PROSITE entry PS51245

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	MALK
Accession [info]	PS51245
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-AUG-2006 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51237

Name and characterization of the entry

Description [info]

Maltose/Maltodextrin import ATP-binding protein malK family profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=131;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=126;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=4.5491691; R2=0.0066142; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1511060; N_SCORE=9999.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=3848; N_SCORE=30.0; MODE=1; TEXT='?';
/CUT_OFF: LEVEL=-2; SCORE=295; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='??';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B0=-1000; B1=-1000; E0=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='L';  M=-10,-26,-20,-30,-20,  6,-26,-11, 20,-21, 37, 37,-26,-26,-11,-16,-26,-10, 10,-20,  0,-16;
/M: SY='P';  M= -1,-11,-27, -6,  0,-26,-11,-16,-20,-10,-30,-20, -7, 47, -6,-16, 12,  3,-21,-34,-26, -6;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='F';  M=-14,-13,-26,-17, -7, 18,-24,-14,-17, 15,-13, -6, -9,-19,-12,  8,-14,-10,-11, -7,  7, -7;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-19,-34,-30,  0,-34,-30, 39,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 41,-26, -6,-30;
/M: SY='T';  M= -4,  4,-19,  3, 20,-19,-20,-11,-19, -1,-14,-14,  0, -6,  3, -6, 11, 24,-13,-30,-14, 12;
/M: SY='G';  M=  6, -4,-19, -4, -9,-24, 30,-14,-29,-14,-30,-20,  6,-14, -9,-14, 23,  3,-19,-31,-24, -9;
/M: SY='T';  M=  0,-13,-10,-19,-19, -6,-24,-24,  7,-14, -1, -1,-13,-19,-19,-14,  7, 28, 22,-30,-10,-19;
/M: SY='A';  M= 24, -1,-19, -3, 20,-24, -9,-11,-19, -1,-14,-14, -6, -6,  3,-11,  6, -4,-13,-24,-20, 12;
/M: SY='I';  M=-10,-17,-30,-23,-13,-13,-31,-21, 15,  5, -2,  7,-11,-16, -7, -4,-16,-10,  8,-20, -4,-13;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='Q';  M=-14, -4,-30, -4, 11,-31,-20,  6,-24, 19,-20, -4,  0,-14, 38, 36, -4,-10,-26,-20,-10, 23;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='E';  M=-10,  6,-30, 11, 43,-34,-20,  4,-26, 10,-20,-11,  0, -4, 37,  4,  0,-10,-30,-26,-16, 40;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='P';  M= -1,-11,-27, -6,  0,-26,-11,-16,-20,-10,-30,-20, -7, 47, -6,-16, 12,  3,-21,-34,-26, -6;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='M';  M= -6,-11,-11,-17,-11,  0,-11,  0, 11, -6, 11, 34,-11,-11,  0, -6,-11, -6,  6,-11,  0, -6; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='P';  M= -6,-11,-23, -6,  0,-17,-11,-11,-11, -6,-17,-11,-11, 51, -6,-11, -6, -6,-17,-17,-17, -6; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='R';  M=-11,-10,-30,-10, -9,-24, 19, -9,-34,  8,-24,-14,  0,-20, -3, 31, -6,-14,-24,-20,-19, -9;
/M: SY='Q';  M= -6,  0,-21, -4,  7,-27,-20, -3,-16,  1,-16, -4,  0,-10, 30,  1,  9, 16,-17,-24,-10, 18;
/M: SY='Q';  M= -6,  0,-21, -4,  7,-27,-20, -3,-16,  1,-16, -4,  0,-10, 30,  1,  9, 16,-17,-24,-10, 18;
/M: SY='F';  M= -9,-30,-14,-34,-30, 35,-30,-26, 17,-24, 10,  6,-26,-30,-34,-20,-14, -4, 28,-13,  7,-30;
/M: SY='W';  M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-24,-34,-24,  6,-34,-24, 33,-30, 37, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 19,-20,  0,-24;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='E';  M=-14, 27,-30, 42, 43,-34,-16,  0,-34,  6,-24,-24,  9, -4, 11, -4,  0,-10,-30,-34,-20, 27;
/M: SY='G';  M=  6, -4,-19, -4, -9,-24, 30,-14,-29,-14,-30,-20,  6,-14, -9,-14, 23,  3,-19,-31,-24, -9;
/M: SY='R';  M=-11, -6,-21,-10, -4,-16,-20, -9,-21, 13,-16,-10,  0,-16,  1, 35,  3, 16,-11,-24,-10, -4;
/M: SY='D';  M=-11, 28,-21, 35,  7,-27,-14, -9,-27, -4,-21,-21, 11,-10, -4,-10,  9, 16,-17,-36,-16,  1;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='Q';  M= -6,  0,-21, -4,  7,-27,-20, -3,-16,  1,-16, -4,  0,-10, 30,  1,  9, 16,-17,-24,-10, 18;
/M: SY='V';  M= -9,-21,-19,-21,-17, -9,-26,-17,  4,  2, -3,  1,-17,-26,-13, 19,-10, -4, 20,-26,-10,-17;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='A';  M= 24, -1,-19, -3, 20,-24, -9,-11,-19, -1,-14,-14, -6, -6,  3,-11,  6, -4,-13,-24,-20, 12;
/M: SY='N';  M=-14, 18,-24,  7,  0,-20, -9,  6,-24, 13,-26,-16, 34,-20,  4, 30,  1, -4,-26,-31,-16,  0;
/M: SY='M';  M=-10,-20,-20,-30,-20,  0,-20,  0, 20,-10, 20, 60,-20,-20,  0,-10,-20,-10, 10,-20,  0,-10;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='L';  M= -6,-30,-16,-30,-24,  6,-30,-24, 24,-26, 33, 16,-30,-30,-24,-20,-21, -6, 27,-24, -4,-24;
/M: SY='P';  M=-10, -7,-36,  3, 26,-30,-20,-11,-24, -1,-26,-20,-11, 51,  3,-11, -6,-10,-30,-30,-26, 12;
/M: SY='A';  M= 27, -4,-10, -9, -4,-20,  0,-14,-16,-10,-21,-16,  1,-10, -4,-14, 27, 11, -6,-31,-20, -4;
/M: SY='D';  M=-16, 33,-30, 48, 37,-36,-14,  0,-36,  4,-26,-26, 11, -6,  9, -6,  0,-10,-30,-36,-20, 23;
/M: SY='H';  M=-14,-17,-30,-23,-17, -9,-31, 27, 15,-21,  3, 11, -7,-20, -7,-17,-16,-14,  4,-24,  9,-17;
/M: SY='G';  M= 28,-10,-19,-16,-14,-24, 30,-20,-23,-14,-19,-14, -6,-14,-14,-20,  6, -9,-13,-20,-24,-14;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='V';  M= 22,-21,-10,-26,-21, -9,-17,-26, 13,-16,  1,  1,-21,-21,-21,-20, -1,  0, 28,-26,-14,-21;
/M: SY='I';  M=-10,-17,-30,-23,-13,-13,-31,-21, 15,  5, -2,  7,-11,-16, -7, -4,-16,-10,  8,-20, -4,-13;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-24,-34,-24,  6,-34,-24, 33,-30, 37, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 19,-20,  0,-24;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='E';  M=-10,  6,-30, 11, 38,-30,-20, -4,-30, 27,-24,-16,  0, -4, 16, 13, -4,-10,-26,-26,-16, 27;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='Q';  M=-10, -9,-26,-13,  3,-23,-20,  6, -3,  1, -3, 26, -9,-14, 34,  1, -9,-10,-13,-20, -6, 18;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-19,-34,-30,  0,-34,-30, 39,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 41,-26, -6,-30;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 16,-36,-20,  1,-24, 27,-24, -4,  0,-10, 38, 19, -4,-10,-26,-20,-10, 27;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='I';  M= -6,-30,-21,-36,-30,  0,-36,-30, 41,-26, 16, 16,-24,-24,-24,-26,-16, -6, 39,-24, -4,-30;
/M: SY='H';  M=-20, -9,-30, -9, -9,  2,-24, 65,-17,-10,-11,  0, -3,-24,  1, -4,-14,-16,-21, -4, 46, -9;
/M: SY='I';  M=-10,-26,-26,-36,-26,  0,-31,-17, 37,-21, 20, 37,-20,-20,-11,-21,-20,-10, 21,-20,  0,-21;
/M: SY='Q';  M=-10, 17,-26,  9, 11,-31,-11, 10,-20,  6,-24, -9, 26,-14, 34,  6,  4, -6,-30,-29,-14, 23;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-26,-36,-26,  4,-36,-26, 37,-30, 33, 20,-24,-24,-20,-26,-24,-10, 21,-20,  0,-26;
/M: SY='P';  M=-10,-11,-36, -6,  4,-30,-20,-16,-24, 16,-30,-16,-11, 47, -1,  2,-10,-10,-26,-26,-21, -1;
/M: SY='G';  M=  6, -4,-19, -4, -9,-24, 30,-14,-29,-14,-30,-20,  6,-14, -9,-14, 23,  3,-19,-31,-24, -9;
/M: SY='I';  M= -1,-17,-21,-23,-17, -9,-23,-21, 20,-21, -2,  3, -7,-16,-11,-21,  6,  3, 13,-29, -9,-17;
/M: SY='R';  M=-20, 16,-30, 25,  9,-29,-16,  0,-34, 17,-24,-19,  9,-16,  6, 35, -6,-10,-24,-29,-14,  4;
/M: SY='Q';  M= -1,  0,-21,  0, 11,-31,-11,  1,-20,  1,-24, -9,  4,-10, 34,  1, 17,  3,-21,-29,-14, 23;
/M: SY='B';  M=-14, 44,-24, 42,  9,-29, -4,  6,-29,  0,-30,-24, 43,-16,  0, -4,  6, -4,-30,-40,-20,  4;
/M: SY='L';  M= -6,-30,-16,-30,-24,  6,-30,-24, 24,-26, 33, 16,-30,-30,-24,-20,-21, -6, 27,-24, -4,-24;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-19,-34,-30,  0,-34,-30, 39,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 41,-26, -6,-30;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='P';  M=-10, 14,-29,  7,  0,-24, -9, -3,-20, -4,-30,-20, 25, 28, -4, -9,  1, -4,-30,-36,-24, -4;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='V';  M=  0,-17,-10,-21,-21, -4,-26,-26, 13,-16,  1,  1,-17,-21,-21,-16,  3, 22, 28,-30,-10,-21;
/M: SY='V';  M= -4,-30,-14,-30,-26,  4,-30,-26, 26,-24, 27, 14,-30,-30,-26,-20,-19, -4, 33,-26, -6,-26;
/M: SY='L';  M=-14,  5,-24, 14, -3,-12,-21,-11, -6,-17, 15, -2, -8,-21,-11,-16,-17,-10, -7,-29, -9, -7;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='E';  M= -6,  6,-21,  7, 30,-21,-20, -9,-21,  1,-16,-16,  0, -4,  7, -4,  9, 16,-17,-30,-16, 18;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='A';  M= 20, 16,-19, 19,  3,-29, -4,-11,-23, -6,-19,-19,  3,-10, -6,-16,  6, -4,-13,-29,-20, -1;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='F';  M=-16,-30,-20,-36,-26, 50,-30,-20,  9,-30, 27,  9,-24,-30,-31,-20,-24,-10,  4, -3, 17,-26;
/M: SY='A';  M= 28, -6,-10,-16,-10,-16, -9,-20,-10,-10,-10,-10, -6,-10,-10,-16, 14, 22,  0,-24,-16,-10;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-24,-34,-24,  6,-34,-24, 33,-30, 37, 20,-26,-26,-20,-24,-26,-10, 19,-20,  0,-24;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='P';  M= 16,-16,-27,-14, -4,-26,-11,-20,-16,-10,-21,-16,-16, 47,-10,-20, -1, -6,-17,-26,-26,-10;
/M: SY='H';  M=-14,  6,-30, 11, 34,-26,-20, 44,-30,  1,-20,-11,  4, -9, 16,  0, -4,-14,-30,-30, -3, 23;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='H';  M=-20, -6,-30, -6,  0,-20,-20, 44,-30, 13,-20, -6,  4,-20, 10, 40,-10,-14,-24,-24,  3,  0;
/M: SY='E';  M= -1,  6,-21, 11, 34,-26,-11, -4,-26,  1,-24,-20,  4, -4, 11, -4, 17,  3,-21,-34,-20, 23;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='R';  M= -9, -4,-19,-10, -6,-14,-20,-11,-19,  7,-14,-10,  0,-14, -1, 25,  7, 24, -9,-26,-10, -6;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 14,-34,-20, -1,-26, 33,-26, -6,  0,-10, 32, 21, -6,-10,-24,-20,-10, 23;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='P';  M=-10,-11,-36, -6,  4,-30,-20,-16,-24, 16,-30,-16,-11, 47, -1,  2,-10,-10,-26,-26,-21, -1;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/I:         E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Post-processing [info]

PROMOTED_BY

PS50893

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_06 which contains 572'619 sequence entries.

Total number of hits	24 in 24 different sequences
Number of true positive hits	24 in 24 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	2

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	V_Lesaux
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

24 sequences

MALK_ALIF1  (Q5DZC6), MALK_ECO57  (P68188), MALK_ECOL5  (Q0TA26),

MALK_ECOL6  (Q8FB37), MALK_ECOLI  (P68187), MALK_ECOUT  (Q1R3Q1), 
MALK_MANSM  (Q65QT6), MALK_PHOLL  (Q7N986), MALK_PHOPR  (Q6LK87), 
MALK_SALCH  (Q57GZ7), MALK_SALPA  (Q5PKZ8), MALK_SALTI  (Q8Z1U0), 
MALK_SALTY  (P19566), MALK_SHIF8  (Q0SXQ1), MALK_SHIFL  (Q7UBD0), 
MALK_SHISS  (Q3YUV0), MALK_VIBCH  (Q9KL04), MALK_VIBPA  (Q87GB5), 
MALK_VIBVU  (Q8D3V0), MALK_VIBVY  (Q7MFC4), MALK_YERPA  (Q1CC21), 
MALK_YERPE  (Q8ZAS8), MALK_YERPN  (Q1CNR8), MALK_YERPS  (Q664X5)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
'Partial' sequences

2 sequences

MALK_KLEAE  (P18813), MALK_PHOLU  (P41124)

PDB
[Detailed view]

17 PDB

1Q12; 1Q1B; 1Q1E; 2AWN; 2AWO; 2R6G; 3FH6; 3GD7; 3PUV; 3PUW; 3PUX; 3PUY; 3PUZ; 3PV0; 3RLF; 4JBW; 4KI0
» more