Home  |  Contact
Entry: PS51729

General information about the entry

Entry name [info] GNAT_YJDJ
Accession [info] PS51729
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-AUG-2014 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE;
13-NOV-2019 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51186
Associated ProRule [info] PRU00532

Name and characterization of the entry

Description [info] Yjdj-type Gcn5-related N-acetyltransferase (GNAT) domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=87;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=82;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.8936970; R2=0.0289670; TEXT='-LogE';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3807.5180664; R2=3.2022684; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=263; H_SCORE=4650; N_SCORE=10.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=125; H_SCORE=4208; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-11; D=-75; I=-75; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='E';  M= -7, -7,-23, -9,  1,-19,-20, -8,-12,  0,-15,-10, -5,-16,  1, -2, -3,  0, -8,-27,-15,  1;
/M: SY='H';  M=-16, -1,-27, -2, -1,-13,-21, 15,-16, -9,-19,-13,  0,-21, -1, -9, -8,-12,-17,-24, -2, -3;
/M: SY='N';  M=-12, 11,-27,  8,  4,-26,-15, -4,-21,  0,-26,-16, 14,-18,  2, -4,  3, -4,-19,-34,-19,  2;
/M: SY='E';  M= -6, -6,-25, -6,  3,-23,-16, -9,-19,  0,-21,-16, -6, -3,  0, -5, -2, -5,-15,-28,-16,  1;
/M: SY='E';  M= -3,  2,-26,  4, 10,-24, -9, -7,-23,  1,-26,-17, -1,-14,  4, -5,  2, -5,-19,-31,-19,  7;
/M: SY='Q';  M= -6, -3,-26, -6,  3,-24,-11, -5,-23,  3,-23,-14,  0,-13,  5,  3,  0, -7,-19,-29,-18,  2;
/M: SY='N';  M= -8,  3,-27, -1,  0,-26,  0,  3,-29, -1,-30,-19,  9,-17,  4, -1,  3, -8,-25,-30,-17,  0;
/M: SY='R';  M= -7, -8,-31,-14,  4,-26,-19, -4,-24, 13,-19,-14, -3,-17, 11, 28, -5, -8,-21,-28,-18,  4;
/M: SY='F';  M=-17,-30,-18,-35,-26, 38,-30, -5,  2,-26,  0, -1,-27,-34,-25,-26,-19,-17, -4,  6, 31,-26;
/M: SY='E';  M= -7,-11,-23, -9,  6, -8,-22, -5,-12, -7,-15,-10,-11,-18, -1,-11, -6, -6,-11,-18,  0,  4;
/M: SY='I';  M= -2,-28, -8,-29,-23, -5,-27,-24, 13,-21,  9,  6,-27,-23,-18,-21,-14, -5, 12,-20, -9,-22;
/M:         M= -9,-10,-24,-11, -3,-15,-18, -5,-15, -5,-16,-12, -7,-17, -4, -4, -6, -6,-14,-21, -7, -4;
/M:         M= -9, -9,-21, -7, -8,-16,-23,-15, -2,-12, -7, -5,-12,-19, -8,-16, -9, -5, -1,-28,-14, -8;
/M: SY='D';  M= -9, 13,-32, 18, 11,-32, -2, -8,-29, -4,-33,-23,  6,-12,  1,-10,  2, -9,-26,-37,-25,  7;
/M: SY='G';  M= -5,  4,-30,  6, -1,-30, 19,-11,-32, -9,-35,-25,  2,-16, -6,-13,  3,-11,-26,-34,-25, -3;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='E';  M= -6,  1,-23,  1,  8,-20,-10, -5,-18,  5,-19,-12, -1,-10,  6,  0, -1, -4,-15,-24,-15,  7; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-18;
/M:         M= -9,-12,-23,-11, -2,-18,-21, -9,-11, -7,-10, -7,-12,-13, -1, -8, -8, -6, -9,-26,-12, -3;
