PROSITE logo

PROSITE entry PS51488


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry

Entry name [info] KBD
Accession [info] PS51488
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-APR-2010 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE;
29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51488
Associated ProRule [info] PRU00821

Name and characterization of the entry

Description [info] KBD domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.6565362; R2=0.0132355; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3196.4665527; R2=4.2466488; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=518; H_SCORE=5396; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=366; H_SCORE=4751; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-30; I=-30; B1=-300; E1=-300; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='F';  M= -8,-21,-23,-20,-13,  8,-21,-18, -3,-21,  4, -3,-17,  5,-17,-18, -8, -4, -7,-21, -6,-15;
/M: SY='P';  M= -8,-18,-29,-17,-12, -6,-23,-10,  0,-14,-12, -6,-14, 15,-10,-17, -4, -4, -8,-14,  7,-15;
/M: SY='R';  M=-20,-16,-27,-20,-10, 12,-23, -6,-20, 11,-10, -7, -6,-23, -6, 41,-13,-10,-14,-10,  3,-10;
/M: SY='H';  M= -9,  8,-22,  1,  2,-22,-16, 20,-19, -3,-19, -7, 15,-14, 14, -1,  6,  9,-20,-29, -6,  7;
/M: SY='V';  M= -2,-24,-18,-24,-25, -8,  2,-25,  5,-22,  5,  2,-20,-27,-25,-20,-11, -8, 16,-25,-14,-25;
/M: SY='S';  M= -3,-16,-18,-21,-16,  7,-19,-18,  7,-21, -6, -3, -6,-17,-15,-18,  8,  4,  5,-23, -3,-16;
/M: SY='P';  M=-15,-25,-31,-24,-14, 22,-25,-20,-11,-19,-11,-11,-20, 33,-24,-20,-15,-10,-16,-11, -2,-19;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E';  M=-15, 10,-28, 16, 22,-12,-19, -2,-24, -1,-16,-14,  1,-11, 11, -5, -4,-10,-24,-22, -8, 18;
/M: SY='D';  M=-15, 19,-33, 34, 22,-35,-15, -6,-32, -1,-28,-25,  3, 24,  1,-11, -3,-10,-30,-35,-23, 10;
/M: SY='D';  M= -8, 25,-24, 37, 22,-31, -9, -3,-31, -1,-28,-25, 13, -8,  4, -8, 13,  0,-24,-38,-20, 13;
/M: SY='E';  M=-12, 19,-30, 31, 51,-32,-18,  0,-32,  8,-22,-22,  4, -2, 16, -2,  0,-10,-30,-32,-20, 34;
/M: SY='E';  M= -4,  7,-24, 14, 41,-27,-14, -3,-27,  4,-23,-20,  3, -3, 14, -3, 13,  0,-24,-33,-20, 27;
/M: SY='I';  M=-10,-30,-27,-37,-27,  3,-37,-27, 40,-30, 30, 20,-23,-23,-20,-27,-23,-10, 24,-20,  0,-27;
/M: SY='V';  M= 16,-24,-10,-27,-24, -6,-20,-27, 17,-17,  4,  4,-24,-24,-24,-20, -4,  0, 34,-27,-13,-24;
/M: SY='R';  M=-14,-10,-30,-10, -6,-23,  9, -6,-33, 14,-23,-13,  0,-20,  0, 41, -7,-13,-23,-20,-16, -6;
/M: SY='I';  M=  9,-24,-24,-34,-24, -6,-27,-27, 31,-24, 10, 10,-17,-17,-17,-27,-10, -7, 20,-20, -6,-24;
/M: SY='N';  M= -7, 24,-23, 10, -6,-23, 22,  0,-26, -6,-30,-20, 41,-20, -6, -6,  7, -6,-30,-34,-23, -6;
/M: SY='P';  M= -4,-14,-30, -7,  0,-27,-14,-17,-20,-10,-30,-20,-10, 58, -7,-17,  6,  0,-24,-33,-27, -7;
/M: SY='R';  M=-17, -7,-30, -7,  6,-26,-20,  3,-27, 24,-20, -7,  0,-17, 26, 51, -7,-10,-23,-20,-10, 13;
/M: SY='E';  M= -9, 12,-30, 21, 26,-32, 11, -6,-35, -2,-25,-22,  4, -9,  3, -9,  0,-13,-30,-29,-23, 14;
/M: SY='W';  M=-15,-21,-36,-23,-13, -9,-24,-19,-10,  6,-14, -7,-17,-21, -6,  9,-22,-16,-12, 35,  5,-10;
/M: SY='W';  M= -9,-26,-32,-28,-25, -5,  2,-25,  0,-25,  2, -1,-20,-24,-20,-23,-20,-17, -6, 15, -3,-23;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='I';  M= -4,-18,-21,-25,-18, -6,-22,-16, 20,-18,  4, 17,-10,-17, -8,-18, -1,  0, 12,-26, -6,-15;
/M: SY='R';  M=-11, -5,-21,-10, -5,-15,-20, -9,-21, 11,-15,-10,  0,-15,  1, 33,  4, 18,-11,-25,-10, -5;
/M: SY='G';  M= -4,-10,-30,-10,-16,-28, 51,-16,-38, -9,-28,-18,  0,-20,-14, -1, -2,-18,-28,-20,-26,-16;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='E';  M=  3,  6,-26, 11, 45,-28,-16, -4,-26,  6,-18,-18, -2, -2, 14, -4,  2, -8,-24,-28,-20, 29;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='Y';  M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='R';  M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='H';  M=-20, -7,-30, -7, -4,-10,-22, 51,-24,  3,-16, -3,  1,-22,  6, 20,-12,-15,-23,-14, 23, -4;
/M: SY='A';  M= 24, -9,-16,-11, -5,-22, -4,-17,-15,-10,-21,-15, -6, 11, -7,-17, 15,  4,-10,-29,-22, -7;
/M: SY='G';  M=  3,  0,-28,  5, -4,-30, 15,-16,-29,-11,-26,-20, -3, 13,-11,-18, -1,-11,-24,-27,-26, -9;
/M: SY='V';  M= -5,-25,-22,-24,-18,-10,-25,-20, 12,-15, -1, 11,-25, 11,-17,-18,-12, -5, 16,-28,-14,-19;
/M: SY='P';  M=-15,-22,-40,-16, -6,-19,-20,-17,-23, -2,-25,-17,-19, 36, -7,  3,-16,-14,-27, 11,-12,-10;
/M: SY='P';  M= -9,  1,-33,  9,  1,-32,  5,-14,-31,  2,-30,-20, -2, 20, -6, -7, -5,-13,-28,-27,-24, -4;
/M: SY='K';  M=-10,  2,-31,  1,  5,-28,-16, -9,-25, 20,-30,-15,  6, 20,  1,  8, -6, -8,-25,-28,-19,  1;
/M: SY='P';  M=-17, -7,-31, -2, -7,  6,-23, -5,-15,-12,-14,-13,-11, 13,-14,-15,-13,-10,-19, -8, 13,-12;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-27,-27,-17, -2,-29,-22, 16,-25, 23, 10,-25,  3,-17,-22,-23,-10,  4,-23, -8,-19;
/I:         I=-7; MD=-25;
/M: SY='D';  M= -9, 15,-20, 22, 22,-25,-11,  2,-21,  4,-16,-12,  5, -5, 17, -1,  0, -7,-20,-21,-12, 19; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='E';  M= -9, -4,-22,  1, 15,-18,-14, -4,-18,  7,-16,-11, -4, 14,  5, 11, -4, -7,-18,-18,-14,  8; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-25;
/M: SY='D';  M=  5, 22,-24, 31, 19,-32, -9, -6,-28, -1,-22,-22,  6, -8,  1,-11,  3, -7,-20,-32,-20, 10;
/M: SY='D';  M=  1,  9,-22, 15, -1,-19,-14,-12,-13,-12,  1, -9, -4,-16, -9,-16, -7, -7, -9,-28,-14, -5;
/M: SY='S';  M=  0, 13,-15, 16,  3,-23, -7,-10,-23, -7,-26,-20, 10,-10, -2,-10, 25, 19,-13,-38,-18,  0;
/M: SY='D';  M= -6, 21,-18, 26,  5,-25,-11, -9,-25, -6,-24,-21, 11,-10, -3,-10, 17, 17,-15,-37,-17,  1;
/M: SY='C';  M=  4, -6, 32,-10,-10,-20,-10,-16,-23,-16,-27,-20,  0,-20,-10,-16, 24, 10,-10,-43,-23,-10;
/M: SY='Y';  M= -7,-19,-19,-19,-19, 10,-24, -2,  5,-13, -3, -1,-17,-26,-14,-13, -4,  0,  9, -4, 30,-19;
/M: SY='V';  M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='R';  M=-16,-10,-32, -8,  4,-26,-20, -2,-26, 17,-22,-10, -4,  6, 16, 38, -8,-10,-24,-22,-14,  6;
/M: SY='F';  M=-18,-30,-22,-40,-30, 63,-32,-22, 10,-30, 12,  4,-20,-28,-36,-22,-20,-10,  6,  4, 24,-30;
/M: SY='A';  M= 33, -6,-10,-12, -6,-20,  0,-16,-14,-10,-18,-14, -2,-10, -6,-16, 23,  8, -4,-28,-20, -6;
/M: SY='K';  M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='N';  M= -4,  6,-22, -2, -4,-24,  7, -7,-22, -6,-21,-13, 12,-15,  5, -6,  8,  9,-20,-27,-17,  0;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_03 which contains 571'609 sequence entries.


Total number of hits 11 in 11 different sequences
Number of true positive hits 11 in 11 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] KBD
Version [info] 4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
11 sequences

SPRE1_HUMAN (Q7Z699), SPRE1_MOUSE (Q924S8), SPRE1_XENTR (Q66JG9), 
SPRE2_DANRE (Q6NYK3), SPRE2_HUMAN (Q7Z698), SPRE2_MOUSE (Q924S7), 
SPRE2_PONAB (Q5RDN2), SPRE2_RAT   (Q3C2P8), SPRE2_XENTR (Q5Y171), 
SPRE3_HUMAN (Q2MJR0), SPRE3_MOUSE (Q6P6N5)
» more