PROSITE entry PS51288

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	THIQ
Accession [info]	PS51288
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-JAN-2007 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51237

Name and characterization of the entry

Description [info]

Thiamine import ATP-binding protein thiQ family profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=205;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=200;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7535055; R2=0.0104004; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=961237; N_SCORE=9999.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=8485; N_SCORE=90.0; MODE=1; TEXT='?';
/CUT_OFF: LEVEL=-2; SCORE=457; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='??';
/DEFAULT: M0=-16; D=-80; I=-80; B1=-500; E1=-500; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;

...

                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-255; BD=-255;
/M: SY='L';  M=-29,-34,-10, -2,  8,-46,  8, 11,-14, 57,  2,-36,-41,-27,-31,-35,-25,  5,-35,-16;
/M: SY='D';  M=-10,-38, 53, 33,-37,-28,-19,-18,  1, -3,-26, 19,-29, 19,-20, 11, -4,-29,-48,-30;
/M: SY='D';  M=-25,-39, 48, -9,-42, 17,-16,-41, 26,-26,-31, 48,-32, 23, 14,-15,-20,-40,-47,-31;
/M: SY='V';  M= -8,-31,-42,-38,-15,-44,-40, 37,-36, 24, 11,-11,-40,-35,-38,-28, -2, 55,-44,-22;
/M: SY='R';  M=-11,-36,  3,  0, -5,-35,  9,  3,  1,-10,-19,-18,-31, 16, 36, -4, 34, -3,-38, -2;
/M: SY='W';  M=-15,-37,-43,-39, 55,-41,-27, 24,-35,  9,-10,-36,-42,-35,-35,-14, -3,  4, 66, 53;
/M: SY='R';  M=-22,-37, 19, -6,-10,-29, 13,-30, -9, -3, -7, 13,-34,-13, 46, 31, -4,-29,-36, 17;
/M: SY='Y';  M=-32,-43, -6,-25, 20,-37, -6,-22, -3, -6,-15, -6, -6, 23,-20,-26,-26,-26, -2, 91;
/M: SY='G';  M=-21,-43,  0, 32,-39, 46, 33,-46,  5,-41,-32,  4, 22, 15, -8,-17,-26,-43,-38, -1;
/M: SY='H';  M=-19,-35, 21, 14,-37,-10, 61,-37,-15,-35,-27,  7,-27, 25, -5, 22, 39,-32,-50,-21;
/M: SY='W';  M=-15,-36,  6, -1, 42,-39,-27,  0,-27, 26, 31,-28,-36, 18,-29,-25, 12,-15, 44, -9;
/M: SY='P';  M=  4, 25,-27,-24,-32,-29,-29,-26,-22, -2, -3,  4, 64,-24, -4,  6, 31,-25, 21,-31;
/M: SY='M';  M=-28,-32,-48,-40, 48,-44,-25,  1,-36, 38, 82,-39,-41,-31,-33,-36,-25,  5,-26, -5;
/M: SY='H';  M=  2, 33,  7, 16,-38,-28, 54,-41, -8,-37,-28,  0,-31,-10, 43, 27, -4,-34,-48,-24;
/M: SY='F';  M=  0,-33,-46,-42, 90,-10,-31,-13,-39, 10,-13,-37,-45,-45,-38,-31,-28,-16,-10, 10;
/M: SY='D';  M=-26,-39, 79,  6,-42,-27, 21,-10,-19,-38,-35, 19,-29,-17,-26,  8, 10,-33,-59,-29;
/M: SY='L';  M= 13, 48,-44,-37,  0,-40,-34,  6,-38, 53,  0,-40,-44,-34,-38,-30,-23, 13,-37,-20;
/M: SY='H';  M=  9,-32,-18, -5,-33,-26, 52,-13,-17,-17,-21, 19,-28, 25,-10, 17, 45,-22,-47,-23;
/M: SY='I';  M=  2,-33,-46,-41, 20,-45,-44, 52,-39,  8, -4,-39,-40,-38,-40,-30,-18, 51,-37,-17;
/M: SY='P';  M= 19, 20, -5, 27,-43, -3,-26,-38, 13,-39,-30, -8, 54, 11,-20, -2,  2,-32,-42,-36;
/M: SY='A';  M= 42,-35, -9,-14,-40, -1,-25,-33, 31,-21,-25,-20, 20, 23, 17,-13,-20,-27,-38,-31;
/M: SY='G';  M= 19,-37,-26,-29,-45, 73,-30,-46, -7,-44,-34,-14,-30, 11,-30,  0,-26,-39,-37,-37;
/M: SY='E';  M= -5,-42, 30, 64,-47,-31,-16,-44, -6,-39,-32,-14,-24, 47,  5,  5,-21,-38,-43,-32;
/M: SY='R';  M=-25,-41,-33,-23,-26,-41,-28, 46, 17,-14,-12,-25,-35, 12, 51, -6,-21, 14,-39,-23;
/M: SY='V';  M= -1,-30,-41,-37,-19,-43,-45, 36,-35, -5, -7,-34,-37,-36,-38,-22, 24, 63,-48,-25;
/M: SY='A';  M= 75,-24,-30,-23,-39,-12,-32,-28,-25,-30,-24,-25,-29,-22,-30,  4,-14,-15,-39,-34;
/M: SY='I';  M=-25,-35,-48,-43,-11,-51,-43, 59,-41, 35,  2,-42,-41,-38,-42,-35,-20, 42,-39,-20;
/M: SY='M';  M= -9,-34,-47,-40,-12,-45,-35, 50,-37, 29, 61,-39,-38,-32,-37,-33,-21, 31,-38,-19;
/M: SY='G';  M=-12,-40,-27,-39,-46, 87,-34,-54,-33,-49,-38,-13,-31,-30,-40,-12,-31,-47,-37,-41;
/M: SY='P';  M= 24,-44,-23, 22,-46,-27,-30,-36,-22,-42,-31,-31, 92,-21,-32,-19,-20,-34,-42,-42;
/M: SY='S';  M= -4,-27,-19,-20,-37,-12,-22,-37,-20,-40,-34, -7,-27,-11,-24, 83,  2,-29,-45,-29;
/M: SY='G';  M=-12,-40,-27,-39,-46, 87,-34,-54,-33,-49,-38,-13,-31,-30,-40,-12,-31,-47,-37,-41;
/M: SY='A';  M= 62,-26,-27,-23,-39,  4,-29,-31,-24,-34,-27,-19,-29,-19,-29, 41, -8,-20,-40,-33;
/M: SY='G';  M=-12,-40,-27,-39,-46, 87,-34,-54,-33,-49,-38,-13,-31,-30,-40,-12,-31,-47,-37,-41;
/M: SY='K';  M=-26,-40,-18, -4,-42,-33,-21,-42, 86,-41,-29,-11,-26, -2, 13,-20,-20,-38,-35,-28;
/M: SY='S';  M= -4,-27,-19,-20,-37,-12,-22,-37,-20,-40,-34, -7,-27,-11,-24, 83,  2,-29,-45,-29;
/M: SY='T';  M=-15,-24,-20,-23,-31,-30,-31,-22,-20,-27,-23, -9,-22,-24,-29, 10, 88,-14,-51,-29;
/M: SY='L';  M=-31,-32,-48,-40, 17,-49,-31,  4,-41, 70,  8,-46,-47,-35,-38,-40,-26, -3,-32,-13;
/M: SY='L';  M=-30,-32,-48,-40, 14,-49,-31,  4,-41, 70,  8,-46,-47,-34,-38,-40,-26, -3,-32,-14;
/M: SY='N';  M=  7,-30, -6,  0,-38,  2,-12,-35,-15,-39,  7, 79,-32,-13,-22, 24,-10,-34,-51,-33;
/M: SY='L';  M=  3,-31,-43,-36, -8,-42,-31, 12,-37, 59, 36,-39,-41,-31,-36,-31, -1, -3,-36,-18;
/M: SY='I';  M=-26,-37,-48,-45,-12,-51,-45, 71,-41, 21, 14,-40,-39,-38,-43,-36,-21, 36,-38,-20;
/M: SY='A';  M= 74,-24,-30,-23,-39,-12,-32,-29,-25,-31,-24,-24,-29,-21,-30,  9,-14,-16,-39,-34;
/M: SY='G';  M=-12,-40,-27,-39,-46, 87,-34,-54,-33,-49,-38,-13,-31,-30,-40,-12,-31,-47,-37,-41;
/M: SY='F';  M=-39,-34,-51,-47,102,-46,-31,-12,-42, -3,-14,-40,-49,-53,-39,-37,-30,-17, -3, 18;
/M: SY='E';  M=-11,-38, 10, 48,-24,-41,-25, 19,-20, 28,-11,-27,-31, 19,-25,-26,-23,  1,-40,-26;
/M: SY='W';  M= 12,-36,-27,  4, -4,-32,  3,-21, -6,  1, -1,-25, 37,  5,  4,-17, 27, -4, 45,-22;
/M: SY='P';  M=  9,-45,-32,-21,-40,-30,-34,-24,-27,-18,-26,-36, 98,-29,-37,-24,-20, -2,-42,-40;
/M: SY='D';  M= 22,-37, 47, 20,-42, -7, 29,-36, -3,-35,-29,-11,-28, 37,-19,-12, 10,-20,-47,-28;
/M: SY='S';  M= 11,-32, -6,  1, -3,-10,-21,-36, -7,-36,-29,-12,-28, 35,  0, 60, -8,-30,-39,-25;
/M: SY='G';  M=-12,-40,-27,-39,-46, 87,-34,-54,-33,-49,-38,-13,-31,-30,-40,-12,-31,-47,-37,-41;
/M: SY='Q';  M=-20,-40, 13, 42,-40,-15,  8,-13, -7,-29,-27,-14,-27, 43, 28, 17,  7,-30,-43,-28;
/M: SY='I';  M=-25,-35,-48,-43,-10,-50,-41, 58,-40, 35, 28,-41,-40,-36,-41,-36,-21, 37,-39,-19;
/M: SY='W';  M=-13,-36, -5,-26,-18,-36,  5,-15,-10, 27,-13,-26,-36,-23, 21, -4, 28, -3, 83,-16;
/M: SY='W';  M=-29,-38,-50,-43, 11,-49,-40, 52,-40, 41, 24,-43,-42,-36,-40,-38,-25, 14, 67,-12;
/M: SY='N';  M= -2,-35, 42,-13,-40,  4, 23,-38,-14,-23,-30, 70,-34,  7,  1,-12,-17,-37,-53,-30;
/M: SY='G';  M=-14,-39, 11, -3,-46, 76,-28,-51,-27,-48,-38, 14,-30,-24,-35,  0,-26,-45,-40,-39;
/M: SY='E';  M=  1,-38, -9, 53,-36,-17,-24,-17,  0,-25,-22,-23,-28, 29, 11,-20,-21, 30,-43,-30;
/M: SY='D';  M=-25,-38, 78,  9,-42,-24,-16,-39,-17,-17,-35, 38,-31,-16,-25, 14, -6,-37,-58,-32;
/M: SY='H';  M=-27,-37,-31,-28,-15,-41, 84,  9,-29, 19, 34,-23,-38, -1,-26,-28,-24, 25,-42, 18;
/M: SY='T';  M=  9,-27,-23,-26,-28,  3,-29,-20,-22,  2,-19,  9,-27,-24,-16,  5, 67, -7,-46,-28;
/M: SY='T';  M= 17,-35,-25,-11,  4,  1, 18,-30,  6,-21,-23,-19, 22,  2, 16,  3, 25,-26,-33, 13;
/M: SY='T';  M=  5,-29,-27,-24,-23,-31, 17,-16,-10, 26, -9,-19,-31, -1, -4, 17, 49,-15,-43,-23;
/M: SY='P';  M= 24,-40,  4, 17,-44,  9,-27,-38,-18,-40,-31,-22, 67,  2, -2,  7,-10,-33,-42,-37;
/M: SY='P';  M=-27,-50,-32,-21,-42,-33,-34,-24,-27,-26,-27,-37,105,-31,-39,-27,-21,  2,-43,-42;
/M: SY='A';  M= 48,-30,-28,-26, -3, 12, 28,-30,-26,-29,-24,-20,-32,-21,-28, 26,-16,-23,-27, 39;
/M: SY='Q';  M= -1,-42, 35, 42,-46,-31,-15,-43, 11,-38,-30,  3,-28, 56, 29,-16,-23,-38,-43,-30;
/M: SY='R';  M=-30,-46,-26,-14,-39,-40,-15,-46, 13,-38,-27,-19,-38, -3, 95,-24,-29,-39,-39,-25;
/M: SY='P';  M=-29,-55,-29,-17,-49,-31,-32,-37,-24,-47,-33,-35,110,  0,-36,-26,-22,-42,-42,-45;
/M: SY='V';  M=-18,-30,-47,-41, 20,-47,-45, 23,-38, 10, -4,-42,-43,-41,-39,-31,-16, 71,-42,-18;
/M: SY='S';  M=  6,-27,-19,-20,-37,-13,-23,-35,-20,-39,-33, -8,-26,-12,-25, 79, 13,-27,-45,-29;
/M: SY='M';  M=-23,-33,-43,-36,-14,-39,-23, 33,-31, 12,100,-31,-34,-24,-30, -9, -1, -1,-38,-16;
/M: SY='L';  M=-28,-33,-48,-41, -5,-50,-35, 29,-41, 63,  7,-45,-45,-35,-39,-39,-24, 17,-36,-17;
/M: SY='F';  M=-39,-34,-51,-47,102,-46,-31,-12,-42, -3,-14,-40,-49,-53,-39,-37,-30,-17, -3, 18;
/M: SY='Q';  M=-22,-48,-17,  3,-53,-30,-10,-39, -2,-34,-20,-13,-29,105, -3,-11,-25,-41,-35,-24;
/M: SY='E';  M=-25,-44, 52, 79,-48,-36,-16,-48, -7,-41,-38,-13,-21, -1,-17,-19,-23,-41,-48,-36;
/M: SY='N';  M=-25,-36, -6,-19,-38, 13, 77,-43,-15,-41,-27, 78,-34,  8,-19,-12,-18,-44,-57,-21;
/M: SY='N';  M=-25,-30,  2,-20,-40,-13, -6,-39,-11,-47,-33,100,-36,-13,-19, -7,-10,-42,-59,-35;
/M: SY='L';  M=-29,-32,-47,-40, -4,-49,-32,  6,-41, 70,  8,-46,-47,-34,-38,-40,-25, 10,-35,-17;
/M: SY='F';  M=-39,-34,-51,-47,102,-46,-31,-12,-42, -3,-14,-40,-49,-53,-39,-37,-30,-17, -3, 18;
/M: SY='P';  M= 38,-33,-27,-21,-38,-20,-30,-29,-24,-18,-26,-23, 64,-22,-31, 30, 16,-24,-42,-35;
/M: SY='H';  M=-32,-44,-16,-16,-31,-34,126,-49,-21,-31,-17, -6,-33,-10,-15,-22,-31,-49,-66,  0;
/M: SY='L';  M=-30,-32,-48,-40, -3,-49,-31,  5,-41, 72,  9,-47,-47,-34,-38,-40,-26, -2,-34,-16;
/M: SY='T';  M=-14,-26, 19,-19,-34,-26,-26,-27,-20,-31,-27,  4,-24,-21,-27, 33, 75,-19,-51,-29;
/M: SY='V';  M=-17,-30,-46,-40,-16,-48,-48, 31,-38,  6, -4,-41,-42,-40,-40,-30,-15, 74,-49,-24;
/M: SY='E';  M= 25,-38,-19, 39, 36,-19,-23,-33,-10,-28,-26,-24,-31, 15, 33,-19,-24,-28, 32,-15;
/M: SY='Q';  M=-23,-43, 35, 39,-48,-32,-14,-40, -7,-36,-27,-11,-26, 80,-10,-13, 11,-38,-42,-28;
/M: SY='N';  M=-25,-30,  2,-20,-40,-13, -6,-39,-11,-47,-33,100,-36,-13,-19, -7,-10,-42,-59,-35;
/M: SY='I';  M= -7,-35,-47,-43,-14,-48,-45, 65,-39, 14, 18,-39,-38,-37,-41,-32,-19, 43,-40,-21;
/M: SY='G';  M= 40,-34,  0,-29,-44, 68,-32,-43,-29,-41,-33,-16,-30,-26,-36, -9,-24,-33,-39,-38;
/M: SY='L';  M=-30,-33,-48,-40, 13,-49,-33, 21,-41, 67,  8,-46,-46,-35,-39,-40,-26, -1,-32,-14;
/M: SY='G';  M=  3,-39,-28,-38,-45, 85,-34,-52,-32,-48,-37,-14,-31,-30,-39,-12,-30,-44,-37,-40;
/M: SY='L';  M=-29,-36,-45,-38,-10,-49,-34, 45,-30, 50,  3,-40,-42,-30, 16,-36,-24, 13,-36,-19;
/M: SY='H';  M=-20,-36,  6,-15,-35,-25, 74,-35, 21,-35,-26, 29,-31,-11, 16, 35,-14,-12,-51,-19;
/M: SY='P';  M=-15,-53,-30,-18,-49,-30,-33,-36,-26,-47,-33,-36,110,-29,-38,-25,-22,-41,-42,-46;
/M: SY='G';  M=  7,-35,  9,-25,-42, 57,-23,-44,-20,-44,-34, 41,-31,-20,  0, 16, -5,-38,-44,-36;
/M: SY='L';  M=-30,-33,-46,-38, -5,-49,-30,  4,-36, 70,  8,-45,-47,-31, -6,-39,-26, -4,-34,-17;
/M: SY='K';  M=-27,-42,-21, -9,-40,-35, 24,-43, 65,-39,-27,-13,-30, -4, 61,-21,-11,-38,-38,-25;
/M: SY='L';  M=-30,-32,-48,-40, -3,-49,-31,  5,-41, 72,  9,-47,-47,-34,-38,-40,-26, -2,-34,-16;
/M: SY='N';  M= -5,-30,  6,-19,-37, -1,-17,-35,-13,-38,-30, 59,-30,-15, 16, 26, 41,-29,-50,-31;
/M: SY='A';  M= 49,-32, -3, 18,-40, -7,-27,-32, -6,-35,-28,-21, 29,-16, -7, 19,-15,-14,-41,-34;
/M: SY='E';  M= 29,-35, -2, 39,-38,  4,-23,-29, 10, -9,-24,-19,-27, 32,-17, -5,-10,-12,-40,-31;
/M: SY='Q';  M=-25,-45, 55, 41,-50,-30,-13,-44, -7,-39,-31,  9,-27, 72,-12,-15,-22,-42,-46,-30;
/M: SY='R';  M=-26,-45,-21,  8,-42,-36,-15,-21, 31,-35,-24,-17,-32, 59, 67,-20,-26,-35,-37,-26;
/M: SY='Q';  M= 14, -1,-15, 36,-42,-28,-19,-37, 28,-23,-25,-17,-27, 54, 17, -6, -3,-31,-39,-29;
/M: SY='Q';  M= 18,-37, -5,-10,-38,-29,-20,-33, 34,-14,-23,-16,-31, 45, 43,-14, 12,-28,-39,-27;
/M: SY='V';  M=-21,-33,-46,-40,-14,-48,-41, 43,-36, 20, 36,-40,-40,-35,-20,-33,-18, 57,-43,-21;
/M: SY='E';  M=  5,-38, 12, 44,-40,-30, 37,-34, 21,-34,-27,  3,-26, 31, -1, -4,  0, -9,-45,-27;
/M: SY='Q';  M=  9,-38, 28, 24,-41,-12,  7,-31, 14,-34,-27,  7,-29, 47,  6,  1,-19, -2,-44,-29;
/M: SY='A';  M= 57,-28,-36,-30,-27,-23,-38, 36,-30,-15,-14,-29,-32,-28,-34,-12,  2, 16,-40,-29;
/M: SY='A';  M= 57,-28,-37,-29,-23,-23,-34, 11,-31, 28, -9,-32,-35,-27,-34,-15,-18, -1,-37,-27;
/M: SY='A';  M= 35, 13,-10,  0,-40,  1, -4,-36, -1,-35,-28,-16,-30, 21, 30, 26,  2,-28,-42,-30;
/M: SY='Q';  M=  4,-43,-22, -6,-44,-31,-14,-40,  3,-35,-24,-16,-33, 73, 63, -3,-24,-36,-37,-26;
/M: SY='V';  M=-16,-29,-44,-38,-17,-44,-39, 14,-35, -1, 53,-37,-39,-35,-36,-27,  8, 69,-48,-22;
/M: SY='G';  M=-12,-39,-27,-39,-46, 86,-34,-53,-32,-49,-38,-13,-31,-30,-40, -5,-30,-47,-37,-41;
/M: SY='L';  M=-28,-34,-48,-41, -7,-50,-37, 41,-41, 58,  6,-44,-44,-35,-40,-38,-24, 21,-36,-18;
/M: SY='A';  M= 34,-35, 28, 31,-43, 25,-23,-39,-17,-38,-31,  2,-27, 22,-24, -2,  3,-30,-43,-34;
/M: SY='G';  M= -8,-39, 38, 21,-45, 53,-22,-47, -6,-45,-37, 28,-29,-16,-11,  3,-22,-42,-45,-36;
/M: SY='F';  M=-31, 23,-41,-34, 45,-43,-22, -8, 10, 38, 35,-35,-43,-29,-25,-33,-26,-13,-18, 44;
/M: SY='L';  M=-26,-36,  2, 32,-16,  1,-25, -9,-27, 47, 41,-30,-35,-20,-30,-30,-25,-14,-38,-22;
/M: SY='D';  M=  5,-38, 41, 29,-40,-28,-19,-35, 28,-15,-28,  5, -9, 32,-12, -3,  5,-32,-44,-30;
/M: SY='R';  M=-13,-45,-26,-14,-39,-38,-16,-45, 12,-37,-27,-19,-38, 12, 91,-22,-28,-38,-39,-26;
/M: SY='L';  M=-29,-34,-37,-27,-11,-44,-28, -4, 30, 58,  1,-34,-41,-22,  6,-34,-25,-10,-35,-19;
/M: SY='P';  M= -8,-52,-30,-19,-48,-30,-33,-36,-26,-46,-33,-35,109,-29,-38,-25,-22,-40,-42,-46;
/M: SY='E';  M= 12,-37, 11, 40,-43, 32,-23,-42, -2,-40,-33,  2,  4,-12,  6,  7,  4,-34,-43,-35;
/M: SY='Q';  M= 15,-39,-12, 41,-44,-28,  8,-37, -7,-34,-25,-16,-26, 69,  5,  0, 12,-32,-40,-28;
/M: SY='L';  M=-30,-32,-48,-40, -4,-49,-32, 10,-41, 70,  8,-46,-47,-34,-38,-40,-26,  3,-34,-16;
/M: SY='S';  M= -4,-27,-19,-20,-37,-12,-22,-37,-20,-40,-34, -7,-27,-11,-24, 83,  2,-29,-45,-29;
/M: SY='G';  M=-12,-40,-27,-39,-46, 87,-34,-54,-33,-49,-38,-13,-31,-30,-40,-12,-31,-47,-37,-41;
/M: SY='G';  M=-12,-40,-27,-39,-46, 87,-34,-54,-33,-49,-38,-13,-31,-30,-40,-12,-31,-47,-37,-41;
/M: SY='Q';  M=-22,-47,-11, 41,-51,-32,-11,-40, -3,-35,-23,-14,-27, 95, -5,-13,-25,-40,-37,-26;
/M: SY='R';  M=-27,-45,-22, -8,-42,-36,-15,-43, 42,-38,-26,-16,-33, 47, 75,-20,-26,-39,-37,-26;
/M: SY='Q';  M=-19,-45,-18,  0,-50, -7,-12,-39, -5,-35,-22,-12,-29, 98, -6, 14,-22,-39,-36,-25;
/M: SY='R';  M=-30,-46,-26,-14,-39,-40,-15,-46, 13,-38,-27,-19,-38, -3, 95,-24,-29,-39,-39,-25;
/M: SY='V';  M= 27,-28,-41,-35,-21,-36,-44, 11,-34, -8, -9,-36,-38,-35,-37,-21, -5, 68,-48,-27;
/M: SY='A';  M= 75,-25,-31,-24,-39,  4,-33,-29,-26,-31,-25,-25,-29,-22,-31, -4,-16,-16,-39,-35;
/M: SY='L';  M=-30,-32,-48,-40, -4,-49,-32, 16,-41, 70,  9,-46,-47,-34,-38,-40,-26, -1,-34,-16;
/M: SY='A';  M= 76,-24,-31,-23,-39,-12,-32,-28,-26,-30,-24,-25,-29,-22,-30, -4,-15,-15,-39,-34;
/M: SY='R';  M=-30,-46,-26,-14,-39,-40,-15,-46, 13,-38,-27,-19,-38, -3, 95,-24,-29,-39,-39,-25;
/M: SY='C';  M= 21,111,-40,-37,-30,-33,-40,-18,-34,-22, 12,-30,-43,-37,-39,-20,  3, 20,-53,-36;
/M: SY='L';  M=-31,-32,-48,-40, 34,-49,-31,  3,-41, 67,  6,-46,-48,-36,-38,-40,-27, -4,-28,-10;
/M: SY='V';  M=-19,-30,-47,-40,-12,-48,-43, 20,-39, 35,  0,-43,-43,-38,-39,-32,-17, 65,-45,-22;
/M: SY='R';  M=-28,-47,-24, -9,-42,-38,-14,-44, 10,-37,-25,-18,-36, 53, 85,-21,-28,-40,-38,-25;
/M: SY='D';  M=-10,-44, 52, 32,-46, -8, 27,-44, -9,-40,-32,-11, 22, 41, 14, -7,-22,-41,-47,-29;
/M: SY='Q';  M=-26,-43,-18, -6,-43,-32,  9,-42, 54,-38,-26, 11,-31, 55, 50,-18,-23,-39,-38,-26;
/M: SY='P';  M=-29,-54, -1,-17,-49,-31,-32,-37,-25,-47,-34,-33,109,-29,-38,-26,-22,-42,-43,-46;
/M: SY='I';  M=-24,-36,-48,-44,-13,-51,-46, 68,-40, 15, 15,-40,-39,-38,-42,-35,-19, 45,-40,-20;
/M: SY='L';  M=-11,-34,-48,-39, -5,-44,-33,  1,-39, 64, 26,-45,-45,-32,-37,-38,-27, -6, 63,-14;
/M: SY='L';  M=-30,-32,-48,-40, -3,-49,-31,  5,-41, 72,  9,-47,-47,-34,-38,-40,-26, -2,-34,-16;
/M: SY='L';  M=-30,-32,-48,-40, -3,-49,-31,  5,-41, 72,  9,-47,-47,-34,-38,-40,-26, -2,-34,-16;
/M: SY='D';  M=-31,-44, 99,  6,-51,-27,-16,-49,-18,-48,-47,  2,-30,-17,-26,-19,-20,-46,-66,-33;
/M: SY='E';  M=-23,-44,  6, 89,-47,-39,-16,-48, -4,-40,-36,-20,-18,  3,-14,-20,-24,-40,-43,-37;
/M: SY='P';  M=-10,-53,-30,-18,-48,-30,-33,-36,-26,-46,-33,-36,109,-29,-38,-25,-22,-40,-42,-46;
/M: SY='F';  M=-39,-34,-51,-47,102,-46,-31,-12,-42, -3,-14,-40,-49,-53,-39,-37,-30,-17, -3, 18;
/M: SY='S';  M= 39,-26,-22,-21,-38,-12,-25,-34,-22,-37,-30,-12,-27,-14,-26, 69, -3,-24,-43,-31;
/M: SY='A';  M= 72,-24,-29,-22,-39,-12,-31,-29,-25,-31,-25,-23,-29,-21,-29, 21,-13,-16,-39,-34;
/M: SY='L';  M=-30,-32,-48,-40, -3,-49,-31,  5,-41, 72,  9,-47,-47,-34,-38,-40,-26, -2,-34,-16;
/M: SY='D';  M=-26,-43, 88, -1,-50, 31,-19,-50,-21,-48,-45, -1,-30,-20,-29,-17,-22,-46,-58,-35;
/M: SY='P';  M=-29,-55,-29,-17,-49,-31,-32,-37,-25,-47,-33,-35,110, -4,-36,-26,-22,-42,-42,-45;
/M: SY='A';  M= 54,-30, -8,-25,-33, 22,  5,  7,-11,-17,-20,-23,-31,-24,-30,-11,-16,  2,-40,-30;
/M: SY='L';  M=-30,-33,-46,-37, -5,-48,-29,  3,-34, 68, 25,-44,-46,-30, -3,-39,-26, -4,-34,-17;
/M: SY='R';  M=-30,-46,-25,-13,-39,-39,-16,-45, 29,-38,-27,-18,-37, -3, 91,-24,-28,-39,-38,-26;
/M: SY='Q';  M= 31,-36, 20, 16,-41,-24, 20,-34,  0,-34,-26, 25,-30, 43, 18,-12,-19,-16,-44,-28;
/M: SY='E';  M=-22,-44, 14, 83,-47,-10,-17,-47, -6,-40,-35,-18,-20, 20,-15,-19,-24,-40,-43,-36;
/M: SY='M';  M=-24,-32,-47,-36,-13,-39,-17,  2,-29, 17,114,-34,-34,-21,-28,-34,-23, -5,-37,-13;
/M: SY='L';  M=-28,-33,-42,-33, -8,-46,-30, 10,-32, 63,  5,-39,-43,  6, -8,-33, -3,  1,-35,-18;
/M: SY='D';  M= 29,-32, 42,  1,-39,-23, 10,-29,-10,-32,-27,-12,-28, 21,-23, 17, 26, -6,-48,-29;
/M: SY='L';  M=-30,-32,-43,-12, -5,-49,-30,  4,-38, 70,  8,-45,-45,-31,-36,-39,-26, -4,-34,-17;
/M: SY='V';  M=-19,-31,-47,-41,-14,-48,-45, 36,-39, 22, -2,-42,-42,-39,-40,-32,-17, 66,-45,-22;
/M: SY='S';  M= 16,-33, 16,  2,-33,-24,-22,-28, 26,  6,-22,  8,-30,  5,  5, 33,-14,-26,-42,-28;
/M: SY='Q';  M=-11,-40, 27, 38,-44,-14, 11,-41, 33,-38,-29,-12,-26, 43,  9, -6, 10,-36,-43,-29;
/M: SY='L';  M=-24,-33,-44,-39,  6,-44,-36, 38,-38, 50,  2,-39,-42,-33,-38,  1,-20, 24,-36,-17;
/M: SY='C';  M= 23,107,-33,-31,-34,-31, 53,-18,-27,-29,-25,-23,-41,-29, -4,-18, -2,-25,-54,-29;
/M: SY='R';  M= 19, 20, 25, 10,-41,-27,  2,-22,  4,-35,-27, -2,-32, 32, 43,  7,-20,-30,-43,-29;
/M: SY='E';  M=-22,-43, 13, 77,-47,-35,-15,-45, -5,-39,-33, -1,-21, 42,-13, -5,-11,-39,-43,-34;
/M: SY='R';  M=-23,-39,-17, 14,-41,-33,-17,-38, 27,-35,-26,  8,-29, 49, 52,-13, 31,-33,-41,-27;
/M: SY='Q';  M= -9,-41, -2,-12,-46, 48,-22,-45, 43,-42,-30,-12,-29, 51,  2,-14,-25,-41,-37,-31;
/M: SY='M';  M=-10,-33,-35,-32, -3,-38,-25, 20,-28, 37, 59, 14,-38,  4,-14,-27, -7,  6,-37,-18;
/M: SY='T';  M=-15,-24,-20,-24,-30,-31,-31,-21,-20,-26,-23,-10,-22,-25,-29,  2, 89,-13,-51,-29;
/M: SY='V';  M=-23,-31,-47,-40, -9,-48,-39, 19,-40, 51,  3,-44,-44,-37,-39,-35,-20, 51,-41,-20;
/M: SY='L';  M=-29,-33,-48,-41, -5,-50,-34, 29,-41, 66,  8,-45,-46,-34,-39,-40,-25,  7,-35,-17;
/M: SY='M';  M=-25,-33,-47,-38,  3,-41,-21, 24,-31, 18,106,-35,-35,-24,-30,-35,-23, -2,-35,-12;
/M: SY='V';  M=  6,-29,-45,-39,-18,-43,-47, 27,-37, -4, -6,-40,-40,-38,-39,-27,-14, 73,-49,-25;
/M: SY='T';  M=-11,-25,-20,-22,-32,-24,-28,-26,-20,-30,-26, -9,-23,-20,-27, 46, 75,-18,-49,-29;
/M: SY='H';  M=-32,-44,-16,-16,-31,-34,126,-49,-21,-31,-17, -6,-33,-10,-15,-22,-31,-49,-66,  0;
/M: SY='H';  M=-21,-38, 38, -8,-41,-23, 61,-41,-14,-38,-28, 35,-30, 50,-16, 28,  3,-38,-51,-22;
/M: SY='P';  M=-27,-41,-38,-29,  7,-39,-34, -7,-33, 30,-10,-40, 80,-34,-38,-32,-22, 18,-37,-25;
/M: SY='D';  M=-20,-39, 53, 44,-45,-26,-17,-44, -9,-42,-36,  7,-26, 20, 13, 34,-15,-38,-49,-32;
/M: SY='D';  M=-29,-44, 90, 39,-50,-29,-16,-49,-15,-46,-44, -2,-27,-12,-24,-19,-21,-45,-61,-34;
/M: SY='A';  M= 63,-26,-33,-26,-30,-18,-33,  0,-28,  2,-16,-27,-32,-24,-32,  6,-15,  8,-39,-30;
/M: SY='R';  M= 17,-38,-22, 24,-32,-33,-22, -1, 21,  2, -1,-22,-31, 29, 42,-19,-23,-21,-38,-26;
/M: SY='R';  M= 25,-38, -5,-16,-37, -2, 20,-37, 18,-18,-24,-18,-34,  7, 63,-17,-24,-31,-40,-26;
/M: SY='I';  M=-28,-37,-43,-37,  8,-47,-36, 57, -3, 40,  1,-36,-39,-31,-16,-17,-22,  5,-34,-17;
/M: SY='A';  M= 57, 24, -2,-25,  3, -6,-32,  7,-28,-23,  6,-24,-32,-25,-32,  8,-16,-13,-38,-26;
/M: SY='D';  M= -6,-38, 65, -5,-44,-25, 17,-40, -7,-41,-34, 18,  6, 20, -6, 17, 14,-36,-53,-30;
/M: SY='R';  M=-27,-44,-23,-12,-37,-35, 39,-39, 12,-17,-22,  0,-36, 41, 73, -5,-25,-37,-41,-22;
/M: SY='V';  M=-11, 12,-38,-35, 11,-38,-35, 20,-33,  8, 12,-30,-37,-32,-35, 12, 20, 46,-38,  3;
/M: SY='I';  M= 15,-32,-44,-38,-13,-41,-40, 44,-38, 36, -1,-39,-40,-34,-39,-29,-20, 37,-39,-22;
/M: SY='F';  M=-30,-34,-40,-16, 66,-45, 20, -4,-33, 28, -7,-35,-43,-34,-11,-32,-13, 20,-21, 14;
/M: SY='I';  M=-24,-34,-48,-43,  6,-50,-43, 53,-40, 33,  1,-42,-42,-38,-41,-35,-20, 46,-38,-18;
/M: SY='D';  M= 28, 12, 55, 34,-40,-27,  8,-30, -5,-33,-30,-13,-29,-15,-23, -6,-18,  2,-50,-32;
/M: SY='N';  M=-27,-40, 54, 25,-45,-26, 16,-44,  2,-42,-33, 54,-31, 32, 18,-15,-19,-42,-52,-30;
/M: SY='G';  M=-12,-40,-27,-36,-46, 86,-33,-53,-31,-48,-37,-13,-31, -5,-38,-12,-31,-47,-37,-40;
/M: SY='R';  M=-26,-42,-21,-10,-40,-35,  6,-41, 41,-37,-26, -3,-32, 39, 67,-17, 11,-36,-39,-25;
/M: SY='I';  M=  0,-35,-46,-42, -1,-46,-44, 65,-39, 10, 17,-38,-38,-37,-41,-31,-19, 39,-38,-20;
/I:         E1=0; IE=-255; DE=-255;

» more

Post-processing [info]

PROMOTED_BY

PS50893

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_06 which contains 572'619 sequence entries.

Total number of hits	44 in 44 different sequences
Number of true positive hits	44 in 44 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	V_Lesaux
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

44 sequences

THIQ_AGRFC  (Q8UBY6), THIQ_ALIF1  (Q5E882), THIQ_BRUA2  (Q2YLW6),

THIQ_BRUAB  (Q57BC2), THIQ_BRUME  (Q8YJ04), THIQ_BRUSU  (Q8FYU9), 
THIQ_CERS4  (Q3IY12), THIQ_CHESB  (Q11D92), THIQ_ECO57  (Q8XA06), 
THIQ_ECOL5  (Q0TLS2), THIQ_ECOL6  (Q8FL82), THIQ_ECOLI  (P31548), 
THIQ_ECOUT  (Q1RGD0), THIQ_HAEDU  (Q7VP69), THIQ_HAEI8  (Q4QLQ1), 
THIQ_HAEIN  (P44986), THIQ_HISS1  (Q0I354), THIQ_JANSC  (Q28VL7), 
THIQ_MANSM  (Q65SC9), THIQ_PASMU  (Q9CNP9), THIQ_PECAS  (Q6D0F3), 
THIQ_PHOLL  (Q7N8V0), THIQ_PHOPR  (Q6LV32), THIQ_RHILO  (Q98FA5), 
THIQ_RHIME  (Q92L31), THIQ_RUEST  (Q1GCR8), THIQ_SALCH  (Q57TF5), 
THIQ_SALPA  (Q5PDF8), THIQ_SALTI  (Q8Z9I6), THIQ_SALTY  (Q8ZRV2), 
THIQ_SHIBS  (Q326G9), THIQ_SHIDS  (Q32K28), THIQ_SHIF8  (Q0T8D1), 
THIQ_SHIFL  (Q83MG3), THIQ_SHISS  (Q3Z5U5), THIQ_SODGM  (Q2NVW9), 
THIQ_VIBCH  (Q9KP42), THIQ_VIBPA  (Q87SV4), THIQ_VIBVU  (Q8DE95), 
THIQ_VIBVY  (Q7MPC5), THIQ_YERPA  (Q1C1Y5), THIQ_YERPE  (Q0WJE4), 
THIQ_YERPN  (Q1CMQ3), THIQ_YERPS  (Q66EN1)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment