PROSITE entry PS51153
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
PURL: https://purl.expasy.org/prosite/signature/PS51153
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | RPW8 |
| Accession [info] | PS51153 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-OCT-2005 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51153 |
| Associated ProRule [info] | PRU00495 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | RPW8 domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=153; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=148; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.3450668; R2=0.0092620; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=16747.2070312; R2=19.4896545; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=773; H_SCORE=31813; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=557; H_SCORE=27603; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-5; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='M'; M= 10,-20,-20,-30,-10,-20,-20, 20, 10, 20, 20, 60, 0,-40,-10, 0,-20, 0, 0,-30,-10,-10; /M: SY='P'; M= 5,-15,-28,-10, -1,-25,-12, -5, -9, 2,-17,-20,-21, 52, -4,-10, -5, 4,-10,-35,-18, -6; /M: SY='I'; M= 0,-18,-17,-31,-27, 5,-16,-20, 49,-20, 21, 10, -7,-32,-22,-24,-12, 2, 37,-28, 1,-27; /M: SY='T'; M= 8, -4,-24,-10,-18,-14, 2,-22, 4,-10, -6, -8, 0,-12,-12,-20, 14, 22, 6,-30,-12,-16; /M: SY='D'; M= 0, 32,-16, 61, 28,-46,-14,-13,-36, 7,-10,-23, 3, -3, 1,-10, 0,-14,-24,-29,-14, 18; /M: SY='F'; M=-15,-26,-18,-32,-24, 31,-17,-29, 16,-18, 14, -5,-25,-34,-22,-13,-16,-13, 15, 28, 23,-24; /M: SY='F'; M= 10,-12,-22,-20,-16, 19,-13,-20, 14,-10, 12, 5, -6,-24,-10,-15, -4, -1, 15,-27, -5,-16; /M: SY='A'; M= 18, -4,-28,-10,-10,-16, 14,-20, 8, -6, -8, -2, 0,-14, -6,-16, 10, 4, 4,-30,-28,-12; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='G'; M= 0, 0,-40,-10,-20,-30, 80,-30,-10,-10,-20,-20, 0,-10,-20,-20, 0,-20,-30, 10,-30,-20; /M: SY='A'; M= 25, 0,-19, 2, 14,-22, -5,-13, -9, 5,-12, -1, -2, -5, 8,-10, 14, 5, -3,-37,-31, 9; /M: SY='V'; M= 19,-13,-24,-17,-19, -3,-14,-24, 30,-13, 5, 6, -8,-27,-13,-15, -3, 8, 33,-37,-13,-19; /M: SY='L'; M= 12, -6,-13, -6, -6, 3,-11,-14, 11,-11, 18, 16,-11,-21, -7,-16, -7, 4, 10,-33, 0, -6; /M: SY='G'; M= 2, 0,-35,-10,-20,-28, 57,-28, -8,-10,-15,-15, 2, -8,-15,-22, 5, -4,-21, -4,-25,-18; /M: SY='A'; M= 17, -6,-14, -3, 6,-12,-14,-16, 4, -3, 2, 5, -9,-15, -1,-12, -1, 2, 9,-32,-14, 4; /M: SY='L'; M= 0, -8,-19, -8, -6, -9, 5,-11, 1, -9, 6, -2,-15, 