PROSITE entry PS51729
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | GNAT_YJDJ |
| Accession [info] | PS51729 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-AUG-2014 CREATED;
07-APR-2021 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51186 |
| Associated ProRule [info] | PRU00532 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Yjdj-type Gcn5-related N-acetyltransferase (GNAT) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=87; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=82; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.8936970; R2=0.0289670; TEXT='-LogE'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3807.5180664; R2=3.2022684; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=263; H_SCORE=4650; N_SCORE=10.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=125; H_SCORE=4208; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-11; D=-75; I=-75; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='E'; M= -7, -7,-23, -9, 1,-19,-20, -8,-12, 0,-15,-10, -5,-16, 1, -2, -3, 0, -8,-27,-15, 1; /M: SY='H'; M=-16, -1,-27, -2, -1,-13,-21, 15,-16, -9,-19,-13, 0,-21, -1, -9, -8,-12,-17,-24, -2, -3; /M: SY='N'; M=-12, 11,-27, 8, 4,-26,-15, -4,-21, 0,-26,-16, 14,-18, 2, -4, 3, -4,-19,-34,-19, 2; /M: SY='E'; M= -6, -6,-25, -6, 3,-23,-16, -9,-19, 0,-21,-16, -6, -3, 0, -5, -2, -5,-15,-28,-16, 1; /M: SY='E'; M= -3, 2,-26, 4, 10,-24, -9, -7,-23, 1,-26,-17, -1,-14, 4, -5, 2, -5,-19,-31,-19, 7; /M: SY='Q'; M= -6, -3,-26, -6, 3,-24,-11, -5,-23, 3,-23,-14, 0,-13, 5, 3, 0, -7,-19,-29,-18, 2; /M: SY='N'; M= -8, 3,-27, -1, 0,-26, 0, 3,-29, -1,-30,-19, 9,-17, 4, -1, 3, -8,-25,-30,-17, 0; /M: SY='R'; M= -7, -8,-31,-14, 4,-26,-19, -4,-24, 13,-19,-14, -3,-17, 11, 28, -5, -8,-21,-28,-18, 4; /M: SY='F'; M=-17,-30,-18,-35,-26, 38,-30, -5, 2,-26, 0, -1,-27,-34,-25,-26,-19,-17, -4, 6, 31,-26; /M: SY='E'; M= -7,-11,-23, -9, 6, -8,-22, -5,-12, -7,-15,-10,-11,-18, -1,-11, -6, -6,-11,-18, 0, 4; /M: SY='I'; M= -2,-28, -8,-29,-23, -5,-27,-24, 13,-21, 9, 6,-27,-23,-18,-21,-14, -5, 12,-20, -9,-22; /M: M= -9,-10,-24,-11, -3,-15,-18, -5,-15, -5,-16,-12, -7,-17, -4, -4, -6, -6,-14,-21, -7, -4; /M: M= -9, -9,-21, -7, -8,-16,-23,-15, -2,-12, -7, -5,-12,-19, -8,-16, -9, -5, -1,-28,-14, -8; /M: SY='D'; M= -9, 13,-32, 18, 11,-32, -2, -8,-29, -4,-33,-23, 6,-12, 1,-10, 2, -9,-26,-37,-25, 7; /M: SY='G'; M= -5, 4,-30, 6, -1,-30, 19,-11,-32, -9,-35,-25, 2,-16, -6,-13, 3,-11,-26,-34,-25, -3; /I: I=-13; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='E'; M= -6, 1,-23, 1, 8,-20,-10, -5,-18, 5,-19,-12, -1,-10, 6, 0, -1, -4,-15,-24,-15, 7; D=-13; /I: I=-13; DM=-18; /M: M= -9,-12,-23,-11, -2,-18,-21, -9,-11, -7,-10, -7,-12,-13, -1, -8, -8, -6, -9,-26,-12, -3; /M: SY='V'; M= 0,-20,-14,-20,-14,-14,-23,-21, 5,-12, -1, -1,-21,-17,-11,-15,-10, -3, 8,-27,-15,-12; /M: SY='G'; M= 20,-15,-12,-15,-14,-24, 22,-19,-22,-14,-27,-18,-15,-14,-14,-15, 6, -8,-13,-30,-23,-14; /M: SY='Y'; M=-11,-16,-23,-17, -4, 1,-25, -7, -7,-10, -9, -6,-15,-23, -7,-12,-10, -9, -8,-14, 2, -5; /M: SY='I'; M= -3,-30, -7,-31,-25, -6,-30,-27, 18,-23, 16, 12,-30,-24,-18,-22,-17, -5, 15,-23,-12,-23; /M: SY='E'; M= -5, 0,-23, 3, 8,-24,-14, -8,-19, -3,-21,-14, -2,-14, 3, -7, 3, 4,-15,-31,-18, 5; /M: SY='Y'; M=-20,-30,-19,-32,-22, 33,-30, 11, -7,-22, -7, -8,-23,-31,-22,-22,-20,-19, -9, 17, 57,-22; /M: SY='Q'; M= -5, -7,-24, -8, 1,-21,-18, -7,-16, 1,-18,-12, -4,-13, 3, 3, 0, -2,-13,-28,-16, 1; /I: I=-7; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10; /M: M= -9,-17,-21,-17, -9,-16,-25,-17, -2, -9, -3, -4,-17,-13, -7, -9,-11, -7, -2,-26,-15,-10; /M: SY='E'; M= -6, 3,-28, 3, 7,-26,-11, -3,-24, 2,-26,-17, 2,-13, 5, 0, 2, -5,-21,-31,-18, 5; /M: SY='G'; M= -8, 6,-31, 8, 1,-32, 12,-10,-32, -7,-35,-25, 4,-10, -4,-11, 1,-10,-27,-35,-25, -1; /M: SY='B'; M= -9, 8,-31, 8, 4,-30, 6, -5,-31, -1,-34,-23, 7,-16, 0, -4, 2, -9,-27,-34,-23, 1; /I: I=-11; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='V'; M= -3,-16,-16,-18,-11,-16,-23,-16, 1, -7, -5, -3,-14,-18, -7,-10, -7, 3, 6,-28,-14, -9; /M: SY='I'; M=-12,-30,-15,-32,-25, -1,-33,-22, 15,-21, 13, 12,-27,-28,-17,-17,-21,-10, 11,-12, -4,-23; /M: M= -7, -6,-20, -3, -8,-14,-21,-15, -1,-14,-11, -7, -9,-20,-11,-19, -5, -2, 0,-29,-13, -9; /M: SY='I'; M=-11,-32,-11,-34,-28, 10,-34,-24, 20,-27, 17, 11,-31,-29,-24,-26,-21,-11, 14,-15, -2,-27; /M: SY='T'; M=-12, -3,-23, -1, -3,-16,-21, -7,-13,-10,-16,-11, -3,-14, -5,-13, -4, 2,-11,-26, -9, -4; /M: SY='H'; M=-16, -1,-29,-10, 1,-13,-18, 59,-28, -5,-28,-19, 7,-19, 8, 3, -6,-16,-28,-21, 12, 1; /M: SY='T'; M= 0,-13,-10,-13,-13,-18,-21,-21, -5,-12, -7, -7, -5,-12,-11,-13, 6, 41, 4,-29,-19,-12; /M: SY='Y'; M=-12,-13,-26,-13, 1, -1,-22, -5,-11,-10,-13, -9,-13,-22, -6,-13,-11,-12,-11,-13, 3, -1; /M: SY='V'; M= -1,-28,-10,-28,-27,-10,-29,-28, 25,-20, 9, 8,-26,-20,-19,-27,-16, 4, 32,-28,-11,-20; /M: SY='P'; M= -7, -2,-27, 1, -1,-29,-13,-11,-24, -8,-28,-22, -5, 17, -5,-14, 0, -7,-20,-36,-22, -3; /M: SY='P'; M= -9, -2,-30, 1, 8,-32,-17,-11,-25, -2,-28,-22, -7, 20, 0,-11, -3, -7,-20,-35,-23, 5; /M: SY='E'; M= 5, -2,-21, 0, 8,-25, -9, -9,-21, 1,-25,-16, -4,-11, 4, -4, 7, -2,-16,-31,-20, 6; /M: SY='F'; M=-15,-27,-17,-30,-21, 13,-28, -6, 0,-21, 5, 2,-24,-28,-16,-18,-19,-14, -4, -8, 13,-20; /I: I=-23; MD=-32; /M: SY='R'; M= -7, -5,-34, -9, 6,-29, -8, -3,-29, 11,-24,-19, -1,-16, 10, 28, -3, -9,-26,-29,-21, 5; D=-23; /I: I=-23; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='G'; M= -2, -7,-30, -7,-15,-30, 49,-15,-38,-17,-39,-29, -6,-19,-16,-16, 0,-18,-30,-30,-28,-16; /M: SY='Q'; M= -9, -3,-30, -8, 9,-28,-18, 1,-27, 18,-22,-11, 0,-14, 25, 19, -2, -8,-21,-26,-18, 12; /M: SY='G'; M= -1, -8,-30, -8,-16,-30, 51,-18,-38,-16,-39,-28, -7,-19,-16,-17, 1,-18,-29,-30,-29,-16; /M: SY='I'; M=-10,-32,-11,-33,-28, 0,-35,-25, 24,-25, 19, 13,-31,-27,-22,-25,-22, -8, 20,-19, -5,-25; /M: SY='A'; M= 24,-16,-11,-16,-13,-23, 18,-20,-19,-13,-26,-16,-16,-14,-13,-13, 7, -6,-10,-30,-23,-13; /M: SY='S'; M= 1, -3,-24, -4, 1,-26, 2,-11,-26, 5,-28,-19, -1,-14, 0, 0, 8, -5,-20,-31,-22, 0; /M: SY='K'; M= -5, -9,-24,-11, 2,-22,-21, -9,-15, 7,-15, -9, -9,-13, 5, 2, -5, -6,-10,-28,-17, 2; /M: SY='L'; M=-18,-38,-11,-39,-29, 2,-39,-28, 20,-29, 35, 21,-37,-30,-20,-21,-28,-10, 11,-19, -8,-29; /M: SY='V'; M= 2,-28, -6,-28,-24, -8,-26,-26, 16,-20, 7, 10,-26,-21,-17,-23,-13, 0, 20,-26,-12,-20; /M: SY='E'; M= -7, 2,-29, 2, 11,-28,-15, -6,-25, 11,-25,-17, 0,-15, 9, 8, 0, -7,-21,-31,-20, 9; /M: SY='A'; M= 5,-10,-20,-10, 1,-19, -9, -8,-18, -1,-20,-13, -9,-15, 0, -2, 0, -5,-13,-26,-15, 0; /I: I=-23; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='A'; M= 15,-24, -6,-24,-19,-12,-12,-23, 3,-17, -5, -2,-23,-17,-15,-18, -3, -1, 8,-27,-15,-17; /M: SY='L'; M=-10,-33,-11,-34,-28, 4,-33,-25, 18,-25, 19, 12,-32,-27,-20,-23,-22, -8, 15,-19, -4,-25; /M: SY='D'; M= -6, 11,-29, 17, 16,-30,-13, -6,-25, 1,-29,-19, 3,-13, 7, -6, 2, -5,-22,-35,-22, 12; /M: SY='Y'; M=-14, -8,-25, -7, -4, -3,-21, 3,-15,-11,-17,-12,-10,-24, -7,-13,-10,-13,-16,-11, 9, -6; /M: SY='A'; M= 20,-23, -4,-23,-16,-13,-14,-23, 3,-15, -6, -2,-22,-16,-14,-16, 0, 1, 8,-27,-16,-15; /M: SY='R'; M= -6, -7,-31,-13, 3,-26,-19, -5,-23, 14,-20,-16, -2,-17, 7, 29, -5, -7,-20,-29,-19, 3; /M: SY='E'; M= 0, 0,-26, 2, 15,-27,-12, -6,-24, 6,-26,-17, -2,-13, 8, 2, 3, -5,-20,-31,-20, 12; /M: SY='E'; M= -7, 4,-29, 0, 11,-26,-15, 3,-25, 6,-26,-16, 9,-15, 10, 7, 2, -5,-23,-30,-17, 10; /M: SY='G'; M= -7, 3,-30, -1, -5,-29, 20, -6,-34, -5,-36,-24, 7,-18, -4, -6, 3,-12,-28,-32,-24, -5; /M: SY='L'; M=-13,-24,-19,-27,-16, -4,-27,-14, -2,-10, 3, 1,-22,-24, -9, -9,-16,-10, -4,-12, -2,-15; /I: I=-17; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='K'; M= -8, -6,-27,-12, 3,-25,-19, -8,-23, 23,-21,-15, -2,-12, 7, 16, -1, -3,-17,-29,-18, 3; /M: SY='V'; M= -3,-30,-10,-30,-28, -6,-33,-29, 29,-24, 14, 11,-30,-24,-22,-27,-19, -5, 30,-25,-11,-24; /M: SY='V'; M= -8,-20,-18,-22,-17,-12,-28,-19, 9,-10, 2, 2,-19,-22,-12,-11,-14, -6, 11,-25,-11,-14; /M: SY='P'; M= -3,-21,-22,-21,-12,-32,-18,-20,-20,-12,-22,-21,-21, 50,-11,-19, -8, -7,-12,-36,-26,-12; /M: SY='T'; M= -4,-18,-13,-19,-14,-12,-22,-17, 1,-13, -1, 0,-14,-18, -9,-14, -3, 6, 3,-25,-12,-12; /M: SY='C'; M= 0,-29, 84,-38,-38,-20,-29,-29,-10,-29,-10,-20,-28,-29,-29,-38, -9, -9,-10,-21,-20,-38; /M: SY='P'; M= -2,-11,-20,-11, -6,-27,-11,-15,-24, -6,-28,-23, -7, 23, -6,-14, 10, 0,-19,-26,-22, -6; /M: SY='Y'; M=-18,-29,-19,-33,-22, 36,-29, 5, -5,-23, -6, -5,-23,-32,-22,-23,-19,-18, -9, 12, 47,-22; /M: SY='V'; M= 9,-26, -7,-27,-22,-10,-22,-25, 15,-18, 2, 4,-26,-19,-18,-22, -9, -1, 20,-27,-12,-18; /M: SY='K'; M= 2, -9,-21,-12, -1,-23,-14, -9,-15, 5,-19,-11, -7,-14, 3, 3, 0, -5,-10,-29,-17, 0; /M: SY='K'; M= 1, -4,-22, -6, 1,-24, -8, -5,-21, 5,-25,-16, -2,-14, 1, 0, 3, -5,-16,-29,-17, 1; /I: I=-18; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='Y'; M=-18,-26,-21,-30,-17, 18,-28, -1, -9,-18, -9, -7,-22,-30,-13,-18,-18,-17,-11, 16, 27,-16; /M: SY='F'; M=-13,-32,-14,-35,-28, 16,-33,-21, 16,-27, 16, 12,-31,-31,-22,-25,-22,-12, 9,-12, 3,-27; /M: SY='E'; M= -7, 3,-30, 4, 12,-28,-14, -6,-25, 8,-26,-17, 1,-12, 8, 5, 0, -6,-21,-32,-21, 9; /M: SY='K'; M= -9, -1,-32, -7, 8,-29,-18, -5,-27, 24,-25,-18, 1,-15, 9, 24, -3, -8,-23,-31,-19, 7; /M: SY='H'; M=-17, 6,-29, -4, 0,-16,-17, 38,-27, -4,-30,-18, 18,-19, 5, 0, -2,-11,-26,-26, 2, 0; /I: I=-12; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='P'; M= -8,-10,-29, -9, -1,-34,-16,-13,-28, -3,-28,-25,-11, 38, -3,-11, -4, -8,-21,-36,-25, -2; /M: SY='E'; M= -8, 8,-33, 15, 27,-29,-14, -4,-26, 5,-29,-19, 1,-13, 13, -3, 2, -8,-24,-32,-21, 21; /M: SY='Y'; M=-17,-27,-19,-29,-18, 15,-28, 3, -9,-18, -8, -9,-22,-28,-16,-18,-18,-16,-11, 13, 35,-18; /M: SY='Q'; M= 0, -4,-22, -6, 3,-24,-13, -4,-21, 4,-22,-12, -3,-13, 8, 2, 2, -5,-15,-29,-18, 3; /M: SY='D'; M=-10, 17,-32, 27, 13,-31,-10, -6,-26, -4,-32,-23, 4,-15, 2,-11, 2, -7,-24,-39,-23, 8; /M: SY='L'; M=-12,-30,-13,-31,-25, -2,-32,-23, 16,-23, 18, 12,-29,-26,-17,-20,-21, -8, 13,-21, -7,-23; /M: SY='L'; M=-10,-28,-14,-29,-22, -6,-30,-23, 11,-19, 12, 6,-26,-23,-15,-17,-18, -6, 10,-20, -9,-20; /M: SY='A'; M= 1,-13,-18,-13, -7,-17,-16,-13, -8, -9,-13, -9,-14,-10, -7,-12, -4, -6, -4,-27,-13, -7; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Post-processing [info]
| COMPETES_HIT_WITH | PS51186; PS51187; PS51191; PS51730; PS51731 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 9 in 9 different sequences |
| Number of true positive hits | 9 in 9 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | N-acetyltransferase |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
9 sequences
NATD1_BOVIN (A6QL79), NATD1_CHICK (Q5ZJI6), NATD1_DANRE (Q5D014), NATD1_HUMAN (Q8N6N6), NATD1_MOUSE (Q9DBW3), NATD1_XENLA (Q6IP48), NATD1_XENTR (Q66IM5), Y1754_ARATH (Q9CAQ2), YJDJ_ECOLI (P39274)» more
|
| PDB [Detailed view] |
6 PDB
1XMT; 2EVN; 2IL4; 2Q44; 2Q4Y; 5I0C |