Matrix / Profile
[info]
|
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=52;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=47;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.6773194; R2=0.0113544; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=880481; N_SCORE=9999.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=1614; N_SCORE=20.0; MODE=1; TEXT='?';
/CUT_OFF: LEVEL=-2; SCORE=425; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='??';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z
/I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20, 0,-20, 0, 20,-10, 20, 60,-20,-20, 0,-10,-20,-10, 10,-20, 0,-10;
/M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0;
/M: SY='C'; M=-10,-25, 47,-30,-25, -4,-30,-25, -4,-30, 17, 1,-25,-35,-25,-25,-20,-10, 0,-34,-14,-25;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='D'; M=-15, 26,-30, 37, 20,-40,-15, 5,-31, 5,-25,-16, 10,-10, 28, 0, 0,-10,-30,-31,-15, 24;
/M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10;
/M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20, 0,-20, 0, 20,-10, 20, 60,-20,-20, 0,-10,-20,-10, 10,-20, 0,-10;
/M: SY='E'; M= 0, 5,-19, 9, 28,-25, -9, -5,-25, 0,-25,-20, 5, -5, 9, -5, 21, 6,-19,-35,-20, 19;
/M: SY='D'; M= 13, 21,-20, 27, 6,-31, -5, -9,-26, -5,-20,-20, 6,-10, -5,-15, 5, -5,-16,-31,-20, 0;
/M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5, 5,-25,-20, -5,-30, 40,-25,-10, 0,-15, 10, 49,-10,-10,-20,-20,-10, 5;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30;
/M: SY='V'; M= 0,-30,-10,-30,-30, 0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10, 0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='C'; M=-10, -9, 41,-14, -4,-31,-25, -9,-25, -9,-20, -9, -9,-24, 17, -9, -5,-10,-20,-34,-19, 7;
/M: SY='G'; M= -5, -5,-30, -5, -1,-35, 27, -6,-31, -6,-25,-10, 0,-15, 18, -6, 0,-15,-30,-20,-20, 9;
/M: SY='P'; M=-15, 17,-35, 32, 10,-35,-15, -9,-31, -5,-30,-25, 1, 38, -5,-15, -5,-10,-30,-35,-25, 0;
/M: SY='V'; M= 24,-20,-10,-25,-20, -9,-16,-25, 11,-15, 0, 0,-20,-20,-20,-20, 0, 0, 26,-25,-15,-20;
/M: SY='H'; M=-15, 5,-30, 10, 31,-25,-20, 47,-30, 0,-20,-10, 5, -9, 15, 0, -5,-15,-30,-30, -1, 21;
/M: SY='E'; M= -5, 5,-19, 4, 23,-19,-20,-10,-19, 0,-15,-15, 0, -5, 4, -5, 10, 21,-14,-30,-15, 14;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30;
/M: SY='N'; M=-10, 21,-25, 10, 9,-29, -9, 10,-20, 5,-25,-10, 31,-15, 28, 5, 5, -5,-30,-31,-15, 19;
/M: SY='R'; M= 17,-10,-19,-15, -5,-20, -9,-10,-19, 9,-15,-10, -5,-15, 0, 23, 0, -5, -9,-20,-15, -5;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='K'; M= 19, -5,-20, -9, 0,-25,-10,-15,-20, 21,-20,-10, -5,-10, 0, 6, 0, -5,-10,-20,-15, 0;
/M: SY='H'; M= -6, 0,-20, 0, 0,-20,-10, 48,-25,-10,-25, -9, 10,-15, 5, -5, 14, -1,-20,-35, 1, 0;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10;
/M: SY='V'; M= 0,-16,-10,-20,-20, -5,-25,-25, 11,-15, 0, 0,-16,-20,-20,-15, 4, 24, 26,-30,-10,-20;
/M: SY='T'; M= 24, -5,-10,-15,-10,-15,-10,-20,-10,-10,-10,-10, -5,-10,-10,-15, 15, 26, 0,-25,-15,-10;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0;
/M: SY='T'; M= 5, 0,-10, -5, -5,-15, -9,-15,-15,-10,-20,-15, 5,-10, -5,-10, 31, 34, -5,-35,-15, -5;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20;
/M: SY='V'; M= -5,-30,-15,-30,-25, 5,-30,-25, 25,-25, 29, 15,-30,-30,-25,-20,-19, -5, 31,-25, -5,-25;
/M: SY='H'; M= -4, 0,-19, 0, 0,-20, -9, 42,-25,-10,-25,-10, 10,-15, 5, -5, 16, 1,-19,-35, -1, 0;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10;
/M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0;
/M: SY='Q'; M=-10,-16,-25,-16, -1,-14,-25, -6, 1,-11, 17, 10,-16,-20, 18, -6,-16,-10, -9,-20, -5, 9;
/M: SY='A'; M= 26,-19,-10,-25,-19,-10,-14,-25, 9,-15, 0, 0,-19,-19,-19,-20, 0, 0, 24,-25,-15,-19;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20;
/M: SY='C'; M=-15,-20, 41,-25,-25, 6,-30, -4,-14,-19, -9, -9,-20,-35,-19,-19,-15,-10,-10, -8, 28,-25;
/M: SY='G'; M= -9,-10,-30,-10,-10,-25, 27,-10,-35, 4,-25,-15, 0,-20, -6, 23, -5,-15,-25,-20,-20,-10;
/M: SY='M'; M= 0,-10,-15,-16,-10, -9,-10, -5, 1,-10, -4, 22, -6,-15, 0,-10, 9, 4, 0,-29, -9, -5;
/M: SY='E'; M=-10, 5,-30, 10, 41,-35,-20, 5,-25, 10,-20,-10, 0, -5, 39, 5, 0,-10,-30,-25,-15, 40;
/M: SY='P'; M=-10,-25,-29,-20,-10, -9,-25,-20, 1,-20, 12, 1,-25, 27,-15,-20,-20,-10, -9,-25,-14,-15;
/I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more
|