PROSITE entry PS51114
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | FBA |
| Accession [info] | PS51114 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JUL-2005 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 08-NOV-2023 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51114 |
| Associated ProRule [info] | PRU00482 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | F-box-associated (FBA) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=179; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=174; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2322681; R2=0.0128714; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=11586.2822266; R2=13.3160849; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=487; H_SCORE=18071; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=332; H_SCORE=16007; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-34,-27, 65,-30, -8, 0,-24, 7, 0,-20,-30,-31,-17,-20,-10, -3, 16, 45,-27; /M: SY='Y'; M= -9,-14, 15,-17,-17, 2,-21, -2,-14,-15,-14,-11,-11,-27,-12,-15, 0, -1,-10,-11, 22,-17; /M: SY='F'; M=-12,-27,-28,-29,-19, 12,-29,-22, 10,-24, 11, 4,-23, 7,-22,-22,-20,-10, 0,-16, -2,-22; /M: SY='L'; M=-13,-25,-26,-28,-18, -1,-30,-18, 16,-14, 23, 12,-19,-24,-12, 1,-22,-10, 8,-20, -3,-18; /M: SY='C'; M= 13, -7, 18,-15,-12,-17,-12,-20,-17,-14,-17,-14, -5,-17,-12,-17, 16, 17, -4,-34,-19,-12; /M: SY='P'; M= -6,-11,-31, -6, 2,-28,-16,-16,-22, 4,-30,-18, -9, 45, -3, -6, 1, -3,-23,-30,-23, -3; /M: SY='L'; M=-15,-25,-22,-28,-18, 21,-28,-15, 3,-16, 23, 8,-20,-28,-18, 1,-23,-10, 0,-12, 6,-18; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='R'; M=-13, -8,-30, -8, -1,-27, 3, -3,-30, 13,-23,-10, 0,-18, 13, 33, -5,-13,-25,-20,-15, 3; /M: SY='R'; M=-20, 7,-30, 13, 6,-26,-17, 0,-33, 21,-23,-16, 6,-17, 7, 47, -7,-10,-23,-26,-13, 3; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='L'; M= -7,-21,-17,-24,-17, 4,-27,-20, 11,-24, 33, 11,-21,-24,-17,-17,-15, 7, 7,-23, -3,-17; /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-36,-26, 4,-36,-26, 37,-30, 33, 20,-24,-24,-20,-26,-24,-10, 21,-20, 0,-26; /M: SY='R'; M=-11, -4,-24, -4, 0,-20,-14, 23,-27, 8,-23,-10, 6,-17, 7, 29, 5, -4,-20,-28, -5, 0; /M: SY='N'; M= -7, 25,-23, 11, -6,-23, 20, 1,-26, -6,-30,-20, 43,-20, -6, -6, 7, -6,-30,-34,-23, -6; /M: SY='P'; M= -2, -9,-23, -7, -3,-22,-15,-17,-17,-10,-24,-17, -6, 35, -7,-14, 12, 15,-16,-33,-22, -7; /M: SY='C'; M=-10,-23, 79,-30,-27,-11,-30,-27,-15,-30, 0, -8,-23,-37,-27,-27,-16,-10, -4,-41,-21,-27; /M: SY='G'; M= 5,-10,-26,-12,-12,-25, 29,-14,-31, -3,-23,-15, -2,-18, -9, 6, -1,-13,-21,-20,-22,-12; /M: SY='E'; M= -4, 7,-24, 14, 43,-27,-14, -3,-27, 4,-23,-20, 3, -3, 14, -3, 12, -1,-24,-33,-20, 28; /M: SY='E'; M=-13, 19,-30, 29, 38,-36,-17, 3,-30, 7,-23,-18, 6, -6, 25, 0, 0,-10,-30,-30,-17, 31; /M: SY='D'; M=-13, 32,-28, 38, 5,-33, 13, -3,-36, -5,-30,-25, 23,-15, -5,-10, 2,-10,-30,-35,-23, 0; /M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26, 49,-30,-20, 9,-30, 28, 9,-24,-30,-31,-20,-24,-10, 4, -3, 17,-26; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='R'; M= -5, 0,-17, 2, 14,-17,-10, -2,-19, 8,-16,-12, 2, -7, 7, 16, 6, -1,-14,-21,-12, 9; D=-12; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='G'; M= 2, -5,-17, -5,-10,-19, 34,-12,-24,-12,-21,-14, 2,-12,-10,-12, 9, -5,-17,-19,-19,-10; D=-12; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='W'; M=-14,-28,-35,-28,-21, 7,-14,-21,-14,-14,-14,-14,-28,-21,-14,-14,-28,-21,-21,106, 21,-14; D=-12; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='E'; M= -7, 8,-24, 13, 14,-23,-16, -9,-12, -7,-17,-14, 3,-10, 1,-12, 7, -1,-11,-33,-16, 6; /M: SY='V'; M= -7,-13,-20,-11,-19, -9,-29,-23, 21,-19, 4, 4,-16,-23,-21,-21,-11, -5, 27,-29, -9,-21; /M: SY='E'; M= -9, 2,-26, 7, 30,-25,-16, -2,-28, 11,-22,-17, 2, -8, 13, 18, 6, -3,-23,-29,-17, 20; /M: SY='H'; M= 3, 6,-22, -1, -3,-20,-10, 46,-22, -8,-19, -7, 15,-17, 2, -6, 0,-10,-21,-29, 0, -3; /M: SY='G'; M= -3, 5,-27, -1,-14,-27, 50,-11,-34,-14,-30,-20, 17,-20,-14,-14, 3,-14,-30,-26,-27,-14; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='D'; M= -9, 33,-22, 37, 9,-29, -4, 0,-29, -3,-30,-24, 28,-13, 0, -7, 14, 1,-24,-40,-20, 4; /M: SY='G'; M= -4,-10,-30,-10,-16,-28, 50,-16,-38, -9,-28,-18, 0,-20,-13, 0, -2,-18,-28,-20,-26,-16; /M: SY='W'; M=-17,-37,-44,-40,-30, 7,-26,-30, 0,-23, -8, -8,-34,-27,-20,-23,-34,-24,-13,101, 21,-23; /M: SY='H'; M= 0, -5,-25, -8, 0,-22,-15, 22,-25, 12,-20, -7, 0,-15, 5, 18, -5,-10,-18,-23, -4, 0; /M: SY='V'; M= -3,-27,-13,-30,-27, 0,-27,-21, 27,-17, 13, 25,-27,-27,-21,-17,-13, -3, 38,-27, -7,-24; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='R'; M=-11, -1,-26, 0, 14,-23,-20, -7,-26, 22,-20,-12, 0,-11, 8, 26, -1, 3,-18,-24,-12, 10; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='D'; M= -8, 26,-18, 37, 10,-25, -5, -2,-25, -2,-22,-20, 13, -7, 0, -7, 9, -1,-18,-30,-15, 5; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='C'; M= 0, -7, 15, -9,-12,-18, 14,-15,-23,-15,-20,-15, -2,-17,-12,-15, 7, -3,-13,-26,-20,-12; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='G'; M= -3, 3,-27, -2,-15,-27, 52,-12,-35,-15,-30,-20, 16,-20,-15,-15, 3,-15,-30,-25,-27,-15; /M: SY='T'; M= -6, -3,-16,-11,-14, -5,-19,-14, 4,-15, 4, 0, 3,-23,-14,-12, -3, 8, 5,-30,-10,-14; /M: SY='S'; M= 0, -1,-20, -1, 5,-23, 10,-13,-26, -8,-22,-17, 2,-11, -4,-11, 14, 9,-18,-29,-20, 1; /M: SY='F'; M=-14,-27, 21,-34,-27, 33,-30,-23, -3,-30, 12, -1,-23,-33,-32,-23,-20,-10, 0,-15, 5,-27; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='T'; M= -3, -5,-14, -4, 7,-11,-18,-12, -3, -5, -6, -6, -8,-10, -4, -8, 2, 9, 4,-23,-11, 1; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='P'; M=-12,-15,-38, -8, 0,-28,-20, 8,-22,-10,-28,-15,-13, 65, -5,-15,-10,-12,-30,-30,-18, -8; /M: SY='D'; M=-15, 20,-30, 29, 4,-32, 8, 24,-37, -8,-27,-19, 12,-16, -2,-10, -3,-16,-30,-32,-11, -1; /M: SY='P'; M= 6, 3,-26, 1, 11,-25,-10, -9,-20, -3,-22,-17, 5, 19, -1,-11, 2, -5,-22,-30,-23, 4; /M: SY='D'; M= -8, 9,-28, 18, 8,-31,-12,-10,-28, 6,-30,-21, 3, 16, 0, -4, 4, -3,-23,-33,-20, 2; /M: SY='V'; M= 3,-22,-10,-22,-22, -5,-22,-25, 17,-17, 0, 2,-20,-25,-22,-17, 3, 5, 34,-33,-13,-22; /M: SY='K'; M= -4, 0,-24, 0, 10,-30,-14, -5,-24, 22,-27,-10, 3,-10, 20, 13, 7, -1,-20,-26,-13, 15; /M: SY='K'; M= -7, 0,-25, -3, 5,-25,-20,-13,-25, 34,-25,-10, 0,-10, 5, 20, -2, 6,-15,-23,-10, 5; /M: SY='C'; M=-14,-20, 53,-26,-26, 2,-30, -8,-17,-21,-11,-11,-20,-36,-21,-21,-14,-10,-10,-14, 19,-26; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='V'; M= 12,-25,-10,-28,-25, -5,-23,-28, 21,-18, 5, 5,-25,-25,-25,-20, -5, 0, 38,-28,-12,-25; /M: SY='T'; M= -3, -9,-13,-16,-13, 14,-18,-18, -9,-16, -9, -9, -3,-16,-16,-13, 13, 26, -2,-21, -1,-13; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='E'; M= -7, 7,-24, 11, 40,-24,-20, -6,-24, 4,-17,-17, 0, -3, 11, -3, 6, 7,-21,-30,-17, 25; /M: SY='W'; M=-15,-21,-38,-20, -2, -4,-20,-15,-14, -9,-11, -3,-24,-19, -4,-12,-24,-20,-21, 61, 9, 0; /M: SY='C'; M= -4,-14, 82,-21,-21,-20,-21,-24,-27,-24,-23,-20,-11,-31,-21,-24, 5, -1,-10,-47,-27,-21; /M: SY='S'; M= -1, -9,-17, -9, -4,-13,-11,-10,-14, -5,-10, -9, -1,-17, -2, 6, 13, 7, -8,-31,-13, -4; /M: SY='K'; M=-10, -9,-30,-12, -2,-21,-26,-16, -7, 27,-15, -1, -6,-13, 1, 13,-13,-10, -5,-20, -7, -2; /M: SY='S'; M= 11, -5,-15, -7, -2,-20, -5,-10,-20, 0,-23,-15, 3,-13, 0, 9, 20, 8,-10,-30,-17, -2; /M: SY='Q'; M= -7, -9,-24, -9, 5,-28,-23, -2, -5, 1,-11, 3, -9,-16, 34, 1, -3, -7, -7,-23,-10, 20; /M: SY='F'; M=-11,-28,-18,-33,-25, 26,-28,-18, 17,-23, 23, 21,-25,-28,-24,-18,-20, -8, 16,-14, 6,-23; /M: SY='I'; M= -5,-30,-20,-35,-30, 0,-35,-30, 40,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 40,-25, -5,-30; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='V'; M= -4,-17,-19,-17,-10,-16,-26,-16, 5, 2, -6, 3,-17,-21, 0, -2, -8, -4, 16,-26,-10, -5; /M: SY='A'; M= 17, 7,-18, -3, -2,-23, -5, -9,-18, 9,-21,-13, 13,-13, -2, -1, 5, -3,-14,-26,-17, -2; /M: SY='E'; M= -4, 7,-24, 14, 43,-27,-14, -3,-27, 4,-23,-20, 3, -3, 14, -3, 12, -1,-24,-33,-20, 28; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='Y'; M=-12,-26,-25,-28,-26, 13,-33, -8, 22,-18, 8, 8,-23,-27,-18,-18,-17, -7, 17, 0, 33,-26; /M: SY='W'; M=-18,-10, -7, -6,-15,-11,-19,-21,-28,-16,-23,-23,-18,-26,-16,-19,-22,-20,-26, 51, 2,-13; /M: SY='E'; M=-10, -1,-33, 6, 32,-33,-20, -3,-24, 4,-23,-15, -6, 24, 22, -3, -3,-10,-30,-27,-20, 25; /M: SY='E'; M=-13, -5,-36, 3, 34,-18,-20, -9,-27, 1,-20,-20,-12, -9, 8, -6,-12,-16,-30, 22, -5, 23; /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23, 7,-33,-23, 29,-30, 41, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 16,-20, 0,-23; /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20, 8,-28,-16, 20,-26, 43, 29,-28,-28,-16,-18,-28,-10, 10,-20, 0,-18; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='T'; M= -3, 0,-16, -4, -4,-16,-15, 17,-18,-10,-18,-10, 6,-13, -2, -7, 17, 22,-11,-33, -4, -4; /M: SY='F'; M= -4,-18,-17,-22,-23, 7, -2,-23, -4,-20, -5, -5,-13,-23,-25,-18, -3, 4, 7,-19, -7,-23; /M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5, 10,-30,-20, 5,-25, 20,-20, -5, 0,-15, 35, 40, -5,-10,-25,-20,-10, 20; /M: SY='P'; M=-10,-23,-37,-18, -8,-22,-25,-23, -2,-15,-17,-10,-20, 61,-13,-23,-13,-10,-14,-27,-22,-15; /M: SY='E'; M= -1, 8,-25, 13, 18,-27,-13, -5,-28, 9,-20,-17, 2,-10, 6, 14, -1, -8,-20,-27,-17, 10; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='C'; M= -8,-22, 18,-24,-21,-11,-27,-21, -3, -8, -7, -4,-19,-30,-18, 4,-10, -6, 14,-32,-15,-21; /M: SY='I'; M= -6,-30,-21,-36,-30, 0,-36,-30, 41,-26, 16, 16,-24,-24,-24,-26,-16, -6, 39,-24, -4,-30; /M: SY='K'; M= 9, -3,-19, -8, -1,-22,-15,-16,-19, 17,-19,-10, -3,-10, -1, 5, 4, 10, -9,-23,-13, -1; /M: SY='D'; M=-17, 35,-30, 50, 20,-40,-13, 3,-34, 3,-27,-21, 14,-10, 17, -4, 0,-10,-30,-34,-17, 19; /M: SY='W'; M=-17,-28,-44,-28,-18, -2,-20,-24,-23, 0,-23,-17,-28,-24,-11, -5,-31,-24,-27,101, 18,-11; /M: SY='W'; M=-10,-30,-25,-30,-28, 10,-27,-18, 10,-18, 0, 0,-30,-30,-23,-18,-20,-10, 15, 31, 21,-25; /M: SY='G'; M= 10, 7,-18, -1, -7,-23, 18, -9,-23,-10,-26,-18, 18,-16, -7,-12, 14, -1,-19,-30,-23, -7; /M: SY='H'; M= 5, -9,-27,-10, -7,-24, 6, 15,-25,-12,-22,-12, -4, 7, -7,-14, -2,-13,-22,-25,-13, -9; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='N'; M= 8, 12,-18, 7, 13,-23, -5, -4,-20, -2,-23,-18, 18,-10, 3, -7, 14, 2,-19,-33,-20, 8; /M: SY='D'; M=-17, 47,-27, 57, 15,-35, -7, 3,-35, 0,-30,-27, 30,-13, 0, -7, 3, -7,-30,-40,-20, 7; /M: SY='C'; M= 4,-18, 90,-28,-25,-20,-23,-28,-25,-25,-18,-18,-18,-33,-25,-28, -5, -8, -8,-43,-28,-25; /M: SY='G'; M= 15,-10,-24,-13,-17,-27, 50,-20,-31,-17,-24,-17, -3,-17,-17,-20, 3,-14,-21,-20,-27,-17; /M: SY='C'; M= 7,-17, 82,-27,-24,-20,-21,-27,-24,-24,-17,-17,-17,-31,-24,-27, -4, -7, -7,-41,-27,-24; /M: SY='L'; M=-11,-18,-23,-22,-15, -6,-28,-17, 7, -8, 9, 5,-12,-20, -9, 6,-11, 3, 4,-22, -5,-15; /M: SY='Y'; M=-17,-23,-27,-23,-20, 24,-30, 8, 6,-16, 15, 6,-23,-30,-13,-13,-23,-10, -4, 15, 57,-20; /M: SY='Q'; M= -7, 0,-24, 2, 18,-27,-14, -1,-25, 9,-23,-13, 3,-10, 20, 18, 9, -1,-22,-28,-15, 18; /M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23, 30,-30,-20, 14,-30, 38, 14,-27,-30,-26,-20,-27,-10, 7,-11, 9,-23; /M: SY='R'; M= 5, -8,-20,-13, -5,-18,-14,-10,-20, 9,-15,-10, -3,-15, 0, 25, 3, 7,-10,-22,-13, -5; /M: SY='V'; M= 15,-24,-10,-27,-24, -6,-21,-27, 18,-17, 4, 4,-24,-24,-24,-20, -4, 0, 35,-27,-13,-24; /M: SY='Q'; M=-13, -3,-30, -3, 12,-32,-20, 3,-25, 24,-22, -5, 0,-13, 35, 30, -5,-10,-25,-20,-10, 23; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='L'; M= 3, -5,-18,-13,-12, -5,-15,-11, 2,-17, 14, 2, 0,-23,-12,-14,-10, -5, -4,-26,-10,-12; /M: SY='D'; M= -7, 7,-21, 12, -1,-11,-11, 1,-19, -7,-21,-17, 4,-16, -3,-10, 12, 3,-15,-20, 9, -3; /M: SY='E'; M= 0, 3,-26, 5, 27,-25,-16, 25,-26, 0,-18,-12, 1, -8, 11, -4, -1,-11,-23,-28, -8, 18; /M: SY='H'; M=-17, 9,-30, 16, 17,-14,-20, 28,-24, -2,-17,-12, 1,-15, 6, -5, -8,-12,-25,-17, 15, 9; /M: SY='E'; M= -9, 1,-24, 3, 22,-11,-22, -1,-18, 0,-13,-13, -4, -9, 5, -5, 1, 7,-17,-17, 5, 12; /M: SY='N'; M=-10, 13,-25, 1, -1,-21,-15, 1, -5, -4,-16, -5, 25,-17, 13, -4, 1, -5,-17,-30,-13, 5; /M: SY='W'; M= -8,-22,-27,-20, -7, -5,-24,-22, 0,-12, -7, -7,-25,-22,-14,-15,-16,-11, 6, 22, -1, -9; /M: SY='I'; M= -7,-30,-20,-33,-26, 4,-33,-26, 31,-27, 31, 17,-27,-27,-23,-23,-22, -7, 26,-23, -3,-26; /M: SY='A'; M= 20, -9,-16,-11, 5,-18,-14,-17, -5, -7, -8, -8,-12,-12, -7,-14, 2, -3, 4,-26,-17, -1; /M: SY='R'; M= -9, -1,-26, 2, 16,-25,-16, -5,-28, 22,-25,-14, 2,-11, 10, 26, 3, -3,-20,-27,-14, 12; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='S'; M= 3, -1,-20, 1, 7,-25, 16,-11,-28, -9,-28,-20, 5,-11, -1,-11, 20, 2,-20,-32,-23, 3; /M: SY='H'; M= 7, -7,-22, -7, -3,-22,-10, 17,-20,-10,-22,-12, -2, 9, -2,-12, 7, -3,-18,-30,-11, -5; /M: SY='S'; M= 0,-15,-21,-13,-13,-19, 3,-20,-10,-15,-18,-11,-10, 4,-16,-17, 5, -2, -2,-30,-22,-16; /M: SY='P'; M=-10,-10,-35, -5, 10,-35,-20, -4,-20, 0,-25,-10,-10, 38, 27, -4, -5,-10,-30,-25,-20, 16; /M: SY='T'; M= -3, -3,-13,-11,-16, -8,-19,-17, 5,-12, -6, -4, 2,-22,-16,-12, 4, 15, 15,-33,-13,-16; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='P'; M= 6, -5,-24, -4, 13,-23,-15,-14,-18, -4,-18,-16, -8, 19, -1,-12, 4, 5,-17,-28,-20, 5; /M: SY='W'; M=-10,-33,-24,-35,-30, 20,-27,-28, 9,-22, 1, -1,-31,-30,-29,-20,-21,-11, 16, 31, 10,-27; /M: SY='P'; M= 7,-15,-24,-16, -4,-19,-17,-13, -7,-11, -1, -2,-15, 8, 3,-13, -7, -7,-11,-22,-15, -2; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='W'; M=-20,-19,-45,-15,-18, -2,-18,-23,-25,-15,-22,-22,-26,-25,-15,-18,-31,-25,-30,106, 18,-13; /M: SY='T'; M= 0, 9,-12, -1, -6,-14,-11,-11,-14, -8,-19,-14, 15,-12, -6, -8, 22, 32, -9,-34,-14, -6; /M: SY='D'; M=-12, 22,-30, 34, 19,-34, 11, -6,-37, -3,-27,-24, 9,-10, -1,-10, 0,-13,-30,-32,-23, 9; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='Q'; M= 3, -7,-26, -9, -1,-28, 5, -6,-25, 4,-20, -9, -2,-15, 13, 12, 0,-10,-21,-20,-17, 5; /M: SY='P'; M= -2, -8,-28, -5, -2,-27, 6,-15,-27, 1,-30,-18, -3, 17, -5, -7, 5, -4,-23,-28,-23, -5; /M: SY='W'; M=-17,-35, -6,-37,-30, 2,-23,-30,-23,-23,-20,-20,-35,-33,-23,-23,-32,-25,-25, 98, 14,-23; /M: SY='Q'; M=-13, -4,-28, -4, 17,-23,-20, 2,-16, 11,-11, 5, -5,-12, 21, 18, -7,-10,-18,-23,-11, 18; /M: SY='E'; M=-13, 19,-30, 29, 38,-36,-17, 3,-30, 7,-23,-18, 6, -6, 25, 0, 0,-10,-30,-30,-17, 31; /M: SY='W'; M=-10,-33,-31,-37,-30, 3,-32,-30, 24,-24, 6, 6,-28,-26,-23,-24,-23,-13, 18, 27, 6,-27; /M: SY='S'; M= 7, 0,-10, -3, -3,-17, -6,-13,-17,-10,-24,-17, 7,-10, -3,-10, 34, 29, -7,-37,-17, -3; /M: SY='H'; M=-17, -9,-30,-12, -9,-14,-26, 62, -7,-16, -8, 6, 1,-20, 1, -9,-13,-17,-13,-27, 14, -9; /M: SY='T'; M= -3, -5,-16, -7, 5,-13,-23,-17, -5, -7, -8, -8, -8,-12, -7,-10, 6, 20, 4,-30,-13, -1; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='T'; M= -4, 15,-16, 15, 1,-21,-13,-12,-21, -7,-20,-18, 8,-10, -5,-10, 19, 26,-11,-35,-15, -2; /M: SY='D'; M=-17, 47,-27, 57, 15,-35, -7, 3,-35, 0,-30,-27, 30,-13, 0, -7, 3, -7,-30,-40,-20, 7; /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-25,-23, 43,-30, 10, 0,-15, 3, 0,-20,-30,-18,-13,-20,-10, -7, 25, 67,-23; /M: SY='P'; M= -5,-15,-35,-10,-10,-30, 24,-20,-30,-15,-30,-20,-10, 36,-15,-20, -5,-15,-30,-25,-30,-15; /M: SY='P'; M= -4, -9,-29, -4, 3,-27,-14,-14,-23, 6,-30,-17, -6, 35, -2, -4, 5, -1,-22,-30,-22, -2; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='I'; M= -6,-30,-21,-36,-30, 0,-36,-30, 41,-26, 16, 16,-24,-24,-24,-26,-16, -6, 39,-24, -4,-30; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='H'; M=-20,-12,-28,-14,-12, 16,-25, 51,-15,-15, -8, 0, -5,-25, -7, -7,-15,-15,-18, -5, 38,-12; /M: SY='V'; M= -5,-30,-17,-32,-27, 3,-32,-27, 31,-25, 24, 15,-28,-28,-25,-22,-18, -5, 34,-25, -5,-27; /M: SY='T'; M= -4, -9,-17,-12, -7,-11,-17,-13,-11, -5, -4, -6, -4,-17, -5, 6, 7, 15, -5,-28,-10, -7; /M: SY='F'; M=-17,-30,-23,-40,-30, 57,-33,-23, 15,-30, 13, 6,-20,-27,-34,-23,-20,-10, 9, 1, 21,-30; /M: SY='E'; M=-10, -4,-27, 1, 28,-21,-23, -4,-13, -2, 0, -4, -9,-11, 17, -4, -9,-10,-18,-25,-12, 23; /M: SY='H'; M=-14, 12,-27, 6, 5,-25,-14, 50,-24, -2,-23, -6, 22,-17, 20, 3, -2,-12,-30,-30, 1, 10; /M: SY='G'; M= -8, -7,-30, -4, 3,-14, 18, -4,-27, -9,-19,-15, -5,-17, -6,-12, -5,-14,-25,-10, 2, -3; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='Q'; M=-13, 0,-30, 3, 26,-32,-20, 4,-26, 15,-20, -8, 0,-10, 35, 23, -3,-10,-27,-23,-13, 30; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='T'; M= -3, -3,-16, -8, -5,-15,-15,-12,-18, 2,-18,-12, 2,-13, -2, 13, 16, 26, -8,-29,-12, -5; /M: SY='Q'; M=-10,-10,-25,-10, 3,-26,-22, -2,-11, 8,-13, 0, -7,-17, 26, 19, -5, -8, -9,-22,-10, 13; /M: SY='F'; M=-12,-20,-20,-25,-20, 42,-22, -8, -5,-20, -3, -5,-12,-25,-23,-15, -4, -2, -5, 2, 29,-20; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='R'; M=-10,-11,-25,-11, -3,-19,-23,-12,-14, 26,-17, -5, -8,-18, 0, 29,-10, -7, -2,-23,-10, -3; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='W'; M=-20,-27,-36,-30,-22, 23,-23, 7,-17,-20,-11, -9,-21,-27,-18,-15,-26,-22,-21, 62, 27,-18; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-25,-22, 42,-30, 11, 0,-15, 2, 0,-20,-30,-17,-12,-20,-10, -8, 25, 68,-22; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='P'; M= 20,-15,-25,-15, -5,-25,-10,-20,-15,-10,-20,-15,-15, 41,-10,-20, 0, -5,-15,-25,-25,-10; /M: SY='R'; M=-14,-12,-27,-12, -2,-15,-23, -8,-17, 20, -5, -2, -8,-20, 2, 35,-15,-10,-12,-20, -7, -2; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='T'; M= 15, -3,-10,-13,-10,-13,-14,-20,-10,-10,-10,-10, -3,-10,-10,-13, 17, 35, 0,-27,-13,-10; /M: SY='N'; M=-13, 30,-23, 15, 0,-20, -5, 33,-23, -3,-27,-15, 47,-20, 3, 0, 5, -5,-30,-37,-10, 0; /M: SY='S'; M= 4, -9,-16,-12, -9,-14,-12,-16, 0,-16,-15, -8, 1,-13, -6,-16, 23, 11, 2,-34,-14, -9; /M: SY='S'; M= 4, 0,-16, 0, 6,-26, -6, -4,-20, -4,-27,-14, 7,-10, 17, -4, 28, 11,-16,-34,-17, 12; /M: SY='V'; M= -2,-30,-14,-32,-30, 0,-32,-30, 34,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 46,-28, -8,-30; /M: SY='W'; M=-15,-15,-35,-15, 4,-12,-24,-13,-10, 0,-11, -9,-14,-17, -1, 7,-16,-15,-14, 16, -1, 0; /M: SY='V'; M= -2,-30,-14,-32,-30, 0,-32,-30, 34,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 46,-28, -8,-30; /M: SY='R'; M= -8, -9,-26,-10, 5,-17,-21,-11, -5, -1,-11, -6, -4,-13, 1, 7, 0, -3, -6,-27,-12, 1; /M: SY='I'; M=-12,-21,-29,-21,-14, -8,-28, 3, 8,-21, 8, 6,-16, 3,-11,-18,-18,-12, -3,-24, -3,-16; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 18 in 18 different sequences |
| Number of true positive hits | 18 in 18 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | FBA |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
18 sequences
FBX17_HUMAN (Q96EF6), FBX17_MOUSE (Q9QZM8), FBX17_RAT (Q6AY27), FBX27_HUMAN (Q8NI29), FBX27_MACFA (Q9N0C8), FBX27_MOUSE (Q6DIA9), FBX2_BOVIN (Q17QK6), FBX2_HUMAN (Q9UK22), FBX2_MOUSE (Q80UW2), FBX44_HUMAN (Q9H4M3), FBX44_MOUSE (Q8BK26), FBX50_DANRE (Q568V3), FBX50_HUMAN (Q6ZVX7), FBX50_MOUSE (G3X9C2), FBX6_BOVIN (Q3SX24), FBX6_HUMAN (Q9NRD1), FBX6_MOUSE (Q9QZN4), FBX6_RAT(Q923V4)» more
|
| PDB [Detailed view] |
8 PDB
1UMH; 1UMI; 2E31; 2E32; 2E33; 2RJ2; 3WSO; 5B4N |