PROSITE entry PS51250
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | TAUB |
| Accession [info] | PS51250 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-AUG-2006 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51237 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Taurine import ATP-binding protein tauB. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=67; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=62; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9104320; R2=0.0120544; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=829332; N_SCORE=9999.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=1501; N_SCORE=20.0; MODE=1; TEXT='?'; /CUT_OFF: LEVEL=-2; SCORE=381; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='??'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='V'; M= -4,-30,-18,-34,-30, 0,-34,-30, 38,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 42,-26, -6,-30; /M: SY='E'; M=-14, 26,-30, 40, 44,-34,-16, 0,-34, 6,-24,-24, 8, -4, 12, -4, 0,-10,-30,-34,-20, 28; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='L'; M= -8,-30,-18,-30,-22, 8,-30,-22, 22,-28, 42, 18,-30,-30,-22,-20,-26, -8, 18,-22, -2,-22; /M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-35,-25, 48,-30,-20, 9,-30, 28, 9,-25,-30,-31,-20,-25,-10, 5, -4, 16,-25; /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-30,-20, 8,-28,-16, 20,-26, 44, 28,-28,-28,-16,-18,-28,-10, 10,-20, 0,-18; /M: SY='A'; M= 31,-10,-18,-16,-14,-24, 27,-20,-22,-14,-18,-14, -6,-14,-14,-20, 6, -8,-12,-20,-24,-14; /M: SY='T'; M= -1, 2,-15, -2, 8,-16,-17,-14,-16, -5,-16,-14, 2, -8, -2, -8, 19, 31, -8,-32,-14, 3; /M: SY='R'; M=-18, 5,-30, 11, 16,-26,-18, 0,-32, 20,-22,-16, 4,-14, 10, 41, -6,-10,-24,-26,-14, 10; /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22, 8,-32,-22, 27,-30, 43, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 14,-20, 0,-22; /M: SY='V'; M= -4,-30,-16,-32,-28, 2,-32,-28, 31,-24, 21, 14,-28,-28,-26,-22,-16, -4, 38,-26, -6,-28; /M: SY='V'; M= -2,-30,-12,-30,-28, 2,-30,-28, 28,-22, 18, 12,-30,-30,-28,-20,-14, -2, 42,-28, -8,-28; /M: SY='M'; M=-10,-24,-20,-30,-20, 4,-24, -8, 20,-18, 33, 43,-24,-24, -8,-14,-24,-10, 10,-20, 0,-14; /M: SY='S'; M= 14, 7,-14, 8, 1,-24, -2,-10,-21, -8,-25,-20, 7,-10, -2,-12, 26, 10,-11,-35,-20, 0; /M: SY='P'; M= -8,-18,-38,-10, -4,-30, -3,-20,-24,-12,-30,-20,-16, 70,-12,-20, -8,-12,-30,-28,-30,-12; /M: SY='R'; M=-12, -1,-30, -3, -4,-24, 3, -5,-28, 6,-26,-16, 10, 0, -2, 20, -4,-10,-26,-26,-20, -6; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='G'; M= 9,-10,-26,-12,-18,-28, 57,-20,-34,-18,-26,-18, -2,-18,-18,-20, 2,-16,-24,-20,-28,-18; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='I'; M= -6,-30,-22,-36,-30, 0,-36,-30, 42,-26, 16, 16,-24,-24,-24,-26,-16, -6, 38,-24, -4,-30; /M: SY='A'; M= 5,-14,-17,-18,-13, -9,-19, 5, -1,-16, 3, 2,-12,-20,-11,-14, -5, 2, 4,-26, -3,-13; /M: SY='K'; M= 2, 0,-26, 0, 14,-26,-16, 8,-26, 19,-22,-10, -1,-10, 8, 8, -4, -9,-19,-24, -9, 10; /M: SY='R'; M=-14, 10,-27, 15, 16,-25,-18, -3,-29, 12,-21,-17, 4,-12, 7, 23, -1, 0,-21,-28,-15, 10; /M: SY='Y'; M=-14,-26,-26,-28,-22, 16,-32, -7, 19,-22, 24, 12,-24,-28,-16,-18,-24,-10, 7, -1, 31,-22; /M: SY='P'; M=-12,-13,-36, -5, 10,-28,-20,-12,-24, 2,-26,-18,-12, 50, -1, 4, -8,-10,-28,-28,-24, 0; /M: SY='L'; M= -4,-23,-16,-23,-17, 1,-23,-20, 13,-24, 25, 9,-21,-26,-17,-18,-11, -1, 13,-26, -6,-17; /M: SY='D'; M= -9, 21,-26, 26, 7,-29, -8, -5,-27, -5,-30,-23, 17, 11, -2,-10, 9, -1,-26,-38,-22, 1; /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-35,-28, 69,-30,-11, 0,-25, 8, 0,-20,-30,-33,-18,-20,-10, -2, 15, 41,-28; /M: SY='A'; M= 40, -2,-12,-13, -8,-20, 0,-15,-12, -8,-13,-12, 1,-12, -8,-17, 10, 0, -5,-23,-20, -8; /M: SY='R'; M= -4, 4,-26, 6, 2,-25,-13, -4,-28, 14,-20,-15, 2,-15, 3, 32, -3, -8,-18,-25,-15, 0; /M: SY='R'; M=-18, 1,-28, 3, 0,-20,-18, 0,-21, 14,-13, 1, 0,-18, 5, 34,-10,-10,-15,-24,-10, 0; /M: SY='F'; M=-13,-24,-26,-29,-26, 28,-10,-15, 2,-24, 1, 0,-15,-25,-25,-20,-15,-12, -2, 0, 19,-26; /M: SY='V'; M= 5,-26,-14,-28,-22, 0,-24,-24, 19,-22, 22, 10,-26,-26,-22,-20,-14, -4, 25,-24, -8,-22; /M: SY='A'; M= 36, 1,-12,-11, -8,-20, 0,-13,-12, -8,-15,-12, 6,-12, -8,-15, 10, 0, -7,-25,-20, -8; /M: SY='G'; M= 10, -7,-25, -7, -5,-28, 39,-17,-32,-13,-24,-18, -2,-14,-11,-17, 2,-14,-23,-22,-26, -8; /M: SY='E'; M= 3, 11,-26, 18, 22,-30, 1, -8,-29, -2,-22,-20, 2, -8, 2,-10, 2, -9,-23,-28,-22, 12; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='P'; M= -2, 2,-16, -1, -2,-16, -8, -9,-14, -6,-19,-14, 7, 13, -4, -8, 11, 11,-14,-27,-16, -4; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='A'; M= 19,-16,-12,-20,-14, -9,-12,-20, 2,-16, 3, -1,-14,-18,-14,-18, 3, 2, 10,-26,-14,-14; /M: SY='R'; M=-13, -8,-26, -8, 0,-20,-16, -2,-28, 21,-22,-12, 2,-18, 8, 52, 1, -3,-18,-24,-12, 0; /M: SY='E'; M= 7, 3,-19, 6, 25,-25, -9, -7,-23, -1,-22,-18, 2, -5, 7, -7, 17, 3,-17,-32,-20, 16; /M: SY='I'; M= -5,-30,-21,-35,-30, 0,-35,-30, 41,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 39,-25, -5,-30; /M: SY='K'; M=-12, -2,-30, -2, 8,-28,-20, -8,-30, 46,-28,-10, 0,-12, 10, 39,-10,-10,-20,-20,-10, 8; /M: SY='A'; M= 22, -4,-15, -8, -2,-22, -5,-14,-18, 4,-22,-14, 0,-10, -2, -5, 16, 5, -8,-27,-18, -2; /M: SY='D'; M= -2, 19,-18, 27, 8,-28, -4, -6,-28, -6,-30,-24, 14,-10, 0,-10, 25, 8,-18,-40,-20, 4; /M: SY='P'; M=-10,-13,-38, -3, 14,-30,-20,-15,-22, -5,-28,-20,-15, 70, -3,-15, -8,-10,-30,-30,-28, 1; /M: SY='E'; M= 4, 5,-26, 8, 12,-31, 7, -7,-27, -3,-22,-15, 1,-10, 9, -9, 2,-10,-23,-25,-20, 10; /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-35,-28, 69,-30,-11, 0,-25, 8, 0,-20,-30,-33,-18,-20,-10, -2, 15, 41,-28; /M: M= -4,-13,-25,-16,-12,-17, -6,-19, -1, -6,-12, -3, -5,-15, -9,-10, 0, -5, -1,-25,-12,-12; /M: SY='R'; M= -2, -4,-26, -5, 12,-26,-16, -2,-24, 14,-18, -9, -2,-12, 19, 27, -2, -8,-20,-22,-14, 14; /M: SY='M'; M= -8,-17,-18,-25,-18, 0,-22, -8, 13,-14, 19, 37,-17,-20, -6,-12,-13, 4, 8,-22, -2,-12; /M: SY='R'; M=-20, -8,-30, -8, 0,-20,-20, 22,-30, 21,-20, -8, 2,-20, 10, 54,-10,-12,-22,-22, -3, 0; /M: SY='E'; M=-12, 17,-30, 27, 44,-34,-18, 2,-30, 8,-22,-19, 4, -4, 23, 0, 0,-10,-30,-30,-18, 33; /M: SY='E'; M= 1, -6,-26, -5, 7,-18, 2, -3,-21, -4,-16,-11, -6,-14, 6, -9, -2,-10,-20,-12, -1, 5; /M: SY='I'; M= -8,-30,-22,-34,-26, 4,-34,-26, 34,-28, 30, 18,-26,-26,-22,-24,-22, -8, 26,-22, -2,-26; /M: SY='L'; M= -8,-23,-18,-26,-18, 6,-28,-20, 13,-26, 37, 13,-23,-26,-18,-18,-19, 3, 8,-22, -2,-18; /M: SY='G'; M= 1, 5,-21, 9, -4,-28, 25,-12,-31,-12,-30,-22, 8,-14, -8,-14, 17, -1,-21,-32,-24, -6; /M: SY='M'; M=-12,-16,-25,-18, -3, -7,-25, -9, 6, -6, 11, 16,-15,-19, -2, 2,-17,-10, 0,-22, -6, -4; /M: SY='I'; M=-10,-30,-24,-38,-30, 15,-36,-28, 37,-28, 16, 14,-22,-24,-26,-26,-18, -8, 28,-16, 4,-30; /M: SY='W'; M=-16,-24,-31,-26,-15, 16,-25, -9, -5,-16, 2, -1,-22,-26, -4,-12,-22,-15,-13, 33, 24, -9; /M: SY='D'; M= 1, 19,-26, 27, 15,-32, 3, -8,-31, -3,-24,-22, 6,-10, -1,-12, 2, -9,-23,-30,-22, 7; /M: SY='M'; M=-10, -9,-24,-10,-10,-15,-25,-10, 11,-11, 2, 15,-11,-18, 2,-12,-11, -8, 7,-25, -7, -5; /M: SY='E'; M= 1, -2,-26, 0, 17,-26, 4, -8,-29, 4,-20,-16, -2,-10, 3, 6, 0,-10,-22,-24,-20, 9; /M: SY='E'; M=-12, 0,-32, 8, 37,-28,-20, -4,-28, 9,-22,-18, -4, 17, 12, 7, -4,-10,-28,-28,-21, 22; /M: SY='A'; M= 23, -1,-19, -2, 22,-25, -9,-11,-19, -1,-15,-15, -5, -5, 4,-11, 5, -5,-14,-25,-20, 13; /M: SY='E'; M=-10,-10,-28,-11, 9, -1,-12,-14, -7,-12, -7, -7, -9,-14, -8,-14, -9,-12,-10,-18, -7, 0; /M: SY='E'; M= -8, -1,-24, 1, 19,-19,-16, 17,-17, -2,-13, 2, -1,-10, 10, -4, 2, -6,-17,-30, -8, 13; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Post-processing [info]
| PROMOTED_BY | PS50893 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 46 in 46 different sequences |
| Number of true positive hits | 46 in 46 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | V_Lesaux |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
46 sequences
TAUB1_PARXL (Q146E7), TAUB2_PARXL (Q13KX9), TAUB3_PARXL (Q13IS7), TAUB_BURCH (A0KAV6), TAUB_BURL3 (Q39CJ6), TAUB_BURMA (Q62AW4), TAUB_BURO1 (Q1BT84), TAUB_BURP1 (Q3JKX3), TAUB_BURPS (Q63JZ3), TAUB_BURTA (Q2T751), TAUB_CHRVO (Q7NU46), TAUB_CUPNH (Q0K2U3), TAUB_CUPPJ (Q471U2), TAUB_ECO57 (Q8X5I6), TAUB_ECOL5 (Q0TKS1), TAUB_ECOL6 (Q8FKF5), TAUB_ECOLI (Q47538), TAUB_ECOUT (Q1RFH8), TAUB_JANSC (Q28K97), TAUB_PARPN (Q6RH47), TAUB_PELUB (Q4FMG5), TAUB_PSE14 (Q48C94), TAUB_PSEAB (Q02SA6), TAUB_PSEAE (Q9HX79), TAUB_PSEE4 (Q1IGM2), TAUB_PSEF5 (Q4KK16), TAUB_PSEPF (Q3KJQ7), TAUB_PSEPK (Q88RA1), TAUB_PSEPU (Q8KZR4), TAUB_PSESM (Q87UH7), TAUB_RHIEC (Q2K164), TAUB_RHIJ3 (Q1M7R4), TAUB_RHILO (Q98DW6), TAUB_RHIME (Q92UX0), TAUB_ROSDO (Q16BJ3), TAUB_RUEPO (Q5LVM5), TAUB_SHIBS (Q325N3), TAUB_SHIDS (Q32IZ6), TAUB_SHIF8 (Q0T7M2), TAUB_SHIFL (Q83MA0), TAUB_SHISS (Q3Z542), TAUB_SINFN (Q6W2B1), TAUB_YERPA (Q1C2S1), TAUB_YERPE (Q8ZJD0), TAUB_YERPN (Q1CCR9), TAUB_YERPS (Q664P8)» more
|