PROSITE entry PS51113
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | ZF_BTK |
| Accession [info] | PS51113 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-APR-2005 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51113 |
| Associated ProRule [info] | PRU00432 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Zinc finger Btk-type profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=37; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=34; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4293971; R2=0.0121034; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2214.9492188; R2=2.0891609; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=543; H_SCORE=3349; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=337; H_SCORE=2919; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='T'; M= -2, 0,-21, -3, 0,-22,-13,-10,-17, -6,-23,-15, 4, 12, 3, -9, 14, 15,-17,-32,-18, 0; /M: SY='N'; M=-11, 13,-28, 9, -4,-23, -1, 7,-18, -9,-23,-14, 20, -4, -5,-10, -1, -9,-23,-32,-15, -6; /M: SY='R'; M=-12,-18,-26,-19, -9, -8,-26,-14, -1, 4, 10, 5,-14,-22, -5, 13,-19,-10, -2,-20, -5, -9; /M: SY='L'; M= -6,-24,-17,-26,-19, 2,-24,-15, 16,-21, 27, 23,-23,-25,-14,-16,-16, -5, 13,-24, -4,-16; /M: SY='Q'; M= 1,-12,-23,-14, -9,-15, -7, -8, -5,-10,-11, -3, -8,-18, 4,-11, 0, -5, -5,-17, -3, -3; /M: SY='K'; M= -4, -9,-24,-11, -4, -5,-17, -8,-19, 14,-18, -9, -5,-16, -2, 13, -3, -4,-13,-13, 3, -4; /M: SY='Y'; M=-19,-21,-12,-24,-22, 30,-30, 10, -3,-15, -1, -2,-20,-31,-16,-13,-19,-10, -9, 19, 62,-22; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='P'; M= -8,-18,-36, -9, 0,-29,-18,-19,-20,-10,-30,-20,-16, 78, -9,-19, -4, -6,-28,-31,-29, -9; /M: SY='G'; M= 0, -8, -5, -9,-13,-26, 30,-18,-33,-11,-29,-19, 0,-19,-13,-13, 7, -8,-21,-29,-25,-13; /M: SY='F'; M= 3,-25,-15,-31,-24, 26,-23,-23, 8,-23, 11, 3,-22,-25,-28,-20,-12, -5, 15,-12, 4,-24; /M: SY='W'; M=-20,-32,-32,-37,-29, 48,-26,-19, -7,-24, -2, -7,-27,-30,-29,-19,-27,-17,-12, 65, 36,-25; /M: SY='V'; M= -6,-18,-19,-20,-15, -8,-24,-17, 5, -7, 1, 1,-12,-21,-11, 4, -4, 3, 11,-26, -9,-15; /M: SY='D'; M= -6, 21,-24, 25, 2,-30, 16, -7,-33, -8,-30,-24, 17,-14, -6,-11, 11, -5,-25,-34,-23, -2; /M: SY='G'; M= 1, 0,-28, 2, -9,-30, 39,-16,-35, -7,-28,-19, 2,-16,-12,-12, 0,-15,-25,-23,-25,-11; /M: SY='K'; M=-10, 0,-25, -3, 3,-15,-16, -5,-23, 20,-23,-10, 6,-15, 8, 18, -2, -5,-19,-21, -8, 6; /M: SY='W'; M=-20,-32,-39,-33,-26, 26,-25,-11,-10,-18, -9,-10,-30,-30,-19,-16,-30,-20,-19, 89, 48,-21; /M: SY='T'; M= -1,-11,-16,-13, -7,-10,-16,-13, -4,-15, 