Due to maintenance work, this service will be unavailable from
Mon Nov 11 17:30 until
Tue Nov 12 09:00
CET.
Apologies for the inconvenience.
PROSITE entry PS51516
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | SOX_C |
| Accession [info] | PS51516 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2010 CREATED;
07-APR-2021 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51516 |
| Associated ProRule [info] | PRU00849 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Sox C-terminal domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=124; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=119; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3774827; R2=0.0158878; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7341.2265625; R2=6.6471472; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=386; H_SCORE=9907; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=260; H_SCORE=9069; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='G'; M= 1,-10,-27, -8, -4,-26, 20,-17,-24,-12,-23,-16, -7, 4,-11,-16, 1,-10,-19,-26,-25, -8; /M: SY='S'; M= 4, -4,-20, -5, -6,-21, 0, -4,-18, -7,-23,-14, 3, -5, -6, -9, 11, 1,-12,-31,-17, -7; /M: SY='P'; M= -2,-16,-27,-15, -5,-18,-19,-14, -8, -7, -5, 0,-15, 18, -3,-11, -8, -7,-12,-25,-15, -5; /M: SY='M'; M= -4, -8, -8,-12, -3,-15,-19, -9, -5, -9, -4, 5, -7,-10, -2,-11, -8, -7, -6,-29,-14, -3; /M: SY='Q'; M= 5, -7,-22, -8, 1,-23,-13, 6,-15, -7,-14, -6, -4, -3, 12, -8, 4, -4,-16,-26,-11, 5; /M: SY='G'; M= 2, -8,-24, -9, -5,-23, 20,-14,-23,-13,-15,-11, -4,-16, -5,-13, 2, -6,-18,-24,-20, -5; /M: SY='I'; M= 8,-19,-19,-26,-19, -4,-20,-15, 15,-16, 5, 15,-16,-18,-11,-19, -6, -4, 12,-18, -1,-17; /M: SY='M'; M=-10,-14,-22,-18,-12, -7,-22, 11, 1,-14, 8, 20,-12,-10, -5,-11,-12, -1, -4,-25, -1,-10; /M: SY='G'; M= -1,-13,-29,-12,-11,-24, 19, -9,-26,-12,-20,-13, -7, 5,-12,-10, -5,-14,-23,-23,-21,-13; /M: SY='C'; M= -5, -9, 38,-16,-16,-18,-20,-20,-17,-19,-20,-16, -4,-14,-16,-20, 4, 3,-10,-41,-23,-17; /M: SY='P'; M= 5, -9,-26, -9, 1,-27,-15, -2,-17, -5,-20,-10, -8, 21, 8,-10, 0, -2,-19,-25,-16, 3; /M: SY='A'; M= 7,-11,-19,-12,-10,-16, -6,-17, -8,-14,-11, -9, -6, 2,-12,-16, 4, -1, -5,-29,-19,-12; /M: SY='P'; M= 5,-10,-23, -7, -1,-24, -9,-15,-19,-10,-28,-19, -5, 35, -5,-15, 15, 5,-18,-33,-24, -5; /M: SY='P'; M= 4,-19,-24,-16, -9,-16,-17,-20, -6,-15, -7, -8,-17, 25,-13,-19, -4, -4, -7,-28,-19,-13; /M: SY='A'; M= 9, -1,-20, -6, -1,-23, -4, 4,-17, -7,-14, -7, 4,-15, 9, -7, 5, -5,-16,-26,-13, 3; /M: SY='M'; M=-11,-22,-24,-26,-19, 10,-25, -7, 11,-17, 10, 20,-19,-12,-11,-15,-15, -8, 3,-11, 12,-16; /M: SY='Y'; M=-19,-22,-28,-23,-21, 32,-30, 13, 2,-13, 6, 2,-21,-30,-13,-12,-21,-10, -7, 24, 68,-21; /M: SY='Y'; M= -4, -7,-20,-12,-12, 11,-15, 2, -9,-11,-12, -9, 0,-21,-10,-11, 3, 0,-11, -6, 23,-12; /M: SY='G'; M= -2, -8,-25, -8,-11,-21, 22, -4,-27,-14,-25,-16, -1, -7,-10,-14, 7, -4,-22,-23,-13,-12; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='Q'; M= 7, -5,-21, -7, 9,-25,-13, -4,-13, 0,-12, -1, -6, -1, 18, -5, 0, -6,-15,-20,-14, 13; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='M'; M= -9,-14,-21,-18,-14, 2,-20, 8, 2,-12, 4, 18,-12,-21, -4,-10, -7, 0, -2,-14, 16,-11; /M: SY='Y'; M=-11,-10,-13,-14,-18, 7, -4, 1,-15,-14,-13,-10, -4,-26,-14,-13, -7, -8,-16, -3, 23,-18; /M: SY='T'; M= -5,-14,-18,-15,-12, 3,-19, -3, -5,-16, -7, -5, -9,-12,-13,-13, 3, 4, -1,-21, 3,-13; /M: SY='P'; M= -8, -7,-34, 2, 2,-31, -8,-14,-24, -8,-29,-20, -8, 49, -3,-15, -2, -8,-28,-30,-26, -3; /M: SY='N'; M= -1, 1,-20, -4, -1,-16, -8, 2,-14, -9,-11, -8, 5,-16, -5, -9, 2, 3,-11,-29,-11, -4; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='S'; M= 2, -4, 6, -7, -4,-16,-10, 0,-15, -8,-14, -8, -1,-12, 2, -8, 8, 4,-10,-24,-10, -1; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7; /M: SY='A'; M= 11, -8,-11, -9, -4,-13, -8,-10, -4, -6, -9, -5, -7, 0, -1, -9, 4, 0, -1,-17,-12, -3; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='H'; M=-11, -6,-25, -7, -1,-14,-20, 14,-18, 8,-13, -4, -3,-17, 7, 10, -5, -4,-16,-18, 6, 1; /M: SY='P'; M=-10,-10,-29,-10, -3,-20,-14, 2,-15, -5,-17, -7, -7, 7, 6, -3, -4, -4,-18,-21, -6, -1; /M: SY='H'; M=-15, 0,-26, -4, -6,-10, -8, 53,-25,-12,-18, -5, 10,-20, -2, -5, -5,-10,-24,-26, 8, -6; /M: SY='P'; M= -8, -9,-29, -7, -2,-22,-16, -2,-14, -9,-17, -6, -5, 28, 0,-11, -4, -6,-21,-30,-17, -3; /M: SY='A'; M= 3,-12,-22,-12, -7,-21, 0,-14,-12,-12,-13, -7, -9, -4, -1,-13, 3, -4, -9,-26,-18, -5; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='A'; M= 8,-12, -8,-13,-10,-18, -6, -7,-13,-13,-16,-10, -9, 3,-11,-16, 1, -4, -7,-27,-16,-12; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='H'; M= -9, -4,-28, -4, 1,-24, -1, 26,-24, -5,-21, -6, 2,-16, 18, -3, 1,-11,-26,-20, 1, 8; /M: SY='L'; M= 2,-19,-21,-21,-13, -8,-20,-18, 2,-17, 11, 7,-19, 2,-12,-17,-10, 0, -1,-23,-11,-14; /M: SY='G'; M= -1, -7,-30, -6, -9,-30, 58,-17,-39,-16,-29,-20, 0,-17,-14,-17, 0,-19,-30,-21,-29,-12; /M: SY='Q'; M=-10, -2,-31, -1, 18,-39,-20, 7,-20, 8,-21, -2, -2, 0, 53, 7, -1,-10,-30,-21,-12, 35; /M: SY='L'; M=-11,-18,-23,-19,-13, -1,-25, -1, 5,-22, 24, 9,-15,-15,-13,-15,-21,-10, -3,-24, -2,-14; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='P'; M= -7,-17,-36, -9, 0,-29,-17,-19,-20,-10,-30,-20,-16, 76, -9,-19, -3, -6,-27,-31,-29, -9; /M: SY='P'; M= -7,-17,-36, -9, 0,-29,-17,-19,-20,-10,-30,-20,-16, 76, -9,-19, -3, -6,-27,-31,-29, -9; /M: SY='P'; M=-11,-17,-39, -9, 0,-29,-20, -3,-21,-10,-29,-17,-16, 75, -7,-17,-10,-11,-30,-30,-23, -9; /M: SY='E'; M=-11, 12,-30, 22, 51,-32,-19, 1,-30, 9,-21,-18, 2, -2, 24, 0, 0,-10,-30,-30,-19, 37; /M: SY='A'; M= 13, -5,-17, -9, -3,-21,-10, -4,-16, -8,-19,-12, -2, 2, 0,-12, 13, 9,-11,-29,-15, -3; /M: SY='P'; M= -7,-13,-30,-12, -1,-24,-14,-11, -9, -9,-12, -4,-10, 13, 11,-11, -4, -8,-16,-25,-16, 3; /M: SY='P'; M= -8,-11,-33, -6, 3,-31,-10, -2,-23, -6,-27,-14, -8, 38, 8,-10, -2, -9,-28,-28,-20, 2; /M: SY='M'; M= 3,-17, -2,-24,-17, 1,-18,-16, 0,-17, 7, 11,-15,-21,-14,-17, -5, 2, 2,-23, -7,-15; /M: SY='D'; M= 0, 4,-21, 8, 7,-24, -5,-10,-20, -3,-19,-15, 0,-13, -3, -4, 6, -3,-11,-30,-19, 2; /M: SY='T'; M= -5, -4, 6, -6,-10,-17,-11,-16,-19,-12,-13,-13, -3,-20,-11, -8, 6, 9,-10,-33,-17,-11; /M: SY='A'; M= 4,-15,-22,-17, -9,-15, -8,-13, -6,-14, 2, 3,-14, -5, -2,-14, -6, -7, -8,-23,-14, -6; /M: SY='D'; M=-10, 27,-23, 32, 17,-28,-12, -3,-28, -1,-24,-22, 17,-10, 2, -7, 9, 6,-22,-36,-18, 9; /M: SY='Q'; M= -6, -4,-25, -2, 9,-20,-15, 10,-19, -3,-21,-10, -1, -3, 17, -4, 7, -2,-21,-22, -1, 11; /M: SY='L'; M= -6,-23, -5,-26,-18, 0,-25,-18, 11,-25, 23, 12,-20,-26,-16,-19,-13, -5, 6,-27, -7,-17; /M: SY='S'; M= -5, -4,-25, -4, 2,-22, -8, -1,-14, -8,-19,-10, 2, -1, 1,-10, 3, -5,-14,-30,-15, 0; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='P'; M= -5, -6,-18, -5, 0,-15,-12, 6, -9, -6,-13, -5, -3, 11, 4, -7, 1, -3,-12,-19, -7, 0; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10; /M: SY='H'; M= -4, 4,-26, 7, 7,-29,-13, 18,-24, -3,-23,-11, 4, -2, 16, -4, 5, -6,-24,-29,-10, 10; /M: SY='A'; M= 16,-11,-14,-14,-14,-17, 7,-20,-11,-14,-15,-11, -6,-16,-14,-17, 12, 5, 1,-27,-19,-14; /M: SY='E'; M=-15, 21,-30, 33, 39,-32,-17, 14,-33, 4,-23,-20, 8, -6, 12, -3, -1,-11,-30,-33,-14, 25; /M: SY='L'; M=-12,-29,-20,-32,-22, 21,-29,-18, 16,-28, 40, 20,-27,-29,-22,-19,-27,-10, 8,-15, 5,-21; /M: SY='W'; M=-13,-27,-30,-26,-12, 4,-26,-20, 2,-22, 21, 4,-29,-26,-14,-17,-29,-15, -6, 25, 5,-12; /M: SY='G'; M= 9, -6, -7, -8, -5,-25, 20,-16,-28,-13,-24,-18, -2,-15,-10,-16, 