G'; M= 3, -6,-24, -6,-13,-26, 42,-17,-31,-16,-27,-19, 2,-15,-14,-17, 9, -9,-22,-26,-26,-13; /M: SY='E'; M= -7, 3,-27, 3, 5,-21,-10, 0,-23, 5,-20,-13, 4, -8, 2, 3, -3, -7,-20,-21,-10, 2; /M: SY='F'; M= -6,-15,-21,-18,-12, 10,-19,-10, -4,-13, 3, 0,-11,-20,-13,-10, -9, -5, -4,-13, 3,-12; /M: SY='A'; M= 21,-13,-14,-20,-15,-14, -7,-21, -2,-16, -3, -5,-11,-13,-14,-19, 4, 4, 3,-23,-15,-15; /M: SY='A'; M= 15, -4,-17, -6, 4,-23, -6,-11,-17, -2,-17,-12, -3,-11, 1, -7, 8, 0,-11,-26,-17, 2; /M: SY='G'; M= 3, 0,-23, 1, 9,-27, 10,-10,-27, -4,-23,-17, 1,-10, 2, -8, 8, -3,-21,-27,-21, 5; /M: SY='L'; M= -3,-18,-21,-21,-17, -4, -4,-17, 2,-20, 6, 6,-13,-21,-15,-18, -6, -6, 1,-22, -8,-16; /M: SY='L'; M= -4,-19,-20,-23,-14, -6,-25,-14, 9,-10, 11, 11,-18,-21, -8, -8,-14, -6, 9,-21, -4,-12; /M: SY='Q'; M= 2, 1,-21, -1, 2,-22,-12, -4,-15, 2,-17, -9, 2,-14, 5, -2, 4, -2,-10,-27,-13, 3; /M: SY='S'; M= 8, 2,-13, 1, 6,-22, -7, -9,-19, -5,-20,-15, 3,-11, 1, -8, 15, 6,-12,-32,-18, 3; /M: SY='L'; M= 3,-23,-13,-27,-21, -1,-21,-22, 14,-21, 17, 10,-22,-24,-19,-20,-12, -3, 17,-23, -6,-21; /M: SY='E'; M= 6, -4,-19, -5, 8,-20,-14, -9,-11, -4,-11, -8, -5,-12, 1, -9, 1, -3, -7,-26,-14, 4; /M: SY='M'; M= -8, -6,-22,-13, -8,-11,-14, 4, -3, -4, -3, 15, 0,-19, 1, -3, -8, -7, -7,-25, -6, -5; /M: SY='I'; M= -9,-17,-26,-20, -6, -8,-28,-16, 11,-10, 5, 6,-14,-18, -1, -8,-13, -8, 5,-21, -5, -5; /M: SY='L'; M= -1,-23,-16,-28,-20, 6,-24,-15, 14,-20, 18, 17,-21,-24,-17,-18,-15, -5, 12,-18, 1,-19; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='G'; M= 3,-11,-23,-13,-17,-21, 36,-19,-25,-17,-15,-11, -5,-20,-16,-17, -3,-13,-19,-21,-22,-16; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='E'; M= -7, 4,-28, 7, 11,-28, -1, -6,-28, 6,-25,-16, 2, 0, 3, 0, -1, -9,-24,-27,-18, 7; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='Q'; M= -8, 4,-24, 5, 8,-24,-16, -4,-15, -1,-13, -7, 1,-13, 14, -2, -1, -4,-16,-26,-12, 10; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='E'; M= -2, 0,-22, 1, 9,-19,-17, -9,-13, -2,-14,-11, -3, -7, -2, -8, 1, -1, -7,-28,-13, 3; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='N'; M= -7, 6,-25, 2, 1,-21,-11, 0,-17, 0,-20,-11, 11, -5, 3, -2, 0, -5,-19,-29,-13, 1; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='V'; M= -6,-27,-14,-32,-27, 