PROSITE entry PS51353

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	ARSC
Accession [info]	PS51353
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-DEC-2007 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51353
Associated ProRule [info]	PRU01282

Name and characterization of the entry

Description [info]

ArsC family profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=131;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=126;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5953034; R2=0.0124863; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=553; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=393; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-400; E1=-400; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='M';  M= -4, -3,-20, -8, -5,-14,-14, -5, -5, -4, -6, 13, -3,-13,  0, -6, -1,  2, -5,-27,-10, -3;
/M: SY='I';  M= -5,-25,-20,-31,-25,  1,-30,-23, 28,-23, 16, 16,-21,-22,-19,-22,-14, -2, 25,-22, -2,-24;
/M: SY='T';  M= -5, -5,-18,-10, -5,-13,-22,-15, -7,  0, -9, -5, -3,-14, -5, -2,  4, 18, -2,-26, -8, -6;
/M: SY='I';  M=-10,-29,-23,-35,-27, 13,-34,-24, 31,-28, 25, 18,-23,-25,-23,-24,-21, -9, 21,-17,  3,-26;
/M: SY='Y';  M=-19,-23,-28,-25,-22, 32,-30,  8,  1,-15,  3,  0,-21,-30,-15,-13,-21,-11, -7, 29, 62,-22;
/M: SY='H';  M= -9, -7,-24, -8, -7,-17,  2, 24,-22,-13,-17, -7,  0,-19, -3,-10, -3, -9,-20,-22, -2, -7;
/M: SY='N';  M= -9,  3,-23, -7,-12, -5,-17, -2,  2,-10,-10, -5, 14,-21, -7,-11, -1, -2, -7,-20,  5,-12;
/M: SY='P';  M= -5,-13,-33, -8,  1,-27,-16,-17,-21,  1,-28,-17,-12, 50, -5, -8, -4, -6,-23,-28,-23, -5;
/M: SY='N';  M= -3,  8,-21,  2,  1,-22, -7, -4,-23, 11,-25,-15, 16,-15,  2, 15,  8,  1,-19,-30,-16,  0;
/M: SY='C';  M= -9,-19,116,-29,-29,-20,-29,-29,-30,-29,-20,-20,-19,-39,-29,-29, -9, -9,-10,-50,-30,-29;
/M: SY='S';  M=  0,  9,-18, 12,  0,-24,  5,-10,-25, -9,-26,-20,  9,-12, -5,-11, 19,  9,-16,-34,-19, -3;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-15, -6, -4,-17,-15,-16,-17,  4,-19,-12,  2,-10, -4, -1, 16, 29, -7,-29,-12, -4;
/M: SY='C';  M= -1,-14, 36,-19,-18,-15,-18,-21,-11,-20,-16,-10, -9,-25,-16,-20,  9,  3,  1,-40,-20,-17;
/M: SY='R';  M=-16, -7,-29, -7,  3,-24,-20, -3,-29, 34,-23, -9,  0,-17, 11, 52, -9, -9,-19,-20,-10,  4;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='K';  M= -7,  6,-27,  3, 11,-28,-15, -5,-26, 30,-27,-12,  8,-11, 11, 19, -3, -6,-21,-25,-13, 11;
/M: SY='A';  M= 33, -9,-10,-18,-12,-16, -6,-20, -8,-11, -9, -8, -9,-12,-11,-17, 10, 12,  2,-23,-17,-11;
/M: SY='R';  M=-11,-17,-23,-19, -9, -7,-25,-12, -3,  2,  9,  5,-15,-22, -6, 11,-17, -9, -2,-20, -5, -9;
/M: SY='K';  M= 10, -3,-21, -6,  5,-24,-10, -9,-20, 11,-19,-11, -2,-11,  5,  5,  2, -2,-13,-23,-15,  4;
/M: SY='W';  M=-15,-33,-36,-34,-24, 13,-24,-23, -3,-21,  4, -2,-32,-28,-18,-19,-32,-20,-12, 69, 19,-19;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-21,-32,-22, 13,-31,-21, 23,-29, 41, 19,-28,-28,-21,-21,-27,-10, 13,-18,  2,-22;
/M: SY='E';  M=-11, 10,-28, 15, 23,-28,-17, -2,-26, 12,-21,-15,  5,-10, 12, 11, -2, -7,-23,-28,-15, 17;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='E';  M=  3, 11,-23, 11, 17,-27, -9, -2,-23,  2,-20,-15,  8, -9,  9, -5,  5, -4,-21,-29,-17, 13;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='H';  M= -5,  6,-23,  1,  2,-20,-12, 26,-22,  0,-20, -9, 14,-16,  6,  4,  1, -6,-21,-29, -4,  2;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='G';  M= -5,  5,-28,  4, -5,-29, 30, -6,-33, -6,-28,-18, 11,-16, -4, -8,  2,-13,-28,-26,-22, -5;
/M: SY='I';  M= -6,-24,-21,-28,-20, -3,-31,-22, 26,-21, 14, 11,-20,-22,-17,-21,-15, -7, 22,-23, -4,-21;
/M: SY='E';  M= -1,  9,-25, 14, 22,-27,-13, -7,-25,  2,-22,-18,  2,  3,  6, -6,  4, -3,-22,-30,-19, 13;
/M: SY='Y';  M=-14,-22,-28,-23,-18, 20,-27, -2, -1,-17, -3, -3,-19, -1,-18,-16,-16,-10, -7,  0, 26,-20;
/M: SY='E';  M= -8,  6,-23,  6, 16,-24,-18, -2,-20,  4,-18,-12,  3, -9, 10,  2,  3,  4,-17,-29,-13, 12;
/M: SY='F';  M= -7,-18,-20,-20, -8, 10,-27,-18,  7,-15,  4,  1,-17,-20,-17,-16,-11, -6,  9,-18, -1,-12;
/M: SY='H';  M=-12,-17,-26,-20,-13, -9,-28,  9,  7, -9, -1,  6,-10,-21, -6, -1,-13,-10,  6,-24,  1,-13;
/M: SY='D';  M=-14, 23,-28, 29, 17,-27,-13,  5,-27,  2,-21,-18, 16,-10,  4,  0, -1, -8,-26,-33,-15, 10;
/M: SY='Y';  M=-16,-25,-27,-28,-24, 27,-32, -2, 14,-19, 11,  7,-21,-27,-17,-17,-21,-10,  3,  9, 44,-23;
/M: SY='L';  M= -9,-20,-22,-21,-14,  0,-24,-15,  2, -6, 13,  6,-17,-24,-12,  1,-17, -7,  3,-19, -2,-13;
/M: SY='K';  M= -5,  5,-25,  8, 17,-27,-17, -8,-24, 19,-22,-13,  2, -9,  8,  9,  0, -3,-17,-27,-15, 12;
/M: SY='B';  M= -6, 15,-21, 15, 11,-24,-13, -1,-22,  0,-20,-15, 10,-11,  6, -5,  7,  6,-19,-31,-14,  8;
/M: SY='P';  M= -5,-12,-32, -9, -5,-26,  1,-17,-22,-10,-26,-17, -9, 38,-10,-15, -3, -6,-24,-27,-25,-10;
/M: SY='P';  M= -9,-25,-31,-22,-12,-11,-26,-21,  4,-19,  3,  0,-23, 30,-15,-21,-17,-10, -6,-24,-14,-17;
/M: SY='S';  M= -1,  9,-16,  8,  2,-20,-10,-10,-20, -5,-22,-17,  8, -8, -2, -8, 18, 18,-13,-34,-16,  0;
/M: SY='R';  M= -1, -8,-24, -9,  2,-20,-18,-10,-14, 10,-13, -7, -7,-11,  2, 12, -5, -6, -8,-23,-12,  1;
/M: SY='E';  M=  0, 11,-24, 16, 22,-28,-12, -5,-25,  4,-21,-17,  4, -6,  8, -4,  4, -4,-20,-30,-18, 15;
/M: SY='E';  M=-10,  2,-26,  6, 22,-20,-20, -1,-19,  2,-12, -8, -3,-10, 11,  0, -4, -5,-19,-23,-10, 16;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-21,-32,-23, 10,-32,-22, 26,-29, 39, 19,-27,-28,-21,-22,-26, -9, 16,-19,  0,-23;
/M: SY='K';  M= -6, -4,-25, -4,  4,-21,-18, -7,-15, 11,-12, -6, -3,-14,  7, 10, -5, -5,-12,-24,-10,  5;
/M: SY='E';  M= -2,  3,-24,  3,  9,-23,-10, -2,-22,  4,-19,-12,  3,-12,  7,  2,  2, -3,-19,-25,-13,  8;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='W';  M=-10,-30,-27,-34,-25, 10,-28,-24, 16,-24, 17, 10,-27,-25,-20,-21,-25,-13,  7, 19,  7,-22; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='L';  M= -6,-25,-16,-28,-20,  6,-28,-16, 19,-24, 27, 14,-23,-25,-18,-20,-20, -8, 13,-19,  1,-20; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='E';  M=  4,  2,-20,  2,  6,-24, -9, -6,-21,  6,-20,-12,  3,-11,  5,  3,  6,  0,-15,-26,-15,  5; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='R';  M= -7, -4,-19, -5,  0,-12,-15, -5, -9,  6, -3,  1, -4,-13,  4,  7, -8, -6, -9,-16, -5,  1; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='T';  M=  1,-10, -8,-14,-10, -4,-15,-12,  0,-12,  6,  4, -9,-14, -7,-11,  0,  9,  1,-20, -6, -9; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='G';  M= -4,  4,-27,  7, 10,-29, 14, -7,-31, -2,-24,-17,  4,-11,  2, -7,  1,-11,-26,-26,-20,  6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='L';  M= -6,-12,-20,-14,-12, -4,-19,-13,  4,-16,  8,  4,-10,-21,-12,-14,-11, -6,  2,-24, -6,-13;
/M: SY='G';  M= -2, -2,-26,  1, -2,-27, 21,-14,-30, -9,-27,-19,  1, -1, -8,-13,  6, -5,-24,-28,-24, -6;
/M: SY='W';  M= -3,-24,-25,-26,-20, -2,-23,-24,  4,-18, -1, -2,-23, -9,-18,-18,-14, -5,  4,  8, -3,-19;
/M: SY='R';  M=-13,  3,-29,  7, 17,-24,-17, -2,-28, 16,-21,-14,  1,-12,  9, 22, -5, -9,-23,-20,-12, 12;
/M: SY='D';  M= -5, 11,-25, 15, 15,-26,-13, -6,-24,  5,-21,-16,  4, -7,  6, -2,  2, -2,-19,-28,-14, 10;
/M: SY='L';  M= -7,-28,-21,-33,-24, 12,-29,-22, 23,-27, 29, 17,-25,-26,-21,-22,-22, -9, 16,-16,  2,-23;
/M: SY='L';  M= -9,-28,-20,-33,-25, 17,-31,-22, 23,-25, 24, 17,-24,-26,-23,-20,-20, -7, 18,-16,  4,-24;
/M: SY='N';  M= -9, 12,-22,  4,  0,-19, -8,  2,-23,  9,-25,-16, 26,-18,  3, 24,  8,  0,-22,-32,-16,  0;
/M: SY='T';  M= -5,  0,-19, -4,  1,-18,-19,-11,-19, 10,-17,-10,  0,-11,  1,  9,  6, 18,-11,-26,-11,  1;
/M: SY='R';  M= -7, -2,-25, -3,  2,-24, -9, -5,-27, 21,-25,-13,  5,-14,  5, 29,  1, -4,-19,-25,-14,  2;
/M: SY='G';  M=  0, -1,-24,  1,  6,-26, 22,-12,-29, -9,-25,-19,  3,-12, -5,-12, 10, -5,-22,-28,-24,  1;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='T';  M= -1,  1,-20, -2,  1,-20,-16,-12,-16,  3,-15, -9,  0, -7,  1,  0,  5, 11,-10,-27,-13,  1;
/M: SY='T';  M=  1,-10,-19,-12, -6,-13,-19,-16, -4, -9, -6, -5,-10, -4, -8,-11,  2,  8, -2,-26,-11, -8;
/M: SY='Y';  M=-15,-24,-29,-27,-22, 33,-26,  0, -4,-15, -1, -4,-21,-28,-18,-13,-20,-12,-10, 37, 51,-21;
/M: SY='R';  M= -9, -4,-28, -4,  6,-25,-18, -4,-26, 26,-22, -9,  0,-13, 12, 34, -5, -7,-19,-22,-11,  7;
/M: SY='E';  M= -1,  7,-24,  8, 22,-27,-11, -5,-25,  9,-21,-15,  4, -8, 10,  1,  4, -3,-21,-28,-17, 16;
/M: SY='L';  M=-10,-26,-20,-27,-18,  6,-28,-17, 17,-26, 40, 18,-25,-27,-16,-18,-25, -8,  8,-21, -1,-17;
/M: SY='G';  M= -5,  9,-25,  8, -2,-25, 14, -6,-28, -5,-26,-18, 13,-10, -5, -8,  4, -6,-24,-28,-19, -4;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='L';  M= -4,-18,-20,-18,-11, -3,-25,-17,  9,-19, 21,  8,-19,-21,-13,-16,-16, -7,  5,-23, -5,-12; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-12;
/M: SY='D';  M= -2, 16,-23, 19, 11,-29, -6, -5,-27,  5,-25,-18,  9, -9,  3, -3,  5, -4,-21,-30,-18,  7; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-12;
/M:         M= -8, -4,-21, -4, -4, -9,-20,-11, -2, -6, -1, -2, -5,-17, -6, -5, -8, -5, -1,-22, -7, -6; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-12;
/M: SY='E';  M= -8,  7,-28, 12, 14,-27,-14, -5,-25,  8,-23,-16,  2,  7,  5,  1, -2, -7,-23,-27,-16,  8; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-12;
/M: SY='D';  M=  1, 12,-21, 13, 10,-25, -8, -5,-23,  0,-22,-17,  9,-10,  2, -6,  9,  2,-18,-31,-17,  6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='L';  M= -6,-23,-20,-25,-17,  3,-25,-18, 13,-22, 26, 15,-22,-24,-15,-17,-19, -6,  8,-16, -2,-16;
/M: SY='S';  M= -1,  8,-17,  7,  0,-21, -7,-10,-21, -7,-24,-18,  9, -6, -4,-10, 20, 19,-13,-35,-17, -2;
/M: SY='D';  M= -9,  9,-26, 14, 12,-21,-17, -7,-17, -1,-11,-11,  0,-12,  1, -4, -5, -7,-15,-28,-13,  6;
/M: SY='D';  M= -1, 16,-24, 19, 18,-29,-10, -3,-26,  2,-23,-18, 10, -7,  7, -5,  5, -4,-22,-31,-18, 13;
/M: SY='E';  M= -5,  7,-26, 10, 26,-29,-14, -3,-24,  9,-21,-13,  2, -7, 17,  2,  2, -5,-22,-27,-16, 21;
/M: SY='L';  M=  8,-22,-19,-26,-16, -3,-19,-20,  7,-18, 17,  6,-21,-22,-13,-17,-14, -7,  5,-11, -6,-14;
/M: SY='I';  M= -6,-26,-23,-32,-23,  5,-31,-22, 26,-23, 22, 14,-22,-24,-18,-20,-19, -8, 18,-18,  1,-23;
/M: SY='D';  M= -2, 13,-24, 16, 16,-29,-12, -4,-26,  6,-22,-16,  6, -9,  8,  0,  2, -4,-20,-29,-17, 12;
/M: SY='L';  M=  9,-22,-18,-27,-17,  1,-21,-20, 10,-22, 22,  8,-21,-22,-16,-20,-14, -6,  7,-17, -5,-17;
/M: SY='M';  M= -9,-26,-21,-32,-22,  4,-28,-14, 26,-21, 29, 35,-24,-24,-13,-18,-23, -9, 16,-20,  0,-18;
/M: SY='A';  M=  7,-16,-16,-20,-12, -9,-18,-16,  5,-14,  5,  3,-14,-19, -9,-14, -4, -2,  7,-24,-10,-11;
/M: SY='E';  M=  4,  6,-22,  7, 18,-26,-13, -5,-22,  5,-19,-14,  2, -8,  9, -3,  5, -2,-18,-28,-16, 14;
/M: SY='H';  M=-14, 15,-26, 12,  5,-21,-14, 31,-24, -1,-22,-10, 20,-17,  8,  0,  0, -7,-25,-29, -1,  4;
/M: SY='P';  M= -8,-17,-37,-10, -3,-29, -5,-19,-22,-12,-28,-19,-15, 65,-11,-19, -7,-10,-28,-28,-29,-11;
/M: SY='M';  M= -1, -8,-22,-13, -7,-16,-14,-13, -5,  0,-10,  1, -4,-15, -3, -2,  0,  0, -3,-25,-11, -6;
/M: SY='L';  M= -9,-29,-21,-31,-21,  8,-30,-20, 23,-28, 43, 22,-28,-28,-19,-20,-27,-10, 13,-20,  0,-21;
/M: SY='I';  M= -9,-30,-25,-36,-27,  3,-35,-26, 38,-28, 27, 20,-24,-24,-20,-26,-22, -9, 25,-20, -1,-26;
/M: SY='K';  M=-12,  5,-29,  4, 17,-28,-17, -2,-28, 30,-26,-12,  8,-11, 15, 25, -5, -9,-24,-24,-13, 15;
/M: SY='R';  M=-19, -9,-29,-10,  0,-20,-19,  0,-29, 28,-20,-10,  1,-20,  9, 65, -8, -8,-19,-21,-10,  0;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='I';  M= -9,-30,-24,-36,-28,  9,-35,-27, 36,-28, 23, 17,-24,-25,-23,-25,-20, -8, 27,-19,  1,-28;
/M: SY='V';  M= -4,-29,-18,-32,-26,  4,-31,-26, 29,-25, 23, 15,-27,-27,-24,-22,-18, -5, 30,-24, -4,-26;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='V';  M= -5,-21,-19,-24,-18, -1,-28,-21, 19,-18, 10,  9,-20,-22,-17,-17,-11, -1, 22,-24, -5,-19;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='D';  M= -5, 12,-22, 15,  3,-24,-11, -4,-23, -1,-20,-15,  7,-11, -1, -4,  5,  4,-16,-30,-14,  0;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='D';  M= -8, 13,-28, 17,  8,-30,  7, -6,-31, -3,-27,-21, 10,  1, -2, -8,  1, -9,-28,-31,-23,  2;
/M: SY='K';  M=-10,  7,-28,  9,  4,-27,  1, -6,-28, 10,-23,-14,  6,-14,  1,  6, -4,-10,-23,-25,-15,  2;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='R';  M= -9, -6,-26, -7, -2,-21, -4, -6,-24, 11,-20,-10, -1,-15,  1, 16, -5, -8,-17,-22,-12, -2;
/M: SY='V';  M=  8,-20,-16,-25,-18, -3,-20,-19, 10,-18, 12,  7,-19,-21,-17,-18, -8,  0, 13,-22, -6,-18;
/M: SY='M';  M= -5,-14,-21,-17, -8,-12,-22, -9, -1, -4,  2,  3,-12,-20,  1,  2, -8, -3,  1,-23, -7, -5;
/M: SY='I';  M= -6,-28,-16,-32,-26,  3,-32,-26, 30,-26, 23, 14,-25,-27,-23,-23,-18, -5, 28,-24, -4,-26;
/M: SY='G';  M=  1,-11,-10,-13,-20,-28, 53,-21,-37,-21,-28,-19, -3,-22,-20,-21,  0,-17,-26,-24,-29,-20;
/M: SY='F';  M=-20,-21,-25,-25,-17, 32,-26, -5,-11, -4, -3, -4,-12,-26,-16, 16,-16,-10, -9,  2, 23,-17;
/M: SY='P';  M= -9,  5,-29,  5,  3,-26,-13, -7,-23,  7,-29,-17,  9, 21, -1,  0,  0, -4,-25,-31,-20, -1;
/M: SY='E';  M= -2, -3,-27,  3, 19,-26,-16,-11,-20, -3,-20,-16, -6, 19,  3,-10,  3, -3,-20,-30,-21,  9;
/M: SY='E';  M= -5, 16,-27, 25, 34,-30,-14, -4,-28,  4,-22,-20,  4, -5, 10, -5,  3, -6,-24,-31,-19, 22;
/M: SY='E';  M= -4,  5,-24,  6, 13,-23,-15, -5,-17,  2,-15,-11,  2,-12,  8, -2,  1, -3,-15,-27,-13, 10;
/M: SY='Y';  M=-11,-27,-24,-30,-25, 11,-31,-16, 19,-20,  9,  7,-25,-27,-20,-19,-19, -9, 17,  5, 20,-24;
/M: SY='R';  M= -7, -8,-25, -8,  4,-16,-20, -7,-12,  4, -2, -2, -7,-17,  4, 11, -9, -8,-11,-23,-10,  3;
/M: SY='E';  M=  1,  3,-23,  5, 13,-25,-13, -7,-21,  6,-18,-12,  0,-10,  6,  2,  2, -3,-15,-27,-15,  9;
/M: SY='F';  M= -9,-24,-22,-30,-22, 18,-28,-19, 14,-22, 16,  8,-19,-25,-20,-18,-18, -8,  9,-10,  7,-21;
/I:         I=-3; MD=-17;
/M: SY='L';  M=-12,-28,-21,-31,-22, 22,-28,-21, 13,-27, 30, 11,-26,-28,-23,-19,-25,-10,  7, -5,  7,-22; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='P';  M= -3, -6,-28, -3,  2,-25,-10,-13,-20, -2,-20,-14, -6, 20, -4, -7, -3, -7,-20,-27,-20, -3;
/M: SY='R';  M= -6, -4,-25, -4,  3,-21,-16, -5,-20, 11,-16,-10, -1,-11,  4, 21, -3, -5,-15,-25,-13,  1;
/M: SY='E';  M= -2, -5,-25, -3,  4,-22,-12,-10,-18,  3,-20,-12, -4,  4,  0, -3,  2, -1,-14,-26,-15,  1;
/M: SY='V';  M= -4,-14,-21,-15,-10,-10,-22,-10,  2, -8, -2,  2,-14,-17, -3, -8, -6, -3,  6,-21, -3, -7;
/M: SY='R';  M=-12, -6,-28, -5,  3,-23,-15,  0,-24, 18,-19, -8, -1,-16,  9, 36, -6, -9,-18,-23,-11,  3;
/M: SY='K';  M= -4, -2,-24, -3,  3,-24, -2, -7,-23,  6,-21,-12,  1,-12,  3,  6,  1, -3,-17,-25,-16,  2;
/M:         M= -1,-17,-22,-19,-10,  0,-21,-13, -3, -9,  0, -1,-15,-11, -9,-10,-10, -6, -2,-16, -1,-10;
/M: SY='E';  M= -9, -6,-24, -7,  9, -1,-18, -7,-17, -2,-12, -9, -5,-12, -1, -4, -4, -5,-15,-18, -4,  4;
/M: SY='L';  M= -6,-13,-21,-17,-13, -3,-23,-14,  3, -9,  7,  4, -9,-21,-11, -9,-10,  0,  1,-18, -3,-13;
/M: SY='K';  M= -6, -5,-27, -6,  6,-21,-15, -6,-17, 12,-15, -6, -3,-14,  6, 10, -6, -8,-15,-18, -9,  5;
/M: SY='E';  M= -7,  7,-26, 12, 28,-26,-16, -2,-23,  3,-16,-14,  1, -8, 14,  0,  1, -4,-22,-28,-16, 20;
/M: SY='A';  M=  7,  4,-22,  5, -5,-20, -2,-13,-18,-10,-13,-12, -2,-15, -8,-14, -1, -7,-12,-20,-15, -6;
/M: SY='E';  M= -7, -5,-27, -4,  4,-21,  2,-10,-21, -2,-15,-10, -3,-14,  3, -1, -3, -7,-18,-23,-15,  3;
/M: SY='E';  M= -9, -6,-26, -4, 14,-16,-22, -7,-10,  3, -5, -4, -8,-13,  5,  2, -7, -7,-11,-23, -8,  9;
/M: SY='R';  M= -8,-11,-24,-14, -9,-14,-20,-10, -3, -1, -5,  1, -7,-16, -3,  3,-10, -8, -2,-19, -8, -7;
/M: SY='V';  M=  6,-21,-14,-24,-20, -2,-22,-22, 13,-18,  9,  5,-19,-23,-18,-18, -6,  1, 20,-24, -8,-19;
/M: SY='N';  M= -5,  0,-23, -2, -6,-13,-14, -7, -6, -8, -9, -6,  1,-17, -7, -8, -3, -5, -6,-23, -5, -8;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH

PS51352; PS50404; PS51354; PS51355

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_02 which contains 571'282 sequence entries.

Total number of hits	63 in 63 different sequences
Number of true positive hits	63 in 63 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	N_Hulo
Taxonomic range [info]	Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	1
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

63 sequences

ARSC1_ECOLX (P08692), ARSC2_ECOLX (P52147), ARSCL_ECOLI (P0CF87),

ARSC_ACIMA  (O50595), ARSC_ECOLI  (P0AB96), ARSC_HAEIN  (P44589), 
ARSC_NEIGO  (P95354), ARSC_NEIMA  (P63621), ARSC_NEIMB  (P63622), 
ARSC_RHIME  (Q92R44), ARSC_SHIFL  (P0AB97), ARSC_YEREN  (P74984), 
ARSI1_SYNY3 (Q6ZEM6), ARSI2_SYNY3 (Q6YRW7), MGSR_BACSU  (P54503), 
SPX1_BACAN  (Q81TR6), SPX1_BACCR  (Q81GK7), SPX1_LACLA  (Q9CI20), 
SPX1_OCEIH  (Q8ERT7), SPX2_BACAN  (Q81MW4), SPX2_BACCR  (Q81AZ5), 
SPX2_LACLA  (P60375), SPX2_OCEIH  (Q8ERE2), SPX_BACSU   (O31602), 
SPX_ENTFA   (Q830U3), SPX_HALH5   (Q9K8Z1), SPX_LACLM   (P60376), 
SPX_LACPL   (Q88V55), SPX_LISIN   (P60377), SPX_LISMF   (Q71XH4), 
SPX_LISMO   (Q9RGX0), SPX_SHOC1   (Q5WEZ7), SPX_STAA8   (Q2G1U6), 
SPX_STAAC   (Q5HH87), SPX_STAAM   (P60378), SPX_STAAN   (P60379), 
SPX_STAAR   (Q6GI88), SPX_STAAS   (Q6GAS9), SPX_STAAW   (P60380), 
SPX_STAEQ   (Q5HQH3), SPX_STAES   (Q8CT68), SPX_STAHJ   (Q4L505), 
SPX_STAS1   (Q49WC6), SPX_STRA3   (Q8E5J8), SPX_STRA5   (Q8DZV0), 
SPX_STRMU   (Q8DU17), SPX_STRP1   (P60381), SPX_STRP3   (P0CZ82), 
SPX_STRP6   (Q5XBX9), SPX_STRP8   (P60382), SPX_STRPN   (Q97Q26), 
SPX_STRPQ   (P0CZ83), SPX_STRR6   (Q8DPA8), Y103_HAEIN  (P44515), 
Y127_MYCGE  (P47373), Y176_UREPA  (Q9PQW7), Y266_MYCPN  (P75509), 
YDRA_RHORU  (P14301), YFFB_ECOLI  (P24178), YFGD_ECOLI  (P76569), 
YFJU_ECOLI  (P0CF86), YGL1_STRVR  (P19434), YUSI_BACSU  (O32175)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

18 PDB

1I9D; 1J9B; 1JZW; 1S3C; 1S3D; 1SD8; 1SD9; 1SJZ; 1SK0; 1SK1; 1SK2; 1Z3E; 3GFK; 3IHQ; 3L78; 6GHB; 6GHO; 7F75
» more