 |
|
| Entry: PS51163 |
General information about the entry
| Entry name [info] | YRDC |
| Accession [info] | PS51163 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] | 01-NOV-2005 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 28-MAR-2018 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00883 |
| Associated ProRule [info] | PRU00518 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | YrdC-like domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=186; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=181; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.3022302; R2=0.0090932; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7595.2270508; R2=23.2954540; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=902; H_SCORE=28608; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=682; H_SCORE=23483; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-6; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='A'; M= 4, -2,-20, 2, 4,-19, -9,-10,-12, 3,-10, -6, -5, 2, 3, -2, 1, -1,-10,-25,-13, 2; /M: SY='D'; M= 2, 2,-18, 6, 5,-18,-10,-10,-15, 2,-10, -6, -2, -8, 5, 3, 0, -6,-12,-21,-12, 3; /M: SY='A'; M= 8, 1,-19, 2, 2,-15, -7,-13, -4, -1, -4, -2, -1,-10, 0,-10, 2, 2, -4,-29,-14, 0; /M: SY='I'; M= 0,-14,-15,-21,-18, 10,-16,-17, 25,-14, 19, 8,-11,-27,-16,-17, -9, 1, 20,-23, 6,-18; /M: SY='E'; M= 5, -1,-19, 2, 13,-20,-12, -5,-15, 8,-12, -1, -2, 0, 11, 2, 0, -5,-14,-26,-15, 11; /M: SY='Q'; M= 5, -3,-15, 1, 13,-22,-13, -9,-15, 7, -9, 0, -7, -1, 17, 6, -3, -5,-14,-22,-13, 14; /M: SY='A'; M= 19, -7,-20,-11,-11, -7, -8,-21, 15, -9, 3, 7, -5,-19, -5,-15, 1, 7, 17,-37,-18,-11; /M: SY='V'; M= 12,-12,-20,-14,-13, 1,-15,-21, 12, -7, 2, 3, -9,-21, -7, -8, -2, 4, 18,-28, -8,-13; /M: SY='E'; M= 6, 3,-18, 9, 15,-23,-12, -8,-18, 8,-12, -4, -1, -4, 12, 3, 3, -4,-15,-25,-16, 13; /M: SY='I'; M= 5,-11,-19,-13,-10, -2,-14,-13, 13, -8, 9, 8, -9,-20, -6,-11, -6, 1, 12,-25, -3,-10; /M: SY='I'; M= -5,-14, -8,-20,-17, 13,-18,-14, 31,-18, 31, 16,-14,-31,-20,-21,-16, 1, 21,-24, 16,-17; /M: SY='R'; M= 1, -1,-21, 2, 9,-16,-13,-10,-18, 14,-14, 5, -2, -4, 10, 16, -2,-10,-14,-21,-10, 8; /M: SY='Q'; M= 8, 4,-19, 6, 8,-23, -5,-12,-16, 6,-15, -4, 4, -6, 12, 3, 3, -3,-16,-27,-20, 8; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='G'; M= 0, 3,-35, -4,-15,-30, 67,-28,-12, -8,-18,-19, 2,-10,-17,-19, 0,-18,-28, 3,-29,-16; /M: SY='G'; M= 4, -1,-29, -4, 2,-22, 22,-16,-14, 6,-16, -5, -1, -5, 1, -6, 1,-10,-22,-10,-20, 1; /M: SY='I'; M= 2,-17,-15,-24,-22, 4,-18,-18, 36,-17, 18, 8,-11,-26,-20,-20,-11, 4, 29,-29, 4,-22; /M: SY='I'; M= 6,-16,-18,-23,-24, 3,-15,-23, 37,-17, 13, 6,-11,-31,-21,-18, -9, 4, 34,-28, -1,-24; /M: SY='V'; M= 20, -9,-25,-13,-14, -8, -5,-22, 20,-10, 2, 6, -5,-21, -8,-15, 1, 6, 21,-36,-19,-14; /M: SY='F'; M= -8,-21,-20,-27,-25, 25,-23,-19, 24,-16, 21, 2,-15,-32,-21,-15,-13, -3, 25,-10, 20,-25; /M: SY='P'; M= -7,-15,-30, -8, 11,-33, -8, 2,-27, 15,-27,-26,-22, 82, 0, -6, -7, -2,-35,-27,-18, 2; /M: SY='T'; M= 7, 1,-23, -8,-19,-20, -1,-21, -3,-10, -4, -5, 8, -4, -5,-26, 15, 32, 1,-37,-13,-12; /M: SY='D'; M= 1, 21,-15, 41, 17,-34,-14,-13,-21, 3, -3,-13, 0, -8, -3,-12, -2, -9,-13,-29,-10, 10; /M: SY='T'; M= 9, -2,-24,-10,-19,-19, 1,-22, 1,-10, -5, -5, 5, -6, -7,-25, 14, 30, 4,-35,-14,-14; /M: SY='I'; M= 4,-10,-22,-15,-22, -3, 7,-26, 16,-14, 2, -5,-10,-26,-21,-14, -5, 0, 13,-17, -4,-22; /M: SY='Y'; M=-32,-29,-50,-18,-21, 35,-27, -6, -8, -9, 22,-14,-33,-14,-13, -3,-16,-10, 6, 35, 67,-22; /M: SY='G'; M= 6, -4,-37, -9,-11,-24, 32, 1, -6, -9,-14, -5, -1, -8, -8,-15, 1, -9,-15,-18,-24,-11; /M: SY='L'; M= -7,-13, -7,-18,-16, 19,-19,-14, 27,-19, 33, 15,-16,-31,-20,-20,-17, -1, 17,-20, 21,-16; /M: SY='A'; M= 12, -8,-23,-13,-14,-10, 12,-21, 8, -8, -2, 2, -5,-20,-12,-14, -1, -1, 5,-23,-19,-15; /M: SY='C'; M= 2,-10, 50,-15, -2,-21,-13,-33, -5,-15, -4, -7, -5,-20,-10,-16, -2, -1, -2,-30,-38, -6; /M: SY='D'; M= 0, 18,-23, 29, 0,-22,-10, -7,-17, -2, -7,-11, 10,-13, -3, -5, 1, -2,-13,-35, -9, -3; /M: SY='A'; M= 13, -6,-15, -7, -3,-18, -4,-15, 0, -4, -5, -1, -6, 0, -3,-14, 2, 5, 0,-35,-23, -6; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='Y'; M= -4, -5,-19, -5, -7, -1, -9,-10, -7, -1, 0, -1, -3,-11, -2, 0, -2, -1, -5,-14, 2, -6; D=-10; /I: I=-10; MD=-21; /M: SY='N'; M= 1, 20,-10, 14, -1,-14, -5, -9, -8, 0,-12, -7, 29,-15, -4,-10, 4, 4,-13,-39,-21, -3; D=-10; /I: I=-10; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21; /M: SY='P'; M= -1, -1,-17, 4, 12,-21, -9, -3,-17, 9,-14, -9, -4, 18, 4, -2, -1, -5,-18,-22,-13, 8; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='E'; M= 6, 4,-17, 10, 13,-22,-10, -7,-17, 7,-11, -4, -1, -2, 8, 1, 2, -6,-13,-26,-16, 10; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='A'; M= 25, -2,-25, -4, -4,-15, 3,-19, -1, -3, -9, 2, -1,-11, 3,-10, 9, 8, 4,-36,-29, -4; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='I'; M= 5,-16,-11,-20,-20, 3,-20,-22, 31,-16, 12, 5,-12,-31,-20,-15, -8, 5, 31,-28, 1,-21; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='E'; M= 5, 2,-15, 7, 20,-25,-11, -9,-19, 10,-12, -4, -3, 0, 16, 4, -1, -8,-18,-21,-16, 18; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='R'; M= -2, -7,-19, -3, 2,-14,-15,-10,-20, 12,-15, 4, -6, -6, 17, 34, -5,-14,-13,-16, -8, 5; /M: SY='I'; M= -3,-15,-11,-23,-20, 9,-16,-17, 38,-19, 27, 14,-11,-30,-20,-22,-14, 1, 26,-26, 9,-20; /M: SY='Y'; M=-20,-24,-30,-19,-19, 28,-24,-15,-11, -5, 8, -8,-23,-22, -3, 19,-13,-18, 3, 17, 33,-17; /M: SY='Q'; M= 5, -2,-16, 2, 12,-20,-13, -8,-16, 8,-11, -1, -4, -4, 14, 8, 1, -6,-12,-24,-14, 11; /M: SY='I'; M= 1,-15,-19,-20,-16, 3,-14,-14, 17,-10, 11, 8,-10,-23, -7, -4, -8, -3, 15,-21, 0,-14; /M: SY='K'; M= -1, -2,-28, -1, 16, -9,-11,-19,-19, 35,-18, 18, -2, 7, 2, 15, -1,-10,-18,-19, -8, 8; /M: SY='G'; M= 2, 2,-26, -1, 0,-21, 12,-13,-15, 5,-16, -3, 5, -8, 7, 6, -2,-10,-20,-17,-19, 1; /I: I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: SY='R'; M=-10,-18,-20,-10,-10, -6,-20,-10,-23, 6,-13, 0,-19,-11, 22, 62,-11,-25, -7, -3, 3, -2; /M: SY='P'; M= 0, 0,-25, 10, 11,-34, -6, -3,-25, 6,-20,-24,-10, 39, 3, -7, 0, -2,-26,-29,-18, 4; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='K'; M= 0, -5,-16, -2, 3,-10,-10, -8,-10, 5, -8, -6, -6, 5, 3, 4, 0, -3, -9,-18, -8, 1; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='D'; M= 3, 12,-24, 13, 1,-21, -3, -7,-14, 2,-12, -7, 12, -7, -3,-11, 5, 2,-14,-34,-17, -2; /M: SY='K'; M= -3, 2,-30, 0, 10,-14,-11, 2,-18, 21,-17, 12, 6, 2, 2, 6, -2, -8,-20,-27,-10, 5; /M: SY='P'; M= -5,-14,-28, -8, 8,-34, -9, 9,-24, 7,-25,-28,-19, 76, 2, -8, -6, 0,-32,-32,-20, 1; /M: SY='F'; M=-11,-16,-14,-23,-20, 36,-20,-14, 16,-15, 28, 6,-13,-31,-22,-17,-15, -5, 11,-13, 23,-20; /M: SY='I'; M= 14, -8,-24,-14,-12,-12, -3,-17, 15, -8, -1, 1, -1,-10, -5,-17, 4, 9, 11,-35,-20,-12; /M: SY='I'; M= 0,-16, -9,-21,-19, 9,-21,-19, 29,-17, 20, 8,-13,-31,-19,-16,-12, 3, 25,-25, 8,-19; /M: SY='M'; M= -5,-17, -8,-24,-11, -2,-21, 14, 9, -7, 16, 23, -8,-27,-14,-12,-15, -5, 2,-25, 0,-12; /M: SY='C'; M= -2,-15, 15,-21,-16, -2,-13,-27, 15,-17, 7, -2,-10,-29,-20,-16, -9, -2, 13,-22,-12,-18; /M: SY='S'; M= 4, -5,-24, -2, -1,-18, -3, -6,-15, 2,-15, -6, -6, 2, 3, 4, 6, -2,-12,-24,-16, -3; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='D'; M= 0, 20,-21, 31, 3,-25, -4,-16,-21, -1,-13,-19, 9,-12, -7,-10, 9, 1,-16,-26,-13, -4; D=-13; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='I'; M= 0,-12,-17,-15,-12, 5,-17,-13, 12, -9, 11, 4,-11,-15,-12,-12, -8, 1, 9,-24, 3,-13; /M: SY='E'; M= 3, 3,-15, 11, 16,-19,-13,-10,-17, 5, -8, -9, -3, -7, 6, -4, 5, -4,-14,-21,-11, 11; /M: SY='Q'; M= 6, 2,-21, 8, 11,-24,-13, -2,-15, 3, -8, -4, -4, -7, 13, -3, 0, -2,-14,-23,-12, 11; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='I'; M= 6,-13,-14,-18,-15, 2,-14,-17, 24,-12, 13, 10,-10,-25,-12,-12, -8, 1, 21,-25, -1,-15; D=-7; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='E'; M= 1, -5,-17, -2, 5,-12, -5,-11,-12, 4, -8, -1, -7, -7, 3, 3, -1, -8,-10,-10, -8, 3; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='E'; M= 2, 1,-15, 5, 13,-21,-11, -6,-17, 7,-11, -4, -1, -1, 8, 1, 0, -6,-15,-21,-14, 10; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='Y'; M=-17,-22,-21,-22,-21, 24,-23,-13, 12,-16, 22, -1,-21,-28,-18,-13,-15, -6, 15, 5, 32,-21; /M: SY='A'; M= 14, -5, -4, -9, -7,-13, -9,-21, 3, -8, -4, -1, -3,-14, -6,-14, 4, 8, 7,-36,-23, -8; /M: SY='E'; M= 0, -5,-20, 0, 9,-18,-15, 1,-13, 3, -7, -2, -8, -4, 8, 1, -1, -6,-11,-20, -7, 8; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='I'; M= 0, -4,-15, -5, -7, -7, -8,-11, 3, -4, -2, -4, -2, -6, -8, -7, -4, 0, 2,-21, -5, -8; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='P'; M= 3, 0,-24, 3, -4,-20, -6,-14, -5, -2, -8,-10, -4, 4, -5,-10, -1, 2, -5,-28,-12, -6; /M: SY='N'; M= 2, 5,-22, 4, 3,-18, -6, -6,-13, 4,-13, -8, 9, 1, -2, -8, 4, 1,-15,-32,-17, -1; /M: SY='E'; M= 1, -3,-15, 2, 7,-18,-14, -8, -8, 0, -3, -5, -7, -1, 3, -5, -3, -3, -8,-24, -7, 5; /M: SY='A'; M= 7,-10,-19,-11, -5, -2,-11,-17, 4, -6, 3, 1,-10,-15, -3,-11, -3, -1, 5,-18, -6, -6; /M: SY='E'; M= -4, -7,-17, -4, 7, -6,-19, -6,-12, 2, -2, -4, -9, -8, 3, -1, -5, -9, -8,-11, 1, 5; /M: SY='R'; M= 2, -8,-19, -4, 7,-14,-12,-14,-16, 11,-12, 2, -9, -4, 10, 15, -3,-12,-11,-13,-11, 6; /M: SY='L'; M= -4,-12, -9,-13, -5, 7,-17,-13, 9, -8, 17, 11,-14,-21, -8,-10,-12, -4, 4,-15, 10, -5; /M: SY='I'; M= 9,-10,-16,-14,-12, 0,-13,-13, 16, -9, 14, 14, -9,-24,-11,-15, -6, 5, 14,-30, -2,-12; /M: SY='E'; M= 2, 0,-15, 1, 9,-13,-14, -9, -9, 6, -1, 6, -2, -7, 2, -5, -2, -1, -9,-26, -6, 7; /M: SY='Q'; M= 5, -4,-17, -2, 5,-17,-11,-10,-12, 6, -9, 2, -4, -7, 8, 6, 0, -4, -8,-24,-14, 4; /M: SY='F'; M= -9,-11,-21,-15,-17, 26,-18,-10, -2,-10, 9, -9, -6,-25,-18,-12, -2, -5, 1,-13, 11,-19; /M: SY='W'; M=-22,-27,-20,-24, -9, 6, -6,-26,-13,-10, -5,-13,-34,-14, -8, -6,-13,-17,-13, 68, 23,-10; /M: SY='P'; M= -5,-12,-25, -3, 11,-36, -9, 4,-26, 9,-24,-29,-21, 74, 2, -7, -7, -3,-32,-28,-19, 3; /M: SY='G'; M= 2, -3,-31, -8,-13,-22, 44,-21, -9, -6,-13, -9, -4,-11, -9, -6, -1,-15,-19, -3,-21,-12; /M: SY='P'; M= -3,-15,-30, -7, 7,-35, -6, 3,-23, 8,-25,-30,-23, 82, 0,-10, -6, 1,-31,-31,-21, -1; /M: SY='L'; M= -9,-17,-16,-20,-19, 16,-19,-14, 28,-17, 29, 11,-16,-29,-19,-19,-15, 0, 21,-15, 23,-19; /M: SY='T'; M= 9, -4,-20,-11,-19,-12,-16,-21, 7,-11, 0, -1, 2,-11, -8,-22, 12, 33, 14,-40, -7,-14; /M: SY='I'; M= -8,-18,-12,-26,-22, 26,-20,-18, 27,-17, 26, 7,-13,-32,-22,-19,-14, -3, 20,-17, 16,-22; /M: SY='I'; M= 2,-17,-16,-25,-24, 6,-17,-20, 41,-18, 20, 10,-11,-33,-22,-19,-12, 3, 34,-27, 5,-24; /M: SY='L'; M= -1, -9, -8,-10, -8, 6,-17,-16, 9,-10, 15, 7,-12,-22,-11,-10, -9, 0, 8,-22, 7, -9; /M: SY='P'; M= -3, -5,-23, 0, 11,-23,-12, -5,-21, 14,-18,-11, -9, 31, 5, 4, -3, -5,-22,-24,-13, 6; /I: I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8; /M: SY='A'; M= 6, -3,-16, -1, 0,-13, -9,-14, -9, 4, -8, 2, -4, -3, 5, 5, 2, 1, -4,-24,-12, 0; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='K'; M= 2, 2,-17, 1, 0,-11, -5,-10, -8, 3, -8, -1, 3, -8, -2, -2, 3, -1, -8,-25,-11, -2; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='D'; M= 1, 3,-20, 8, 8,-22, -2, -7,-16, 5,-11, -9, -3, 7, 1, -5, 0, -5,-16,-21,-13, 4; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: M= 0, -5,-16, -5, -2,-12, -9, -8, -4, -1, -5, -3, -5, -3, -3, -5, -2, -1, -5,-22, -8, -3; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='I'; M= -1,-13, -9,-16,-11, 0,-14,-13, 15,-11, 11, 3,-12,-13,-13,-12, -8, 1, 11,-23, 1,-13; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='P'; M= 2, -5,-20, -2, 1,-21, -9, -5,-13, 2,-14,-14, -7, 24, -3, -7, 3, 5,-14,-30,-16, -4; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='P'; M= 0, 0,-18, 5, 6,-20, -8, -9,-16, 5,-12,-10, -5, 10, 2, 1, 0, -4,-16,-21,-12, 2; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='I'; M= 0, -6,-16, -7, -6, -3, -7,-14, 2, -5, 2, -1, -5,-15, -8, -9, -2, -1, 1,-16, -2, -8; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='I'; M= 3,-11,-17,-15,-16, 2,-15,-16, 21,-11, 11, 6, -8,-23,-13,-11, -7, 2, 18,-25, 1,-16; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='T'; M= 7, -2,-22, -6, -8,-12, -9, -3, -3, -5, -5, 0, 3, -8, -3,-11, 7, 11, -1,-35,-13, -7; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='P'; M= 4, -6,-25, -5, 1,-24, 2, -8,-13, 3,-16,-14, -8, 29, 1, -9, 1, 3,-18,-27,-19, -2; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='G'; M= 1, 5,-28, 1, -7,-20, 26,-18,-12, 1,-16, -9, 7, -9, -8, -7, 3, -7,-19,-14,-20, -9; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: M= -1, -4,-14, -6, -5, -8, -5,-14, -4, -2, -3, -1, -3,-10, 0, 0, -1, -1, -6,-19, -6, -5; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='D'; M= 0, 8,-25, 10, 2,-21, 7,-14,-17, 6,-15, -9, 5, 0, -2, -3, 1, -7,-19,-21,-17, -1; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='T'; M= 4, -3,-20, -9, -9,-11,-15,-14, -6, -2, -6, -2, 4, -5, 0,-11, 11, 20, -2,-32, -9, -6; /M: SY='I'; M= 2,-18,-14,-25,-21, 5,-20,-20, 35,-16, 16, 7,-11,-31,-18,-17,-11, 3, 31,-26, 3,-21; /M: SY='G'; M= 11, 0,-35, -6,-13,-23, 47,-25, -7, -6,-15,-10, 0,-11,-11,-16, 4, -9,-16,-10,-29,-13; /M: SY='I'; M= -2,-19,-16,-28,-26, 16,-21,-21, 34,-17, 19, 5,-12,-34,-23,-18,-12, 0, 31,-21, 9,-26; /M: SY='R'; M= -5,-19,-21,-15,-11, -7,-17, -5,-17, 8, -9, 9,-15,-17, 16, 51,-11,-22, -6, -8, -2, -5; /M: SY='I'; M= -3,-17, 0,-25,-18, 4,-21,-15, 29,-16, 21, 13,-11,-32,-20,-17,-15, 0, 22,-25, 2,-19; /M: SY='P'; M= -5,-15,-28, -8, 7,-34, -9, 5,-24, 8,-27,-33,-21, 85, -1,-11, -5, 3,-32,-33,-21, -2; /M: SY='D'; M= -2, 11,-29, 21, -1,-16, -6,-13,-17, -1, -6,-12, 4,-12, -4, -6, 1, -3,-10,-22, -2, -5; /M: SY='H'; M= -3, 3,-16, -1, -3,-21, -9, 19,-12, -8,-10, -2, 9, -9, -6,-14, 3, 0,-16,-37,-17, -5; /M: SY='P'; M= -1,-11,-26, -7, 6,-25, -7, -4,-20, 7,-19,-19,-16, 47, 5, -2, -4, -2,-23,-25,-16, 2; /M: SY='I'; M= -4,-17,-18,-25,-22, 16,-20,-17, 27,-16, 20, 6,-12,-29,-18,-17,-12, 0, 22,-17, 12,-21; /M: SY='H'; M= 3,-12,-13,-15, -7,-13,-17, 14, 1,-11, 0, 7, -7, -9, -4,-13, -3, 2, 0,-37,-13, -7; /M: SY='R'; M= -5,-11,-21, -8, -2, -9,-20, 12,-10, -3, -1, 6,-11,-11, 12, 15, -9,-10, -9,-20, 3, 2; /M: SY='E'; M= 7, -1,-15, 3, 9,-14,-13, -7, -7, 3, 0, 6, -5,-10, 3, -5, -3, -4, -6,-28, -9, 7; /M: SY='L'; M= -6,-14, -8,-19,-17, 16,-18,-13, 29,-18, 32, 17,-14,-31,-20,-21,-17, 0, 18,-22, 18,-17; /M: SY='I'; M= -2,-13,-11,-19,-15, 11,-13,-14, 20,-15, 20, 10,-12,-28,-17,-18,-11, -1, 14,-20, 7,-16; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='Q'; M= 5, 0,-18, 6, 13,-21,-11,-10,-19, 11,-14, -1, -4, -3, 15, 13, 1, -8,-15,-20,-15, 12; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='Q'; M= 1, -7,-20, -5, 6,-13,-12, -5,-10, 2, -3, 1, -9, -7, 9, 1, -4, -6, -9,-16, -4, 6; /M: SY='L'; M= 0,-11, -6,-15,-10, 3,-19,-14, 9,-11, 12, 4, -9,-22,-11,-15, -4, 6, 8,-25, 1,-10; /I: I=-7; MD=-14; /M: SY='G'; M= 0, 7,-32, 4, -8,-27, 42,-22,-14, -3,-18,-17, 4, -6,-11,-13, 0,-13,-25, -6,-23,-10; D=-7; /I: I=-7; MD=-14; /M: SY='A'; M= 4, -4,-16, -5, 0, -8, -2,-11, -4, 1, -5, -2, -2, -8, -1, -3, 0, -3, -4,-16,-10, -1; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='P'; M= -3,-17,-27,-10, 5,-29,-11, 4,-19, 6,-19,-24,-23, 72, -2,-10, -8, 1,-26,-31,-17, -3; /M: SY='I'; M= -4,-14,-10,-21,-18, 11,-18,-14, 33,-19, 30, 15,-13,-31,-20,-21,-15, 1, 23,-24, 15,-18; /M: SY='V'; M= 11,-13,-25,-16,-18, 5,-17,-20, 21,-12, 10, 6,-11,-26,-13,-14, -4, 7, 25,-28, 0,-18; /M: SY='A'; M= 12, -6,-13,-11, -9,-13, -3,-18, 1, -5, -3, 3, -1,-16, -6,-14, 6, 9, 2,-29,-20, -9; /M: SY='T'; M= 6, -4,-21, -8, -9,-22,-11,-13, -8, -4,-10,-11, -1, 18, -3,-21, 16, 30, -5,-40,-15, -8; /M: SY='S'; M= 10, 0,-20, -1, 0,-11, -2,-11,-10, 0,-18,-18, 1, -9, -9,-11, 38, 22, -9,-31,-19, -9; /M: SY='A'; M= 29, -3,-27, -4, -5,-13, 0,-20, 5, -4, -4, 8, -3,-15, 2,-12, 5, 7, 11,-41,-28, -5; /M: SY='N'; M= -1, 31,-13, 5, -9,-10, -1, -9, 1, 1,-17, 1, 65,-24, -9,-17, -1, 7,-17,-61,-34,-10; /M: SY='I'; M= -5,-15,-15,-17,-12, 6,-17,-14, 12, -9, 12, 3,-15,-11,-11, -7,-11, -3, 8,-20, 7,-13; /M: SY='S'; M= 5, -3,-23, -3, -1,-11, -2, -9,-12, 0,-16,-20, -4, 5, -8,-12, 23, 12,-13,-27,-16, -9; /M: SY='G'; M= 0, 6,-32, 4, -9,-28, 46,-24,-13, -5,-15,-16, 2, -8,-13,-16, 1,-12,-25, -6,-23,-11; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='E'; M= 0, -2,-14, 3, 20,-22,-16, -1,-21, 9,-12, -3, -5, -2, 19, 8, -2,-10,-20,-19,-11, 19; /M: SY='P'; M= -4,-10,-25, -5, 5,-28, -5, -4,-17, 5,-18,-22,-16, 48, -2, -9, -5, -3,-22,-23,-16, -1; /M: SY='T'; M= 3, -8,-21, -8, -4,-12,-10,-11, -1, -3, -7,-11, -8, 5, -5,-12, 6, 8, -3,-26,-10, -7; /M: SY='P'; M= 0,-13,-16,-15, -7,-10,-13, -9, 4, -5, -1, -3,-12, 6, -9,-11, -6, 2, 0,-26, -8,-10; /M: SY='T'; M= 2, -8,-21,-13,-13, -6,-15,-14, 5, -6, 3, 1, -2,-11, -5,-13, 3, 13, 6,-28, -3,-11; /M: SY='D'; M= 1, 10,-16, 16, 0,-19,-13,-14,-16, -1, -8,-10, 5,-10, -3, -8, 5, 4, -9,-30,-11, -2; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='A'; M= 4, -3,-18, -3, -4,-12,-10,-13, -1, -3, -5, -7, -3, -1, -8,-12, -2, 0, -1,-30,-13, -7; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='E'; M= 3, 3,-14, 9, 19,-25,-11,-10,-17, 7, -9, -6, -3, 0, 9, -5, 0, -6,-15,-21,-14, 15; /M: SY='E'; M= 1, 4,-17, 15, 22,-29,-15, 8,-21, 5, -7, -5, -6, -1, 7, -7, -1,-11,-18,-24,-11, 17; /M: SY='I'; M= 9,-13,-19,-20,-16, 1,-15,-19, 27,-12, 10, 8, -8,-25,-12,-15, -6, 3, 24,-31, -6,-16; /M: SY='E'; M= -2, -4,-16, -2, 1, -6,-13,-14, -5, -1, 0, -4, -5,-14, -2, -2, -3, -7, -3,-18, -3, -1; /M: SY='E'; M= 4, 2,-19, 7, 12,-23,-10, -7,-16, 7,-12, -6, -2, 0, 7, 0, 1, -6,-14,-25,-16, 9; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='E'; M= 1, -1,-16, 6, 14,-22,-13, -5,-16, 5, -7, -5, -6, -3, 12, 1, -3, -8,-15,-18, -9, 12; D=-8; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='F'; M=-13,-19,-16,-25,-20, 36,-20,-15, 13,-14, 26, 5,-17,-31,-20,-14,-15, -8, 11, -2, 26,-20; D=-8; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='G'; M= -1, -2,-24, -2, -1,-15, 8,-14,-12, 2,-11, -9, -3, 1, -3, -5, -3, -8,-16,-13,-12, -3; D=-8; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='D'; M= 3, 8,-23, 10, 3,-24, 8, -8,-15, 2,-14, -9, 6, -2, -3, -9, 3, -4,-17,-25,-19, -1; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='M'; M= 0, -8,-19,-11, -4, -7,-10, -8, 1, 0, -3, 3, -4,-12, 3, 2, -5, -5, -1,-18, -5, -3; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='V'; M= 8,-10,-16,-12,-15, 2,-18,-20, 19,-12, 8, 3, -9,-25,-15,-13, -5, 5, 22,-32, -3,-16; /M: SY='D'; M= 1, 28,-23, 53, 7,-37,-10,-17,-27, 0, -9,-21, 3, -2, -7, -9, -1, -7,-16,-35,-12, 0; /M: SY='L'; M= -5,-15,-22,-17,-18, 13, -9,-17, 13,-13, 17, 3,-15,-26,-17,-14,-11, -4, 11, -8, 15,-18; /M: SY='I'; M= -2,-19,-21,-27,-24, 15,-21,-19, 31,-15, 17, 4,-12,-30,-20,-16,-11, 0, 29,-19, 10,-24; /M: SY='I'; M= -2,-15,-14,-20,-20, 11,-16,-19, 31,-18, 22, 8,-14,-30,-21,-19,-12, 1, 25,-22, 11,-20; /M: SY='D'; M= -2, 23,-21, 42, 5,-31,-12,-13,-21, -2, -5,-16, 3, -7, -7,-11, -3, -6,-13,-33, -9, -1; /M: SY='G'; M= -1, 0,-37, 0, -8,-22, 16, 6,-12, -7,-11, -8, -2, -5, -8,-13, -1, -9,-17,-18,-12, -9; /M: SY='G'; M= -1, 10,-31, 8, -8,-31, 42,-22,-16, -4,-18,-19, 6, -3,-13,-16, -1,-13,-27, -9,-25,-10; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='P'; M= -3, -3,-16, 4, 6,-17,-12, -5,-15, 3, -7,-11, -9, 13, 6, 1, -4, -5,-13,-14, -4, 5; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='C'; M= -6,-11, 13,-17, -7,-12,-17,-21, 7,-10, 1, -7, -5,-10,-12,-17, -5, -1, 3,-25,-16,-10; /M: M= -2, -9,-11, -9, -3,-11, -9,-15, -6, -3, -6, -7, -9, -4, -2, -3, -3, -4, -7,-15, -9, -4; /M: SY='T'; M= -3, -6,-26, -9,-11, -7, -4, -9, 0, -6, -4, -6, 0,-11, -8, -9, -1, 1, -2,-20, -3,-12; /M: SY='G'; M= 1, -5,-30, -9,-11,-19, 25,-18,-10, -3,-14,-10, -3, -6, -3, 1, -1,-12,-15, -9,-18,-10; /M: SY='L'; M= 1, -8, -3, -8, 1,-11,-18,-14, 4, -7, 5, 1, -9,-16, 0, -9, -6, -1, 2,-23, -5, 1; /M: SY='P'; M= 2, 4,-20, 15, 14,-32, -4, -8,-23, 5,-15,-18, -8, 22, 1, -9, 1, -5,-21,-26,-18, 8; /M: SY='S'; M= 7, 10,-23, 17, -1,-20, -2,-14,-15, -1,-16,-20, 3, -9, -9,-11, 27, 15,-11,-33,-17, -8; /M: SY='T'; M= 9, 0,-21, -7,-14,-18,-13,-17, -3, -6, -5, -5, 6, -1, -3,-24, 22, 38, 3,-43,-13, -9; /M: SY='I'; M= 5,-18,-19,-26,-27, 5,-19,-24, 43,-19, 15, 6,-11,-33,-24,-19,-10, 6, 40,-29, 2,-27; /M: SY='V'; M= 5,-18,-21,-22,-25, 7,-22,-23, 37,-18, 15, 5,-15,-33,-22,-14,-10, 5, 38,-26, 7,-25; /M: SY='D'; M= 1, 20,-24, 38, 9,-30,-11,-14,-27, 6,-12,-13, 3, -7, 3, 4, 1, -8,-16,-28,-11, 4; /M: SY='L'; M= -7,-18, -4,-22,-17, 13,-19,-19, 15,-15, 17, 5,-17,-30,-18,-12,-14, -4, 13, -7, 11,-17; /M: SY='T'; M= 6, -1,-18, -3, -9,-15,-16,-17, 1, -6, -1, -2, 1,-10, -3,-14, 7, 17, 6,-35, -9, -7; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='D'; M= 4, 7,-21, 10, 2,-23, 4,-12,-14, 0,-13,-12, 3, -4, -3, -9, 6, -1,-14,-26,-19, -1; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='G'; M= -1, 8,-26, 9, -1,-25, 20,-14,-15, 0,-14,-12, 5, -4,-10,-13, 0, -9,-22,-17,-19, -5; /I: I=-7; MD=-15; /M: SY='E'; M= 0, -3,-20, -2, 8,-17, -7, -8,-13, 8,-11, -5, -3, 6, 2, -3, 1, -2,-13,-21,-11, 5; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='P'; M= -9,-18,-21,-15, -6, -5,-11, -9, -3, -4, -2,-10,-22, 14, -9, -9,-10, -5, -6, 3, 5,-10; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='Q'; M= 0, -8,-12, -7, 6,-17,-16, -6,-13, 6, -9, 3, -6, -6, 15, 12, -3, -4,-10,-18, -9, 8; D=-7; /I: I=-7; DM=-15; /M: SY='I'; M= 0,-19,-17,-28,-26, 11,-20,-21, 39,-18, 19, 7,-11,-31,-23,-20,-11, 3, 33,-26, 5,-26; /M: SY='L'; M= -4,-13,-13,-16,-15, 12,-19,-14, 24,-15, 26, 13,-14,-29,-18,-17,-15, 0, 18,-21, 16,-16; /M: SY='R'; M= -9,-17,-20, -9, -9,-10,-19,-10,-28, 11,-20, 0,-16,-10, 27, 73, -9,-27,-11, -3, -2, 0; /M: SY='Q'; M= -1, -9,-14, -3, 13,-21,-17, 1,-19, 5,-11, -7,-12, 8, 16, 9, -4,-10,-17,-18,-10, 13; /M: SY='G'; M= 5, 0,-36, -8,-15,-26, 60,-26, -9, -7,-19,-16, 0,-10,-15,-16, 5,-12,-22, -2,-29,-16; /M: SY='R'; M= 8, -6,-19, -4, -1,-15, -6,-16, -9, 4,-10, 0, -7, -7, 4, 9, 0, -7, -4,-24,-17, -2; /M: SY='G'; M= 2,-10,-21,-19,-20, -9, 17,-24, 16,-14, 1, -4, -6,-22,-18,-18, -4, -5, 7,-15,-13,-20; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 181 in 181 different sequences |
| Number of true positive hits | 181 in 181 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | YrdC-like |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
181 sequences
HYPF2_CUPNH (O07451 ), HYPF_AZOCH (Q43950 ), HYPF_AZOVI (P40596 ), HYPF_ECOLI (P30131 ), HYPF_METJA (Q58123 ), HYPF_RHILV (P28156 ), HYPF_RHOCA (Q02987 ), HYPF_SYNY3 (Q55638 ), SUA5_BACSU (P39153 ), SUA5_PYRAB (Q9UYB2 ), SUA5_SCHPO (O94530 ), SUA5_SULTO (Q970S6 ), SUA5_YEAST (P32579 ), TSAC_ACIAD (Q6FFH9 ), TSAC_ACIBC (B2I111 ), TSAC_ACIBS (B0VNL3 ), TSAC_ACIBT (A3M154 ), TSAC_ACIBY (B0VCB7 ), TSAC_ACTP2 (A3N1E4 ), TSAC_ACTP7 (B3GY27 ), TSAC_ACTPJ (B0BQ80 ), TSAC_ACTSZ (A6VL69 ), TSAC_AERHH (A0KEX6 ), TSAC_AERS4 (A4ST51 ), TSAC_ALCBS (Q0VTD8 ), TSAC_ALKEH (Q0A5B4 ), TSAC_BAUCH (Q1LT55 ), TSAC_BLOFL (Q7VQB9 ), TSAC_BLOPB (Q493I0 ), TSAC_BUCAI (P57561 ), TSAC_BUCAP (Q8K977 ), TSAC_BUCBP (Q89A89 ), TSAC_CELJU (B3PGZ1 ), TSAC_CHRSD (Q1QTJ8 ), TSAC_CHRVO (Q7P0L7 ), TSAC_CITK8 (A8AQH7 ), TSAC_COLP3 (Q48AU1 ), TSAC_COXBN (A9KH21 ), TSAC_COXBR (A9N9G8 ), TSAC_COXBU (Q83AA2 ), TSAC_CROS8 (A7MPF3 ), TSAC_DICNV (A5EW39 ), TSAC_ECO24 (A7ZSH1 ), TSAC_ECO57 (Q8X8F8 ), TSAC_ECODH (B1X6D5 ), TSAC_ECOHS (A8A587 ), TSAC_ECOK1 (A1AGH4 ), TSAC_ECOL5 (Q0TCH9 ), TSAC_ECOL6 (Q8FD17 ), TSAC_ECOLC (B1IQ17 ), TSAC_ECOLI (P45748 ), TSAC_ECOSM (B1LGN9 ), TSAC_ECOUT (Q1R650 ), TSAC_ENT38 (A4WF91 ), TSAC_HAEDU (Q7VNS3 ), TSAC_HAEI8 (Q4QMR0 ), TSAC_HAEIE (A5UE77 ), TSAC_HAEIG (A5UHE9 ), TSAC_HAEIN (P44807 ), TSAC_HAES1 (Q0I1B6 ), TSAC_HAHCH (Q2SQW8 ), TSAC_HALHL (A1WZH9 ), TSAC_HISS2 (B0UWV9 ), TSAC_HYDCU (Q31JQ7 ), TSAC_IDILO (Q5QXJ5 ), TSAC_KLEP7 (A6TET6 ), TSAC_LARHH (C1D9T5 ), TSAC_MANSM (Q65WC1 ), TSAC_MARHV (A1TWN4 ), TSAC_MARMS (A6VT87 ), TSAC_METCA (Q603G8 ), TSAC_METFK (Q1H4G9 ), TSAC_METJA (Q60369 ), TSAC_MORCB (D5V9A9 ), TSAC_MYCLE (P45831 ), TSAC_MYCTO (P9WGC8 ), TSAC_MYCTU (P9WGC9 ), TSAC_NEIG1 (Q5F5I5 ), TSAC_NEIM0 (A9M4K6 ), TSAC_NEIMA (A1IP83 ), TSAC_NEIMB (Q9JXA4 ), TSAC_NEIMF (A1KWL6 ), TSAC_NITOC (Q3J7C4 ), TSAC_PASMU (Q9CLG4 ), TSAC_PHOLL (Q7MYI5 ), TSAC_PHOPR (Q6LLJ9 ), TSAC_PSE14 (Q48QH8 ), TSAC_PSEA6 (Q15ZX7 ), TSAC_PSEA7 (A6UX84 ), TSAC_PSEAB (Q02V59 ), TSAC_PSEAE (Q9I7A5 ), TSAC_PSEE4 (Q1I2G9 ), TSAC_PSEF5 (Q4KKQ6 ), TSAC_PSEHT (Q3IDH7 ), TSAC_PSEMY (A4XNB6 ), TSAC_PSEP1 (A5VWK1 ), TSAC_PSEPF (Q3KKE2 ), TSAC_PSEPG (B0KF32 ), TSAC_PSEPK (Q88RQ9 ), TSAC_PSEPW (B1J499 ), TSAC_PSESM (Q88B46 ), TSAC_PSEU2 (Q500S6 ), TSAC_PSEU5 (A4VFI1 ), TSAC_PSYA2 (Q4FPS7 ), TSAC_PSYCK (Q1Q7W4 ), TSAC_PSYIN (A1SR31 ), TSAC_RIEPU (D4G8K6 ), TSAC_SACD2 (Q21PU1 ), TSAC_SALAR (A9MN84 ), TSAC_SALCH (Q57J68 ), TSAC_SALPA (Q5PIS8 ), TSAC_SALPB (A9N8A7 ), TSAC_SALTI (Q8Z1W6 ), TSAC_SALTY (Q8ZLN0 ), TSAC_SERP5 (A8GKG1 ), TSAC_SHEAM (A1S1K5 ), TSAC_SHEB5 (A3CYL0 ), TSAC_SHEB8 (A6WHB6 ), TSAC_SHEB9 (A9KUA7 ), TSAC_SHEDO (Q12TA0 ), TSAC_SHEFN (Q08A23 ), TSAC_SHEHH (B0TLD6 ), TSAC_SHELP (A3QJE8 ), TSAC_SHEON (Q8EKQ3 ), TSAC_SHEPA (A8GYH9 ), TSAC_SHEPC (A4Y1D2 ), TSAC_SHESA (A0KR66 ), TSAC_SHESH (A8FP81 ), TSAC_SHESM (Q0HPA1 ), TSAC_SHESR (Q0I0R7 ), TSAC_SHESW (A1RDY7 ), TSAC_SHEWM (B1KCX0 ), TSAC_SHIB3 (B2U2Q0 ), TSAC_SHIBS (Q31VZ4 ), TSAC_SHIDS (Q32B67 ), TSAC_SHIF8 (Q0T019 ), TSAC_SHIFL (Q83JD1 ), TSAC_SHISS (Q3YWX6 ), TSAC_SODGM (Q2NQQ7 ), TSAC_STRMK (B2FIS1 ), TSAC_THIDA (Q3SG43 ), TSAC_VIBC3 (A5F4C5 ), TSAC_VIBCB (A7N129 ), TSAC_VIBCH (Q9KVT5 ), TSAC_VIBF1 (Q5E1R5 ), TSAC_VIBPA (Q87KE2 ), TSAC_VIBVU (Q8DDD6 ), TSAC_VIBVY (Q7MGL3 ), TSAC_WIGBR (Q8D257 ), TSAC_XANAC (Q8PG13 ), TSAC_XANC5 (Q3BNJ9 ), TSAC_XANC8 (Q4UQ07 ), TSAC_XANCB (B0RWR5 ), TSAC_XANCP (Q8P4F2 ), TSAC_XANOM (Q2P833 ), TSAC_XANOP (B2SL46 ), TSAC_XANOR (Q5H5D8 ), TSAC_XYLF2 (B2I8S9 ), TSAC_XYLFA (Q9PEV9 ), TSAC_XYLFM (B0U4N0 ), TSAC_XYLFT (Q87AQ5 ), TSAC_YERE8 (A1JRY6 ), TSAC_YERP3 (A7FNJ8 ), TSAC_YERPA (Q1C2Y3 ), TSAC_YERPB (B2K500 ), TSAC_YERPE (Q74XX5 ), TSAC_YERPG (A9R933 ), TSAC_YERPN (Q1CCY0 ), TSAC_YERPP (A4TH27 ), TSAC_YERPS (Q664V8 ), TSAC_YERPY (B1JJI2 ), Y1198_HAEIN (P45103 ), Y259_MYCGE (Q49404 ), Y362_MYCPN (P75419 ), YCIO_ECOL6 (P0AFR5 ), YCIO_ECOLI (P0AFR4 ), YCIO_SHIFL (P0AFR6 ), YRDC_BOVIN (Q0VC80 ), YRDC_HUMAN (Q86U90 ), YRDC_MOUSE (Q3U5F4 ), YRDC_RAT (Q499R4 )» more
|
| PDB [Detailed view] |
7 PDB
1HRU; 1K7J; 1KK9; 2EQA; 2MX1; 3AJE; 4E1B |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission