PROSITE entry PS51266
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | ZF_CHY |
Accession [info] | PS51266 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-NOV-2006 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC51266 |
Associated ProRule [info] | PRU00601 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | Zinc finger CHY-type profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=68; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=63; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4746594; R2=0.0057403; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=10074.6943359; R2=3.6835620; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1172; H_SCORE=14392; N_SCORE=9.2; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=702; H_SCORE=12661; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-17; D=-80; I=-80; B1=-400; E1=-400; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255; ... A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y /I: B1=0; BI=-255; BD=-255; /M: SY='P'; M=-31,-49, 14, 7, 3, -7,-10, 4,-14,-15, 8,-29, 67, 18, -9,-17,-14,-10,-44,-32; /M: SY='E'; M= -5,-43, -8, 47,-36, 26, 14,-12, -8, 15,-25,-11, -2,-21,-30,-18,-16,-11,-47,-34; /M: SY='P'; M=-18,-46,-25, 26,-40,-37,-30,-21, 13,-11,-28, -5, 60, 26, -6, 12,-24, 8,-46,-21; /M: SY='M'; M= -3,-42, 6, 2,-24, 17,-27,-33, 27, -2, 35, 12,-14, 21, 9, -1,-13,-33,-45,-32; /M: SY='N'; M=-30, 0, 19, 13,-38,-19, 18, 20, 11,-21,-26, 28, 1, 24, 14,-16,-26, 5,-51,-32; /M: SY='G'; M=-30,-42,-41,-41, 38, 40, 11,-22,-34, 21, 11,-32,-45,-34, 5,-30, -9, -7,-28, 36; /M: SY='G'; M= 22,-40,-32,-39,-48, 77,-38,-50,-35,-48,-39,-20,-35,-33,-42, -1, 11,-41,-44,-44; /M: SY='C'; M=-30,142,-50,-50,-40,-45,-50,-47,-45,-38,-38,-36,-61,-53,-52,-32,-30,-34,-70,-51; /M: SY='E'; M= -4,-46,-17, 50,-49,-36,-26,-45, 43,-44,-36, -8, 27, 21, 18, 6,-15,-32,-46,-38; /M: SY='H'; M=-38,-50,-22,-22,-36,-40,132,-55,-27,-37,-22,-11,-38,-16,-21,-27,-36,-54,-72, -5; /M: SY='Y'; M=-40,-50,-40,-43, 33,-47, -7,-24,-35,-21,-18,-41,-52,-31,-32,-35,-34,-30, 4,114; /M: SY='K'; M=-20,-47, -3, -6,-43,-39,-26,-43, 61,-41, -6,-21,-12, 16, 53, -8,-17,-27, 36,-31; /M: SY='R'; M=-34,-49,-28,-17,-45,-42, 6,-49, 40,-44,-32, 1,-40, 10, 85,-26, -7,-43,-45,-31; /M: SY='N'; M= -7,-38,-19,-25,-45, 12,-21,-46, -3,-48,-37, 62,-38,-17, 41, 46,-17,-41,-52,-37; /M: SY='C'; M= 2,118,-43,-42, 6,-42, 52,-31,-40,-30,-29,-32,-52,-42,-42,-30,-29, 9,-54, -4; /M: SY='K'; M=-33, -2,-31,-18, -6,-43, -9,-36, 65, 3, -2,-24,-39, -4, 54,-30,-29,-35,-40,-28; /M: SY='W'; M=-35,-44,-56,-48, 20,-53,-47, 46,-46, 45, -6,-51,-49,-43,-46,-44,-32, 14, 90,-14; /I: I=-21; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65; /M: SY='R'; M=-44,-59,-43,-18,-50,-57,-38,-31, 28,-25,-38,-38,-53,-25, 66,-42,-41, -2,-56,-43; D=-21; /I: I=-21; DM=-65; /M: SY='F'; M= 47,-45,-54,-48, 56,-41,-49,-38,-48,-35,-37,-46,-53,-49,-50,-31, -7,-33,-39,-23; D=-21; /I: I=-21; DM=-65; /M: SY='P'; M= 5,-50,-31, 4,-48,-34,-33,-36,-26,-26,-32,-34, 91, 36,-34, 1,-25,-17,-47,-43; /M: SY='C'; M=-30,142,-50,-50,-40,-45,-50,-47,-45,-38,-38,-36,-61,-53,-52,-32,-30,-34,-70,-51; /I: I=-22; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71; /M: SY='C'; M=-30,142,-50,-50,-40,-45,-50,-47,-45,-38,-38,-36,-61,-53,-52,-32,-30,-34,-70,-51; /M: SY='N'; M= -9,-41, 35,-13,-47, 44, 3,-48, 1,-37,-39, 64,-37,-23,-29, 4,-23,-45,-54,-39; /M: SY='K'; M=-30,-46, -9, 35,-46,-39, 0,-46, 63,-25,-33,-20,-33, 18, 37, 2,-26,-42,-44,-33; /M: SY='W'; M= -8,-44,-56,-47, 18,-49,-50, 41,-44, 31,-11,-50,-47,-42,-45,-41,-32, 25,102,-14; /M: SY='Y'; M=-41,-45,-47,-46, 78,-49,-18,-19,-40,-15,-18,-43,-53,-41,-37,-38,-34,-11, -2, 91; /M: SY='P'; M=-17,-43, 18,-24,-43,-12,-10,-31,-16,-38, -4,-24, 74,-30,-36, 0, 49, -4,-53,-39; /M: SY='C'; M=-30,142,-50,-50,-40,-45,-50,-47,-45,-38,-38,-36,-61,-53,-52,-32,-30,-34,-70,-51; /M: SY='R'; M=-36,-52, 38,-16,-45,-43, 3,-19, -1,-42,-34,-21, 15,-14, 84,-29,-32,-41,-49,-32; /M: SY='H'; M=-18,-42,-35,-14, 43,-45, 76, 16,-13, 16,-16,-28,-42,-29, -5,-30, 13,-21,-37, 6; /M: SY='C'; M=-30,142,-50,-50,-40,-45,-50,-47,-45,-38,-38,-36,-61,-53,-52,-32,-30,-34,-70,-51; /M: SY='H'; M=-38,-50,-22,-22,-36,-40,132,-55,-27,-37,-22,-11,-38,-16,-21,-27,-36,-54,-72, -5; /M: SY='D'; M=-23,-46, 91, -5,-50,-29,-19,-51,-22,-51,-47, 52,-37,-22,-30,-21,-23,-49,-65,-13; /M: SY='E'; M= 8,-44, 33, 63,-45,-22,-24,-42, 10,-12,-34, 21,-31, 3,-22,-22,-13,-38,-50,-38; /I: I=-13; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42; /M: SY='N'; M= 8,-40, 16, 12,-36, -2, 12, 4, 2,-31,-28, 42,-39,-25,-29, -5,-23, 26,-51, -9; D=-13; /I: I=-13; DM=-42; /M: SY='E'; M=-16, 15, 29, 55,-22,-35, 1,-42, -6,-30,-36,-20, 2, 27,-24, 29, -8,-26,-50,-35; /M: SY='D'; M=-14,-44, 65, -4,-48, 6,-23,-46, 3,-45, -1, 33,-37,-20, 34,-12, 7,-42,-56,-37; /M: SY='H'; M=-38,-50,-22,-22,-36,-40,132,-55,-27,-37,-22,-11,-38,-16,-21,-27,-36,-54,-72, -5; /M: SY='H'; M= -7,-41, 22, 35,-16,-37, 41,-33, -7,-13,-29, -7,-34, 16, 5, 6, 31, -7,-51,-29; /M: SY='C'; M= -4, 46,-50,-44, 30,-48,-36, 28,-42, 41, 44,-43,-48,-13,-42,-37,-29, 2,-36, 5; /M: SY='D'; M=-32, -6, 62, 34,-47,-36,-26, -5,-22,-40,-36, 26, 43, 15,-30,-25,-25, -8,-57,-39; /M: SY='R'; M=-36,-49,-34,-24,-34,-46, 29,-15, 0, -2, 3,-27,-44,-13, 88,-32,-34,-34,-43, -3; /M: SY='H'; M= 31,-42,-29, -5, 20,-34, 59,-39, 31,-35,-28,-24, 11, 18, 7,-22,-16,-35,-38, 6; /M: SY='K'; M= 17,-41, 19, 24,-45,-32,-24,-41, 34,-24,-32, 34,-34, 29, 11,-18, 12,-36,-49,-36; /M: SY='V'; M=-25,-37,-39,-34, -8,-46,-40, 18,-10,-11,-18,-31,-40,-31, 33,-24, 48, 49,-50,-29; /M: SY='K'; M=-17,-42,-26, 21,-38,-39,-28, 0, 44,-27, 43,-24,-33, 29, 2, 1, 18, 5,-46,-31; /I: I=-22; MD=-71; /M: SY='E'; M=-43,-60,-25, 41,-58,-49, 21,-60, 13,-46,-47, 26,-45, 31,-16,-25,-40,-58, 28,-43; D=-22; /I: I=-22; MI=-71; MD=-71; IM=-71; DM=-71; /M: SY='M'; M=-39,-50,-65,-58,-33,-63,-51, 16,-53, -2, 75,-56,-57,-49,-53,-51,-37, 41,-61,-37; D=-22; /I: I=-22; DM=-71; /M: SY='I'; M=-31,-41,-49,-41, 5,-53,-41, 53,-24, 34, 35,-43,-45, 7,-21,-39,-28, 29,-41,-22; /M: SY='C'; M=-30,142,-50,-50,-40,-45,-50,-47,-45,-38,-38,-36,-61,-53,-52,-32,-30,-34,-70,-51; /M: SY='M'; M=-13,-38,-38,-39,-30, 44,-32, -5,-35, 6, 75,-26,-37,-30,-38, 20, 15,-22,-44,-30; /M: SY='Y'; M= -9,-41,-35, -6, 14,-43, 0, 4, -8, 27,-15, -5,-43,-16, -1,-11, 8, 2,-29, 49; /M: SY='C'; M=-30,142,-50,-50,-40,-45,-50,-47,-45,-38,-38,-36,-61,-53,-52,-32,-30,-34,-70,-51; /M: SY='N'; M= -1,-41, 29, 4, -7, 22,-24,-37,-25, -9, -7, 37,-38, 3,-16, 21,-12,-36,-42, 18; /M: SY='T'; M=-28, -3,-28,-23,-36,-40, 31,-20, 43, -5, 4, 2,-35,-20, 27,-19, 54,-28,-49,-29; /M: SY='E'; M= -4,-45,-19, 60,-32,-45,-30, 13,-21, 3,-23,-33, 8, 1, -1,-29,-18, 13,-44, -2; /M: SY='Q'; M=-27,-51,-25, -6, 5,-12,-18,-42,-11,-37,-26,-20,-36,105,-12, -5,-30,-44,-38,-25; /M: SY='P'; M= -5,-48, 22, 13,-16,-17, 12,-43, 13,-45,-37,-24, 73,-22, 7, 2, 2,-41,-48,-37; /M: SY='V'; M= 36,-38, 6,-33,-26,-38,-40, 26,-14,-19,-19,-35, -5,-35,-37,-26,-22, 49,-43, 16; /M: SY='Q'; M= 11, 12, 12,-19,-48, 28,-27,-44, 2,-44,-35, 9,-35, 53,-16, 27, 12,-38,-48,-37; /I: I=-21; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65; /M: SY='Q'; M= 8,-46, 20, 12,-11,-34, 2,-43, 29,-40,-31,-19, 3, 76,-13,-15, -8,-40,-43,-30; /M: SY='T'; M=-21,-41, -5, 17,-11,-40, 9, 7,-24,-26, -4, 13, -3, 7, 3, -4, 30, 26,-44, 14; /M: SY='C'; M=-30,142,-50,-50,-40,-45,-50,-47,-45,-38,-38,-36,-61,-53,-52,-32,-30,-34,-70,-51; /M: SY='I'; M=-27,-44, 9, 25,-32,-41,-33, 37, 5,-11, 7,-27, 11, -5, -6, 19, -4, 5,-46,-15; /I: I=-21; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65; /M: SY='H'; M=-30,-46, 2, -7,-16, 13, 44,-50, 1,-47,-39, 39,-42, 13,-28, 30,-26,-47,-48, 14; D=-21; /I: I=-21; DM=-65; /M: SY='C'; M=-30,142,-50,-50,-40,-45,-50,-47,-45,-38,-38,-36,-61,-53,-52,-32,-30,-34,-70,-51; /M: SY='G'; M=-21,-43,-14,-15,-47, 65, -4,-49, -5,-27,-36, 25,-36, 32,-30, 17,-27,-46,-46,-39; /M: SY='V'; M= 2,-39,-31, -1,-31,-14,-33, 1, 21,-24, 7, 9,-39, 3, 0,-12, 8, 42,-46, 1; /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 15 in 15 different sequences |
Number of true positive hits | 15 in 15 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 0 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | window20 |
Author [info] | N_Hulo |
Feature key [info] | ZN_FING |
Feature description [info] | CHY-type |
Version [info] | 6 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
15 sequences
BTSL1_ARATH (F4IDY5), BTSL2_ARATH (F4HVS0), BTS_ARATH (Q8LPQ5), HOT13_KLULA (Q6CIK2), HOT13_YEAST (P36078), MIEL1_ARATH (Q8VZK0), SRFP1_ORYSJ (Q10LI1), YEMC_SCHPO (O14033), YERG_SCHPO (O14099), YGU5_SCHPO (O43034), YNS9_SCHPO (O60140), ZFP34_ARATH (Q9FFB6), ZFP34_ORYSJ (Q5JL96), ZN363_HUMAN (Q96PM5), ZN363_MOUSE (Q9CR50)» more
|
PDB [Detailed view] |
3 PDB
2DKT; 2K2C; 7YNX |