6,-11,-16, -9, -2, -8,-21, -4, -8; /M: SY='L'; M= 4,-10,-10,-10,-12, 10,-18,-16, 20,-16, 24, 14,-16,-28,-16,-16,-12, 4, 18,-28, 12,-12; /M: SY='Q'; M= 8, -4,-22, -4, 12,-17, -9, -9,-16, 9,-20, -7, -4, -2, 25, 9, 13, 6,-19,-21,-14, 13; /M: SY='Q'; M= 10, -6,-10, -5, 24,-27,-14, -7, -7, 5, -7, -3, -6, -3, 25, -4, -2, -6,-11,-21,-20, 25; /M: SY='I'; M= -4,-12,-16,-22,-20, 2, 5,-18, 30,-18, 20, 8, -8,-26,-20,-24,-12, -4, 14,-18, 2,-20; /M: SY='F'; M=-22,-24,-33,-29,-23, 49,-28, 8, -1,-14, 21, -3,-18,-26,-19,-10,-14,-14, 3, 2, 37,-23; /M: SY='D'; M= 2, 10,-21, 17, 15,-25,-14,-17,-21, 17,-12, 1, 3, 4, 1, -6, 5, 2,-15,-29,-12, 10; /M: SY='V'; M= 5,-15,-18,-17,-17, 1,-17,-18, 20,-11, 9, 8,-12,-25, -7, 1, -9, -2, 21,-25, -1,-15; /M: SY='F'; M= -2,-15,-18,-23,-21, 24,-18,-20, 20,-13, 13, -3,-10,-29,-22,-15, -1, 3, 19,-20, 8,-23; /M: SY='I'; M= 2,-14,-20,-22,-16,-11,-16,-15, 16, -9, 1, 2, -3,-14, 11, 1, -3, 5, 12,-25, -8, -8; /M: SY='K'; M= 3, -3,-16, -2, 10,-18,-14,-12,-17, 11,-13, -2, -3, 0, 7, 4, 11, 5,-12,-24,-12, 8; /M: SY='E'; M= 24, 0,-14, 4, 25,-28, -8,-12,-12, 8,-10, 2, -4, -2, 14,-10, 6, -2, -6,-34,-32, 21; /M: SY='W'; M= 3,-15,-26,-11, -1,-10, -3,-25,-16, 4,-16, 1,-20,-11, 8, 13, -5,-15, -8, 22, -7, -1; /M: SY='D'; M= -2, 13,-28, 30, 10,-24,-12,-18,-29, 19,-16, -3, -1, -2, 3, 19, -2,-15,-18,-23, -8, 4; /M: SY='Y'; M=-11,-14,-33,-12, -4, 1,-16,-14, -4, 12, -1, 8,-12, -8, -1, 11, -8,-11, 0, -3, 14, -6; /M: SY='V'; M= 8, -8,-22, -8, -8, -2,-15,-21, 8, 1, -8, -3, -8,-18,-16, -5, 10, 9, 12,-28, -5,-14; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='M'; M= -4, 5, -8, -1, -2, 3, -9,-10, 3, 1, 6, 12, 11,-16,-10,-10, -7, 0, -5,-27, 0, -4; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='D'; M= 10, 10,-16, 17, -1,-18, -5,-12, -8, -2, -4, -4, 4, -4, 0, -9, 5, 8, 0,-27,-12, -2; D=-11; /I: I=-11; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23; /M: SY='F'; M= -7,-12,-16,-22,-20, 38,-16,-16, 0, -6, 8, -8, -2,-16,-12, -9, -1, 0, 6, -4, 11,-18; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='K'; M= 2, 0,-16, 0, 8, -6, -4,-10,-10, 16,-12, 5, 0, 2, -2, 2, 7, -1,-10,-13, -7, 2; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='C'; M= -5, -7, 17, -7, 4,-15, -9, -8,-12, -3,-10,-16, -8, 16, -5, -7, 3, 1,-14,-16,-18, -2; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='V'; M= -2,-15,-18,-25,-26, 21,-22,-22, 22,-16, 18, 2, -8,-27,-19,-20, -5, 9, 23,-25, 10,-23; /M: SY='A'; M= 14, -6,-19, -6, -8, -3, -9,-16, 7, -7, -2, -3, -7,-19,-11,-12, 14, 12, 10,-33,-10,-12; /M: SY='H'; M= -2, 10,-28, 11, 8,-25,-14, 18,-19, 5,-16, 2, 14, -4, 13, 1, -4, -6,-24,-37,-14, 8; /M: SY='R'; M= -1, 1,-16, 15, 15,-29,-18, -8,-30, 8,-16,-11, -9, -4, 31, 32, -6,-17,-21,-13, -8, 19; /M: SY='L'; M=-10,-10, 0,-10,-10, 20,-20,-10, 20,-20, 40, 20,-20,-30,-20,-20,-20, 0, 10,-20, 30,-10; /M: SY='C'; M= 8, 2, 16, 6, 1,-18,-14,-24, -6,-10, 3, 0, -5,-19, -6,-14, -4, -1, -1,-36,-23, -2; /M: SY='S'; M= 16, 0,-22, -2, -5,-14, -5,-14, -6, -2,-13,-10, 2, -8, -4,-15, 30, 25, -1,-38,-22, -8; /M: SY='T'; M= 5, -2,-15,-10,-18,-11,-20,-18, 5,-12, 9, 5, 3, -7, -5,-28, 11, 39, 10,-43, -1,-10; /M: SY='I'; M= 4,-20,-20,-36,-22, -8,-14, -4, 39, -4, 20, 31, 0,-34,-16,-18,-14, 0, 24,-30,-10,-22; /M: SY='E'; M= -4, 8, -3, 21, 23,-21,-18, -8,-14, 1, 8, -4, -9, -9, -1,-14, -7,-11,-13,-20, 0, 17; /M: SY='R'; M= 3, -7,-20, -4, -4,-10, -7,-10,-17, 4,-20,-13, -7,-10, 5, 23, 22, 2,-10,-19,-13, -6; /M: SY='I'; M= -4,-16,-12,-28,-22, 8,-14,-16, 44,-20, 28, 14, -8,-30,-20,-26,-14, 0, 28,-26, 6,-22; /M: SY='V'; M= -1,-11,-10, -8, -2, -7,-22,-14, 0, -4, 4, 2,-13,-15, 0, 5, -5, -1, 6,-20, 3, 0; /M: SY='P'; M=-10,-20,-30,-10, 10,-40,-10, 10,-30, 10,-30,-40,-30,110, 0,-10,-10, 0,-40,-30,-20, 0; /M: SY='I'; M= -1,-16,-19,-26,-26, 20,-22,-22, 24,-16, 17, 1, -7,-27,-19,-20, -5, 9, 24,-25, 9,-24; /M: SY='I'; M= -4,-20,-18,-35,-25, 21,-18,-14, 32,-11, 24, 14, -6,-34,-20,-19,-14, -4, 21,-20, 6,-25; /M: SY='K'; M= 8, 4,-24, -2, 1, -8,-10,-20, -1, 13,-12, 10, 13,-11, -6, -3, 0, 1, -1,-37,-17, -4; /M: SY='E'; M= 2, -2, -2, 4, 46,-33,-18, -3,-26, 19,-14, -5, -8, 8, 29, 1, -2,-14,-28,-12,-16, 42; /M: SY='I'; M= 2,-20,-20,-37,-30, 2,-13,-22, 57,-20, 18, 8, -3,-32,-22,-27,-10, 2, 42,-30, -7,-30; /M: SY='D'; M= 2, 18,-13, 38, 31,-42,-16, -8,-32, 7,-12,-18, -2, 0, 22, -1, -2,-11,-26,-22,-14, 28; /M: SY='K'; M= -5,-11,-33, -8, 1, -3,-15, -5, -9, 16, 0, 13, -9,-11, -6, 2, 0, -2, -7, -8, 11, -5; /M: SY='M'; M= 3,-14,-17,-16, -8, -9,-15, 2, -1, 7, 6, 23, -7,-26, -4, 10, -4, -1, -3,-22, -4, -8; /M: SY='Q'; M= 6, 2,-23, -5, 2,-23, 10,-10,-12, -2,-20,-13, 9, -9, 25, 3, 4, 1,-24,-19,-21, 8; /M: SY='D'; M= 4, 4,-26, 12, 7,-18,-17,-18,-10, 10,-11, -1, -5, -8, 8, 5, -4, -3, -6,-24, -5, 5; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='E'; M= 2, -4, -8, -2, 13,-20, 3,-12, -6, 2, -6, -8, -8, -6, -2,-10, -2,-10, -8, -8,-12, 9; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='E'; M= 1, -2, -5, 0, 10, -7, -9, -6, -5, -1, 0, -5, -7, -9, -4,-10, 10, 3, -7,-18, -5, 4; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='P'; M= -2, 12,-22, 12, -2,-25, 12, -9,-15, 0,-17,-18, 11, 15, -8,-12, -2, -4,-22,-26,-20, -6; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='R'; M= 9, -4,-13, 0, 8,-15, -7, -9,-13, 5,-12, -3, -6, -5, 10, 11, 8, -3, -7,-19,-16, 6; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='H'; M= -5, -9,-29, -9, -2,-23, 8, 26,-14, -5,-16,-11, -8, 20, -6,-10, 2, -5,-23,-20,-13, -6; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='R'; M= -6, -8, -5, -6, -6, 5,-12, -6, 0, -5, 10, 7,-12,-13, 0, 11, -9, -7, 1, -7, 11, -4; D=-10; /I: I=-10; MI=-22; IM=-22; DM=-22; /M: SY='Q'; M= 1, -9,-24,-10, -7,-21, 1,-14,-17, -1,-16, -6, -7, -6, 25, 25, -2, -5,-15,-11,-11, 3; /M: SY='K'; M= 13, -4,-18, -4, 13,-20,-10, -6, -9, 15, -8, 12, -2, -9, 2, -5, 6, 1, -9,-29,-21, 7; /M: SY='Z'; M= 6, -9, -8, -5, 18,-20,-24,-11, -3, 1, -5, -6,-14,-10, 16, -1, -6, -5, -1,-17, -7, 19; /M: SY='F'; M= -7, -6,-11,-19,-19, 23,-15,-16, 22,-14, 20, 7, 6,-32,-20,-21,-12, -1, 11,-27, 7,-19; /M: SY='E'; M= 2, -2,-16, -1, 25,-29, 5,-11,-21, 13,-16, -6, -6, 3, 19, 0, -2,-14,-28, -8,-18, 24; /M: SY='D'; M= 2, 6,-24, 20, -7,-23,-18,-11,-10, 2, -1, 3, -4,-23, -6, 10, -9, -8, 1,-28, -4, -8; /M: SY='L'; M=-10,-10, 0,-10,-10, 20,-20,-10, 20,-20, 40, 20,-20,-30,-20,-20,-20, 0, 10,-20, 30,-10; /M: SY='T'; M= -1, -7,-26,-15,-10, 11,-19,-22, -7, 8, -3, 3, 2, -5, -7,-11, 6, 12, -1,-25, -1, -9; /M: SY='D'; M= -9, 14, 14, 32, 19,-41,-21, 4,-31, -5, -8,-16, -1, -7, -4,-12, -6,-16,-24,-31,-20, 10; /M: SY='T'; M= 1, -8,-19,-18,-22, 10,-22,-20, 3,-12, 10, -1, 1,-13, -9,-24, 8, 28, 10,-33, 4,-16; /M: SY='L'; M= -4,-14, -8,-20,-14, 8,-18, -6, 26,-12, 32, 26,-12,-32,-18,-18,-18, 0, 14,-24, 14,-14; /M: SY='E'; M= 0, 10, 2, 26, 50,-42,-18, -4,-32, 16,-10,-14, -6, 6, 14,-10, 0,-18,-28,-16,-18, 40; /M: SY='K'; M= -4, -6,-22, -4, 8, -4,-14,-16,-14, 22, -8, 16, -8, -2, 2, 19, -6,-12,-12,-16, 0, 4; /M: SY='A'; M= 31, 0,-32, -2, -5,-22, 18,-22, -2, -2,-12, 3, 0,-10, 3,-12, 8, 3, 1,-36,-38, -5; /M: SY='Y'; M= -8,-11,-30, -9,-10, 3, -1,-18, 2, -2, 7, 3,-15,-16,-15, -8,-10, -7, 1, -2, 17,-13; /M: SY='V'; M= 2, -9,-12, -7, 4, -3,-21,-17, 8, 2, 5, 7,-13,-16,-11, -8, -8, -3, 9,-22, 3, 0; /M: SY='L'; M= -8,-16,-10,-22,-16, 28,-22, -8, 14,-10, 32, 20,-14,-34,-20,-14,-18, -4, 8,-16, 22,-16; /M: SY='V'; M= 10,-15,-20,-18,-28, 3,-28,-28, 31,-18, 8, 0,-13,-31,-23,-15, -3, 19, 41,-35, 5,-25; /M: SY='E'; M= -4, 7,-11, 22, 36,-40,-20, 24,-30, 7,-10, -8, -5, 5, 9,-10, -2,-18,-28,-25,-14, 28; /M: SY='K'; M= 14, 0,-30, 0, 13,-14, -6,-20,-13, 26,-16, 16, 0, 3, 4, 3, 4, -3, -9,-31,-21, 6; /M: SY='C'; M=-24,-24, 44,-21,-10, 1,-34,-27, -3,-21, 13,-12,-23,-29,-19,-11,-18,-10, 7, 3, 10,-14; /M: SY='S'; M= 6, -6,-19, -4, 0,-11, -7, -8, -5, -3, -7,-10,-10, 9, -7,-12, 12, 10, -8,-31,-12, -6; /M: SY='H'; M= -4, -8,-23, -5, 12,-19,-16, 21,-21, 9,-16, 2, -8, 1, 7, 13, 5,-11,-19,-23,-10, 8; /M: SY='I'; M= 1,-12,-13,-16,-16, 7,-15,-16, 26,-15, 16, 5,-11,-28,-20,-18, -2, 7, 20,-26, 6,-18; /M: SY='Q'; M= 0, -6,-18, -2, 22,-20,-16,-10,-24, 22,-18, 4, -8, 4, 27, 24, -4,-14,-22,-12,-10, 22; /M: SY='R'; M=-16,-22,-22,-14, -4, -6,-12,-20,-28, 10,-20, -2,-26,-10, 16, 49,-12,-30,-16, 37, 8, 0; /M: SY='W'; M=-34,-35,-28,-23,-12, 7, -9,-25,-26, -7,-10,-15,-46,-21, 4, 29,-21,-35,-15, 97, 40, -8; /M: SY='N'; M= 4, 22,-14, 4, -2,-14, -4, -8, -6, 0,-20, -6, 46,-20, 8, -8, 6, 10,-20,-50,-30, 0; /M: SY='I'; M= -2,-16,-12,-24,-22, 10,-18,-18, 40,-20, 26, 12,-12,-32,-22,-22,-14, 2, 30,-26, 10,-22; /M: SY='L'; M= -4,-15,-24,-14,-14, 10,-16,-12, 17,-14, 23, 9,-16,-24,-12,-15,-12, 0, 16,-12, 21,-14; /M: SY='R'; M= -6,-11,-13, -5, 8, -9,-18,-10,-18, 12, -6, 7,-14, -7, 12, 30, -8,-18,-11,-10, 1, 8; /M: SY='K'; M= 2, -2,-28, -2, 20,-15,-12,-15,-20, 31,-20, 13, -2, 8, 18, 15, -2, -8,-22,-18,-10, 17; /M: SY='Y'; M= -6,-13,-32, -6, -9, 9,-15, -8, -1, -8, 14, -1,-19,-18, -8, -9, -1, 3, 6, -3, 27,-12; /M: SY='R'; M= -3, -9,-18, -8, -6, -6,-18,-14,-11, 5, -3, 8, -9, -8, 7, 20, -3, -1, -3,-20, 2, -2; /M: SY='Y'; M=-33,-25,-46,-10,-18, 28,-28, -2, -3,-12, 32, -3,-35,-22,-12, -5,-20, -8, 10, 34, 76,-18; /M: SY='T'; M= 13, -4,-24,-12,-11,-14,-12,-20, 9, -2, -2, 8, 4, -7, -2,-19, 9, 21, 11,-41,-17, -8; /M: SY='R'; M= -8,-16,-22, -8, -4,-10,-18,-12,-28, 16,-20, 4,-16, -6, 24, 66, -8,-26,-12, -4, -2, 2; /M: SY='K'; M= 6, -3,-20, 0, 19,-18,-12,-14,-20, 23,-16, 9, -5, 3, 11, 13, 0,-11,-15,-21,-16, 15; /M: SY='I'; M= 4,-20,-20,-34,-25, -2,-16,-13, 45,-11, 18, 19, -4,-34,-20,-19,-12, 2, 33,-30, -6,-25; /M: SY='E'; M= 0, 0, -5, 6, 45,-29,-16, -7,-26, 27,-14, 1, -6, 10, 13, -3, 0,-16,-26,-14,-16, 35; /M: SY='E'; M= 10, 0,-13, 2, 23,-25,-14,-13,-16, 15,-10, 3, -2, 4, 9, -9, 6, 2,-12,-28,-20, 19; /M: SY='I'; M= -4,-16,-12,-28,-22, 8,-14,-16, 44,-20, 28, 14, -8,-30,-20,-26,-14, 0, 28,-26, 6,-22; /M: SY='E'; M= 0, 16, 2, 10, 31,-28,-12, -4,-18, 12,-14, -6, 27, -6, 8,-14, 0, -8,-26,-35,-28, 25; /M: SY='R'; M= -2, -8,-22, -8, 1,-11, -1,-13,-13, 6, -8, 3,-10, -7, 