PROSITE entry PS51243
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | CCMA |
| Accession [info] | PS51243 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-AUG-2006 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51237 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Cytochrome C biogenesis export ATP-binding protein ccmA family profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=200; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=195; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3513448; R2=0.0145995; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=684726; N_SCORE=9999.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=3264; N_SCORE=50.0; MODE=1; TEXT='?'; /CUT_OFF: LEVEL=-2; SCORE=285; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='??'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-30,-21, 9,-30,-21, 21,-29, 47, 19,-30,-30,-21,-20,-29, -9, 13,-21, -1,-21; /M: SY='S'; M= 3, -3,-17, -5, 0,-16,-14,-11,-11, -6, -7, -4, -4,-13, -1, -8, 7, 7, -7,-28,-13, -1; /M: SY='A'; M= 15,-19,-17,-25,-19, -8,-13,-23, 9,-19, 7, 2,-17,-19,-17,-21, -5, -1, 12,-22,-12,-19; /M: SY='H'; M=-10, -2,-27, -1, 5,-22,-19, 20,-19, 5,-15, -5, 1,-15, 9, 8, -6,-10,-18,-26, -4, 5; /M: SY='B'; M=-11, 18,-28, 18, 10,-31, -2, 0,-29, 9,-27,-17, 18,-14, 11, 6, 0, -9,-28,-29,-18, 10; /M: SY='L'; M= -8,-30,-19,-31,-23, 7,-31,-23, 24,-28, 41, 18,-29,-29,-22,-21,-26, -8, 18,-22, -2,-23; /M: SY='A'; M= 14, -1,-16, -6, -1,-20,-11,-14,-11, -8,-14,-10, -2,-10, 0,-12, 13, 11, -6,-27,-15, -1; /M: SY='C'; M= -6,-21, 35,-29,-27, 4,-13,-25,-13,-26, -9,-10,-17,-30,-29,-25,-10,-10, -3,-26,-12,-27; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='V'; M= -5, -9,-19,-10, -6,-13,-19,-12, 4, -9, -5, 3, -7,-15, -2, -7, 0, -2, 5,-25, -9, -6; D=-12; /I: I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25; /M: SY='R'; M=-18,-10,-27,-10, -1,-15,-19, 1,-25, 24,-17, -8, -1,-19, 8, 58,-10, -9,-17,-15, -3, -1; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='G'; M= -4, 4,-24, 3, -5,-24, 30, -2,-30,-11,-26,-17, 12,-15, -8,-11, 5,-10,-25,-25,-20, -7; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='E'; M= -4, 10,-25, 15, 21,-25, 0, -5,-27, -1,-21,-19, 6, -9, 3, -7, 0,-10,-25,-18,-17, 12; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='R'; M=-14, 2,-29, 3, 9,-25,-19, 4,-25, 19,-19, -9, 4,-15, 15, 28, -7,-10,-22,-24,-10, 10; /M: M= -6,-11,-25,-13, -5,-15,-22,-13, -1, -7, -4, -2, -7, -4, -3, -4, -7, -3, -5,-25,-12, -6; /M: SY='L'; M= -8,-30,-20,-33,-25, 5,-33,-25, 30,-28, 34, 18,-27,-27,-22,-23,-23, -8, 23,-22, -2,-25; /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28, 64,-30,-20, 5,-30, 19, 5,-22,-30,-35,-20,-22,-10, 2, 3, 23,-28; /M: SY='D'; M= -5, 13,-24, 16, 12,-29, -7, -3,-26, 1,-23,-17, 9,-11, 10, 1, 7, -1,-22,-30,-17, 11; /M: SY='H'; M=-12, 8,-28, 9, 5,-26, -4, 11,-25, -2,-19,-11, 9, -9, 5, -4, -4,-11,-25,-29,-12, 4; /M: SY='L'; M= -9,-23,-21,-28,-23, 8,-29,-21, 23,-26, 26, 13,-18,-27,-21,-20,-20, -7, 16,-21, -1,-23; /M: SY='N'; M= -5, 20,-20, 18, 2,-23, -8, -5,-18, -7,-24,-18, 22,-13, -3, -9, 15, 6,-16,-37,-17, -1; /M: SY='F'; M=-16,-27,-18,-36,-27, 59,-29,-21, 3,-27, 11, 1,-20,-28,-35,-19,-16, -3, 5, 1, 21,-27; /M: SY='S'; M= -1, -5,-19, -5, 5,-10,-14, 3,-17, -6,-17,-11, 0,-14, -2, -4, 10, 3,-10,-28, -8, 1; /M: SY='L'; M= -5,-29,-22,-31,-22, 5,-28,-23, 20,-27, 32, 14,-28,-27,-20,-21,-24,-10, 14, -9, 0,-22; /M: SY='N'; M= -2, 1,-24, 0, 0,-22,-10, -1,-16, -5,-19,-13, 5, 1, -5, -6, -1, -7,-14,-30,-17, -4; /M: SY='A'; M= 22, -3,-17, -4, -2,-24, -5,-15,-18, -4,-21,-15, -3, 2, -5,-12, 12, 2,-10,-28,-20, -4; /M: SY='G'; M= 1, -9,-28, -9,-18,-29, 63,-19,-38,-19,-30,-20, 1,-19,-18,-19, 4,-16,-28,-22,-29,-18; /M: SY='E'; M= -9, 9,-28, 16, 22,-27, -4, 0,-25, -4,-20,-17, 3, -9, 4, -9, 1, -9,-22,-30,-17, 12; /M: SY='A'; M= 16,-17, -6,-25,-17, -3,-16,-20, 1,-18, 7, 2,-16,-19,-16,-20, -5, 0, 4,-21, -9,-16; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='L'; M= -4,-25,-15,-27,-20, 11,-24,-19, 16,-23, 27, 14,-24,-25,-20,-18,-19, -6, 16,-17, -1,-20; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='V'; M= -4,-16,-20,-19,-12, -4,-24, -5, 4,-13, -1, 3,-13,-20, -3,-12, -5, -1, 5,-19, 3, -8; /M: SY='I'; M= -7,-30,-20,-34,-27, 3,-34,-27, 35,-27, 26, 17,-26,-26,-23,-24,-20, -7, 31,-23, -3,-27; /M: SY='Q'; M= -7, -4,-23, -4, 6,-22,-16, -3,-17, 7,-17, -7, -3,-13, 8, 5, 1, 1,-10,-26,-11, 6; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='P'; M= -3, -5,-26, -2, 3,-24,-14, -4,-22, -2,-24,-16, -4, 19, -1, -1, 4, 0,-20,-30,-18, -2; /M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20, 0,-20, 0, 10,-20, 0,-30,-20, 60,-20, 0, 0, 10, 0,-30,-40,-20, 0; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='A'; M= 19,-10, 0,-15,-11,-17, -9,-18, -8,-15,-15,-11, -4,-14, -9,-18, 16, 6, -1,-31,-18,-11; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='T'; M= 3, 0,-10, -7, -7,-13,-15,-17,-13,-10,-15,-13, 3,-10, -7,-10, 25, 42, -3,-33,-13, -7; /M: SY='T'; M= 5, 0,-10, -5, -5,-15,-10,-15,-15,-10,-20,-15, 5,-10, -5,-10, 30, 36, -5,-35,-15, -5; /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21, 16,-30,-20, 18,-30, 47, 18,-29,-30,-22,-20,-29,-10, 9,-17, 3,-21; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='R'; M=-18, -8,-30, -8, 2,-22,-20, -2,-30, 33,-22,-10, 0,-18, 10, 63,-10,-10,-20,-20,-10, 2; /M: SY='I'; M= -3,-23,-19,-29,-22, 0,-27,-20, 22,-21, 20, 20,-20,-22,-16,-19,-14, 0, 18,-23, -4,-20; /M: SY='L'; M= -9,-30,-23,-33,-24, 6,-33,-24, 31,-29, 37, 19,-27,-27,-21,-23,-25, -9, 20,-21, -1,-24; /M: SY='A'; M= 39,-11, -4,-20,-12,-19, -5,-20, -8,-13,-10, -9, -9,-12,-11,-20, 10, 1, 1,-23,-19,-12; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='L'; M=-12,-30,-21,-32,-22, 20,-31,-21, 20,-30, 41, 17,-28,-29,-23,-21,-28,-10, 10,-15, 5,-22; /M: SY='L'; M= 2,-18,-17,-20,-12, -5,-18,-13, 5,-17, 16, 12,-16,-20, -6,-14, -7, -3, 2,-24, -7, -9; /M: SY='Q'; M=-11, -5,-29, -5, 6,-24,-21, 0,-16, 5,-16, -6, -1, 2, 13, 7, -6, -6,-19,-25,-12, 7; /M: SY='P'; M= -9,-17,-36,-10, 1,-29,-21,-18,-18, -4,-27,-16,-17, 66, -4,-13, -9, -9,-24,-28,-25, -6; /M: SY='S'; M= 7, -1,-19, -1, 8,-17,-11, -8,-17, -4,-15,-13, -2,-11, 0, -5, 10, 3,-12,-26,-11, 4; /M: SY='A'; M= 16, -3,-20, -5, 1,-26, 4,-12,-22, -1,-20,-13, -2,-11, 1, -5, 7, -5,-15,-24,-19, 1; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='E'; M=-12, 5,-27, 9, 22,-27,-18, 9,-27, 8,-21,-13, 4,-10, 19, 14, 1, -4,-24,-28,-12, 19; /M: SY='I'; M= -6,-26,-22,-33,-27, -1,-35,-29, 36,-25, 13, 13,-20,-21,-21,-25,-12, 1, 32,-24, -4,-27; /M: SY='L'; M= -4,-20,-22,-24,-16, 10,-23,-11, 4,-16, 11, 4,-17,-23,-11,-10,-12, -6, 0,-10, 11,-14; /M: SY='W'; M=-16,-30,-31,-34,-26, 21,-28,-17, 8,-23, 10, 6,-28,-28,-20,-19,-28,-16, -3, 39, 25,-22; /M: SY='N'; M=-11, 16,-26, 16, 13,-25, -9, -2,-24, 5,-24,-18, 18, -7, 2, 4, 0, -7,-23,-32,-19, 7; /M: SY='G'; M= -8, 11,-28, 9, -6,-28, 28, -8,-33, -8,-29,-21, 17,-11, -9, -7, 1,-12,-29,-29,-25, -9; /M: SY='K'; M= -5, -2,-12, -5, 0,-23, -6, -3,-22, 2,-20,-12, 2,-16, -3, 0, -3, -7,-17,-27,-15, -2; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='D'; M=-11, 12,-27, 16, 1,-18, -6, -8,-24, -8,-24,-20, 9, 13, -8,-12, 0, -6,-24,-29,-17, -4; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='I'; M= -6,-22,-23,-28,-22, -2,-23,-23, 28,-24, 14, 12,-15,-18,-16,-23,-13, -7, 16,-19, -4,-22; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='N'; M= -2, 3,-19, -1, -1,-20, -3, -6,-19, 3,-21,-12, 9, -5, 3, 5, 7, 3,-17,-25,-15, 0; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='E'; M= -5, 2,-19, -2, 6,-12,-14, -5,-14, 5,-14, -9, 5,-12, 3, 4, 0, -1,-12,-21, -9, 5; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='Q'; M= -3, -1,-12, -1, 8,-20,-16, -7,-11, -2,-11, -6, -3,-11, 9, -5, -1, -5,-11,-23,-12, 8; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='R'; M= 1,-10,-20,-11, -3,-13, 0,-10,-17, 0,-10, -8, -6,-14, -3, 8, -6, -9,-13, -5,-10, -4; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='D'; M= -8, 5,-11, 6, 3,-21, -9, -1,-18, -1,-15,-10, 4,-15, 2, -4, -1, -6,-15,-27,-13, 2; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='T'; M= -5, 2,-18, 2, 5,-12,-17, -6,-12, -5, -6, -7, -3,-11, 1, -7, 1, 9,-10,-19, -2, 3; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='Y'; M=-11,-19,-24,-20,-16, 17,-24, 9, 0,-13, 8, 3,-17,-25,-11, -7,-17, -9, -6, 5, 36,-16; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='Q'; M= -5, -2,-24, -2, 5,-24,-13, -4,-19, 12,-21, -9, 1, 4, 14, 12, -1, -5,-19,-21,-13, 8; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='R'; M= -7, 2,-22, 6, 8,-16,-14, -3,-18, 6,-11,-10, -1,-12, 2, 10, -4, -6,-14,-18, -5, 4; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='E'; M= -5, 5,-20, 8, 16,-19,-14, -3,-17, 0,-15,-10, 0, -9, 13, -3, 2, -4,-15,-22,-11, 15; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='L'; M= -9,-25, 5,-28,-20, 3,-27,-18, 10,-26, 31, 17,-25,-28,-18,-19,-23, -9, 6,-24, -5,-19; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='H'; M= -3,-10, -9,-16,-13, -2,-20, 7, -8,-17, 0, -2, -5,-22,-12,-13, -6, 0, -5,-25, -1,-13; /M: SY='Y'; M=-19,-23,-31,-25,-22, 29,-28, 9, -1,-13, -1, 2,-23,-29,-13,-12,-23,-13,-11, 41, 64,-20; /M: SY='L'; M= -5,-23,-21,-28,-21, 2,-27,-19, 23,-24, 28, 18,-19,-25,-17,-20,-20, -8, 14,-22, -3,-20; /M: SY='G'; M= 2, -4,-27, -2,-14,-29, 52,-17,-36,-17,-29,-20, 2,-18,-16,-18, 4,-14,-26,-24,-28,-15; /M: SY='H'; M=-16, -3,-27, -3, -2,-17,-19, 79,-25,-12,-15, 0, 7,-20, 6, -3, -7,-15,-25,-30, 15, -2; /M: SY='R'; M= -4, -6,-23,-10, -5,-17,-12, -1,-16, 2, -8, -5, 0,-18, 1, 10, -5, -4,-13,-24,-10, -3; /M: SY='D'; M= -3, 8,-25, 12, 0,-24, -8,-11,-17,-10,-17,-15, 3, 2, -7,-15, 2, -4,-16,-32,-19, -5; /M: SY='G'; M= 12, -9,-24,-11,-16,-27, 47,-19,-31,-17,-25,-18, -1,-17,-16,-19, 6,-12,-21,-22,-27,-16; /M: SY='L'; M=-10,-29,-23,-34,-25, 12,-33,-23, 29,-28, 32, 20,-25,-26,-21,-23,-24, -9, 18,-18, 2,-24; /M: SY='K'; M=-10, 3,-29, 1, 9,-29,-19, -9,-29, 46,-30,-11, 4,-11, 9, 28, -9, -9,-21,-21,-11, 9; /M: SY='E'; M= 1, 1,-25, 7, 15,-27,-12, -9,-24, -1,-24,-19, -1, 13, 2, -5, 8, -2,-21,-31,-21, 7; /M: SY='E'; M= -8, 12,-25, 19, 20,-23,-16, -3,-25, 1,-17,-17, 3,-10, 4, -1, 1, -3,-20,-27,-10, 11; /M: SY='L'; M=-12,-28,-22,-30,-20, 12,-29,-18, 18,-24, 36, 20,-25,-27,-18,-14,-26,-10, 9,-17, 2,-19; /M: SY='T'; M= 1, 3,-11, -6, -7,-13,-15,-16,-13, -9,-15,-13, 6,-11, -7, -9, 23, 41, -4,-33,-13, -7; /M: SY='V'; M= 17,-21,-12,-25,-20, -6,-18,-24, 11,-17, 8, 3,-21,-21,-20,-19, -4, 1, 21,-25,-12,-20; /M: SY='L'; M= -9,-20,-27,-20, -4, 2,-24,-15, -5,-11, 7, -2,-19,-21,-10, -4,-19,-12, -8, 5, 1, -7; /M: SY='E'; M=-12, 20,-30, 32, 50,-32,-18, 0,-32, 8,-22,-22, 5, -2, 15, -2, 0,-10,-30,-32,-20, 33; /M: SY='N'; M=-11, 32,-22, 16, 2,-16, -4, 10,-19, 0,-26,-18, 48,-20, 0, -1, 6, -2,-28,-33,-11, 1; /M: SY='L'; M= -9,-29, -9,-30,-22, 7,-30,-22, 17,-29, 42, 16,-29,-31,-22,-21,-27, -9, 12,-23, -3,-22; /M: SY='R'; M= -9, -6,-24, -9, -2,-18,-21, -2,-10, 4, -9, -2, -1,-16, 7, 8, -4, 0,-11,-25, -7, 1; /M: SY='F'; M=-15,-28,-26,-35,-27, 51,-27,-15, -1,-24, 4, -2,-22,-28,-29,-19,-21,-12, -4, 29, 33,-26; /M: SY='W'; M=-11,-18,-33,-20,-16, 5,-18,-15,-13,-15, -9,-11,-18,-24,-11,-15,-19,-15,-18, 51, 15,-11; /M: SY='A'; M= 5, -5, 4,-11, -3,-20,-16,-13,-12,-10,-12, -9, -2,-17, 0,-13, 3, 0,-10,-30,-17, -2; /M: SY='A'; M= 3, -4,-22, -5, 1,-19,-10, -3,-16, -4, -7, -7, -5,-15, 1, -1, -3, -3,-12,-24,-12, 0; /M: SY='L'; M=-13,-30,-25,-36,-26, 22,-32,-22, 22,-28, 25, 16,-25,-26,-23,-22,-25,-11, 11, -1, 9,-24; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='H'; M= -2, -9,-17,-11, -9, -1,-15, 15, -6,-11, 0, 0, -7,-16, -5, -9, -4, -2, -7,-10, 14, -9; D=-9; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='G'; M= 5, 3,-15, -2, -8,-17, 24, -8,-19, -8,-17,-12, 10,-12, -8,-10, 3, -7,-16,-17,-17, -8; D=-9; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='G'; M= -3, -1, 0, 0, -3,-20, 14,-10,-23, -9,-18,-13, 0,-13, -5,-11, 1, -8,-17,-21,-17, -4; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='E'; M= -5, 3,-20, 5, 16,-20, -5, -4,-20, 1,-19,-15, 5, 5, 4, -1, 5, -3,-19,-24,-16, 9; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='I'; M= -4,-10,-18,-13,-10, -6,-16,-10, 4, -9, -1, -1, -7, 1, -8, -7, -8, -5, 0,-14, -3,-11; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='G'; M= 2, 6,-18, 6, -2,-22, 11, -9,-23, -4,-23,-16, 8,-11, -5, -7, 11, 2,-16,-26,-18, -4; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='E'; M= -1, -3,-24, -4, 5,-17,-12, -9,-16, 1,-14,-10, -4,-13, -1, 0, -1, -1,-12,-20, -6, 0; /M: SY='D'; M= -4, 7,-24, 13, 11,-20, -8, -9,-20, -6,-14,-14, 0,-13, -1,-11, 0, -7,-15,-28,-15, 5; /M: SY='S'; M= -5, 0,-14, 0, -5,-19, -5, -9,-21, -1,-19,-10, -2,-16, -3, -6, 1, 1,-15,-23, -8, -4; /M: SY='V'; M= 10,-22,-18,-28,-20, -7,-23,-25, 18,-20, 6, 5,-19,-13,-18,-22, -7, -1, 19,-24,-10,-21; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='R'; M= -8,-11,-27,-10, -1,-13,-14, 0,-18, -2,-16,-10, -8,-18, 2, 4, -5, -6,-16, 1, 2, 0; /M: SY='A'; M= 11, 0,-19, 0, 11,-24,-11,-11,-19, -4,-18,-15, -2, 1, 3,-10, 10, 6,-14,-28,-19, 7; /M: SY='A'; M= 32,-12,-12,-19,-12,-15, -7,-20, -3,-13, -6, -6,-10,-13,-11,-19, 9, 2, 5,-24,-17,-12; /M: SY='L'; M= -1,-26,-10,-30,-20, 3,-27,-22, 15,-27, 33, 13,-25,-27,-19,-22,-22, -9, 9,-22, -5,-20; /M: SY='E'; M= 3, -1,-24, 0, 13,-17,-10, 2,-22, -2,-16,-12, -2,-11, 4, -3, -1, -9,-18,-22,-11, 8; /M: SY='Q'; M= -3,-10,-23,-13, -2,-12,-21, -8, -7, -1, -3, -2, -9,-16, 4, 3, -6, 0, -8,-17, -1, 0; /M: SY='V'; M= -8,-28,-16,-33,-28, 20,-29,-22, 21,-22, 16, 17,-26,-28,-26,-19,-16, -5, 27,-17, 3,-26; /M: SY='G'; M= -3, 3,-27, 1,-10,-29, 41,-13,-35, -8,-30,-20, 10,-18,-12,-11, 3,-13,-28,-25,-25,-11; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='A'; M= 6, 0,-20, -1, 0,-21, -3, 1,-21, -5,-16,-12, 3,-14, -2, -2, 5, -4,-15,-28,-14, -2; /M: SY='H'; M= -8, 4,-29, 7, 1,-27, 10, 16,-33, -4,-24,-15, 5,-16, -1, 2, -3,-15,-26,-26,-12, -2; /M: SY='L'; M= -9,-23,-23,-26,-17, 11,-27, -8, 7,-18, 22, 9,-20,-26,-15, -7,-21,-10, 2,-14, 7,-17; /M: SY='E'; M= -9, -9,-25, -7, 13,-15,-25,-11, -3, -5, 1, -2,-10,-13, 4, -5, -8, -5, -5,-25,-11, 8; /M: SY='D'; M=-17, 25,-29, 31, 12,-29,-14, 28,-31, 2,-24,-13, 16,-14, 5, -2, -4,-12,-27,-34, -7, 7; /M: SY='L'; M= -3,-16,-23,-17, -6, -7,-24,-13, 0, -3, 9, 3,-16,-20, -7, -3,-15, -8, 0,-18, -2, -8; /M: SY='P'; M= -6,-13,-32, -8, 4,-24,-20,-16,-18, 5,-18,-12,-14, 34, -4, -5,-10, -9,-20,-25,-19, -2; /M: SY='C'; M= 11,-19, 15,-26,-21, -2,-18,-24, -3,-20, -6, -6,-15,-23,-21,-22, -1, -3, 6,-25,-12,-21; /M: SY='R'; M= 2,-10,-24,-12, -8,-17, 4, -2,-24, 1,-19,-12, -3,-18, -3, 13, 0, -8,-16,-18, -7, -8; /M: SY='M'; M= -7,-11,-20,-15, -8, -4,-19, 0, -5, -8, -4, 6, -7,-18, 1, -3, 0, 4, -5,-20, 2, -4; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='A'; M= 25,-10,-14,-16, -7,-18, -7,-13, -8, -9, -6, -2, -8,-13, 0,-14, 8, 0, -3,-23,-15, -3; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='Q'; M=-10, -2,-29, -3, 16,-36,-20, 9,-16, 8,-16, 6, -2,-11, 54, 8, -2,-10,-26,-20, -9, 35; /M: SY='R'; M=-14, -3,-30, -3, 9,-29,-20, 6,-27, 28,-23, -6, 1,-14, 25, 36, -7,-11,-24,-21, -8, 15; /M: SY='R'; M=-17, -7,-30, -7, 3,-23,-20, -3,-30, 37,-23,-10, 0,-17, 10, 56,-10,-10,-20,-20,-10, 3; /M: SY='R'; M=-18,-11,-30,-12, -1,-19,-22, -2,-22, 23,-16, -6, -2,-19, 11, 56,-10,-10,-16,-20, -9, 0; /M: SY='L'; M= -3,-26,-17,-29,-22, 3,-27,-22, 21,-23, 27, 16,-25,-26,-20,-19,-17, -3, 21,-23, -5,-21; /M: SY='A'; M= 30,-10,-14,-16, -8,-20, 0,-16,-11,-11, -9, -8, -8,-13, -4,-16, 9, 0, -5,-23,-18, -6; /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-22, 7,-31,-20, 26,-29, 42, 23,-27,-27,-19,-21,-27,-10, 14,-20, 0,-21; /M: SY='A'; M= 42,-10,-11,-19,-10,-18, -2,-19, -9,-11, -8, -9,-10,-11,-10,-19, 10, 1, 0,-22,-19,-10; /M: SY='R'; M=-18, -8,-30, -8, 2,-22,-20, -2,-30, 33,-22,-10, 0,-18, 10, 63,-10,-10,-20,-20,-10, 2; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='W'; M= -9,-30,-30,-32,-23, 5,-26,-18, 10,-25, 18, 6,-28,-26,-18,-21,-27,-15, 0, 25, 8,-20; /M: SY='L'; M= 7,-20,-15,-24,-17, -4,-20,-13, 9,-19, 16, 10,-20,-22,-15,-17,-10, -2, 12,-23, -7,-17; /M: SY='T'; M= 5, -7, -1,-13,-12,-11,-15,-15, -7,-14,-13,-10, -2,-17,-11,-15, 13, 14, 0,-29,-10,-12; /M: SY='R'; M=-13, 3,-22, 4, 1,-21,-12, -7,-27, 7,-24,-15, 3, -3, 2, 10, -6,-10,-23,-25,-15, 0; /M: SY='R'; M= 0, -9,-14,-11, -4,-21,-15,-10,-23, 12,-20,-12, -3,-11, 0, 25, 1, -2,-14,-25,-15, -4; /M: SY='P'; M=-10, -5,-33, 2, 6,-31,-18,-12,-24, 8,-29,-17, -7, 39, 3, -3, -5, -8,-26,-28,-21, 2; /M: SY='L'; M= -9,-30,-22,-33,-24, 6,-33,-24, 30,-29, 38, 19,-27,-27,-21,-23,-26, -9, 19,-21, -1,-24; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='L'; M= -9,-30,-23,-34,-25, 5,-34,-25, 33,-29, 35, 19,-26,-26,-21,-24,-25, -9, 21,-21, -1,-25; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='P'; M= -9,-21,-37,-12, -3,-27,-21,-21,-15,-11,-26,-17,-21, 78,-12,-20,-10, -9,-22,-30,-28,-12; /M: SY='F'; M= -7,-14,-18,-18, -9, 11,-22,-13, -2,-16, 6, 2,-11,-19,-13,-13, -3, 7, -2,-17, 3,-10; /M: SY='T'; M= 9,-12,-12,-19,-16, -9,-20,-23, 5,-14, -3, -3,-11,-15,-15,-16, 7, 23, 14,-27,-11,-16; /M: SY='A'; M= 29, -2,-16,-11, -8,-22, 5,-15,-16, -9,-18,-14, 3, -5, -9,-16, 10, -1,-10,-25,-22, -9; /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21, 9,-31,-21, 24,-30, 46, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 13,-20, 0,-21; /M: SY='D'; M=-17, 45,-28, 63, 18,-38, -9, -1,-38, -1,-30,-29, 19,-10, 0,-10, 4, -7,-28,-40,-20, 9; /M: SY='K'; M= -1, -4,-23, -3, 3,-21,-19,-12,-13, 12,-10, -5, -8,-15, 1, 3, -8, -7, -6,-24,-12, 2; /M: SY='E'; M= 0, -4,-23, -4, 5,-11,-10, 1,-18, -6,-11,-10, -5,-15, 0, -5, -2, -7,-15,-19, -3, 1; /M: SY='G'; M= 4, -6,-26, -9,-12,-23, 30,-14,-28,-13,-26,-17, 2,-18, -8,-15, 4,-10,-23, -9,-19,-10; /M: SY='V'; M= -5,-17,-20,-18,-16,-10,-26,-19, 11,-10, 3, 4,-16,-23,-11, -4,-10, -5, 17,-25, -9,-15; /M: SY='R'; M= 5, -2,-22, -3, 6,-22,-14, -9,-19, 8,-13,-10, -4,-12, 5, 11, -1, -3,-13,-23,-14, 4; /M: SY='L'; M= -5,-22,-22,-25,-14, -1,-26,-18, 11,-20, 21, 12,-22,-23,-11,-17,-18, -6, 6,-11, -3,-13; /M: SY='F'; M=-13,-30,-21,-35,-26, 35,-31,-22, 17,-29, 29, 12,-25,-29,-28,-21,-24, -9, 11, -9, 11,-26; /M: SY='N'; M= 3, 3,-22, -1, 4,-22, 5,-10,-20, -5,-20,-14, 8,-12, -3, -9, 6, -2,-17,-28,-19, 0; /M: SY='N'; M= -1, -1,-23, -5, 1,-19, 2, -6,-22, -2,-18,-13, 3,-15, 0, 1, 2, 0,-18,-21,-10, -1; /M: SY='L'; M= -6,-24,-22,-28,-19, 0,-28,-15, 20,-20, 25, 17,-21,-24,-15,-17,-20, -9, 13,-21, -2,-19; /M: SY='I'; M=-10,-29,-22,-35,-27, 13,-32,-22, 30,-26, 23, 22,-23,-25,-21,-22,-21, -9, 22,-17, 3,-25; /M: SY='A'; M= 7,-11,-20,-13, 0,-17,-16, -6, -8, -4, -6, -4, -8,-15, 0, -1, -2, -5, -4,-24,-11, -2; /M: SY='E'; M= 3, 1,-24, 1, 14,-25,-14, -1,-20, 9,-16, -6, -2,-10, 9, 3, -2, -8,-16,-24,-13, 11; /M: SY='H'; M=-18, 2,-29, 1, 1,-21,-19, 84,-29, -4,-22, -2, 12,-19, 9, 3, -9,-18,-29,-30, 15, 1; /M: SY='L'; M= 3,-19, 1,-23,-14,-10,-21,-17, -4,-13, 8, 1,-17,-24,-10, -5,-11, -7, 0,-25,-12,-13; /M: SY='A'; M= 10, 7,-20, 4, 3,-24, -9,-10,-22, 7,-21,-15, 6,-11, -1, 0, 6, 1,-14,-27,-17, 1; /M: SY='R'; M= -6, -3,-26, -5, 1,-26, -3, -5,-27, 17,-24,-12, 4,-15, 9, 24, 0, -7,-21,-23,-15, 4; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='I'; M= 3,-22,-13,-31,-22, -5,-26,-21, 22,-21, 12, 18,-18,-19,-14,-22,-12, -5, 15,-22, -6,-20; /M: SY='V'; M= 4,-27,-15,-31,-27, -3,-28,-29, 29,-21, 10, 10,-25,-25,-25,-22,-10, -2, 39,-26, -9,-27; /M: SY='I'; M= -8,-30,-23,-34,-26, 4,-34,-26, 35,-28, 29, 18,-26,-26,-22,-24,-22, -8, 26,-22, -2,-26; /M: SY='L'; M= 4,-23,-16,-29,-20, 5,-21,-17, 14,-20, 22, 19,-23,-23,-16,-18,-15, -6, 13,-19, -4,-18; /M: SY='T'; M= 18, -3,-10,-10, -7,-16, -9,-17,-13,-10,-15,-13, 0,-10, -7,-13, 22, 27, -3,-30,-16, -7; /M: SY='T'; M= 3, -2,-10, -8, -8,-12,-15,-18,-10,-11,-15,-12, 1,-11, -8,-11, 24, 37, 1,-33,-13, -8; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='Q'; M=-10, -6,-26, -7, 0,-21,-17, 0, -7, -7, -2, 5, -6,-16, 17, -5, -7, -6,-13,-23, -7, 8; /M: SY='D'; M= -5, 15,-29, 25, 18,-31,-14, -8,-28, -2,-24,-22, 1, 15, 0,-11, 0, -6,-24,-32,-22, 8; /M: SY='L'; M= -8,-26,-20,-27,-20, 6,-27,-17, 18,-25, 32, 17,-24,-27,-17,-19,-20, -6, 11,-20, 2,-19; /M: SY='G'; M= 2, 0,-25, 0, -2,-27, 12,-12,-24, -9,-24,-17, 3, 0, -5,-13, 4, -7,-20,-28,-23, -4; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='I'; M= -5,-25,-22,-31,-22, 5,-29,-22, 27,-25, 19, 15,-18,-20,-17,-23,-15, -7, 16,-18, 0,-22; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='K'; M= 0, 0,-17, 1, 5,-18,-12, -9,-14, 12,-16, -9, -2, -9, 1, 4, 1, -2, -6,-21,-11, 3; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='D'; M= -8, 9,-25, 14, 8,-27,-10, -8,-28, 8,-26,-18, 5, -4, 1, 6, 6, 2,-20,-31,-17, 4; /M: SY='A'; M= 13,-14,-16,-17,-12, -8,-15,-14, -3, -8, -3, -4,-12,-18,-11,-12, 1, 2, 3,-19, -2,-12; /M: SY='R'; M=-15, -1,-28, -2, 10,-23,-18, 8,-23, 15,-18, -4, 4,-15, 18, 33, -6,-10,-22,-24,-10, 11; /M: SY='M'; M= -7,-10,-22,-13, -1,-11,-24, -8, 3, -8, 0, 6, -9,-15, -4,-10, -4, 2, 2,-26, -7, -3; /M: SY='L'; M=-10,-24,-20,-26,-16, 12,-29,-18, 14,-23, 26, 10,-23,-26,-19,-18,-19, -4, 11,-16, 5,-18; /M: SY='R'; M=-13, 0,-26, -1, 0,-18,-12, 2,-21, 6,-14, -9, 5,-19, 0, 21, -5, -6,-16,-26,-11, -2; /M: SY='L'; M=-11,-29,-23,-33,-24, 13,-32,-19, 26,-27, 31, 19,-25,-27,-20,-21,-24, -9, 16,-15, 7,-23; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Post-processing [info]
| PROMOTED_BY | PS50893 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 127 in 127 different sequences |
| Number of true positive hits | 127 in 127 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | V_Lesaux |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
127 sequences
AB1I_ARATH (Q9C8T1), CCMA1_CUPMC (Q1LKR4), CCMA1_SALCH (Q57M97), CCMA1_SALPA (Q5PI55), CCMA1_SALTY (Q8ZKZ9), CCMA2_CUPMC (Q1LFZ8), CCMA2_SALPA (Q5PKT6), CCMA2_SALTY (P61378), CCMAE_SALCH (Q57I19), CCMA_AGRFC (Q8UC12), CCMA_ALBFT (Q21QL9), CCMA_ALCBS (Q0VR80), CCMA_ALIF1 (Q5E3S7), CCMA_ALKEH (Q0A808), CCMA_ANAMM (Q5PBP5), CCMA_AROAE (Q5P3L0), CCMA_BARHE (Q6G529), CCMA_BARQU (Q6G0V9), CCMA_BORBR (Q7WIP8), CCMA_BORPA (Q7W736), CCMA_BRADU (P30963), CCMA_BRUA2 (Q2YNU0), CCMA_BRUAB (Q57FS7), CCMA_BRUME (Q8YEM5), CCMA_BRUSU (Q8G358), CCMA_CAUVC (Q9A298), CCMA_CERS4 (O33570), CCMA_CHESB (Q11CZ6), CCMA_COLP3 (Q487I2), CCMA_CUPNH (Q7WXC1), CCMA_CUPPJ (Q46RX0), CCMA_DECAR (Q478L3), CCMA_ECO57 (Q8XE58), CCMA_ECOL5 (Q0TFP1), CCMA_ECOL6 (Q8FFR2), CCMA_ECOLI (P33931), CCMA_ECOUT (Q1R9L8), CCMA_GLUOX (Q5FQN4), CCMA_GRABC (Q0BV49), CCMA_HAEDU (Q7VN12), CCMA_HAEI8 (Q4QLJ9), CCMA_HAEIN (P45032), CCMA_HAHCH (Q2SE49), CCMA_HISS1 (Q0I2G0), CCMA_HYPNA (Q0BWF7), CCMA_IDILO (Q5QZP7), CCMA_JANSC (Q28NZ8), CCMA_LEGPA (Q5X6P7), CCMA_LEGPH (Q5ZX76), CCMA_LEGPL (Q5WY52), CCMA_LEGPN (Q8RPP4), CCMA_MANSM (Q65V02), CCMA_MARMM (Q0AKQ2), CCMA_METCA (Q60AB3), CCMA_NITEU (Q82WC8), CCMA_NITHX (Q1QR47), CCMA_NITMU (Q2Y9Q1), CCMA_NITOC (Q3JCI7), CCMA_NITWN (Q3SVV2), CCMA_NOVAD (Q2G9A9), CCMA_PARDP (P52218), CCMA_PARM1 (Q2VZJ1), CCMA_PARXL (Q13I12), CCMA_PASMU (Q9CPN2), CCMA_PECAS (Q6D606), CCMA_PHOPR (Q6LTL7), CCMA_PSE14 (Q48GL0), CCMA_PSEAE (Q9I3N7), CCMA_PSEAI (Q8GQ92), CCMA_PSEF5 (Q4KG27), CCMA_PSEPF (Q3KFY6), CCMA_PSEPG (P95487), CCMA_PSEPK (Q88EX5), CCMA_PSESM (Q87Z03), CCMA_PSEU2 (Q4ZQZ7), CCMA_RECAM (O21280), CCMA_RHIEC (Q2K396), CCMA_RHIET (Q52733), CCMA_RHIJ3 (Q1MAL7), CCMA_RHILO (Q98EA4), CCMA_RHIME (Q92L55), CCMA_RHOCB (P29959), CCMA_RHOP2 (Q2J3F7), CCMA_RHOPA (Q6NDA6), CCMA_RHOPB (Q21CV6), CCMA_RHOPS (Q13DS7), CCMA_RHORT (Q2RYF0), CCMA_RICBR (Q1RKE4), CCMA_RICCN (Q92G95), CCMA_RICFE (Q4UK25), CCMA_RICPR (Q9ZCF9), CCMA_RICTY (Q68VV5), CCMA_ROSDO (Q166I9), CCMA_RUEPO (Q5LR15), CCMA_RUEST (Q1GHY4), CCMA_SACD2 (Q21JK3), CCMA_SALTI (P61377), CCMA_SHEDO (Q12I82), CCMA_SHEFN (Q089M3), CCMA_SHEON (Q8EK40), CCMA_SHESM (Q0HNQ5), CCMA_SHESR (Q0I074), CCMA_SHIBS (Q31Z24), CCMA_SHIDS (Q32I01), CCMA_SHIFL (Q83KD5), CCMA_SHISS (Q3Z006), CCMA_SODGM (Q2NSG3), CCMA_SPHAL (Q1GS38), CCMA_TATCI (Q9Z651), CCMA_VIBCH (Q9KQE3), CCMA_VIBPA (Q87MK8), CCMA_VIBVU (Q8DB62), CCMA_VIBVY (Q7MIR0), CCMA_WOLPM (Q73HX8), CCMA_XANAC (Q8PK53), CCMA_XANC8 (Q4UVG2), CCMA_XANCP (Q8P8M1), CCMA_XANE5 (Q3BSL0), CCMA_XANOM (Q2P3U8), CCMA_XANOR (Q5H0W2), CCMA_XYLFA (Q9PAP0), CCMA_XYLFT (Q87BH8), CCMA_YERPA (Q1C647), CCMA_YERPE (Q8ZD58), CCMA_YERPN (Q1CHI9), CCMA_YERPS (Q668T8), CCMA_ZYMMO (Q5NQX0)» more
|
| PDB [Detailed view] |
9 PDB
7F02; 7F03; 7F04; 7VFJ; 7VFP; 8CE1; 8CE5; 8CE8; 8CEA |