PROSITE entry PS51171
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | PREPHENATE_DEHYDR_3 |
| Accession [info] | PS51171 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2005 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00671 |
| Associated ProRule [info] | PRU00517 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Prephenate dehydratase domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=183; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=178; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8558452; R2=0.0154492; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=463; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=301; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='R'; M= -7, -8,-26, -9, 0,-22,-19, -9,-22, 29,-20, -8, -4,-16, 4, 35, -8, -8,-11,-21,-11, 0; /M: SY='V'; M= -4,-30,-18,-34,-30, 0,-34,-30, 38,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 42,-26, -6,-30; /M: SY='A'; M= 28,-13,-15,-20,-13,-16, 0,-20, -5,-15, -5, -6,-10,-14,-12,-20, 5, -2, 0,-22,-17,-13; /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23, 46,-30, 8, 0,-16, 3, 0,-20,-30,-19,-13,-20,-10, -7, 24, 64,-23; /M: SY='L'; M= -9,-27,-19,-28,-19, 8,-29,-20, 17,-28, 44, 17,-27,-28,-19,-19,-25, -4, 9,-21, -1,-19; /M: SY='G'; M= -1,-12,-29,-12,-20,-26, 60,-20,-34,-21,-22,-16, -3,-21,-20,-20, -3,-19,-26,-20,-27,-20; /M: SY='P'; M= -8,-18,-36, -9, 0,-29,-18,-19,-20,-10,-30,-20,-16, 78, -9,-19, -4, -6,-28,-31,-29, -9; /M: SY='K'; M= 0, -5,-25, -6, 10,-14,-17,-10,-22, 18,-18,-11, -4,-11, 2, 12, -5, -8,-15,-18, -9, 6; /M: SY='G'; M= 10,-10,-26,-12,-18,-28, 56,-20,-34,-18,-26,-18, -2,-18,-18,-20, 2,-16,-24,-20,-28,-18; /M: SY='T'; M= 3, 0,-10, -7, -7,-13,-14,-17,-13,-10,-16,-13, 3,-10, -7,-10, 26, 41, -3,-33,-13, -7; /M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-32,-26, 59,-30, -3, 0,-22, 6, 0,-20,-30,-28,-16,-20,-10, -4, 18, 51,-26; /M: SY='T'; M= 4, -2, 2, -7, -7,-16,-11,-16,-17,-12,-21,-16, 3,-13, -7,-12, 27, 29, -6,-37,-17, -7; /M: SY='H'; M=-13, 3,-28, 6, 20,-25,-18, 51,-28, -2,-21, -8, 6,-12, 17, 0, -1,-12,-28,-30, 1, 16; /M: SY='L'; M= 3,-13,-21,-14, 0,-14,-20,-12, -3, -5, 6, 2,-14,-17, 3, -7,-10, -7, -3,-22,-10, 2; /M: SY='A'; M= 45,-12,-10,-21,-12,-18, -3,-21, -6,-11, -8, -8,-12,-12,-12,-20, 8, 0, 5,-21,-19,-12; /M: SY='A'; M= 28,-15,-12,-22,-14,-11,-11,-21, 0,-15, 4, -2,-15,-16,-14,-19, 1, 3, 7,-22,-14,-14; /M: SY='L'; M= -9,-13,-23,-13, -1, -9,-23, -8, -5, -3, 3, 1,-12,-20, 1, 1, -9, -6, -5,-19, 0, -1; /M: SY='K'; M= -8, 0,-26, 0, 12,-28,-18, -5,-25, 25,-24,-10, 1,-10, 17, 19, 1, -1,-20,-24,-12, 14; /M: SY='Y'; M=-10,-18, -8,-24,-17, 20,-24, 4, -7,-16, -2, 