15, 18, -8,-12,-16, -9, -3, 5; /M: SY='D'; M= 12, 10,-26, 16, 2,-23, -9,-18,-14, 6,-11, -3, 4, -4, -2,-10, 13, 12, -6,-39,-18, -2; /M: SY='L'; M= -6,-18,-15,-29,-21, 24,-20,-10, 23,-10, 27, 18, -9,-34,-20,-16,-16, -4, 15,-18, 13,-21; /M: SY='M'; M= -4, -8,-13, -6, -3, 2,-14,-12, -3, 0, 5, 7,-12,-15, -5, 7, -1, -3, -3,-18, 6, -5; /M: SY='K'; M= -6, 1,-22, -4, 4, -7, -2,-21,-15, 13,-20, -1, 7,-10, -6, -2, 3, -6,-20, 3, -9, -2; /M: SY='F'; M=-11,-26,-26,-45,-33, 61,-24,-20, 13, -7, 20, -1, -6,-38,-25,-12,-12,-13, 14, -4, 16,-33; /M: SY='C'; M=-13,-18, 63,-26, -9, -6,-28,-32, 15,-24, 15, -2,-12,-32,-22,-20,-16, -7, 10,-24,-18,-13; /M: SY='Q'; M= 6, 0,-24, 7, 9,-21,-18,-14,-11, 5,-12, -4, -6, -7, 25, 11, -6, -2,-10,-21, -6, 13; /M: SY='I'; M= 6, -6,-18,-17,-25, 3,-19,-23, 35,-15, 5, 2, 7,-36,-23,-16, -8, 8, 32,-39, -6,-25; /M: SY='D'; M= 2, 16,-11, 35, 34,-42,-16, -7,-32, 9,-12,-17, -3, 1, 22, -2, -2,-12,-26,-21,-14, 30; /M: SY='F'; M= -4,-18,-14,-22,-24, 32,-26,-22, 24,-18, 24, 4,-18,-36,-26,-14,-14, 0, 26,-18, 22,-24; /M: SY='Q'; M= 2,-13,-24,-17, 6, 3,-21,-10,-15, 4,-11, -7, -8, -7, 42, 18, -8, -6,-19, -7, -1, 17; /M: SY='V'; M= 2,-11,-12,-14,-19, 7,-24,-19, 23,-18, 20, 8,-13,-27,-19,-19, -7, 15, 24,-30, 14,-17; /M: SY='H'; M= -7, 6,-23, 5, -8,-14,-15, 20, 4,-13, 5, 5, 9,-17,-12,-18, -8, -5, -4,-41, -4,-10; /M: SY='Q'; M= 4,-12,-16,-17, 2,-13,-18, -7, 6, -9, 1, 1,-10,-13, 37, 6,-12, 0, -6,-17, -2, 14; /M: SY='W'; M=-29,-31,-24,-31,-14, 23,-13, 2,-10,-18, 4, -6,-34,-24,-14, -9,-19,-26,-13, 59, 31,-14; /M: SY='R'; M= 12, 2,-26, 14, -2,-22,-10,-16,-20, 4,-14, -2, -6,-10, 14, 27, 0,-10, -4,-27,-18, 0; /M: SY='D'; M= 0, 46,-22, 57, 2,-34, -6,-16,-24, 0,-14,-18, 39,-18,-10,-14, 0, -2,-20,-52,-22, -4; /M: SY='I'; M= 6,-16,-20,-23, -9,-10,-19,-14, 22,-12, 1, -1, -9,-20, 19, -1,-10, 2, 13,-22, -5, -1; /M: SY='H'; M= -9, -9,-22, -9, 3, -2,-19, 21, -4, 2, 7, 20,-11, -6, -8, -7,-11, -8,-10,-27, 9, -1; /M: SY='H'; M= -2, 2,-25, 10, 22,-31,-19, 25,-25, 8,-14, 0, -5, 5, 19, 2, -4,-12,-26,-26,-10, 20; /M: SY='Y'; M=-10,-14,-20,-14,-14, 12,-16,-10, 16,-14, 22, 4,-16,-24,-16,-16, -6, 2, 12,-10, 24,-16; /M: SY='M'; M= 3,-16,-22,-20, -4,-16,-18, 5, -5, 22, 3, 38, -5,-23, 1, 20,-14, -9, -6,-21, -8, -4; /M: SY='A'; M= 19, -8,-28, -4, 0,-22, -6,-12,-12, 4,-16, -2,-10, 15, 12, 9, 2, 0, -4,-36,-28, 0; /M: SY='D'; M= 4, 11,-26, 20, 9,-19, -6,-16,-20, 14,-18, -8, 2, -3, -6, -3, 16, 2,-16,-29,-14, -1; /M: SY='M'; M= 8,-15,-20,-27,-16,-16,-18, 3, 18, 5, 15, 36, 2,-29,-10,-13, -9, 11, 10,-35,-10,-14; /M: SY='S'; M= 6, 0,-18, 0, 8,-20, 12,-12,-14, 2,-18,-18, -2, -6, -6,-12, 24, 4,-18,-18,-22, 0; /M: SY='A'; M= 13, -9,-11, -7, 13,-20,-18, -7, 0, 7, 1, 11, -8,-16, 0, -8, -4, -3, 3,-27,-15, 9; /M: SY='M'; M= 10,-16,-22,-21,-12,-14,-14, -3, 9, 5, 5, 26, -5,-25, 1, 10, -9, -5, 8,-27,-14,-10; /M: SY='D'; M= -2, 12,-12, 15, -4, -5,-11,-12, -1, -9, 8, -1, 6,-22,-14,-16, 0, 4, -5,-34, 0, -8; /M: SY='T'; M= 6, 15,-20, 15,-13,-19,-16,-20, -1, -8, -4, -7, 18,-17,-11,-19, 5, 20, 5,-48,-12,-12; /M: SY='K'; M= 0, 4,-22, 0, 3,-10, -8,-14,-16, 17,-20, 3, 12, -7, 3, 16, 6, -4,-16,-28,-16, -1; /M: SY='Y'; M= -7,-14,-21,-12,-19, 12,-24,-15, 14,-16, 23, 5,-18,-24,-16,-16, -9, 11, 19,-14, 30,-17; /M: SY='D'; M= 4, 5,-23, 12, 8, -3,-14,-19,-18, 9, -6, -6, -1, -9, -3, -6, 0,-10,-10,-23, -9, 2; /M: SY='Q'; M= 13, -7,-18, -7, 17,-24,-14, -3,-11, 15, -7, 15, -4, -8, 20, 4, -5, -4,-13,-24,-18, 17; /M: SY='N'; M= 4, 11,-20, 10,-11,-13,-10,-18, 7, -7, -5, -9, 15,-23,-16,-15, 6, 7, 6,-40,-15,-15; /M: SY='I'; M= -3,-16,-11,-25,-18, 5,-16, -9, 34,-13, 29, 22, -9,-32,-18,-21,-16, 0, 20,-26, 7,-18; /M: SY='D'; M= 0, 18,-19, 19, -5,-16, 7,-16, -9, -6, -5,-10, 15,-18,-14,-16, 4, 0,-13,-32,-13, -9; /M: SY='R'; M= 9, -6,-24, -4, 5,-15,-10,-12,-16, 11,-18, 0, -6, -4, 20, 21, 6, -3,-11,-22,-16, 7; /M: SY='C'; M= -5, -1, 12, 6, 3,-23,-20,-23,-12, -1, -9,-13, -9, 3,-13, -8, -8, -6, -7,-28,-17, -5; /M: SY='I'; M= 0,-14,-16,-26,-20, 2,-10,-16, 38,-16, 16, 6, -4,-26,-18,-24, -2, 4, 24,-28, -4,-22; /M: SY='D'; M= 2, 16,-30, 29, 8,-33, 6,-18,-25, 6,-16,-14, 1, -4, 10, 1, -2,-10,-24,-19,-14, 7; /M: SY='Q'; M= -5, -5, 13,-15, -4,-16,-17,-16, -2, -7, -9, -4, 8,-19, 15, 10,-10, -7, -8,-26,-22, 1; /M: SY='V'; M= -2,-14,-10,-13, -3, -4,-21,-14, 11, -6, 8, 4,-15,-20, -4, 2,-10, -8, 12,-18, 3, -3; /M: SY='G'; M= 6, -9,-29,-19,-18, 8, 10,-22, 5, -8, -3, -9, -2,-19,-14,-16, 7, -3, 2,-17,-14,-20; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 12 in 12 different sequences |
| Number of true positive hits | 12 in 12 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | RPW8 |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
12 sequences
ADR1_ARATH (Q9FW44), DAR5_ARATH (Q84WJ0), DRL29_ARATH (Q9SZA7), DRL30_ARATH (Q9LZ25), DRL42_ARATH (Q9FKZ1), DRL43_ARATH (Q9FKZ0), HR1_ARATH (Q9SCS9), HR2_ARATH (Q9SCS8), HR3_ARATH (Q9SCS7), HR4_ARATH (Q9SCS6), RPW81_ARATH (Q9C5Z7), RPW82_ARATH (Q9C5Z6)» more
|
| PDB [Detailed view] |
5 PDB
7L7V; 7L7W; 8YL6; 8ZW9; 8ZWA |