PROSITE entry PS51531
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | FV_PR |
Accession [info] | PS51531 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-MAR-2011 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC51531 |
Associated ProRule [info] | PRU00863 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | Foamy virus protease (FV PR) domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=140; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=135; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.0756733; R2=0.0130310; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=12962.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=417; H_SCORE=12962; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=263; H_SCORE=12962; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-25; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='M'; M=-28,-42,-81,-51,-34,-25,-47,-47, 6, -2, 13, 78,-35,-49,-18,-22,-28,-20, 9,-65,-61,-26; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='D'; M= -6, 18,-61, 20, 14,-65,-14, -6,-34,-17,-47,-39, 11,-10, 4,-25, -3,-13,-16,-29,-54, 12; D=-12; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='L'; M= -3,-37,-67,-42,-37,-23,-37,-40, -4,-45, 13, -3,-31,-21,-25,-45,-22,-17, 0,-53,-45,-26; /M: SY='L'; M=-34,-50,-83,-55,-44,-14,-60,-32, 5,-44, 43, 14,-44,-35,-17,-43,-46,-36, -6,-35,-45,-27; /M: SY='Q'; M=-20, -8,-74,-15, -6,-73,-38, -5,-32, 7,-39,-16, -7,-19, 24, 7,-15, -9,-37,-68,-62, 13; /M: SY='P'; M= 2,-19,-51,-28,-24,-66,-25,-16,-45,-34,-41,-47,-17, 51,-11,-22, 2,-15,-29,-84,-71,-16; /M: SY='L'; M=-31,-53,-79,-61,-52, -4,-63,-41, 16,-48, 45, 15,-44,-38,-31,-46,-44,-32, 4,-41,-39,-38; /M: SY='Z'; M= -8, -8,-65, -6, 6,-65,-31,-16,-24,-24,-37,-29,-12, -1, 11,-21,-13,-16,-16,-59,-61, 12; /M: SY='A'; M= 14,-27,-18, -4, -5,-45, 5,-41, 6,-46,-19, -8,-27,-20,-33,-47,-14, -4, 0,-27,-52,-28; /M: SY='E'; M=-13, 14,-87, 28, 48,-87,-25,-14,-31,-16,-56,-36, -3,-27, 24,-27,-20,-30, -9, -9,-62, 45; /M: SY='I'; M=-21,-38,-36,-36,-27,-18,-51,-39, 45,-30, -3, 4,-30,-41,-32,-14,-33,-14, 10,-52,-41,-34; /M: SY='K'; M=-40,-10,-90,-20,-20,-90,-40,-30,-40, 60,-50, 0, 0,-40,-10, 20,-20,-10,-50,-70,-60,-10; /M: SY='G'; M= 0,-10,-60,-10,-20,-60, 60,-50,-60,-40,-70,-50,-10,-30,-40,-60, 0,-20, 0, 0,-80,-20; /M: SY='T'; M= 3, -3,-37, -4,-17,-48,-14,-25, -7,-15,-35,-19, 5,-24,-27,-31, 8, 26,-16,-57,-39,-24; /M: SY='K'; M=-31, -6,-75,-15,-14,-75,-37, -8,-41, 29,-46,-13, 2,-28, 3, 11,-16,-13,-45,-63,-52, 0; /M: SY='L'; M=-36,-56,-80,-64,-54, 0,-68,-42, 21,-48, 50, 18,-46,-42,-32,-46,-48,-34, 6,-40,-38,-40; /M: SY='K'; M=-36,-12,-86,-22,-24,-69,-41,-25,-30, 33,-31, -2, -2,-39,-13, 2,-21,-14,-40,-60,-52,-14; /M: SY='G'; M= 17,-10,-52,-10,-16,-56, 35,-46,-43,-40,-57,-42,-10,-17,-32,-52, 4, -7, 0,-34,-67,-16; /M: SY='Y'; M=-46,-31,-48,-50,-51, 21,-62, 23,-31,-55,-30,-46,-14,-52,-35,-38,-36,-43,-43,-28, 35,-36; /M: SY='W'; M=-77,-67, -2, -8, -7,-13, -9,-37,-74,-69,-31,-69,-48,-89,-79, -8,-31,-75, -6,113, -7,-87; /M: SY='D'; M=-10, 50,-90, 60, 40,-90,-10,-10,-40,-20,-70,-60, 30,-40, 0,-50,-10,-20, 0, 0,-70, 20; /M: SY='S'; M= 10, -3,-18,-13,-23,-43, -5,-33,-32,-17,-47,-27, 7, -5,-30,-15, 35, 28,-25,-43,-40,-23; /M: SY='G'; M= -4, -8,-66, -8,-12,-64, 41,-37,-56,-34,-62,-44,-10,-26,-19,-49, -6,-22, -8,-15,-78, -7; /M: SY='A'; M= 37,-10,-40,-11,-12,-50, -2,-40,-19,-37,-40,-29, -9, -2,-21,-39, 11, 14, -1,-80,-49,-12; /M: SY='D'; M= -3, 10,-69, 13, 13,-72,-21,-21,-25,-14,-49,-33, 4,-25, 2,-32, -3, 6,-10,-45,-55, 11; /M: SY='I'; M=-18,-40,-35,-35,-26, -5,-53,-49, 65,-41, 9, 10,-31,-48,-40,-32,-39,-10, 26,-70,-32,-40; /M: SY='T'; M= 10,-10,-40,-20,-30,-50,-20,-40,-10,-10,-40,-20, 0,-20,-30,-30, 20, 50,-10,-80,-40,-30; /M: SY='C'; M=-40,-70, 90,-90,-90,-80,-60,-50,-40,-90,-90,-80,-60,-50,-90,-50,-10,-40, 0, 0,-20,-90; /M: SY='I'; M= -8,-40,-17,-17,-12,-23,-25,-44, 47,-46, 4, 10,-36,-38,-40,-42,-34,-10, 12,-33,-42,-40; /M: SY='P'; M= 0,-30,-50,-40,-30,-70,-30,-20,-50,-40,-40,-50,-30, 70,-10,-20, 0,-20,-30,-90,-80,-20; /M: SY='Z'; M= -3, -1,-72, 1, 9,-74,-23,-20,-30, -6,-44,-23, -5,-19, 10,-19,-11, -8,-19,-59,-58, 15; /M: SY='S'; M= 4,-12,-26,-12,-15,-35,-16,-36, -2,-31,-30,-18, -7,-18,-30,-26, 5, 5, -6,-44,-42,-23; /M: SY='F'; M=-48,-64,-74,-84,-80, 59,-65,-29, -2,-78, 6,-18,-47,-66,-69,-59,-42,-47,-34,-22, 31,-70; /M: SY='L'; M=-37,-57,-83,-66,-56, 0,-69,-41, 18,-49, 53, 19,-47,-41,-31,-47,-49,-36, 4,-37,-39,-40; /M: SY='Z'; M=-17,-13,-72, -9, 4,-49,-41,-25, 1,-26,-18,-13,-16,-32, 2,-30,-27,-18, -1,-48,-50, 7; /M: SY='D'; M= -8, 29,-84, 40, 35,-84, 0,-21,-41,-24,-67,-52, 13,-35, -1,-49,-11,-23, 0, 0,-69, 22; /M: SY='E'; M=-10, 20,-90, 40, 60,-90,-20,-20,-30,-20,-60,-40, 0,-30, 20,-40,-20,-30, 0, 0,-60, 50; /M: SY='Q'; M=-17, -3,-75, 5, 22,-70,-34, -6,-19,-17,-34,-21,-12,-23, 30,-15,-27,-26,-18,-44,-61, 30; /M: SY='P'; M= 0,-30,-50,-40,-30,-70,-30,-20,-50,-40,-40,-50,-30, 70,-10,-20, 0,-20,-30,-90,-80,-20; /M: SY='I'; M=-14,-40,-27,-27,-20,-13,-41,-47, 57,-43, 7, 10,-33,-44,-40,-36,-37,-10, 20,-54,-36,-40; /M: SY='K'; M=-23,-13,-71,-20,-21,-72, -5,-29,-46, 9,-56,-25, -8,-30,-14, -3,-11,-19,-30,-30,-70,-10; /M: SY='Z'; M=-16, 6,-77, 4, 5,-76,-28,-13,-32, 6,-46,-23, 5,-27, 10,-13,-11, -5,-28,-57,-57, 11; /M: SY='T'; M=-14,-19,-56,-22,-18,-55,-34,-24,-10, -3,-29, -5,-13,-26, -6, -7,-12, 2,-20,-60,-53,-12; /M: SY='L'; M=-27,-20,-71,-21,-26,-30,-39,-24,-14,-33, 2,-14,-14,-40,-26,-38,-23,-22, -9,-23,-41,-27; /M: SY='I'; M=-16,-40,-32,-32,-24, -8,-49,-48, 62,-42, 8, 10,-32,-46,-40,-34,-38,-10, 24,-65,-34,-40; /M: SY='K'; M=-17, -5,-74, -9, -7,-76,-31,-26,-29, 18,-46,-14, -1,-29, -3, -7, -8, 4,-29,-65,-55, -1; /M: SY='T'; M= 10,-10,-40,-20,-30,-50,-20,-40,-10,-10,-40,-20, 0,-20,-30,-30, 20, 50,-10,-80,-40,-30; /M: SY='I'; M=-20,-40,-40,-40,-30, 0,-60,-50, 70,-40, 10, 10,-30,-50,-40,-30,-40,-10, 30,-80,-30,-40; /M: SY='H'; M=-40, 0,-50,-10,-20,-30,-50, 80,-50,-30,-40,-50, 20,-20, 20, 0,-30,-40,-40,-40,-10, 10; /M: SY='G'; M= -1, -3,-60, -5,-17,-59, 51,-41,-56,-35,-67,-49, -2,-30,-36,-55, 1,-17, -5, -7,-73,-17; /M: SY='E'; M=-12, 3,-75, 11, 21,-72,-27,-29,-16, -9,-47,-25, -3,-32, -1,-29,-15,-10, -5,-34,-53, 16; /M: SY='K'; M=-28, -9,-80,-17,-10,-79,-40,-11,-35, 25,-42,-11, -5,-26, 15, 13,-18,-12,-42,-67,-62, 8; /M: SY='Z'; M=-23, 2,-86, 6, 20,-84,-34,-11,-35, 7,-49,-23, -4,-27, 22, -4,-21,-25,-28,-37,-63, 28; /M: SY='Q'; M=-19, 4,-83, 8, 22,-74,-30, 14,-40,-17,-41,-31, -4,-17, 44,-14,-26,-31,-28,-50,-60, 40; /M: SY='B'; M=-16, 18,-78, 16, 5,-79,-21,-12,-40, 0,-56,-39, 15,-18, -6,-21, -7,-14,-25,-43,-62, 2; /M: SY='I'; M= -1,-40,-17,-11, -9,-35,-10,-40, 22,-49, 4, 7,-38,-28,-37,-49,-29,-12, 0,-13,-49,-37; /M: SY='Y'; M=-50,-40,-20,-70,-60, 40,-80,-10,-30,-60,-40,-60,-30,-80,-70,-70,-40,-40,-50,-20, 90,-60; /M: SY='Y'; M=-50,-40,-20,-70,-60, 40,-80,-10,-30,-60,-40,-60,-30,-80,-70,-70,-40,-40,-50,-20, 90,-60; /M: SY='L'; M=-22,-51,-50,-39,-33,-18,-39,-40, 19,-50, 33, 16,-46,-36,-34,-50,-41,-27, 0,-17,-44,-40; /M: SY='T'; M= -3, 3,-57, -3,-11,-61,-21,-25,-21, 0,-46,-24, 10,-26,-17,-22, 7, 21,-20,-62,-44,-11; /M: SY='F'; M=-45,-65,-82,-82,-78, 52,-61,-35, 3,-70, 14, 2,-49,-62,-63,-53,-41,-44,-26,-29, 12,-66; /M: SY='K'; M=-40,-10,-90,-20,-20,-90,-40,-30,-40, 60,-50, 0, 0,-40,-10, 20,-20,-10,-50,-70,-60,-10; /M: SY='I'; M=-11,-40,-22,-22,-17,-18,-33,-46, 52,-44, 6, 10,-34,-41,-40,-39,-36,-10, 17,-44,-39,-40; /M: SY='Z'; M=-22, 6,-87, 7, 9,-71,-33, -8,-31, -6,-34,-23, 1,-30, 14,-20,-22,-23,-23,-42,-59, 16; /M: SY='G'; M= -5,-10,-64,-11,-20,-64, 47,-47,-57,-27,-67,-43, -9,-31,-36,-49, -3,-19, -7, -9,-77,-19; /M: SY='R'; M=-40,-30,-50,-50,-40,-60,-60, 0,-30, 20,-50,-20,-20,-20, 0, 70,-10,-30,-50, 0,-70,-10; /M: SY='K'; M=-40,-14,-82,-26,-24,-84,-44,-24,-38, 52,-50, -4, -4,-36, -8, 30,-18,-14,-50,-57,-62,-10; /M: SY='I'; M= -8,-42,-18,-16,-13,-28,-20,-42, 35,-48, 9, 11,-39,-35,-39,-46,-34,-13, 6,-19,-45,-40; /M: SY='Z'; M= -7, 16,-78, 23, 31,-75,-20, -5,-31,-16,-49,-34, 6,-22, 21,-27,-13,-20,-17,-38,-55, 33; /M: SY='A'; M= 24,-18,-23,-22,-24,-54,-12,-41,-21,-41,-47,-35,-15,-10,-31,-39, 9, 11, -2,-69,-44,-24; /M: SY='E'; M=-10, 20,-90, 40, 60,-90,-20,-20,-30,-20,-60,-40, 0,-30, 20,-40,-20,-30, 0, 0,-60, 50; /M: SY='I'; M= 0,-40, 0, 0, 0,-40, 0,-40, 30,-50, 0, 10,-40,-30,-40,-50,-30,-10, 0, 0,-50,-40; /M: SY='I'; M=-17,-37,-43,-39,-32, -7,-55,-48, 55,-36, 6, 6,-27,-45,-38,-31,-32, -4, 22,-77,-32,-39; /M: SY='A'; M= 21, -8,-40,-10,-15,-51, 18,-41,-37,-36,-51,-36, -6, -9,-28,-40, 13, 3, -7,-45,-57,-15; /M: SY='T'; M= 10, -4,-23,-14,-24,-44, -9,-34,-27,-16,-46,-26, 6, -9,-30,-19, 31, 33,-21,-52,-40,-24; /M: SY='P'; M= 6,-17,-50,-25,-22,-62,-24,-25,-32,-27,-39,-34,-15, 22, -9,-24, 4, 6,-21,-84,-62,-14; /M: SY='L'; M=-44,-52,-61,-70,-60, 17,-74,-27, -7,-54, 18,-14,-42,-57,-47,-58,-46,-40,-21,-26, 15,-48; /M: SY='D'; M= -3, 36,-83, 47, 36,-84,-10,-16,-35,-23,-64,-52, 19,-33, 1,-47, -9,-18, 0,-11,-65, 21; /M: SY='Y'; M=-50,-40,-20,-70,-60, 40,-80,-10,-30,-60,-40,-60,-30,-80,-70,-70,-40,-40,-50,-20, 90,-60; /M: SY='I'; M= -1,-34,-24,-19,-15,-25,-25,-44, 37,-44, -3, 2,-30,-33,-36,-40,-27, -6, 13,-49,-42,-34; /M: SY='L'; M=-31,-51,-68,-57,-47, 0,-66,-44, 37,-46, 38, 16,-41,-44,-34,-41,-46,-27, 13,-52,-36,-40; /M: SY='I'; M=-25,-50,-56,-46,-38, -8,-52,-43, 33,-47, 32, 15,-42,-41,-35,-44,-43,-24, 9,-39,-39,-40; /M: SY='S'; M= 15,-10,-20,-18,-24,-51,-11,-35,-26,-32,-48,-34, -4,-11,-31,-30, 17, 14,-12,-57,-41,-24; /M: SY='P'; M= 0,-30,-50,-40,-30,-70,-30,-20,-50,-40,-40,-50,-30, 70,-10,-20, 0,-20,-30,-90,-80,-20; /M: SY='T'; M= 6,-16,-31,-15,-19,-41, 0,-41,-12,-31,-36,-21,-10,-20,-34,-34, 5, 8, -5,-41,-49,-26; /M: SY='D'; M=-10, 50,-90, 60, 40,-90,-10,-10,-40,-20,-70,-60, 30,-40, 0,-50,-10,-20, 0, 0,-70, 20; /M: SY='I'; M= -9,-40,-19,-19,-14,-21,-28,-45, 49,-45, 5, 10,-35,-39,-40,-41,-35,-10, 14,-37,-41,-40; /M: SY='P'; M= 0,-30,-50,-40,-30,-70,-30,-20,-50,-40,-40,-50,-30, 70,-10,-20, 0,-20,-30,-90,-80,-20; /M: SY='W'; M=-80,-70, 0, 0, 0,-20, 0,-40,-80,-70,-30,-70,-50,-90,-80, 0,-30,-80, 0,130,-20,-90; /M: SY='F'; M=-40,-48,-53,-64,-54, 16,-72,-30, 6,-52, 12,-13,-38,-57,-47,-54,-44,-34,-14,-36, 12,-48; /M: SY='K'; M=-28,-24,-80,-33,-28,-55,-44,-31,-18, 11,-15, 11,-16,-35,-10,-10,-21, -9,-24,-65,-54,-16; /M: SY='K'; M=-24,-13,-79,-20,-12,-82,-37,-13,-43, 13,-42,-19,-11, -2, 12, 4,-17,-18,-42,-78,-68, 4; /M: SY='K'; M=-23,-11,-71,-19,-15,-63,-29,-18,-37, 4,-45,-22, -8,-32, -2,-14,-17,-12,-35,-59,-45, -3; /M: SY='P'; M= -1,-24,-55,-31,-20,-72,-29,-20,-48,-38,-42,-49,-27, 58, -7,-22, -2,-21,-27,-80,-78,-12; /M: SY='L'; M=-40,-60,-90,-70,-60, 0,-70,-40, 10,-50, 60, 20,-50,-40,-30,-50,-50,-40, 0,-30,-40,-40; /M: SY='Z'; M=-14, 12,-90, 23, 43,-86,-28, -3,-34,-16,-47,-32, -4,-22, 41,-23,-24,-30,-17,-34,-64, 50; /M: SY='L'; M=-40,-60,-90,-70,-60, 0,-70,-40, 10,-50, 60, 20,-50,-40,-30,-50,-50,-40, 0,-30,-40,-40; /M: SY='T'; M= 10,-10,-40,-20,-30,-50,-20,-40,-10,-10,-40,-20, 0,-20,-30,-30, 20, 50,-10,-80,-40,-30; /M: SY='I'; M=-14,-38,-33,-32,-25,-11,-47,-48, 57,-39, 4, 8,-29,-44,-39,-33,-34, -5, 22,-66,-34,-39; /M: SY='K'; M=-40,-31,-90,-41,-37,-52,-53,-34,-19, 14, -4, 8,-21,-40,-18, -9,-33,-23,-29,-53,-52,-23; /M: SY='I'; M=-18,-47,-40,-33,-27,-17,-38,-42, 33,-48, 22, 13,-41,-38,-37,-45,-39,-20, 7,-30,-42,-40; /M: SY='P'; M= -4, 5,-68, 4, 1,-79,-21,-16,-46,-31,-53,-54, -4, 22, -6,-33, -4,-20,-17,-50,-76, -2; /M: SY='L'; M=-21,-45,-50,-40,-35,-16,-41,-40, 16,-45, 24, 10,-38,-34,-34,-43,-32,-21, 0,-28,-42,-38; /M: SY='Z'; M=-17, 9,-87, 16, 34,-81,-32, 7,-36,-16,-43,-31, -4,-19, 45,-17,-26,-31,-23,-43,-62, 47; /M: SY='E'; M=-12, 16,-79, 25, 33,-82,-20,-17,-35,-10,-56,-35, 4,-27, 12,-26,-12,-20,-14,-20,-60, 30; /M: SY='Y'; M=-35,-25,-61,-39,-25,-18,-61, -1,-29,-37,-22,-31,-24,-44, -3,-36,-37,-36,-39,-48, 2, -9; /M: SY='Q'; M=-27, -2,-90, -4, 8,-85,-38, -2,-39, 16,-40,-14, -5,-23, 36, 4,-25,-22,-41,-70,-65, 27; /M: SY='Z'; M=-17, 13,-74, 19, 22,-71,-22, 0,-35,-15,-56,-41, 8,-28, 8,-20,-14,-26,-17,-12,-52, 24; /M: SY='R'; M=-15,-15,-55,-27,-26,-61,-37,-20,-23, 7,-43,-18, -7,-21, -7, 9, 0, 9,-30,-55,-55,-12; /M: SY='L'; M=-34,-54,-76,-62,-52, 0,-67,-43, 27,-47, 46, 17,-44,-43,-33,-44,-47,-32, 8,-44,-37,-40; /M: SY='L'; M=-32,-55,-71,-56,-48, -6,-59,-41, 21,-49, 45, 17,-46,-40,-33,-47,-46,-32, 4,-32,-40,-40; /M: SY='N'; M=-12, 6,-51, -3,-14,-54,-21, -3,-35, 0,-46,-27, 16,-20, -9, -8, 6, 3,-35,-53,-40, -7; /M: SY='Z'; M=-16, 9,-78, 9, 13,-75,-27, -5,-32, 2,-45,-25, 7,-25, 18,-13,-12,-12,-29,-54,-55, 21; /M: SY='T'; M= 14, -7,-30,-15,-24,-47,-11,-37,-21,-17,-43,-25, 2,-11,-29,-25, 25, 35,-15,-64,-41,-24; /M: SY='T'; M= 6, -6,-48,-11,-16,-38,-21,-27, -2,-23,-28,-14, 1,-24,-23,-30, -1, 7, -5,-72,-41,-17; /M: SY='L'; M=-37,-57,-83,-66,-56, 0,-69,-41, 18,-49, 53, 19,-47,-41,-31,-47,-49,-36, 4,-37,-39,-40; /M: SY='S'; M= 4, -7,-37,-13,-15,-56, -2,-30,-42,-27,-51,-38, -4, 8,-21,-24, 17, 2,-21,-41,-57,-13; /M: SY='K'; M=-16, -6,-70, -9, -8,-76,-12,-31,-43, 5,-54,-26, -5,-17,-13,-14, -7,-13,-27,-43,-64, -4; /M: SY='Z'; M=-17, 12,-84, 18, 27,-84,-26,-12,-36, -2,-51,-29, 2,-26, 20,-18,-16,-21,-21,-35,-62, 29; /M: SY='G'; M=-15, -8,-70,-11,-12,-47, 3,-23,-44,-37,-51,-42,-10,-35,-15,-45,-16,-27,-18,-23,-50, -7; /M: SY='K'; M=-37, -9,-90,-17,-15,-89,-40,-23,-40, 51,-47, -3, -1,-36, 1, 17,-21,-13,-49,-71,-61, -2; /M: SY='Z'; M=-20, -7,-82, -2, 14,-65,-37,-18,-15, -8,-30, -6,-12,-31, 17,-18,-27,-24,-11,-51,-59, 20; /M: SY='Q'; M=-30,-11,-77,-16, -4,-62,-45, -9,-32, -1,-38,-21,-12,-32, 11, -5,-26,-27,-34,-42,-45, 10; /M: SY='L'; M=-40,-60,-90,-70,-60, 0,-70,-40, 10,-50, 60, 20,-50,-40,-30,-50,-50,-40, 0,-30,-40,-40; /M: SY='K'; M=-24, -8,-83,-14, -9,-82,-34,-19,-37, 29,-44, -9, -4,-27, 9, 7,-18,-12,-40,-74,-61, 5; /M: SY='K'; M=-18, 1,-67, -7,-11,-71,-28,-17,-33, 15,-49,-21, 6,-27, -7, 1, -4, -3,-34,-50,-55, -5; /M: SY='L'; M=-38,-58,-85,-67,-57, 0,-69,-41, 16,-49, 55, 19,-48,-41,-31,-48,-49,-37, 3,-35,-39,-40; /M: SY='F'; M=-46,-66,-84,-82,-79, 50,-64,-34, 4,-75, 23, -5,-50,-59,-61,-56,-44,-46,-25,-24, 10,-65; /M: SY='D'; M=-11, 2,-62, 10, 4,-53,-23,-27, -9,-30,-29,-25, -3,-34,-17,-42,-16,-14, 0,-21,-53, -8; /M: SY='K'; M=-32, -9,-85,-17,-16,-85,-38,-24,-37, 43,-46, -5, -1,-34, -2, 12,-17, -6,-45,-72,-59, -4; /M: SY='Y'; M=-50,-43,-26,-72,-63, 44,-78,-12,-27,-63,-36,-56,-32,-79,-71,-69,-40,-41,-49,-20, 85,-62; /M: SY='D'; M=-10, 39,-81, 44, 28,-80,-13, -4,-39,-16,-61,-50, 26,-32, 6,-37, -7,-16,-12,-19,-63, 19; /M: SY='A'; M= 15, 13,-53, 10, -2,-56, -6,-19,-25,-23,-47,-36, 14,-16,-15,-35, 8, 7,-13,-60,-46, -5; /M: SY='L'; M=-40,-60,-90,-70,-60, 0,-70,-40, 10,-50, 60, 20,-50,-40,-30,-50,-50,-40, 0,-30,-40,-40; /M: SY='W'; M=-80,-70, 0, 0, 0,-20, 0,-40,-80,-70,-30,-70,-50,-90,-80, 0,-30,-80, 0,130,-20,-90; /M: SY='Q'; M=-20, 0,-90, 0, 20,-80,-40, 20,-40,-10,-30,-20,-10,-10, 70, 0,-30,-30,-40,-80,-70, 50; /M: SY='H'; M=-28,-10,-34,-20,-24,-53,-39, 21,-44,-23,-48,-40, 1,-21, -1, -6,-13,-24,-34,-42,-31, -6; /M: SY='W'; M=-80,-70, 0, 0, 0,-20, 0,-40,-80,-70,-30,-70,-50,-90,-80, 0,-30,-80, 0,130,-20,-90; /M: SY='E'; M=-10, 24,-90, 43, 57,-90,-19,-19,-31,-20,-61,-43, 4,-31, 17,-41,-19,-29, 0, 0,-61, 46; /M: SY='N'; M=-10, 40,-60, 30, 0,-50,-10, 20,-30, 0,-50,-40, 50,-30,-10,-20, 10, 0,-40,-50,-30, 0; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 5 in 5 different sequences |
Number of true positive hits | 5 in 5 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 0 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotic viruses |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | CJA_Sigrist |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | Peptidase A9 |
Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
5 sequences
POL_FFV (O93209), POL_FOAMV (P14350), POL_SFV1(P23074), POL_SFV3L (P27401), POL_SFVCP (Q87040)» more
|
PDB [Detailed view] |
1 PDB
2JYS |