PROSITE entry PS51413

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	DBINO
Accession [info]	PS51413
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-DEC-2008 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51413
Associated ProRule [info]	PRU00746

Name and characterization of the entry

Description [info]

DBINO domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=126;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=121;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8247193; R2=0.0059708; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=18961.7968750; R2=14.5587568; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1118; H_SCORE=35238; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=784; H_SCORE=30376; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-5; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='I';  M= 12,-16,-22,-25,-22, -3,-15,-18, 36,-11, 11, 13, -6,-30,-16,-16, -7,  5, 32,-34,-10,-22;
/M: SY='W';  M=-43,-46,-20,-40,-13,  9,  7,-46,-17,-20,-14,-24,-60,-30,-11, -4,-27,-43,-20,167, 41,-13;
/M: SY='Q';  M= -1,-11,-20,-13,  1, -8,-15,-13,  0,  6, -3,  8, -8, -9, 15, 13, -9, -7, -5,-17, -2,  4;
/M: SY='D';  M=  0, 19,-14, 24,  5,-21, -9,-12, -9, -2, -4,-10, 14,-15, -8,-15,  3, -1,-10,-36,-14,  0;
/M: SY='I';  M=  2,-19,-17,-32,-20, -4,-15, -4, 36, -6, 23, 29, -3,-34,-16,-18,-15,  0, 21,-29, -4,-20;
/M: SY='A';  M= 27, -7,-26, -7,-10, -9,-10,-22, 13, -7, -4,  4, -7,-20, -6,-10,  6, 11, 22,-41,-21,-11;
/M: SY='R';  M= -6,-12,-24, -6,  1,-10,-16,-14,-26, 21,-20,  8,-12, -2, 19, 54, -6,-22,-14, -8, -4,  4;
/M: SY='K';  M= -2, -4,-28, -2, 14,-10,-12,-18,-22, 34,-20, 16, -4,  6,  6, 24, -2,-14,-18,-16, -8,  8;
/M: SY='D';  M=  0, 24, -9, 48, 36,-45,-15,-10,-35, 10,-10,-20,  0,  0,  6,-10,  0,-15,-25,-24,-15, 26;
/M: SY='I';  M=  4,-14,-17,-21,-20,  3,-15,-19, 32,-15, 11,  2, -9,-28,-20,-18,  0,  7, 26,-28, -1,-22;
/M: SY='P';  M=  6,  0,-28, -5, -6,-27, 12,-12,-11, -1,-18,-14,  4, 24, -4,-16,  2,  6,-18,-34,-28, -7;
/M: SY='K';  M= -2, -5,-28, -2, 13,-10,-12,-18,-22, 33,-20, 15, -5,  5,  7, 27, -2,-15,-18,-15, -8,  8;
/M: SY='M';  M=  4,-15,-23,-16,-12, -4,-22, 16, 14,-11, 11, 18,-12,-24,-13,-11,-11,  1, 13,-35,  2,-12;
/M: SY='H';  M= -9, -9,-32,-13, -6,  4,-19, 20,-11, -7, -5, -6,  1,-13,  9, -1, -3, -4,-14,-18,  6, -3;
/M: SY='R';  M= -7,-14,-23, -7, -1,-10,-17,-13,-27, 19,-20,  6,-14, -4, 21, 59, -7,-24,-13, -6, -3,  3;
/M: SY='I';  M=  4,-13,-16,-22,-13, -1,-13,-14, 29,-14, 16, 10, -7,-23, -1,-15,-10,  1, 17,-27, -2,-10;
/M: SY='F';  M=  3,-11,-27,-18, -9, 14,-15,-23,  7,  8, -1,  7, -5,-15,-11, -5, -3, -5,  8,-21, -4,-12;
/M: SY='Q';  M= 15, -6,-22,-11, -3,-18,-11,-13,  2, -5, -8, -3, -1, -8, 20, -6,  9, 15,  0,-32,-18,  3;
/M: SY='N';  M=  6, 14,-19, 11,  1,-24,-11,-11,-13, -2,-15,-10, 18,-10, 17, -5,  7, 13,-15,-39,-18,  6;
/M: SY='N';  M=  4,  6,-20,-11,-15, 11, -7,-17,  7, -5, -5, -4, 28,-26,-12,-16,  4,  4,  0,-40,-19,-17;
/M: SY='H';  M=-13,-19,-38,-14,  1,-18,-26, 57,-20, -8, -8,  4,-16,  0, 26, 17,-11,-14,-21,-16, 11,  8;
/M: SY='R';  M= -5, -2,-27, -2, -2, -4,-10,-11,-15,  9,-13, -3,  3,-10,  0, 12,  7, -2,-11,-16, -1, -5;
/M: SY='N';  M=  0,  8,-16,  5,  1,-13,-13,-15, -1,  2,  0,  4, 10,-11, -6,-15, -1,  4, -4,-35, -9, -2;
/M: SY='R';  M= -6,-14,-19,-17,-11, 10,-20,-13, -7,  4,  4, 10,-10,-17, -1, 15, -8, -7, -1,-14,  7, -9;
/M: SY='S';  M=  4, -5,-15, -7, -6, -1, -6,-11,  6, -8,  0, -6, -5,-18,-14,-15, 19, 12,  1,-27, -6,-12;
/M: SY='T';  M= 11, -4,-21,-13,-17,-15,-13,-19, 10, -9,  0,  0,  6, -8, -4,-25, 16, 32, 13,-43,-14,-13;
/M: SY='N';  M=  0, 42,-14, 25, -6,-18, -2,-12, -8,  0,-18, -6, 66,-26,-10,-18,  0,  6,-20,-64,-34, -8;
/M: SY='C';  M=  4,-10, 21,-15, -5,  2,-16,-25, -3,-11,  2, -4, -7,-22,-10,-14,  1, -1,  0,-28,-21, -8;
/M: SY='R';  M= -6,-11,-24, -6,  3,-10,-16,-14,-26, 23,-20,  9,-11, -1, 17, 49, -6,-21,-14, -9, -4,  4;
/M: SY='R';  M= -4, -8,-26, -4,  7,-10,-14,-16,-24, 27,-20, 12, -8,  2, 13, 39, -4,-18,-16,-12, -6,  6;
/M: SY='T';  M=  1,-12,-19,-20,-25, 16,-24,-23, 12,-14, 12, -1, -5,-21,-16,-20,  1, 20, 19,-29,  8,-20;
/M: SY='A';  M= 32,  0,-27,  0,  0,-17,  0,-17, -3,  0,-13,  2,  0,-10,  4,-10, 18, 13,  4,-44,-34, -3;
/M: SY='H';  M=  5,  2,-30,  6, -2,-25, -3,  8, -7, -7, -9, -6, -1, -8,  5, -8,  2, -3,-10,-31,-16, -2;
/M: SY='L';  M= -3, -9,-13,-12, -7, -1, -1, -9,  7,-11, 17, 12,-13,-23, -4,-10,-15, -4, -5,-14,  8, -4;
/M: SY='C';  M=-20,-17,140,-26,  9,-29,-34,-46,-17,-26, -1,-16, -9,-27,-16,-19,-16,-16,-16,-24,-57,  0;
/M: SY='A';  M= 16, -7,-25,-12, -2,-22,  2, -5, -4,  4, -7, 11, -2,-16, 11, -1,  1,  2, -9,-25,-21,  1;
/M: SY='R';  M= -6,-12,-24, -6,  2,-10,-16,-14,-26, 22,-20,  8,-12, -2, 18, 52, -6,-22,-14, -8, -4,  4;
/M: SY='E';  M=  2, -4,  3,  3, 40,-29,-22, -7,-14, 11, -6, -8,-12, -1,  9,-10, -2,-13,-12,-14,-13, 32;
/M: SY='V';  M= 27, -9,-26, -9,-13, -7,-13,-24, 18, -9, -1,  6, -9,-23, -8,-10,  1, 10, 28,-41,-18,-13;
/M: SY='R';  M= -7,-14,-23, -7, -1,-10,-17,-13,-27, 19,-20,  6,-14, -4, 21, 60, -7,-24,-13, -6, -3,  3;
