PROSITE entry PS51237
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | CYSA |
| Accession [info] | PS51237 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-AUG-2006 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51237 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein cysA family profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=148; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=143; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7113944; R2=0.0100890; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=990910; N_SCORE=9999.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=4142; N_SCORE=43.5; MODE=1; TEXT='?'; /CUT_OFF: LEVEL=-2; SCORE=475; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='??'; /DEFAULT: M0=-20; D=-80; I=-80; B1=-200; E1=-200; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255; ... A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y /I: B1=0; BI=-255; BD=-255; /M: SY='Q'; M=-31,-56,-27, -7,-53,-39,-18,-46,-12,-41,-29,-22,-18,112,-13,-21,-34,-48,-40, 7; /M: SY='E'; M=-17,-51, 23, 85,-55,-43,-25,-54, 9,-48,-43,-25,-29, 21,-21, -4,-30,-47,-52,-43; /M: SY='E'; M=-31,-53, -2, 97,-55,-48,-25,-56,-13,-48,-44,-28,-27, -5,-23,-28,-32,-48,-52,-45; /M: SY='A'; M= 85,-33,-39,-31,-47,-20,-41,-37,-34,-39,-33,-34,-38,-31,-39,-12,-24,-23,-47,-43; /M: SY='M'; M=-36,-41,-55,-47,-16,-54,-37, 14,-45, 64, 74,-49,-50,-38,-44,-44, -9,-10,-44,-24; /M: SY='E'; M=-30,-51, 36, 88,-55,-43,-25,-55,-15,-49,-46,-24,-29, -9,-25, 8,-29,-48,-54,-44; /M: SY='V'; M=-28,-39,-55,-48,-21,-56,-49, 18,-47, 35, 30,-51,-51,-45,-47,-41,-26, 70,-53,-30; /M: SY='A'; M= 77,-33,-37,-31,-47,-21,-39,-38,-33,-40,-34,-30,-37,-29,-38, 31,-15,-26,-48,-42; /M: SY='D'; M=-39,-52,101, -4,-59,-36, 7,-57,-25,-55,-52, 10,-39, 8,-33,-26,-29,-54,-73,-40; /M: SY='R'; M=-35,-53,-24, 44,-50,-47, -2,-54, 10,-46,-37,-27,-40, 17, 84,-20,-21,-47,-49,-36; /M: SY='I'; M=-30,-43,-56,-52,-23,-59,-57, 70,-48, -7,-10,-49,-48,-48,-51,-41,-26, 64,-52,-31; /M: SY='V'; M= 14,-37,-52,-46,-28,-50,-55, 12,-45,-13,-16,-48,-49,-46,-47,-34,-22, 82,-58,-34; /M: SY='V'; M=-27,-40,-55,-49,-23,-57,-54, 38,-47, 18,-11,-50,-50,-48,-49,-40,-25, 75,-54,-31; /M: SY='M'; M=-35,-41,-56,-46, 13,-51,-31, -6,-42, 43,107,-46,-47,-35,-40,-44,-33, -9,-42,-20; /M: SY='N'; M=-29,-40, 6, -1,-48,-25, -2,-48, 7,-53,-41, 90,-41,-19, -3, 33,-18,-47,-62,-41; /M: SY='Q'; M= -1,-48,-23, 6,-51,-35, 37,-49, 39,-46,-34, 32,-38, 69, 21, 1,-28,-46,-50,-34; /M: SY='G'; M=-20,-48,-36,-48,-54, 93,-43,-62,-41,-58,-47,-22,-40,-39,-49,-21,-40,-56,-45,-49; /M: SY='R'; M=-20,-24,-29,-21,-48,-14, 4,-47, 37,-45,-35, 29,-43, 29, 73,-27,-32,-21,-49,-35; /M: SY='I'; M=-35,-47,-57,-54, 1,-61,-56, 83,-50, 8, -8,-48,-47,-47,-52,-44,-29, 35,-45,-27; /M: SY='E'; M=-32,-51, -7, 91,-47,-49,-27,-14,-16,-12,-36,-31,-29, -9,-26,-30,-32,-22,-51,-42; /M: SY='Q'; M=-31,-56,-26, -5,-61,-39,-19,-47,-11,-42,-29,-21,-38,115,-11,-20,-33,-49,-44,-32; /M: SY='V'; M=-12,-42,-49,-41,-27,-52,-48, 52,-40, -2, 5,-42,-46, 27,-42,-34, 1, 58,-51,-31; /M: SY='G'; M=-12,-48, 24,-38,-55, 86,-39,-61,-38,-57,-47, -6,-40,-36,-46,-21,-37,-54,-48,-48; /M: SY='T'; M= -6,-36,-28,-12,-43,-31,-34,-39, 3,-42,-36,-18,-33,-24, -8, 60, 66,-31,-55,-38; /M: SY='P'; M= 15,-56,-38,-27,-55,-36,-41,-44,-34,-53,-40,-42,109,-36,-45,-12,-28,-45,-50,-52; /M: SY='D'; M= 16,-47, 51, 28,-52,-12,-28,-28, 14,-44,-38, 1,-37, 46, 7,-23,-12,-19,-53,-39; /M: SY='E'; M= -4,-50, 39, 77,-54,-41,-24,-52,-16,-47,-13, 13,-32, 23, -5,-26,-30,-46,-54,-42; /M: SY='V'; M=-29,-41,-56,-50,-22,-58,-54, 53,-48, 21, -9,-50,-50,-47,-49,-41,-26, 67,-52,-30; /M: SY='Y'; M=-41, 1,-44,-44, 5,-47, 7,-31,-37,-28,-25,-43,-53,-33,-35,-11,-37,-36, 81,110; /M: SY='D'; M=-17,-50, 78, 37,-54,-37, 6,-55,-17,-51,-46, 22,-38,-18, 35,-18,-29,-50,-62,-40; /M: SY='H'; M= -2,-47,-23, 16,-45,-23, 78,-48, 16,-43,-32, 16,-38, 46, 14, -5, 16,-44,-53,-12; /M: SY='P'; M=-38,-63,-38,-27,-58,-40,-41,-45,-34,-56,-42,-45,117,-38,-47,-35,-30,-51,-51,-55; /M: SY='A'; M= 57,-38,-29, 6,-45,-28,-34, -2, -7,-37,-32, 27,-38, 9, -7, 2, 5,-14,-50,-40; /M: SY='S'; M=-21,-36, -1,-28,-44,-27,-29,-40,-26,-45,-38, 51,-35,-24,-33, 61, 57,-34,-59,-39; /M: SY='P'; M= 24,-49,-16, -2,-15,-36,-35,-43,-25,-46,-37,-34, 82,-29, 25, 3, -2,-40,-46, -5; /M: SY='F'; M=-47,-43,-60,-55,109,-54,-39,-20,-50,-12,-22,-48,-58,-61,-47,-46,-39,-26,-12, 10; /M: SY='V'; M=-23,-37,-55,-48,-26,-56,-57, 10,-46,-11,-14,-50,-51,-49,-48,-38,-22, 88,-60,-33; /M: SY='Y'; M=-24, 14,-44,-44, 37, -6, 13,-23,-39, -2, 