PROSITE entry PS51288
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | THIQ |
| Accession [info] | PS51288 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JAN-2007 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51237 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Thiamine import ATP-binding protein thiQ family profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=205; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=200; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7535055; R2=0.0104004; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=961237; N_SCORE=9999.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=8485; N_SCORE=90.0; MODE=1; TEXT='?'; /CUT_OFF: LEVEL=-2; SCORE=457; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='??'; /DEFAULT: M0=-16; D=-80; I=-80; B1=-500; E1=-500; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255; ... A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y /I: B1=0; BI=-255; BD=-255; /M: SY='L'; M=-29,-34,-10, -2, 8,-46, 8, 11,-14, 57, 2,-36,-41,-27,-31,-35,-25, 5,-35,-16; /M: SY='D'; M=-10,-38, 53, 33,-37,-28,-19,-18, 1, -3,-26, 19,-29, 19,-20, 11, -4,-29,-48,-30; /M: SY='D'; M=-25,-39, 48, -9,-42, 17,-16,-41, 26,-26,-31, 48,-32, 23, 14,-15,-20,-40,-47,-31; /M: SY='V'; M= -8,-31,-42,-38,-15,-44,-40, 37,-36, 24, 11,-11,-40,-35,-38,-28, -2, 55,-44,-22; /M: SY='R'; M=-11,-36, 3, 0, -5,-35, 9, 3, 1,-10,-19,-18,-31, 16, 36, -4, 34, -3,-38, -2; /M: SY='W'; M=-15,-37,-43,-39, 55,-41,-27, 24,-35, 9,-10,-36,-42,-35,-35,-14, -3, 4, 66, 53; /M: SY='R'; M=-22,-37, 19, -6,-10,-29, 13,-30, -9, -3, -7, 13,-34,-13, 46, 31, -4,-29,-36, 17; /M: SY='Y'; M=-32,-43, -6,-25, 20,-37, -6,-22, -3, -6,-15, -6, -6, 23,-20,-26,-26,-26, -2, 91; /M: SY='G'; M=-21,-43, 0, 32,-39, 46, 33,-46, 5,-41,-32, 4, 22, 15, -8,-17,-26,-43,-38, -1; /M: SY='H'; M=-19,-35, 21, 14,-37,-10, 61,-37,-15,-35,-27, 7,-27, 25, -5, 22, 39,-32,-50,-21; /M: SY='W'; M=-15,-36, 6, -1, 42,-39,-27, 0,-27, 26, 31,-28,-36, 18,-29,-25, 12,-15, 44, -9; /M: SY='P'; M= 4, 25,-27,-24,-32,-29,-29,-26,-22, -2, -3, 4, 64,-24, -4, 6, 31,-25, 21,-31; /M: SY='M'; M=-28,-32,-48,-40, 48,-44,-25, 1,-36, 38, 82,-39,-41,-31,-33,-36,-25, 5,-26, -5; /M: SY='H'; M= 2, 33, 7, 16,-38,-28, 54,-41, -8,-37,-28, 0,-31,-10, 43, 27, -4,-34,-48,-24; /M: SY='F'; M= 0,-33,-46,-42, 90,-10,-31,-13,-39, 10,-13,-37,-45,-45,-38,-31,-28,-16,-10, 10; /M: SY='D'; M=-26,-39, 79, 6,-42,-27, 21,-10,-19,-38,-35, 19,-29,-17,-26, 8, 10,-33,-59,-29; /M: SY='L'; M= 13, 48,-44,-37, 0,-40,-34, 6,-38, 53, 0,-40,-44,-34,-38,-30,-23, 13,-37,-20; /M: SY='H'; M= 9,-32,-18, -5,-33,-26, 52,-13,-17,-17,-21, 19,-28, 25,-10, 17, 45,-22,-47,-23; /M: SY='I'; M= 2,-33,-46,-41, 20,-45,-44, 52,-39, 8, -4,-39,-40,-38,-40,-30,-18, 51,-37,-17; /M: SY='P'; M= 19, 20, -5, 27,-43, -3,-26,-38, 13,-39,-30, -8, 54, 11,-20, -2, 2,-32,-42,-36; /M: SY='A'; M= 42,-35, -9,-14,-40, -1,-25,-33, 31,-21,-25,-20, 20, 23, 17,-13,-20,-27,-38,-31; /M: SY='G'; M= 19,-37,-26,-29,-45, 73,-30,-46, -7,-44,-34,-14,-30, 11,-30, 0,-26,-39,-37,-37; /M: SY='E'; M= -5,-42, 30, 64,-47,-31,-16,-44, -6,-39,-32,-14,-24, 47, 5, 5,-21,-38,-43,-32; /M: SY='R'; M=-25,-41,-33,-23,-26,-41,-28, 46, 17,-14,-12,-25,-35, 12, 51, -6,-21, 14,-39,-23; /M: SY='V'; M= -1,-30,-41,-37,-19,-43,-45, 36,-35, -5, -7,-34,-37,-36,-38,-22, 24, 63,-48,-25; /M: SY='A'; M= 75,-24,-30,-23,-39,-12,-32,-28,-25,-30,-24,-25,-29,-22,-30, 4,-14,-15,-39,-34; /M: SY='I'; M=-25,-35,-48,-43,-11,-51,-43, 59,-41, 35, 2,-42,-41,-38,-42,-35,-20, 42,-39,-20; /M: SY='M'; M= -9,-34,-47,-40,-12,-45,-35, 50,-37, 29, 61,-39,-38,-32,-37,-33,-21, 31,-38,-19; /M: SY='G'; M=-12,-40,-27,-39,-46, 87,-34,-54,-33,-49,-38,-13,-31,-30,-40,-12,-31,-47,-37,-41; /M: SY='P'; M= 24,-44,-23, 22,-46,-27,-30,-36,-22,-42,-31,-31, 92,-21,-32,-19,-20,-34,-42,-42; /M: SY='S'; M= -4,-27,-19,-20,-37,-12,-22,-37,-20,-40,-34, -7,-27,-11,-24, 83, 2,-29,-45,-29; /M: SY='G'; M=-12,-40,-27,-39,-46, 87,-34,-54,-33,-49,-38,-13,-31,-30,-40,-12,-31,-47,-37,-41; /M: SY='A'; M= 62,-26,-27,-23,-39, 4,-29,-31,-24,-34,-27,-19,-29,-19,-29, 41, -8,-20,-40,-33; /M: SY='G'; M=-12,-40,-27,-39,-46, 87,-34,-54,-33,-49,-38,-13,-31,-30,-40,-12,-31,-47,-37,-41; /M: SY='K'; M=-26,-40,-18, -4,-42,-33,-21,-42, 86,-41,-29,-11,-26, -2, 13,-20,-20,-38,-35,-28; /M: SY='S'; M= -4,-27,-19,-20,-37,-12,-22,-37,-20,-40,-34, -7,-27,-11,-24, 83, 2,-29,-45,-29; /M: SY='T'; M=-15,-24,-20,-23,-31,-30,-31,-22,-20,-27,-23, -9,-22,-24,-29, 10, 88,-14,-51,-29; /M: SY='L'; M=-31,-32,-48,-40, 17,-49,-31, 4,-41, 70, 8,-46,-47,-35,-38,-40,-26, -3,-32,-13; /M: SY='L'; M=-30,-32,-48,-40, 14,-49,-31, 4,-41, 70, 8,-46,-47,-34,-38,-40,-26, -3,-32,-14; /M: SY='N'; M= 7,-30, -6, 0,-38, 2,-12,-35,-15,-39, 7, 79,-32,-13,-22, 24,-10,-34,-51,-33; /M: SY='L'; M= 3,-31,-43,-36, -8,-42,-31, 12,-37, 59, 36,-39,-41,-31,-36,-31, -1, -3,-36,-18; /M: SY='I'; M=-26,-37,-48,-45,-12,-51,-45, 71,-41, 21, 14,-40,-39,-38,-43,-36,-21, 36,-38,-20; /M: SY='A'; M= 74,-24,-30,-23,-39,-12,-32,-29,-25,-31,-24,-24,-29,-21,-30, 9,-14,-16,-39,-34; /M: SY='G'; M=-12,-40,-27,-39,-46, 87,-34,-54,-33,-49,-38,-13,-31,-30,-40,-12,-31,-47,-37,-41; /M: SY='F'; M=-39,-34,-51,-47,102,-46,-31,-12,-42, -3,-14,-40,-49,-53,-39,-37,-30,-17, -3, 18; /M: SY='E'; M=-11,-38, 10, 48,-24,-41,-25, 19,-20, 28,-11,-27,-31, 19,-25,-26,-23, 1,-40,-26; /M: SY='W'; M= 12,-36,-27, 4, -4,-32, 3,-21, -6, 1, -1,-25, 37, 5, 4,-17, 27, -4, 45,-22; /M: SY='P'; M= 9,-45,-32,-21,-40,-30,-34,-24,-27,-18,-26,-36, 98,-29,-37,-24,-20, -2,-42,-40; /M: SY='D'; M= 22,-37, 47, 20,-42, -7, 29,-36, -3,-35,-29,-11,-28, 37,-19,-12, 10,-20,-47,-28; /M: SY='S'; M= 11,-32, -6, 1, -3,-10,-21,-36, -7,-36,-29,-12,-28, 35, 0, 60, -8,-30,-39,-25; /M: SY='G'; M=-12,-40,-27,-39,-46, 87,-34,-54,-33,-49,-38,-13,-31,-30,-40,-12,-31,-47,-37,-41; /M: SY='Q'; M=-20,-40, 13, 42,-40,-15, 8,-13, -7,-29,-27,-14,-27, 43, 28, 17, 7,-30,-43,-28; /M: SY='I'; M=-25,-35,-48,-43,-10,-50,-41, 58,-40, 35, 28,-41,-40,-36,-41,-36,-21, 37,-39,-19; /M: SY='W'; M=-13,-36, -5,-26,-18,-36, 5,-15,-10, 27,-13,-26,-36,-23, 21, -4, 28, -3, 83,-16; /M: SY='W'; M=-29,-38,-50,-43, 11,-49,-40, 52,-40, 41, 24,-43,-42,-36,-40,-38,-25, 14, 67,-12; /M: SY='N'; M= -2,-35, 42,-13,-40, 4, 23,-38,-14,-23,-30, 70,-34, 7, 1,-12,-17,-37,-53,-30; /M: SY='G'; M=-14,-39, 11, -3,-46, 76,-28,-51,-27,-48,-38, 14,-30,-24,-35, 0,-26,-45,-40,-39; /M: SY='E'; M= 1,-38, -9, 53,-36,-17,-24,-17, 0,-25,-22,-23,-28, 29, 11,-20,-21, 30,-43,-30; /M: SY='D'; M=-25,-38, 78, 9,-42,-24,-16,-39,-17,-17,-35, 38,-31,-16,-25, 14, -6,-37,-58,-32; /M: SY='H'; M=-27,-37,-31,-28,-15,-41, 84, 9,-29, 19, 34,-23,-38, -1,-26,-28,-24, 25,-42, 18; /M: SY='T'; M= 9,-27,-23,-26,-28, 3,-29,-20,-22, 2,-19, 9,-27,-24,-16, 5, 67, -7,-46,-28; /M: SY='T'; M= 17,-35,-25,-11, 4, 1, 18,-30, 6,-21,-23,-19, 22, 2, 16, 3, 25,-26,-33, 13; /M: SY='T'; M= 5,-29,-27,-24,-23,-31, 17,-16,-10, 26, -9,-19,-31, -1, -4, 17, 49,-15,-43,-23; /M: SY='P'; M= 24,-40, 4, 17,-44, 9,-27,-38,-18,-40,-31,-22, 67, 2, -2, 7,-10,-33,-42,-37; /M: SY='P'; M=-27,-50,-32,-21,-42,-33,-34,-24,-27,-26,-27,-37,105,-31,-39,-27,-21, 2,-43,-42; /M: SY='A'; M= 48,-30,-28,-26, -3, 12, 28,-30,-26,-29,-24,-20,-32,-21,-28, 26,-16,-23,-27, 39; /M: SY='Q'; M= -1,-42, 35, 42,-46,-31,-15,-43, 11,-38,-30, 3,-28, 56, 29,-16,-23,-38,-43,-30; /M: SY='R'; M=-30,-46,-26,-14,-39,-40,-15,-46, 13,-38,-27,-19,-38, -3, 95,-24,-29,-39,-39,-25; /M: SY='P'; M=-29,-55,-29,-17,-49,-31,-32,-37,-24,-47,-33,-35,110, 0,-36,-26,-22,-42,-42,-45; /M: SY='V'; M=-18,-30,-47,-41, 20,-47,-45, 23,-38, 10, -4,-42,-43,-41,-39,-31,-16, 71,-42,-18; /M: SY='S'; M= 6,-27,-19,-20,-37,-13,-23,-35,-20,-39,-33, -8,-26,-12,-25, 79, 13,-27,-45,-29; /M: SY='M'; M=-23,-33,-43,-36,-14,-39,-23, 33,-31, 12,100,-31,-34,-24,-30, -9, -1, -1,-38,-16; /M: SY='L'; M=-28,-33,-48,-41, -5,-50,-35, 29,-41, 63, 7,-45,-45,-35,-39,-39,-24, 17,-36,-17; /M: SY='F'; M=-39,-34,-51,-47,102,-46,-31,-12,-42, -3,-14,-40,-49,-53,-39,-37,-30,-17, -3, 18; /M: SY='Q'; M=-22,-48,-17, 3,-53,-30,-10,-39, -2,-34,-20,-13,-29,105, -3,-11,-25,-41,-35,-24; /M: SY='E'; M=-25,-44, 52, 79,-48,-36,-16,-48, -7,-41,-38,-13,-21, -1,-17,-19,-23,-41,-48,-36; /M: SY='N'; M=-25,-36, -6,-19,-38, 13, 77,-43,-15,-41,-27, 78,-34, 8,-19,-12,-18,-44,-57,-21; /M: SY='N'; M=-25,-30, 2,-20,-40,-13, -6,-39,-11,-47,-33,100,-36,-13,-19, -7,-10,-42,-59,-35; /M: SY='L'; M=-29,-32,-47,-40, -4,-49,-32, 6,-41, 70, 8,-46,-47,-34,-38,-40,-25, 10,-35,-17; /M: SY='F'; M=-39,-34,-51,-47,102,-46,-31,-12,-42, -3,-14,-40,-49,-53,-39,-37,-30,-17, -3, 18; /M: SY='P'; M= 38,-33,-27,-21,-38,-20,-30,-29,-24,-18,-26,-23, 64,-22,-31, 30, 16,-24,-42,-35; /M: SY='H'; M=-32,-44,-16,-16,-31,-34,126,-49,-21,-31,-17, -6,-33,-10,-15,-22,-31,-49,-66, 0; /M: SY='L'; M=-30,-32,-48,-40, -3,-49,-31, 5,-41, 72, 9,-47,-47,-34,-38,-40,-26, -2,-34,-16; /M: SY='T'; M=-14,-26, 19,-19,-34,-26,-26,-27,-20,-31,-27, 4,-24,-21,-27, 33, 75,-19,-51,-29; /M: SY='V'; M=-17,-30,-46,-40,-16,-48,-48, 31,-38, 6, -4,-41,-42,-40,-40,-30,-15, 74,-49,-24; /M: SY='E'; M= 25,-38,-19, 39, 36,-19,-23,-33,-10,-28,-26,-24,-31, 15, 33,-19,-24,-28, 32,-15; /M: SY='Q'; M=-23,-43, 35, 39,-48,-32,-14,-40, -7,-36,-27,-11,-26, 80,-10,-13, 11,-38,-42,-28; /M: SY='N'; M=-25,-30, 2,-20,-40,-13, -6,-39,-11,-47,-33,100,-36,-13,-19, -7,-10,-42,-59,-35; /M: SY='I'; M= -7,-35,-47,-43,-14,-48,-45, 65,-39, 14, 18,-39,-38,-37,-41,-32,-19, 43,-40,-21; /M: SY='G'; M= 40,-34, 0,-29,-44, 68,-32,-43,-29,-41,-33,-16,-30,-26,-36, -9,-24,-33,-39,-38; /M: SY='L'; M=-30,-33,-48,-40, 13,-49,-33, 21,-41, 67, 8,-46,-46,-35,-39,-40,-26, -1,-32,-14; /M: SY='G'; M= 3,-39,-28,-38,-45, 85,-34,-52,-32,-48,-37,-14,-31,-30,-39,-12,-30,-44,-37,-40; /M: SY='L'; M=-29,-36,-45,-38,-10,-49,-34, 45,-30, 50, 3,-40,-42,-30, 16,-36,-24, 13,-36,-19; /M: SY='H'; M=-20,-36, 6,-15,-35,-25, 74,-35, 21,-35,-26, 29,-31,-11, 16, 35,-14,-12,-51,-19; /M: SY='P'; M=-15,-53,-30,-18,-49,-30,-33,-36,-26,-47,-33,-36,110,-29,-38,-25,-22,-41,-42,-46; /M: SY='G'; M= 7,-35, 9,-25,-42, 57,-23,-44,-20,-44,-34, 41,-31,-20, 0, 16, -5,-38,-44,-36; /M: SY='L'; M=-30,-33,-46,-38, -5,-49,-30, 4,-36, 70, 8,-45,-47,-31, -6,-39,-26, -4,-34,-17; /M: SY='K'; M=-27,-42,-21, -9,-40,-35, 24,-43, 65,-39,-27,-13,-30, -4, 61,-21,-11,-38,-38,-25; /M: SY='L'; M=-30,-32,-48,-40, -3,-49,-31, 5,-41, 72, 9,-47,-47,-34,-38,-40,-26, -2,-34,-16; /M: SY='N'; M= -5,-30, 6,-19,-37, -1,-17,-35,-13,-38,-30, 59,-30,-15, 16, 26, 41,-29,-50,-31; /M: SY='A'; M= 49,-32, -3, 18,-40, -7,-27,-32, -6,-35,-28,-21, 29,-16, -7, 19,-15,-14,-41,-34; /M: SY='E'; M= 29,-35, -2, 39,-38, 4,-23,-29, 10, -9,-24,-19,-27, 32,-17, -5,-10,-12,-40,-31; /M: SY='Q'; M=-25,-45, 55, 41,-50,-30,-13,-44, -7,-39,-31, 9,-27, 72,-12,-15,-22,-42,-46,-30; /M: SY='R'; M=-26,-45,-21, 8,-42,-36,-15,-21, 31,-35,-24,-17,-32, 59, 67,-20,-26,-35,-37,-26; /M: SY='Q'; M= 14, -1,-15, 36,-42,-28,-19,-37, 28,-23,-25,-17,-27, 54, 17, -6, -3,-31,-39,-29; /M: SY='Q'; M= 18,-37, -5,-10,-38,-29,-20,-33, 34,-14,-23,-16,-31, 45, 43,-14, 12,-28,-39,-27; /M: SY='V'; M=-21,-33,-46,-40,-14,-48,-41, 43,-36, 20, 36,-40,-40,-35,-20,-33,-18, 57,-43,-21; /M: SY='E'; M= 5,-38, 12, 44,-40,-30, 37,-34, 21,-34,-27, 3,-26, 31, -1, -4, 0, -9,-45,-27; /M: SY='Q'; M= 9,-38, 28, 24,-41,-12, 7,-31, 14,-34,-27, 7,-29, 47, 6, 1,-19, -2,-44,-29; /M: SY='A'; M= 57,-28,-36,-30,-27,-23,-38, 36,-30,-15,-14,-29,-32,-28,-34,-12, 2, 16,-40,-29; /M: SY='A'; M= 57,-28,-37,-29,-23,-23,-34, 11,-31, 28, -9,-32,-35,-27,-34,-15,-18, -1,-37,-27; /M: SY='A'; M= 35, 13,-10, 0,-40, 1, -4,-36, -1,-35,-28,-16,-30, 21, 30, 26, 2,-28,-42,-30; /M: SY='Q'; M= 4,-43,-22, -6,-44,-31,-14,-40, 3,-35,-24,-16,-33, 73, 63, -3,-24,-36,-37,-26; /M: SY='V'; M=-16,-29,-44,-38,-17,-44,-39, 14,-35, -1, 53,-37,-39,-35,-36,-27, 8, 69,-48,-22; /M: SY='G'; M=-12,-39,-27,-39,-46, 86,-34,-53,-32,-49,-38,-13,-31,-30,-40, -5,-30,-47,-37,-41; /M: SY='L'; M=-28,-34,-48,-41, -7,-50,-37, 41,-41, 58, 6,-44,-44,-35,-40,-38,-24, 21,-36,-18; /M: SY='A'; M= 34,-35, 28, 31,-43, 25,-23,-39,-17,-38,-31, 2,-27, 22,-24, -2, 3,-30,-43,-34; /M: SY='G'; M= -8,-39, 38, 21,-45, 53,-22,-47, -6,-45,-37, 28,-29,-16,-11, 3,-22,-42,-45,-36; /M: SY='F'; M=-31, 23,-41,-34, 45,-43,-22, -8, 10, 38, 35,-35,-43,-29,-25,-33,-26,-13,-18, 44; /M: SY='L'; M=-26,-36, 2, 32,-16, 1,-25, -9,-27, 47, 41,-30,-35,-20,-30,-30,-25,-14,-38,-22; /M: SY='D'; M= 5,-38, 41, 29,-40,-28,-19,-35, 28,-15,-28, 5, -9, 32,-12, -3, 5,-32,-44,-30; /M: SY='R'; M=-13,-45,-26,-14,-39,-38,-16,-45, 12,-37,-27,-19,-38, 12, 91,-22,-28,-38,-39,-26; /M: SY='L'; M=-29,-34,-37,-27,-11,-44,-28, -4, 30, 58, 1,-34,-41,-22, 6,-34,-25,-10,-35,-19; /M: SY='P'; M= -8,-52,-30,-19,-48,-30,-33,-36,-26,-46,-33,-35,109,-29,-38,-25,-22,-40,-42,-46; /M: SY='E'; M= 12,-37, 11, 40,-43, 32,-23,-42, -2,-40,-33, 2, 4,-12, 6, 7, 4,-34,-43,-35; /M: SY='Q'; M= 15,-39,-12, 41,-44,-28, 8,-37, -7,-34,-25,-16,-26, 69, 5, 0, 12,-32,-40,-28; /M: SY='L'; M=-30,-32,-48,-40, -4,-49,-32, 10,-41, 70, 8,-46,-47,-34,-38,-40,-26, 3,-34,-16; /M: SY='S'; M= -4,-27,-19,-20,-37,-12,-22,-37,-20,-40,-34, -7,-27,-11,-24, 83, 2,-29,-45,-29; /M: SY='G'; M=-12,-40,-27,-39,-46, 87,-34,-54,-33,-49,-38,-13,-31,-30,-40,-12,-31,-47,-37,-41; /M: SY='G'; M=-12,-40,-27,-39,-46, 87,-34,-54,-33,-49,-38,-13,-31,-30,-40,-12,-31,-47,-37,-41; /M: SY='Q'; M=-22,-47,-11, 41,-51,-32,-11,-40, -3,-35,-23,-14,-27, 95, -5,-13,-25,-40,-37,-26; /M: SY='R'; M=-27,-45,-22, -8,-42,-36,-15,-43, 42,-38,-26,-16,-33, 47, 75,-20,-26,-39,-37,-26; /M: SY='Q'; M=-19,-45,-18, 0,-50, -7,-12,-39, -5,-35,-22,-12,-29, 98, -6, 14,-22,-39,-36,-25; /M: SY='R'; M=-30,-46,-26,-14,-39,-40,-15,-46, 13,-38,-27,-19,-38, -3, 95,-24,-29,-39,-39,-25; /M: SY='V'; M= 27,-28,-41,-35,-21,-36,-44, 11,-34, -8, -9,-36,-38,-35,-37,-21, -5, 68,-48,-27; /M: SY='A'; M= 75,-25,-31,-24,-39, 4,-33,-29,-26,-31,-25,-25,-29,-22,-31, -4,-16,-16,-39,-35; /M: SY='L'; M=-30,-32,-48,-40, -4,-49,-32, 16,-41, 70, 9,-46,-47,-34,-38,-40,-26, -1,-34,-16; /M: SY='A'; M= 76,-24,-31,-23,-39,-12,-32,-28,-26,-30,-24,-25,-29,-22,-30, -4,-15,-15,-39,-34; /M: SY='R'; M=-30,-46,-26,-14,-39,-40,-15,-46, 13,-38,-27,-19,-38, -3, 95,-24,-29,-39,-39,-25; /M: SY='C'; M= 21,111,-40,-37,-30,-33,-40,-18,-34,-22, 12,-30,-43,-37,-39,-20, 3, 20,-53,-36; /M: SY='L'; M=-31,-32,-48,-40, 34,-49,-31, 3,-41, 67, 6,-46,-48,-36,-38,-40,-27, -4,-28,-10; /M: SY='V'; M=-19,-30,-47,-40,-12,-48,-43, 20,-39, 35, 0,-43,-43,-38,-39,-32,-17, 65,-45,-22; /M: SY='R'; M=-28,-47,-24, -9,-42,-38,-14,-44, 10,-37,-25,-18,-36, 53, 85,-21,-28,-40,-38,-25; /M: SY='D'; M=-10,-44, 52, 32,-46, -8, 27,-44, -9,-40,-32,-11, 22, 41, 14, -7,-22,-41,-47,-29; /M: SY='Q'; M=-26,-43,-18, -6,-43,-32, 9,-42, 54,-38,-26, 11,-31, 55, 50,-18,-23,-39,-38,-26; /M: SY='P'; M=-29,-54, -1,-17,-49,-31,-32,-37,-25,-47,-34,-33,109,-29,-38,-26,-22,-42,-43,-46; /M: SY='I'; M=-24,-36,-48,-44,-13,-51,-46, 68,-40, 15, 15,-40,-39,-38,-42,-35,-19, 45,-40,-20; /M: SY='L'; M=-11,-34,-48,-39, -5,-44,-33, 1,-39, 64, 26,-45,-45,-32,-37,-38,-27, -6, 63,-14; /M: SY='L'; M=-30,-32,-48,-40, -3,-49,-31, 5,-41, 72, 9,-47,-47,-34,-38,-40,-26, -2,-34,-16; /M: SY='L'; M=-30,-32,-48,-40, -3,-49,-31, 5,-41, 72, 9,-47,-47,-34,-38,-40,-26, -2,-34,-16; /M: SY='D'; M=-31,-44, 99, 6,-51,-27,-16,-49,-18,-48,-47, 2,-30,-17,-26,-19,-20,-46,-66,-33; /M: SY='E'; M=-23,-44, 6, 89,-47,-39,-16,-48, -4,-40,-36,-20,-18, 3,-14,-20,-24,-40,-43,-37; /M: SY='P'; M=-10,-53,-30,-18,-48,-30,-33,-36,-26,-46,-33,-36,109,-29,-38,-25,-22,-40,-42,-46; /M: SY='F'; M=-39,-34,-51,-47,102,-46,-31,-12,-42, -3,-14,-40,-49,-53,-39,-37,-30,-17, -3, 18; /M: SY='S'; M= 39,-26,-22,-21,-38,-12,-25,-34,-22,-37,-30,-12,-27,-14,-26, 69, -3,-24,-43,-31; /M: SY='A'; M= 72,-24,-29,-22,-39,-12,-31,-29,-25,-31,-25,-23,-29,-21,-29, 21,-13,-16,-39,-34; /M: SY='L'; M=-30,-32,-48,-40, -3,-49,-31, 5,-41, 72, 9,-47,-47,-34,-38,-40,-26, -2,-34,-16; /M: SY='D'; M=-26,-43, 88, -1,-50, 31,-19,-50,-21,-48,-45, -1,-30,-20,-29,-17,-22,-46,-58,-35; /M: SY='P'; M=-29,-55,-29,-17,-49,-31,-32,-37,-25,-47,-33,-35,110, -4,-36,-26,-22,-42,-42,-45; /M: SY='A'; M= 54,-30, -8,-25,-33, 22, 5, 7,-11,-17,-20,-23,-31,-24,-30,-11,-16, 2,-40,-30; /M: SY='L'; M=-30,-33,-46,-37, -5,-48,-29, 3,-34, 68, 25,-44,-46,-30, -3,-39,-26, -4,-34,-17; /M: SY='R'; M=-30,-46,-25,-13,-39,-39,-16,-45, 29,-38,-27,-18,-37, -3, 91,-24,-28,-39,-38,-26; /M: SY='Q'; M= 31,-36, 20, 16,-41,-24, 20,-34, 0,-34,-26, 25,-30, 43, 18,-12,-19,-16,-44,-28; /M: SY='E'; M=-22,-44, 14, 83,-47,-10,-17,-47, -6,-40,-35,-18,-20, 20,-15,-19,-24,-40,-43,-36; /M: SY='M'; M=-24,-32,-47,-36,-13,-39,-17, 2,-29, 17,114,-34,-34,-21,-28,-34,-23, -5,-37,-13; /M: SY='L'; M=-28,-33,-42,-33, -8,-46,-30, 10,-32, 63, 5,-39,-43, 6, -8,-33, -3, 1,-35,-18; /M: SY='D'; M= 29,-32, 42, 1,-39,-23, 10,-29,-10,-32,-27,-12,-28, 21,-23, 17, 26, -6,-48,-29; /M: SY='L'; M=-30,-32,-43,-12, -5,-49,-30, 4,-38, 70, 8,-45,-45,-31,-36,-39,-26, -4,-34,-17; /M: SY='V'; M=-19,-31,-47,-41,-14,-48,-45, 36,-39, 22, -2,-42,-42,-39,-40,-32,-17, 66,-45,-22; /M: SY='S'; M= 16,-33, 16, 2,-33,-24,-22,-28, 26, 6,-22, 8,-30, 5, 5, 33,-14,-26,-42,-28; /M: SY='Q'; M=-11,-40, 27, 38,-44,-14, 11,-41, 33,-38,-29,-12,-26, 43, 9, -6, 10,-36,-43,-29; /M: SY='L'; M=-24,-33,-44,-39, 6,-44,-36, 38,-38, 50, 2,-39,-42,-33,-38, 1,-20, 24,-36,-17; /M: SY='C'; M= 23,107,-33,-31,-34,-31, 53,-18,-27,-29,-25,-23,-41,-29, -4,-18, -2,-25,-54,-29; /M: SY='R'; M= 19, 20, 25, 10,-41,-27, 2,-22, 4,-35,-27, -2,-32, 32, 43, 7,-20,-30,-43,-29; /M: SY='E'; M=-22,-43, 13, 77,-47,-35,-15,-45, -5,-39,-33, -1,-21, 42,-13, -5,-11,-39,-43,-34; /M: SY='R'; M=-23,-39,-17, 14,-41,-33,-17,-38, 27,-35,-26, 8,-29, 49, 52,-13, 31,-33,-41,-27; /M: SY='Q'; M= -9,-41, -2,-12,-46, 48,-22,-45, 43,-42,-30,-12,-29, 51, 2,-14,-25,-41,-37,-31; /M: SY='M'; M=-10,-33,-35,-32, -3,-38,-25, 20,-28, 37, 59, 14,-38, 4,-14,-27, -7, 6,-37,-18; /M: SY='T'; M=-15,-24,-20,-24,-30,-31,-31,-21,-20,-26,-23,-10,-22,-25,-29, 2, 89,-13,-51,-29; /M: SY='V'; M=-23,-31,-47,-40, -9,-48,-39, 19,-40, 51, 3,-44,-44,-37,-39,-35,-20, 51,-41,-20; /M: SY='L'; M=-29,-33,-48,-41, -5,-50,-34, 29,-41, 66, 8,-45,-46,-34,-39,-40,-25, 7,-35,-17; /M: SY='M'; M=-25,-33,-47,-38, 3,-41,-21, 24,-31, 18,106,-35,-35,-24,-30,-35,-23, -2,-35,-12; /M: SY='V'; M= 6,-29,-45,-39,-18,-43,-47, 27,-37, -4, -6,-40,-40,-38,-39,-27,-14, 73,-49,-25; /M: SY='T'; M=-11,-25,-20,-22,-32,-24,-28,-26,-20,-30,-26, -9,-23,-20,-27, 46, 75,-18,-49,-29; /M: SY='H'; M=-32,-44,-16,-16,-31,-34,126,-49,-21,-31,-17, -6,-33,-10,-15,-22,-31,-49,-66, 0; /M: SY='H'; M=-21,-38, 38, -8,-41,-23, 61,-41,-14,-38,-28, 35,-30, 50,-16, 28, 3,-38,-51,-22; /M: SY='P'; M=-27,-41,-38,-29, 7,-39,-34, -7,-33, 30,-10,-40, 80,-34,-38,-32,-22, 18,-37,-25; /M: SY='D'; M=-20,-39, 53, 44,-45,-26,-17,-44, -9,-42,-36, 7,-26, 20, 13, 34,-15,-38,-49,-32; /M: SY='D'; M=-29,-44, 90, 39,-50,-29,-16,-49,-15,-46,-44, -2,-27,-12,-24,-19,-21,-45,-61,-34; /M: SY='A'; M= 63,-26,-33,-26,-30,-18,-33, 0,-28, 2,-16,-27,-32,-24,-32, 6,-15, 8,-39,-30; /M: SY='R'; M= 17,-38,-22, 24,-32,-33,-22, -1, 21, 2, -1,-22,-31, 29, 42,-19,-23,-21,-38,-26; /M: SY='R'; M= 25,-38, -5,-16,-37, -2, 20,-37, 18,-18,-24,-18,-34, 7, 63,-17,-24,-31,-40,-26; /M: SY='I'; M=-28,-37,-43,-37, 8,-47,-36, 57, -3, 40, 1,-36,-39,-31,-16,-17,-22, 5,-34,-17; /M: SY='A'; M= 57, 24, -2,-25, 3, -6,-32, 7,-28,-23, 6,-24,-32,-25,-32, 8,-16,-13,-38,-26; /M: SY='D'; M= -6,-38, 65, -5,-44,-25, 17,-40, -7,-41,-34, 18, 6, 20, -6, 17, 14,-36,-53,-30; /M: SY='R'; M=-27,-44,-23,-12,-37,-35, 39,-39, 12,-17,-22, 0,-36, 41, 73, -5,-25,-37,-41,-22; /M: SY='V'; M=-11, 12,-38,-35, 11,-38,-35, 20,-33, 8, 12,-30,-37,-32,-35, 12, 20, 46,-38, 3; /M: SY='I'; M= 15,-32,-44,-38,-13,-41,-40, 44,-38, 36, -1,-39,-40,-34,-39,-29,-20, 37,-39,-22; /M: SY='F'; M=-30,-34,-40,-16, 66,-45, 20, -4,-33, 28, -7,-35,-43,-34,-11,-32,-13, 20,-21, 14; /M: SY='I'; M=-24,-34,-48,-43, 6,-50,-43, 53,-40, 33, 1,-42,-42,-38,-41,-35,-20, 46,-38,-18; /M: SY='D'; M= 28, 12, 55, 34,-40,-27, 8,-30, -5,-33,-30,-13,-29,-15,-23, -6,-18, 2,-50,-32; /M: SY='N'; M=-27,-40, 54, 25,-45,-26, 16,-44, 2,-42,-33, 54,-31, 32, 18,-15,-19,-42,-52,-30; /M: SY='G'; M=-12,-40,-27,-36,-46, 86,-33,-53,-31,-48,-37,-13,-31, -5,-38,-12,-31,-47,-37,-40; /M: SY='R'; M=-26,-42,-21,-10,-40,-35, 6,-41, 41,-37,-26, -3,-32, 39, 67,-17, 11,-36,-39,-25; /M: SY='I'; M= 0,-35,-46,-42, -1,-46,-44, 65,-39, 10, 17,-38,-38,-37,-41,-31,-19, 39,-38,-20; /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;» more |
Post-processing [info]
| PROMOTED_BY | PS50893 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 44 in 44 different sequences |
| Number of true positive hits | 44 in 44 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | V_Lesaux |
| Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
44 sequences
THIQ_AGRFC (Q8UBY6), THIQ_ALIF1 (Q5E882), THIQ_BRUA2 (Q2YLW6), THIQ_BRUAB (Q57BC2), THIQ_BRUME (Q8YJ04), THIQ_BRUSU (Q8FYU9), THIQ_CERS4 (Q3IY12), THIQ_CHESB (Q11D92), THIQ_ECO57 (Q8XA06), THIQ_ECOL5 (Q0TLS2), THIQ_ECOL6 (Q8FL82), THIQ_ECOLI (P31548), THIQ_ECOUT (Q1RGD0), THIQ_HAEDU (Q7VP69), THIQ_HAEI8 (Q4QLQ1), THIQ_HAEIN (P44986), THIQ_HISS1 (Q0I354), THIQ_JANSC (Q28VL7), THIQ_MANSM (Q65SC9), THIQ_PASMU (Q9CNP9), THIQ_PECAS (Q6D0F3), THIQ_PHOLL (Q7N8V0), THIQ_PHOPR (Q6LV32), THIQ_RHILO (Q98FA5), THIQ_RHIME (Q92L31), THIQ_RUEST (Q1GCR8), THIQ_SALCH (Q57TF5), THIQ_SALPA (Q5PDF8), THIQ_SALTI (Q8Z9I6), THIQ_SALTY (Q8ZRV2), THIQ_SHIBS (Q326G9), THIQ_SHIDS (Q32K28), THIQ_SHIF8 (Q0T8D1), THIQ_SHIFL (Q83MG3), THIQ_SHISS (Q3Z5U5), THIQ_SODGM (Q2NVW9), THIQ_VIBCH (Q9KP42), THIQ_VIBPA (Q87SV4), THIQ_VIBVU (Q8DE95), THIQ_VIBVY (Q7MPC5), THIQ_YERPA (Q1C1Y5), THIQ_YERPE (Q0WJE4), THIQ_YERPN (Q1CMQ3), THIQ_YERPS (Q66EN1)» more
|