10, -5,-18,-29,-25, -7; /M: SY='D'; M=-15, 31,-30, 47, 39,-35,-15, 0,-35, 5,-25,-25, 11, -5, 9, -5, 0,-10,-30,-35,-20, 24; /M: SY='V'; M= -2,-29,-14,-31,-29, 0,-30,-27, 32,-20, 12, 16,-28,-28,-26,-20,-12, -2, 43,-28, -8,-28; /M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10, 0,-40, 0,-30,-30, 20,-10, 0,-10, 0,-10,-30,-40,-20, 10; /M: SY='R'; M=-18,-11,-29,-11, -1,-19,-21, -3,-25, 27,-15, -7, -3,-20, 7, 56,-12,-10,-17,-20, -9, -1; /M: SY='B'; M=-10, 18,-20, 14, 0,-20,-14, 11,-22, -6,-20,-14, 17,-14, -3, -6, 9, 16,-17,-34, -9, -2; /M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20, 0,-30, 10,-20,-20, 0, 0, 20, 0, 0,-10,-30,-30,-20, 40; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='D'; M=-16, 37,-29, 51, 30,-35,-12, 1,-35, 3,-27,-26, 18, -8, 6, -6, 1, -9,-30,-37,-20, 18; /M: SY='Q'; M=-10, 0,-30, 0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20, 0, 0,-10, 60, 10, 0,-10,-30,-20,-10, 40; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='L'; M= -8,-30,-18,-30,-22, 8,-30,-22, 22,-28, 43, 18,-30,-30,-22,-20,-26, -8, 17,-22, -2,-22; /M: SY='N'; M= -8, 19,-21, 13, 0,-21, -6, 1,-17, -4,-23,-10, 26, -6, -1, -7, 8, 0,-21,-36,-18, -1; /M: SY='Y'; M= -2,-13, -5,-18,-15, 5,-19,-10, -6,-16,-10, -8, -8,-21,-13,-16, 5, 5, -3,-15, 10,-15; /M: SY='S'; M= 6, -9,-19, -9, -3,-19, 0,-17,-13,-11,-17,-12, -7, -5,-10,-15, 7, 2, -4,-29,-20, -7; /M: SY='R'; M= 4,-11,-24,-12, -6,-17, -5, -9,-20, 0,-20,-13, -5, -2, -4, 7, 3, -4,-15,-20, -9, -8; /M: SY='K'; M= 2, -2,-23, -8, -4,-17,-16, 0,-14, 10,-16, -7, 2,-14, -1, 2, -2, -2,-11,-20, -2, -4; /M: SY='R'; M= -6, -7,-25, -5, 2,-24,-13, 2,-23, 3,-26,-14, 0, 6, 7, 12, 9, 0,-20,-30,-15, 2; /M: SY='D'; M= -7, 11,-27, 21, 19,-29,-16, -9,-22, -2,-20,-19, -2, 8, -1,-11, -2, -8,-17,-32,-21, 8; /M: SY='E'; M= -9, 4,-25, 10, 14,-21,-17, -8,-17, -5,-12, -8, -3, 2, 1,-10, 0, 1,-16,-31,-16, 7; /M: SY='A'; M= 17, -9,-19,-13, -3,-21, 5,-14,-13, -9,-11, -4, -9,-13, -3,-14, 1, -7, -7,-22,-18, -3; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='A'; M= 3,-11,-12,-13, -8, -6,-11,-11, 0,-10, 3, 3,-10, -2, -7,-11, -2, 3, -1,-17, -8, -8; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='G'; M= -2, -6,-21, -5, -9,-21, 27, -3,-25,-12,-22,-13, 0, -3, -9,-12, 3, -9,-20,-20,-17,-10; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='Y'; M=-13,-24,-24,-25,-21, 18,-21, -7, 4,-18, 14, 5,-21,-28,-18,-10,-20,-10, 1, -2, 23,-21; /M: SY='G'; M= -7,-13,-31,-14,-12,-23, 13, -5,-16,-15,-17, -4, -7, 1, -5,-16, -7,-15,-18,-23,-17,-11; /M: SY='Y'; M=-10,-13,-26,-14,-15, -3, -6, 7,-13,-13,-12, -7,-10,-11,-11,-13, -6, -2,-12, -9, 17,-16; /M: SY='H'; M= -9, -9, -6,-12,-11,-18, -8, 17,-18,-15,-11, -5, -5,-22, -4,-11, -5, -6,-13,-29, -6, -9; /M: SY='V'; M= -7,-10,-21, -9, -7,-13,-25,-18, 2, -9, -6, -4,-11, -8,-11, -8, -4, 4, 8,-29,-12,-11; /M: SY='G'; M= -1, -2,-10, -2,-11,-24, 19, -7,-29,-16,-20,-15, -1,-20,-13,-17, 0,-11,-20,-29,-20,-12; /M: SY='H'; M= -7, -6,-23, -6, 1,-19,-11, 8,-16, -5,-12, -5, -3,-16, 5, -4, 0, -1,-12,-27, -8, 2; /M: SY='A'; M= 5, -8,-20, -9,-12,-16, -9,-17, -2,-13, -8, 0,-10, -8,-12,-17, -1, -4, 3,-28,-16,-13; /M: SY='P'; M= -4, -2,-26, -2, 2,-27, -5,-10,-24, 3,-29,-16, 3, 15, 2, -3, 7, -2,-23,-30,-21, 1; /M: SY='L'; M= -3,-17,-17,-21,-18, -5,-11,-19, 4,-19, 10, 7,-15,-22,-16,-16, -5, 6, 8,-26,-10,-17; /M: SY='S'; M= 12, -4,-17, -8, -4,-23, 4,-12,-19, -8,-19,-12, 0,-12, 3,-10, 14, 9,-13,-26,-18, 0; /I: I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8; /M: SY='S'; M= 4, -4,-12, -4, -1,-15, 3, -7,-13, -5,-15, -9, -1, 3, 2, -7, 8, 0,-11,-17,-12, 0; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='A'; M= 8, -6,-10, -8, -6,-11, 2, -9, -8, -4, -9, -6, -3, -9, -5, -2, 5, 0, -2,-15,-11, -6; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='S'; M= 4, -5, 1, -7, -6,-12, 1,-11,-12, -8,-13,-10, -3, -1, -7,-10, 6, 4, -7,-18,-13, -7; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='S'; M= 1, -5,-11, -5, -4,-11, 3, -7,-10, -7,-12, -4, -1, 2, -3, -8, 9, 2, -8,-18,-11, -4; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='C'; M= 1, -4, 17, -6, -6,-11, -7,-10,-12, -9,-14,-11, -1,-11, -6, -9, 12, 9, -5,-24,-12, -6; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='D'; M= -4, 2, 1, 5, -5,-13, -2, -9,-12, -8,-11,-10, -1,-12, -8,-10, 1, -3, -4,-21,-12, -7; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='P'; M= -4, 0,-26, 2, -1,-18, 4, -6,-22, -8,-21,-16, 1, 5, -7,-12, -3, -9,-22,-18, -8, -6; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='G'; M= -1, 1,-23, 3, 0,-25, 13,-14,-27,-10,-26,-19, 3, -3, -7,-13, 12, 5,-20,-30,-22, -4; /M: SY='E'; M= -8, 13,-24, 16, 21,-26, -8, 6,-27, -1,-23,-18, 10, -9, 5, -5, 7, 0,-24,-32,-15, 13; /M: SY='S'; M= 3, 4,-15, -1, -6,-20, 10,-11,-22,-11,-26,-18, 13,-13, -6,-11, 24, 15,-15,-34,-20, -6; /M: SY='S'; M= 3, -7,-19, -8, -6,-15,-11,-13,-10,-13,-10,-10, -1, 4, -8,-14, 7, 3,-11,-31,-17, -8; /M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23, 7,-33,-23, 29,-30, 41, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 16,-20, 0,-23; /M: SY='I'; M= -4,-20,-26,-24,-17,-10,-26,-23, 20,-21, -1, 3,-11, -2,-13,-23, -1, -1, 10,-27,-10,-19; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='V'; M= 11,-25,-14,-29,-23, -4,-23,-26, 20,-20, 11, 7,-23,-23,-22,-21, -9, -3, 28,-25,-10,-23; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-33,-24, 16,-31,-22, 23,-29, 37, 16,-27,-29,-24,-21,-25, -9, 16,-17, 3,-24; /M: SY='S'; M= 22, -3,-10, -6, -3,-20, 0,-13,-17,-10,-24,-17, 4,-10, -3,-13, 31, 14, -7,-34,-20, -3; /M: SY='D'; M=-19, 44,-30, 63, 26,-39,-11, 0,-39, 1,-29,-29, 17, -9, 3, -9, 0,-10,-30,-39,-20, 14; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='S'; M= 4, 6,-11, 0, -3,-17, -6,-10,-17, -9,-24,-17, 14,-11, -3, -9, 30, 26,-10,-37,-17, -3; /M: SY='S'; M= 20, -3,-10, -8, -5,-18, -4,-15,-15,-10,-20,-15, 2,-10, -5,-13, 27, 20, -5,-32,-18, -5; /M: SY='A'; M= 31,-14,-11,-22,-14,-13,-10,-21, -1,-14, 0, -4,-14,-15,-14,-19, 3, 3, 8,-22,-15,-14; /M: SY='V'; M= -7,-26, 2,-27,-27, 6,-30,-15, 13,-18, 3, 3,-26,-31,-24,-18,-13, -4, 24,-15, 14,-27; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='Y'; M=-15, -7,-26,-10,-14, 15,-21, 15, -6, -8, -9, -6, -2,-26, -7, -8, -7, -5,-14, 9, 50,-14; /M: SY='C'; M= -3, 8, 23, 4, -6,-23,-10,-11,-26,-13,-27,-21, 11,-20, -9,-14, 15, 4,-16,-43,-23, -7; /M: SY='Y'; M= 1, -4,-20,-11,-11, 0,-15, -1, -6,-11, -5, -6, 1,-21, -8,-11, -1, 1, -9,-11, 15,-11; /M: SY='C'; M= -7,-14, 38,-18,-18, -6,-21,-10,-18,-18,-17,-14,-11,-28,-15,-18, 2, -1,-10,-24, 5,-18; /M: SY='I'; M= -9,-19,-28,-24,-20, -2,-15,-22, 9,-21, -4, 0,-11, 0,-20,-22,-12,-10, 3,-21, -9,-22; /M: SY='S'; M= -2, 5,-15, 3, -4,-18,-11, 2,-15, -9,-20,-13, 8,-15, -5, -9, 17, 13, -6,-36,-12, -5; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 19 in 19 different sequences |
| Number of true positive hits | 19 in 19 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Sox C-terminal |
| Version [info] | 6 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
19 sequences
S17AA_XENLA (Q3KQ35), S17AB_XENLA (Q90ZH9), S17B1_XENLA (O42601), S17B1_XENTR (Q8AWH2), S17B2_XENTR (Q6GLH8), S17B3_XENLA (A5D8R3), S17B3_XENTR (Q6F2F0), SOX17_HUMAN (Q9H6I2), SOX17_MOUSE (Q61473), SOX18_HUMAN (P35713), SOX18_MOUSE (P43680), SOX18_XENTR (B3DLD3), SOX7_HUMAN (Q9BT81), SOX7_MOUSE (P40646), SOX7_XENLA (O42342), SOX7_XENTR (Q28GD5), SX17A_XENTR (Q8AWH3), SX18A_XENLA (Q90ZH8), SX18B_XENLA (Q90ZH7)» more
|