4, -1, -7,-18, -2,-12, 7, 9, -3,-29,-10, -4; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='Q'; M= -9, -6,-26, -6, 2,-24, -8, 10,-22, 4,-16, -5, -1,-16, 14, 8, -2, -9,-20,-24, -8, 7; /M: SY='Q'; M=-10, -1,-30, 0, 18,-35, -8, 4,-25, 9,-21, -6, 0,-11, 39, 12, -1,-11,-29,-21,-14, 27; /M: SY='T'; M= 5, -5,-14,-10, -6,-14,-14,-16,-11, -4,-10, -9, -3,-13, -6, -7, 13, 21, -4,-29,-12, -6; /M: SY='E'; M= 1, 5, -7, 8, 17,-27, -3,-10,-29, -5,-22,-20, 0,-11, 0,-11, 5, -6,-21,-32,-22, 8; /M: SY='K'; M=-12, 0,-30, 3, 20,-28,-20, -5,-30, 35,-25,-12, 0,-10, 12, 32, -8,-10,-22,-22,-12, 15; /M: SY='N'; M= 2, 11,-15, -1, -6,-14, -9, -7,-12, -8,-13,-12, 19,-16, -6, -9, 12, 15,-11,-33,-15, -6; /M: SY='A'; M= 25, -6,-13,-14,-10,-19, 5,-19,-16,-11,-15,-13, -4,-11,-10,-16, 15, 12, -6,-25,-19,-10; /M: SY='P'; M= -5,-19,-27,-19, -7, -7,-20,-13, -6,-12, -4, 2,-17, 19, -4,-14,-11, -9,-12,-20,-10, -7; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='K'; M= -9, 7,-25, 10, 13,-28,-16, -5,-27, 16,-24,-14, 4,-10, 13, 14, 3, 1,-20,-27,-14, 12; /M: SY='K'; M= -3,-13,-27,-14, -4,-19,-21,-15, -9, 12,-10, -4,-10, -2, -3, 8,-11, -9, -8,-21,-11, -5; /M: SY='T'; M= -1,-18, -2,-24,-20, -2,-22,-19, -4,-18, -1, -5,-18,-24,-17,-18, -7, 6, 1, -1, 2,-19; /M: SY='E'; M= -4, 1,-23, -2, 10,-18,-16, 5,-18, 0,-10, -9, 3,-14, 3, 4, -1, -1,-16,-27,-10, 5; /M: SY='S'; M= 8, 6,-17, 3, -2,-19, -7, 4,-17,-10,-15,-12, 8,-15, -3,-11, 10, 0,-13,-32,-13, -3; /M: SY='R'; M= -8,-16,-29,-18,-12, -2, -9,-10,-21, 4,-16,-10,-11,-21, -8, 12,-13,-13,-17, 11, 7,-11; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 23 in 23 different sequences |
| Number of true positive hits | 23 in 23 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | PS_Langendijk_Genevaux |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | ZN_FING |
| Feature description [info] | Btk-type |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
23 sequences
BMX_HUMAN (P51813), BMX_MOUSE (P97504), BTKL_DROME (P08630), BTK_CHICK (Q8JH64), BTK_HUMAN (Q06187), BTK_MOUSE (P35991), GAP1_DROME (P48423), ITK_HUMAN (Q08881), ITK_MOUSE (Q03526), RAS4B_HUMAN (C9J798), RASA2_HUMAN (Q15283), RASA2_MOUSE (P58069), RASA2_RAT (Q63713), RASA3_BOVIN (Q28013), RASA3_HUMAN (Q14644), RASA3_MOUSE (Q60790), RASA3_RAT (Q9QYJ2), RASL1_HUMAN (O95294), RASL1_MOUSE (Q9Z268), RASL2_HUMAN (O43374), RASL2_MOUSE (Q6PFQ7), TEC_HUMAN (P42680), TEC_MOUSE (P24604)» more
|
| PDB [Detailed view] |
16 PDB
1B55; 1BTK; 1BWN; 2E6I; 2LUL; 2YS2; 2Z0P; 6TSE; 6TT2; 6TUH; 6TVN; 6YYF; 6YYG; 6YYK; 8GMB; 8S93 » more |