PROSITE entry PS51242
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | FBPC |
| Accession [info] | PS51242 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-AUG-2006 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51237 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Ferric cations import ATP-binding protein fbpC family profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=151; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=146; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2402563; R2=0.0089692; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1114566; N_SCORE=9999.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=3653; N_SCORE=35.0; MODE=1; TEXT='?'; /CUT_OFF: LEVEL=-2; SCORE=475; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='??'; /DEFAULT: M0=-19; D=-80; I=-80; B1=-500; E1=-500; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255; ... A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y /I: B1=0; BI=-255; BD=-255; /M: SY='D'; M=-36,-49,103, 1,-56,-32,-21,-54,-23,-53,-52, -3,-35,-22,-31,-24,-25,-51,-71,-39; /M: SY='Q'; M=-28,-53,-23, -3,-56,-36,-16,-44, -5,-39,-26,-19,-35,107, 28,-18,-30,-45,-40,-29; /M: SY='D'; M= 6,-40, 40, 29,-46, 20,-30,-43,-24,-44,-38,-16, 13,-21,-32, 24, 38,-36,-52,-39; /M: SY='E'; M=-28,-49, 1, 94,-52,-44,-21,-53, -9,-45,-41,-25,-23, -2,-19,-25,-29,-45,-48,-42; /M: SY='A'; M= 80,-29,-35,-28,-44,-17,-37,-34,-30,-36,-30,-29,-34,-26,-35, 9,-19,-21,-44,-39; /M: SY='F'; M=-38,-38,-54,-47, 68,-52,-35, -6,-46, 58, 22,-49,-52,-44,-43,-44,-33,-12,-25, -5; /M: SY='A'; M= 63,-32,-31,-25,-44,-19,-32,-37,-24,-39,-32,-23,-34, 12, 2, 45,-16,-26,-45,-37; /M: SY='F'; M=-29,-38,-51,-46, 59,-51,-36, 1,-42, 8, 24,-45,-49,-44,-41,-37,-26, 56,-26, 38; /M: SY='S'; M= 59,-30,-30,-26,-43,-17,-32,-37,-28,-40,-33,-21,-33,-22,-32, 61,-12,-26,-47,-37; /M: SY='D'; M=-20,-48,101, 0,-56,-19,-22,-54,-23,-52,-51, -4,-35,-23,-32,-23,-25,-50,-69,-39; /M: SY='R'; M=-19,-46,-22, 28,-45,-40,-22,-43, 13,-38, -4,-21,-35, 50, 65,-21, 24,-38,-45,-32; /M: SY='V'; M=-25,-38,-52,-47,-19,-55,-52, 56,-44, 9, -7,-46,-46,-44,-46,-37,-22, 67,-49,-27; /M: SY='I'; M= 48,-36,-45,-39,-26,-36,-45, 50,-39, 6,-13,-39,-40,-36,-42,-24,-23, 29,-44,-31; /M: SY='V'; M=-21,-35,-51,-45,-22,-53,-54, 24,-43, -7,-10,-46,-47,-45,-45,-35,-19, 83,-55,-29; /M: SY='M'; M=-29,-38,-52,-42,-19,-44,-23, 13,-35, 4,121,-38,-39,-26,-33,-39,-28, -9,-42,-18; /M: SY='R'; M=-31,-44,-19,-17,-45,-33, 6,-47, 48,-46,-34, 55,-38, 17, 59, -6,-24,-44,-48,-33; /M: SY='Q'; M= 18,-44, 48, 22,-51,-32,-23,-46, 39,-43,-35,-16,-32, 55,-13, -7,-25,-40,-48,-35; /M: SY='G'; M=-17,-45,-32,-44,-51, 91,-39,-59,-38,-54,-43,-18,-36,-35,-45,-17,-36,-52,-42,-46; /M: SY='R'; M=-30,-47, -4, 22,-46, 10, 12,-49, 50,-45,-35, 0,-34, 6, 54,-23, -5,-44,-45,-33; /M: SY='I'; M=-34,-44,-54,-50, 3,-57,-48, 77,-47, 35, -2,-46,-45,-43,-48,-43,-28, 8,-39,-22; /M: SY='M'; M= 40,-35,-38, -1,-29,-32,-31,-13,-31, 10, 71,-34,-38, 4,-33, 1,-23, 16,-45,-29; /M: SY='Q'; M=-28,-52,-22, -4,-55,-36, 47,-45, -9,-38,-25,-17,-35,107, -9,-17,-31,-46,-43,-25; /M: SY='I'; M=-12,-39,-34,-11,-30,-39,-36, 34, 30, -1,-18,-27,-37, -3,-24, 28, 5, 28,-46,-30; /M: SY='G'; M= 27,-41, 3,-36,-50, 79,-37,-52,-35,-50,-40,-19,-36,-33,-42,-16,-32,-43,-43,-44; /M: SY='T'; M= 16,-36,-28,-25,-42,-29, 10,-35,-24,-39,-32,-20, 45, 5, -4, 34, 57,-29,-51,-35; /M: SY='P'; M= 4,-55,-34,-23,-53,-34,-37,-41,-30,-50,-37,-39,108, 1,-40,-28,-26,-43,-47,-49; /M: SY='R'; M=-32,-47, -9,-16,-38,-41, 24,-36, 35, -1, 8,-22,-38, 52, 52,-25, 0,-36, 26,-26; /M: SY='E'; M=-16,-46, 54, 74,-49,-40,-24,-18,-15,-42,-39,-18,-27,-10,-25,-22, 9,-38,-53,-39; /M: SY='L'; M=-34,-38,-53,-46, 10,-55,-40, 34,-46, 65, 1,-50,-50,-41,-44,-44,-30, 14,-39,-20; /M: SY='Y'; M=-39,-51,-41,-43, 11,-46, -9, -5,-34,-21,-18,-42,-51,-30,-32,-36,-35,-28, 66,111; /M: SY='R'; M=-31,-47,-27, 22,-30,-42, 8,-33, 15, 14,-23,-27,-39, 38, 51, -2,-30,-34, 49, 7; /M: SY='Q'; M= 11,-43, 0,-16,-38,-34, 38,-41, 0,-38,-29,-19,-36, 55, 45, 3, 20,-36,-42, 15; /M: SY='P'; M=-34,-60,-35,-23,-54,-37,-37,-42,-28,-52,-38,-40,113,-33,-10,-32,-27,-47,-47,-50; /M: SY='N'; M= 46,-35,-26,-27,-38,-26,-30, 15, 17,-30,-26, 49,-37,-24, -9, -5,-20, 6,-48,-35; /M: SY='D'; M=-22,-39, 66,-13,-44,-26, 24,-43,-25,-23,-38, 11,-34,-20,-30, 55, 8,-38,-59,-33; /M: SY='E'; M= 15,-39,-28, 37,-24,-41,-29,-17,-24, 35, 23,-35,-39,-21, 13, -8,-26, 0,-40, 5; /M: SY='F'; M=-25,-43, 12, -2, 82,-42,-31,-26,-34,-20, 3,-33, 35, 10,-36,-10,-30,-29,-22, -3; /M: SY='M'; M= -5,-35,-42,-39,-22,-44,-39, 35,-36, 18, 50,-33,-38,-35,-40,-24, 47, 30,-48,-27; /M: SY='A'; M= 79,-30,-36,-28,-43,-19,-37,-32,-28,-35,-29,-30,-35,-26, -6,-10,-21,-11,-44,-39; /M: SY='N'; M=-27,-40, 41, 15,-40,-31, 14,-38, 4, -8,-32, 43,-35,-18, 10, 21, 26,-36,-55,-33; /M: SY='F'; M=-44,-39,-56,-52,106,-51,-36,-17,-47, -8,-19,-45,-54,-58,-44,-42,-35,-22, -8, 13; /M: SY='M'; M=-32,-39,-53,-44,-15,-50,-32, 40,-40, 40, 94,-43,-43,-33,-39,-41,-29, -3,-41,-20; /M: SY='G'; M=-17,-45,-32,-44,-51, 91,-39,-59,-38,-54,-43,-18,-36,-35,-45,-17,-36,-52,-42,-46; /M: SY='E'; M=-31,-48, 53, 77, 6,-41,-22,-49, 2,-42,-41,-19,-28, -9,-22,-26,-28,-44,-47,-33; /M: SY='A'; M= 51,-32, -5, -7,-42, 1,-33,-36,-27,-38,-32,-20,-32,-24,-33, 35, 42,-25,-49,-37; /M: SY='N'; M=-27,-36,-21,-33,-30,-30,-25, 23,-27, 8,-20, 74,-41,-27,-33, 13, 2, 16,-54,-33; /M: SY='V'; M=-26,-39,-50,-42,-21,-52,-46, 53,-40, 8, 29,-43,-44, 6,-42,-36,-23, 61,-48,-27; /M: SY='F'; M=-16, 20,-53,-46, 67,-50,-38, 2,-45, 41, 16,-46,-51,-45,-43,-40,-30, 21,-28, -7; /M: SY='P'; M=-14,-47, 12, -3,-49,-12,-30,-42, -5,-47,-37, 16, 82, 9,-31, 11, 15,-41,-50,-43; /M: SY='A'; M= 62, 57,-36,-34,-45, 40,-39,-40,-34,-40,-34,-28, -7,-32,-40,-14,-25,-29,-46,-43; /M: SY='N'; M= -5,-40, 0, 22,-41,-31, 34,-41, -4,-41,-32, 45,-34, 34, 14, 8, 34,-37,-50, -8; /M: SY='L'; M=-30,-38,-52,-46, 24,-54,-42, 30,-45, 47, -4,-48,-49,-43,-44,-40,-27, 46,-38, 2; /M: SY='D'; M= 16,-40, 36, 18,-40, 9,-27, 8,-25,-13,-29, 34,-36, 8,-31, 5, -9,-16,-51,-36; /M: SY='G'; M= 12,-42, 29,-11,-49, 47, 5,-47, 1,-46,-37, 0, -5, 32,-28, 8, 2,-41,-48,-37; /M: SY='G'; M= -4,-43, 28, 17,-49, 60,-30,-45,-26,-45,-38, -3,-34, 23,-33, 10,-27,-15,-47,-40; /I: I=-24; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77; /M: SY='W'; M= -1,-41, -9,-24, -6,-22,-28,-28, -8, 2,-24, 4,-38, 42, 5, -9, 36,-16, 70, 15; /M: SY='A'; M= 54,-34,-39,-33,-35, 12,-41, -4,-10,-15,-23,-33, -7,-32,-36,-18,-10, 36,-46,-36; /M: SY='D'; M=-30,-45, 59, 30,-46,-34, 58,-43,-18,-42,-35, 23,-34, 24, -2, -3, 8,-18,-59,-30; /M: SY='C'; M= 9,100,-41, -8,-31,-42,-45, 43,-38,-13,-21,-34,-44,-38,-44,-12, 8, -3,-52,-36; /M: SY='N'; M= 23,-41, 9,-27,-16, 26,-27,-33,-26,-16,-30, 37, 27, 10, -9,-10,-25,-11,-41, 12; /M: SY='W'; M=-31,-43, 4,-34,-22, 28, 22, 6,-12, 44,-13,-32,-43,-12,-36,-32,-13,-21, 59,-23; /M: SY='Y'; M=-25,-46,-35,-40,-16, 61,-23,-19,-31,-35,-29,-26,-41,-31, 4,-23, -1,-23,-21, 71; /M: SY='R'; M=-17, 4, 7, 2,-43,-39, -2,-38, 16,-27,-30, 9,-39, 39, 66,-12,-28, -6,-47,-32; /M: SY='V'; M= -2,-38,-52,-46, 42,-50,-47, 43,-44, 15, -9,-45,-46,-45,-45,-36,-25, 53,-38,-17; /M: SY='P'; M= 24,-44,-10, -8,-47, 9,-35,-37, 9,-41, 4,-29, 78,-27,-31, -4, -4,-22,-46,-42; /M: SY='V'; M= -5, 30,-47,-40,-22,-48,-42, 20,-33, 29,-10,-41,-47,-36, 17,-33,-11, 53,-49,-29; /M: SY='P'; M= 13,-44, 48,-15,-46,-31, 17,-40, 10,-27, -7, 26, 49, 11, -9,-21, -1,-38,-53,-36; /I: I=-18; MI=0; MD=-57; IM=0; DM=-57; /M: SY='A'; M= 18,-54,-19, 3,-59,-29,-46,-48,-14,-42,-47, 1,-51, 2,-43, -6, -2,-14,-66,-54; D=-18; /I: I=-18; DM=-57; /M: SY='H'; M=-17,-44, 34, 18,-45, 4, 56,-45, 12,-43,-34, 23,-35, 22, 20, 6, -9,-25,-53,-30; /M: SY='F'; M= 1,-42, 9,-25, 47,-13,-25,-37, 0,-34,-31, 39, 12, -3, 39, 0,-25,-36,-36,-19; /M: SY='G'; M= 19,-38, -8,-29,-38, 26, 8, -4,-30,-12,-28, 22, 17, -5,-35, 22, 13, -5,-49,-35; /M: SY='P'; M= 8,-41,-36,-27, -5,-38,-33, -3, 8, 8,-21,-31, 36, 7, 29, 7, -4, 14,-43,-30; /M: SY='Q'; M= 14,-43, -5,-18,-48, 14, 26,-44, 7,-44,-33, 17, 36, 49, -3, 17,-10,-40,-47,-34; /I: I=-17; MI=0; MD=-53; IM=0; DM=-53; /M: SY='G'; M=-22,-47,-33,-43,-53, 78,-39,-58,-37,-55,-45, 9,-40,-14,-29, -9, -4,-52,-48,-48; D=-17; /I: I=-17; DM=-53; /M: SY='P'; M= 8,-44, 7, 29,-47, -3,-26,-39,-18,-41, -8, 24, 46, 24, 13, 4, -4,-21,-49,-38; /M: SY='C'; M= 49, 63,-37,-35,-35, 29,-37,-30,-32,-34,-30,-29,-40,-32,-11, -7, -8, 6,-42, 9; /M: SY='R'; M=-28,-41,-31,-21,-35,-40,-26,-28, 13, 9, -5,-24,-38, 39, 55, 1, 35,-10,-45,-29; /M: SY='I'; M=-28,-39,-53,-48,-17,-55,-49, 59,-45, 30, -4,-47,-46,-43,-46,-39,-24, 54,-46,-26; /M: SY='M'; M= 13,-38,-42,-40,-27, 43,-33,-16,-37, 25, 69,-32,-40,-32,-39, -7,-28, 0,-43,-29; /M: SY='V'; M= -5,-38,-51,-46,-17,-51,-46, 48,-44, 39, -4,-46,-46,-41,-45,-37,-25, 49,-45,-26; /M: SY='R'; M= -9,-50,-32,-20,-44,-43,-21,-50, 7,-43,-32,-25,-43, -9, 98,-28,-33,-42,-44,-31; /M: SY='P'; M=-33,-58,-36,-24,-51,-37,-39,-36,-32,-48,-36,-42,113,-35,-44,-32,-26,-13,-48,-50; /M: SY='E'; M= -1,-46, -4, 82,-50,-12,-22,-50,-11,-45,-39, 16,-27, -6, 7,-22,-27,-43,-48,-41; /M: SY='Q'; M= 47,-41,-27, 3,-50, 5,-26,-40,-19,-39,-30,-24, 11, 75,-22, -6,-25,-34,-43,-36; /M: SY='I'; M= -7,-41,-52,-48, 38,-52,-48, 66,-45, 9, -8,-44,-45,-44,-47,-38,-26, 37,-37,-17; /M: SY='T'; M=-23,-37, 7, 4,-36,-17,-28,-30, -8,-13,-28,-19,-33, 16, 22, 23, 57, -9,-47, -6; /M: SY='L'; M=-33,-39,-53,-47, 2,-55,-42, 44,-46, 60, 0,-49,-49,-41,-45,-43,-29, 21,-40,-22; /M: SY='T'; M= 4,-38, -1, -8, 3, -6, 35, -3, 13,-20,-26,-20,-34, 20,-24, 18, 36,-10,-46,-26; /M: SY='P'; M= 14,-45, 26, 15,-47,-32, 1,-40, 1,-29,-35,-11, 70,-22, 1, -1, 6,-37,-50,-39; /M: SY='H'; M= 10,-39, 18, 11,-39,-33, 52,-14,-22,-10,-26, 14,-34, 28,-15, 5, 38,-29,-53,-29; /I: I=-22; MD=-71; /M: SY='G'; M= 3,-46, 3,-13,-53, 60,-36,-54,-31,-52,-43,-22, 14, 2,-13, 22,-29,-47,-49,-45; D=-22; /I: I=-22; MI=-71; MD=-71; IM=-71; DM=-71; /M: SY='E'; M= 22,-43, -1, 40,-47, 9,-32,-22,-24,-41, -8,-10, 13, -5,-11, 10, 9,-35,-50,-41; D=-22; /I: I=-22; DM=-71; /M: SY='E'; M= 25,-42, 21, 44,-47, 4,-28,-27, -3,-42,-36, 9, 31, -3,-27, -8, 8,-35,-49,-40; /M: SY='G'; M= 14,-40, -1,-13,-47, 44, 5,-43,-28,-45,-36,-19, 25, 14,-33, 42,-10,-24,-47,-38; /M: SY='Q'; M= -6,-42, -6,-21, 14,-13, 38,-24,-23, 2, 28,-25,-39, 62, -7,-23, 10, -3,-39, 5; /M: SY='R'; M= 16,-41,-29,-24,-40, 9,-24,-41,-11,-39, 8, 0,-13, 13, 57, 36,-22,-36,-43, -4; /I: I=-13; MI=0; MD=-40; IM=0; DM=-40; /M: SY='C'; M= 19,103,-45,-48,-49, 44,-48,-52,-45,-47,-43,-33,-50,-46,-51,-27,-35,-41,-58,-52; D=-13; /I: I=-13; DM=-40; /M: SY='T'; M=-31,-46,-33, 10, -7,-47,-38,-15, 2,-36,-33,-29,-40, 33, -3, -4, 44, 9,-53,-36; D=-13; /I: I=-13; DM=-40; /M: SY='I'; M= -7,-44,-56,-52,-25,-56,-57, 64,-48, -9,-12,-48,-48,-47,-51,-40,-27, 51,-51,-32; D=-13; /I: I=-13; DM=-40; /M: SY='T'; M= 2,-40, -3,-26,-35,-40,-34, 7, 33, -5,-24, -5,-37,-25, 17,-12, 38, 10,-49,-33; D=-13; /I: I=-13; DM=-40; /M: SY='H'; M= 9,-41, 19, -5,-44, 8, 79,-47, -9,-42,-32, 14,-35, 23,-24, 31, -9,-41,-55,-25; /M: SY='A'; M= 31, 7,-39,-34,-30,-33,-39, 26,-30, -4,-19,-31,-39,-30, 5, 27, 5, 31,-48,-32; /M: SY='V'; M= 30,-37, 39, 32,-38,-35,-35,-16,-27,-28,-27,-25,-35,-25,-33,-21, 9, 41,-54,-36; /M: SY='Y'; M=-11,-43,-45,-44, 70,-46,-19,-17,-39,-15,-18,-42,-51,-39,-36,-35,-32, 7, -5, 88; /M: SY='M'; M= 17,-36,-43,-34,-22,-39,-30,-10, -3, 34, 75,-35,-41,-27, 8,-14, -6, 4,-43,-25; /M: SY='G'; M=-18,-45, -6,-38,-51, 87,-37,-58, -6,-54,-43,-17,-36,-33,-39,-18,-35,-52,-43,-45; /M: SY='N'; M=-27,-39, 15,-24, 26, -7,-25,-35, 1,-19,-31, 46, 20, -4, -5, 24, 24,-34,-44,-26; /I: I=-15; MD=-47; /M: SY='Q'; M=-17,-65,-16, -7,-59,-63, 1, 9,-49,-47,-45,-49,-19, 14,-54,-45, 2,-11,-73,-54; D=-15; /I: I=-15; MD=-47; /M: SY='H'; M=-46, 0, -4,-46,-12,-54, 48,-44,-49,-28, 38,-41, 2,-44,-50, 10,-41,-25,-64,-12; D=-15; /I: I=-15; MD=-47; /M: SY='W'; M=-21,-52,-44,-45,-29, -7,-40,-39, -9,-25,-38, 3,-49,-40,-42,-32, 35,-20, 77, 39; D=-15; /I: I=-15; MI=0; MD=-47; IM=0; DM=-47; /M: SY='E'; M= 1,-47,-28, 41,-39, -3,-37,-32,-16, 22,-28, -4,-43,-27,-37, -5,-33,-16,-53,-41; D=-15; /I: I=-15; DM=-47; /M: SY='I'; M=-34,-47,-45,-45,-32,-52, 3, 42,-38,-14,-22, 6,-47,-40, -5,-18, 23, 27, 20,-34; D=-15; /I: I=-15; DM=-47; /M: SY='H'; M=-18,-42, 3,-27,-28,-25, 73,-10,-29, 18,-17,-25,-41, 19, -7,-27, 18, 14,-51, -3; D=-15; /I: I=-15; MI=0; MD=-47; IM=0; DM=-47; /M: SY='I'; M= 17, 35,-40,-33,-26,-40,-37, 36,-33, 2,-15,-34,-41, 32,-36,-10, 10, 31,-43, 5; /M: SY='E'; M=-30,-44, 26, 46, -6,-20, 38, -5, -6,-34, -1, 22, -1, 6,-10,-22, 21,-33,-50,-29; /M: SY='W'; M= -4,-47,-44,-16,-14,-23,-40, 33,-37, -3,-20,-14, -4,-35,-40,-34,-10, 9,110, 39; /M: SY='H'; M= 15,-41, 4, 43,-45, 7, 59,-46,-19,-43,-34, 31,-32, -1, -9, 12, -4,-40,-53,-31; /I: I=-24; MD=-77; /M: SY='G'; M=-27,-44, 39,-12,-39, 43, 3, -5,-36, -1,-29,-23,-41,-33,-41,-10, -1, 15,-53,-37; D=-24; /I: I=-24; MI=-77; IM=-77; DM=-77; /M: SY='Q'; M= 18,-44,-21, 32,-47, 23,-25,-42, 22,-38, 17, -2,-33, 49, 17,-20,-28,-38,-43,-35; /M: SY='E'; M= -3,-42, 44, 44,-37,-18,-26,-36,-23,-11,-32,-20, 18,-19,-30, 5, 26,-22,-46, 9; /M: SY='L'; M= 3,-40,-18, 2, 7, 19,-34, 6,-27, 23, 4,-32,-41, -5, 18,-28, -9, 13,-41,-27; /M: SY='L'; M=-17,-40,-39, -9,-20,-46, 31, 23,-35, 48, 10,-12, -5, 7,-36,-34, -7, 10,-45,-24; /M: SY='W'; M=-13,-43,-25, 39,-32, 26,-34, 3, -6, 9,-23, -7,-36, 3,-31,-26, 0, 8, 49,-31; /M: SY='Q'; M= 8,-40,-30,-26, -9,-36,-29, 31, -2,-12, 21, 33,-12, 43, -5,-22, 9, 2,-44,-28; /M: SY='L'; M= 19, 6,-10, 19, 7,-39,-34, -8, 17, 29,-17,-32,-39,-25,-27, -9,-11, 10,-42,-27; /M: SY='N'; M=-30, 37,-25,-32, 27,-34,-29, -9,-12,-32,-29, 58, 14,-30,-15,-19, 43,-16, 50,-24; /M: SY='P'; M= 18,-41,-41,-35,-31,-15,-41, 28,-33, -5,-19,-37, 51,-34, -2, -2,-23, 37,-47,-34; /M: SY='T'; M=-12,-38, 13, 15,-34,-36,-30, 12,-22, -4,-24, 8,-35, 6, 8, 24, 31, 11,-50,-32; /I: I=-7; MD=-24; /M: SY='R'; M=-20,-52, 19, 0,-48,-43, 7,-45,-12,-19,-34, -8,-44, 45, 57, -3,-33,-28,-53,-36; D=-7; /I: I=-7; MD=-24; /M: SY='P'; M= 1,-48,-10, 9, 45,-43, -6,-31,-37, 8,-28,-39, 48,-36,-42, -2,-32,-33,-39,-23; D=-7; /I: I=-7; MD=-24; /M: SY='D'; M= 29,-44, 39,-22,-54, -1,-32,-49, -7,-50,-43, 17,-40, 20,-32, 26,-25,-42,-57,-43; D=-7; /I: I=-7; MD=-24; /M: SY='P'; M= 11,-52,-49,-40,-41,-47, 15, 12,-44, 4,-27,-47, 58,-17,-48,-38,-35, 7,-56,-41; D=-7; /I: I=-7; MD=-24; /M: SY='E'; M=-40,-58, 32, 45,-60,-46, 26,-59,-28,-57,-50, 5, 30,-24,-15, -6,-16,-55,-66,-47; D=-7; /I: I=-7; MD=-24; /M: SY='P'; M=-47,-62,-58,-48,-48,-64,-54, 2,-43, -8, -6,-54, 18, 10, 7,-48, -8, 13,-65,-49; D=-7; /I: I=-7; MD=-24; /M: SY='G'; M= -8,-64,-58,-63,-66, 43,-62,-65,-60,-29,-57,-46,-61,-56,-65, -3,-25,-60,-69,-64; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24; /M: SY='D'; M=-15,-65, 24, 1,-71,-58,-51,-66, 14,-66,-60,-39,-55,-12,-41,-41, 14,-60,-76,-61; D=-7; /I: I=-7; DM=-24; /M: SY='H'; M=-28,-67, -4, 11,-71,-55, 29,-70,-14,-68,-58, 21,-57, 12,-43,-25,-19,-66,-78,-55; D=-7; /I: I=-7; DM=-24; /M: SY='V'; M= 14,-60,-65,-58,-44,-61,-58,-34,-15,-19,-41,-61,-66,-55,-55,-49,-48, 19,-59, 16; D=-7; /I: I=-7; DM=-24; /M: SY='Y'; M= -7,-67,-60,-60, -3, -8,-46,-56,-57,-55,-51,-55, 1,-55,-60,-17,-25,-55,-41, 53; D=-7; /I: I=-7; DM=-24; /M: SY='V'; M=-48,-57,-72,-66,-35,-74,-65, 20,-65, 28,-22,-68,-68,-62,-65,-60,-45, 32,-65,-45; D=-7; /I: I=-7; DM=-24; /M: SY='H'; M=-13,-61,-43, 6,-49,-57, 44,-45,-43,-48, -5,-16,-55, 12,-45,-41, -5, -5,-63, 7; D=-7; /I: I=-7; DM=-24; /M: SY='F'; M=-18,-58,-72,-66, 47,-68,-61, 13,-64, 7,-29,-64,-68,-65,-64,-57,-48, 5,-47,-27; D=-7; /I: I=-7; DM=-24; /M: SY='H'; M=-36,-66, 24,-40,-66,-57, 51,-67, -2,-63,-12, 3,-59,-43,-45,-27, -4,-64,-83,-50; D=-7; /I: I=-7; DM=-24; /M: SY='P'; M=-28,-69,-49, 13, -6,-33,-56,-58,-46,-60,-57,-54, 35,-47, -9,-30,-14,-31,-66,-55; D=-7; /I: I=-7; DM=-24; /M: SY='R'; M=-12,-67,-53,-45,-28,-58, 13,-64, -7,-61,-53,-46,-62, 12, 15, -2,-24,-60,-60, 7; D=-7; /I: I=-7; DM=-24; /M: SY='G'; M=-23,-62, 15,-49,-69, 53,-54,-71,-52,-69,-61,-35,-54,-50,-59,-15, -8,-64,-67,-62; D=-7; /I: I=-7; DM=-24; /M: SY='M'; M=-50,-58,-62,-62,-37,-67, -5, 21,-59, 20, 29, -4,-65,-55,-59,-56,-45, 10,-65,-43; D=-7; /I: I=-7; DM=-24; /M: SY='F'; M= 6,-54,-66,-61, 63,-59,-56,-15,-59,-16,-35,-58,-64,-62,-59,-47,-21, -3,-40,-20; D=-7; /I: I=-7; DM=-24; /M: SY='V'; M=-45,-54,-67,-62, -7,-69,-57, 23,-60, 21,-21,-63,-64,-58,-60,-55,-41, 35,-53, 9; D=-7; /I: I=-7; DM=-24; /M: SY='L'; M=-28,-53,-60,-51,-30,-63,-47, 8,-41, 40, 20,-55,-60,-43, 23,-52,-43,-11,-55,-37; D=-7; /I: I=-7; DM=-24; /M: SY='G'; M= 1,-40,-23,-29,-46, 49,-27,-47, -1,-48,-38, 45, 10,-23, 11, 31, -9,-42,-48,-40; /I: I=-7; E1=0; IE=-255; DE=-24;» more |
Post-processing [info]
| PROMOTED_BY | PS50893 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 41 in 41 different sequences |
| Number of true positive hits | 41 in 41 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | V_Lesaux |
| Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
41 sequences
FBPC1_HAEIN (P44531), FBPC1_PECAS (Q6D734), FBPC1_RHIME (Q92WJ0), FBPC1_RHOJR (Q0SBZ1), FBPC2_HAEIN (P44513), FBPC2_PECAS (Q6D2F6), FBPC2_RHIME (Q92UV5), FBPC2_RHOJR (Q0S0Z3), FBPC3_RHOJR (Q0RYP7), FBPC_ACTPL (Q57293), FBPC_AGRFC (Q8U6M1), FBPC_BRUA2 (Q2YKX3), FBPC_BRUAB (Q578K3), FBPC_BRUME (Q8YCG3), FBPC_BRUSU (Q8FVV5), FBPC_ECO57 (Q7AH43), FBPC_ECOLI (P37009), FBPC_FUSNN (Q8RGC8), FBPC_HAEI8 (Q4QP85), FBPC_HISS1 (Q0I2Z4), FBPC_MANSM (Q65S66), FBPC_NEIG1 (Q5FA19), FBPC_NEIGO (Q50966), FBPC_NEIMA (Q9JVH1), FBPC_NEIMB (Q4W575), FBPC_PASMU (Q9CM80), FBPC_PHOLL (Q7N8B9), FBPC_PHOPR (Q6LKD4), FBPC_PSEF5 (Q4KC87), FBPC_PSEPF (Q3KCC5), FBPC_RHIEC (Q2K8C8), FBPC_RHILO (Q98G43), FBPC_SERMA (P21410), FBPC_STRAW (Q82JY6), FBPC_STRCO (O86751), FBPC_VIBCH (Q9KLQ5), FBPC_YEREN (Q56927), FBPC_YERPA (Q1C607), FBPC_YERPE (Q8ZCM2), FBPC_YERPN (Q1CJS9), FBPC_YERPS (Q668Q3)» more
|
| PDB [Detailed view] |
1 PDB
3FVQ |