PROSITE entry PS51317
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | NDVA |
| Accession [info] | PS51317 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-MAY-2007 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51237 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Beta-(1-->2)glucan export ATP-binding/permease protein ndvA family profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=254; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=249; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7273581; R2=0.0091813; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1088874; N_SCORE=9999.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=9397; N_SCORE=88.0; MODE=1; TEXT='?'; /CUT_OFF: LEVEL=-2; SCORE=520; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='??'; /DEFAULT: M0=-9; D=-80; I=-80; B1=-500; E1=-500; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255; ... A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y /I: B1=0; BI=-255; BD=-255; /M: SY='V'; M= -2,-16,-33,-27, -4,-34,-36, 31,-25, 11, 8,-29,-29,-28,-26,-16, 0, 53,-38,-12; /M: SY='R'; M=-13,-32, 5, 43,-29,-27, -3,-34, 19,-26,-18, -6,-15, 13, 52, -9,-13,-26,-28,-17; /M: SY='F'; M=-26,-21,-38,-34, 81,-33,-18, 1,-29, 10, -1,-27,-36,-40,-26,-24,-17, -4, 10, 31; /M: SY='E'; M=-13,-25, 1, 42, -8,-31,-10, -2, -5, 28, 4,-18,-17, 2,-11,-15,-12, -5,-26,-13; /M: SY='D'; M=-18,-31, 78, 19,-38,-14, -3,-36, -5,-35,-34, 15,-17, -4,-13, -6, -7,-33,-53,-20; /M: SY='V'; M= -2,-16,-33,-27, -4,-34,-36, 31,-25, 11, 8,-29,-29,-28,-26,-16, 0, 53,-38,-12; /M: SY='G'; M= 5,-20,-10,-16,-29, 52,-15,-32,-13,-32,-23, 3,-16, -7,-19, 34, 1,-25,-28,-22; /M: SY='F'; M=-26,-21,-38,-34, 81,-33,-18, 1,-29, 10, -1,-27,-36,-40,-26,-24,-17, -4, 10, 31; /M: SY='E'; M= 0,-22, 9, 44,-29,-11, -6,-29, 2,-27,-22, 0, -9, 10, -6, 32, 3,-21,-31,-20; /M: SY='F'; M=-24,-26,-29,-28, 64,-30, 0, -2,-22, 4, 0,-24,-35,-23,-19,-20,-16, -8, 17, 64; /M: SY='D'; M= 32,-20, 51, 6,-31, -6,-11,-24, -9,-25,-20, 3,-17, -7,-15, 3, -4,-14,-37,-21; /M: SY='N'; M= -5,-22, 3,-15,-30, 50, -4,-33, -7,-35,-22, 51,-21, -7,-15, 4, -6,-31,-34,-25; /M: SY='K'; M= 0,-20, -5, 1,-26, -8, -8,-26, 37,-28,-18, 4,-13, 6, 11, 34, 5,-20,-27,-16; /M: SY='G'; M= -7,-30,-14,-12,-29, 49,-11,-37, 8,-30,-19, -3,-22, -2, 46, -5,-17,-30,-25,-20; /M: SY='P'; M=-12,-38,-10, 7,-38,-18, -7,-25, 1,-27,-13, -9, 69, 50, -3, -5,-10,-28,-25,-20; /M: SY='G'; M= 34,-19,-16,-18,-29, 52,-20,-27,-16,-26,-18, -6,-17,-13,-22, 5,-10,-16,-25,-25; /M: SY='I'; M= -8,-21,-35,-30, -1,-37,-36, 46,-27, 14, 11,-27,-26,-27,-29,-20, -4, 44,-31, -9; /M: SY='E'; M= 1,-21, 8, 42,-28,-10, -6,-29, 1,-27,-22, 0, -9, 9, -6, 34, 4,-21,-31,-20; /M: SY='D'; M= -7,-29, 52, 1,-35, 50,-12,-39,-12,-35,-29, 8,-18,-10,-20, -2,-13,-34,-35,-24; /M: SY='V'; M= -9,-17,-34,-27, 3,-35,-26, 25,-26, 36, 15,-31,-31,-24,-26,-21, -6, 38,-29, -7; /M: SY='S'; M= 9,-14, -6, -7,-24, 1, -9,-24, -7,-27,-21, 6,-14, 2,-11, 53, 15,-16,-32,-16; /M: SY='F'; M=-26,-21,-38,-34, 81,-33,-18, 1,-29, 10, -1,-27,-36,-40,-26,-24,-17, -4, 10, 31; /M: SY='E'; M= -6,-20, 8, 43,-25,-22,-10,-20, 2,-20,-16, -2, -7, 5, -8, 5, 36,-12,-34,-19; /M: SY='V'; M= 33,-14,-25,-18,-13,-14,-27, 15,-18, -1, 0,-20,-22,-18,-22, -2, -1, 35,-32,-16; /M: SY='Q'; M=-13,-26,-16, 1, -9,-25, -6, 1, -4, 29, 9,-13,-24, 50, -3,-10,-13, -5,-22, -7; /M: SY='P'; M= 32,-23,-17, -8,-30, -7,-20,-19,-13,-24,-15,-17, 69,-12,-21, 0, -5,-13,-27,-27; /M: SY='G'; M= 1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25, 0,-18,-17,-27, 1,-18,-34,-24,-28; /M: SY='Q'; M= -9,-35, -4, 16,-40,-17, 3,-26, 11,-21, -7, 0,-16, 74, 10, 2,-12,-28,-22,-11; /M: SY='T'; M= -2,-11, -7,-11,-17,-18,-18, -8, -7,-13,-10, 3, -9,-12,-16, 15, 59, 0,-38,-16; /M: SY='I'; M= -8,-21,-35,-30, -1,-37,-36, 46,-27, 14, 11,-27,-26,-27,-29,-20, -4, 44,-31, -9; /M: SY='A'; M= 53,-11,-18,-10,-26, 1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17, 9, -2, -2,-26,-21; /M: SY='I'; M=-16,-24,-35,-31, 5,-39,-27, 43,-29, 38, 18,-30,-29,-23,-29,-26,-11, 23,-22, -5; /M: SY='V'; M= -2,-16,-33,-27, -4,-34,-36, 31,-25, 11, 8,-29,-29,-28,-26,-16, 0, 53,-38,-12; /M: SY='G'; M= 1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25, 0,-18,-17,-27, 1,-18,-34,-24,-28; /M: SY='P'; M= 30,-24,-17, -7,-31, -8,-20,-19,-13,-25,-16,-18, 72,-13,-21, -1, -5,-14,-27,-27; /M: SY='T'; M= -2,-11, -7,-11,-17,-18,-18, -8, -7,-13,-10, 3, -9,-12,-16, 15, 59, 0,-38,-16; /M: SY='G'; M= 1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25, 0,-18,-17,-27, 1,-18,-34,-24,-28; /M: SY='A'; M= 53,-11,-18,-10,-26, 1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17, 9, -2, -2,-26,-21; /M: SY='G'; M= 1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25, 0,-18,-17,-27, 1,-18,-34,-24,-28; /M: SY='K'; M=-13,-27, -5, 9,-29,-20, -8,-29, 59,-28,-16, 2,-13, 11, 26, -7, -7,-25,-22,-15; /M: SY='T'; M= 4,-12, -6, -9,-21, -8,-13,-15, -7,-19,-15, 5,-11, -5,-13, 37, 43, -7,-35,-16; /M: SY='T'; M= -2,-11, -7,-11,-17,-18,-18, -8, -7,-13,-10, 3, -9,-12,-16, 15, 59, 0,-38,-16; /M: SY='L'; M= 30,-15,-26,-18, -4,-14,-19, 5,-20, 31, 9,-22,-25,-15,-21, -6, -7, 5,-23,-11; /M: SY='I'; M=-15,-28,-36,-35, 1,-41,-36, 58,-29, 18, 15,-26,-24,-26,-33,-24, -8, 31,-23, -7; /M: SY='N'; M= 31,-14, 2, -8,-26, 0, -3,-20, -4,-25,-15, 50,-20, -4,-11, 7, 1,-14,-35,-22; /M: SY='L'; M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3; /M: SY='L'; M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3; /M: SY='H'; M=-14,-33, -4, 8,-28,-19, 76,-30, 3,-20, -6, 4,-18, 53, 5, -3,-15,-31,-34, 2; /M: SY='R'; M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12; /M: SY='V'; M= 33,-14,-25,-18,-13,-14,-27, 15,-18, -1, 0,-20,-22,-18,-22, -2, -1, 35,-32,-16; /M: SY='F'; M=-26,-21,-38,-34, 81,-33,-18, 1,-29, 10, -1,-27,-36,-40,-26,-24,-17, -4, 10, 31; /M: SY='D'; M= -2,-21, 53, 8,-30, -6, -6,-29, -6,-31,-26, 11,-15, -1,-12, 34, 5,-23,-41,-18; /M: SY='P'; M=-16,-42,-17, -5,-36,-18,-20,-24,-13,-34,-20,-23, 98,-16,-25,-14, -9,-29,-29,-33; /M: SY='Q'; M= 1,-23, -5, 6,-31, -7, -3,-25, 2,-24,-14, 3,-15, 50, 0, 36, 4,-21,-27,-13; /M: SY='T'; M= 4,-12, -6, -9,-21, -8,-13,-15, -7,-19,-15, 5,-11, -5,-13, 37, 43, -7,-35,-16; /M: SY='G'; M= 1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25, 0,-18,-17,-27, 1,-18,-34,-24,-28; /M: SY='R'; M= -9,-24,-22,-12,-14,-30,-15, 9, 9, -4, -2,-16,-27, -4, 49,-13, -8, 28,-31,-12; /M: SY='I'; M= -8,-22,-35,-31, -1,-37,-36, 47,-27, 15, 11,-27,-26,-26,-30,-20, -4, 43,-30, -9; /M: SY='K'; M=-15,-23,-18, -6, -5,-27,-13, 1, 34, 30, 8,-13,-23, -3, 7,-16,-10, -3,-22, -9; /M: SY='I'; M=-15,-28,-36,-35, 1,-41,-36, 58,-29, 18, 15,-26,-24,-26,-33,-24, -8, 31,-23, -7; /M: SY='D'; M=-18,-31, 78, 19,-38,-14, -3,-36, -5,-35,-34, 15,-17, -4,-13, -6, -7,-33,-53,-20; /M: SY='G'; M= 1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25, 0,-18,-17,-27, 1,-18,-34,-24,-28; /M: SY='M'; M=-13,-24,-35,-29, 0,-33,-18, 43,-22, 20, 55,-23,-22,-16,-23,-22, -9, 22,-24, -3; /M: SY='D'; M=-18,-31, 78, 19,-38,-14, -3,-36, -5,-35,-34, 15,-17, -4,-13, -6, -7,-33,-53,-20; /M: SY='T'; M= -2,-13,-18,-18,-10,-25,-26, 15,-15, 0, -1, -9,-17,-19,-20, 2, 40, 33,-38,-14; /M: SY='R'; M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12; /M: SY='G'; M= -1,-18,-11,-17,-24, 47,-19,-21,-13,-23,-17, 2,-13,-14,-21, 8, 37,-13,-31,-21; /M: SY='V'; M= -9,-17,-34,-27, 3,-35,-26, 25,-26, 36, 15,-31,-31,-24,-26,-21, -6, 38,-29, -7; /M: SY='T'; M= -2,-11, -7,-11,-17,-18,-18, -8, -7,-13,-10, 3, -9,-12,-16, 15, 59, 0,-38,-16; /M: SY='M'; M=-14,-26,-22,-10,-12,-26, -3, -4, 11, 4, 50,-12,-23, 3, 50,-15,-13, -7,-25, -6; /M: SY='K'; M= -1,-20, -5, 2,-27, -9, -8,-27, 39,-28,-18, 4,-13, 6, 12, 32, 5,-20,-27,-16; /M: SY='G'; M= 5,-20,-10,-15,-28, 50,-14,-31,-13,-31,-23, 3,-16, -6,-18, 36, 2,-24,-28,-21; /M: SY='L'; M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3; /M: SY='R'; M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12; /M: SY='H'; M=-18,-32, -8, -2,-21,-24, 79,-35, 12,-21, -8, 1,-22, 6, 49,-10,-17,-31,-38, 3; /M: SY='N'; M= 0,-15, 6, -7,-25, 0, 0,-25, -2,-30,-20, 50,-18, 1, -9, 37, 10,-22,-39,-19; /M: SY='I'; M=-15,-28,-36,-35, 1,-41,-36, 58,-29, 18, 15,-26,-24,-26,-33,-24, -8, 31,-23, -7; /M: SY='G'; M= 36,-18,-16,-17,-29, 50,-20,-26,-16,-25,-17, -6,-17,-13,-22, 5, -9,-14,-25,-24; /M: SY='T'; M= -2,-13,-18,-18,-10,-25,-26, 15,-15, 0, -1, -9,-17,-19,-20, 2, 40, 33,-38,-14; /M: SY='V'; M= -2,-16,-33,-27, -4,-34,-36, 31,-25, 11, 8,-29,-29,-28,-26,-16, 0, 53,-38,-12; /M: SY='F'; M=-26,-21,-38,-34, 81,-33,-18, 1,-29, 10, -1,-27,-36,-40,-26,-24,-17, -4, 10, 31; /M: SY='Q'; M= -9,-35, -4, 16,-40,-17, 3,-26, 11,-21, -7, 0,-16, 74, 10, 2,-12,-28,-22,-11; /M: SY='D'; M=-14,-31, 59, 47,-36,-20, -3,-35, 2,-31,-28, 6,-11, 7, -7, -6, -9,-30,-41,-22; /M: SY='A'; M= 53,-11,-18,-10,-26, 1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17, 9, -2, -2,-26,-21; /M: SY='G'; M= -7,-23,-23,-26, -7, 48,-20, -3,-24, 26, 4,-13,-25,-19,-26,-11,-16, -7,-22,-14; /M: SY='L'; M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3; /M: SY='F'; M=-21,-20,-36,-30, 58,-35,-18, 11,-28, 37, 12,-30,-35,-29,-25,-26,-15, 4, -4, 17; /M: SY='N'; M=-12,-17, 15, -7,-27, 0, 7,-26, 2,-34,-20, 73,-23, 0, -6, 6, 3,-29,-46,-22; /M: SY='R'; M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12; /M: SY='S'; M= 9,-14, -6, -7,-24, 1, -9,-24, -7,-27,-21, 6,-14, 2,-11, 53, 15,-16,-32,-16; /M: SY='I'; M=-15,-28,-36,-35, 1,-41,-36, 58,-29, 18, 15,-26,-24,-26,-33,-24, -8, 31,-23, -7; /M: SY='E'; M= 31,-20, 5, 44,-30,-11,-10,-24, 0,-22,-17, -9,-10, 6, -8, 2, -6,-13,-28,-22; /M: SY='D'; M=-14,-31, 59, 47,-36,-20, -3,-35, 2,-31,-28, 6,-11, 7, -7, -6, -9,-30,-41,-22; /M: SY='N'; M=-12,-17, 15, -7,-27, 0, 7,-26, 2,-34,-20, 73,-23, 0, -6, 6, 3,-29,-46,-22; /M: SY='I'; M=-16,-24,-35,-31, 5,-39,-27, 43,-29, 38, 18,-30,-29,-23,-29,-26,-11, 23,-22, -5; /M: SY='R'; M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12; /M: SY='V'; M= -2,-16,-33,-27, -4,-34,-36, 31,-25, 11, 8,-29,-29,-28,-26,-16, 0, 53,-38,-12; /M: SY='G'; M= 1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25, 0,-18,-17,-27, 1,-18,-34,-24,-28; /M: SY='R'; M=-15,-30, -9, 4,-27,-23, -5,-31, 45,-26,-15, -2,-19, 10, 57, -9,-11,-25,-24,-14; /M: SY='P'; M= 32,-23,-17, -8,-30, -7,-20,-19,-13,-24,-15,-17, 69,-12,-21, 0, -5,-13,-27,-27; /M: SY='D'; M=-18,-31, 78, 19,-38,-14, -3,-36, -5,-35,-34, 15,-17, -4,-13, -6, -7,-33,-53,-20; /M: SY='A'; M= 53,-11,-18,-10,-26, 1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17, 9, -2, -2,-26,-21; /M: SY='T'; M= 4,-13, -6, -8,-21, -7,-13,-16, -7,-20,-15, 5,-11, -4,-13, 39, 41, -8,-35,-16; /M: SY='D'; M=-15,-23, 56, 8,-32, -6, 3,-31, -1,-34,-26, 54,-20, -2,-10, 1, -1,-31,-50,-21; /M: SY='V'; M= 33,-14,-25,-18,-13,-14,-27, 15,-18, -1, 0,-20,-22,-18,-22, -2, -1, 35,-32,-16; /M: SY='E'; M=-10,-31, 19, 65,-34,-26, -3,-35, 9,-27,-23, -7, -5, 16, -1, -7,-11,-27,-30,-24; /M: SY='I'; M=-16,-24,-35,-31, 5,-39,-27, 43,-29, 38, 18,-30,-29,-23,-29,-26,-11, 23,-22, -5; /M: SY='H'; M=-18,-32, -8, -2,-21,-24, 79,-35, 12,-21, -8, 1,-22, 6, 49,-10,-17,-31,-38, 3; /M: SY='A'; M= 32,-15,-25,-17, -5,-13,-19, 4,-19, 29, 8,-21,-24,-14,-21, -5, -7, 5,-23,-12; /M: SY='A'; M= 53,-11,-18,-10,-26, 1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17, 9, -2, -2,-26,-21; /M: SY='A'; M= 53,-11,-18,-10,-26, 1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17, 9, -2, -2,-26,-21; /M: SY='E'; M= -6,-23, 0, 39,-16,-30,-17, 11, -5, -3, -4,-17,-16, -1,-12,-11, -5, 31,-34,-17; /M: SY='R'; M= 32,-20,-16, -6,-26,-10,-10,-23, 10,-21,-12, -9,-20, 1, 47, 1, -8,-12,-26,-17; /M: SY='A'; M= 53,-11,-18,-10,-26, 1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17, 9, -2, -2,-26,-21; /M: SY='Q'; M= 34,-21,-11, 5,-32, -7, -7,-20, 0,-19, -9, -6,-16, 49, -2, 6, -6,-12,-24,-16; /M: SY='A'; M= 53,-11,-18,-10,-26, 1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17, 9, -2, -2,-26,-21; /M: SY='Q'; M=-13,-26,-16, 1, -9,-25, -6, 1, -4, 29, 9,-13,-24, 50, -3,-10,-13, -5,-22, -7; /M: SY='D'; M=-18,-31, 78, 19,-38,-14, -3,-36, -5,-35,-34, 15,-17, -4,-13, -6, -7,-33,-53,-20; /M: SY='F'; M=-26,-21,-38,-34, 81,-33,-18, 1,-29, 10, -1,-27,-36,-40,-26,-24,-17, -4, 10, 31; /M: SY='I'; M=-15,-28,-36,-35, 1,-41,-36, 58,-29, 18, 15,-26,-24,-26,-33,-24, -8, 31,-23, -7; /M: SY='D'; M=-17,-24, 50, 1, -7,-24,-10, 0,-15, 29, 3, -4,-25,-12,-19,-16,-10, -5,-34,-11; /M: SY='R'; M= 32,-20,-16, -6,-26,-10,-10,-23, 10,-21,-12, -9,-20, 1, 47, 1, -8,-12,-26,-17; /M: SY='N'; M=-12,-22, 6, 2,-28, -9, 0,-28, 41,-31,-18, 49,-18, 6, 14, 0, -2,-26,-32,-18; /M: SY='D'; M= -2,-21, 53, 8,-30, -6, -6,-29, -6,-31,-26, 11,-15, -1,-12, 34, 5,-23,-41,-18; /M: SY='G'; M= -7,-23,-23,-26, -7, 48,-20, -3,-24, 26, 4,-13,-25,-19,-26,-11,-16, -7,-22,-14; /M: SY='G'; M= 1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25, 0,-18,-17,-27, 1,-18,-34,-24,-28; /M: SY='Y'; M=-23,-27,-28,-28, 62,-30, 1, -3,-21, 3, 0,-24,-35,-22,-18,-20,-16, -8, 17, 66; /M: SY='D'; M=-18,-31, 78, 19,-38,-14, -3,-36, -5,-35,-34, 15,-17, -4,-13, -6, -7,-33,-53,-20; /M: SY='T'; M= -2,-11, -7,-11,-17,-18,-18, -8, -7,-13,-10, 3, -9,-12,-16, 15, 59, 0,-38,-16; /M: SY='N'; M= -7,-17, -4,-16,-13,-15,-10, 12,-10, -5, -3, 45,-26,-12,-16, -4, 1, 31,-42,-16; /M: SY='V'; M= 33,-14,-25,-18,-13,-14,-27, 15,-18, -1, 0,-20,-22,-18,-22, -2, -1, 35,-32,-16; /M: SY='G'; M= 1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25, 0,-18,-17,-27, 1,-18,-34,-24,-28; /M: SY='E'; M=-10,-31, 19, 65,-34,-26, -3,-35, 9,-27,-23, -7, -5, 16, -1, -7,-11,-27,-30,-24; /M: SY='R'; M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12; /M: SY='G'; M= 1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25, 0,-18,-17,-27, 1,-18,-34,-24,-28; /M: SY='G'; M= -7,-30,-14,-12,-29, 49,-11,-37, 8,-30,-19, -3,-22, -2, 46, -5,-17,-30,-25,-20; /M: SY='Q'; M=-10,-26,-16, 2,-17,-21, 0, -2, 0, 5, 51, -8,-18, 51, 0, -8,-11, -7,-23, -5; /M: SY='L'; M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3; /M: SY='S'; M= 9,-14, -6, -7,-24, 1, -9,-24, -7,-27,-21, 6,-14, 2,-11, 53, 15,-16,-32,-16; /M: SY='G'; M= 1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25, 0,-18,-17,-27, 1,-18,-34,-24,-28; /M: SY='G'; M= 1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25, 0,-18,-17,-27, 1,-18,-34,-24,-28; /M: SY='E'; M=-10,-31, 19, 65,-34,-26, -3,-35, 9,-27,-23, -7, -5, 16, -1, -7,-11,-27,-30,-24; /M: SY='R'; M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12; /M: SY='Q'; M= -9,-35, -4, 16,-40,-17, 3,-26, 11,-21, -7, 0,-16, 74, 10, 2,-12,-28,-22,-11; /M: SY='R'; M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12; /M: SY='I'; M=-16,-24,-35,-31, 5,-39,-27, 43,-29, 38, 18,-30,-29,-23,-29,-26,-11, 23,-22, -5; /M: SY='A'; M= 37,-12,-12, -8,-25, 1,-14,-19,-10,-22,-15, -3,-15, -4,-14, 36, 7, -8,-29,-19; /M: SY='I'; M=-15,-28,-36,-35, 1,-41,-36, 58,-29, 18, 15,-26,-24,-26,-33,-24, -8, 31,-23, -7; /M: SY='A'; M= 53,-11,-18,-10,-26, 1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17, 9, -2, -2,-26,-21; /M: SY='R'; M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12; /M: SY='A'; M= 53,-11,-18,-10,-26, 1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17, 9, -2, -2,-26,-21; /M: SY='V'; M= -9,-17,-34,-27, 3,-35,-26, 25,-26, 36, 15,-31,-31,-24,-26,-21, -6, 38,-29, -7; /M: SY='L'; M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3; /M: SY='K'; M=-13,-27, -5, 9,-29,-20, -8,-29, 59,-28,-16, 2,-13, 11, 26, -7, -7,-25,-22,-15; /M: SY='D'; M=-18,-31, 78, 19,-38,-14, -3,-36, -5,-35,-34, 15,-17, -4,-13, -6, -7,-33,-53,-20; /M: SY='P'; M= 32,-23,-17, -8,-30, -7,-20,-19,-13,-24,-15,-17, 69,-12,-21, 0, -5,-13,-27,-27; /M: SY='P'; M=-16,-42,-17, -5,-36,-18,-20,-24,-13,-34,-20,-23, 98,-16,-25,-14, -9,-29,-29,-33; /M: SY='I'; M=-15,-28,-36,-35, 1,-41,-36, 58,-29, 18, 15,-26,-24,-26,-33,-24, -8, 31,-23, -7; /M: SY='L'; M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3; /M: SY='I'; M= -8,-21,-35,-30, -1,-37,-36, 46,-27, 14, 11,-27,-26,-27,-29,-20, -4, 44,-31, -9; /M: SY='L'; M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3; /M: SY='D'; M=-18,-31, 78, 19,-38,-14, -3,-36, -5,-35,-34, 15,-17, -4,-13, -6, -7,-33,-53,-20; /M: SY='E'; M=-10,-31, 19, 65,-34,-26, -3,-35, 9,-27,-23, -7, -5, 16, -1, -7,-11,-27,-30,-24; /M: SY='A'; M= 53,-11,-18,-10,-26, 1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17, 9, -2, -2,-26,-21; /M: SY='T'; M= -2,-11, -7,-11,-17,-18,-18, -8, -7,-13,-10, 3, -9,-12,-16, 15, 59, 0,-38,-16; /M: SY='S'; M= 9,-14, -6, -7,-24, 1, -9,-24, -7,-27,-21, 6,-14, 2,-11, 53, 15,-16,-32,-16; /M: SY='A'; M= 53,-11,-18,-10,-26, 1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17, 9, -2, -2,-26,-21; /M: SY='L'; M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3; /M: SY='D'; M=-18,-31, 78, 19,-38,-14, -3,-36, -5,-35,-34, 15,-17, -4,-13, -6, -7,-33,-53,-20; /M: SY='V'; M= 33,-14,-25,-18,-13,-14,-27, 15,-18, -1, 0,-20,-22,-18,-22, -2, -1, 35,-32,-16; /M: SY='E'; M= -6,-23, 1, 42,-17,-30,-16, 9, -4, -5, -6,-16,-15, 1,-12,-11, -5, 28,-34,-17; /M: SY='T'; M= -2,-11, -7,-11,-17,-18,-18, -8, -7,-13,-10, 3, -9,-12,-16, 15, 59, 0,-38,-16; /M: SY='E'; M=-10,-31, 19, 65,-34,-26, -3,-35, 9,-27,-23, -7, -5, 16, -1, -7,-11,-27,-30,-24; /M: SY='D'; M= 30,-20, 54, 8,-32, -6,-10,-25, -8,-25,-21, 4,-17, -6,-15, 2, -5,-15,-38,-21; /M: SY='R'; M=-15,-30, -9, 4,-27,-23, -5,-31, 45,-26,-15, -2,-19, 10, 57, -9,-11,-25,-24,-14; /M: SY='V'; M= -2,-16,-33,-27, -4,-34,-36, 31,-25, 11, 8,-29,-29,-28,-26,-16, 0, 53,-38,-12; /M: SY='N'; M=-12,-22, 6, 2,-28, -9, 0,-28, 41,-31,-18, 49,-18, 6, 14, 0, -2,-26,-32,-18; /M: SY='E'; M=-13,-25, 1, 42, -8,-31,-10, -2, -5, 28, 4,-18,-17, 2,-11,-15,-12, -5,-26,-13; /M: SY='A'; M= 53,-11,-18,-10,-26, 1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17, 9, -2, -2,-26,-21; /M: SY='I'; M=-16,-24,-35,-31, 5,-39,-27, 43,-29, 38, 18,-30,-29,-23,-29,-26,-11, 23,-22, -5; /M: SY='D'; M=-18,-31, 78, 19,-38,-14, -3,-36, -5,-35,-34, 15,-17, -4,-13, -6, -7,-33,-53,-20; /M: SY='E'; M=-10,-31, 19, 65,-34,-26, -3,-35, 9,-27,-23, -7, -5, 16, -1, -7,-11,-27,-30,-24; /M: SY='L'; M= -9,-17,-34,-27, 4,-35,-26, 25,-26, 37, 16,-31,-32,-24,-26,-22, -7, 36,-28, -7; /M: SY='M'; M=-14,-26,-22,-10,-12,-26, -3, -4, 11, 4, 50,-12,-23, 3, 50,-15,-13, -7,-25, -6; /M: SY='R'; M=-15,-30, -9, 4,-27,-23, -5,-31, 45,-26,-15, -2,-19, 10, 57, -9,-11,-25,-24,-14; /M: SY='D'; M= -8,-29, 54, 3,-36, 48,-11,-38,-11,-35,-29, 8,-18,-10,-19, -2,-12,-34,-37,-24; /M: SY='R'; M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12; /M: SY='T'; M= -2,-11, -7,-11,-17,-18,-18, -8, -7,-13,-10, 3, -9,-12,-16, 15, 59, 0,-38,-16; /M: SY='T'; M= -2,-11, -7,-11,-17,-18,-18, -8, -7,-13,-10, 3, -9,-12,-16, 15, 59, 0,-38,-16; /M: SY='F'; M=-26,-21,-38,-34, 81,-33,-18, 1,-29, 10, -1,-27,-36,-40,-26,-24,-17, -4, 10, 31; /M: SY='I'; M= -8,-22,-35,-31, -1,-37,-36, 47,-27, 15, 11,-27,-26,-26,-30,-20, -4, 43,-30, -9; /M: SY='I'; M=-15,-28,-36,-35, 1,-41,-36, 58,-29, 18, 15,-26,-24,-26,-33,-24, -8, 31,-23, -7; /M: SY='A'; M= 53,-11,-18,-10,-26, 1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17, 9, -2, -2,-26,-21; /M: SY='H'; M=-19,-31, -3, -3,-18,-21,103,-36, -8,-18, -4, 7,-20, 3, -2, -9,-18,-36,-53, 13; /M: SY='R'; M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12; /M: SY='L'; M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3; /M: SY='T'; M= 4,-12, -6, -9,-21, -8,-13,-15, -7,-19,-15, 5,-11, -5,-13, 37, 43, -7,-35,-16; /M: SY='T'; M= -2,-11, -7,-11,-17,-18,-18, -8, -7,-13,-10, 3, -9,-12,-16, 15, 59, 0,-38,-16; /M: SY='I'; M= -8,-21,-35,-30, -1,-37,-36, 46,-27, 14, 11,-27,-26,-27,-29,-20, -4, 44,-31, -9; /M: SY='R'; M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12; /M: SY='H'; M=-19,-31, 56, 10,-27,-17, 76,-36, -6,-26,-17, 12,-18, -1, -8, -7,-12,-34,-53, -1; /M: SY='A'; M= 53,-11,-18,-10,-26, 1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17, 9, -2, -2,-26,-21; /M: SY='D'; M=-10,-20, 55, 7,-27,-16,-10,-21, -6,-23,-21, 10,-13, -8,-15, 5, 36,-14,-45,-18; /M: SY='R'; M=-17,-25,-23,-13, -4,-32,-10, 1, 6, 30, 8,-18,-30, -3, 46,-19,-14, -3,-23, -7; /M: SY='I'; M= -8,-21,-35,-30, -1,-37,-36, 46,-27, 14, 11,-27,-26,-27,-29,-20, -4, 44,-31, -9; /M: SY='V'; M= -9,-17,-34,-27, 3,-35,-26, 25,-26, 36, 15,-31,-31,-24,-26,-21, -6, 38,-29, -7; /M: SY='F'; M=-13,-19,-36,-30, 58,-34,-25, 18,-27, 10, 4,-28,-33,-33,-26,-20, -8, 33, -7, 16; /M: SY='F'; M=-17,-20,-36,-28, 56,-29,-10, 9,-22, 16, 54,-23,-27,-20,-19,-22,-13, 2, -5, 18; /M: SY='D'; M=-18,-31, 78, 19,-38,-14, -3,-36, -5,-35,-34, 15,-17, -4,-13, -6, -7,-33,-53,-20; /M: SY='N'; M=-12,-22, 6, 2,-28, -9, 0,-28, 41,-31,-18, 49,-18, 6, 14, 0, -2,-26,-32,-18; /M: SY='G'; M= 1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25, 0,-18,-17,-27, 1,-18,-34,-24,-28; /M: SY='R'; M=-15,-30, -9, 4,-27,-23, -5,-31, 45,-26,-15, -2,-19, 10, 57, -9,-11,-25,-24,-14; /M: SY='V'; M= -2,-16,-33,-27, -4,-34,-36, 31,-25, 11, 8,-29,-29,-28,-26,-16, 0, 53,-38,-12; /M: SY='I'; M= -8,-21,-35,-30, -1,-37,-36, 46,-27, 14, 11,-27,-26,-27,-29,-20, -4, 44,-31, -9; /M: SY='E'; M=-10,-31, 19, 65,-34,-26, -3,-35, 9,-27,-23, -7, -5, 16, -1, -7,-11,-27,-30,-24; /M: SY='M'; M= 0,-16,-18,-14,-10,-11, -6, 0,-11, 5, 52, -6,-17, -3,-13, 29, 4, -2,-28, -7; /M: SY='G'; M= 1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25, 0,-18,-17,-27, 1,-18,-34,-24,-28; /M: SY='G'; M= 0,-19,-11,-18,-25, 50,-19,-22,-13,-24,-17, 2,-14,-15,-21, 8, 35,-15,-30,-21; /M: SY='F'; M=-26,-21,-38,-34, 81,-33,-18, 1,-29, 10, -1,-27,-36,-40,-26,-24,-17, -4, 10, 31; /M: SY='D'; M= 32,-20, 51, 6,-31, -6,-11,-24, -9,-25,-20, 3,-17, -7,-15, 3, -4,-14,-37,-21; /M: SY='E'; M=-10,-31, 19, 65,-34,-26, -3,-35, 9,-27,-23, -7, -5, 16, -1, -7,-11,-27,-30,-24; /M: SY='L'; M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3; /M: SY='S'; M= 4,-15,-17,-15,-13,-13,-20, 11,-15, -5, -5, -7,-20,-10,-18, 32, 8, 30,-35,-14; /M: SY='L'; M= 30,-15,-26,-18, -4,-14,-19, 5,-20, 31, 9,-22,-25,-15,-21, -6, -7, 5,-23,-11; /M: SY='R'; M=-13,-34, -9, 8,-32,-22, 0,-29, 20,-23,-11, -3,-21, 52, 53, -5,-14,-27,-24,-12; /M: SY='N'; M=-15,-24, 4, -4,-26,-11, 3,-29, 16,-29,-17, 51,-24, 5, 48, -1, -5,-27,-35,-17; /M: SY='G'; M= 1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25, 0,-18,-17,-27, 1,-18,-34,-24,-28; /M: SY='R'; M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12; /M: SY='F'; M=-26,-21,-38,-34, 81,-33,-18, 1,-29, 10, -1,-27,-36,-40,-26,-24,-17, -4, 10, 31; /M: SY='A'; M= 53,-11,-18,-10,-26, 1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17, 9, -2, -2,-26,-21; /M: SY='E'; M= 1,-21, 8, 42,-28,-10, -6,-29, 1,-27,-22, 0, -9, 9, -6, 34, 4,-21,-31,-20; /M: SY='L'; M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3; /M: SY='L'; M= 30,-15,-26,-18, -4,-14,-19, 5,-20, 31, 9,-22,-25,-15,-21, -6, -7, 5,-23,-11; /M: SY='R'; M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12; /M: SY='A'; M= 53,-11,-18,-10,-26, 1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17, 9, -2, -2,-26,-21; /M: SY='G'; M= -4,-30, -9, -1,-36, 50, -8,-33, -3,-28,-16, 0,-17, 48, -5, 1,-15,-31,-23,-19; /M: SY='F'; M=-10,-24,-24,-29, 53, 49,-19,-16,-24, -8,-12,-11,-26,-27,-27, -9,-18,-17, -5, 10; /M: SY='M'; M=-14,-19,-34,-25, 5,-31,-11, 17,-22, 40, 56,-27,-27,-14,-19,-24,-11, 9,-22, -1; /M: SY='L'; M= -9,-17,-34,-27, 4,-35,-26, 25,-26, 37, 16,-31,-32,-24,-26,-22, -7, 36,-28, -7; /M: SY='N'; M=-11,-25, 7, 6,-33, -7, 5,-26, 6,-27,-13, 51,-20, 50, 2, 4, -3,-28,-33,-16; /M: SY='D'; M=-14,-31, 59, 47,-36,-20, -3,-35, 2,-31,-28, 6,-11, 7, -7, -6, -9,-30,-41,-22; /M: SY='E'; M=-10,-31, 19, 65,-34,-26, -3,-35, 9,-27,-23, -7, -5, 16, -1, -7,-11,-27,-30,-24; /M: SY='E'; M= 31,-20, 5, 44,-30,-11,-10,-24, 0,-22,-17, -9,-10, 6, -8, 2, -6,-13,-28,-22; /M: SY='R'; M= -9,-23,-22,-13,-13,-31,-16, 11, 7, -3, -1,-16,-27, -5, 46,-14, -7, 31,-32,-12; /M: SY='R'; M= 30,-21,-15, -5,-26,-11,-10,-23, 12,-21,-12, -9,-21, 2, 50, 0, -9,-13,-26,-16; /M: SY='R'; M= 30,-21,-15, -5,-26,-11,-10,-23, 12,-21,-12, -9,-21, 2, 50, 0, -9,-13,-26,-16; /M: SY='L'; M= -9,-17,-34,-27, 4,-35,-26, 25,-26, 37, 16,-31,-32,-24,-26,-22, -7, 36,-28, -7; /M: SY='S'; M= 36,-13,-11, -8,-25, 1,-14,-19, -9,-22,-16, -2,-15, -3,-14, 37, 7, -9,-29,-19; /M: SY='R'; M= -9,-21,-10, -5,-22,-23, -9,-19, 13,-19,-12, -1,-17, 1, 50, 3, 35,-12,-31,-14; /M: SY='S'; M= 36,-13,-11, -8,-25, 1,-14,-19, -9,-22,-16, -2,-15, -3,-14, 37, 7, -9,-29,-19; /M: SY='T'; M= -2,-14,-19,-18,-10,-26,-26, 17,-15, 1, 0,-10,-18,-19,-21, 1, 38, 35,-38,-13; /M: SY='D'; M=-13,-33, 53, 18,-39,-16, 0,-30, 4,-27,-18, 8,-17, 52, 0, -2,-10,-30,-34,-15; /M: SY='D'; M= -7,-29, 52, 1,-35, 50,-12,-39,-12,-35,-29, 8,-18,-10,-20, -2,-13,-34,-35,-24; /M: SY='E'; M= 31,-20, 5, 44,-30,-11,-10,-24, 0,-22,-17, -9,-10, 6, -8, 2, -6,-13,-28,-22; /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;» more |
Post-processing [info]
| PROMOTED_BY | PS50893 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 23 in 23 different sequences |
| Number of true positive hits | 23 in 23 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | V_Lesaux |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
23 sequences
NDVA_AGRFC (P0A2V0), NDVA_AGRVI (Q71ED1), NDVA_BARBA (P70864), NDVA_BARBK (A1USS5), NDVA_BARHE (Q6G2Z5), NDVA_BARQU (Q6FZF2), NDVA_BRADU (Q89UT8), NDVA_BRUA2 (Q2YQ73), NDVA_BRUAB (P0C529), NDVA_BRUME (Q8YH20), NDVA_BRUSU (Q8G0T8), NDVA_NITHX (Q1QH37), NDVA_NITWN (Q3SP57), NDVA_RHIEC (Q2K342), NDVA_RHIJ3 (Q1MAB5), NDVA_RHILO (Q983H5), NDVA_RHIME (P18767), NDVA_RHIRD (P0A2V1), NDVA_RHOP2 (Q2J0F4), NDVA_RHOP5 (Q07QX6), NDVA_RHOPA (Q6N1Y7), NDVA_RHOPB (Q20Z38), NDVA_RHOPS (Q13BH6)» more
|