/M: SY='V';  M=  0,-20,-14,-20,-14,-14,-23,-21,  5,-12, -1, -1,-21,-17,-11,-15,-10, -3,  8,-27,-15,-12;
/M: SY='G';  M= 20,-15,-12,-15,-14,-24, 22,-19,-22,-14,-27,-18,-15,-14,-14,-15,  6, -8,-13,-30,-23,-14;
/M: SY='Y';  M=-11,-16,-23,-17, -4,  1,-25, -7, -7,-10, -9, -6,-15,-23, -7,-12,-10, -9, -8,-14,  2, -5;
/M: SY='I';  M= -3,-30, -7,-31,-25, -6,-30,-27, 18,-23, 16, 12,-30,-24,-18,-22,-17, -5, 15,-23,-12,-23;
/M: SY='E';  M= -5,  0,-23,  3,  8,-24,-14, -8,-19, -3,-21,-14, -2,-14,  3, -7,  3,  4,-15,-31,-18,  5;
/M: SY='Y';  M=-20,-30,-19,-32,-22, 33,-30, 11, -7,-22, -7, -8,-23,-31,-22,-22,-20,-19, -9, 17, 57,-22;
/M: SY='Q';  M= -5, -7,-24, -8,  1,-21,-18, -7,-16,  1,-18,-12, -4,-13,  3,  3,  0, -2,-13,-28,-16,  1;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
/M:         M= -9,-17,-21,-17, -9,-16,-25,-17, -2, -9, -3, -4,-17,-13, -7, -9,-11, -7, -2,-26,-15,-10;
/M: SY='E';  M= -6,  3,-28,  3,  7,-26,-11, -3,-24,  2,-26,-17,  2,-13,  5,  0,  2, -5,-21,-31,-18,  5;
/M: SY='G';  M= -8,  6,-31,  8,  1,-32, 12,-10,-32, -7,-35,-25,  4,-10, -4,-11,  1,-10,-27,-35,-25, -1;
/M: SY='B';  M= -9,  8,-31,  8,  4,-30,  6, -5,-31, -1,-34,-23,  7,-16,  0, -4,  2, -9,-27,-34,-23,  1;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='V';  M= -3,-16,-16,-18,-11,-16,-23,-16,  1, -7, -5, -3,-14,-18, -7,-10, -7,  3,  6,-28,-14, -9;
/M: SY='I';  M=-12,-30,-15,-32,-25, -1,-33,-22, 15,-21, 13, 12,-27,-28,-17,-17,-21,-10, 11,-12, -4,-23;
/M:         M= -7, -6,-20, -3, -8,-14,-21,-15, -1,-14,-11, -7, -9,-20,-11,-19, -5, -2,  0,-29,-13, -9;
/M: SY='I';  M=-11,-32,-11,-34,-28, 10,-34,-24, 20,-27, 17, 11,-31,-29,-24,-26,-21,-11, 14,-15, -2,-27;
/M: SY='T';  M=-12, -3,-23, -1, -3,-16,-21, -7,-13,-10,-16,-11, -3,-14, -5,-13, -4,  2,-11,-26, -9, -4;
/M: SY='H';  M=-16, -1,-29,-10,  1,-13,-18, 59,-28, -5,-28,-19,  7,-19,  8,  3, -6,-16,-28,-21, 12,  1;
/M: SY='T';  M=  0,-13,-10,-13,-13,-18,-21,-21, -5,-12, -7, -7, -5,-12,-11,-13,  6, 41,  4,-29,-19,-12;
/M: SY='Y';  M=-12,-13,-26,-13,  1, -1,-22, -5,-11,-10,-13, -9,-13,-22, -6,-13,-11,-12,-11,-13,  3, -1;
/M: SY='V';  M= -1,-28,-10,-28,-27,-10,-29,-28, 25,-20,  9,  8,-26,-20,-19,-27,-16,  4, 32,-28,-11,-20;
/M: SY='P';  M= -7, -2,-27,  1, -1,-29,-13,-11,-24, -8,-28,-22, -5, 17, -5,-14,  0, -7,-20,-36,-22, -3;
/M: SY='P';  M= -9, -2,-30,  1,  8,-32,-17,-11,-25, -2,-28,-22, -7, 20,  0,-11, -3, -7,-20,-35,-23,  5;
/M: SY='E';  M=  5, -2,-21,  0,  8,-25, -9, -9,-21,  1,-25,-16, -4,-11,  4, -4,  7, -2,-16,-31,-20,  6;
/M: SY='F';  M=-15,-27,-17,-30,-21, 13,-28, -6,  0,-21,  5,  2,-24,-28,-16,-18,-19,-14, -4, -8, 13,-20;
/I:         I=-23; MD=-32;
/M: SY='R';  M= -7, -5,-34, -9,  6,-29, -8, -3,-29, 11,-24,-19, -1,-16, 10, 28, -3, -9,-26,-29,-21,  5; D=-23;
/I:         I=-23; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='G';  M= -2, -7,-30, -7,-15,-30, 49,-15,-38,-17,-39,-29, -6,-19,-16,-16,  0,-18,-30,-30,-28,-16;
