PROSITE entry PS51311
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | SCGB |
| Accession [info] | PS51311 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-APR-2007 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00338 |
| Associated ProRule [info] | PRU00643 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Secretoglobin (SCGB) family profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=70; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=65; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8306879; R2=0.0210770; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4038.7561035; R2=2.0973053; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=317; H_SCORE=4704; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=222; H_SCORE=4504; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='D'; M= -4, 9,-23, 13, 13,-28, 2, -6,-26, -4,-25,-18, 8,-11, 6, -7, 11, -3,-21,-32,-20, 9; /M: SY='I'; M= -6,-16,-25,-19,-21, -8, -4,-23, 8,-22, 0, 1,-12,-21,-20,-22, -9, -7, 8,-22,-10,-22; /M: SY='C'; M=-10,-15,109,-26,-28,-20,-28,-27,-29,-28,-21,-20,-14,-38,-28,-28, -8, -9,-12,-49,-29,-28; /M: SY='P'; M= -9, -6,-33, -1, 10,-29,-17,-10,-22, -1,-28,-18, -4, 45, 3, -9, -3, -7,-28,-30,-24, 4; /M: SY='A'; M= 15,-17,-19,-23,-16, -6, -7,-19, -2,-15, 1, -2,-12,-18,-14,-13, -4, -6, 0,-19,-11,-16; /M: SY='F'; M=-12,-29,-19,-34,-25, 30,-30,-21, 17,-27, 28, 14,-26,-29,-27,-20,-23, -8, 14,-12, 8,-25; /M: SY='Q'; M= -5, 0,-25, 2, 5,-19,-15, -5,-13, -1, -7, -2, -6,-15, 6, -5, -7, -9,-12,-21, -6, 5; /M: SY='D'; M=-12, 16,-27, 23, 19,-29,-13, 11,-30, 5,-25,-18, 11,-11, 11, 7, 4, -6,-26,-32,-13, 13; /M: SY='V'; M= -1,-12,-17,-11, -7, -6,-22,-18, 4, -9, -2, 0,-15,-20,-14,-13, -7, -4, 15,-26,-10,-10; /M: SY='I'; M= -6,-25,-20,-30,-24, 5,-31,-25, 26,-25, 17, 11,-20,-23,-21,-22,-12, 0, 23,-22, -2,-24; /M: SY='E'; M= -5, -1,-25, 1, 10,-16,-19, -4,-14, -1,-11, -8, -3,-12, 4, -3, -3, -5,-13,-24, -9, 6; /M: SY='T'; M= 3, -3,-19, -6, -6,-18, -5,-14,-16, -1,-11, -9, -1,-15, -6, -5, 3, 5,-10,-26,-14, -6; /M: SY='F'; M=-11,-22,-17,-29,-22, 33,-27,-21, 4,-24, 15, 3,-18,-25,-26,-17,-11, 7, 6,-11, 9,-22; /M: SY='L'; M= -6,-29,-22,-32,-22, 8,-31,-23, 25,-29, 36, 17,-25,-26,-20,-23,-24, -9, 14,-19, 0,-22; /M: SY='N'; M=-10, 0,-19,-11,-14, 6,-16, -6, 0,-14, 2, 4, 10,-24,-13,-10, -7, -2, -5,-25, -5,-13; /M: SY='G'; M= 0, 1,-25, 1, -5,-26, 23,-13,-27,-10,-26,-18, 5,-10, -9,-13, 8, -6,-21,-28,-23, -7; /M: SY='T'; M= -1, 4,-16, 0, -2,-20, -8,-12,-19, -5,-22,-15, 7, -6, -2, -7, 19, 23,-12,-33,-16, -2; /M: SY='P'; M= -7,-12,-26, -8, 8,-19,-24,-17, -6, -5,-12, -9,-15, 15, -6,-12, -6, -4, -3,-29,-18, -1; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='E'; M= -7, 2,-26, 9, 26,-24,-17, -1,-23, -2,-18,-16, -2, 7, 6, -7, 4, -3,-22,-32,-17, 15; /M: SY='E'; M= -8, 2,-25, 7, 24,-20,-16, -7,-17, -1, -8,-11, -3,-11, 4, -5, -2, -7,-16,-29,-15, 14; /M: SY='Y'; M=-18,-23,-27,-25,-21, 34,-30, 7, 3,-16, 10, 3,-22,-30,-16,-13,-22,-10, -5, 18, 59,-21; /M: SY='E'; M=-10, -1,-25, 3, 14,-22,-21, 2,-16, 12,-15, -5, -5,-13, 4, 4, -7, -9, -9,-27,-10, 8; /M: SY='E'; M= 1, -3,-23, -3, 12,-16,-10,-10,-19, 2,-11,-10, -3,-12, 0, -2, -3, -5,-15,-23,-14, 6; /M: SY='T'; M= -2,-10,-21,-10, 0,-10,-18, -6, -9, -9, -6, -6, -9, -8, 0,-10, 2, 3,-10,-19, 1, -1; /M: SY='L'; M= -7,-30,-17,-30,-23, 7,-30,-22, 23,-26, 38, 19,-30,-30,-22,-20,-24, -7, 21,-23, -3,-22; /M: SY='K'; M= 0, 0,-26, 0, 15,-29,-10, -7,-24, 16,-22,-11, -1, -9, 16, 6, 0, -5,-21,-23,-15, 16; /M: SY='K'; M= -9, -3,-29, -1, 16,-27,-20, -8,-22, 19,-20, -7, -5, 4, 12, 8, -7, -7,-20,-24,-14, 13; /M: SY='F'; M=-19,-26,-23,-31,-26, 54,-30, -5, 2,-21, 6, 1,-21,-30,-27,-16,-19, -9, 0, 15, 47,-26; /M: SY='N'; M= -8, 16,-22, 8, 0,-20,-13, -5,-12, 2,-20,-12, 22,-16, -1, -2, 4, 2,-13,-33,-15, -1; /M: SY='A'; M= 12, -3,-21, -2, 0,-20,-12,-15,-14, -8,-15,-13, -7, 5, -5,-15, 1, -2, -9,-25,-17, -3; /M: SY='D'; M= -8, 8,-26, 12, 0,-23,-11,-10,-19, -9,-16,-15, 4, 10, -7,-13, -2, -3,-19,-32,-19, -5; /M: SY='P'; M=-11, 2,-31, 10, 7,-28,-16, -4,-23, -6,-23,-17, -2, 30, -1,-12, -2, -5,-25,-32,-20, 1; /M: SY='E'; M= -1, -2,-24, 0, 9,-12,-17, -7,-14, -2,-12, -7, -7, -6, -2, -9, -4, -6,-12,-19, -4, 3; /M: SY='A'; M= 16,-14,-15,-20,-11,-11,-16,-19, 4,-13, 2, 4,-13,-15,-11,-17, 0, 4, 8,-23,-12,-11; /M: SY='R'; M= -6,-14,-21,-15, -5,-13,-23,-13, -4, 4, -2, 0,-13,-20, -3, 10, -9, -4, 3,-24,-10, -5; /M: SY='E'; M= 1, 9,-23, 9, 22,-25,-13, -5,-24, 8,-21,-16, 7, -8, 7, 2, 5, -1,-20,-29,-18, 14; /M: SY='A'; M= 35, -1,-12,-13, -8,-19, -2,-15,-12, -8,-13,-12, 2,-12, -8,-16, 11, 5, -5,-24,-19, -8; /M: SY='M'; M= 0,-12,-21,-16,-13,-14, -4,-15, -5, -3, -5, 6, -8,-18, -9, -7, -7, -6, -1,-23,-12,-11; /M: SY='E'; M= -2, -7,-21, -8, 1,-15,-15,-12,-10, -1, -3, 0, -8,-15, -3, -3, -5, 0, -6,-25,-12, -1; /M: SY='E'; M=-10, 3,-29, 4, 22,-30,-16, -3,-23, 19,-22,-10, 2, -9, 21, 10, -4,-10,-24,-24,-14, 21; /M: SY='L'; M=-10,-29,-19,-33,-26, 21,-31,-23, 22,-26, 26, 15,-26,-28,-26,-21,-21, -7, 20,-16, 4,-25; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 11,-31,-20, -9,-29, 47,-29, -9, 0,-10, 14, 29, -9,-10,-21,-20,-10, 12; /M: SY='R'; M=-11, 3,-28, 5, 14,-27,-18, -3,-24, 20,-23,-11, 4,-12, 14, 22, -2, -7,-21,-25,-13, 12; /M: SY='C'; M= -9,-22, 96,-30,-29,-15,-30,-29,-21,-29,-10,-14,-22,-38,-29,-28,-12, -9, -4,-45,-25,-29; /M: SY='F'; M= -9,-26,-18,-31,-26, 22,-30,-22, 18,-23, 10, 6,-21,-26,-26,-20,-12, -2, 21,-13, 9,-26; /M: SY='D'; M= -9, 25,-24, 35, 6,-26,-13, -7,-21, -7,-12,-16, 7,-15, -6,-13, -4, -8,-15,-34,-16, 0; /M: SY='E'; M= -5, 7,-22, 5, 11,-24,-15, -5,-23, 10,-22,-14, 8,-11, 9, 9, 6, 5,-18,-28,-14, 10; /M: SY='M'; M= -8, -9,-22,-14, -5,-13,-22, -7, 1, -7, 6, 11, -7,-18, 9, -5, -8, 1, -6,-23, -6, 2; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='S'; M= 1, -3,-19, -6, -4,-20, -6,-12,-16, -9,-20,-11, 1, 5, -2,-11, 14, 14,-13,-31,-18, -4; /M: SY='Q'; M=-13, 5,-28, 6, 7,-17,-18, 8,-17, -1,-13, -8, 4, -9, 9, -3, -7, -9,-22,-20, 1, 7; /M: SY='E'; M= -9, -1,-27, 2, 17,-23,-13, -9,-17, 3,-13,-10, -4,-11, 4, 0, -4, -7,-14,-26,-15, 10; /M: SY='T'; M= -8, 12,-21, 13, 5,-22,-15, -2,-23, -1,-21,-16, 8, -6, -2, -5, 9, 16,-16,-32,-12, 1; /M: SY='R'; M=-14, -9,-28, -9, 2,-20,-22, -5,-21, 24,-11, -4, -5,-18, 10, 37,-12,-10,-16,-20, -8, 4; /M: SY='E'; M= -5, -7,-23, -5, 12,-16,-21, 0, -7, -4, -5, -2, -8,-13, 1, -8, -4, -7, -6,-27,-10, 5; /M: SY='N'; M= -8, 12,-21, 4, 1,-17,-11, 5,-12, -5,-13, -8, 22,-19, 5, -4, 2, -3,-17,-32,-13, 3; /M: SY='I'; M= 0,-20,-20,-25,-21, -1,-26,-22, 22,-20, 11, 13,-18,-21,-18,-21,-13, -6, 20,-22, -5,-21; /M: SY='G'; M= 3,-16,-20,-20,-17, -6, 5,-20, -6,-18, -5, -2,-11,-19,-18,-18, -4, -4, -1,-20,-12,-17; /M: SY='K'; M= -2,-10,-20,-10, 0,-16,-20,-15, -8, 9, -8, -4,-10,-16, -4, 1, -4, -1, 1,-26,-11, -2; /M: SY='L'; M= -7,-23,-17,-28,-21, 9,-26,-17, 16,-21, 21, 20,-21,-24,-17,-17,-14, -1, 15,-21, -1,-19; /M: SY='L'; M= -8,-21,-20,-26,-16, 1,-27,-15, 18,-19, 25, 25,-21,-22,-12,-16,-17, -2, 11,-22, -3,-15; /M: SY='E'; M= -5, -3,-22, -2, 7,-12,-16, -4,-11, -6,-11, -8, -4,-15, -3, -9, -2, -3, -5,-24, -7, 2; /M: SY='K'; M= 0, -5,-23, -8, 3,-16,-18,-10,-18, 16,-16, -7, -5,-12, 4, 6, -4, -1,-13,-18, -5, 3; /M: SY='I'; M= -8,-30,-25,-38,-30, 0,-38,-30, 45,-28, 18, 18,-22,-22,-22,-28,-18, -8, 35,-22, -2,-30; /M: SY='Y'; M= -5,-19,-20,-22,-15, 14,-24, -8, 4,-16, 9, 4,-18,-24,-15,-15,-11, -2, 3, -7, 18,-16; /M: SY='B'; M= -4, 12,-21, 11, 3,-22, -7, -7,-20, -1,-17,-14, 11,-14, 0, -5, 5, 3,-17,-31,-16, 1; /M: SY='S'; M= 8, -1,-15, -2, 3,-19, -6, -9,-20, 0,-26,-17, 5,-11, 1, -5, 25, 11,-12,-31,-13, 2; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='P'; M= -7, -1,-23, 3, 6,-21,-13, -7,-15, 2,-18,-11, -3, 15, 4, -1, -1, -5,-16,-22,-14, 3; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='L'; M= -7, -8,-18, -6, -1, -6,-16,-11, -5, -6, 6, -1,-10,-14, -5, -6, -9, -3, -6,-10, -4, -3; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='C'; M=-11,-14,108,-22,-26,-22,-28,-28,-31,-28,-21,-21,-17,-38,-28,-28, -9,-10,-12,-49,-29,-27; /M: SY='B'; M= -7, 10,-22, 9, 3,-23, -7, -4,-19, 1,-19, -6, 9,-13, 4, -3, 6, 1,-17,-31,-15, 4; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 31 in 31 different sequences |
| Number of true positive hits | 31 in 31 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
31 sequences
ABP_MESAU (Q0PGP2), FEL1A_FELCA (P30438), FEL1B_FELCA (P30440), PSC1_RAT(P02782), PSC2_RAT(P02781), S2B20_MOUSE (Q9JI02), S2B24_MOUSE (Q7M747), SC2B2_HUMAN (Q4G0G5), SG1C1_HUMAN (Q8TD33), SG1C1_MOUSE (Q7M742), SG1C1_RAT (Q05702), SG1C2_HUMAN (P0DMR2), SG1D1_HUMAN (O95968), SG1D2_HUMAN (O95969), SG1D4_HUMAN (Q6XE38), SG1D_BOVIN (A0JNP2), SG2A1_HUMAN (O75556), SG2A1_RAT (Q9JHB9), SG2A2_HUMAN (Q13296), SG2A2_RAT (P02780), SG2B2_MOUSE (Q6UGQ3), UTER_BOVIN (Q2VPS3), UTER_HORSE (Q8MKG2), UTER_HUMAN (P11684), UTER_LEPCA (P06913), UTER_MACFU (Q9TS45), UTER_MESAU (Q8VD96), UTER_MOUSE (Q06318), UTER_NEOAS (Q65C83), UTER_RABIT (P02779), UTER_RAT(P17559)» more
|
| PDB [Detailed view] |
10 PDB
1CCD; 1PUO; 1UTG; 1UTR; 1ZKR; 2EJN; 2UTG; 5VYF; 7VF3; 7VG7 |