PROSITE entry PS51306

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	ASD1
Accession [info]	PS51306
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-APR-2007 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51306
Associated ProRule [info]	PRU00637

Name and characterization of the entry

Description [info]

ASD1 domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=90;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=85;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5554396; R2=0.0104833; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6714.1762695; R2=6.2038612; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=663; H_SCORE=10827; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=472; H_SCORE=9642; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-7; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-22,-32,-22,  8,-32,-22, 26,-30, 44, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 14,-20,  0,-22;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 12,-32,-20, -6,-28, 42,-28, -8,  0,-10, 20, 26, -8,-10,-22,-20,-10, 16;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-26, 20, 34,-26,-20, -6,-20,  2,-16,-16, -2, -8,  6, -6, -2, -8,-14,-32,-18, 20;
/M: SY='A';  M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='A';  M= 30, -6,-14,-12, -4,-22, -4,-16,-16,  2,-18,-12, -4,-10, -4, -8, 12,  2, -6,-24,-18, -4;
/M: SY='R';  M=-16, -6,-30, -6,  4,-24,-20, -4,-30, 38,-24,-10,  0,-16, 10, 53,-10,-10,-20,-20,-10,  4;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='R';  M=-14, -8,-30, -8,  0,-26, -1, -2,-30, 15,-22,-10,  0,-18, 14, 38, -6,-12,-24,-20,-14,  4;
/M: SY='A';  M= 38, -6,-14,-12,  4,-22, -4,-16,-14, -6,-12,-12, -8, -8, -4,-16,  8, -2, -6,-22,-20,  0;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='K';  M=-12, -2,-30, -2, 10,-30,-20, -4,-28, 37,-26, -8,  0,-12, 21, 34, -8,-10,-22,-20,-10, 14;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='R';  M=-18, -8,-30, -8,  2,-22,-20, -2,-30, 34,-22,-10,  0,-18, 10, 62,-10,-10,-20,-20,-10,  2;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='E';  M=-14, 23,-30, 35, 37,-36,-16,  2,-32,  6,-24,-20,  8, -6, 20, -2,  0,-10,-30,-32,-18, 29;
/M: SY='P';  M= -8,-16,-30,-14, -6,-20,-20,-16,-10,-10,-16, -2,-16, 49, -8,-16, -6,  2,-16,-28,-20,-10;
/M: SY='G';  M= -4, -3,-22, -9,-14, -3, 22,-12,-24,-16,-21,-16,  9,-20,-17,-14,  6, -6,-20,-21,-13,-14;
/M:         M= -6,-18,-26,-20,-16,-12, -7,-22, -1,-20,  0, -2,-14,  0,-16,-20, -8,  0, -4,-24,-14,-18;
/M: SY='P';  M= -4,-14,-32, -8, -4,-28,  0,-18,-24,-12,-30,-20,-10, 50,-10,-18,  2, -6,-26,-30,-28,-10;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='D';  M=  1, 13, 11, 16, -1,-23,-10,-10,-23, -8,-17,-17,  1,-14, -8,-14,  0, -6,-13,-29,-18, -4; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='H';  M=-10, -8,-18,-10, -6, -8,-18, 12,-10, -4, -1,  0, -4,-15, -2,  8, -5,  3, -8,-20,  0, -6; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='F';  M= -8,-16,-15,-17,-14, 19,-17, -6,  0,-16,  5,  0,-11,-19,-14,-12, -5, -2, -2, -5, 17,-14; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='R';  M= -6, -6,-22, -4,  2,-20,-12, -8,-20, 12,-21,-12, -2,  9,  2, 15,  2, -2,-16,-21,-13,  0; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='L';  M= -8,-14,-22,-10,  3, -8,-20,-12, -2,-12, 10,  0,-16,  7, -6,-12,-14, -8, -8,-20,-10, -3; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='W';  M= -8, -6,-20,-12,-12, 10,-10,-10,-12,-12,-14,-12,  2,-18,-12,-10, -3, -4,-14, 18,  4,-10; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='R';  M=-10,-12,-24,-10,  0,-16,-18, -6,-10,  1, -5, -2,-10,  6,  8,  9,-10, -8,-14,-18,-10,  2; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='P';  M=-10,  3,-28, 13, 15,-26,-14, -8,-21, -2,-22,-18, -4, 35,  0,-10, -4, -8,-24,-26,-20,  5; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
/M: SY='F';  M=-12,-14,-17,-16,-12,  8,-20,  8, -5, -6, -3,  0, -8,-20,-10,  5,-10, -8,  1,-14,  6,-12; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='R';  M=-10,  2,-22, -2, -4,-18,  7, -2,-24,  7,-20,-12, 12,-16,  0, 23, -2, -8,-20,-20,-14, -4; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='M';  M= -4,-12,-14,-18,-12, -4,-12, -2,  8, -8,  6, 31,-10,-14,  0, -8, -4, -2,  4,-20, -4, -6; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='R';  M=-10, -8,-24, -8, -4,-11, -1,  2,-17,  2,-14, -6, -4,-16,  8, 11, -6,-10,-17, -6,  6,  0; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='S';  M= -2,  3,-15,  5, -2,-16,-10,-10, -6,-10,-14,-10,  4,-10, -4,-12, 12,  4, -4,-28,-12, -4; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='P';  M=  0, -8,-20, -4,  0,-20, -8,-12,-16, -8,-24,-16, -4, 31, -4,-12, 12,  4,-16,-28,-20, -4; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='D';  M= -2, 11,-16, 17, 16,-21, -6, -4,-21, -2,-21,-18,  8, -6,  4, -6, 16,  4,-16,-29,-16, 10; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='A';  M= 16,-10,-10,-18,-12,  6,-10,-16, -6,-12, -4, -6, -8,-12,-14,-14,  4,  7,  0,-12, -4,-12; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='V';  M=  0, -4,-10, -8,-12, -8,-12,-12,  4,-10, -8, -4,  2,-18,-12,-10,  6,  4, 12,-28,-12,-12; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='P';  M= -6, -8,-27, -2,  8,-24,  2,-12,-22, -6,-22,-16, -8, 31, -4,-12, -4,-10,-24,-22,-22,  0; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='H';  M= -6, -4,-17, -2,  8,-12,-14, 12,-12, -8, -4, -4, -2,-12,  2, -6,  1, -3,-12,-24, -4,  4; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='S';  M=  2, -6,-10, -7, -6,  3, -6,-10,-12,-12,-16,-12,  2,-12, -7,-10, 20, 10, -6,-22, -6, -6; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='W';  M= -8,-17,-21,-17,-13,  6,-16, -7, -4,-14,  0, -4,-15,-19,-10,-12, -9, -5, -8, 21, 17,-12; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='E';  M=-10,  1,-24,  9, 11,-18,-16, -8,-13, -6, -6,-10, -6, 11, -2,-10, -8, -8,-16,-24,-14,  3; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='H';  M=  1, -6,-22, -6,  2,-22,-12, 15,-16, -4,-16, -6, -4,  9, 10, -6, -2, -8,-18,-20, -7,  4; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='T';  M=  0, -8,-12,-12,-14,-10, -1,-18, -6,-12, -8, -6, -6,-14,-14,-12,  6, 17,  4,-22,-12,-14; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='P';  M= -6,-10,-18, -8,  0,-12,-14, -6, -4, -6, -1,  0,-10, 11,  6, -6, -8, -6,-10,-14, -8,  2; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='P';  M=  3, -8,-16, -8, -2,-14, -8, -8,-12,  2,-12, -8, -6, 11, -2,  7, -2, -4,-10,-14,-12, -4; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='E';  M= -6,  2,-18,  4, 18,-19,-12,  0,-16, 14,-14, -6,  0, -4, 17,  8, -2, -6,-16,-14, -8, 18; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='K';  M=-10, -6,-25, -4,  4,-21,-16, -8,-22, 24,-21,-10, -4,  9,  4, 23, -8, -8,-18,-18,-12,  2; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='N';  M=-10, 12,-21,  6,  0,-18, -8, 21,-18, -4,-21,-12, 22,  5,  0, -4,  0, -6,-24,-28, -9, -2; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-7;
/M: SY='S';  M=  4,  2,-14,  2, 11,-20, -8,-10,-20, -6,-24,-18,  6, -8,  2, -8, 28, 19,-12,-36,-18,  7;
/M: SY='A';  M= 19,-14,-16,-16,-10,-18,-11,-20, -6,-12,-14,-10,-13,  7,-12,-18,  7,  2,  2,-28,-20,-12;
/M: SY='T';  M= -6, -2,-16, -2,-10,-10,-22,-18, -2,-14,  3, -4, -8,-18,-14,-14, -1, 15,  6,-30,-10,-12;
/M: SY='S';  M=  0, -3,-18, -5, -6,-18,-11,-12, -9,-10,-21,-14,  5,  5, -9,-12, 13,  6, -5,-36,-20, -9;
/M: SY='A';  M= 25, -6,-14,-10, -8,-22, 13,-16,-19,-12,-22,-16,  0,-12, -8,-16, 20,  4, -9,-28,-22, -8;
/M: SY='A';  M=  6, -8,-22,-10, -8,-14,  3, -8,-20,  1,-20,-12, -4,-16, -6, -5,  4, -4,-14,-14,  0, -8;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='P';  M= -8,-18,-32,-12, -2,-26,-22,-16,-10, -8,-20,-10,-18, 47,  0,-14, -8, -8,-14,-28,-22, -4;
/M: SY='H';  M=  4,  6,-20,  0,  2,-24, -8, 16,-20, -4,-22,-10, 14,-14, 12, -4, 11, -1,-20,-30,-11,  6;
/M: SY='A';  M= 19,-20,-16,-22,-16,-14,-16,-24,  4,-14, -6, -4,-20,  1,-18,-20, -2, -2, 14,-26,-18,-18;
/M: SY='S';  M= 10, -8,-20,-10, -8,-22,  7,-18,-20,-12,-22,-16, -4,  6,-10,-16, 12,  8,-14,-28,-22,-10;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='I';  M=-10,-26,-26,-32,-24, -4,-34,-24, 29,-15, 10, 12,-18,-22,-16, -7,-16, -8, 24,-22, -4,-24;
/M: SY='G';  M= -4,-10,-30,-10,-16,-28, 51,-16,-38, -9,-28,-18,  0,-20,-14, -1, -2,-18,-28,-20,-26,-16;
/M: SY='G';  M=  8,-12,-28,-12,-14,-28, 38,-20,-30,-16,-26,-18, -6,  5,-16,-20,  0,-14,-24,-22,-28,-16;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='R';  M=-16, -6,-30, -6,  4,-24,-20, -4,-30, 38,-24,-10,  0,-16, 10, 54,-10,-10,-20,-20,-10,  4;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='F';  M=-14,-30,-22,-36,-26, 34,-32,-22, 18,-30, 29, 12,-24,-28,-28,-22,-24,-10, 10, -9, 11,-26;
/M: SY='T';  M= -2, -4,-16,-10, -8,-14,-20,-20,-12,-10,-14,-12, -4, 11,-10,-12, 14, 37, -6,-30,-14,-10;
/M: SY='V';  M=  5,-14,-16,-18,-12, -9,-21,-20,  1, -4,  3,  1,-14,-18,-12, -8, -5,  6,  9,-24,-10,-12;
/M: SY='E';  M=  3,  4,-26,  8, 37,-30,-16, -2,-24,  6,-18,-14, -2, -4, 21, -2,  2, -8,-24,-26,-18, 29;
/M: SY='Q';  M=-10,  0,-30,  0, 18,-38,-20,  6,-22, 19,-22, -2,  0,-10, 49, 14, -2,-10,-28,-20,-10, 34;
/M: SY='K';  M=-12, -2,-30, -2,  8,-28,-20, -8,-30, 46,-28,-10,  0,-12, 10, 39,-10,-10,-20,-20,-10,  8;
/M: SY='K';  M= -8,-11,-22,-13, -6,-11,-24,-16, -7,  7,  5,  1,-11,-18, -6,  3,-11,  3, -4,-22, -6, -6;
/M: SY='H';  M=-14,-12,-26,-14, -6,-12,-22, 16,-10,  5,  0, 12, -8,-20,  2, 14,-16,-12,-10,-22,  0, -4;
/M: SY='S';  M=  6, -4, 16, -6, -6,-20, -6,-14,-22,-14,-28,-20,  4,-16, -6,-14, 30, 14,-10,-42,-22, -6;
/M: SY='Y';  M=-20,-22,-28,-24,-22, 41,-30, 11,  0,-14,  2,  0,-20,-30,-16,-12,-20,-10, -8, 26, 69,-22;
/M: SY='S';  M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='E';  M=-12, 19,-30, 31, 51,-32,-18,  0,-32,  8,-22,-22,  4, -2, 16, -2,  0,-10,-30,-32,-20, 34;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='M';  M=-10,-24,-22,-32,-22,  2,-26,-10, 26,-18, 26, 44,-22,-22, -8,-16,-22,-10, 14,-20,  0,-16;
/M: SY='B';  M=-14, 44,-24, 41,  8,-28, -4,  6,-28,  0,-30,-24, 43,-16,  0, -4,  6, -4,-30,-40,-20,  4;
/M: SY='E';  M=-12,  6,-30, 12, 37,-28,-20, 18,-30, 15,-22,-14,  2, -6, 16,  6, -4,-12,-28,-28,-10, 26;
/M: SY='V';  M= -2,-30,-12,-30,-28,  2,-30,-28, 28,-22, 18, 12,-30,-30,-28,-20,-14, -2, 42,-28, -8,-28;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Post-processing [info]

PROMOTED_BY

PS51307

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_06 which contains 572'619 sequence entries.

Total number of hits	10 in 10 different sequences
Number of true positive hits	10 in 10 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	ASD1
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

10 sequences

SHRM1_HUMAN (Q2M3G4), SHRM1_MOUSE (Q5SX79), SHRM1_XENLA (Q01613),

SHRM2_HUMAN (Q13796), SHRM2_MOUSE (A2ALU4), SHRM2_RAT   (Q7TP36), 
SHRM2_XENTR (Q09JY9), SHRM3_HUMAN (Q8TF72), SHRM3_MOUSE (Q9QXN0), 
SHRM3_XENLA (Q27IV2)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment