 |
|
| Entry: PS51501 |
General information about the entry
| Entry name [info] | ZF_DNL |
| Accession [info] | PS51501 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JUL-2010 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 12-AUG-2020 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51501 |
| Associated ProRule [info] | PRU00834 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Zinc finger DNL-type profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=98; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=93; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5998648; R2=0.0072396; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6019.4628906; R2=16.9158573; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=954; H_SCORE=22157; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=677; H_SCORE=17471; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-6; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='A'; M= 4, -4,-20, -5, -1,-13, -1,-13, -4, 1, -5, 0, -4,-10, -3, -4, 1, -3, -7,-21,-11, -3; /M: SY='P'; M= 2,-12,-24, -9, 6,-24,-10, -4,-12, 5,-16,-15,-16, 36, 3, -6, -3, 1,-16,-26,-15, 2; /M: SY='R'; M= 0, 0,-16, 5, 10,-20,-12,-11,-21, 11,-16, -4, -1, -6, 12, 19, 1,-11,-15,-20,-13, 9; /M: SY='R'; M= -4, -6,-26, -1, -3,-23, 1, -7,-22, 4,-19,-12,-10, 13, 8, 20, -5,-14,-20,-15,-13, -2; /M: SY='S'; M= 5, -2,-21, 1, 0,-15,-12,-10,-12, 2,-12, -6, -5, -8, 7, 7, 11, 5, -7,-26,-10, 0; /M: SY='Y'; M=-17,-20,-35,-14,-14, 19,-24, -5, 1, -4, 24, 9,-23,-24,-13, -5,-16, -5, 8, 9, 44,-15; /M: SY='L'; M= -1, -7,-20, -5, -5, -6,-19, -6, 3, -3, 9, 8, -9,-20, -4, -5, -9, -1, 4,-20, 7, -5; /M: SY='I'; M= 3,-15,-15,-22,-19, 10,-18,-15, 28,-13, 21, 15,-11,-31,-18,-16,-12, 2, 23,-26, 6,-19; /M: SY='T'; M= 9, -8,-17,-10, -5,-12,-17,-13, 4, -5, 0, 3, -6,-15, 5, -6, 3, 12, 6,-30, -8, -2; /M: SY='F'; M=-24,-26,-17,-39,-31, 72,-30,-26, -4,-11, 18,-17,-12,-35,-25,-10,-12,-17, 6, 11, 30,-32; /M: SY='T'; M= 11, -1,-21,-10,-18,-19,-19,-19, 1, -8, 0, 3, 8, -3, -1,-26, 17, 44, 10,-48,-11,-10; /M: SY='C'; M=-28,-19,158,-28, 11,-29,-39,-47,-19,-28, 0,-19,-10,-29,-19,-19,-19,-19,-19,-20,-57, 1; /M: SY='N'; M= 1, 16,-19, 5, -1,-14, -2,-15, -9, 7,-15, 2, 30,-12, -2, -7, 1, 4,-16,-40,-21, -2; /M: SY='A'; M= 3, -6,-23, -6, 0,-12,-13, -9, 2, 3, -5, 1, -7, 0, -7, -8, -5, -2, 0,-29, -8, -4; /M: SY='C'; M=-24,-15,144,-22, 8,-30,-36,-46,-19,-26, -1,-18, -8,-27,-17,-20,-16,-15,-17,-24,-55, 0; /M: SY='G'; M= 3, 13,-23, 8, 0,-26, 21,-16,-13, 0,-18,-13, 17, -6, -6,-14, 4, -4,-23,-26,-27, -3; /M: SY='T'; M= 3, 2, -7, -4, 4,-23,-13, -8,-11, -1, -9, -3, 10, -4, 5,-13, 8, 12,-11,-36,-20, 6; /M: SY='R'; M= -8,-16,-23, -8, -5,-12,-14,-12,-28, 14,-20, 1,-16, -4, 22, 63, -8,-26,-13, -3, -3, 1; /M: SY='S'; M= 11, 0,-20, -5, -3,-15, -2,-11, -3, -1,-12, -7, 6,-12, -3,-12, 21, 16, -5,-34,-21, -7; /M: SY='A'; M= 14, -3,-22, -7, -7,-14, -6,-18, 3, -5, -7, -3, 1,-13, -1,-12, 9, 14, 5,-34,-17, -6; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='R'; M=-10,-11,-33, -8, 7,-12,-16, 16,-22, 17,-16, 13,-11, 3, 5, 19, -6,-18,-19,-11, 1, 4; /M: SY='M'; M= 2, -5,-21, -8, -6,-11,-12,-11, -7, 4, -3, 7, -2, -6, 2, 1, 0, 7, -5,-27, -6, -4; /M: SY='F'; M= -7,-24,-24,-41,-33, 44,-21,-24, 30,-15, 19, -2, -7,-36,-25,-18,-11, -7, 26,-13, 10,-33; /M: SY='S'; M= 8, 7,-13, 0, -5,-11, -4,-13, -5, -3,-16,-12, 16,-15,-10,-14, 26, 19, -7,-40,-23,-10; /M: SY='K'; M= -4, -8,-27, -5, 12,-11,-13,-13,-23, 27,-20, 5, -9, 19, 5, 19, -4,-13,-20,-16, -8, 6; /M: SY='H'; M= -2, -7,-24, -5, 6,-22,-19, 24,-11, -5, -7, 1, -9, -4, 16, 2, -6, -6,-14,-26, -4, 10; /M: SY='A'; M= 26, -1,-20, -2, -1,-19, 5,-19, -4, -2,-13, -2, 0,-11, 1,-11, 16, 9, 0,-38,-35, -4; /M: SY='Y'; M=-38,-29,-56,-12,-19, 31,-28, -4,-11, -8, 26,-10,-38,-20,-10, 0,-19,-12, 7, 50, 82,-19; /M: SY='H'; M= -8, -7,-28, -2, 13,-28,-22, 51,-20, -3, -9, 3, -6, 8, 6, -9, -4,-10,-22,-32, -6, 11; /M: SY='K'; M= -5, 0,-18, -2, 8,-18,-15, 10,-19, 11,-17, 7, 7, -2, 7, 9, -3,-10,-21,-30,-14, 6; /M: SY='G'; M= 0, 0,-40,-10,-20,-30, 80,-30,-10,-10,-20,-20, 0,-10,-20,-20, 0,-20,-30, 10,-30,-20; /M: SY='V'; M= 7,-12,-19,-20,-24, -3,-22,-22, 27,-15, 11, 5, -5,-24,-17,-21, -1, 21, 30,-36, 0,-21; /M: SY='V'; M= 10,-20,-20,-20,-29, 9,-30,-28, 39,-18, 10, 2,-19,-40,-29,-10,-10, 10, 48,-30, 9,-29; /M: SY='F'; M= -6,-19,-20,-31,-26, 30,-19,-20, 28,-16, 23, 3,-10,-31,-21,-19,-12, -4, 23,-15, 13,-26; /M: SY='I'; M= 8,-17,-20,-23,-25, 3,-16,-24, 39,-18, 12, 5,-11,-32,-21,-18, -8, 5, 37,-30, -2,-25; /M: SY='Q'; M= 3,-12,-20,-10, 6,-21,-19, -5,-19, 8,-14, 3, -9, -5, 41, 34, -7, -5,-17,-14, -7, 17; /M: SY='C'; M=-28,-20,158,-29, 8,-28,-39,-49,-16,-29, 1,-19,-11,-31,-21,-19,-19,-18,-16,-21,-56, -2; /M: SY='P'; M= -3, -2,-21, 10, 9,-33, -9, -6,-27, 7,-21,-24,-14, 44, 1, -1, -3, -5,-26,-28,-19, 2; /M: SY='G'; M= 1, 5,-32, -2, -7,-22, 38,-19,-12, 2,-20,-10, 8, -8,-13,-12, 6, -9,-24,-12,-24,-11; /M: SY='C'; M=-28,-19,157,-29, 8,-30,-33,-49,-19,-29, -1,-20, -9,-29,-20,-20,-19,-20,-21,-18,-58, -1; /M: SY='Q'; M= 2, 2,-20, 1, 14,-23, -6, -1,-18, 10,-17, 0, 4, -2, 15, 6, -1, -9,-22,-23,-18, 14; /M: SY='N'; M= 7, 7,-18, -2, -6, -6,-10,-17, 5, 1,-11, -1, 20,-21,-12,-10, 5, 8, 2,-42,-18,-10; /M: SY='R'; M=-13,-19,-26,-16, -5, -2,-17, 6,-14, -4, -4, 2,-21,-12, 10, 18,-13,-18,-11, 11, 14, -1; /M: SY='H'; M=-18,-16,-47,-17, 0,-28,-27,124,-19,-16,-11, 19, -4, 8, -1,-10, -9,-18,-29,-50, -3, 0; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='L'; M= -6,-10, -6,-12,-10, 14,-18,-13, 20,-13, 28, 16,-16,-26,-18,-16,-15, 0, 13,-21, 20,-11; D=-12; /I: I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25; /M: SY='I'; M= -1,-17,-15,-29,-21, 4,-14,-17, 42,-15, 19, 9, -6,-28,-18,-23,-10, -1, 30,-25, -2,-21; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='A'; M= 22, -3,-24, -3, 0,-13, -6,-16, 0, 0, -9, 2, -4,-11, 6, -5, 9, 9, 4,-35,-22, -1; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='D'; M= 0, 38,-28, 69, 5,-36,-10,-20,-30, -1, -6,-25, 8,-12,-11,-10, -1, -9,-14,-35, -8, -4; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='H'; M= -7, 9,-24, -4, -3,-18,-14, 38, -9, -4,-14, 7, 30,-11, -2, -9, -4, -4,-20,-51,-20, -3; /M: SY='L'; M= -9,-10, -5,-12,-13, 16,-19,-11, 19,-18, 32, 15,-14,-28,-17,-18,-16, 2, 11,-21, 23,-12; /M: SY='G'; M= -1, 4,-31, -7,-12,-25, 51,-19,-10, -3,-19,-11, 11,-10,-15,-16, -1,-14,-27, -8,-28,-14; /M: SY='W'; M=-27,-32,-11,-33,-15, 18, -8,-33, -2,-16, 3, -9,-37,-31,-16, -9,-21,-25, -5, 79, 27,-16; /M: SY='F'; M=-14,-25,-28,-38,-31, 57,-23,-24, 7,-11, 15,-12,-11,-32,-23,-13, -6, -9, 12, 6, 21,-31; /M: SY='G'; M= 0, -3,-27, -4, 0,-15, 3, 0,-10, 1, -8, -2, -1,-10, -5, -8, 1, -6,-13,-19,-10, -3; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='D'; M= -2, 23,-21, 39, 15,-34, -8, -8,-27, 3, -9,-17, 8, -7, 1, -9, -2,-10,-21,-27,-11, 10; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='I'; M= 1, -3,-15, -7, -6, -5, -3, -9, 4, -4, -3, -5, 3, -5, -4, -9, -1, 2, -1,-17, -7, -7; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='P'; M= -2, -3,-15, -1, 4,-12, -1, -9,-11, 6,-10, -5, -7, 9, -2, -2, 1, -3,-12, -6, -6, 1; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='G'; M= -4, -2,-24, -2, 1, -9, 3,-10,-14, 3, -7, -6, -2, -9, -2, -3, -3,-12,-15,-10, -6, -1; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='K'; M= -2, -4,-20, -2, 6,-11,-10, -1,-15, 12,-13, 2, -3, 3, 5, 12, 0, -8,-13,-16, -7, 3; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='Q'; M= 1,-10,-22,-11, 0,-10, -7,-12, -9, 1,-10, -5, -9, -6, 3, 0, 1, -4, -7,-10, -9, 0; /M: SY='N'; M= 5, 12,-21, 12, -4,-20,-12,-12,-10, 0,-10, -5, 14, -9, -4,-11, 9, 13, -6,-42,-15, -5; /M: SY='I'; M= 3,-13,-17,-21,-18, 1,-11,-19, 32,-15, 14, 6, -8,-26,-18,-20, -5, 