62,-37,-48,-36,-38,-33, 15,-27,-20, 77; /M: SY='S'; M=-26,-47, 22, 36,-49, 36, 25, -8,-25,-45,-39, 7,-36, 15,-12, 36,-26,-41,-53,-38; /M: SY='F'; M=-47,-43,-59,-55,108,-55,-39,-20,-50, -3,-21,-49,-57,-60,-47,-46,-39,-25,-13, 9; /M: SY='L'; M=-34,-42,-55,-49, -5,-55,-43, 39,-48, 57, 32,-50,-51,-42,-47,-21,-30, 27,-45,-26; /M: SY='G'; M=-20,-48,-36,-48,-54, 93,-43,-62,-41,-58,-47,-22,-40,-39,-49,-21,-40,-56,-45,-49; /M: SY='D'; M= 13,-46, 45, 43,-44,-35, 14,-43,-24,-10,-36, 27, 5, 18,-30, 3,-27,-40,-52, -4; /M: SY='V'; M= 19,-37,-44,-39, -6,-40,-46, 4,-10,-10,-21,-37,-44,-37,-39, 26, -4, 62,-52,-33; /M: SY='N'; M=-27,-42, 3,-31,-47,-27,-21, 6,-25,-47,-39, 97,-46,-26,-33, 8,-21,-39,-66,-43; /M: SY='R'; M=-18, 2,-36, 9,-40,-48, 15,-31, -2, 0,-29,-33,-45, 13, 59,-13, 1, 12, 11,-34; /M: SY='F'; M=-42,-44,-59,-53, 63,-32,-44, 22,-52, 52,-10,-53,-56,-50,-50,-48,-37, -4,-33,-13; /M: SY='P'; M=-22,-53, 12, 1,-50,-39, 56,-47,-19,-49,-39, 7, 71, 8,-12, 13,-10,-28,-56,-17; /M: SY='G'; M= -4,-47,-15,-41,-14, 67,-41,-38,-17,-23,-37, -4,-44, -6,-24,-10,-34, 10,-49,-41; /I: I=-4; MD=-14; /M: SY='R'; M=-34, 1, 6, 18,-45,-46, 23,-36,-14,-13,-34, -1,-44, 5, 39, 1, 25, 4,-59,-38; D=-4; /I: I=-4; MD=-14; /M: SY='V'; M= 0,-48,-28,-19,-33,-50,-48, 28,-43, 0,-24, 5,-25,-42,-27,-10,-31, 42, 33,-12; D=-4; /I: I=-4; MD=-14; /M: SY='H'; M= 4,-55, -2, 35,-57,-25, 37,-58, -1,-54,-45,-31,-44, 14, 33, 9,-22,-51,-60,-43; D=-4; /I: I=-4; MD=-14; /M: SY='G'; M=-15,-54, 2, -7,-53, 34, 5, -8, -5,-29,-42, 20,-47, 13,-10, 0,-25,-45,-59,-46; D=-4; /I: I=-4; MD=-14; /M: SY='G'; M=-17,-55,-19,-50, -4, 66,-47,-28,-45,-33,-47, 8,-50,-45,-27,-11,-43,-51,-53,-47; D=-4; /I: I=-4; MD=-14; /M: SY='Q'; M=-31,-57, -9, 6, -7, -6, 16,-48, 5,-37,-41, 14,-49, 48, 17,-34,-16,-16,-56,-39; D=-4; /I: I=-4; MD=-14; /M: SY='W'; M=-12,-55,-61,-35, 31,-40,-56, 7,-54, 10,-29,-56,-59,-53,-56,-23,-24, 18, 75, -8; D=-4; /I: I=-4; MD=-14; /M: SY='W'; M=-23,-59,-44, 0, -8,-38, 36,-39, -7, -8,-37,-21,-11, 15, -3,-42,-16, -2, 55, -6; D=-4; /I: I=-4; MD=-14; /M: SY='V'; M= -5,-53,-56,-56, -8,-36,-22, 16,-53, 21,-26, 5,-60,-51,-55,-32,-25, 22,-56, -5; D=-4; /I: I=-4; MD=-14; /M: SY='G'; M= 6,-57,-29,-27,-33, 55,-14,-29,-49,-57,-51,-10,-53,-22,-55,-15,-45,-25,-60,-53; D=-4; /I: I=-4; MD=-14; /M: SY='G'; M= -3,-59, 17, 27,-64, 32,-46,-64,-29,-49,-55,-20,-11,-36,-47, 10,-41,-58,-65,-57; D=-4; /I: I=-4; MD=-14; /M: SY='H'; M=-16,-60,-26,-47, 14,-36, 49, -8,-43,-19,-40,-16,-60,-11, 10, -6,-29,-20,-61,-36; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='W'; M=-19,-67,-36,-58,-12,-66, 2, 12,-40,-16,-41,-38, 16,-57,-20,-55,-35, 3, 25,-47; D=-4; /I: I=-4; DM=-14; /M: SY='W'; M=-34,-68,-20, 2,-44,-64,-59, 11,-24, 7,-39,-58, 19,-23,-54,-54,-35,-40, 80,-42; D=-4; /I: I=-4; DM=-14; /M: SY='P'; M= 3,-57,-29,-47,-55,-11,-53,-44,-48, -8,-44,-46, 38,-24,-35, 15, 2,-15,-66,-55; D=-4; /I: I=-4; DM=-14; /M: SY='P'; M=-36, -3, -7,-43,-29,-38,-50,-15,-23, 17,-35,-20, 58,-10,-51,-32,-29,-27,-61,-49; D=-4; /I: I=-4; DM=-14; /M: SY='P'; M= 8,-58, 7, 17,-23, 7,-46, -3,-40,-50,-46, -7, 26,-22,-22,-26,-20,-31,-60,-50; D=-4; /I: I=-4; DM=-14; /M: SY='H'; M= 9,-51,-43,-14, 14,-48, 38,-14,-17,-12,-33, -7,-17, 2,-22, -4,-17, 3,-50, 8; D=-4; /I: I=-4; DM=-14; /M: SY='Q'; M= 13,-52, 8,-21,-50,-20,-37,-51,-12,-52,-44,-15, 13, 37,-37, 25, 11,-46,-53, 9; D=-4; /I: I=-4; DM=-14; /M: SY='P'; M= 1,-53, 2, 19,-55,-12, 8,-50,-14,-20,-43, 23, 26, 9,-38, -5, 2,-48,-62,-48; D=-4; /I: I=-4; DM=-14; /M: SY='W'; M= 12,-52,-26,-21,-42,-14,-14, -1,-41, 5, 6,-23, 5, 9,-18, -5,-37, 4, 27,-41; D=-4; /I: I=-4; DM=-14; /M: SY='H'; M= 0,-53, 9, 9,-26, 4, 28,-50,-21,-22,-42, 0, 17, -4,-24, 11,-13,-47,-55, -3; D=-4; /I: I=-4; DM=-14; /M: SY='Q'; M= 9,-52, 24, 9,-51,-11, -4, 0,-20,-44, 0, 25,-23, 30,-22,-25, -4,-39, 18,-42; D=-4; /I: I=-4; DM=-14; /M: SY='Q'; M= -8,-54,-13, 2,-58, 49, 20,-54,-31,-44,-41, 0,-23, 60,-35,-26,-25,-35,-54,-44; D=-4; /I: I=-4; DM=-14; /M: SY='P'; M= 14,-51, -2, 17,-55,-34, 35,-50, 4,-50,-41, -3, 35, 25, -6, 11,-11,-33,-58,-42; D=-4; /I: I=-4; DM=-14; /M: SY='A'; M= 39,-12,-42,-14,-39, 9,-28,-27, -8,-26,-32,-38, -8,-26,-24, 1,-30, 27,-48, 13; D=-4; /I: I=-4; DM=-14; /M: SY='T'; M=-24,-49, 31, 22,-45,-46, 22, -5,-16,-17,-34,-13,-18, 7, 11,-13, 33, -5,-60,-39; D=-4; /I: I=-4; DM=-14; /M: SY='L'; M= 25,-44,-54,-49, 27, -2,-46, 11,-48, 30,-19,-47,-52,-46,-49,-37,-34, 23,-43, -3; D=-4; /I: I=-4; DM=-14; /M: SY='Y'; M=-29,-49,-52,-51, 74,-53,-24,-24,-45, 6,-21,-48,-58,-45,-42,-43,-39,-29,-10, 87; /M: SY='V'; M= 3, -7,-56,-50, 28,-53,-51, 28,-48, 24,-15,-50,-52,-48,-49,-39,-19, 55,-47,-26; /M: SY='R'; M=-26,-56,-37,-25,-49,-50,-26,-56, 2,-48,-37,-30,-49,-14,100,-34,-39,-49,-49,-36; /M: SY='P'; M=-39,-64,-40,-29,-59,-41,-42,-48,-34,-57,-44,-44,112,-38,-16,-14,-32,-52,-53,-55; /M: SY='H'; M=-41,-55,-11, 15,-34,-24,111,-54,-30,-43,-32, -4,-43, -8,-18,-32,-21,-54, 60, 27; /M: SY='D'; M=-38,-55, 79, 62,-59,-43, 5,-59,-22,-54,-50,-17,-35, 4,-30,-29,-33,-54,-65,-43; /M: SY='V'; M=-36,-44,-59,-52, 28,-59,-50, 39,-50, 36, 24,-53,-53,-48,-50,-46,-33, 43, 29,-22; /M: SY='E'; M= 3, 8, 20, 42,-40,-44, -3, -1,-28,-18,-11,-31,-40, 0, -7, 4, -3, 15,-52, -4; /I: I=-10; MD=-33; /M: SY='I'; M=-40,-49,-61,-56,-22,-63,-53, 55,-54, 39, 3,-56,-55,-50,-54,-50,-36, 29, 22,-10; D=-10; /I: I=-10; MD=-33; /M: SY='S'; M= 5,-53,-12, 6,-57, 0, -7,-54, -8,-23,-47, -7,-49, -9,-42, 35, -8,-49,-64,-50; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-33; IM=0; DM=-33; /M: SY='T'; M= -8,-58,-48,-13,-51,-55,-49,-17, 5,-15,-42,-43,-25, -4, 5, -4, 22,-30, 9,-24; D=-10; /I: I=-10; DM=-33; /M: SY='Q'; M= -4,-58, 4, 24,-58,-32,-12,-50, -9,-44,-44,-35, 28, 39, 3, -8,-12,-21,-59,-32; D=-10; /I: I=-10; DM=-33; /M: SY='P'; M= 5,-50, 10, 0,-50, 5, 32,-11,-23,-45, -1, 4, 53, 0,-38, 14, -9,-40,-56,-41; /M: SY='D'; M= 12, 18, 31, 7,-48, 7,-11,-26,-30,-10,-37, 12,-43, 11, -1, 18,-15,-34,-57,-42; /M: SY='Q'; M= 17,-47, 21, 7,-48, 11, 1,-33,-11,-14,-36,-27, -6, 27,-17, 2, 16,-19,-55,-41; /M: SY='N'; M= 3, -4, 26, 22,-55, 19,-32,-52,-10,-53,-44, 31, 19, 22,-34, 9, -8,-48,-57,-46; /M: SY='G'; M= 29, 27,-38,-23,-48, 33, 11,-40,-38,-43, 0, -5, 17,-36,-43, 4, 19, -7,-56,-44; /M: SY='W'; M=-13,-48,-56,-52, 2,-56,-19, 53,-48, 33,-13,-50,-51,-45,-41,-43, -7, 6, 54, 11; /M: SY='P'; M= 19, 7,-39,-10,-49,-26,-40,-27,-23,-20,-37,-39, 79, -1,-10, 7,-30,-40,-51,-21; /M: SY='A'; M= 56,-40,-45,-41, -9, 24,-47,-26,-41,-35,-32,-37,-44,-40,-46,-22, -3, 29,-51,-41; /I: I=-24; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77; /M: SY='Q'; M= -2,-47,-15, 14,-48,-43,-15,-15, 21,-33,-34, -2,-40, 39, 23,-10, 35,-12,-54,-39; /M: SY='V'; M=-32,-45,-58,-54, -9,-61,-57, 49,-51, 1,-14,-53,-53,-51,-52,-44,-29, 67,-53,-11; /M: SY='E'; M= -4,-48, 6, 28,-41,-46,-11,-16, 15, -4,-31,-15,-41, 3, 20,-17, 22, 0,-52,-14; /M: SY='W'; M= 11,-51, 4, 7,-42,-22, 37,-50, 7,-37,-38, -5,-44,-23, 50,-19, -4,-45, 53, 4; /M: SY='I'; M= -2, -6,-50,-27,-31,-49,-50, 47,-30, 6, 6,-44,-20,-41,-47, 14,-27, 41,-54,-36; /M: SY='H'; M=-34,-48,-40,-36,-34,-47, 38, 21,-28, 7, -4, -1,-47, 13, 32, 8, 10, 9,-53,-13; /M: SY='P'; M= 9,-52, -3,-32,-15,-42, 35,-29,-19,-31,-13,-19, 43,-30, 32, -9,-12,-30, 16, 42; /M: SY='L'; M=-24,-46,-24,-39, -4,-15,-43, 18, 16, 28,-20,-39,-49,-35, 10, 1,-16, 20,-49,-33; /M: SY='G'; M= 10,-49,-15,-44,-56, 79,-43,-60,-37,-57,-47,-26,-43,-38, 0,-23,-23,-52,-50,-50; /M: SY='W'; M= 18,-48,-38,-38, 6, 23, 31,-44,-35,-45,-39, 14, 36,-35, -9, -7, 12,-28, 55,-32; /M: SY='W'; M=-16,-48,-34, 29, 22,-48,-36, -2, -9, -7, 19,-16,-44,-12, 11, -2, 7, 0, 29, 4; /M: SY='V'; M= 2,-44,-48,-42,-33,-49,-46, 15,-35, -4, 19,-41,-47, -5, 15,-23, 23, 46, 33,-34; /M: SY='R'; M=-39,-57,-34,-10,-28,-48, 40,-33, 18,-44,-34,-28,-46, 56, 68,-32,-38,-31,-47, 3; /M: SY='V'; M= 7,-43,-56,-50,-23,-54,-49, 25,-49, 44,-12,-52,-53,-46,-50,-42,-31, 46,-50,-11; /M: SY='E'; M=-35,-52, 40, 69,-51,-47,-31,-26,-20,-28,-42,-27,-36,-17, 12, -4, -6,-20,-58,-44; /M: SY='L'; M= 11,-43,-55,-49,-23,-52,-48, 20,-49, 52,-11,-52,-53,-45,-49,-26,-32, 33,-50,-32; /M: SY='Q'; M= 5,-48, 11, 17,-13,-41,-32,-27, 22,-24,-35,-15,-42, 27, 16, 7, 4,-17,-47, 7; /M: SY='P'; M=-24,-48,-23,-39,-15,-26, 4, 12,-34, 24,-23,-25, 30,-36, 19, 5, -6, 10, 2,-34; /M: SY='D'; M= 13,-48, 26, 22,-26, 4,-37,-13, -7, -4, -9,-14, 3,-12, 0,-28, 9,-24,-53,-40; /M: SY='D'; M= -1,-51, 49,-15,-56, 39, 0,-39, 1,-54,-46, 4, 6, 9,-23, 8,-32,-49,-57,-45; /I: I=-11; MD=-35; /M: SY='W'; M= -9,-49, -2,-14, 5, 21,-39,-43,-25,-32,-11, 11,-44, 25,-38, 17, 13,-29, 76,-30; D=-11; /I: I=-11; MD=-35; /M: SY='Q'; M=-23,-56, 32, -1,-56, 17, 19,-51,-19,-26,-43, 0,-20, 40, -8, -4,-22,-31,-61,-44; D=-11; /I: I=-11; MD=-35; /M: SY='W'; M=-26,-66,-17, 6,-60, -9, 11,-59,-43,-44,-53,-10, 5, 17,-27, -5,-27,-32, 53,-49; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-35; IM=0; DM=-35; /M: SY='N'; M=-21,-63,-30,-36,-48,-63,-56, 1,-58, 11,-39, 15,-11,-55,-62,-30,-28, -6,-69,-22; D=-11; /I: I=-11; DM=-35; /M: SY='W'; M=-48,-58,-16,-36, 6,-41,-57, 30,-57, 22,-25,-58,-62,-55,-59,-55,-45, 15, 54, 1; D=-11; /I: I=-11; DM=-35; /M: SY='E'; M=-24,-52, -1, 52,-48,-32, 34,-15, 1,-32,-16, -1, 8, 0, 11,-21, 12,-30,-55,-24; /M: SY='A'; M= 39,-43,-27, 0,-35,-42,-47, 33,-40,-14,-24,-41,-45,-20,-44,-11,-15, 37,-52,-16; /M: SY='H'; M=-23,-53,-23, 50,-24,-45, 51,-27, 2,-33,-37,-29, 28, 29, -8, 1, -4,-44,-52,-14; /M: SY='L'; M=-38,-46,-59,-54, 7,-38,-51, 47,-52, 48, -9,-54,-54,-49,-52,-48,-34, 30,-47,-28; /M: SY='S'; M= 2, -4, 1, 26,-50, 5,-37,-41,-31,-46,-41, 1, 21,-28,-39, 34, 29, -7,-58,-45; /M: SY='R'; M=-10,-51,-41,-22,-34,-23, 10, 10, 20, -5,-28,-20, 16,-29, 38,-22,-34, 6, 13, 15; /M: SY='D'; M=-20,-52, 36, 33,-53,-14, 11,-46, -7,-48,-42,-11, 26, 16, 13, 16,-30, -9,-58,-42; /M: SY='D'; M= 22,-49, 29, 15,-47,-39, 14,-30, -5,-19, 18,-29, -1, 19, 15, 4,-31,-26, 3,-38; /M: SY='F'; M= 22,-48,-23,-13, 59, -7, -6,-33,-42,-10,-31,-42, 34,-42,-45,-23,-36,-25, 15, 19; /M: SY='R'; M= -6,-49, 20, -4,-50, -7, 11,-46, -7,-28,-38, 23,-26, 23, 45, 12,-14,-23,-56,-39; /M: SY='Q'; M= 1,-50, 30, 27,-25,-19,-31,-26, 1, -6,-35, 18,-42, 31, 14, -9,-32,-27,-54,-39; /M: SY='L'; M=-11,-47, 16, -8, -7,-49, 37,-24,-24, 41,-19,-36,-49, 9,-24,-20, -9,-12,-47, 12; /M: SY='Q'; M= 18,-48,-18, -3,-48, 12, 28,-31,-29,-33,-37, 26, 27, 33,-12, 1,-13,-31,-52,-11; /M: SY='L'; M= -3,-46,-53,-47, 3,-33,-45, 30,-47, 44,-14,-48, 16,-44,-49,-15,-12, 5,-45, -5; /M: SY='Q'; M= 15,-50, -8, 17,-51,-21,-34,-42, 25,-32, -3,-30,-21, 43, 20, 2,-22,-13,-52,-41; /M: SY='P'; M= 1,-51, 6, 17,-50,-14, 9,-40, 6,-30,-38,-31, 35, 0, 16, 10,-20, 2,-56,-42; /I: I=-16; MD=-50; /M: SY='G'; M=-33,-54,-14,-30, 16, 64,-44,-52, -3,-51,-46, 2,-49,-23, -9,-32,-42,-21,-49,-41; D=-16; /I: I=-16; MI=0; MD=-50; IM=0; DM=-50; /M: SY='Q'; M=-24,-54, 46, 41,-59,-22,-29,-55, 1,-52,-45, 2,-39, 54, -4, 5,-14,-51,-58,-43; /M: SY='Q'; M=-10,-49,-32, 6,-36,-44, -8,-25, 15,-42,-35, 4,-20, 40, 35,-12, 31, -3,-55,-39; /M: SY='V'; M=-27,-45,-58,-53,-21,-60,-50, 33,-51, 38,-12,-55,-55,-49,-51,-46,-32, 51,-48, 13; /M: SY='Y'; M=-13,-53,-47,-45, 40,-12, -1,-17,-25,-23,-30,-25,-23,-20, 7,-38,-24,-17, 51, 74; /M: SY='I'; M= 0,-46,-58,-51, 23,-56,-52, 44,-50, 23,-15,-52,-53,-22,-51,-43,-33, 42,-47,-28; /M: SY='R'; M=-25,-52,-36, -7,-26, -2,-35, -8, 29,-42,-36,-30,-18, 41, 42, -3, -1, -9,-51,-39; /M: SY='P'; M= -5,-59,-45,-34,-25,-18,-45,-38,-38, -8,-37,-47, 95,-18,-22,-37,-35,-19,-52,-49; /M: SY='R'; M=-13,-52,-14,-24,-51,-32,-32,-50, 37,-35,-38,-28,-18, 21, 63, -9, 15,-45,-52,-40; /M: SY='R'; M= -3,-51,-17, -1,-46,-43, 28,-44, 26,-28,-37, 21,-46, 18, 39,-12, -9,-15,-53, -7; /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;» more |
Post-processing [info]
| PROMOTED_BY | PS50893 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 65 in 65 different sequences |
| Number of true positive hits | 65 in 65 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 2 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | window20 |
| Author [info] | V_Lesaux |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
65 sequences
CYSA1_AGRFC (Q8UH62), CYSA1_CHRVO (Q7NX01), CYSA1_RHIME (Q92XW1), CYSA1_SHEON (Q8EBC3), CYSA2_AGRFC (Q8UA73), CYSA2_CHRVO (Q7NWX3), CYSA2_RHIME (Q92VJ2), CYSA2_SHEON (Q8E8K8), CYSA_ACIAD (Q6F9A8), CYSA_ANTAG (Q85A69), CYSA_BACC1 (O31339), CYSA_BACCR (Q81GU1), CYSA_BORBR (Q7WGW1), CYSA_BORPA (Q7W9U5), CYSA_BORPE (Q7VZE5), CYSA_BRADU (Q89UD2), CYSA_BRUME (P63353), CYSA_BRUSU (P63354), CYSA_BURMA (Q62K82), CYSA_BURPS (Q63TY1), CYSA_CAUVC (Q9A7X1), CYSA_CUCSA (Q9G4F5), CYSA_ECO57 (Q8XBJ8), CYSA_ECOL6 (Q8FFB3), CYSA_ECOLI (P16676), CYSA_GLOVI (Q7NIW1), CYSA_HALH5 (Q9K876), CYSA_LEPIC (Q72PE5), CYSA_LEPIN (Q8F6Z1), CYSA_MANSM (Q65T42), CYSA_MARPO (P10091), CYSA_MESVI (Q9MUN1), CYSA_METCA (Q609Q1), CYSA_MYCBO (P0A4W3), CYSA_MYCPA (Q73XU8), CYSA_MYCTO (P9WQM0), CYSA_MYCTU (P9WQM1), CYSA_NEIMA (Q9JUX4), CYSA_NEIMB (Q9JZW0), CYSA_NEPOL (Q9TKX3), CYSA_NITEU (Q82WT5), CYSA_NOCFA (Q5YZY9), CYSA_NOSS1 (Q8Z0H0), CYSA_PECAS (Q6D201), CYSA_PHOLL (Q7N6Z2), CYSA_PSEAE (Q9I6L0), CYSA_PSEPK (Q88CL2), CYSA_PSESM (Q88AS5), CYSA_RALN1 (Q8XZP8), CYSA_RHILO (Q98K23), CYSA_RHOPA (Q6NBT1), CYSA_SALTI (Q8Z4V6), CYSA_SALTY (P40860), CYSA_SHIFL (Q7UC29), CYSA_SYNE7 (P14788), CYSA_SYNY3 (P74548), CYSA_THEVB (Q8DIA0), CYSA_VIBCH (Q9KUI0), CYSA_VIBVU (Q8D653), CYSA_XANAC (Q8PNN4), CYSA_XANCP (Q8PC11), CYSA_XYLFA (Q9PDN2), CYSA_XYLFT (Q87DT9), CYSA_YERPE (Q8D0W8), CYSA_YERPS (Q668K6)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot 'Partial' sequences |
2 sequences
CYSA_BURCE (Q93DX8), CYSA_CHLVU (P56344) |