9,-30,-25, 23,-24, 16, 11,-24,-26,-25,-22,-15, -4, 25,-20, -1,-27; /M: SY='E'; M= 0, -7,-21, -9, 2,-18,-17, -5, -9, -4,-11, -6, -5,-13, 1, -4, 0, 1, -7,-24, -9, 0; /M: SY='A'; M= 14,-12,-16,-18,-13, -7,-10,-16, -5,-14, -9, -7,-10,-12,-13,-17, 3, 4, 0,-17, -7,-14; /M: SY='V'; M= 0,-26,-15,-31,-25, 4,-27,-24, 23,-23, 12, 10,-21,-24,-22,-22,-12, -5, 24,-21, -3,-25; /M: SY='D'; M= -3, 12,-17, 15, -1,-28, 10,-10,-29, -9,-26,-21, 8,-10, -8,-13, 6, -4,-22,-32,-22, -5; /M: SY='F'; M= -6,-22,-20,-28,-23, 13, -4,-18, 1,-23, 8, 10,-17,-24,-22,-19,-15,-11, 1,-14, -2,-21; /M: SY='P'; M= -8,-13,-25,-13, -8,-10,-20,-12, -5,-11, -5, -2,-12, 3, -8,-12, -7, 1, -7,-18, -5,-10; /M: SY='P'; M= -5, -7,-27, -3, 2,-19,-18,-14,-11, -8,-10, -9,-10, 13, -7,-11, -7, -7,-13,-27,-17, -4; /M: SY='D'; M= -9, 18,-26, 24, 10,-30, 7, -5,-32, -4,-26,-21, 10,-12, -2, -9, 4, -4,-25,-32,-20, 4; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='E'; M= -7, 5,-25, 8, 12,-24, -5, -5,-18, -3,-14, -6, 0,-12, 4, -7, -2, -8,-16,-28,-16, 8; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='S'; M= -3, 7,-22, 8, 2,-24, 5, -9,-26, -6,-25,-18, 9, -8, -3, -7, 11, 2,-20,-31,-20, -1; /M: SY='I'; M= -2,-19,-23,-21,-15, -7,-24,-21, 9,-18, 3, 3,-17, -1,-15,-19, -9, -2, 7,-24,-10,-17; /M: SY='D'; M= -6, 8,-27, 12, 8,-28, 9, -7,-29, -3,-23,-17, 5,-11, 0, -8, 1, -9,-24,-27,-18, 4; /I: I=-6; MD=-29; /M: SY='D'; M= -5, 8,-21, 9, 6,-22,-13, -9,-18, -3,-15,-11, 2,-10, 3, -6, 6, 9,-13,-29,-14, 4; D=-6; /I: I=-6; MD=-29; /M: SY='L'; M= -6,-14,-18,-16,-15, 3,-22,-15, 5,-17, 8, 3,-12,-21,-15,-14, -7, -2, 5,-21, -2,-15; D=-6; /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='L'; M= -4,-15,-22,-18, -8, -1,-19,-12, -1,-10, 1, 1,-11,-16, -8, -7, -7, -4, -2,-18, -1, -9; /M: SY='E'; M= -1, 4,-24, 6, 12,-25,-11, -7,-19, 0,-17,-12, 0, -7, 5, -3, 1, -3,-16,-27,-16, 8; /M: SY='K'; M= -7, -2,-25, -2, 8,-22,-18, -2,-20, 16,-17, -6, -1,-13, 10, 13, -5, -7,-17,-22, -9, 8; /M: SY='I'; M= -6,-27,-21,-33,-25, 9,-31,-21, 27,-24, 19, 16,-23,-25,-21,-22,-18, -7, 22,-16, 5,-25; /M: SY='Q'; M= -5, -3,-20, -5, 2,-18,-17, -6,-11, 2,-11, -3, -1,-15, 4, 1, -3, -4, -9,-26,-11, 2; /M: SY='E'; M= 2, 8,-22, 9, 14,-26,-12, -4,-22, 3,-19,-14, 4,-10, 8, -1, 5, -1,-18,-28,-16, 11; /M: SY='A'; M= 15,-12,-18,-17, -9,-10,-14,-14, -4, -7, -5, -4,-11,-16, -7,-10, -1, -2, 0,-17, -6, -9; /M: SY='I'; M= -5,-28,-20,-33,-26, 4,-31,-24, 30,-25, 23, 17,-24,-25,-21,-23,-18, -7, 25,-21, -2,-25; /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='E'; M= 0, 5,-17, 5, 8,-18, -8, 0,-16, 3,-13, -9, 4, -9, 3, 0, 1, -3,-13,-21,-10, 5; D=-4; /I: I=-4; DM=-23; /M: SY='E'; M= -4, 2,-21, 2, 11,-21,-11, -3,-20, 9,-17,-10, 2, -9, 8, 8, 2, -2,-16,-22,-12, 9; D=-4; /I: I=-4; DM=-23; /M: SY='V'; M= -2,-16,-15,-19,-13, -1,-21,-16, 7,-14, 7, 4,-14,-19,-13,-13, -8, -2, 9,-20, -5,-13; D=-4; /I: I=-4; DM=-23; /M: SY='D'; M= -9, 16,-27, 19, 5,-25, -8, -4,-24, -2,-23,-17, 10, -7, -1, -8, 0, -6,-22,-26,-14, 1; /M: SY='S'; M= -2, 2,-20, 1, 4,-21, -9, -8,-19, -5,-19,-13, 4, -2, 1, -8, 8, 5,-16,-30,-17, 2; /M: SY='G'; M= -3, 5,-22, 6, 4,-24, 7, -7,-26, -5,-22,-17, 5,-12, -3, -9, 2, -7,-21,-27,-18, 0; /M: SY='D'; M=-10, 19,-26, 25, 21,-30,-12, 1,-29, 8,-25,-19, 11,-10, 8, 3, 1, -8,-25,-32,-17, 14; /M: SY='G'; M= -4, -1,-29, 1, 3,-30, 29, -8,-34, -7,-26,-18, 2,-12, -3,-10, 0,-14,-28,-24,-23, 0; /M: SY='V'; M= 0,-26,-15,-29,-25, 2,-26,-26, 21,-21, 11, 7,-23,-25,-24,-20,-11, -1, 29,-21, -6,-25; /M: SY='L'; M= -5,-28,-21,-32,-23, 6,-30,-23, 26,-26, 30, 16,-25,-26,-21,-22,-21, -7, 19,-20, 0,-23; /M: SY='I'; M= -6,-28,-14,-34,-27, 11,-32,-26, 26,-26, 16, 12,-23,-26,-25,-23,-16, -5, 25,-20, 0,-27; /M: SY='L'; M=-11,-29,-20,-32,-23, 24,-29,-19, 16,-28, 35, 18,-26,-28,-23,-20,-25,-10, 9,-14, 6,-22; /M: SY='T'; M= 2,-15, -8,-21,-19, -1,-21,-20, 5,-15, -1, 0,-14,-20,-18,-16, 2, 16, 15,-24, -5,-19; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='L'; M= -9,-27,-22,-32,-22, 5,-30,-18, 26,-24, 33, 28,-24,-25,-16,-20,-23, -8, 15,-20, 0,-20; /M: SY='G'; M= -7,-20,-27,-22,-21, 2, 12,-18,-14,-20, -5, -6,-14,-22,-20,-18,-13,-15,-12, -1, -3,-20; /M: SY='G'; M= 4, -6,-19, -6,-12,-25, 37,-16,-31,-16,-29,-20, 4,-16,-12,-16, 17, -3,-21,-29,-25,-12; /M: SY='G'; M= 13,-13,-22,-16,-16,-20, 30,-20,-20,-18,-11,-10, -8,-18,-16,-20, -1,-11,-14,-21,-22,-16; /M: SY='T'; M= 2, -5,-15,-10, -6,-13,-15,-16, -9, -7,-12, -9, -2,-12, -7, -7, 14, 21, -1,-30,-13, -7; /M: SY='P'; M= -8,-18,-29,-15, -6,-17,-21,-15, -6,-12,-10, -2,-18, 36, -9,-16, -9, -5,-11,-26,-16,-10; /M: SY='F'; M= -7, -7,-10,-16,-16, 13,-17,-11, -7,-17, -7, -7, 1,-23,-17,-14, -1, 0, -7,-16, 3,-15; /M: SY='N'; M= -3, 12,-20, 1, -4,-18, -3, -2,-17, -3,-20,-13, 22,-17, -2, -1, 5, 0,-18,-29,-14, -3; /M: SY='E'; M= 0, -3,-22, -3, 7,-20,-18,-11,-10, 0,-10, -7, -5,-11, 3, -4, -1, -1, -7,-27,-13, 4; /M: SY='A'; M= 18,-14,-12,-21,-13, -9,-12,-16, -1,-13, -1, 3,-12,-16,-11,-15, 1, 1, 4,-22,-11,-12; /M: SY='A'; M= 8,-16,-15,-21,-15, -6,-17,-17, 6,-16, 4, 2,-12,-19,-13,-16, -2, -1, 8,-24, -9,-15; /M: SY='R'; M= -6, -9,-23,-11, -3,-13,-17,-11, -8, -1, -5, -2, -6,-13, -1, 3, -3, -1, -7,-25,-10, -3; /M: SY='L'; M= -6, -9,-22, -8, 1, -9,-23,-12, -3, -9, 4, -1,-12,-17, -5, -9,-11, -7, -3,-22, -6, -3; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='M'; M= 0,-16,-16,-21,-13, 0,-19,-13, 8,-15, 9, 11,-14,-18,-11,-14, -8, -4, 7,-19, -4,-12; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='M'; M= -1,-11,-16,-13, -8, -3,-11, -8, 0,-11, 3, 4, -9,-13, -7,-10, -5, -2, -1,-16, -3, -8; D=-4; /I: I=-4; DM=-22; /M: SY='E'; M= -7, 13,-23, 17, 18,-26, -6, -1,-26, 5,-22,-16, 9, -8, 7, 0, 3, -5,-22,-28,-16, 12; D=-4; /I: I=-4; DM=-22; /M: SY='R'; M= -9, -1,-26, -2, 2,-19,-13, 1,-19, 6,-17, -9, 1,-12, 2, 7, -4, -5,-16,-24, -7, 1; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='P'; M= -8, 4,-30, 11, 16,-30, -9, -9,-27, 0,-26,-20, -1, 18, 2, -7, 1, -5,-26,-31,-22, 7; /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='N'; M= -8, 9,-22, 7, 5,-22, -8, 1,-22, 10,-21,-11, 11,-11, 5, 11, 0, -5,-19,-25,-12, 4; D=-4; /I: I=-4; DM=-23; /M: SY='V'; M= -5,-26,-14,-30,-26, 3,-30,-23, 23,-21, 12, 11,-23,-26,-22,-20,-13, -2, 27,-21, -2,-25; /M: SY='E'; M= -8, -1,-26, 2, 10,-17,-18, -2,-20, 5,-15,-11, -2, -9, 3, 7, -5, -8,-17,-23, -9, 5; /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='V'; M= -5,-27,-15,-31,-26, 1,-31,-25, 27,-23, 18, 13,-24,-26,-23,-20,-15, -3, 29,-25, -5,-25; /M: SY='I'; M= -5,-28,-17,-33,-27, 2,-33,-26, 32,-25, 18, 14,-24,-25,-23,-24,-16, -6, 29,-23, -3,-27; /M: SY='S'; M= 9, 5,-16, 4, 3,-21, -7,-11,-19, -7,-20,-16, 5, -8, -3,-11, 15, 12,-12,-31,-17, 0; /M: SY='G'; M= 4, -5,-25, -9,-16,-25, 43,-15,-28,-15,-23,-13, 4,-19,-15,-16, 1,-14,-22,-23,-25,-15; /M: SY='V'; M= 1,-22,-15,-25,-19, -5,-23,-21, 12,-18, 8, 9,-21,-11,-17,-18, -9, 0, 15,-25, -9,-19; /M: SY='N'; M= -7, 14,-15, 3, -7, -9, -9, -2,-12, -8,-16,-12, 26,-20, -6, -7, 8, 6,-15,-31,-10, -7; /M: SY='L'; M= -4,-22,-17,-26,-20, 3,-27,-21, 16,-23, 25, 12,-21,-24,-19,-18,-14, 4, 15,-23, -3,-20; /M: SY='P'; M= 4,-11,-28, -8, 4,-26,-12,-15,-18, -7,-21,-15,-11, 35, -3,-14, 0, -4,-20,-28,-23, -2; /M: SY='M'; M= -2,-19,-20,-25,-18, -5,-11, -9, 9,-16, 13, 25,-16,-21, -9,-15,-12, -7, 5,-21, -5,-14; /M: SY='L'; M= 9,-23,-15,-27,-20, -2,-21,-22, 15,-21, 19, 9,-23,-23,-19,-20,-12, -3, 17,-22, -8,-20; /M: SY='L'; M= -7,-26,-21,-29,-19, 3,-29,-20, 22,-24, 28, 16,-24,-25,-17,-20,-21, -8, 15,-21, -2,-19; /M: SY='E'; M= -3, 4,-25, 7, 24,-23,-16, -5,-21, 4,-17,-14, 1, -7, 8, 0, 2, -4,-19,-28,-16, 16; /M: SY='A'; M= 18,-16,-15,-22,-14, -9,-11,-19, 1,-15, 2, 1,-14,-17,-12,-18, -1, -1, 6,-20,-11,-13; /M: SY='V'; M= 6,-19,-17,-24,-19, 0,-12,-19, 5,-19, 6, 4,-16,-21,-18,-19, -6, -3, 9,-20, -6,-19; /I: I=-3; MD=-14; /M: SY='M'; M= -5, -9,-15,-12, -9, -4,-16,-10, -3, -8, 0, 3, -7,-17, -8, -3, -5, -1, 0,-21, -6, -9; D=-3; /I: I=-3; MD=-14; /M: SY='E'; M= -1, -3,-16, -3, 4,-14,-13, -6,-11, 0, -9, -5, -3,-12, 1, -2, 0, -2, -8,-20, -8, 2; D=-3; /I: I=-3; MD=-14; /M: SY='R'; M= -1, -8,-18,-10, -2,-15,-13, -6,-12, 8,-11, -5, -3,-12, 3, 18, -3, -4, -8,-17, -9, -1; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='D'; M= -4, 0,-12, 1, 0, -9, -8, -3, -7, -5, -5, -4, -1, -9, -1, -6, -1, -2, -7,-15, -4, -1; D=-3; /I: I=-3; DM=-14; /M: SY='E'; M= -4, 2,-19, 4, 6,-16,-12, -8,-11, -4, -8, -7, -2, -5, -1, -7, -1, -3,-10,-23,-12, 2; D=-3; /I: I=-3; DM=-14; /M: SY='G'; M= 0, 3,-22, 1, -1,-22, 14, -7,-24, -7,-22,-14, 7,-14, -4, -9, 5, -5,-20,-26,-18, -3; D=-3; /I: I=-3; DM=-14; /M: SY='A'; M= 2, -9,-21,-11, -5,-14,-13,-10, -6, -8, -3, 1, -8,-12, -2, -9, -3, -3, -6,-23, -9, -4; /M: SY='S'; M= -2, 10,-20, 11, 3,-23, -4, -7,-22, -7,-24,-18, 11, -5, -2,-10, 14, 6,-17,-34,-18, 0; /M: SY='L'; M= -7,-24,-21,-27,-19, 8,-26,-19, 14,-20, 21, 11,-20,-23,-18,-16,-17, -6, 9,-19, 0,-18; /M: SY='E'; M= -4, 11,-25, 16, 19,-27,-13, -1,-25, 3,-21,-16, 4, -5, 8, -3, 3, -4,-22,-29,-15, 13; /M: SY='E'; M= 0, 7,-24, 11, 25,-28,-13, -5,-23, 3,-19,-15, 1, -7, 12, -4, 5, -2,-20,-28,-17, 18; /M: SY='I'; M= -4,-27,-19,-32,-24, 7,-30,-24, 25,-25, 22, 13,-23,-25,-21,-22,-18, -7, 20,-19, -1,-24; /M: SY='V'; M= 3,-18,-17,-21,-14, -7,-22,-16, 5,-10, 2, 2,-16,-17,-11,-11, -8, -4, 9,-20, -4,-14; /M: SY='E'; M= 3, 5,-21, 5, 12,-24,-12, -6,-20, 2,-18,-13, 2,-10, 6, -3, 4, -2,-16,-27,-16, 9; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='E'; M= -3, 2,-20, 0, 7,-20,-14, -2,-15, 1,-15, -8, 3,-13, 5, -3, 1, -1,-13,-27,-11, 5; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: SY='I'; M= 11,-21,-17,-27,-19, -6,-20,-22, 15,-19, 8, 5,-17,-19,-15,-20, -7, -3, 15,-22, -9,-18; /M: SY='L'; M= -5,-14,-21,-16, -8, -8,-22,-12, 1, -7, 2, 2,-12,-17, -6, -7, -9, -4, 1,-22, -5, -8; /M: SY='E'; M= -2, 5,-24, 8, 24,-25,-15, -5,-23, 7,-20,-15, 1, -7, 10, 0, 2, -4,-20,-26,-15, 17; /M: SY='A'; M= 7, -4,-14, -9, -3,-18, -9,-13,-12, -5,-12, -8, -3,-14, -4, -9, 3, 0, -8,-26,-14, -4; /M: SY='G'; M= 6, -7,-21,-10,-10,-21, 22,-15,-25, -9,-22,-15, -2,-14, -9,-12, 4, -7,-18,-22,-19,-10; /M: SY='R'; M= -7, -6,-25, -6, 1,-20,-17, -3,-21, 15,-19, -9, -3,-11, 4, 19, -4, -5,-15,-21, -7, 0; /M: SY='E'; M= -7, 5,-26, 8, 17,-27,-14, -5,-24, 9,-22,-14, 3, -5, 11, 4, 3, -2,-21,-28,-15, 14; /M: SY='G'; M= 2, -7,-21, -9,-10,-16, 13,-11,-20,-11,-16,-11, -3,-16, -8,-11, 2, -5,-15,-21,-12,-10; /M: SY='I'; M= -6,-27,-17,-32,-25, 1,-32,-25, 29,-25, 18, 13,-23,-25,-22,-23,-17, -7, 26,-21, -3,-25; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 18 in 18 different sequences |
| Number of true positive hits | 18 in 18 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | V_Lesaux |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | PTS EIIA type-4 |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
18 sequences
DGAR_SALT1 (D0ZLR9), DHAM1_LISIN (Q927E4), DHAM2_LISIN (Q92ET9), DHAM_ECOLI (P37349), DHAM_KLEM8 (A0A0H3H456), DHAM_LACLA (Q9CIV6), DHAM_PANAM (D4GL26), DHAM_PROSM (P0DN88), LEVR_BACSU (P23914), PTFA_BACSU (P26379), PTNAB_ECO57 (P69799), PTNAB_ECOL6 (P69798), PTNAB_ECOLI (P69797), PTNAB_SHIFL (P69800), PTNAB_STRP6 (Q5XAF5), PTRA_KLEPN (P37080), PTRA_LACCA (Q9RGG5), YADI_ECOLI (P36881)» more
|
| PDB [Detailed view] |
7 PDB
1PDO; 1VRC; 1VSQ; 2JZN; 2JZO; 3CR3; 3CT6 |