3, 24,-27, -3,-19; /M: SY='E'; M= 0, 0, -2, 5, 38,-22,-17, -6,-24, 15, -9, -9, -5, 2, 12, -8, 2,-14,-23,-14,-15, 30; /M: SY='D'; M= 1, 22,-19, 40, 18,-36, -9,-14,-28, 8,-12,-15, 4, -4, 4, -3, 1,-10,-21,-27,-14, 12; /M: SY='I'; M= -9,-18,-22,-23,-19, 9,-20, -5, 21,-14, 21, 9,-13,-25,-15,-17,-12, -1, 17,-14, 17,-19; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='L'; M= 0,-10, -9,-14,-11, 8,-15, -8, 16,-10, 23, 18,-10,-25,-13,-14,-12, 2, 10,-22, 10,-11; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='K'; M= 6, 1,-17, 1, 3,-11, -4,-12, -9, 7, -8, 4, 0, -7, 2, 3, 1, -3, -7,-23,-13, 1; D=-3; /I: I=-3; MD=-6; /M: SY='A'; M= 9, 2,-14, 0, 9,-16, -9, -8, -7, 6,-10, 1, 5, -5, 4, -7, 6, 4, -7,-29,-18, 7; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-6; IM=0; DM=-6; /M: SY='K'; M= -1, 1,-20, 1, 8,-12,-10, -8,-15, 17,-14, 7, 3, 0, 9, 13, -2, -6,-15,-18, -9, 7; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='G'; M= 1, 2,-24, -4, -5,-21, 39,-18, -9, -2,-13,-10, 3, -7, -8,-12, 0,-12,-21, -3,-21, -6; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='E'; M= 3, -1, -7, 1, 22,-22,-14, 1,-11, 8, -7, 0, -2, -2, 13, -4, -2, -7,-14,-18,-14, 20; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='E'; M= 5, -1,-13, 0, 11,-14, -9, -9,-12, 9,-11, -1, 0, -1, 8, 1, 7, 2,-11,-20,-12, 9; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='V'; M= 3,-17,-16,-21,-22, 12,-22,-19, 28,-13, 13, 5,-13,-31,-19,-10,-10, 4, 30,-21, 8,-21; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='K'; M= 2, -6,-13, -5, 2,-11,-14,-16, -6, 7, -9, 1, -6, -4, 1, 4, 1, 0, -3,-21, -8, 0; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='R'; M= -3,-10,-21, -9, -3, -5,-13,-16,-10, 10,-10, 3, -8, -6, 3, 17, 1, -5, -5,-11, -3, -3; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='G'; M= 4, -1,-24, -3,-14,-14, 11,-19, 3, -8, -3, -4, -1,-17,-13,-13, 0, 1, 0,-20,-12,-14; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='T'; M= 1, -3,-20, -6, -5,-13, -2,-12, -3, -3, -5, -6, 0, -3, -3,-10, 1, 4, -6,-22, -8, -5; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='G'; M= 0, 0,-19, -3, -8,-12, 15,-16, 1, -7, -3, -7, 0,-11,-13,-16, -1, -3, -8,-18,-11,-10; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='D'; M= 3, 6,-17, 9, 4,-22, 5,-15,-14, 0,-11,-12, 2, -1, -1, -9, -1, -6,-16,-22,-18, 1; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='D'; M= 2, 2,-17, 7, 0,-12, -5,-15, -5, -3, 0, -5, -4,-14, -5, -7, -3, -5, -2,-20, -6, -2; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='A'; M= 4, 3,-15, 3, 2,-19, -3,-15, -2, -3, -4, -7, 3,-12, -2,-13, -1, 0, -3,-24,-13, 1; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='L'; M= -1, -4,-12, -5, -9, 3, -9,-15, 9,-10, 11, 3, -4,-24,-16,-14, -8, -1, 6,-21, 4,-11; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='E'; M= 1, 2,-12, 5, 15,-19, -3,-12,-13, 4, -8,-10, -3, -6, 1,-10, 2, -8,-14,-11,-12, 9; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='D'; M= -1, 3,-21, 6, -5,-15, -9, -6, -2, -6, -1, -6, -1, -9, -8,-11, -6, -3, -3,-27, -6, -7; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='E'; M= -4, -5,-13, -2, 1, -3,-15,-17, -4, -4, -1,-10, -9,-17, -6,-10, -3, -6, -2, -4, 1, -2; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='E'; M= 1, 3,-20, 12, 13,-26, 0,-11,-19, 3,-11,-17, -7, 8, 1,-10, 0, -8,-19,-17,-14, 7; D=-3; /I: I=-3; DM=-6; /M: SY='E'; M= 2, 7,-14, 18, 20,-27,-10,-11,-22, 4, -9,-12, -4, -5, 8, -6, 3, -7,-18,-15,-11, 15; /M: SY='A'; M= 6, 4,-25, 4, -8,-13, 1,-19, -4, -6, -7,-10, 3,-16, -1, -9, 2, 2, -5,-26,-13, -7; /M: SY='D'; M= 4, 4,-17, 7, -2,-13,-12,-15, 0, -4, 2, 0, 0,-15, -5, -9, 0, 1, 2,-31, -8, -4; /M: SY='A'; M= 6, 0,-22, -2, 0,-19, 5,-17, -6, 2,-11, -4, 2, -8, -1, -4, -2, -6, -9,-23,-19, -1; /M: SY='A'; M= 10, -1,-25, -3, 2,-16, -6,-11,-10, 3,-13, -6, 2, 6, 4, -9, 5, 6,-10,-32,-20, 0; /M: SY='E'; M= 4, 2,-17, 3, 10,-21, 1,-12,-12, 3, -9, -6, -1, -2, 5, -9, 1, -2,-16,-22,-15, 8; /M: SY='A'; M= 8, 0,-17, -1, 7,-13,-11,-13, -5, 3, -6, 0, 2,-10, 8, -5, 2, 1, -6,-29,-15, 6; /M: SY='E'; M= 6, 3,-20, 5, 12,-27, 9,-14,-17, 6,-16,-11, -1, 0, 4, -8, 7, -4,-21,-19,-22, 8; /M: SY='D'; M= 5, 6,-22, 8, 6,-24, -3, -3,-11, 0,-12, -6, 5, -8, 2, -7, 3, -4,-13,-30,-20, 3; /M: SY='N'; M= -1, 6,-20, 3, -6,-10, -3,-13, -4, -2, -5, -5, 10,-18, -7, -6, 1, -2, -7,-27,-11, -8; /M: SY='A'; M= 8, 3,-22, 2, 1,-19, -3,-18, -6, 3,-10, -3, 4, -4, -4,-12, 4, 6, -5,-31,-18, -2; /M: SY='A'; M= 1, -2,-21, -4, -4, 1,-14,-14, -1, -2, 1, -2, 0,-14, -2, -8, -4, -2, -1,-24, -3, -5; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 9 in 9 different sequences |
| Number of true positive hits | 9 in 9 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | ZN_FING |
| Feature description [info] | DNL-type |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
9 sequences
DNLZ_DANRE (A1L1P7 ), DNLZ_HUMAN (Q5SXM8 ), DNLZ_MOUSE (Q9D113 ), DNLZ_XENLA (Q0IH40 ), YA72_SCHPO (Q09759 ), ZIM17_YEAS1 (B3LPE4 ), ZIM17_YEAS6 (B5VQB0 ), ZIM17_YEAS7 (A6ZSH0 ), ZIM17_YEAST (P42844 )» more
|
| PDB [Detailed view] |
1 PDB
2E2Z |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission