PROSITE entry PS51523
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | ZF_HD_DIMER |
| Accession [info] | PS51523 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-FEB-2011 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51523 |
| Associated ProRule [info] | PRU00856 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Zinc-finger ZF-HD dimerization-type profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=50; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=45; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3594837; R2=0.0175728; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2746.1230469; R2=2.5307693; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=435; H_SCORE=3847; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=236; H_SCORE=3343; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='Y'; M=-16,-16,-27,-16,-15, 18,-25, 14, -6, -5, -6, -4,-14,-26, -6, -1,-11, -6,-11, 15, 56,-15; /M: SY='R'; M= -3,-10,-28,-12, -6,-22, -2,-13,-19, 13,-18, -8, -4,-16, -2, 17, -7,-11,-13,-20,-14, -6; /M: SY='E'; M= -4, 3,-28, 8, 33,-30, -7, -4,-28, 9,-22,-16, -1, -6, 16, 0, 0,-11,-26,-25,-19, 25; /M: SY='C'; M= -9,-19,100,-27,-29,-21,-17,-29,-31,-29,-21,-20,-17,-37,-29,-29, -9,-11,-13,-46,-30,-29; /M: SY='L'; M= -9,-13,-23,-13, 0,-10,-24, -5, -2, -8, 12, 9,-13,-18, 2, -6,-13, -4, -6,-23, -5, 1; /M: SY='K'; M=-12, -2,-30, -2, 8,-28,-20, -8,-30, 46,-28,-10, 0,-12, 10, 37,-10,-10,-20,-20,-10, 8; /M: SY='N'; M=-11, 26,-21, 10, -2,-18, -5, 8,-17, 3,-23, -9, 43,-20, 1, 8, 4, -2,-24,-35,-16, -1; /M: SY='H'; M=-15, -2,-28, -3, -5,-18, -9, 66,-27,-11,-19, -4, 6,-19, 3, -4, -5,-11,-25,-26, 13, -5; /M: SY='A'; M= 33,-11, 3,-20,-11,-20, -6,-19,-15, -7,-13,-11,-10,-15,-10, -9, 5, -3, -4,-24,-20,-11; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='A'; M= 25,-10,-12,-14, -3,-14, -9,-16, -4, -9, -3, -5,-12,-12, -8,-15, 2, -2, 3,-20,-15, -6; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='A'; M= 21, -6,-13,-10, -7,-19, 7,-13,-17, -7,-18,-13, -1,-11, -6, -7, 13, 2, -8,-23,-18, -7; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='M'; M=-14,-16,-24,-23,-17, 5,-25, 2, 8,-13, 9, 17, -9,-23, -9, -4,-16,-10, 1,-19, 3,-14; /M: SY='G'; M= -2,-13,-15,-14,-21,-24, 49,-21,-32,-22,-20,-15, -5,-23,-21,-21, -4,-18,-24,-23,-27,-21; /M: SY='G'; M= 3,-11,-29,-11,-17,-29, 53,-20,-35,-18,-28,-19, -3, -5,-18,-20, 0,-17,-27,-21,-29,-18; /M: SY='H'; M=-12, -4,-28, -3, 0,-19,-18, 37,-21, -3,-19, -6, 2, -5, 8, -2, -4,-10,-23,-24, 6, 1; /M: SY='A'; M= 30,-12,-13,-18,-13,-17, 3,-20, -9,-14, -8, -8,-10,-15,-13,-19, 8, -1, 1,-23,-19,-13; /M: SY='L'; M= -9,-29,-18,-32,-25, 21,-30,-23, 20,-27, 26, 12,-26,-28,-26,-20,-20, -5, 19,-17, 3,-25; /M: SY='D'; M=-19, 40,-29, 57, 15,-34,-13, -3,-32, -4,-20,-24, 14,-13, -3,-11, -4,-10,-25,-37,-17, 6; /M: SY='G'; M= -4,-13,-29,-13,-18,-24, 46,-18,-31,-15,-19,-14, -4,-21,-16, -9, -5,-18,-24,-20,-24,-18; /M: SY='C'; M=-12,-19, 84,-27,-26, -8,-29,-12,-26,-27,-16,-15,-16,-36,-26,-25,-11,-11,-11,-40,-16,-26; /M: SY='G'; M= -3, -8, -8,-11,-12,-28, 28,-15,-31,-14,-24,-15, -3,-19, -4,-14, 1, -8,-24,-25,-24, -8; /M: SY='E'; M= -7, 3,-26, 9, 37,-24,-19, -5,-23, 8,-14,-14, -2, -6, 12, 0, 0, -6,-22,-29,-16, 24; /M: SY='F'; M=-20,-25,-22,-33,-25, 62,-29, -1, -4,-25, 5, 0,-16,-29,-31,-16,-19,-11, -5, 7, 34,-25; /M: SY='M'; M=-12, -7,-25, -9, -9,-12,-24, -8, 10,-12, 9, 21,-11,-18, 1,-13,-15,-10, 2,-24, -5, -5; /M: SY='P'; M= 3,-10,-25, -9, -4,-24, -3,-15,-21, -6,-25,-17, -6, 21, -7, -6, 7, 1,-18,-28,-22, -8; /M: SY='S'; M= 9, 1,-19, 1, 5,-24, 0,-10,-24, 0,-23,-17, 2,-11, 0, 0, 13, 1,-15,-29,-19, 2; /M: SY='S'; M= -2, -1,-23, 0, 6,-23, 1,-11,-19, -7,-23,-16, 3, 0, -4,-11, 8, -2,-15,-32,-22, 0; /M: SY='E'; M= -9, -7,-33, -2, 17,-25,-11,-10,-25, -3,-23,-17, -9, 12, 8, -8, -4, -9,-28, -6,-15, 12; /M: SY='E'; M= -6, 9,-23, 10, 16,-24,-12, -3,-25, 6,-22,-17, 10,-11, 6, 11, 8, 2,-20,-31,-17, 10; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='G'; M= -3, -4,-21, -6,-10,-17, 17,-12,-18,-12,-14,-11, 2, -2,-11,-13, -1, -4,-17,-21,-18,-11; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='S'; M= 7, 2,-15, -1, 4,-17, -7, -8,-14, -4,-16,-13, 5, 2, -2, -8, 10, 7,-12,-25,-16, 1; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='L'; M= -2,-10,-17,-13, -5,-10,-16, -9, -3, -5, 3, 1, -8,-14, 3, 1, -3, 2, -4,-18, -7, -2; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='E'; M= 2, 9,-19, 13, 15,-13,-11, -6,-19, -2,-13,-14, 0, -7, -1, -9, 0, -6,-15,-20,-11, 8; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10; /M: SY='A'; M= 8, -2,-20, -3, -1,-21,-10, -9,-18, 0,-14,-10, -2,-14, 3, 6, 5, -2,-12,-26,-15, 0; /M: SY='V'; M= 0,-25,-15,-27,-22, 2,-26,-22, 17,-15, 15, 13,-24,-26,-20,-15,-14, -4, 25,-23, -6,-21; /M: SY='L'; M=-11,-17,-11,-21,-14, -9,-27,-18, 1, -5, 4, 2,-12,-21,-10, 4,-11, 0, 1,-24, -8,-14; /M: SY='C'; M= -3, -9, 62,-17,-15,-22,-11,-21,-29,-20,-21,-19, -7,-29,-19,-22, -4, -9,-15,-41,-27,-17; /M: SY='A'; M= 12,-15,-22,-17,-10,-11, -3,-19,-13,-15,-12,-11,-12, 10,-14,-19, 1, -4,-11,-22,-17,-13; /M: SY='A'; M= 25,-15,-19,-20,-13,-18, 0,-21, -7,-15, -7, -7,-13, -2,-13,-21, 0, -6, -4,-21,-19,-14; /M: SY='C'; M=-13,-18, 51,-23,-16,-14,-26,-10,-24,-22,-14,-14,-18,-31,-18,-21,-15,-14,-15,-17,-12,-17; /M: SY='G'; M= -9, -7,-30, -9,-10,-23, 17, 1,-26, -1,-22,-11, 2,-19, -6, 7, -6,-15,-21,-22,-14,-10; /M: SY='C'; M=-11,-16, 41,-22,-18,-18,-28, 2,-13,-21,-12, -6,-12,-29,-11,-19,-10,-11, -6,-37,-11,-16; /M: SY='H'; M=-16, 13,-29, 16, 5,-28, -7, 46,-31, -5,-24,-10, 14,-17, 10, -3, -4,-15,-30,-31, -1, 5; /M: SY='R'; M=-17, 4,-29, 4, -3,-17,-15, -2,-19, 6,-15, -2, 4,-19, 1, 18,-10,-11,-18,-10, -7, -2; /M: SY='N'; M= -7, 18,-21, 16, 2,-22, -8, -3,-19, -3,-24,-18, 22,-15, -1, -1, 13, 2,-17,-36,-17, -1; /M: SY='F'; M= -8,-24,-21,-32,-22, 33,-25,-17, 3,-18, 9, 7,-17,-24,-22, -8,-16, -9, 2, -6, 10,-21; /M: SY='H'; M= -8, 1,-26, -6, -7,-13,-17, 44,-12,-11,-14, -2, 10,-20, 0, -7, -6,-11,-17,-24, 10, -7; /M: SY='R'; M= -4,-11,-23,-13, -2,-19,-20, -7,-12, 5, -8, -2, -7,-17, 11, 18, -4, -3, -8,-22,-10, 3; /M: SY='R'; M=-12, 7,-26, 5, 1,-22,-16, -5,-18, 13,-21,-11, 12,-16, 2, 18, -2, -5,-16,-28,-13, -1; /M: SY='L'; M= -6, -4,-23, -1, -2,-13,-23,-16, 3,-15, 7, -1,-11,-18,-10,-17,-11, -8, 3,-27,-10, -7; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 40 in 40 different sequences |
| Number of true positive hits | 40 in 40 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | ZN_FING |
| Feature description [info] | ZF-HD dimerization-type |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
40 sequences
MIF1_ARATH (Q9CA51), MIF1_ORYSI (B8BIU8), MIF1_ORYSJ (Q2RB28), MIF2_ARATH (Q9LJW5), MIF2_ORYSI (B8BLT3), MIF2_ORYSJ (B9GBM3), MIF3_ARATH (Q2Q493), MIF3_ORYSI (A2Z182), MIF3_ORYSJ (Q6ER22), MIF4_ORYSJ (Q0J5F8), ZHD10_ARATH (Q9FIW9), ZHD10_ORYSJ (Q6Z528), ZHD11_ARATH (Q9SEZ1), ZHD11_ORYSI (A2XLF4), ZHD11_ORYSJ (Q10DV5), ZHD12_ARATH (Q9FKJ9), ZHD13_ARATH (Q9FMY7), ZHD14_ARATH (Q9LQW3), ZHD1_ARATH (Q9FKP8), ZHD1_ORYSI (A2Z259), ZHD1_ORYSJ (Q6YXH5), ZHD2_ARATH (Q9SB61), ZHD2_ORYSI (A2YWA6), ZHD2_ORYSJ (Q6ZB90), ZHD3_ARATH (O64722), ZHD3_ORYSJ (Q2QW44), ZHD4_ARATH (Q9M9S0), ZHD4_ORYSJ (Q53N87), ZHD5_ARATH (Q9FRL5), ZHD5_ORYSI (A2WSZ6), ZHD5_ORYSJ (Q5VM82), ZHD6_ARATH (Q9ZPW7), ZHD6_ORYSI (B8AX53), ZHD6_ORYSJ (Q688U3), ZHD7_ARATH (Q9SVL0), ZHD7_ORYSJ (Q8S3Q9), ZHD8_ARATH (Q9LXG0), ZHD8_ORYSJ (Q7X7N3), ZHD9_ARATH (Q9LHF0), ZHD9_ORYSJ (Q6ER21)» more
|