PROSITE entry PS51236
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | TSP_CTER |
| Accession [info] | PS51236 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-MAR-2007 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51236 |
| Associated ProRule [info] | PRU00635 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Thrombospondin C-terminal domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=215; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=210; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9005461; R2=0.0112374; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-43306.7968750; R2=47.7637558; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=899; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=410; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='R'; M=-16, -8,-26,-10, -2,-18,-20, -4,-26, 21,-18,-10, 0,-18, 6, 53, -4, 3,-16,-22,-10, -2; /M: SY='N'; M= -4, 12,-21, 7, 3,-24,-11, -2,-18, 2,-20, -8, 15,-13, 11, -1, 8, 5,-18,-30,-14, 7; /M: SY='F'; M=-16,-28,-22,-32,-24, 43,-30,-12, 8,-26, 24, 8,-24,-30,-26,-18,-24,-10, 2, 2, 28,-24; /M: SY='Q'; M=-12, 5,-30, 7, 17,-37,-19, 6,-24, 15,-22, -6, 2,-11, 42, 16, -2,-10,-28,-22,-11, 29; /M: SY='M'; M= -5,-10,-15,-20,-15, -5,-20,-10, 5,-10, 5, 26,-10,-15, -5,-10, 0, 20, 5,-25, -5,-10; /M: SY='V'; M= -4,-29,-16,-31,-29, 3,-32,-25, 31,-21, 11, 11,-27,-28,-26,-21,-13, -3, 40,-22, 1,-29; /M: SY='A'; M= 17, -8,-19,-13, -9,-19,-10,-18, -9,-10,-15,-11, -6, 13,-11,-17, 3, 1, -5,-27,-21,-11; /M: SY='L'; M=-10,-26,-21,-25,-12, 6,-29,-18, 15,-26, 43, 16,-27,-27,-16,-18,-27,-10, 6,-21, -2,-14; /M: SY='D'; M=-17, 33,-15, 47, 19,-37,-14, -2,-36, -1,-27,-25, 12,-12, 6, -9, -1,-10,-28,-38,-20, 12; /M: SY='P'; M=-11,-18,-39, -9, 0,-29,-20, -8,-21,-10,-29,-18,-17, 79, -8,-18,-10,-11,-30,-30,-25, -9; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='E'; M= -9, -1,-27, 4, 25,-25,-18, -3,-20, 10,-15, -9, -4, 3, 18, 3, -5, -9,-22,-22,-14, 21; D=-4; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='G'; M= 0, -7,-21, -7,-14,-21, 48,-14,-28,-14,-21,-14, 0,-14,-14,-14, 0,-14,-21,-14,-21,-14; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='T'; M= -3, 4,-17, 4, -4,-16,-15,-14,-10,-12,-12,-11, 2,-13, -7,-13, 14, 16, -5,-33,-13, -6; /M: SY='A'; M= 25, -5,-12, -9, -5,-20, -2, -3,-16,-10,-20,-13, 1,-11, -4,-14, 21, 7, -7,-30,-16, -5; /M: SY='Q'; M= -5, -1,-24, -1, 12,-32,-14, 3,-21, 6,-23, -7, 3,-11, 36, 10, 11, -1,-23,-26,-13, 24; /M: SY='I'; M= 2,-21,-24,-28,-19, -8,-25,-23, 16,-18, 2, 4,-17,-18, -9,-20, -9, -3, 11, -5, -4,-16; /M: SY='D'; M= -9, 21,-30, 33, 8,-32,-14, -9,-24, -6,-23,-21, 5, 9, -5,-15, -3, -9,-21,-34,-20, 0; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='N'; M=-10, 5,-21, -3, -9, -9,-16, 8, -7, -3,-12, -6, 14,-23, -6, -3, -5, -5, -8,-25, 0, -9; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='V'; M= -2,-26,-14,-25,-20, -3,-30,-27, 25,-18, 8, 8,-26,-26,-24,-19,-10, -2, 39,-29,-10,-22; /M: SY='V'; M= -4,-30,-17,-34,-30, 0,-34,-30, 37,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 43,-26, -6,-30; /M: SY='Y'; M=-18,-15,-28,-15, -9, 2,-25, 13,-10, 1, -1, 0,-11,-25, 2, 15,-16,-11,-13, -2, 27, -7; /M: SY='N'; M= -9, 36,-23, 31, 5,-26, -5, 12,-26, -2,-28,-21, 38,-16, 0, -5, 5, -5,-28,-38,-17, 2; /M: SY='K'; M=-11, 10,-28, 8, 7,-30, -5, -1,-28, 17,-27,-13, 13,-14, 15, 15, -2, -9,-26,-26,-15, 10; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='A'; M= 19, -9,-17,-16, -7,-18,-10,-13,-11, 5,-10, 1, -8,-12, -3, -1, 0, 0, -4,-21,-13, -5; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28, 2,-38,-28, 44,-30, 26, 20,-22,-22,-20,-28,-22,-10, 26,-20, 0,-28; /M: SY='V'; M=-10,-21,-21,-24,-21, 3,-29, 12, 12,-20, 3, 8,-14,-25,-17,-16,-13, -9, 16,-24, 6,-21; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='T'; M= -4, -1,-17,-11,-10,-12,-21,-17, -3, -6, -9, -6, 3,-13, -8, -8, 8, 27, 0,-28, -9,-10; /M: SY='M'; M= -8,-20,-20,-23,-14, 1,-26,-14, 9, -9, 9, 14,-19,-23, -6, -8,-14, -7, 11,-20, -2,-10; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='S'; M= 6, -4, 16, -6, -6,-20, -6,-14,-22,-14,-28,-20, 4,-16, -6,-14, 30, 14,-10,-42,-22, -6; /M: SY='D'; M=-12, 43,-28, 60, 17,-38, -9, -2,-37, -1,-28,-28, 17,-10, -1,-11, 1, -9,-27,-38,-20, 8; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='G'; M= 10,-10,-26,-12,-18,-28, 56,-20,-34,-18,-26,-18, -2,-18,-18,-20, 2,-16,-24,-20,-28,-18; /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22, 8,-32,-22, 25,-30, 45, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 13,-20, 0,-22; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='V'; M= -4,-30,-18,-34,-30, 0,-34,-30, 38,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 42,-26, -6,-30; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='Y'; M=-18, 5,-28, 10, -2, -6,-20, 10,-18, 1,-12, -4, -1,-19, -3, 2,-11,-11,-17,-14, 13, -4; /M: SY='D'; M= -9, 26,-25, 35, 8,-30,-12, 15,-30, -5,-23,-19, 12,-12, -1, -9, 2, -2,-22,-34,-11, 3; /M: SY='A'; M= 11, -7,-16,-10, -2,-18,-11,-13,-14, 0,-15,-11, -4,-14, -3, 5, 10, 6, -4,-27,-16, -4; /M: SY='F'; M=-16,-28,-20,-36,-26, 48,-28,-16, 8,-26, 20, 17,-22,-28,-27,-18,-22,-10, 4, -3, 17,-24; /M: SY='E'; M= -8, 2,-24, 3, 5,-20, -8,-11,-11, -4,-14,-10, 2,-16, -6, -9, -3, -8, -7,-29,-17, -1; /M: SY='G'; M= 4, 4,-24, 6, -7,-29, 32,-14,-33,-13,-28,-21, 5,-15,-11,-16, 9, -8,-23,-28,-25, -9; /M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='E'; M= -5, 14,-22, 21, 29,-27,-12, -5,-27, 1,-24,-21, 7, -6, 8, -6, 13, 4,-22,-35,-19, 19; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='T'; M= 0, 0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10, 0,-10,-10,-10, 20, 50, 0,-30,-10,-10; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='F'; M=-20,-25,-23,-32,-25, 60,-29, -2, -2,-23, 5, 0,-18,-29,-29,-16,-19,-11, -5, 13, 43,-25; /M: SY='I'; M= -6,-30,-23,-36,-30, 0,-36,-30, 43,-26, 16, 16,-24,-24,-24,-26,-16, -6, 37,-24, -4,-30; /M: SY='N'; M= -9, 27,-23, 20, 19,-23, -9, 3,-23, 2,-25,-19, 32,-12, 5, -2, 7, 2,-27,-36,-19, 12; /M: SY='D'; M=-10, 25,-20, 30, 5,-25,-15,-10,-25, -5,-20,-20, 10,-10, -5,-10, 10, 20,-15,-35,-15, 0; /M: SY='E'; M= -1, 3,-20, 3, 14,-23,-18, -9,-16, -1,-14,-11, -2, -9, 9, -6, 6, 10,-11,-28,-14, 11; /M: SY='T'; M= -2, -7,-20,-11, -7,-13,-15,-16,-15, -2,-19,-12, -2,-14, -5, -1, 11, 16, -9,-11, -8, -6; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23, 45,-30, 8, 0,-16, 3, 0,-20,-30,-19,-13,-20,-10, -7, 24, 65,-23; /M: SY='A'; M= 26,-20,-10,-25,-20,-10,-14,-25, 9,-15, 0, 0,-20,-20,-20,-20, 0, 0, 24,-25,-15,-20; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='V'; M= -4,-27,-18,-32,-28, -1,-33,-29, 33,-23, 12, 12,-23,-24,-24,-23,-10, 2, 36,-26, -6,-28; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='G'; M= 8, -5,-19, -6,-10,-25, 33,-15,-29,-15,-28,-19, 4,-15,-10,-15, 19, 0,-19,-29,-25,-10; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='Q'; M= -9, -3,-28, -3, 14,-36,-21, 6,-14, 7,-17, 1, -3,-12, 50, 7, -1, -9,-21,-21,-10, 32; /M: SY='S'; M= 2, 14,-15, 16, 4,-24, -2, -6,-24, -7,-30,-22, 18,-11, 0, -9, 29, 12,-16,-40,-20, 2; /M: SY='N'; M= -2, 23,-16, 12, 0,-20, 0, 2,-20, -4,-30,-20, 39,-16, 0, -4, 23, 8,-22,-40,-20, 0; /M: SY='S'; M= 11, -5,-15, -7, -4,-16, -6, -2,-18, -6,-21,-14, 2,-13, -1, -3, 20, 8,-10,-27, -8, -4; /M: SY='K'; M=-10, -2,-27, -2, 6,-26,-17, 3,-29, 32,-27,-10, 2,-13, 9, 29, -3, -7,-20,-24, -8, 6; /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29, 76,-30,-17, 0,-28, 9, 0,-20,-30,-38,-19,-20,-10, -1, 12, 34,-29; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='V'; M= 8,-23,-11,-27,-24, -4,-23,-24, 19,-16, 6, 10,-23,-24,-22,-18, -5, 3, 33,-27,-11,-23; /M: SY='V'; M= -2,-28,-12,-30,-28, 0,-28,-24, 28,-18, 12, 20,-28,-28,-24,-18,-12, -2, 42,-28, -8,-26; /M: SY='M'; M= -1,-13,-18,-21,-12, -9,-16, -4, 6, -8, 5, 32,-12,-16, 3, -9, -5, 0, 2,-23, -6, -5; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 14,-34,-20, -1,-26, 33,-26, -6, 0,-10, 32, 21, -6,-10,-24,-20,-10, 23; /M: SY='A'; M= 12, -8,-16,-13,-13,-16, 2,-18, -8,-14,-14, -9, -2,-15,-13,-16, 11, 7, -1,-28,-17,-13; /M: SY='N'; M= -6, 5,-24, 2, 7,-22,-14, -9,-17, -1,-22,-15, 10, 8, -1, -6, 6, 5,-19,-32,-18, 2; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='T'; M= -2, 10,-12, 4, -4,-14,-13,-11,-14, -7,-15,-13, 9,-10, -6, -8, 16, 30, -7,-30,-12, -5; D=-4; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='Y'; M=-18,-22,-30,-22,-20, 23,-25, 8, -4,-11, -4, -4,-22,-27,-11,-11,-22,-13,-13, 50, 61,-18; D=-4; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='W'; M=-18,-33,-38,-35,-27, 23,-20,-25,-14,-20,-12,-14,-31,-27,-22,-18,-31,-23,-21,105, 27,-20; D=-4; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='E'; M= -3, 2,-17, 4, 17,-21,-10, -1,-17, 8,-17, -9, 2, -5, 17, 4, 6, -1,-16,-19,-11, 17; D=-4; /I: I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18; /M: SY='S'; M= 12, 1,-11, -3, -2,-15, -2, -8,-12, -6,-16,-12, 6, 0, -3, -9, 13, 5, -9,-22,-15, -3; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='T'; M= -3, -3,-11, -7, -6, -4,-13, -6, -8, -4, -9, -7, -1,-10, -4, 0, 9, 19, -4,-14, 3, -6; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='P'; M= -7,-14,-28, -7, 0,-21,-14,-14,-14, -7,-21,-14,-14, 62, -7,-14, -7, -7,-21,-21,-21, -7; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='F'; M= -9,-15,-12,-20,-16, 36,-16,-13, -3,-17, 1, -3, -9,-17,-20,-12, -4, 1, -1, -2, 12,-16; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='R'; M=-11, 1,-19, 3, 2,-16,-13, -2,-20, 16,-15, -9, 2,-11, 4, 30, -3, -2,-13,-17, -8, 1; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='A'; M= 40,-10,-14,-18,-12,-22, 15,-20,-16,-12,-14,-12, -8,-12,-12,-20, 8, -4, -6,-20,-22,-12; /M: SY='S'; M= -3, -3,-17, -6, -5,-18,-15, 2, -8, -8,-15, -6, 3,-17, 3, -7, 10, 7, -2,-32,-10, -1; /M: SY='A'; M= 34,-10,-16,-17,-13,-23, 22,-20,-19,-13,-16,-13, -7,-13,-13,-20, 7, -6, -9,-20,-23,-13; /M: SY='E'; M= -6, -5,-25, -4, 14,-12,-21, 0,-13, -2, -6, -6, -8,-13, 11, -5, -4, -3,-16,-14, 5, 12; /M: SY='P'; M= -6,-10,-28, -6, 1,-25,-14,-12,-23, 5,-28,-17, -5, 26, -1, 7, 5, -1,-21,-30,-21, -3; /M: SY='G'; M= 6,-10,-28,-11,-19,-29, 62,-20,-36,-19,-28,-19, -1,-19,-19,-20, 1,-18,-26,-20,-29,-19; /M: SY='I'; M= -6,-30,-20,-34,-28, 2,-34,-28, 36,-26, 21, 16,-26,-26,-24,-24,-18, -6, 35,-24, -4,-28; /M: SY='Q'; M= -6, -3,-23, -5, 8,-27,-20, -1,-14, 0,-11, -1, -3,-12, 33, 1, 4, 4,-18,-24,-10, 20; /M: SY='L'; M= -9,-30,-20,-32,-23, 7,-32,-23, 26,-29, 40, 19,-28,-28,-21,-22,-26, -9, 18,-21, -1,-23; /M: SY='K'; M=-11, -1,-30, -1, 9,-29,-20, -9,-30, 48,-29,-10, 0,-11, 10, 35,-10,-10,-20,-20,-10, 9; /M: SY='L'; M= 3,-27,-15,-28,-22, 1,-25,-24, 19,-23, 25, 11,-27,-27,-22,-20,-16, -5, 23,-24, -7,-22; /M: SY='V'; M= -2,-30,-13,-32,-30, 0,-32,-30, 33,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 47,-28, -8,-30; /M: SY='N'; M=-13, 37,-24, 30, 6,-26, -5, 5,-26, 7,-30,-21, 41,-16, 1, 2, 5, -4,-29,-37,-19, 4; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='A'; M= 11, 4,-17, -4, 1,-20,-11,-12,-17, 3,-17,-12, 6,-11, -3, -4, 9, 11,-11,-27,-15, -1; /M: SY='T'; M= -1, 1,-14, -5, -1,-15,-18,-16,-15, -2,-15,-12, 1, -9, -4, -5, 18, 36, -6,-30,-12, -3; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='P'; M= -9,-18,-36,-10, -1,-28,-20,-20,-19,-10,-28,-19,-18, 78,-10,-19, -6, -3,-26,-30,-28,-10; /M: SY='G'; M= 1, -9,-28, -9,-18,-29, 62,-19,-38,-19,-30,-20, 1,-19,-18,-19, 5,-15,-28,-22,-29,-18; /M: SY='E'; M= -8, 5,-27, 7, 25,-25,-18, -6,-22, 1,-21,-17, 3, 12, 8, -5, 3, 3,-24,-31,-19, 16; /M: SY='A'; M= 13,-10,-18,-17,-10,-11,-13, 6, -9, -6, -7, 2, -8,-16, -4, -5, -2, -2, -6,-17, 1, -9; /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20, 8,-28,-16, 20,-26, 45, 27,-28,-28,-16,-18,-28,-10, 10,-20, 0,-18; /M: SY='R'; M=-12,-10,-28,-11, -1,-20,-18, -2,-28, 25,-19,-10, -1,-19, 8, 60, -8, -9,-18,-20,-11, -1; /M: SY='N'; M=-13, 43,-23, 36, 6,-26, -3, 7,-26, 0,-30,-23, 48,-17, 0, -3, 7, -3,-30,-40,-20, 3; /M: SY='A'; M= 34, -6,-10,-12, -6,-20, 0,-16,-14,-10,-18,-14, -2,-10, -6,-16, 22, 8, -4,-28,-20, -6; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='H'; M=-15, -1,-27, -2, 2,-16,-20, 46,-19, -4, -9, -1, 6,-19, 4, 0,-11,-14,-21,-28, 5, 0; /M: SY='T'; M= -2, 6,-14, 2, 0,-16,-17,-15,-16, -7,-15,-14, 3, -9, -5, -9, 18, 35, -7,-32,-13, -3; /M: SY='G'; M= 11,-10,-25,-12,-18,-28, 54,-20,-33,-18,-25,-18, -2,-18,-18,-20, 2,-15,-23,-20,-28,-18; /M: SY='D'; M= -8, 28,-21, 35, 9,-29, -7, -5,-29, -4,-28,-24, 18,-11, -1, -9, 15, 7,-20,-39,-19, 4; /M: SY='T'; M= 0, -3,-10,-12,-12, -9,-21,-21, -6,-11, -8, -8, -3,-12,-12,-11, 17, 44, 6,-30,-10,-12; /M: SY='P'; M= -6, -1,-25, 0, 1,-24,-18,-15,-21, 7,-24,-15, -3, 16, -3, -2, 3, 11,-16,-29,-17, -2; /M: SY='N'; M= -8, 30,-23, 24, 1,-26, 9, 1,-28, -4,-30,-22, 36,-17, -3, -7, 10, -3,-28,-37,-22, -1; /M: SY='Q'; M=-10, 3,-30, 6, 32,-37,-20, 7,-23, 10,-20, -6, 0, -7, 48, 7, 0,-10,-30,-23,-13, 40; /M: SY='V'; M= 14,-21,-10,-25,-22, -7,-21,-26, 14,-16, 2, 2,-21,-22,-22,-19, -1, 6, 31,-27,-13,-22; /M: SY='R'; M=-11, -4,-24, -7, 0,-20,-20, -9,-24, 23,-20,-10, 0,-14, 4, 34, -1, 8,-14,-23,-10, 0; /M: SY='L'; M= -7,-24,-17,-26,-19, 5,-28,-21, 15,-25, 34, 13,-24,-26,-19,-18,-18, 3, 12,-23, -3,-19; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='H'; M=-13, -2,-28, -2, 3,-19,-19, 39,-24, 9,-21, -5, 3,-16, 12, 7, -5,-11,-23,-20, 11, 5; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='P'; M= -5, -5,-30, 2, 0,-28, -4,-15,-24,-10,-30,-21, -5, 40, -7,-16, 6, -3,-25,-33,-26, -6; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='M'; M= -7,-11,-15,-13, -8, -6,-16, -7, 1, 5, 2, 13,-10,-14, -2, 7,-11, -6, 3,-15, -4, -5; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='N'; M= -5, 19,-20, 13, 5,-25, -5, 1,-23, 4,-29,-17, 28,-14, 8, 1, 15, 3,-23,-35,-18, 7; /M: SY='I'; M= -3,-19,-24,-23,-13,-14,-28,-18, 17, -9, 1, 8,-15,-18, 0,-12,-10, -7, 13,-22, -7, -9; /M: SY='G'; M= 4,-10,-28,-11,-19,-29, 64,-20,-38,-19,-28,-19, -1,-19,-19,-20, 1,-18,-28,-20,-29,-19; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='K'; M= -8, -3,-24, -4, 5,-22,-21,-12,-19, 24,-19, -9, -3,-12, 3, 18, -3, 3, -9,-24,-11, 3; /M: SY='P'; M=-14, 15,-34, 29, 17,-34,-16, -8,-30, -3,-29,-24, 0, 34, -1,-13, -4,-10,-30,-34,-24, 6; /M: SY='R'; M=-15, 0,-27, -5, -2, -9,-18, 0,-22, 19,-20,-10, 9,-19, 2, 28, -8, -8,-19,-16, 2, -2; /M: SY='T'; M= 0,-11,-10,-17,-17, -6,-24,-24, 5,-14, -3, -3,-11,-17,-17,-14, 9, 31, 19,-30,-10,-17; /M: SY='A'; M= 33, -6,-10,-11, -6,-20, 0,-16,-14,-10,-19,-14, -1,-10, -6,-16, 23, 9, -4,-29,-20, -6; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='Q'; M= -9, -5,-24, -6, 7,-16,-20, 2,-14, 0, -8, -3, -4,-14, 15, 0, -2, -1,-16,-23, -5, 11; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='H'; M=-11,-10,-25,-12, -3,-16,-24, 24, -6,-10, -2, 5, -6,-19, 12, -5, -9, -8,-10,-25, 2, 2; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='E'; M= -2, 5,-23, 8, 18,-27,-14, -5,-24, 6,-22,-14, 3, -8, 14, 3, 9, 3,-19,-29,-16, 15; /M: SY='I'; M= -6,-24,-21,-32,-26, -2,-34,-28, 33,-24, 12, 12,-18,-20,-20,-24,-10, 4, 29,-24, -4,-26; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='Y'; M=-11,-19,-20,-22,-19, 16,-27, -2, 4,-19, 11, 4,-17,-25,-17,-14,-13, 2, 3, -8, 21,-19; /M: SY='I'; M=-10,-28,-28,-38,-28, 0,-36,-24, 44,-26, 20, 28,-20,-20,-16,-26,-20,-10, 26,-20, 0,-26; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='F'; M=-12,-30,-18,-35,-28, 36,-31,-24, 17,-27, 20, 9,-25,-29,-31,-21,-20, -7, 18,-10, 10,-28; /M: SY='R'; M=-14,-12,-26,-13, -7, -4,-24, 2,-13, 9,-11, -4, -9,-21, 2, 20, -9, -2,-10, -6, 18, -6; /M: SY='L'; M=-11,-26,-19,-32,-22, 17,-26,-13, 17,-22, 30, 30,-25,-26,-17,-16,-24, -9, 11,-16, 4,-19; /M: SY='Y'; M=-20,-21,-28,-23,-21, 38,-29, 17, -2,-15, 1, 0,-18,-29,-15,-12,-19,-11, -9, 20, 63,-21; /M: SY='E'; M=-12, 11,-29, 14, 31,-30,-17, 2,-27, 15,-23,-15, 8, -8, 22, 12, -1, -9,-28,-28,-16, 26; /M: SY='G'; M= -1, -9,-30, -9,-17,-30, 61,-19,-39,-13,-30,-19, 0,-19,-17,-15, -1,-19,-29,-20,-28,-17; /M: SY='N'; M= 1, 11,-18, 4, 4,-22, -7, -5,-21, 6,-26,-16, 19,-12, 1, 1, 15, 8,-17,-33,-17, 3; /M: SY='N'; M=-12, 18,-25, 13, 7,-24,-13, 10,-26, 12,-25,-15, 21,-14, 4, 10, 1, -1,-24,-31,-11, 5; /M: SY='L'; M=-10,-26,-22,-28,-17, 3,-28,-15, 19,-23, 36, 24,-25,-26, -9,-16,-25,-10, 8,-20, -1,-14; /M: SY='V'; M= -1,-23,-18,-25,-16, -4,-28,-22, 22,-18, 12, 12,-22,-22,-17,-19,-12, -5, 26,-25, -8,-18; /M: SY='A'; M= 20,-19,-16,-28,-19, -3,-16,-21, 11,-17, 3, 7,-16,-17,-16,-21, -4, -4, 13,-19, -8,-18; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='S'; M= 9, 0,-10, -1, -1,-19, -2,-11,-19,-10,-28,-19, 9,-10, -1,-10, 38, 23, -9,-39,-19, -1; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='N'; M= -3, 15,-21, 3, -5,-18, -7, -1,-13, -2,-20,-10, 27, -8, -3, -1, 3, -3,-18,-33,-18, -5; /M: SY='I'; M= -8,-28,-23,-34,-26, 2,-35,-27, 36,-27, 23, 16,-23,-24,-21,-25,-18, -5, 27,-22, -2,-26; /M: SY='Y'; M=-18,-24,-26,-27,-23, 34,-31, 2, 7,-19, 12, 5,-22,-29,-18,-15,-22,-10, -2, 14, 51,-23; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='D'; M= -6, 10,-22, 15, 12,-27,-12, -6,-28, 11,-27,-18, 7,-10, 5, 8, 11, 3,-19,-32,-16, 8; /M: SY='T'; M= 1, 0,-10, -9, -9,-11,-18,-19,-11,-10,-12,-11, 1,-10, -9,-10, 22, 47, -1,-31,-11, -9; /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-31,-23, 16,-30,-16, 20,-25, 30, 21,-26,-27,-20,-19,-24, -9, 13,-14, 9,-22; /M: SY='K'; M= 0, -7,-25, -9, 2,-23,-17, -9,-19, 21,-14, -6, -5,-14, 8, 19, -7, -8,-14,-20,-11, 4; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21, 8,-30,-19, 24,-28, 43, 25,-28,-28,-18,-20,-28,-10, 12,-20, 0,-20; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='V'; M= -5,-30,-14,-31,-27, 12,-30,-26, 24,-24, 21, 12,-29,-30,-28,-20,-17, -4, 33,-23, -3,-27; /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28, 69,-30,-11, 0,-26, 8, 0,-20,-30,-34,-18,-20,-10, -2, 14, 41,-28; /M: SY='C'; M= -9,-22, 92,-31,-30,-16,-31,-30,-16,-29,-13,-13,-21,-37,-29,-29,-11, -9, -1,-45,-25,-30; /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29, 72,-30,-20, 2,-30, 15, 2,-21,-30,-38,-20,-21,-10, 1, 7, 