PROSITE entry PS51353
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | ARSC |
| Accession [info] | PS51353 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2007 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51353 |
| Associated ProRule [info] | PRU01282 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | ArsC family profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=131; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=126; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5953034; R2=0.0124863; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=553; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=393; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-400; E1=-400; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='M'; M= -4, -3,-20, -8, -5,-14,-14, -5, -5, -4, -6, 13, -3,-13, 0, -6, -1, 2, -5,-27,-10, -3; /M: SY='I'; M= -5,-25,-20,-31,-25, 1,-30,-23, 28,-23, 16, 16,-21,-22,-19,-22,-14, -2, 25,-22, -2,-24; /M: SY='T'; M= -5, -5,-18,-10, -5,-13,-22,-15, -7, 0, -9, -5, -3,-14, -5, -2, 4, 18, -2,-26, -8, -6; /M: SY='I'; M=-10,-29,-23,-35,-27, 13,-34,-24, 31,-28, 25, 18,-23,-25,-23,-24,-21, -9, 21,-17, 3,-26; /M: SY='Y'; M=-19,-23,-28,-25,-22, 32,-30, 8, 1,-15, 3, 0,-21,-30,-15,-13,-21,-11, -7, 29, 62,-22; /M: SY='H'; M= -9, -7,-24, -8, -7,-17, 2, 24,-22,-13,-17, -7, 0,-19, -3,-10, -3, -9,-20,-22, -2, -7; /M: SY='N'; M= -9, 3,-23, -7,-12, -5,-17, -2, 2,-10,-10, -5, 14,-21, -7,-11, -1, -2, -7,-20, 5,-12; /M: SY='P'; M= -5,-13,-33, -8, 1,-27,-16,-17,-21, 1,-28,-17,-12, 50, -5, -8, -4, -6,-23,-28,-23, -5; /M: SY='N'; M= -3, 8,-21, 2, 1,-22, -7, -4,-23, 11,-25,-15, 16,-15, 2, 15, 8, 1,-19,-30,-16, 0; /M: SY='C'; M= -9,-19,116,-29,-29,-20,-29,-29,-30,-29,-20,-20,-19,-39,-29,-29, -9, -9,-10,-50,-30,-29; /M: SY='S'; M= 0, 9,-18, 12, 0,-24, 5,-10,-25, -9,-26,-20, 9,-12, -5,-11, 19, 9,-16,-34,-19, -3; /M: SY='T'; M= 0, 0,-15, -6, -4,-17,-15,-16,-17, 4,-19,-12, 2,-10, -4, -1, 16, 29, -7,-29,-12, -4; /M: SY='C'; M= -1,-14, 36,-19,-18,-15,-18,-21,-11,-20,-16,-10, -9,-25,-16,-20, 9, 3, 1,-40,-20,-17; /M: SY='R'; M=-16, -7,-29, -7, 3,-24,-20, -3,-29, 34,-23, -9, 0,-17, 11, 52, -9, -9,-19,-20,-10, 4; /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='K'; M= -7, 6,-27, 3, 11,-28,-15, -5,-26, 30,-27,-12, 8,-11, 11, 19, -3, -6,-21,-25,-13, 11; /M: SY='A'; M= 33, -9,-10,-18,-12,-16, -6,-20, -8,-11, -9, -8, -9,-12,-11,-17, 10, 12, 2,-23,-17,-11; /M: SY='R'; M=-11,-17,-23,-19, -9, -7,-25,-12, -3, 2, 9, 5,-15,-22, -6, 11,-17, -9, -2,-20, -5, -9; /M: SY='K'; M= 10, -3,-21, -6, 5,-24,-10, -9,-20, 11,-19,-11, -2,-11, 5, 5, 2, -2,-13,-23,-15, 4; /M: SY='W'; M=-15,-33,-36,-34,-24, 13,-24,-23, -3,-21, 4, -2,-32,-28,-18,-19,-32,-20,-12, 69, 19,-19; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-22, 13,-31,-21, 23,-29, 41, 19,-28,-28,-21,-21,-27,-10, 13,-18, 2,-22; /M: SY='E'; M=-11, 10,-28, 15, 23,-28,-17, -2,-26, 12,-21,-15, 5,-10, 12, 11, -2, -7,-23,-28,-15, 17; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='E'; M= 3, 11,-23, 11, 17,-27, -9, -2,-23, 2,-20,-15, 8, -9, 9, -5, 5, -4,-21,-29,-17, 13; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='H'; M= -5, 6,-23, 1, 2,-20,-12, 26,-22, 0,-20, -9, 14,-16, 6, 4, 1, -6,-21,-29, -4, 2; /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='G'; M= -5, 5,-28, 4, -5,-29, 30, -6,-33, -6,-28,-18, 11,-16, -4, -8, 2,-13,-28,-26,-22, -5; /M: SY='I'; M= -6,-24,-21,-28,-20, -3,-31,-22, 26,-21, 14, 11,-20,-22,-17,-21,-15, -7, 22,-23, -4,-21; /M: SY='E'; M= -1, 9,-25, 14, 22,-27,-13, -7,-25, 2,-22,-18, 2, 3, 6, -6, 4, -3,-22,-30,-19, 13; /M: SY='Y'; M=-14,-22,-28,-23,-18, 20,-27, -2, -1,-17, -3, -3,-19, -1,-18,-16,-16,-10, -7, 0, 26,-20; /M: SY='E'; M= -8, 6,-23, 6, 16,-24,-18, -2,-20, 4,-18,-12, 3, -9, 10, 2, 3, 4,-17,-29,-13, 12; /M: SY='F'; M= -7,-18,-20,-20, -8, 10,-27,-18, 7,-15, 4, 1,-17,-20,-17,-16,-11, -6, 9,-18, -1,-12; /M: SY='H'; M=-12,-17,-26,-20,-13, -9,-28, 9, 7, -9, -1, 6,-10,-21, -6, -1,-13,-10, 6,-24, 1,-13; /M: SY='D'; M=-14, 23,-28, 29, 17,-27,-13, 5,-27, 2,-21,-18, 16,-10, 4, 0, -1, -8,-26,-33,-15, 10; /M: SY='Y'; M=-16,-25,-27,-28,-24, 27,-32, -2, 14,-19, 11, 7,-21,-27,-17,-17,-21,-10, 3, 9, 44,-23; /M: SY='L'; M= -9,-20,-22,-21,-14, 0,-24,-15, 2, -6, 13, 6,-17,-24,-12, 1,-17, -7, 3,-19, -2,-13; /M: SY='K'; M= -5, 5,-25, 8, 17,-27,-17, -8,-24, 19,-22,-13, 2, -9, 8, 9, 0, -3,-17,-27,-15, 12; /M: SY='B'; M= -6, 15,-21, 15, 11,-24,-13, -1,-22, 0,-20,-15, 10,-11, 6, -5, 7, 6,-19,-31,-14, 8; /M: SY='P'; M= -5,-12,-32, -9, -5,-26, 1,-17,-22,-10,-26,-17, -9, 38,-10,-15, -3, -6,-24,-27,-25,-10; /M: SY='P'; M= -9,-25,-31,-22,-12,-11,-26,-21, 4,-19, 3, 0,-23, 30,-15,-21,-17,-10, -6,-24,-14,-17; /M: SY='S'; M= -1, 9,-16, 8, 2,-20,-10,-10,-20, -5,-22,-17, 8, -8, -2, -8, 18, 18,-13,-34,-16, 0; /M: SY='R'; M= -1, -8,-24, -9, 2,-20,-18,-10,-14, 10,-13, -7, -7,-11, 2, 12, -5, -6, -8,-23,-12, 1; /M: SY='E'; M= 0, 11,-24, 16, 22,-28,-12, -5,-25, 4,-21,-17, 4, -6, 8, -4, 4, -4,-20,-30,-18, 15; /M: SY='E'; M=-10, 2,-26, 6, 22,-20,-20, -1,-19, 2,-12, -8, -3,-10, 11, 0, -4, -5,-19,-23,-10, 16; /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-23, 10,-32,-22, 26,-29, 39, 19,-27,-28,-21,-22,-26, -9, 16,-19, 0,-23; /M: SY='K'; M= -6, -4,-25, -4, 4,-21,-18, -7,-15, 11,-12, -6, -3,-14, 7, 10, -5, -5,-12,-24,-10, 5; /M: SY='E'; M= -2, 3,-24, 3, 9,-23,-10, -2,-22, 4,-19,-12, 3,-12, 7, 2, 2, -3,-19,-25,-13, 8; /I: I=-4; MD=-21; /M: SY='W'; M=-10,-30,-27,-34,-25, 10,-28,-24, 16,-24, 17, 10,-27,-25,-20,-21,-25,-13, 7, 19, 7,-22; D=-4; /I: I=-4; MD=-21; /M: SY='L'; M= -6,-25,-16,-28,-20, 6,-28,-16, 19,-24, 27, 14,-23,-25,-18,-20,-20, -8, 13,-19, 1,-20; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='E'; M= 4, 2,-20, 2, 6,-24, -9, -6,-21, 6,-20,-12, 3,-11, 5, 3, 6, 0,-15,-26,-15, 5; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='R'; M= -7, -4,-19, -5, 0,-12,-15, -5, -9, 6, -3, 1, -4,-13, 4, 7, -8, -6, -9,-16, -5, 1; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='T'; M= 1,-10, -8,-14,-10, -4,-15,-12, 0,-12, 6, 4, -9,-14, -7,-11, 0, 9, 1,-20, -6, -9; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='G'; M= -4, 4,-27, 7, 10,-29, 14, -7,-31, -2,-24,-17, 4,-11, 2, -7, 1,-11,-26,-26,-20, 6; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='L'; M= -6,-12,-20,-14,-12, -4,-19,-13, 4,-16, 8, 4,-10,-21,-12,-14,-11, -6, 2,-24, -6,-13; /M: SY='G'; M= -2, -2,-26, 1, -2,-27, 21,-14,-30, -9,-27,-19, 1, -1, -8,-13, 6, -5,-24,-28,-24, -6; /M: SY='W'; M= -3,-24,-25,-26,-20, -2,-23,-24, 4,-18, -1, -2,-23, -9,-18,-18,-14, -5, 4, 8, -3,-19; /M: SY='R'; M=-13, 3,-29, 7, 17,-24,-17, -2,-28, 16,-21,-14, 1,-12, 9, 22, -5, -9,-23,-20,-12, 12; /M: SY='D'; M= -5, 11,-25, 15, 15,-26,-13, -6,-24, 5,-21,-16, 4, -7, 6, -2, 2, -2,-19,-28,-14, 10; /M: SY='L'; M= -7,-28,-21,-33,-24, 12,-29,-22, 23,-27, 29, 17,-25,-26,-21,-22,-22, -9, 16,-16, 2,-23; /M: SY='L'; M= -9,-28,-20,-33,-25, 17,-31,-22, 23,-25, 24, 17,-24,-26,-23,-20,-20, -7, 18,-16, 4,-24; /M: SY='N'; M= -9, 12,-22, 4, 0,-19, -8, 2,-23, 9,-25,-16, 26,-18, 3, 24, 8, 0,-22,-32,-16, 0; /M: SY='T'; M= -5, 0,-19, -4, 1,-18,-19,-11,-19, 10,-17,-10, 0,-11, 1, 9, 6, 18,-11,-26,-11, 1; /M: SY='R'; M= -7, -2,-25, -3, 2,-24, -9, -5,-27, 21,-25,-13, 5,-14, 5, 29, 1, -4,-19,-25,-14, 2; /M: SY='G'; M= 0, -1,-24, 1, 6,-26, 22,-12,-29, -9,-25,-19, 3,-12, -5,-12, 10, -5,-22,-28,-24, 1; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='T'; M= -1, 1,-20, -2, 1,-20,-16,-12,-16, 3,-15, -9, 0, -7, 1, 0, 5, 11,-10,-27,-13, 1; /M: SY='T'; M= 1,-10,-19,-12, -6,-13,-19,-16, -4, -9, -6, -5,-10, -4, -8,-11, 2, 8, -2,-26,-11, -8; /M: SY='Y'; M=-15,-24,-29,-27,-22, 33,-26, 0, -4,-15, -1, -4,-21,-28,-18,-13,-20,-12,-10, 37, 51,-21; /M: SY='R'; M= -9, -4,-28, -4, 6,-25,-18, -4,-26, 26,-22, -9, 0,-13, 12, 34, -5, -7,-19,-22,-11, 7; /M: SY='E'; M= -1, 7,-24, 8, 22,-27,-11, -5,-25, 9,-21,-15, 4, -8, 10, 1, 4, -3,-21,-28,-17, 16; /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-27,-18, 6,-28,-17, 17,-26, 40, 18,-25,-27,-16,-18,-25, -8, 8,-21, -1,-17; /M: SY='G'; M= -5, 9,-25, 8, -2,-25, 14, -6,-28, -5,-26,-18, 13,-10, -5, -8, 4, -6,-24,-28,-19, -4; /I: I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: SY='L'; M= -4,-18,-20,-18,-11, -3,-25,-17, 9,-19, 21, 8,-19,-21,-13,-16,-16, -7, 5,-23, -5,-12; D=-2; /I: I=-2; DM=-12; /M: SY='D'; M= -2, 16,-23, 19, 11,-29, -6, -5,-27, 5,-25,-18, 9, -9, 3, -3, 5, -4,-21,-30,-18, 7; D=-2; /I: I=-2; DM=-12; /M: M= -8, -4,-21, -4, -4, -9,-20,-11, -2, -6, -1, -2, -5,-17, -6, -5, -8, -5, -1,-22, -7, -6; D=-2; /I: I=-2; DM=-12; /M: SY='E'; M= -8, 7,-28, 12, 14,-27,-14, -5,-25, 8,-23,-16, 2, 7, 5, 1, -2, -7,-23,-27,-16, 8; D=-2; /I: I=-2; DM=-12; /M: SY='D'; M= 1, 12,-21, 13, 10,-25, -8, -5,-23, 0,-22,-17, 9,-10, 2, -6, 9, 2,-18,-31,-17, 6; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='L'; M= -6,-23,-20,-25,-17, 3,-25,-18, 13,-22, 26, 15,-22,-24,-15,-17,-19, -6, 8,-16, -2,-16; /M: SY='S'; M= -1, 8,-17, 7, 0,-21, -7,-10,-21, -7,-24,-18, 9, -6, -4,-10, 20, 19,-13,-35,-17, -2; /M: SY='D'; M= -9, 9,-26, 14, 12,-21,-17, -7,-17, -1,-11,-11, 0,-12, 1, -4, -5, -7,-15,-28,-13, 6; /M: SY='D'; M= -1, 16,-24, 19, 18,-29,-10, -3,-26, 2,-23,-18, 10, -7, 7, -5, 5, -4,-22,-31,-18, 13; /M: SY='E'; M= -5, 7,-26, 10, 26,-29,-14, -3,-24, 9,-21,-13, 2, -7, 17, 2, 2, -5,-22,-27,-16, 21; /M: SY='L'; M= 8,-22,-19,-26,-16, -3,-19,-20, 7,-18, 17, 6,-21,-22,-13,-17,-14, -7, 5,-11, -6,-14; /M: SY='I'; M= -6,-26,-23,-32,-23, 5,-31,-22, 26,-23, 22, 14,-22,-24,-18,-20,-19, -8, 18,-18, 1,-23; /M: SY='D'; M= -2, 13,-24, 16, 16,-29,-12, -4,-26, 6,-22,-16, 6, -9, 8, 0, 2, -4,-20,-29,-17, 12; /M: SY='L'; M= 9,-22,-18,-27,-17, 1,-21,-20, 10,-22, 22, 8,-21,-22,-16,-20,-14, -6, 7,-17, -5,-17; /M: SY='M'; M= -9,-26,-21,-32,-22, 4,-28,-14, 26,-21, 29, 35,-24,-24,-13,-18,-23, -9, 16,-20, 0,-18; /M: SY='A'; M= 7,-16,-16,-20,-12, -9,-18,-16, 5,-14, 5, 3,-14,-19, -9,-14, -4, -2, 7,-24,-10,-11; /M: SY='E'; M= 4, 6,-22, 7, 18,-26,-13, -5,-22, 5,-19,-14, 2, -8, 9, -3, 5, -2,-18,-28,-16, 14; /M: SY='H'; M=-14, 15,-26, 12, 5,-21,-14, 31,-24, -1,-22,-10, 20,-17, 8, 0, 0, -7,-25,-29, -1, 4; /M: SY='P'; M= -8,-17,-37,-10, -3,-29, -5,-19,-22,-12,-28,-19,-15, 65,-11,-19, -7,-10,-28,-28,-29,-11; /M: SY='M'; M= -1, -8,-22,-13, -7,-16,-14,-13, -5, 0,-10, 1, -4,-15, -3, -2, 0, 0, -3,-25,-11, -6; /M: SY='L'; M= -9,-29,-21,-31,-21, 8,-30,-20, 23,-28, 43, 22,-28,-28,-19,-20,-27,-10, 13,-20, 0,-21; /M: SY='I'; M= -9,-30,-25,-36,-27, 3,-35,-26, 38,-28, 27, 20,-24,-24,-20,-26,-22, -9, 25,-20, -1,-26; /M: SY='K'; M=-12, 5,-29, 4, 17,-28,-17, -2,-28, 30,-26,-12, 8,-11, 15, 25, -5, -9,-24,-24,-13, 15; /M: SY='R'; M=-19, -9,-29,-10, 0,-20,-19, 0,-29, 28,-20,-10, 1,-20, 9, 65, -8, -8,-19,-21,-10, 0; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='I'; M= -9,-30,-24,-36,-28, 9,-35,-27, 36,-28, 23, 17,-24,-25,-23,-25,-20, -8, 27,-19, 1,-28; /M: SY='V'; M= -4,-29,-18,-32,-26, 4,-31,-26, 29,-25, 23, 15,-27,-27,-24,-22,-18, -5, 30,-24, -4,-26; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='V'; M= -5,-21,-19,-24,-18, -1,-28,-21, 19,-18, 10, 9,-20,-22,-17,-17,-11, -1, 22,-24, -5,-19; /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='D'; M= -5, 12,-22, 15, 3,-24,-11, -4,-23, -1,-20,-15, 7,-11, -1, -4, 5, 4,-16,-30,-14, 0; /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='D'; M= -8, 13,-28, 17, 8,-30, 7, -6,-31, -3,-27,-21, 10, 1, -2, -8, 1, -9,-28,-31,-23, 2; /M: SY='K'; M=-10, 7,-28, 9, 4,-27, 1, -6,-28, 10,-23,-14, 6,-14, 1, 6, -4,-10,-23,-25,-15, 2; /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='R'; M= -9, -6,-26, -7, -2,-21, -4, -6,-24, 11,-20,-10, -1,-15, 1, 16, -5, -8,-17,-22,-12, -2; /M: SY='V'; M= 8,-20,-16,-25,-18, -3,-20,-19, 10,-18, 12, 7,-19,-21,-17,-18, -8, 0, 13,-22, -6,-18; /M: SY='M'; M= -5,-14,-21,-17, -8,-12,-22, -9, -1, -4, 2, 3,-12,-20, 1, 2, -8, -3, 1,-23, -7, -5; /M: SY='I'; M= -6,-28,-16,-32,-26, 3,-32,-26, 30,-26, 23, 14,-25,-27,-23,-23,-18, -5, 28,-24, -4,-26; /M: SY='G'; M= 1,-11,-10,-13,-20,-28, 53,-21,-37,-21,-28,-19, -3,-22,-20,-21, 0,-17,-26,-24,-29,-20; /M: SY='F'; M=-20,-21,-25,-25,-17, 32,-26, -5,-11, -4, -3, -4,-12,-26,-16, 16,-16,-10, -9, 2, 23,-17; /M: SY='P'; M= -9, 5,-29, 5, 3,-26,-13, -7,-23, 7,-29,-17, 9, 21, -1, 0, 0, -4,-25,-31,-20, -1; /M: SY='E'; M= -2, -3,-27, 3, 19,-26,-16,-11,-20, -3,-20,-16, -6, 19, 3,-10, 3, -3,-20,-30,-21, 9; /M: SY='E'; M= -5, 16,-27, 25, 34,-30,-14, -4,-28, 4,-22,-20, 4, -5, 10, -5, 3, -6,-24,-31,-19, 22; /M: SY='E'; M= -4, 5,-24, 6, 13,-23,-15, -5,-17, 2,-15,-11, 2,-12, 8, -2, 1, -3,-15,-27,-13, 10; /M: SY='Y'; M=-11,-27,-24,-30,-25, 11,-31,-16, 19,-20, 9, 7,-25,-27,-20,-19,-19, -9, 17, 5, 20,-24; /M: SY='R'; M= -7, -8,-25, -8, 4,-16,-20, -7,-12, 4, -2, -2, -7,-17, 4, 11, -9, -8,-11,-23,-10, 3; /M: SY='E'; M= 1, 3,-23, 5, 13,-25,-13, -7,-21, 6,-18,-12, 0,-10, 6, 2, 2, -3,-15,-27,-15, 9; /M: SY='F'; M= -9,-24,-22,-30,-22, 18,-28,-19, 14,-22, 16, 8,-19,-25,-20,-18,-18, -8, 9,-10, 7,-21; /I: I=-3; MD=-17; /M: SY='L'; M=-12,-28,-21,-31,-22, 22,-28,-21, 13,-27, 30, 11,-26,-28,-23,-19,-25,-10, 7, -5, 7,-22; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='P'; M= -3, -6,-28, -3, 2,-25,-10,-13,-20, -2,-20,-14, -6, 20, -4, -7, -3, -7,-20,-27,-20, -3; /M: SY='R'; M= -6, -4,-25, -4, 3,-21,-16, -5,-20, 11,-16,-10, -1,-11, 4, 21, -3, -5,-15,-25,-13, 1; /M: SY='E'; M= -2, -5,-25, -3, 4,-22,-12,-10,-18, 3,-20,-12, -4, 4, 0, -3, 2, -1,-14,-26,-15, 1; /M: SY='V'; M= -4,-14,-21,-15,-10,-10,-22,-10, 2, -8, -2, 2,-14,-17, -3, -8, -6, -3, 6,-21, -3, -7; /M: SY='R'; M=-12, -6,-28, -5, 3,-23,-15, 0,-24, 18,-19, -8, -1,-16, 9, 36, -6, -9,-18,-23,-11, 3; /M: SY='K'; M= -4, -2,-24, -3, 3,-24, -2, -7,-23, 6,-21,-12, 1,-12, 3, 6, 1, -3,-17,-25,-16, 2; /M: M= -1,-17,-22,-19,-10, 0,-21,-13, -3, -9, 0, -1,-15,-11, -9,-10,-10, -6, -2,-16, -1,-10; /M: SY='E'; M= -9, -6,-24, -7, 9, -1,-18, -7,-17, -2,-12, -9, -5,-12, -1, -4, -4, -5,-15,-18, -4, 4; /M: SY='L'; M= -6,-13,-21,-17,-13, -3,-23,-14, 3, -9, 7, 4, -9,-21,-11, -9,-10, 0, 1,-18, -3,-13; /M: SY='K'; M= -6, -5,-27, -6, 6,-21,-15, -6,-17, 12,-15, -6, -3,-14, 6, 10, -6, -8,-15,-18, -9, 5; /M: SY='E'; M= -7, 7,-26, 12, 28,-26,-16, -2,-23, 3,-16,-14, 1, -8, 14, 0, 1, -4,-22,-28,-16, 20; /M: SY='A'; M= 7, 4,-22, 5, -5,-20, -2,-13,-18,-10,-13,-12, -2,-15, -8,-14, -1, -7,-12,-20,-15, -6; /M: SY='E'; M= -7, -5,-27, -4, 4,-21, 2,-10,-21, -2,-15,-10, -3,-14, 3, -1, -3, -7,-18,-23,-15, 3; /M: SY='E'; M= -9, -6,-26, -4, 14,-16,-22, -7,-10, 3, -5, -4, -8,-13, 5, 2, -7, -7,-11,-23, -8, 9; /M: SY='R'; M= -8,-11,-24,-14, -9,-14,-20,-10, -3, -1, -5, 1, -7,-16, -3, 3,-10, -8, -2,-19, -8, -7; /M: SY='V'; M= 6,-21,-14,-24,-20, -2,-22,-22, 13,-18, 9, 5,-19,-23,-18,-18, -6, 1, 20,-24, -8,-19; /M: SY='N'; M= -5, 0,-23, -2, -6,-13,-14, -7, -6, -8, -9, -6, 1,-17, -7, -8, -3, -5, -6,-23, -5, -8; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Post-processing [info]
| COMPETES_HIT_WITH | PS51352; PS50404; PS51354; PS51355 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 63 in 63 different sequences |
| Number of true positive hits | 63 in 63 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | N_Hulo |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
63 sequences
ARSC1_ECOLX (P08692), ARSC2_ECOLX (P52147), ARSCL_ECOLI (P0CF87), ARSC_ACIMA (O50595), ARSC_ECOLI (P0AB96), ARSC_HAEIN (P44589), ARSC_NEIGO (P95354), ARSC_NEIMA (P63621), ARSC_NEIMB (P63622), ARSC_RHIME (Q92R44), ARSC_SHIFL (P0AB97), ARSC_YEREN (P74984), ARSI1_SYNY3 (Q6ZEM6), ARSI2_SYNY3 (Q6YRW7), MGSR_BACSU (P54503), SPX1_BACAN (Q81TR6), SPX1_BACCR (Q81GK7), SPX1_LACLA (Q9CI20), SPX1_OCEIH (Q8ERT7), SPX2_BACAN (Q81MW4), SPX2_BACCR (Q81AZ5), SPX2_LACLA (P60375), SPX2_OCEIH (Q8ERE2), SPX_BACSU (O31602), SPX_ENTFA (Q830U3), SPX_HALH5 (Q9K8Z1), SPX_LACLM (P60376), SPX_LACPL (Q88V55), SPX_LISIN (P60377), SPX_LISMF (Q71XH4), SPX_LISMO (Q9RGX0), SPX_SHOC1 (Q5WEZ7), SPX_STAA8 (Q2G1U6), SPX_STAAC (Q5HH87), SPX_STAAM (P60378), SPX_STAAN (P60379), SPX_STAAR (Q6GI88), SPX_STAAS (Q6GAS9), SPX_STAAW (P60380), SPX_STAEQ (Q5HQH3), SPX_STAES (Q8CT68), SPX_STAHJ (Q4L505), SPX_STAS1 (Q49WC6), SPX_STRA3 (Q8E5J8), SPX_STRA5 (Q8DZV0), SPX_STRMU (Q8DU17), SPX_STRP1 (P60381), SPX_STRP3 (P0CZ82), SPX_STRP6 (Q5XBX9), SPX_STRP8 (P60382), SPX_STRPN (Q97Q26), SPX_STRPQ (P0CZ83), SPX_STRR6 (Q8DPA8), Y103_HAEIN (P44515), Y127_MYCGE (P47373), Y176_UREPA (Q9PQW7), Y266_MYCPN (P75509), YDRA_RHORU (P14301), YFFB_ECOLI (P24178), YFGD_ECOLI (P76569), YFJU_ECOLI (P0CF86), YGL1_STRVR (P19434), YUSI_BACSU (O32175)» more
|
| PDB [Detailed view] |
18 PDB
1I9D; 1J9B; 1JZW; 1S3C; 1S3D; 1SD8; 1SD9; 1SJZ; 1SK0; 1SK1; 1SK2; 1Z3E; 3GFK; 3IHQ; 3L78; 6GHB; 6GHO; 7F75 » more |