PROSITE entry PS51262
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | COS |
| Accession [info] | PS51262 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-NOV-2006 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51262 |
| Associated ProRule [info] | PRU00586 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | COS domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=59; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=54; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.9286619; R2=0.0150344; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3689.9523926; R2=2.8761904; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=504; H_SCORE=5140; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=371; H_SCORE=4757; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-5; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='L'; M= 0,-13, -9,-17,-13, 6,-18, -7, 22,-10, 29, 25,-13,-31,-16,-16,-16, 1, 13,-26, 12,-13; /M: SY='E'; M= 1, 8,-19, 17, 25,-26,-13,-14,-21, 20,-13, 0, -1, 3, 7, -1, -1,-11,-19,-21,-13, 17; /M: SY='E'; M= 3, 2, -2, 11, 40,-35,-17, -4,-26, 13,-12, -9, -5, 3, 24, 1, -1,-14,-25,-16,-19, 36; /M: SY='P'; M= -3, -2,-25, -6, -4,-25, -6, 5,-15, 0,-19,-15, 6, 32, -2,-11, 1, 8,-22,-39,-20, -6; /M: SY='D'; M= -1, 18,-25, 32, 7,-28, 2, -9,-25, -1,-11,-19, 4, -8, -4,-10, 1,-11,-21,-23,-13, 2; /M: SY='H'; M= 3,-14,-28,-14, -3,-19,-12, 7, -6, 3, -5, 4,-11, 5, 3, -3, -4, 3,-10,-23, -7, -3; /M: SY='A'; M= 19, -5,-24, -5, -1,-18, -7,-14, 0, -1,-10, -4, -5, 2, 0,-13, 10, 11, 3,-39,-25, -3; /M: SY='A'; M= 9, -5, 4, -3, -1,-16,-13,-22, -1, -8, -1, -1, -8,-17, -5, -9, -3, -1, 4,-30,-19, -2; /M: SY='F'; M=-22,-29,-33,-43,-34, 82,-29,-24, -3, -9, 18,-20,-15,-27,-26, -9,-11,-17, 6, 12, 33,-35; /M: SY='L'; M= -3,-11, -7,-13,-13, 10,-19,-11, 20,-15, 28, 16,-14,-28,-18,-18,-12, 6, 14,-25, 17,-13; /M: SY='Q'; M= 7,-11,-19,-12, 9,-22,-20, -5,-11, -3,-13, -6,-10, -6, 56, 23, -9, 2,-17,-14, -6, 25; /M: SY='A'; M= 13, -5,-21,-10, -8,-10,-12,-17, 9, -5, -2, 3, -1,-14, 2,-11, 5, 13, 9,-35,-13, -6; /M: SY='A'; M= 23, -3,-28, -3, -3,-16, 0, -7, -2, -3,-12, -1, -2,-11, -1,-11, 16, 9, 2,-39,-27, -6; /M: SY='K'; M= -1, 3,-25, 3, 10,-15,-10,-14,-20, 22,-20, 4, 5, 6, 7, 14, 0, -7,-20,-25,-14, 6; /M: SY='Q'; M= 9, 1,-16, -1, 10,-22,-12, -7, -7, 2,-10, -4, 4, -7, 14, -4, 2, 2,-10,-30,-19, 10; /M: SY='L'; M= -4,-11, -7,-15,-15, 11,-18,-14, 25,-18, 28, 13,-13,-27,-19,-21,-11, 5, 17,-25, 16,-15; /M: SY='I'; M= 1,-11,-18,-19,-16, -1,-16,-10, 25,-13, 15, 11, -6,-20,-13,-21, -6, 8, 18,-32, 1,-15; /M: SY='D'; M= 1, 16,-16, 19, 14,-25,-12, -1,-15, 5, -9, -3, 14, -8, 1,-10, -2, -6,-17,-37,-17, 9; /M: SY='R'; M= -4,-11,-21, -7, 2,-13,-11,-11,-21, 11,-16, 1,-12, -5, 22, 40, -6,-17,-15, -7, -5, 7; /M: SY='I'; M= 6,-17,-21,-25,-22, -3,-16,-18, 34,-13, 8, 4, -8,-20,-18,-19, -4, 8, 29,-32, -6,-23; /M: SY='A'; M= 10, -3,-23, -5, -1,-18, -5,-17, -9, 4,-11, -1, -1, -4, 4, -5, 10, 10, -5,-28,-16, 0; /M: SY='D'; M= 4, 8, -8, 15, 2,-22,-14,-15,-12, 2, -4, 1, 3,-16, -5, -5, -1, -1, -7,-33,-16, -2; /M: SY='A'; M= 19, 1,-22, -5, -8,-14, -2,-16, 2, -4, -2, 7, 5,-13, -1,-16, 7, 14, 4,-41,-22, -6; /M: SY='S'; M= 10, -1,-18, 0, 7,-23,-10,-10, -9, 1,-12,-10, -3, 2, 8,-10, 13, 11, -9,-31,-19, 5; /M: SY='K'; M= 4, -6,-23, -7, 9,-11, -8,-13,-16, 15,-13, 5, -3, -5, 13, 12, -3,-10,-15,-17,-13, 9; /M: SY='T'; M= 9, -1,-13, -4, -7,-11,-10,-18, -4, -7, -4, -5, 1,-13, 3,-12, 6, 12, -2,-32,-15, -4; /M: SY='W'; M=-12,-14,-10,-10, -4, -2, -7,-23,-15, -8, -8,-15,-21,-18, -8, -5, 2, -8,-12, 30, 6, -7; /M: SY='H'; M= -4, -5,-23, -9, -3,-12,-20, 19, -3, -9, -2, 2, 1,-11, 5, -8, -4, 3, -7,-31, 0, 0; /M: SY='I'; M= 3, -7,-21,-10, -9, -7, -3,-18, 4, -4, -1, 1, -6,-14, -5, -6, 1, 4, 2,-22, -6, -9; /M: SY='E'; M= -5, -9,-14, -6, 15,-19, -7, 2,-18, 3, -8, -7,-13, 4, 12, 3, -6,-16,-21,-10, -8, 15; /M: SY='R'; M= 0, -1,-22, 3, -4,-13,-15,-13,-10, 7, -7, 6, -1,-14, 3, 17, -5, -8, -4,-25, -7, -4; /M: SY='P'; M= -2,-12,-19, -8, 0,-20,-15, -5,-12, 1, -8,-11,-17, 33, 2, -3, -5, 4,-12,-28, -8, -1; /M: SY='E'; M= 3, -1,-11, 3, 24,-30,-15, -5,-17, 9,-12, -9, -3, 13, 17, -7, -1, -4,-20,-24,-18, 22; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='P'; M= -6,-11,-21,-11, -1, -7,-15, 3,-10, 2, -8, -6,-11, 19, -1, 1, -8, -5,-13,-21, -3, -3; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='G'; M= 3, -3,-27, -4,-10,-19, 21,-23, -4, -4, -9, -8, -5,-13,-11, -8, -1, -7, -7,-12,-14,-10; /M: SY='Y'; M=-13,-14,-33,-14,-15, 20,-18,-12, -2, -5, 10, -7,-11,-19,-13, -9, 0, 2, 4, -1, 26,-17; /M: SY='E'; M= 1, 4,-13, 17, 30,-37,-16, 6,-28, 8,-14,-15, -8, 15, 15, -5, 0,-10,-26,-24,-17, 24; /M: SY='N'; M= 3, 10,-16, 6, 5,-16, -7,-12,-10, 6,-15, -7, 16,-10, -4, -8, 14, 6,-13,-35,-20, 0; /M: SY='M'; M= 2,-21,-20,-32,-14, 8,-22, 2, 10, 8, 17, 31, -4,-36,-14, -6,-15, -5, 6,-20, -1,-15; /M: SY='D'; M= 2, 33,-26, 53, 2,-28, -9,-18,-27, 0,-10,-21, 14,-15, -8, -7, 2, -6,-15,-38,-13, -5; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='H'; M=-12,-15,-33,-14, -2,-12,-23, 64,-10,-12, -3, 7,-10, 0, 0, -7, -7, -9,-13,-26, 6, -1; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='F'; M=-16,-23,-13,-33,-26, 54,-27,-20, 6,-12, 24, -3,-15,-35,-24,-11,-14,-11, 11, -1, 26,-26; /M: SY='T'; M= 6, -1,-21, -4,-10,-20,-15,-12, -5, -2, -6, -1, 6, -2, 4, -7, 6, 18, -1,-38,-13, -6; /M: SY='I'; M= 2,-15,-13,-18,-20, 10,-21,-20, 33,-19, 22, 10,-15,-32,-22,-17,-13, 4, 30,-27, 11,-20; /M: SY='D'; M= 3, 36,-27, 59, 3,-36,-10,-14,-25, -2,-10,-19, 16,-14,-10,-11, 1, -4,-13,-44,-15, -4; /M: SY='F'; M= -1,-11,-23,-19,-25, 25,-23,-24, 5,-11, 8, -8, -3,-22,-17,-18, 3, 14, 14,-24, 8,-23; /M: SY='E'; M= 7, 4,-10, 7, 24,-26, -8,-11,-16, 11,-12, -6, 0, -3, 4, -9, 5, -6,-15,-24,-21, 17; /M: SY='H'; M= -2, -2,-27, 4, 8,-30,-10, 23,-22, 0,-16, -6, -4, 10, 10, 3, -4,-12,-23,-30,-15, 7; /M: SY='E'; M= 0, -9, -7, -7, 11,-10,-21, -1, 3, -5, 9, 5,-14,-14, 0,-11, -9, -5, 0,-22, 1, 9; /M: SY='A'; M= 13, -2,-20, 3, 9,-21, -8,-11,-13, 6,-10, 2, -5, -8, 12, 5, 2, -4, -8,-27,-20, 9; /M: SY='R'; M= 3, -4,-23, -2, 1,-15,-13, -9,-15, 7,-11, 1, -2,-10, 13, 14, 1, -2,-10,-20, -7, 3; /M: SY='A'; M= 19, -8,-20, -9, -3,-14,-12,-11, 3, 1, 2, 16, -5,-18, 1, -5, -1, 6, 8,-36,-17, -3; /M: SY='L'; M= -7,-13, -6,-19,-16, 14,-17,-13, 33,-20, 34, 17,-14,-30,-20,-23,-17, 0, 19,-23, 17,-16; /M: SY='Q'; M= 0, -9,-24, -4, 7,-23,-20, 12,-18, 2, -9, 1,-10, -5, 26, 16, -6, -6,-15,-18, -4, 13; /M: SY='Q'; M= 6, 2,-10, -3, 7,-21,-13, -3,-13, 3,-13, 1, 9, -6, 11, -2, 3, 2,-13,-35,-23, 8; /M: SY='L'; M= -5,-12, -8,-17,-16, 11,-13,-13, 27,-18, 30, 16,-14,-30,-20,-20,-16, -1, 15,-21, 16,-16; /M: SY='D'; M= 0, 33,-28, 49, 2,-27,-10,-10,-25, 1,-10,-16, 19,-13, -9,-10, -1, -6,-17,-42,-14, -4; /M: SY='F'; M=-20,-29,-31,-43,-32, 78,-27,-23, -4, -7, 14,-22,-14,-19,-25,-10,-10,-17, 3, 7, 26,-34; /M: SY='I'; M= -1,-11, -9,-18,-13, -1, -3,-17, 7,-10, 7, 3, -7,-21, -8,-10, -5, -2, 2,-19, -6,-12; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 38 in 38 different sequences |
| Number of true positive hits | 38 in 38 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | COS |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
38 sequences
FSD1L_HUMAN (Q9BXM9), FSD1L_MOUSE (Q8BYN5), FSD1_BOVIN (Q05B84), FSD1_DANRE (Q1LY10), FSD1_HUMAN (Q9BTV5), FSD1_MACFA (Q4R539), FSD1_MOUSE (Q7TPM6), TRI18_HUMAN (O15344), TRI18_MOUSE (O70583), TRI18_MUSSP (P82457), TRI18_RAT (P82458), TRI36_HUMAN (Q9NQ86), TRI36_MOUSE (Q80WG7), TRI42_HUMAN (Q8IWZ5), TRI42_MOUSE (Q9D2H5), TRI46_HUMAN (Q7Z4K8), TRI46_MOUSE (Q7TNM2), TRI46_RAT (A0A0G2JXN2), TRI54_BOVIN (Q58D15), TRI54_HUMAN (Q9BYV2), TRI54_MOUSE (Q9ERP3), TRI54_PONAB (Q5REJ9), TRI54_RAT (Q5XIH6), TRI55_HUMAN (Q9BYV6), TRI55_MOUSE (G3X8Y1), TRI55_RAT (Q5PQN5), TRI63_HUMAN (Q969Q1), TRI63_MOUSE (Q38HM4), TRI63_RAT (Q91Z63), TRI67_HUMAN (Q6ZTA4), TRI67_MOUSE (Q505D9), TRIM1_HUMAN (Q9UJV3), TRIM1_MOUSE (Q9QUS6), TRIM9_BOVIN (Q29RQ5), TRIM9_DROME (M9MRI4), TRIM9_HUMAN (Q9C026), TRIM9_MOUSE (Q8C7M3), TRIM9_RAT (Q91ZY8)» more
|
| PDB [Detailed view] |
1 PDB
5IM8 |