PROSITE entry PS51187
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | AUTOINDUCER_SYNTH_2 |
| Accession [info] | PS51187 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-MAR-2006 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00731 |
| Associated ProRule [info] | PRU00533 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Autoinducer synthase family profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=179; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=174; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0832906; R2=0.0184168; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9227.4169922; R2=14.4733143; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=702; H_SCORE=19388; N_SCORE=15.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=240; H_SCORE=12701; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-29,-20, -1,-16, -1, 17,-10, 18, 56,-19,-20, -1,-10,-19,-10, 8,-20, -1,-10; /M: SY='I'; M= -7,-24,-23,-27,-20, -1,-29,-19, 19,-19, 15, 10,-19,-18,-16,-14,-15, -6, 14,-22, -4,-20; /M: SY='R'; M= -8, -9,-23, -9, 1,-12,-21, -3, -6, -3, -7, -1, -7,-16, 0, 2, -3, -3, -4,-25, -6, -1; /M: SY='I'; M= -8,-23,-23,-28,-19, 2,-28,-20, 21,-22, 15, 11,-18,-22,-14,-20,-14, -4, 15,-19, 0,-19; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='I'; M= -7,-21,-18,-25,-19, 4,-26,-19, 18,-16, 11, 8,-17,-21,-15,-13,-12, -2, 17,-18, 0,-18; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='D'; M= -7, 4,-22, 5, -1,-19,-17, -6,-14, -2,-15,-11, 3,-12, -2, -1, 4, 4,-10,-29,-10, -3; /M: SY='A'; M= 3,-10,-24,-11, -5,-21, 1, -6,-20, -2,-18,-11, -6,-11, -4, -1, -1, -8,-13,-18,-14, -6; /M: SY='D'; M= -2, 12,-22, 14, 6,-25, -6, -3,-26, 1,-23,-18, 10,-13, 0, 1, 9, 0,-19,-32,-17, 2; /M: SY='N'; M=-10, 6,-24, 2, -2, -9,-11, 2,-14, -7,-10, -8, 10,-17, -2, -6, -4, -6,-18,-22, -1, -3; /M: SY='R'; M= -1, -5,-22, -7, 1,-15,-15, -7,-13, 0, -9, -7, -3,-16, 1, 4, -1, -2,-10,-22, -7, 0; /M: SY='E'; M= 1, -3,-23, -2, 9,-22, -9, -3,-19, -1,-15,-11, -2, -9, 3, -3, 3, -3,-16,-27,-14, 5; /M: SY='L'; M=-10,-15,-20,-18, -7, -5,-24, -5, -1, -9, 8, 6,-12,-18, -5, -2,-14, -8, -4,-22, -4, -7; /M: SY='H'; M=-14, -4,-30, -1, -5, -9,-15, 15,-17, -9,-18,-10, -4, 2, -4,-10, -7, -9,-20,-14, 13, -8; /M: SY='E'; M= 2, -1,-24, 0, 5,-24,-13, -6,-20, 2,-19,-13, -2, -1, 1, 5, 3, -3,-15,-27,-16, 2; /M: SY='E'; M= 2, 3,-22, 4, 11,-22,-10, -7,-24, 6,-19,-14, 0,-10, 2, 1, 3, 0,-16,-26,-14, 6; /M: SY='L'; M= -4,-19,-20,-22,-15, 0,-25,-18, 10,-16, 13, 6,-19,-22,-15,-13,-13, -3, 10,-16, -1,-16; /M: SY='L'; M= -7,-20,-21,-23,-14, 8,-24,-14, 8,-17, 17, 12,-18,-23,-13,-14,-15, -7, 4,-16, 3,-14; /M: SY='D'; M= -8, 9,-26, 13, 12,-24,-11, 0,-24, 5,-18,-13, 4,-13, 5, 4, -3, -8,-20,-26,-11, 8; /M: SY='Q'; M= -4, 2,-26, 5, 17,-29, -9, -3,-24, 3,-21,-11, 0, -5, 18, 3, 3, -5,-23,-26,-17, 17; /M: SY='M'; M= -7,-23,-21,-28,-19, 5,-25, -6, 16,-18, 23, 29,-21,-24, -9,-15,-20, -9, 8,-16, 6,-15; /M: SY='F'; M=-13,-21,-23,-26,-21, 34,-16, 1, -7,-22, 3, -1,-14,-26,-22,-16,-15,-11, -8, 0, 25,-21; /M: SY='R'; M= -9, -5,-21, -6, 3,-21,-15, -4,-26, 19,-20,-11, 1,-16, 5, 32, -2, -5,-17,-25,-12, 1; /M: SY='L'; M= -9,-24,-22,-27,-20, 15,-26,-15, 13,-25, 27, 12,-23,-27,-19,-19,-22,-10, 6,-11, 11,-20; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='H'; M= -4, -3,-26, -6, -2,-16,-15, 29,-22, 8,-19, -6, 1,-17, 3, 5, -6,-11,-19,-18, 9, -2; /M: SY='E'; M= -6, 1,-27, 3, 18,-27,-19, -5,-22, 15,-19,-11, -1,-10, 16, 13, -2, -5,-19,-24,-13, 16; /M: SY='V'; M= -1,-24,-16,-28,-23, -5,-29,-25, 25,-18, 7, 9,-22,-24,-17,-19, -8, 0, 33,-26, -8,-21; /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29, 76,-30,-17, 0,-28, 9, 0,-20,-30,-38,-19,-20,-10, -1, 12, 34,-29; /M: SY='V'; M= -1,-15,-20,-17,-13,-13,-20,-14, 4, -2, -7, 0,-12,-19,-11, -5, -4, -3, 12,-26, -9,-13; /M: SY='D'; M=-14, 25,-29, 35, 22,-34, -8, -2,-34, 8,-26,-22, 11, -9, 7, 1, -1, -9,-28,-32,-18, 14; /M: SY='R'; M=-16, -5,-29, -5, 11,-22,-20, -1,-28, 24,-20,-10, 0,-15, 15, 46, -7, -8,-22,-21,-10, 10; /M: SY='L'; M=-12,-23,-23,-23,-13, 0,-27,-15, 6,-11, 29, 13,-22,-26,-11, 1,-24,-10, 2,-20, -3,-13; /M: SY='G'; M= -5, -2,-30, -1, -4,-30, 34,-13,-36, 0,-28,-17, 3,-16, -6, -2, -2,-16,-28,-22,-23, -5; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='D'; M=-12, 18,-27, 25, 14,-29,-15, 0,-28, 4,-22,-16, 8, -6, 5, 3, 0, -3,-23,-31,-15, 8; /M: SY='V'; M= 1,-20,-15,-20,-21, -4,-25,-24, 18,-20, 13, 7,-22,-25,-22,-19,-11, -2, 26,-27, -9,-22; /M: M= -7,-11,-25, -8, 0,-15,-22,-10, -6, -7, -5, -4,-11, -1, -1, -8, -7, -7, -7,-26,-11, -2; /M: SY='V'; M= -3,-13, -4,-15,-13,-12,-19,-19, -1,-11, -7, -3,-11,-21,-13, -9, 0, 3, 8,-31,-14,-14; /M: SY='R'; M= -7, -4,-20, -6, -3,-17,-16, -5,-15, 0,-15, -9, 0,-11, -1, 7, 0, 0,-12,-26, -9, -4; /M: SY='D'; M= -8, 9,-29, 15, 9,-31, -4, -3,-28, -1,-26,-18, 5, 8, 4, -4, 0, -9,-27,-30,-20, 5; /M: SY='G'; M= -6, 6,-29, 9, -2,-30, 27, -6,-32,-10,-26,-19, 6,-13, -7,-12, -1,-15,-27,-26,-22, -6; /M: SY='M'; M=-13,-20,-26,-22,-12, 5,-25, -6, 0, -6, 7, 11,-16,-23, -6, 4,-18,-11, -4, -3, 10,-10; /M: SY='E'; M=-10, 11,-30, 22, 59,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 1, 0, 19, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 39; /M: SY='I'; M=-12,-21,-26,-25,-17, 2,-26,-17, 3, -8, -2, 2,-14,-22,-10, 3,-12, -6, 2, -3, 1,-15; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='Q'; M= -8, 0,-27, 1, 17,-27,-14, 3,-24, 9,-20, -9, 2,-11, 26, 13, 2, -6,-24,-24,-12, 21; /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-30,-25, 55,-30, 0, 0,-20, 5, 0,-20,-30,-25,-15,-20,-10, -5, 20, 55,-25; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='B'; M= -4, 17,-17, 14, 2,-24, -6, -1,-24, -3,-22,-17, 16,-15, -3, -4, 5, 1,-19,-33,-17, -1; /M: SY='P'; M= -4, -6,-27, -2, 7,-19,-15,-12,-14, -9, -8,-10, -9, 11, -2,-13, -7, -8,-17,-26,-17, 1; /M: SY='D'; M= -8, 20,-25, 23, 10,-29, -7, 7,-29, 4,-26,-18, 16,-13, 5, 1, 3, -7,-24,-32,-15, 7; /M: SY='P'; M= 11, -9,-19,-12, -7,-19,-14,-20,-13,-10,-17,-13, -8, 20,-10,-16, 9, 17,-10,-28,-19,-10; /M: SY='V'; M= -5,-19,-20,-22,-15, -5,-26,-11, 9,-13, 7, 5,-15,-22,-12, -6, -9, -2, 11,-23, -3,-16; /M: SY='Y'; M=-20,-18,-31,-18,-18, 22,-28, 30, -5,-10, -3, -1,-16,-29, -8, -9,-19,-12,-13, 26, 70,-17; /M: SY='I'; M= -7,-28,-19,-31,-24, 3,-31,-20, 27,-25, 27, 20,-26,-27,-20,-20,-21, -7, 25,-23, -2,-23; /M: SY='L'; M= -7,-27,-15,-30,-24, 11,-30,-19, 19,-23, 21, 13,-25,-28,-22,-20,-18, -5, 19,-17, 6,-24; /M: SY='A'; M= 13,-15, -9,-21,-17,-13, -2,-20, -7,-17, -7, -6,-12,-19,-15,-20, -1, -3, -3,-13,-11,-16; /M: SY='L'; M= -9,-18,-16,-20,-11, -5,-27,-10, 6,-12, 8, 7,-15,-22, -7, -9,-13, -8, 4,-23, -3,-10; /M: SY='D'; M=-12, 20,-21, 28, 13,-28, -9, -6,-29, -1,-25,-21, 10,-13, 0, -6, 2, -5,-22,-29,-18, 6; /M: SY='D'; M=-11, 12,-24, 16, 14,-28,-10, -6,-27, 2,-25,-19, 7, 2, 2, -2, 1, -6,-24,-32,-20, 7; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='G'; M= -5, -1,-29, 0, -1,-27, 26,-12,-32, -6,-24,-17, 2,-16, -6, -4, -2,-13,-26,-20,-22, -4; /M: SY='R'; M=-11, 0,-27, 1, 8,-25,-14, -2,-24, 13,-21,-11, 1,-14, 11, 21, -1, -4,-19,-25,-12, 8; /M: SY='I'; M= -7,-28,-20,-30,-25, 0,-32,-19, 28,-24, 19, 13,-25,-23,-22,-21,-17, -7, 28,-25, -4,-25; /M: SY='V'; M= -5,-20, 4,-25,-23, -4,-24,-22, 7,-17, 2, 2,-17,-27,-21,-14, -9, -2, 15,-28, -9,-23; /M: SY='G'; M= 7,-11,-17,-13,-19,-28, 53,-21,-35,-19,-26,-19, -3,-20,-19,-21, 1,-16,-24,-22,-29,-19; /M: SY='C'; M= -4,-13, 40,-17,-19,-16, -4,-17,-26,-20,-22,-18, -8,-27,-18,-20, 5, -3,-14,-33,-15,-19; /M: SY='M'; M= 1,-22,-21,-25,-17, -3,-18,-14, 5,-17, 7, 9,-20,-22,-11,-16,-12, -8, 5, -4, -3,-14; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='L'; M= -7,-28,-20,-31,-21, 14,-28,-20, 18,-28, 39, 17,-27,-28,-21,-20,-25, -9, 10,-17, 2,-21; /M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-29,-21, 7,-30,-18, 20,-24, 34, 17,-26,-27,-18,-16,-24, -7, 12,-18, 3,-20; /M: SY='P'; M= -9,-11,-36, -2, 4,-30,-17,-15,-22, -7,-29,-20,-11, 65, -5,-14, -5, -8,-28,-31,-27, -5; /M: SY='T'; M= 3, -2, -6,-11,-10,-11,-18,-20,-10,-11,-10,-10, -2,-12,-10,-12, 18, 41, -1,-31,-12,-10; /M: SY='T'; M= -3, -2, -7, -8,-10,-12,-20,-16, -8,-10, -6, -5, -3,-16, -9,-11, 7, 24, -1,-30,-11, -9; /M: SY='G'; M= -4, -5,-27, -4, -5,-22, 16,-12,-29, 3,-23,-14, -2,-17, -7, 4, -3,-12,-20,-20,-16, -6; /M: SY='P'; M= -8,-13,-36, -5, 2,-29,-18,-16,-22, -6,-28,-19,-14, 66, -7,-12, -7, -9,-27,-30,-27, -6; /M: SY='H'; M=-12, 0,-22, -6, -9, -2,-19, 25,-12, -9,-13, -6, 6,-21, -4, -6, -1, 5,-14,-14, 22, -9; /M: SY='M'; M=-10,-24,-20,-30,-20, 4,-24, -9, 20,-19, 33, 42,-24,-24, -9,-14,-24,-10, 10,-20, 0,-14; /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-31,-21, 7,-29,-18, 23,-27, 42, 26,-27,-27,-17,-19,-27,-10, 12,-20, 0,-19; /M: SY='S'; M= -3, 3,-22, 3, 5,-23, -5, -5,-25, 5,-26,-16, 7, -9, 1, 3, 11, 3,-18,-29,-14, 2; /M: SY='D'; M=-13, 28,-28, 38, 17,-33, 0, 1,-35, -2,-27,-24, 15,-11, 2, -8, 3, -8,-28,-35,-19, 9; /M: SY='V'; M= 0,-20,-15,-23,-19, -6,-27,-25, 17,-17, 3, 4,-19,-18,-20,-18, -3, 9, 28,-28,-10,-20; /M: SY='F'; M=-19,-29,-21,-38,-28, 70,-30,-18, 2,-29, 14, 2,-21,-30,-36,-19,-21,-10, 0, 8, 30,-28; /M: SY='P'; M= -5,-13,-29, -9, -2,-23,-13,-14,-21, -5,-25,-16, -9, 38, -4, -4, 1, -3,-22,-28,-22, -6; /M: SY='H'; M=-10, -1,-25, 1, 7,-12,-19, 19,-17, -7,-14, -7, -1,-12, 2, -7, -2, -5,-15,-23, 4, 2; /M: SY='L'; M= -7,-27,-15,-30,-21, 12,-29,-20, 16,-27, 34, 13,-26,-28,-21,-21,-23, -8, 10,-18, 2,-21; /M: SY='L'; M= -7,-22, 2,-28,-22, 13,-26,-19, 5,-24, 18, 8,-20,-28,-22,-19,-17, -6, 6,-21, -2,-21; /M: SY='D'; M= -4, 6,-24, 9, -2,-26, 9, -6,-28, -7,-22,-17, 4,-12, -6, -8, 4, -3,-20,-29,-18, -5; /M: SY='G'; M= -8, 4,-24, 10, -1,-29, 18, -8,-31, -8,-24,-17, 2,-14, -7, -9, -2,-13,-22,-28,-21, -5; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='A'; M= 5, -4,-20, -7, 0,-19, -3, -7,-14, -2,-15, -8, 0, -7, 0, -2, 2, -4,-11,-22,-15, -1; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='P'; M= 2,-12,-27,-11, -4,-22,-14,-18,-10,-11,-16,-12,-11, 28, -8,-17, -2, -2,-12,-27,-21, -9; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='A'; M= 7,-11,-16,-13, -8,-10,-13,-14, 0,-10, 0, -2,-10, -3, -9,-11, -4, -4, 0,-19,-11, -9; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='P'; M= -8,-22,-35,-16, -7,-22,-23,-22, -6,-14,-17,-11,-21, 61,-13,-21,-12, -9,-15,-28,-23,-14; /M: SY='R'; M= -7, -6, -9, -7, 2,-22,-19, -5,-22, 9,-19,-11, -2,-17, 6, 21, -3, -5,-15,-27,-14, 2; /M: SY='S'; M= 2, 4,-21, 6, 1,-23, 4, -2,-26, -5,-25,-17, 7,-14, -2, -3, 13, 0,-18,-29,-15, -2; /M: SY='P'; M= 2,-10,-29, -8, -3,-26, -9,-11,-20, -7,-26,-17, -7, 39, -7,-14, 0, -5,-22,-29,-23, -8; /M: SY='D'; M= -6, 10,-24, 13, 8,-23,-10, 1,-23, -1,-18,-14, 5,-13, 3, -2, 2, -2,-19,-28,-11, 5; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='I'; M= -6,-27,-13,-32,-27, -1,-31,-25, 31,-23, 15, 18,-23,-24,-21,-22,-15, -5, 30,-24, -5,-26; D=-14; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='W'; M=-14,-32,-37,-33,-25, 12,-21,-20, -9,-18, -7, -8,-32,-27,-18,-17,-30,-21,-15, 89, 26,-19; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='E'; M=-10, 11,-30, 21, 59,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 1, 0, 19, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 39; /M: SY='L'; M= -1,-21,-15,-24,-18, -4,-16,-20, 1,-20, 3, 2,-18,-22,-14,-18, -8, -5, 0, 0, -5,-16; /M: SY='T'; M= 6, 0,-10, -4, -4,-16, -8,-14,-16,-10,-22,-16, 6,-10, -4,-10, 32, 33, -6,-36,-16, -4; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='F'; M=-18,-29,-21,-37,-28, 63,-30,-16, 4,-27, 13, 5,-21,-29,-33,-19,-21,-10, 2, 7, 30,-27; /M: SY='C'; M= 11,-17, 26,-26,-20, 4,-17,-22,-14,-21,-10,-11,-13,-24,-22,-22, 0, -2, -4,-24,-11,-20; /M: SY='V'; M= 1,-26,-15,-29,-25, -1,-27,-25, 25,-20, 13, 12,-24,-25,-22,-20,-10, 0, 32,-26, -8,-24; /M: SY='D'; M= -6, 16,-22, 22, 3,-24, -9, -1,-22, -6,-22,-17, 9,-14, -3, -7, 8, -2,-14,-33,-13, -1; /M: SY='P'; M= -4, -9,-27, -8, 0,-22,-14,-11,-18, 2,-20,-11, -7, 16, -3, -1, -1, 2,-16,-26,-17, -4; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='S'; M= -1, 0,-23, 1, -2,-20, -1, -3,-23, -6,-24,-17, 4, -5, -4, -6, 9, -1,-19,-23,-11, -4; /M: SY='E'; M= -7, -4,-28, -2, 4,-21,-17, -4,-16, -1,-16,-11, -2, 4, 3, 1, -5, -8,-18,-22,-12, 2; /M: SY='V'; M= 2,-18,-15,-22,-18, -7,-21,-21, 11,-18, 8, 3,-15,-19,-17,-16, -9, -3, 12,-25,-10,-19; /M: SY='T'; M= 6, -3,-11, -9,-10,-10, -7,-16,-15,-11,-14,-12, -1,-14,-11,-11, 12, 19, -6,-26,-11,-11; /M: SY='M'; M= -3,-11,-17,-14, -9, -9, -9, -8, -9, -8, -2, 1, -6,-20, -5, -2, -5, -5, -9,-21, -6, -8; /M: SY='E'; M= -3, -8,-24, -8, 9,-15,-20, -9, -7, -3, -4, 1,-10, -8, 4, -6, -7, -7, -9,-23,-11, 6; /M: SY='L'; M= -8,-28,-20,-31,-21, 8,-29,-19, 22,-27, 39, 22,-27,-27,-19,-20,-25, -9, 14,-20, -1,-20; /M: SY='F'; M=-11,-27,-19,-33,-24, 33,-27,-17, 12,-25, 25, 19,-24,-27,-24,-18,-22, -9, 8, -9, 10,-22; /M: SY='A'; M= 2,-18, -8,-22,-14, -7,-20,-19, -2,-16, 2, -2,-15,-19,-11,-13, -6, -1, -1,-16, -9,-13; /M: SY='A'; M= 18, -6,-18, -8, -5,-24, 18,-16,-24, -9,-23,-16, -1,-12, -7,-14, 13, -2,-14,-26,-22, -6; /M: SY='I'; M= -6,-25,-20,-30,-23, 2,-25,-20, 24,-23, 21, 21,-22,-24,-18,-20,-17, -6, 20,-22, -3,-22; /M: SY='I'; M= -4,-21,-11,-25,-19, 0,-21,-12, 8,-19, 6, 6,-18,-24,-13,-17,-13, -8, 8,-17, 3,-17; /M: SY='E'; M= -7, 11,-27, 14, 29,-28,-15, 1,-27, 12,-22,-16, 8, -8, 13, 7, 1, -7,-25,-29,-16, 20; /M: SY='Y'; M=-15,-23,-15,-28,-23, 24,-27, -5, -5,-20, -2, -2,-20,-28,-21,-16,-17, -7, -4, 17, 25,-22; /M: SY='A'; M= 29,-10, -6,-16,-12,-21, 12,-19,-18,-13,-16,-12, -6,-14,-12,-19, 10, -2, -8,-25,-22,-12; /M: SY='L'; M= -5,-15,-24,-17, -4,-11,-23, -5, 1, -9, 9, 9,-14,-19, 4, -8,-13, -9, -4,-18, -4, -1; /M: SY='Q'; M= 4, 3,-21, 3, 2,-22, -9, -7,-16, -4,-13,-10, 2,-14, 5, -6, 4, -3,-13,-26,-13, 3; /M: SY='N'; M= -5, 1,-22, -5, -1,-14,-14, 2,-13, -2,-12, -7, 9,-17, 5, 3, 1, -3,-15,-25, -8, 1; /M: SY='G'; M= -1, -2,-29, -2,-14,-29, 52,-13,-37,-15,-29,-19, 5,-19,-15,-16, 0,-17,-29,-23,-26,-15; /M: SY='I'; M= -2,-26,-23,-32,-24, 2,-30,-21, 29,-24, 19, 14,-22,-23,-18,-23,-17, -8, 20,-16, 4,-24; /M: SY='N'; M= -5, 7,-17, 4, 4,-23,-11, -4,-23, 2,-21,-14, 9,-13, 4, 4, 9, 9,-17,-30,-15, 3; /M: SY='E'; M= -2, 3,-23, 2, 9,-24, -5, -1,-24, 0,-20,-14, 5,-12, 6, 2, 6, 2,-19,-28,-15, 7; /M: SY='I'; M= -9,-27,-24,-32,-26, 10,-33,-18, 28,-24, 18, 14,-23,-25,-20,-22,-19, -8, 20,-11, 14,-25; /M: SY='V'; M= 2,-20,-17,-24,-19, -4,-25,-21, 18,-18, 3, 4,-17,-21,-17,-19, -4, 1, 23,-23, -4,-20; /M: SY='T'; M= 9,-11,-14,-17,-15,-14, -1,-21, -6,-16, -9, -7, -7,-15,-14,-18, 7, 11, 0,-26,-16,-15; /M: SY='V'; M= 0,-24,-16,-28,-23, -2,-28,-26, 25,-19, 9, 8,-22,-25,-21,-20,-10, -3, 33,-26, -8,-23; /M: SY='V'; M= -2,-17,-11,-23,-19, 2,-23,-18, 8,-17, 2, 5,-15,-21,-17,-16, -1, 10, 13,-22, 0,-19; /M: SY='D'; M= -7, 18,-22, 23, 13,-24,-12, -6,-25, -2,-23,-20, 10, -8, 0, -7, 10, 5,-18,-34,-17, 7; /M: SY='T'; M= -2,-16,-20,-17,-11, -9,-21,-16, -1,-12, 0, -2,-14, -7,-12,-11, -3, 6, 3,-22,-10,-13; /M: SY='A'; M= 1,-16,-24,-19,-13, -6, -5,-14,-14, -9,-12, -9,-11,-12,-10, -4, -5, -7,-11, -4, -4,-12; /M: SY='M'; M=-11,-25,-22,-31,-23, 3,-23,-14, 11,-15, 10, 26,-23,-25,-12,-13,-22,-13, 5, 13, 4,-17; /M: SY='E'; M= -8, -5,-26, -1, 21,-16,-23, -8, -8, -4, -1, -3,-10, -8, 2, -8, -8, -8,-11,-25,-11, 11; /M: SY='R'; M=-13,-10,-29, -9, -1,-21,-20, -5,-24, 20,-19, -9, -4, -3, 4, 36, -8, -6,-17,-23,-12, -2; /M: SY='I'; M=-10,-24,-25,-29,-21, 0,-31,-19, 22,-15, 13, 13,-18,-23,-14, -8,-17, -8, 16,-18, 1,-21; /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-31,-23, 24,-29,-14, 15,-25, 28, 13,-25,-29,-22,-19,-23, -9, 8, -7, 17,-22; /M: SY='R'; M=-10, -7,-26, -8, 2,-21,-20, -7,-19, 21,-16, -5, -2,-16, 7, 30, -6, -6,-12,-22,-10, 3; /M: SY='R'; M=-15, -8,-29, -8, 1,-21,-20, -2,-23, 22,-16, -7, -2,-18, 12, 44, -9,-10,-18,-19, -8, 4; /M: SY='A'; M= 6,-13,-11,-19,-14, -7,-13,-16, 1,-18, 2, 2, -8,-19,-12,-17, 1, 0, 2,-27,-11,-13; /M: SY='G'; M= -2, -9,-30, -9,-17,-29, 58,-15,-38,-15,-29,-18, 0,-19,-16,-14, -1,-18,-29,-21,-26,-17; /M: SY='W'; M=-12,-30,-24,-33,-27, 13,-24,-25, -2,-21, -4, -7,-27,-29,-23,-20,-23,-15, -4, 52, 14,-23; /M: SY='R'; M= -8, -6,-27, -5, 3,-20,-16, -7,-17, 4,-18,-10, -3, 1, 2, 8, -4, -6,-15,-25,-14, 0; /M: SY='I'; M= -3,-24,-10,-27,-21, -1,-24,-18, 10,-21, 8, 6,-22,-13,-20,-21,-14, -8, 10,-23, -6,-22; /M: SY='R'; M=-11, 4,-26, 6, 14,-24,-17, 15,-27, 10,-21,-12, 5,-12, 11, 16, 0, -4,-22,-28, -8, 10; /M: SY='R'; M=-13,-12,-28,-10, 0,-20,-19, -9,-19, 10,-18,-10, -8, 2, 0, 28, -7, -6,-13,-25,-15, -3; /M: SY='L'; M= -6,-27,-21,-30,-21, 7,-28,-19, 19,-24, 32, 17,-25,-26,-18,-16,-22, -9, 12,-18, 1,-20; /M: SY='G'; M= 6, -7,-26, -9,-14,-27, 46,-18,-32,-14,-26,-17, 1,-18,-15,-16, 2,-14,-23,-22,-26,-14; /M: SY='P'; M= -9, -5,-27, -1, 0,-19,-14,-10,-15, -8,-14,-11, -7, 8, -6, -9, -3, -3,-13,-28,-15, -5; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='P'; M= 6,-17,-23,-16,-10,-18,-11,-16, -6,-12,-13, -7,-16, 24,-13,-18, -5, -6, -5,-24,-19,-13; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='H'; M= -8,-10,-24,-11, -2,-13,-22, 7, -8, -3, -3, 2, -7,-18, 4, 2, -9, -8, -8,-23, -3, 0; /M: SY='R'; M= -7, -8,-23, -7, 0,-19,-11,-10,-16, 2, -9, -4, -7, -9, 0, 4, -8,-10,-14,-24,-14, -1; /M: SY='I'; M= -8,-17,-23,-19,-13, -5,-26, -8, 12,-17, 4, 9,-14,-14,-11,-16, -9, -4, 8,-22, 1,-14; /M: SY='G'; M= -5, 3,-29, 7, 3,-30, 23,-12,-34, -3,-27,-19, 3, -7, -5, -9, -1,-12,-27,-26,-24, -1; /M: SY='G'; M= -4, 2,-25, -1, -6,-22, 14,-11,-24, -1,-23,-15, 9,-17, -7, -3, 0, -9,-19,-25,-19, -7; /M: SY='E'; M= -6, 1,-19, 3, 11,-20,-10,-10,-19, -2,-14,-10, -4,-12, -2, -6, 0, 0,-12,-27,-14, 5; /M: SY='R'; M= -9, -5,-27, -4, 0,-21,-16, -8,-21, 7,-19,-12, -3, -4, 1, 16, -2, 0,-16,-20,-12, -1; /M: SY='V'; M= 7,-20,-16,-25,-20, -6,-20,-24, 15,-20, 7, 4,-17,-20,-18,-20, -4, 2, 19,-25,-10,-20; /M: SY='V'; M= -6,-26,-14,-29,-25, 4,-28,-18, 22,-20, 13, 16,-24,-27,-20,-18,-13, -4, 26,-21, 2,-23; /M: SY='A'; M= 29,-15,-11,-21,-14,-13, -5,-19, -5,-15, -2, -5,-15,-14,-14,-20, 0, -4, 2,-20,-13,-14; /M: SY='L'; M= -3,-23,-12,-26,-23, -3, -2,-23, 2,-25, 9, 2,-18,-26,-23,-22,-14,-11, 4,-22,-11,-23; /M: M= -7,-13,-23,-15, -6, -4,-20,-10, -9, -8, 0, -3,-11,-19, -6, -2, -8, -1, -9, -6, -3, -6; /M: SY='I'; M= -8,-29,-24,-34,-25, 13,-28,-22, 19,-24, 18, 14,-25,-25,-21,-21,-21,-10, 13, 1, 5,-23; /M: SY='P'; M= -8, 5,-30, 13, 18,-30,-16, 0,-26, -2,-25,-18, -2, 22, 4, -9, -1, -7,-26,-31,-19, 9; /M: SY='V'; M= -1,-26, -1,-32,-26, 4,-28,-26, 18,-24, 11, 8,-24,-27,-25,-23,-13, -5, 23,-24, -7,-26; /M: SY='D'; M= -6, 17,-21, 19, 2,-24, -2, -4,-26, -7,-25,-20, 14,-11, -4,-10, 13, 8,-19,-34,-16, -2; /M: SY='E'; M= -6, 2,-24, 7, 15,-26,-17, -5,-23, 2,-18,-15, -2, 4, 5, 2, -2, -6,-22,-28,-18, 9; /M: SY='E'; M= -3, 11,-24, 14, 19,-27,-14, -4,-23, 4,-19,-16, 6,-10, 8, 1, 3, -4,-20,-29,-17, 13; /M: SY='T'; M= 0, -1,-15, -7, -9, -7,-16,-11,-10, -9, -9, -9, 1,-16,-10, -8, 7, 17, -3,-26, -7,-10; /M: SY='L'; M=-10,-19,-13,-22,-15, -2,-23, -9, -2,-13, 8, 3,-16,-26,-10, -5,-17,-10, -2,-13, 0,-13; /M: SY='K'; M= 2, -4,-25, -6, 9,-24,-15, -8,-17, 10,-15, -8, -3, -9, 9, 8, -3, -8,-15,-23,-14, 8; /M: SY='A'; M= 7, -5,-22, -8, 3,-23, -8, -9,-19, 3,-17,-11, -2,-10, 6, 6, 4, -1,-14,-24,-16, 3; /M: SY='L'; M= -4,-26,-19,-29,-21, 1,-27,-21, 21,-23, 25, 17,-24,-22,-18,-20,-17, -4, 18,-23, -5,-21; /M: SY='R'; M= -9, -7,-15, -9, -6,-17, -9, -9,-21, 4,-13,-10, -2,-20, -4, 17, -5, -5,-15,-24,-12, -7; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Post-processing [info]
| COMPETES_HIT_WITH | PS51186; PS51191; PS51729; PS51730; PS51731 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 29 in 29 different sequences |
| Number of true positive hits | 29 in 29 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | PS_Langendijk_Genevaux |
| Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Version [info] | 6 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
29 sequences
ABAI_ACIBA (B0FLN1), AHYI_AERHY (Q44058), ANOI_ACINO (A0A0A7XNA3), ASAI_AERSA (P70774), BJAI_BRADU (Q89VI2), CARI_PECCC (P33880), EAGI_ENTAG (P33881), ECHI_DICCH (Q46968), ESAI_PANSE (P54656), EXPI_DICD3 (Q47187), EXPI_PECPM (P33882), LASI_PSEAE (P33883), LUXI_ALIFS (P12747), LUXJ_ALIF1 (P35328), PHZI_PSECL (Q51522), PHZI_PSEFL (Q51785), PSYI_PSEAJ (P52990), RAII_RHIET (O54451), RHLI_PSEAE (P54291), RPAI_RHOPA (Q6NCZ6), SOLI_RALN1 (P58584), SOLI_RALSL (O30920), SWRI_SERLI (P52989), TRAI_AGRFC (P33907), TRAI_RHIRD (P33904), TRAI_SINFN (P55394), VANI_VIBAN (P74945), YENI_YEREN (P52988), YUKI_YERRU (O87970)» more
|
| PDB [Detailed view] |
4 PDB
1K4J; 1KZF; 1RO5; 6WN0 |