27,-29; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='E'; M=-11, 4,-31, 12, 43,-29,-20, -3,-29, 13,-22,-18, -2, 8, 15, 6, -3,-10,-28,-28,-19, 28; /M: SY='Q'; M=-10, 5,-24, -1, 9,-18,-15, 2,-10, 5,-10, 10, 8,-14, 11, 1, -5, -8,-15,-27,-11, 10; /M: SY='I'; M= -5,-30,-20,-35,-30, 0,-35,-30, 40,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 40,-25, -5,-30; /M: SY='I'; M=-11,-26,-27,-35,-27, 11,-36,-24, 34,-26, 14, 13,-18,-21,-20,-25,-16, -3, 20,-14, 9,-27; /M: SY='W'; M=-20,-38,-44,-40,-30, 24,-22,-28,-16,-22,-14,-16,-36,-30,-24,-20,-36,-26,-24,122, 30,-22; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='N'; M=-13, 43,-23, 33, 5,-25, -3, 7,-25, 0,-30,-23, 50,-17, 0, -3, 7, -3,-30,-40,-20, 3; /M: SY='L'; M= -8,-28,-18,-30,-22, 6,-28,-17, 22,-23, 35, 27,-28,-28,-17,-18,-24, -8, 18,-22, -2,-20; /M: SY='K'; M= -9, -5,-27, -6, 9,-24,-21, -5,-14, 22,-14, 6, -6,-12, 15, 12, -9, -9,-12,-22, -9, 12; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='R'; M= -9, -6,-23, -7, 2,-18,-16, -5,-20, 13,-17, -5, 0,-14, 5, 27, 3, 2,-13,-26,-12, 2; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='N'; M= -9, 25,-22, 13, 7,-22, -6, 4,-23, 8,-28,-18, 37,-16, 4, 8, 8, -1,-26,-35,-18, 5; /M: SY='D'; M=-18, 38,-29, 51, 20,-35,-11, 1,-36, 5,-28,-26, 19,-11, 3, 1, 0, -9,-29,-37,-19, 11; /M: SY='T'; M= -3, 16,-18, 12, 0,-21,-11, -8,-21, -3,-20,-17, 15,-13, -4, -3, 13, 17,-14,-33,-16, -2; /M: SY='I'; M= -6,-30,-20,-35,-29, 1,-35,-29, 38,-26, 20, 16,-25,-25,-24,-25,-17, -6, 36,-24, -4,-29; /M: SY='P'; M=-10,-18,-39, -9, 1,-30,-20,-19,-21, -4,-30,-19,-18, 80, -8,-15,-10,-10,-29,-29,-28, -8; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Post-processing [info]
| COMPETES_HIT_WITH | PS51234 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 22 in 22 different sequences |
| Number of true positive hits | 22 in 22 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | N_Hulo |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | TSP C-terminal |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
22 sequences
COMP_BOVIN (P35445), COMP_HUMAN (P49747), COMP_MOUSE (Q9R0G6), COMP_RAT(P35444), TSP1_BOVIN (Q28178), TSP1_HUMAN (P07996), TSP1_MOUSE (P35441), TSP1_XENLA (P35448), TSP2_BOVIN (Q95116), TSP2_CHICK (P35440), TSP2_HUMAN (P35442), TSP2_MOUSE (Q03350), TSP3A_DANRE (Q8JHW2), TSP3B_DANRE (Q1L8P7), TSP3_HUMAN (P49746), TSP3_MOUSE (Q05895), TSP4B_DANRE (Q8JGW0), TSP4_BOVIN (Q3SWW8), TSP4_HUMAN (P35443), TSP4_MOUSE (Q9Z1T2), TSP4_RAT(P49744), TSP4_XENLA (Q06441)» more
|
| PDB [Detailed view] |
4 PDB
1UX6; 1YO8; 2RHP; 3FBY |