3,-14,-25,-11,-13,-13,-10, -8, -5, 21,-14; /M: SY='F'; M= 5,-24,-16,-32,-23, 34,-21,-21, 2,-23, 8, 0,-19,-24,-28,-20,-11, -6, 6, -6, 8,-23; /M: SY='D'; M= 2, 4,-24, 6, 1,-29, 2, -9,-22, 1,-20,-12, -1,-14, 5, -6, 0, -9,-16,-25,-18, 3; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='H'; M= 1, -3,-19, -8, -5, -5,-12, 5,-15, 1,-15, -8, 3,-16, -3, 2, 0, -4,-12,-15, 3, -5; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='H'; M= -5, -5,-15, -6, -7,-10, 5, 14, -9, -9, -8, -2, 0,-10, -4, -7, -4, -9, -9,-12, -2, -7; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='D'; M= -6, 6,-14, 9, 0, -7, -9, -7,-13, -6,-13,-11, 2, 2, -6, -8, 4, 4,-10,-18, -8, -3; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='G'; M= -3, 4,-16, 6, 4,-18, 9, -6,-20, 2,-17,-12, 3, -7, -1, -2, 3, -5,-15,-17,-13, 2; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='S'; M= 0, 6,-22, 9, 5,-26, -3,-10,-18, -8,-20,-15, 4,-11, 2,-12, 10, -2,-14,-31,-18, 3; /M: SY='L'; M= 2,-21,-19,-24,-14, 6,-24,-17, 11,-18, 12, 4,-20,-22,-17,-18,-12, -6, 11,-15, 3,-16; /M: SY='E'; M=-10, -2,-28, -1, 20,-22,-24, 1,-12, 2,-12, -7, -3, -9, 11, -3, -3, -4,-14,-26, -9, 14; /M: SY='H'; M=-13, -4,-27, -2, 1,-11,-22, 9,-10, -5, -8, -4, -4,-18, 4, -2, -7, -8,-13,-17, 9, 0; /M: SY='M'; M= -8, -9,-20,-10, -9, -4,-21,-14, -4, -3, 1, 3,-10,-19,-10, -5, -8, -1, 0,-23, -5, -9; /M: SY='P'; M= 2,-18,-31,-17, -9,-18,-11,-17, -9,-13,-17,-11,-16, 34,-12,-20, -7, -9,-15,-20,-13,-14; /M: SY='C'; M= 0,-19, 19,-25,-22, 0,-23, -9, -6,-17, -5, -1,-19,-28,-17,-19,-10, -7, 0,-13, 12,-21; /M: SY='K'; M= 7, 6,-21, 4, 7,-25, -9, -8,-23, 11,-22,-15, 6,-11, 2, 6, 4, -3,-16,-27,-17, 4; /M: SY='S'; M= 8, 4,-13, -2, -2,-19, -6,-11,-18, -3,-24,-16, 11,-11, -2, -6, 25, 19,-10,-34,-17, -2; /M: SY='I'; M= -6,-27,-27,-35,-25, 12,-32,-26, 27,-26, 10, 9,-19,-10,-22,-26,-16, -9, 15,-15, 1,-26; /M: SY='P'; M= -5, -8,-28, -4, -1,-19,-17, -8,-16, -5,-16,-11, -9, 15, 0, -6, -3, -6,-18,-22, -9, -3; /M: SY='D'; M= -9, 27,-28, 39, 29,-35,-13, -1,-32, 3,-24,-22, 9, -7, 11, -6, 1, -9,-27,-33,-19, 20; /M: SY='V'; M= 7,-24, 15,-29,-26, -8,-25,-28, 11,-21, 1, 1,-23,-27,-25,-23, -7, -3, 26,-31,-15,-26; /M: SY='F'; M=-14,-30,-22,-38,-29, 40,-33,-24, 21,-29, 17, 9,-22,-27,-31,-23,-20, -9, 16, -7, 13,-29; /M: SY='D'; M= -5, 15,-22, 16, 11,-23,-13, -5,-21, 1,-19,-16, 12,-13, 0, 0, 3, 1,-15,-32,-17, 5; /M: SY='A'; M= 15, -3,-20, -5, 11,-26,-10, -7,-19, 2,-17,-11, -3, -9, 12, 0, 8, -2,-15,-24,-17, 11; /M: SY='V'; M= 2,-27,-13,-28,-26, 2,-27,-23, 22,-19, 11, 8,-27,-28,-25,-19,-11, -2, 35,-22, -1,-26; /M: SY='E'; M=-12, 6,-26, 14, 22,-24,-20, -6,-20, 6,-16,-14, -2,-12, 4, 8, -4, -8,-12,-30,-16, 12; /M: SY='N'; M= 2, 12,-20, 7, 6,-23,-11, 6,-20, -3,-19,-13, 13,-12, 6, -6, 7, 4,-18,-30,-13, 6; /M: SY='G'; M= -5, 3,-29, 3, -6,-31, 36,-10,-35, -6,-29,-18, 8,-17, -4, -9, 0,-15,-29,-24,-24, -5; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='Q'; M= -1, -2,-21, -4, 7,-23, -7, -7,-20, 6,-17, -9, -1,-10, 12, 5, 3, 3,-16,-21,-13, 9; D=-13; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='A'; M= 20,-12, 4,-17,-13,-14, -9,-19, -5,-13,-10, -8,-10,-16,-13,-17, 10, 3, 7,-27,-17,-13; D=-13; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='D'; M=-14, 32,-27, 40, 10,-33, -3, -2,-32, -2,-27,-23, 18,-12, 3, -8, 3, -3,-26,-35,-19, 7; /M: SY='Y'; M=-19,-25,-25,-29,-24, 48,-30, 0, 2,-20, 9, 2,-21,-30,-23,-15,-21,-10, -4, 17, 52,-24; /M: SY='A'; M= 31, -9,-16,-15,-12,-23, 20,-19,-20,-13,-18,-14, -5,-13,-12,-19, 10, -4,-10,-22,-23,-12; /M: SY='V'; M= -5,-29, -2,-32,-29, 8,-31,-28, 23,-24, 12, 8,-27,-30,-29,-22,-14, -4, 33,-25, -5,-29; /M: SY='V'; M= -1,-30,-11,-30,-29, 1,-30,-29, 29,-21, 15, 11,-30,-30,-29,-20,-12, -1, 45,-29, -9,-29; /M: SY='P'; M= -4,-19,-37,-11, -1,-29,-18,-20,-19,-10,-28,-19,-19, 80,-10,-20, -8, -9,-27,-29,-29,-10; /M: SY='I'; M= -8,-30,-24,-36,-28, 2,-36,-28, 40,-28, 24, 18,-24,-24,-22,-26,-20, -8, 30,-22, -2,-28; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='S'; M= 7, -4,-13, -8, -3,-11, -9,-11,-15,-10,-19,-13, 2,-12, 0,-10, 22, 17, -9,-29,-12, -1; /M: SY='T'; M= -2,-15,-17,-21,-17, -6,-24,-22, 12,-19, 3, 2,-10,-17,-14,-18, 4, 15, 13,-28, -8,-17; /M: SY='E'; M= -8, 19,-25, 26, 34,-29,-12, -1,-29, 3,-25,-22, 12, -6, 10, -4, 9, -3,-26,-35,-20, 22; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='S'; M= 9,-10,-16,-12, -6,-17,-12,-15, -8,-11,-10, -8, -7, -4, -3,-13, 10, 8, -3,-29,-16, -5; /M: SY='V'; M= -2,-30,-14,-32,-30, 0,-32,-30, 34,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 46,-28, -8,-30; /M: SY='N'; M= -6, 10,-18, -2,-10,-12,-13, -7, -2,-10,-10, -7, 22,-20, -8,-10, 5, 5, -6,-34,-14,-10; /M: SY='H'; M=-14,-11,-28, -8, -2, -2,-23, 2, -8,-13, 1, 1,-13, 1, -8,-13,-15,-11,-13,-18, 2, -6; /M: SY='T'; M= 2, -6,-10,-12,-12,-10,-18,-20, -4,-12,-10, -8, -4,-14,-12,-12, 18, 34, 8,-32,-12,-12; /M: SY='Y'; M=-14,-24,-26,-27,-19, 16,-31, -7, 14,-20, 17, 10,-21,-26,-11,-16,-21,-10, 3, -1, 27,-17; /M: SY='D'; M=-19, 44,-30, 62, 19,-39,-11, -1,-39, 6,-30,-28, 18,-10, 1, -5, -1,-10,-29,-38,-19, 10; /M: SY='L'; M= -1,-17,-19,-19,-12, -1,-19,-11, 2,-13, 13, 8,-15,-21, -9,-11, -9, -3, 0,-19, 2,-11; /M: SY='L'; M=-12,-30,-21,-33,-23, 22,-31,-21, 19,-30, 40, 16,-27,-29,-24,-21,-27,-10, 10,-14, 6,-23; /M: SY='L'; M= -7,-12,-24,-13, -7, -6,-23,-11, -1,-11, 8, 3,-12,-20, 1, -5,-13, -9, -5,-19, -4, -4; /M: SY='H'; M=-14, 4,-30, 7, 16,-27,-21, 27,-21, 4,-18, -6, 3,-12, 18, 2, -6,-13,-23,-27, -3, 15; /M: SY='S'; M= -8, 0,-23, 0, -1,-12, -1, -1,-25, -7,-19,-14, 2,-15, -6, -3, 4, 2,-18,-25,-10, -4; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='Q'; M= -1, -5,-11, -6, -2,-11, -9, -5, -4, 1, -8, 2, -3, -9, 5, -1, 4, 1, -2,-17, -7, 1; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: SY='D'; M=-13, 18,-29, 26, 9,-31,-12, -5,-30, 4,-29,-22, 10, 11, 0, 0, 0, -6,-26,-34,-20, 3; /M: SY='I'; M= -2,-28,-20,-32,-24, 2,-30,-25, 28,-26, 28, 15,-25,-25,-21,-23,-19, -7, 23,-22, -4,-24; /M: SY='Q'; M= -7, -8,-24, -8, 4,-13,-20,-10,-15, 4,-16, -8, -7, -3, 6, -1, -1, -1,-12,-22, -9, 5; /M: SY='I'; M= -7,-30,-24,-37,-30, 0,-37,-30, 44,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 36,-23, -3,-30; /M: SY='V'; M= -3,-27, -5,-33,-27, 5,-31,-27, 23,-25, 13, 9,-23,-26,-25,-24,-14, -6, 24,-23, -5,-27; /M: SY='G'; M= 20,-10,-22,-14,-16,-26, 43,-20,-28,-16,-22,-16, -4,-16,-16,-20, 4,-12,-18,-20,-26,-16; /M: SY='E'; M=-10, 14,-29, 20, 53,-29,-18, 1,-29, 9,-21,-20, 7, -2, 18, 0, 1, -9,-30,-31,-20, 35; /M: SY='M'; M= -9,-18,-22,-23,-11, 1,-27,-14, 13,-15, 10, 16,-16,-19, -6,-14,-12, -3, 8,-20, -2, -9; /M: SY='T'; M= -1, -9,-18,-11, -2, -4,-22, -9, -4, -8, -6, -6,-11,-16, -8,-11, 1, 10, 1,-16, 7, -6; /M: SY='L'; M= -9,-30,-21,-32,-23, 7,-32,-23, 27,-29, 40, 19,-28,-28,-21,-22,-26, -9, 18,-21, -1,-23; /M: SY='P'; M=-14, 6,-32, 15, 5,-29,-17, 2,-27, -3,-26,-19, -1, 27, -3, -5, -4, -6,-26,-32,-17, -2; /M: SY='I'; M= -2,-28,-26,-37,-28, -2,-34,-29, 41,-27, 15, 15,-20,-20,-20,-28,-15, -8, 28,-21, -3,-28; /M: SY='H'; M= -3, 8,-19, 4, -2,-19,-13, 24,-21, -8,-19,-11, 12,-14, -1, -7, 9, 9,-17,-32, -5, -3; /M: SY='H'; M=-17, -9,-27,-10, -4, -2,-23, 48,-18,-12, -8, 2, -1,-21, 8, -4,-12,-15,-21,-19, 14, 0; /M: SY='C'; M= -9, 2, 22, -5, -9,-20,-15, 20,-26,-14,-24,-14, 11,-24, -6,-11, 4, -5,-20,-40,-11, -9; /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22, 8,-32,-22, 26,-30, 44, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 14,-20, 0,-22; /M: SY='L'; M= -9,-29,-21,-32,-23, 6,-31,-21, 27,-27, 37, 23,-27,-27,-19,-21,-25, -9, 18,-21, -1,-22; /M: SY='V'; M= 13,-18,-12,-20,-19,-11, -7,-23, 5,-16, -6, -3,-15,-21,-19,-18, 5, 2, 19,-29,-16,-19; /M: SY='K'; M= -5,-10,-26,-10, -5,-16, -9, 2,-19, 4,-15, -8, -6, -7, -3, 4, -6, -9,-17,-19, -2, -6; /M: SY='P'; M= -6, -4,-29, 1, 4,-26, -9,-14,-19, -3,-24,-16, -4, 19, -4,-10, 1, -5,-19,-30,-21, -2; /M: SY='S'; M= -6, 0,-24, 0, -2,-20, -1, -7,-23, 3,-22,-13, 0,-14, 1, -2, 4, 3,-18,-20, -5, -1; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='T'; M= -5, -4,-16, -7, 0,-12,-17,-11,-13, -1, -8, -8, -2,-12, -2, 7, 7, 18, -7,-25,-10, -2; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='P'; M= -7, 2,-23, 4, 7,-20,-13, -8,-14, 0,-19,-12, 2, 13, -1, -6, 0, -4,-16,-25,-15, 1; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='I'; M= 0, -2,-13, -9, -9, -5,-12, -9, 4,-11, 4, 0, 3,-14, -8,-10, -3, 2, -1,-19, -7, -9; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='A'; M= 10, 3,-20, 0, 1,-21, -2,-11,-18, -3,-14,-12, 3,-13, -4, -9, 3, -4,-13,-27,-17, -2; /M: SY='K'; M=-10, 13,-25, 16, 13,-27,-14, -5,-28, 18,-26,-17, 10,-11, 5, 13, 3, -1,-21,-30,-15, 9; /M: SY='I'; M= -7,-30,-22,-35,-28, 2,-35,-28, 38,-27, 23, 17,-25,-25,-23,-25,-19, -7, 31,-23, -3,-28; /M: SY='E'; M=-10, 9,-27, 10, 15,-28, -8, -4,-28, 13,-24,-15, 7,-11, 11, 10, 0, -4,-24,-27,-16, 12; /M: SY='K'; M= -8, 3,-21, -3, -1,-19,-18, 0,-21, 14,-20,-10, 7,-13, 1, 13, 4, 13,-14,-27, -8, -1; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='I'; M= -7,-30,-22,-35,-28, 2,-35,-28, 39,-27, 23, 17,-25,-25,-23,-25,-19, -7, 32,-23, -3,-28; /M: SY='Y'; M= -5,-17,-26,-20,-17, 12,-24, 15, 0,-12, -2, 0,-15,-24, -9,-13,-13, -9, -6, 9, 46,-17; /M: SY='S'; M= 13, -1,-10, -3, -2,-19, -2,-12,-18,-10,-26,-18, 7,-10, -2,-11, 35, 21, -8,-37,-19, -2; /M: SY='H'; M=-20, -3,-29, -4, -3,-11,-21, 89,-27,-12,-17, 0, 7,-21, 5, -2,-11,-19,-27,-26, 21, -3; /M: SY='P'; M= -2,-16,-32,-13, -4,-24,-18,-19,-12, -7,-22,-13,-14, 47, -8,-16, -4, -6,-17,-28,-23,-10; /M: SY='Q'; M= -9, -8,-25, -9, 5,-27,-22, 11, -8, 0,-11, 7, -7,-16, 32, 1, -5, -9,-11,-23, -6, 18; /M: SY='A'; M= 23,-13,-18,-16,-10,-21, 0,-20,-12,-12,-16,-12,-11, 8,-12,-19, 6, -2, -5,-25,-22,-12; /M: SY='F'; M= -8,-28,-24,-32,-23, 23,-27,-18, 10,-25, 21, 7,-25,-27,-22,-20,-23,-11, 3, 9, 16,-22; /M: SY='A'; M= 26, -7,-18,-13, -3,-26, 1,-13,-17, 0,-16, -9, -6,-11, 5, -8, 5, -5,-11,-20,-18, 1; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='C'; M= -6,-21, 69,-28,-28,-13,-29,-29,-10,-25,-10,-10,-21,-34,-28,-25, -7, -1, 9,-42,-22,-28; /M: SY='R'; M=-12, -4,-26, -3, 7,-22,-16, 8,-28, 17,-23,-12, 3,-15, 9, 35, 1, -5,-20,-26,-10, 5; /M: SY='K'; M= -8, 10,-10, 3, 3,-26,-13, -4,-25, 18,-28,-14, 17,-16, 7, 9, 1, -4,-22,-31,-16, 5; /M: SY='W'; M=-20,-31,-35,-34,-27, 38,-26,-12, -8,-20, -5, -8,-28,-30,-23,-17,-28,-18,-15, 70, 45,-23; /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-22, 7,-31,-20, 27,-28, 40, 24,-27,-27,-18,-21,-27,-10, 14,-20, 0,-21; /M: SY='R'; M= 0, 6,-23, 5, 6,-24,-11, 5,-25, 8,-22,-14, 8,-13, 4, 11, 4, -5,-19,-28,-13, 4; /M: SY='R'; M= 3, -7,-21, -9, 2,-18,-15,-11,-17, 9,-12, -8, -5,-13, 0, 11, 1, 1,-10,-24,-13, 0; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='H'; M=-10, 4,-18, 1, 0,-14,-12, 37,-18, 0,-15, -4, 9,-12, 4, 2, -2, -4,-17,-21, 4, 0; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='F'; M=-15,-24,-22,-28,-22, 37,-28, -8, 9,-21, 14, 6,-20,-26,-22,-16,-20, -9, 2, 6, 33,-22; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='P'; M=-11,-18,-39, -9, 0,-29,-20, -8,-21,-10,-29,-18,-17, 79, -8,-18,-10,-11,-30,-30,-25, -9; /M: SY='N'; M= -1, 12,-22, 9, 3,-27, 1, 7,-24, -4,-25,-14, 17,-14, 10, -5, 10, -3,-23,-31,-15, 6; /M: SY='W'; M= 8,-27,-22,-30,-24, -3,-18,-27, 3,-17, -5, -5,-27,-24,-21,-20,-14, -9, 10, 29, 0,-21; /M: SY='K'; M=-11, 7,-28, 11, 12,-28,-18, -6,-23, 14,-21, -8, 0, 1, 8, 4, -4, -4,-20,-27,-14, 9; /M: SY='Y'; M=-11,-26,-21,-28,-23, 15,-30,-13, 14,-17, 14, 8,-23,-28,-20,-10,-18, -7, 15, -9, 16,-23; /M: SY='E'; M= -8,-10,-25, -9, 8,-15,-23,-13, -3, -1, -5, -3, -9,-14, -1, -1, -5, -5, -2,-26,-11, 2; /M: SY='Y'; M= 1, -6,-24,-10, -3,-10,-15, -5, -9, -5,-13, -9, -2, -7, -4, -5, -1, -4,-11,-16, 2, -6; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='A'; M= 14,-14, 3,-21,-18,-11,-18,-24, 0,-15, -5, -5,-14,-19,-18,-18, 5, 14, 14,-29,-15,-18; /M: SY='E'; M= -5, 10,-20, 11, 16,-19,-12, -2,-22, -2,-22,-18, 9,-10, 3, -6, 14, 7,-18,-29, -9, 9; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='T'; M= -3, 12,-13, -1, -7,-13,-14,-11,-13, -7,-16,-13, 18,-13, -7, -7, 17, 35, -9,-33,-13, -7; /M: SY='A'; M= 23, -6,-14,-10, -8,-22, 15,-16,-20,-12,-22,-16, 0,-12, -8,-16, 20, 4,-10,-28,-22, -8; /M: SY='E'; M= 12, 8,-22, 10, 15,-28,-10,-10,-24, 8,-20,-16, 0, -8, 2, -4, 2, -6,-16,-26,-18, 9; /M: SY='A'; M= 41, -9,-12,-17,-10,-21, 7,-19,-14,-11,-14,-12, -7,-11,-10,-19, 12, 0, -4,-22,-21,-10; /M: SY='A'; M= 22,-18, -2,-26,-19,-12,-15,-22, 6,-16, -1, 3,-17,-19,-16,-21, -2, -3, 14,-25,-15,-18; /M: SY='E'; M=-11, 6,-29, 7, 24,-30,-18, 0,-27, 23,-24,-12, 6, -9, 23, 18, -3, -9,-26,-25,-14, 23; /M: SY='M'; M=-14,-15,-27,-20, -9, 1,-26, 3, -2, -5, -3, 8, -9,-19, 3, 1,-13,-11, -6,-15, 5, -4; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='V'; M= 4,-25,-10,-27,-26, -3,-26,-28, 22,-18, 6, 6,-25,-26,-26,-19, -5, 5, 40,-29,-11,-26; /M: SY='A'; M= 29, -9,-15,-15, -6,-19, -7,-17,-12, 0,-11, -8, -8,-12, -6, -9, 6, -1, -4,-22,-16, -6; /M: SY='D'; M=-11, 22,-27, 29, 27,-32,-13, 0,-30, 9,-26,-20, 13, -8, 12, 0, 4, -6,-27,-33,-18, 20; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='H'; M= -1, -2, 1, -2, 3,-14, -9, 14,-16, -6,-12, -7, 0,-10, 0, -6, 2, -4,-12,-21, -5, 1; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='P'; M= -7, 6,-19, 7, 4,-18, -9, -5,-16, 8,-19,-11, 5, 13, 0, 1, -3, -5,-17,-19,-12, 1; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='D'; M=-10, 25,-27, 33, 17,-32, 5, -4,-34, -3,-28,-24, 15,-11, 0, -9, 5, -8,-28,-34,-22, 8; /M: SY='L'; M=-10,-11,-27,-13, -1, -8,-23,-15, -2,-14, 4, -3,-10, -9, -8,-14,-13, -5, -9, -9, -7, -5; /M: SY='T'; M= -3, -1,-20, -8, -8,-14,-16, -2,-10, -7,-10, -7, 4, -8, -7, -4, 1, 7, -8,-29,-11, -9; /M: SY='I'; M= -5, -7,-23, -7,-11,-13,-23, -7, 7,-17, 1, 1, -7,-18,-11,-18, -7, -6, 5,-28, -7,-13; /M: SY='A'; M= 29,-12,-17,-18,-14,-20, 18,-20,-16,-15,-10,-10, -9,-15,-14,-20, 3, -7, -8,-20,-21,-14; /M: SY='A'; M= 45,-12,-10,-21,-12,-18, -3,-21, -6,-11, -8, -8,-12,-12,-12,-20, 8, 0, 5,-21,-19,-12; /M: SY='I'; M= -1,-28,-20,-33,-26, 0,-31,-27, 32,-25, 20, 14,-24,-24,-22,-24,-16, -6, 28,-23, -5,-26; /M: SY='A'; M= 30, -9,-16,-16,-13,-22, 20,-20,-19,-13,-16,-13, -6,-13,-13,-19, 8, -2, -9,-21,-22,-13; /M: SY='N'; M= 1, 10,-18, 4, -2,-22, 5, -6,-22, -8,-30,-20, 22, -4, -3, -9, 21, 7,-20,-37,-22, -3; /M: SY='E'; M= -8, 12,-27, 22, 29,-30,-14, -5,-29, 6,-26,-21, 4, 3, 8, -3, 6, -4,-25,-33,-20, 18; /M: SY='M'; M= -2,-12,-19,-15, -6, -7,-19, -8, -2, -7, 0, 8,-11,-18, -4, -4, -3, 1, 0,-21, -1, -6; /M: SY='A'; M= 33,-10,-14,-17,-11,-15, 3,-14,-13,-11,-13,-11, -8,-13,-10,-18, 9, -1, -5,-16, -9,-11; /M: SY='A'; M= 40,-10,-14,-18,-12,-22, 15,-20,-16,-12,-14,-12, -8,-12,-12,-20, 8, -4, -6,-20,-22,-12; /M: SY='E'; M= -2, 1,-24, 2, 21,-23,-17, -2,-21, 6,-18,-11, -2, -9, 17, 0, 4, -1,-20,-22, -7, 18; /M: SY='L'; M=-10,-18,-20,-21,-14, -1,-25, -4, 4,-16, 22, 13,-16,-23,-10, -7,-15, 1, 1,-23, -1,-13; /M: SY='Y'; M=-19,-14,-30,-17,-18, 22,-24, 18, -7,-12, -6, -4, -9,-28,-11,-10,-17,-12,-15, 25, 52,-17; /M: SY='G'; M= -8, 6,-29, 7, 3,-29, 18, 0,-34, 4,-28,-17, 9,-15, -2, -2, -2,-14,-28,-26,-18, 0; /M: SY='L'; M= -4,-28,-19,-29,-19, 7,-27,-20, 17,-28, 44, 17,-28,-28,-19,-20,-26, -9, 9,-20, -2,-19; /M: SY='E'; M= -3, 4,-25, 4, 20,-22,-15, -1,-22, 12,-21,-13, 3,-10, 12, 3, 2, -5,-21,-22, -7, 15; /M: SY='I'; M= -3,-23,-24,-29,-21, -7,-30,-24, 24,-12, 6, 9,-17,-20,-15,-11,-13, -7, 21,-22, -6,-21; /M: SY='L'; M= -8,-30,-20,-32,-24, 6,-32,-24, 29,-28, 35, 18,-28,-28,-22,-22,-24, -8, 23,-22, -2,-24; /M: SY='A'; M= 20, -1,-18, -2, 7,-23,-10,-14,-15, 0,-14,-12, -6,-10, -3,-10, 3, -4, -6,-25,-18, 2; /M: SY='R'; M=-16, 9,-30, 15, 18,-28,-18, 8,-32, 20,-24,-15, 5,-12, 10, 24, -6,-11,-25,-27,-11, 12; /M: SY='N'; M= -9, 23,-24, 18, 1,-24, -1, -2,-21, -1,-26,-18, 28,-16, -3, -5, 5, -4,-22,-34,-18, -1; /M: SY='I'; M= -8,-26,-26,-33,-22, -3,-36,-27, 39,-24, 14, 14,-20,-20,-18,-25,-16, -8, 29,-23, -4,-24; /M: SY='Q'; M= 5, 1,-21, -1, 13,-26,-13, -4,-15, 0,-18, -9, 3,-11, 17, -4, 7, -3,-14,-27,-16, 15; /M: SY='D'; M=-18, 48,-28, 60, 16,-36, -8, 2,-36, 0,-30,-28, 28,-12, 0, -8, 2, -8,-30,-40,-20, 8; /M: SY='K'; M=-10,-10,-25, -9, 0,-10,-22, -3,-11, 8, -9, -4, -9,-18, 3, 8, -8, -6, -9,-13, 8, 0; /M: SY='R'; M= -6,-11,-26,-11, -4,-20, -9,-10,-22, 10,-16,-10, -5, -7, -1, 24, -5, -7,-16,-23,-15, -5; /M: SY='N'; M= -8, 16,-25, 14, -3,-27, 14, -5,-25, -7,-25,-17, 20,-18, -4, -9, 2, -9,-22,-31,-21, -3; /M: SY='N'; M= 2, 30,-18, 12, -2,-20, 0, 4,-18, -2,-26,-18, 46,-18, -2, -4, 10, 0,-24,-36,-20, -2; /M: SY='R'; M=-10,-11,-22,-15, -9, 0,-20, -1,-11, -2,-12, -6, -3,-18, -6, 7, 0, 1, -8,-21, 0, -9; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='R'; M=-19, -9,-30, -9, 2,-22,-20, 1,-29, 28,-20, -9, 0,-19, 16, 63, -9,-10,-21,-20,-10, 5; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='I'; M= -7,-31,-21,-33,-27, 4,-31,-27, 27,-25, 21, 12,-29,-28,-24,-22,-21, -8, 26, -8, -1,-26; /M: SY='I'; M= -1,-28,-19,-32,-25, 1,-30,-26, 30,-25, 23, 14,-25,-25,-22,-23,-17, -6, 27,-23, -5,-25; /M: SY='L'; M= -8,-30,-21,-33,-25, 5,-33,-25, 31,-28, 33, 18,-27,-27,-22,-23,-23, -8, 24,-22, -2,-25; /M: SY='G'; M= 14, -7,-22,-10, -8,-27, 23,-15,-26, -6,-23,-14, -2,-14, -4,-11, 6, -8,-18,-22,-22, -6; /M: SY='R'; M= -5, -6,-27, -6, 4,-26,-16, -7,-25, 21,-24,-11, -2, -2, 11, 25, -2, -6,-19,-23,-14, 6; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 48 in 48 different sequences |
| Number of true positive hits | 48 in 48 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | PS_Langendijk_Genevaux |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Prephenate dehydratase |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
48 sequences
AROD1_ARATH (Q9SA96), AROD1_PETHY (D3U715), AROD2_ARATH (Q9SSE7), AROD2_PETHY (D3U716), AROD3_ARATH (Q9ZUY3), AROD3_PETHY (D3U717), AROD4_ARATH (O22241), AROD5_ARATH (Q9FNJ8), AROD6_ARATH (Q9SGD6), CMPDT_AQUAE (O67085), CMPDT_BUCAI (P57472), CMPDT_BUCAP (Q8K9F8), CMPDT_BUCBP (Q89AE5), CMPDT_ECO57 (P0A9J9), CMPDT_ECOLI (P0A9J8), CMPDT_ENTAG (Q02286), CMPDT_HAEIN (P43900), CMPDT_NEIG1 (Q9ZHY3), CMPDT_PSEAE (Q9HZ67), CMPDT_SHIFL (P0A9K0), CMPDT_STUST (P27603), GQQA_KOMEU (A0A0M0ELU2), PHA2_SCHPO (O14361), PHA2_YEAST (P32452), PHEA_AMYME (Q44104), PHEA_BACSU (P21203), PHEA_CORGL (P10341), PHEA_LACLA (Q9CEU2), PHEA_LACLM (P43909), PHEA_METJA (Q58054), PHEA_MYCA1 (A0Q994), PHEA_MYCA9 (B1MEG8), PHEA_MYCBO (Q7TVJ6), PHEA_MYCBP (A1KQH3), PHEA_MYCGI (A4T6G3), PHEA_MYCLB (B8ZTU2), PHEA_MYCLE (Q9CDC4), PHEA_MYCMM (B2HMM5), PHEA_MYCPA (Q745J2), PHEA_MYCS2 (A0R643), PHEA_MYCSJ (A3Q7Q1), PHEA_MYCSK (A1UNA3), PHEA_MYCSS (Q1B1U6), PHEA_MYCTA (A5U9G7), PHEA_MYCTO (P9WIC2), PHEA_MYCTU (P9WIC3), PHEA_MYCUA (A0PX17), PHEA_MYCVP (A1TGX7)» more
|
| PDB [Detailed view] |
2 PDB
7ALZ; 7AM0 |