/M: SY='R';  M=  0,-15,-21,-13,  1,-16,-19, -3,-19, 14,-12, 12,-11,-11, 29, 44,-11,-15,-14,-11, -6,  8;
/M: SY='W';  M=-16,-23,-25,-18,  1, -3, -1,-32,-22,  5,-18, -5,-32,-12,  0, 10,-12,-26,-19, 72, 12, -1;
/M: SY='Q';  M= 21, -8,-24, -8,  3,-19,-14,-13, -1, -4,-10, -1, -8,-11, 32,  7, -2,  6,  1,-29,-17, 11;
/M: SY='L';  M= -3,-12,-19,-20,-17, 11,  2,-14, 10, -9, 13,  5, -7,-26,-19,-16, -6, -4,  1,-13,  3,-18;
/M: SY='R';  M= -2, -9,-20, -7,  2,-16,-17, -9,-23, 10,-20,  0, -5, -7, 36, 47, -8,-15,-18,-12, -8, 11;
/M: SY='T';  M= 13,  5,-20, -2, -7,-14, -6,-14, -4, -3,-13, -7, 14,-10, -4,-17, 24, 26, -2,-44,-23, -8;
/M: SY='Q';  M= -7,-11,-28,-17, -8,  7,-19, -8, -1, -6,  1, -7, -1,-18, 20,  3,-10, -3, -5, -8, 10,  0;
/M: SY='K';  M= -1, -2,-29, -1, 17,-10,-11,-19,-21, 37,-20, 18, -2,  8,  3, 17, -1,-12,-19,-18, -9,  9;
/M: SY='N';  M=  0,  3,-18,-13,-13, -9,  4,-15, 16,-10, -1,  1, 20,-23, -3,-16, -7,  0, -2,-32,-17,-11;
/M: SY='C';  M= -3, -8,  9,-19, -7,-21,-17, -8,  2, -2, -2,  4,  6, -1, -9,-16, -8,  6, -7,-37,-24, -9;
/M: SY='K';  M= -2, -4,-28, -2, 14,-10,-12,-18,-22, 34,-20, 16, -4,  6,  6, 24, -2,-14,-18,-16, -8,  8;
/M: SY='D';  M=  2, 28,-18, 50, 17,-42,-14,-15,-30,  3, -8,-19,  5, -3,  0,-14,  4, -1,-17,-34,-13, 11;
/M: SY='T';  M=  9, -8,-20,-16,-16,  2,-17,-14,  4, -5, 10, 11, -1,-18, -7,-18,  2, 18,  9,-34, -4,-12;
/M: SY='Q';  M=  3,-14,-19,-12,  2,-15,-20, -6, -2, -6, -6, -9,-18,  8, 25,  6,-12,  2, -8,-20, -1,  9;
/M: SY='W';  M= -4,-18,-23,-21,-12,-12, -7,-22,  0,-10, -7, -9,-17,  3, -5,-17, -3,  4, -1, 13, -3,-11;
/M: SY='R';  M= -9,-17,-21, -9, -6,-10,-19,-11,-29, 14,-20,  3,-17, -7, 26, 70, -9,-27,-11, -3, -1,  1;
/M: SY='A';  M= 34,  0,-28, -2, -4,-20, -4,-20,  0, -2, -8,  8,  2, -8,  8,-14, 12, 18, 10,-50,-34, -2;
/M: SY='R';  M= -5,-10,-25, -5,  6,-10,-15,-15,-25, 26,-20, 10,-10,  0, 14, 44, -5,-20,-15,-10, -5,  5;
/M: SY='R';  M= -8,-16,-22, -8, -4,-10,-18,-12,-28, 16,-20,  4,-16, -6, 24, 66, -8,-26,-12, -4, -2,  2;
/M: SY='I';  M=  4,-11,-17,-16,-17,  2, -3,-19, 24,-16, 16,  8,-11,-26,-17,-19,-10,  0, 16,-24,  1,-17;
/M: SY='T';  M=  9, -9,-20,-18,-15,-15,-15, -6,  9, -1,  5, 15,  4,-18, -8,-17,  8, 23,  7,-38,-12,-13;
/M: SY='R';  M= -8,-17,-22, -8, -5,-10,-18,-12,-28, 15,-20,  3,-17, -7, 25, 69, -8,-27,-12, -3, -2,  2;
/M: SY='E';  M=  0, 17, -4, 37, 43,-43,-17, -7,-33, 13,-10,-17, -3,  3, 10,-10,  0,-17,-27,-20,-17, 33;
/M: SY='M';  M= 10,-17,-20,-27,-11,-20,-20, 14,  9, 16, 17, 51,  1,-34, -9, -4,-14,  7,  1,-33,-10,-10;
/M: SY='M';  M=  1,-12,-11,-15, -5, -2,-17,  0,  8, -3, 19, 23,-10,-27, -3, -7,-11,  3, -1,-23,  6, -4;
/M: SY='I';  M=  3, -3,-16, -9,-16,  2, -3,-19, 16,-14, 10,  5, -1,-28,-18,-16, -9,  2, 11,-28, -1,-16;
/M: SY='F';  M=-28,-30,-41,-35,-32, 74,-30,-19, -4,-10, 24,-16,-21,-32,-22, -6,-14,-16, 10, 25, 53,-32;
/M: SY='W';  M=-50,-50,-20,-40,-10, 10, 10,-50,-30,-20,-20,-30,-70,-30,-10,  0,-30,-50,-30,200, 50,-10;
/M: SY='K';  M=  0,  0,-30,  0, 20,-10,-10,-20,-20, 40,-20, 20,  0, 10,  0, 10,  0,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='R';  M= -7,-14,-23, -7, -1,-10,-17,-13,-27, 19,-20,  6,-14, -4, 21, 60, -7,-24,-13, -6, -3,  3;
/M: SY='Y';  M=-23,  0,-39, -1,-16, 13,-17, -4, -6, -6,  9, -6, 12,-24,-10, -9,-11, -1, -3, -2, 34,-16;
/M: SY='E';  M=  0, 16, -3, 35, 44,-43,-17, -6,-33, 14,-10,-16, -4,  4, 10,-10,  0,-17,-27,-20,-17, 34;
/M: SY='R';  M= -5,-11,-25, -5,  4,-10,-15,-15,-25, 24,-20,  9,-11, -1, 16, 47, -5,-21,-15, -9, -5,  5;
/M: SY='V';  M=  7,-12,-11,-10,  5,-12,-25,-16,  8, -5, -1, -5,-15,-18,  6, -2, -7,  0, 12,-20, -2,  6;
/M: SY='E';  M=  2, -4,  4,  2, 46,-36,-20,  4,-22, 20, -4,  4, -8,  0, 14, -8, -4,-16,-24,-14,-18, 38;
/M: SY='R';  M=  1,-13,-23, -7, -3,-12,-15,-13,-23, 13,-18,  5,-13, -7, 22, 52, -5,-19, -8,-13, -9,  2;
/M: SY='D';  M=  0, 26,-11, 52, 34,-45,-15,-11,-35,  9,-10,-21,  1, -1,  4,-10,  0,-15,-25,-26,-15, 24;
/M: SY='H';  M= -5, -8,-10, -8,  7, -9,-22, 15, -2, -9, 12,  9,-12, -9,  3,-13, -9, -1, -8,-25,  7,  8;
/M: SY='R';  M= -7,-15,-23, -7, -2,-10,-17,-13,-27, 18,-20,  5,-15, -5, 22, 62, -7,-25,-13, -5, -3,  3;
/M: SY='K';  M= -2, -4,-28, -2, 13,-10,-12,-18,-22, 33,-20, 16, -4,  6,  7, 26, -2,-14,-18,-16, -8,  8;
/M: SY='K';  M=  3, -6,-27, -3,  9,-11,-11,-17,-20, 26,-19, 13, -6,  1, 10, 26, -1,-13,-13,-19,-12,  6;
/M: SY='Q';  M= 22, -8,-24,-12,  1,-20,-10, -9,  4,  0, -5, 10, -3,-14, 24,  0, -2,  4,  1,-33,-23,  6;
/M: SY='E';  M=  0,  0, 10, 10, 60,-40,-20,  0,-30, 20,-10,-10,-10, 10, 20,-10,  0,-20,-30,-10,-20, 50;
/M: SY='R';  M= -4, -7,-26, -4,  9,-10,-14,-16,-24, 29,-20, 13, -7,  3, 11, 36, -4,-17,-16,-13, -6,  6;
/M: SY='E';  M=  1, -1,  6,  7, 54,-39,-20,  0,-29, 17,-11,-10,-10,  9, 29, -4, -1,-17,-30,-10,-19, 49;
/M: SY='A';  M= 34,  0,-24,  1,  9,-23, -3,-17, -4,  3,-10,  7, -1, -7, 11,-10,  9,  6,  4,-44,-37,  7;
/M: SY='M';  M=  5, -7, -6, -6,  8, -7,-16, -6,  4, -2, 16, 17,-11,-19, -4,-13,-10, -3,  0,-25,  0,  5;
/M: SY='E';  M=  0,  7,  4, 22, 53,-41,-19, -3,-31, 17,-10,-13, -7,  7, 16,-10,  0,-19,-29,-14,-19, 43;
/M: SY='Q';  M= 11, -2,-20, -5,  7,-22,-13, -7,-15,  1,-18, -3,  4, -8, 46, 22, -5, -1,-18,-25,-19, 19;
/M: SY='R';  M= 10,-13,-26,-13,-11,  7,-13,-18,-11,  2, -8,  0, -9,-16, 10, 24, -1,-11,  2,-20,-11, -8;
/M: SY='K';  M= -1, -3,-29, -1, 16,-10,-11,-19,-21, 36,-20, 17, -3,  7,  4, 20, -1,-13,-19,-17, -9,  9;
/M: SY='R';  M= -1, -9,-21, -8,  6, -9,-16,-10,-12, 19, -6, 18, -8, -7,  9, 20, -8,-10,-12,-16, -2,  6;
/M: SY='E';  M=  0, 19, -5, 40, 41,-44,-16, -8,-34, 12,-10,-18, -2,  2,  9,-10,  0,-16,-26,-21,-16, 31;
/M: SY='E';  M=  4, -6, -3, -1, 32,-27,-22, -7,-12,  7, -7, -8,-12, -3, 20, -2, -4, -9,-12,-14,-11, 30;
/M: SY='E';  M=  6,  0,  4,  9, 51,-37,-17, -3,-26, 17,-10, -7, -9,  7, 19,-10,  1,-16,-24,-16,-23, 43;
/M: SY='L';  M=  1, -2,-13,  1,  6,-17,-17, -5,  0, -2,  9,  8, -7,-17,  8, -6,-11, -4, -5,-22, -2,  7;
/M: SY='R';  M= -5,-17,-21,-13,-10, -7,-19,-15,-11,  7,-12,  4,-15,-13, 14, 48, -9,-19,  1, -9, -1, -5;
/M: SY='E';  M=  0,  0, 10, 10, 60,-40,-20,  0,-30, 20,-10,-10,-10, 10, 20,-10,  0,-20,-30,-10,-20, 50;
/M: SY='A';  M= 23, -2,-24, -2, -3,-12, -3,-16, -1, -2,-13, -5, -2,-13, -3,-10, 22, 15,  5,-39,-26, -8;
/M: SY='K';  M=  5, -3,-29, -1, 13,-11,-10,-19,-18, 30,-19, 16, -3,  4,  6, 17,  0,-10,-14,-22,-13,  7;
/M: SY='R';  M=-10,-20,-20,-10,-10,-10,-20,-10,-30, 10,-20,  0,-20,-10, 30, 80,-10,-30,-10,  0,  0,  0;
/M: SY='Q';  M= 10,-10,-20,-10, 20,-30,-20,  0,-20,  0,-20,-10,-10,  0, 80, 30,-10,  0,-30,-10,-10, 40;
/M: SY='Q';  M= 17, -6,-24, -6, 14,-24,-13, -9,-14,  6,-17,  0, -6, -1, 48, 16, -3,  1,-17,-23,-18, 24;
/M: SY='R';  M= -5,-15,-21, -9,  0,-14,-19, -9,-27, 12,-20,  1,-15, -5, 36, 61, -9,-21,-15, -5, -3,  9;
/M: SY='K';  M= -2, -4,-28, -2, 14,-10,-12,-18,-22, 34,-20, 16, -4,  6,  6, 24, -2,-14,-18,-16, -8,  8;
/M: SY='L';  M=-10,-10,  0,-10,-10, 20,-20,-10, 20,-20, 40, 20,-20,-30,-20,-20,-20,  0, 10,-20, 30,-10;
/M: SY='N';  M=  0, 41,-13, 22, -7,-16, -1,-11, -6,  0,-19, -4, 70,-27,-10,-19,  0,  7,-20,-66,-36, -9;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-30,-50,-40,100,-30,-30,  0,-10, 20,-20,-10,-40,-30,-10,-10,-20, 10, 10, 30,-40;
/M: SY='L';  M=-10,-10,  0,-10,-10, 20,-20,-10, 20,-20, 40, 20,-20,-30,-20,-20,-20,  0, 10,-20, 30,-10;
/M: SY='I';  M= -1,-19,-17,-36,-27,  3,-11,-19, 55,-20, 23, 11, -3,-30,-20,-29,-11,  0, 36,-29, -5,-27;
/M: SY='T';  M=  8,  0,-22, -7, -9,-17,-15,-19, -5,  1, -7,  1,  7,  0, -1,-19, 19, 34,  1,-41,-11, -6;
/M: SY='Q';  M= 10,-10,-20,-10, 20,-30,-20,  0,-20,  0,-20,-10,-10,  0, 80, 30,-10,  0,-30,-10,-10, 40;
/M: SY='T';  M= 10,  0,-20,-10,-20,-20,-20,-20,  0,-10,  0,  0, 10,  0,  0,-30, 20, 50, 10,-50,-10,-10;
/M: SY='E';  M=  0,  0, 10, 10, 60,-40,-20,  0,-30, 20,-10,-10,-10, 10, 20,-10,  0,-20,-30,-10,-20, 50;
/M: SY='L';  M=-10,-10,  0,-10,-10, 20,-20,-10, 20,-20, 40, 20,-20,-30,-20,-20,-20,  0, 10,-20, 30,-10;
/M: SY='Y';  M=-40,-30,-60,-10,-20, 30,-30,  0,-10,-10, 30,-10,-40,-20,-10,  0,-20,-10, 10, 50, 90,-20;
/M: SY='S';  M= 21,  0,-24,  0,  0,-14,  0,-14, -6,  0,-16, -9,  0,-10, -2,-10, 29, 16, -2,-38,-28, -6;
/M: SY='H';  M=-20,-20,-50,-20,  0,-30,-30,140,-20,-20,-10, 20,-10, 10,  0,-10,-10,-20,-30,-50,  0,  0;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-30,-50,-40,100,-30,-30,  0,-10, 20,-20,-10,-40,-30,-10,-10,-20, 10, 10, 30,-40;
/M: SY='M';  M=  7,-20,-20,-31,-19,-10,-19,  1, 29,  3, 19, 37, -3,-37,-16,-10,-16,  1, 19,-30, -7,-19;
/M: SY='G';  M=  6, -2,-29, -6, -5,-22, 31,-17,-12, -4,-20,-18, -2, -8,  3, -7, 13, -1,-22, -9,-22, -5;
/M: SY='R';  M= -6, -3,-21, -4, -3,-10,-14,-12,-22, 16,-20,  5,  4, -9, 15, 43, -6,-17,-14,-18,-10,  1;
/M: SY='K';  M=  0,  0,-30,  0, 20,-10,-10,-20,-20, 40,-20, 20,  0, 10,  0, 10,  0,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='I';  M=  0,-14,-16,-21,-18, -4,-17,-10, 18, -8, 14, 16, -6,-23, -7, -7, -8,  5, 14,-27,  0,-14;
/M: SY='D';  M=  0, 25,-32, 42,  6,-34, 10,-22,-28,  9,-15,-14,  5, -4, -9, -7,  0,-12,-22,-23,-14, -2;
/M: SY='T';  M=  6, -2,-19, -9, -8,-16,-14, -7, -7,  2, -8,  4,  9,-13,  8,  2,  8, 15, -6,-34,-14, -4;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_05 which contains 572'214 sequence entries.

Total number of hits	30 in 30 different sequences
Number of true positive hits	30 in 30 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	DBINO
Version [info]	4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

30 sequences

INO80_ARATH (Q8RXS6), INO80_ASPCL (A1C9W6), INO80_ASPFU (Q4WTV7),

INO80_ASPNC (A2R9H9), INO80_ASPOR (Q2UTQ9), INO80_ASPTN (Q0CA78), 
INO80_CANAL (Q59KI4), INO80_CANGA (Q6FV37), INO80_COCIM (Q1DUF9), 
INO80_CRYNB (P0CO17), INO80_CRYNJ (P0CO16), INO80_DEBHA (Q6BGY8), 
INO80_DROME (Q9VDY1), INO80_EMENI (Q5BAZ5), INO80_EREGS (Q74Z27), 
INO80_GIBZE (Q4IL82), INO80_HUMAN (Q9ULG1), INO80_KLULA (Q6CNY4), 
INO80_LODEL (A5E0W5), INO80_MOUSE (Q6ZPV2), INO80_NEOFI (A1CZE5), 
INO80_NEUCR (Q872I5), INO80_PHANO (Q0UG82), INO80_PYRO7 (A4R227), 
INO80_SCHPO (O14148), INO80_SCLS1 (A7EQA8), INO80_USTMA (Q4PGL2), 
INO80_VANPO (A7TJI3), INO80_YEAS7 (A6ZU34), INO80_YEAST (P53115)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

6 PDB

5NBN; 6HTS; 7ZI4; 8A5A; 8A5O; 8EUF