PROSITE entry PS51151
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | NAC_AB |
| Accession [info] | PS51151 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-OCT-2005 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51151 |
| Associated ProRule [info] | PRU00507 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | NAC A/B domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=66; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=61; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.6092148; R2=0.0166524; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3196.8601074; R2=3.0698924; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=414; H_SCORE=4468; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=294; H_SCORE=4099; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='P'; M= 2, -7,-24, -6, -3,-23, -5,-15,-18, -6,-22,-14, -5, 17, -7,-12, 6, 2,-15,-29,-21, -6; /M: SY='R'; M= -4, -9,-23,-11, -5,-18,-13,-11,-13, 9,-14, -4, -5,-14, -2, 11, -4, -3, -6,-24,-12, -5; /M: SY='D'; M= -9, 21,-26, 25, 12,-31, 0, 0,-30, 1,-26,-18, 14,-12, 6, -5, 4, -8,-26,-32,-18, 9; /M: SY='E'; M= -9, 4,-27, 10, 19,-22,-18, -7,-18, -2,-15, -9, -3, 6, 2, -9, -3, -6,-17,-30,-17, 10; /M: SY='K'; M=-11, -2,-28, -2, 7,-26,-19, -8,-28, 38,-26,-11, 0,-10, 8, 34, -6, -6,-19,-22,-11, 7; /M: SY='K'; M=-11, 3,-29, 4, 9,-30,-18, -1,-29, 34,-26,-10, 3,-12, 15, 27, -7,-10,-22,-22,-10, 11; /M: SY='L'; M= 1,-21,-18,-26,-18, 0,-22,-16, 14,-21, 23, 17,-20,-23,-14,-18,-15, -5, 10,-21, -3,-17; /M: SY='Q'; M=-11, -2,-27, -4, 11,-25,-19, 8,-18, 10,-15, 0, 1,-13, 23, 17, -4, -8,-20,-24, -9, 15; /M: SY='K'; M= 0, -3,-24, -4, 7,-23,-14, -7,-21, 18,-19,-10, -1,-13, 7, 15, -3, -7,-16,-22,-12, 6; /M: SY='M'; M= 8,-14,-18,-19, -9,-12,-18,-13, 3,-10, 4, 9,-14,-16, -1,-12, -5, 0, 4,-22,-10, -6; /M: SY='L'; M= -9,-26,-21,-30,-21, 5,-27,-15, 23,-23, 35, 32,-25,-25,-13,-17,-24, -8, 13,-21, -1,-18; /M: SY='K'; M= -3, -5,-26, -6, 2,-26, 0, -7,-25, 15,-23, -8, -2,-14, 4, 10, -3,-10,-18,-22,-14, 2; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='K'; M= -7, 1,-24, 0, 7,-24,-13, -5,-24, 26,-22, -9, 2,-10, 10, 22, -4, -5,-17,-19,-10, 8; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='L'; M=-10,-29,-23,-34,-25, 10,-32,-22, 29,-27, 32, 22,-25,-26,-20,-22,-24, -9, 18,-18, 2,-24; /M: SY='G'; M= -8, 10,-29, 11, 1,-30, 15, -5,-33, 4,-29,-18, 11,-12, -3, -1, -1,-12,-27,-27,-20, -1; /M: SY='L'; M= 1,-23,-13,-25,-19, -4,-20,-19, 11,-19, 15, 13,-22,-21,-16,-18,-12, -4, 14,-25, -9,-18; /M: SY='E'; M= -6, 2,-26, 3, 21,-27,-18, -5,-23, 18,-20, -9, -1, -8, 16, 10, -1, -4,-19,-25,-14, 18; /M: SY='E'; M= -9, 5,-29, 9, 18,-27,-17, -1,-24, 4,-23,-16, 2, 13, 8, -2, -1, -5,-25,-28,-16, 12; /M: SY='I'; M= -9,-28,-22,-33,-24, 8,-32,-23, 30,-25, 24, 19,-24,-25,-21,-22,-20, -8, 23,-20, 0,-24; /M: SY='E'; M= -7, 5,-28, 12, 13,-29, -5,-10,-28, 0,-27,-20, 1, 13, 0, -7, 3, -4,-25,-31,-22, 5; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='G'; M= 0, 11,-21, 11, -3,-24, 22, -8,-26, -8,-22,-17, 12,-13, -8,-11, 3, -9,-21,-23,-20, -5; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='V'; M= 5,-26,-18,-32,-26, -2,-28,-28, 29,-22, 10, 10,-23,-23,-23,-24,-10, -4, 33,-24, -7,-26; /M: SY='E'; M= -3, 4,-23, 7, 16,-22,-15, -3,-19, -2,-16,-13, -1,-10, 4, -7, 3, 0,-14,-28,-14, 10; /M: SY='E'; M=-13, 3,-30, 9, 37,-25,-20, 0,-29, 19,-20,-16, -1, -7, 15, 19, -4,-10,-26,-24,-12, 25; /M: SY='V'; M= 7,-26, -8,-29,-26, -2,-26,-28, 21,-20, 7, 6,-25,-26,-26,-21, -8, -2, 35,-27,-10,-26; /M: SY='T'; M= -2, -2,-14, -9, -6,-13,-19,-14, -1, -9, -9, -6, 3,-17, -8,-10, 3, 10, 2,-30,-13, -8; /M: SY='I'; M=-11,-28,-25,-37,-27, 13,-33,-21, 32,-26, 22, 25,-21,-23,-19,-23,-21,-10, 20,-16, 4,-25; /M: SY='R'; M=-13,-12,-26,-14, -3, 1,-24, -7,-13, 12,-11, -3, -8,-18, -5, 14,-12, -9, -9,-14, 3, -4; /M: SY='R'; M=-10,-11,-25,-12, -4,-14,-18,-11,-13, 12, -5, -1, -8,-18, 1, 15,-11, -5,-10,-20, -8, -2; /M: SY='K'; M= 0, 1,-25, 3, 10,-27,-10,-10,-24, 14,-23,-14, -1, -2, 3, 4, -1, -5,-18,-26,-17, 6; /M: SY='D'; M=-14, 28,-28, 37, 12,-33, -4, -3,-35, 6,-29,-23, 15,-12, 2, 2, 1, -8,-27,-33,-19, 7; /I: I=-5; MD=-25; /M: SY='G'; M= -3, 4,-19, 4, -6,-21, 28, -8,-25, -7,-21,-14, 8,-12, -7, -9, 3, -9,-20,-19,-18, -6; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='K'; M= -4, -3,-22, -6, 2,-18,-16, -7,-13, 5,-13, -6, 0,-13, -1, 0, 2, 4, -9,-27,-11, 0; /M: SY='V'; M= -7,-14,-17,-14, -5, -8,-26,-16, 6,-11, 4, 1,-14,-20,-11,-10, -9, -4, 9,-26, -8, -9; /M: SY='L'; M=-12,-27,-22,-31,-24, 19,-31,-16, 20,-25, 25, 15,-24,-27,-21,-20,-21, -7, 12,-10, 14,-23; /M: SY='V'; M= -4,-13,-20,-17,-14, -8,-23, 2, 6,-13, -4, 2, -8,-22,-10,-10, -6, -4, 10,-25, -1,-14; /M: SY='F'; M=-13,-30,-23,-38,-30, 37,-33,-25, 21,-28, 13, 9,-22,-26,-30,-23,-20, -9, 16, -2, 13,-29; /M: SY='E'; M= -2, 9,-22, 8, 10,-24,-13, -7,-21, 8,-22,-15, 8,-10, 2, 2, 4, -1,-15,-30,-17, 5; /M: SY='N'; M= -5, 14,-22, 10, 9,-25, -9, 0,-23, 8,-25,-14, 20,-13, 9, 7, 8, -1,-22,-32,-16, 9; /M: SY='P'; M= -2,-20,-34,-13, -3,-27,-18,-21,-15,-11,-25,-17,-20, 69,-11,-20, -8, -8,-21,-29,-27,-11; /M: SY='E'; M= -3, 4,-23, 5, 12,-24,-15, -8,-20, 9,-19,-12, 1,-10, 3, 1, 2, 1,-13,-28,-14, 7; /M: SY='V'; M= 1,-29,-12,-30,-29, 0,-29,-29, 29,-21, 12, 10,-29,-29,-28,-21,-11, -1, 45,-28, -9,-29; /M: SY='Y'; M= -9, -7,-25,-10, -4, -6,-22, 6, -7, -6, -9, -1, -6,-18, 10, -6, -4, -1,-12, -9, 17, 1; /M: SY='R'; M= -1,-14,-13,-18,-12,-13,-13,-17, -8, 0, -8, -3,-11,-20,-10, 1, -7, -5, 0,-23,-12,-12; /I: I=-5; MD=-25; /M: SY='M'; M= 2,-14,-15,-20,-15, -6,-16,-14, 8,-15, 1, 11,-10,-17, -9,-15, 4, 6, 9,-26, -8,-13; D=-5; /I: I=-5; MD=-25; /M: SY='P'; M= -6, -7,-25, -3, 3,-20,-18,-13,-11, -1,-14, -9, -9, 13, -4, -6, -4, -4,-10,-27,-16, -2; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='A'; M= 13, -6,-20,-11, -6,-23, 9, -8,-19, -9,-17, -8, -2,-12, -2,-11, 6, -3,-14,-24,-17, -5; /M: SY='S'; M= 1, 3,-15, -1, 0,-24, -3, -8,-20, -5,-23,-13, 8, -9, 5, -7, 14, 7,-17,-31,-18, 2; /M: SY='N'; M= -8, 17,-26, 13, 7,-27, 10, 0,-29, 2,-28,-19, 22,-15, 1, -2, 3, -9,-28,-31,-20, 4; /M: SY='T'; M= -1, -5,-12, -9, -4,-15,-18,-12,-11, -7,-10, -7, -3,-13, 0, -7, 11, 21, -4,-29,-11, -2; /M: SY='Y'; M=-16,-20,-26,-22,-16, 27,-28, -2, -1,-10, 3, 0,-17,-22,-15,-10,-17, -7, -6, 7, 39,-17; /M: SY='V'; M= -1,-22,-19,-26,-19, -3,-26,-21, 18,-18, 7, 8,-19,-19,-13,-18, -9, -1, 20,-23, -5,-17; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='V'; M= -5,-30,-18,-34,-29, 5,-33,-28, 34,-25, 17, 14,-26,-27,-26,-23,-16, -5, 37,-24, -4,-29; /M: SY='F'; M= -6,-15,-18,-21,-17, 17,-22,-11, -1,-18, 0, -3,-10,-19,-18,-15, -2, 7, 1,-13, 9,-17; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-18,-30, 66,-19,-39,-19,-30,-19, 0,-20,-17,-19, 0,-20,-30,-20,-29,-17; /M: SY='D'; M= -9, 13,-27, 17, 16,-27,-15, -5,-23, 7,-22,-16, 7, -5, 4, -2, -1, -5,-20,-29,-15, 10; /M: SY='A'; M= 8,-12,-22,-15, -7,-11,-13,-11, -8,-11,-10, -6,-10, 6, -8,-15, -3, -5, -8,-21,-10, -9; /M: SY='K'; M= -6, 0,-21, 1, 11,-26,-16, -9,-21, 15,-20,-10, -2,-12, 9, 8, -2, -3,-14,-26,-14, 9; /M: SY='E'; M= -6, -4,-22, -2, 11,-16,-20, -8,-10, -3,-10, -9, -5, -9, -1, -4, -1, -1, -6,-28,-13, 5; /M: SY='E'; M=-10, 4,-29, 9, 23,-27,-19, -6,-26, 21,-23,-15, 1, -5, 9, 15, -5, -9,-21,-26,-15, 15; /M: SY='D'; M= -8, 12,-25, 19, 14,-26,-15, -7,-24, 1,-22,-18, 4, 0, 2, -6, 3, -1,-19,-31,-16, 7; /M: SY='M'; M= -3,-17,-22,-22,-14, -8,-23,-16, 9, -9, 8, 13,-14,-13, -9,-10,-12, -4, 5,-23, -7,-13; /M: SY='S'; M= 4, 2,-18, 0, 4,-20, -9,-10,-16, -4,-16,-13, 3,-12, 0, -6, 11, 7,-11,-30,-16, 2; /M: SY='E'; M= 1, 2,-22, 3, 17,-22,-12, -3,-19, -3,-15,-12, 0, -9, 8, -7, 5, -1,-17,-27,-14, 12; /M: SY='E'; M= -5, -9,-24,-10, 2,-16,-15,-12, -7, -5, -3, -2, -8,-10, 0, -6, -5, -4, -9,-25,-12, 0; /M: SY='I'; M= 0,-15,-23,-16, -8,-12,-22,-17, 3,-10, 0, 0,-13, -6, -8,-13, -6, -2, 2,-24, -9, -9; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 132 in 132 different sequences |
| Number of true positive hits | 132 in 132 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Archaea, Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | N_Hulo |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | NAC-A/B |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
132 sequences
BT3L4_BOVIN (Q2KIY7), BT3L4_CHICK (Q5ZJG3), BT3L4_DANRE (Q6PC91), BT3L4_HUMAN (Q96K17), BT3L4_MOUSE (Q9CQH7), BT3L4_PONAB (Q5RC59), BT3L4_XENLA (Q4KLF5), BT3L4_XENTR (Q5M8V0), BTF3L_ARATH (Q9CAT7), BTF3_ARATH (Q9SMW7), BTF3_CAEEL (Q18885), BTF3_HUMAN (P20290), BTF3_MOUSE (Q64152), NACA1_ARATH (Q9LHG9), NACA2_ARATH (Q94JX9), NACA2_HUMAN (Q9H009), NACA3_ARATH (Q6ICZ8), NACA4_ARATH (Q9SZY1), NACA5_ARATH (Q8LGC6), NACAD_HUMAN (O15069), NACAD_MOUSE (Q5SWP3), NACAM_HUMAN (E9PAV3), NACAM_MOUSE (P70670), NACA_AJECN (A6R641), NACA_ASPCL (A1CMF8), NACA_ASPFU (Q4WD81), NACA_ASPNC (A2R4V1), NACA_ASPOR (Q2U955), NACA_ASPTN (P0C2C7), NACA_BABDI (Q45FF9), NACA_BOTFB (A6SB28), NACA_BOVIN (Q5E9A1), NACA_CAEBR (Q61UX1), NACA_CAEEL (Q86S66), NACA_CANAL (Q5ANP2), NACA_CANGA (Q6FJD5), NACA_CHAGB (Q2H4Z2), NACA_CHILA (Q6QN10), NACA_COCIM (Q1DHR3), NACA_CRYNB (P0CP07), NACA_CRYNJ (P0CP06), NACA_DANRE (Q8JIU7), NACA_DEBHA (Q6BSN9), NACA_DICDI (Q54U07), NACA_DROME (Q94518), NACA_EMENI (Q5AYK0), NACA_ENCCU (Q8SWB5), NACA_EREGS (Q756T5), NACA_GIBZE (Q4I2J8), NACA_HUMAN (Q13765), NACA_KLULA (Q6CWG6), NACA_LODEL (A5DXK7), NACA_MOUSE (Q60817), NACA_NEOFI (A1DLM0), NACA_NEUCR (Q7SI17), NACA_ORENI (Q8AWF2), NACA_PHANO (Q0UKB5), NACA_PICGU (A5DGN9), NACA_PICST (A3GHD3), NACA_PINTA (Q9M612), NACA_PONAB (Q5R9I9), NACA_PYRO7 (A4RC89), NACA_SCHPO (P87147), NACA_SCLS1 (A7EIZ1), NACA_USTMA (Q4P341), NACA_VANPO (A7TG43), NACA_XENLA (Q6IP73), NACA_XENTR (Q68F90), NACA_YARLI (Q6CDH0), NACA_YEAS7 (A6ZT99), NACA_YEAST (P38879), NACB1_YEAS7 (A6ZWL1), NACB1_YEAST (Q02642), NACB2_YEAS7 (A6ZYK4), NACB2_YEAST (P40314), NACB_AJECN (A6R5Z3), NACB_ASPCL (A1CMP1), NACB_ASPFU (Q4WCX4), NACB_ASPNC (A2R091), NACB_ASPOR (Q2U6N1), NACB_ASPTN (Q0CGL5), NACB_BOTFB (A6S6B0), NACB_CANAL (Q59TU0), NACB_CANGA (Q6FKD1), NACB_CHAGB (Q2H4X9), NACB_COCIM (Q1DI23), NACB_CRYNB (P0CP09), NACB_CRYNJ (P0CP08), NACB_DEBHA (Q6BLV1), NACB_DICDI (Q54TR8), NACB_EMENI (Q5ASI4), NACB_EREGS (Q751F1), NACB_GIBZE (Q4I283), NACB_KLULA (Q6CR46), NACB_LODEL (A5DT59), NACB_NEOFI (A1DL98), NACB_NEUCR (Q7SDU4), NACB_PHANO (Q0ULD0), NACB_PICGU (A5DF06), NACB_PICST (A3GHR2), NACB_PYRO7 (A4RC23), NACB_SCHPO (Q92371), NACB_SCLS1 (A7F9B8), NACB_USTMA (Q4P9Y9), NACB_YARLI (Q6C2F3), NACP4_HUMAN (Q9BZK3), NAC_AERPE (Q9YFQ1), NAC_ARCFU (O30024), NAC_HALMA (Q5V5C9), NAC_HALSA (Q9HS36), NAC_META3 (A6UVF4), NAC_METAC (Q8TSA1), NAC_METJA (Q57728), NAC_METKA (Q8TWS7), NAC_METM5 (A4FZP7), NAC_METM6 (A9A807), NAC_METM7 (A6VIT0), NAC_METMA (Q8PVF0), NAC_METMP (Q6M0I0), NAC_METTH (O26279), NAC_METTM (P0C0K9), NAC_METVS (A6URS6), NAC_NATPD (Q3IUB3), NAC_PICTO (Q6L1N3), NAC_PYRAB (Q9V0Z2), NAC_PYRFU (Q8U0P1), NAC_PYRHO (O59193), NAC_SULAC (Q4J6D8), NAC_SULTO (Q96YI2), NAC_THEAC (Q9HI94), NAC_THEKO (Q5JGB7), NAC_THEVO (Q97CI3)» more
|
| PDB [Detailed view] |
8 PDB
1TR8; 3LKX; 3MCB; 3MCE; 7QWQ; 7QWR; 7QWS; 8P2K |