/M: SY='Q';  M= -9, -3,-30, -8,  9,-28,-18,  1,-27, 18,-22,-11,  0,-14, 25, 19, -2, -8,-21,-26,-18, 12;
/M: SY='G';  M= -1, -8,-30, -8,-16,-30, 51,-18,-38,-16,-39,-28, -7,-19,-16,-17,  1,-18,-29,-30,-29,-16;
/M: SY='I';  M=-10,-32,-11,-33,-28,  0,-35,-25, 24,-25, 19, 13,-31,-27,-22,-25,-22, -8, 20,-19, -5,-25;
/M: SY='A';  M= 24,-16,-11,-16,-13,-23, 18,-20,-19,-13,-26,-16,-16,-14,-13,-13,  7, -6,-10,-30,-23,-13;
/M: SY='S';  M=  1, -3,-24, -4,  1,-26,  2,-11,-26,  5,-28,-19, -1,-14,  0,  0,  8, -5,-20,-31,-22,  0;
/M: SY='K';  M= -5, -9,-24,-11,  2,-22,-21, -9,-15,  7,-15, -9, -9,-13,  5,  2, -5, -6,-10,-28,-17,  2;
/M: SY='L';  M=-18,-38,-11,-39,-29,  2,-39,-28, 20,-29, 35, 21,-37,-30,-20,-21,-28,-10, 11,-19, -8,-29;
/M: SY='V';  M=  2,-28, -6,-28,-24, -8,-26,-26, 16,-20,  7, 10,-26,-21,-17,-23,-13,  0, 20,-26,-12,-20;
/M: SY='E';  M= -7,  2,-29,  2, 11,-28,-15, -6,-25, 11,-25,-17,  0,-15,  9,  8,  0, -7,-21,-31,-20,  9;
/M: SY='A';  M=  5,-10,-20,-10,  1,-19, -9, -8,-18, -1,-20,-13, -9,-15,  0, -2,  0, -5,-13,-26,-15,  0;
/I:         I=-23; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='A';  M= 15,-24, -6,-24,-19,-12,-12,-23,  3,-17, -5, -2,-23,-17,-15,-18, -3, -1,  8,-27,-15,-17;
/M: SY='L';  M=-10,-33,-11,-34,-28,  4,-33,-25, 18,-25, 19, 12,-32,-27,-20,-23,-22, -8, 15,-19, -4,-25;
/M: SY='D';  M= -6, 11,-29, 17, 16,-30,-13, -6,-25,  1,-29,-19,  3,-13,  7, -6,  2, -5,-22,-35,-22, 12;
/M: SY='Y';  M=-14, -8,-25, -7, -4, -3,-21,  3,-15,-11,-17,-12,-10,-24, -7,-13,-10,-13,-16,-11,  9, -6;
/M: SY='A';  M= 20,-23, -4,-23,-16,-13,-14,-23,  3,-15, -6, -2,-22,-16,-14,-16,  0,  1,  8,-27,-16,-15;
/M: SY='R';  M= -6, -7,-31,-13,  3,-26,-19, -5,-23, 14,-20,-16, -2,-17,  7, 29, -5, -7,-20,-29,-19,  3;
/M: SY='E';  M=  0,  0,-26,  2, 15,-27,-12, -6,-24,  6,-26,-17, -2,-13,  8,  2,  3, -5,-20,-31,-20, 12;
/M: SY='E';  M= -7,  4,-29,  0, 11,-26,-15,  3,-25,  6,-26,-16,  9,-15, 10,  7,  2, -5,-23,-30,-17, 10;
/M: SY='G';  M= -7,  3,-30, -1, -5,-29, 20, -6,-34, -5,-36,-24,  7,-18, -4, -6,  3,-12,-28,-32,-24, -5;
/M: SY='L';  M=-13,-24,-19,-27,-16, -4,-27,-14, -2,-10,  3,  1,-22,-24, -9, -9,-16,-10, -4,-12, -2,-15;
/I:         I=-17; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='K';  M= -8, -6,-27,-12,  3,-25,-19, -8,-23, 23,-21,-15, -2,-12,  7, 16, -1, -3,-17,-29,-18,  3;
/M: SY='V';  M= -3,-30,-10,-30,-28, -6,-33,-29, 29,-24, 14, 11,-30,-24,-22,-27,-19, -5, 30,-25,-11,-24;
/M: SY='V';  M= -8,-20,-18,-22,-17,-12,-28,-19,  9,-10,  2,  2,-19,-22,-12,-11,-14, -6, 11,-25,-11,-14;
/M: SY='P';  M= -3,-21,-22,-21,-12,-32,-18,-20,-20,-12,-22,-21,-21, 50,-11,-19, -8, -7,-12,-36,-26,-12;
/M: SY='T';  M= -4,-18,-13,-19,-14,-12,-22,-17,  1,-13, -1,  0,-14,-18, -9,-14, -3,  6,  3,-25,-12,-12;
/M: SY='C';  M=  0,-29, 84,-38,-38,-20,-29,-29,-10,-29,-10,-20,-28,-29,-29,-38, -9, -9,-10,-21,-20,-38;
/M: SY='P';  M= -2,-11,-20,-11, -6,-27,-11,-15,-24, -6,-28,-23, -7, 23, -6,-14, 10,  0,-19,-26,-22, -6;
/M: SY='Y';  M=-18,-29,-19,-33,-22, 36,-29,  5, -5,-23, -6, -5,-23,-32,-22,-23,-19,-18, -9, 12, 47,-22;
/M: SY='V';  M=  9,-26, -7,-27,-22,-10,-22,-25, 15,-18,  2,  4,-26,-19,-18,-22, -9, -1, 20,-27,-12,-18;
/M: SY='K';  M=  2, -9,-21,-12, -1,-23,-14, -9,-15,  5,-19,-11, -7,-14,  3,  3,  0, -5,-10,-29,-17,  0;
/M: SY='K';  M=  1, -4,-22, -6,  1,-24, -8, -5,-21,  5,-25,-16, -2,-14,  1,  0,  3, -5,-16,-29,-17,  1;
/I:         I=-18; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='Y';  M=-18,-26,-21,-30,-17, 18,-28, -1, -9,-18, -9, -7,-22,-30,-13,-18,-18,-17,-11, 16, 27,-16;
/M: SY='F';  M=-13,-32,-14,-35,-28, 16,-33,-21, 16,-27, 16, 12,-31,-31,-22,-25,-22,-12,  9,-12,  3,-27;
/M: SY='E';  M= -7,  3,-30,  4, 12,-28,-14, -6,-25,  8,-26,-17,  1,-12,  8,  5,  0, -6,-21,-32,-21,  9;
/M: SY='K';  M= -9, -1,-32, -7,  8,-29,-18, -5,-27, 24,-25,-18,  1,-15,  9, 24, -3, -8,-23,-31,-19,  7;
/M: SY='H';  M=-17,  6,-29, -4,  0,-16,-17, 38,-27, -4,-30,-18, 18,-19,  5,  0, -2,-11,-26,-26,  2,  0;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='P';  M= -8,-10,-29, -9, -1,-34,-16,-13,-28, -3,-28,-25,-11, 38, -3,-11, -4, -8,-21,-36,-25, -2;
/M: SY='E';  M= -8,  8,-33, 15, 27,-29,-14, -4,-26,  5,-29,-19,  1,-13, 13, -3,  2, -8,-24,-32,-21, 21;
/M: SY='Y';  M=-17,-27,-19,-29,-18, 15,-28,  3, -9,-18, -8, -9,-22,-28,-16,-18,-18,-16,-11, 13, 35,-18;
/M: SY='Q';  M=  0, -4,-22, -6,  3,-24,-13, -4,-21,  4,-22,-12, -3,-13,  8,  2,  2, -5,-15,-29,-18,  3;
/M: SY='D';  M=-10, 17,-32, 27, 13,-31,-10, -6,-26, -4,-32,-23,  4,-15,  2,-11,  2, -7,-24,-39,-23,  8;
/M: SY='L';  M=-12,-30,-13,-31,-25, -2,-32,-23, 16,-23, 18, 12,-29,-26,-17,-20,-21, -8, 13,-21, -7,-23;
/M: SY='L';  M=-10,-28,-14,-29,-22, -6,-30,-23, 11,-19, 12,  6,-26,-23,-15,-17,-18, -6, 10,-20, -9,-20;
/M: SY='A';  M=  1,-13,-18,-13, -7,-17,-16,-13, -8, -9,-13, -9,-14,-10, -7,-12, -4, -6, -4,-27,-13, -7;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH PS51186; PS51187; PS51191; PS51730; PS51731

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2019_10 which contains 561'356 sequence entries.


Total number of hits 9 in 9 different sequences
Number of true positive hits 9 in 9 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] N-acetyltransferase
Version [info] 3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
9 sequences

NATD1_BOVIN (A6QL79    ), NATD1_CHICK (Q5ZJI6    ), NATD1_DANRE (Q5D014    ), 
NATD1_HUMAN (Q8N6N6    ), NATD1_MOUSE (Q9DBW3    ), NATD1_XENLA (Q6IP48    ), 
NATD1_XENTR (Q66IM5    ), Y1754_ARATH (Q9CAQ2    ), YJDJ_ECOLI  (P39274    )
» more

PDB
[Detailed view]
6 PDB

1XMT; 2EVN; 2IL4; 2Q44; 2Q4Y; 5I0C

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission