PROSITE entry PS51531

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	FV_PR
Accession [info]	PS51531
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-MAR-2011 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51531
Associated ProRule [info]	PRU00863

Name and characterization of the entry

Description [info]

Foamy virus protease (FV PR) domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=140;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=135;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.0756733; R2=0.0130310; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=12962.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=417; H_SCORE=12962; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=263; H_SCORE=12962; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-25; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='M';  M=-28,-42,-81,-51,-34,-25,-47,-47,  6, -2, 13, 78,-35,-49,-18,-22,-28,-20,  9,-65,-61,-26;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='D';  M= -6, 18,-61, 20, 14,-65,-14, -6,-34,-17,-47,-39, 11,-10,  4,-25, -3,-13,-16,-29,-54, 12; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='L';  M= -3,-37,-67,-42,-37,-23,-37,-40, -4,-45, 13, -3,-31,-21,-25,-45,-22,-17,  0,-53,-45,-26;
/M: SY='L';  M=-34,-50,-83,-55,-44,-14,-60,-32,  5,-44, 43, 14,-44,-35,-17,-43,-46,-36, -6,-35,-45,-27;
/M: SY='Q';  M=-20, -8,-74,-15, -6,-73,-38, -5,-32,  7,-39,-16, -7,-19, 24,  7,-15, -9,-37,-68,-62, 13;
/M: SY='P';  M=  2,-19,-51,-28,-24,-66,-25,-16,-45,-34,-41,-47,-17, 51,-11,-22,  2,-15,-29,-84,-71,-16;
/M: SY='L';  M=-31,-53,-79,-61,-52, -4,-63,-41, 16,-48, 45, 15,-44,-38,-31,-46,-44,-32,  4,-41,-39,-38;
/M: SY='Z';  M= -8, -8,-65, -6,  6,-65,-31,-16,-24,-24,-37,-29,-12, -1, 11,-21,-13,-16,-16,-59,-61, 12;
/M: SY='A';  M= 14,-27,-18, -4, -5,-45,  5,-41,  6,-46,-19, -8,-27,-20,-33,-47,-14, -4,  0,-27,-52,-28;
/M: SY='E';  M=-13, 14,-87, 28, 48,-87,-25,-14,-31,-16,-56,-36, -3,-27, 24,-27,-20,-30, -9, -9,-62, 45;
/M: SY='I';  M=-21,-38,-36,-36,-27,-18,-51,-39, 45,-30, -3,  4,-30,-41,-32,-14,-33,-14, 10,-52,-41,-34;
/M: SY='K';  M=-40,-10,-90,-20,-20,-90,-40,-30,-40, 60,-50,  0,  0,-40,-10, 20,-20,-10,-50,-70,-60,-10;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-60,-10,-20,-60, 60,-50,-60,-40,-70,-50,-10,-30,-40,-60,  0,-20,  0,  0,-80,-20;
/M: SY='T';  M=  3, -3,-37, -4,-17,-48,-14,-25, -7,-15,-35,-19,  5,-24,-27,-31,  8, 26,-16,-57,-39,-24;
/M: SY='K';  M=-31, -6,-75,-15,-14,-75,-37, -8,-41, 29,-46,-13,  2,-28,  3, 11,-16,-13,-45,-63,-52,  0;
/M: SY='L';  M=-36,-56,-80,-64,-54,  0,-68,-42, 21,-48, 50, 18,-46,-42,-32,-46,-48,-34,  6,-40,-38,-40;
/M: SY='K';  M=-36,-12,-86,-22,-24,-69,-41,-25,-30, 33,-31, -2, -2,-39,-13,  2,-21,-14,-40,-60,-52,-14;
/M: SY='G';  M= 17,-10,-52,-10,-16,-56, 35,-46,-43,-40,-57,-42,-10,-17,-32,-52,  4, -7,  0,-34,-67,-16;
/M: SY='Y';  M=-46,-31,-48,-50,-51, 21,-62, 23,-31,-55,-30,-46,-14,-52,-35,-38,-36,-43,-43,-28, 35,-36;
/M: SY='W';  M=-77,-67, -2, -8, -7,-13, -9,-37,-74,-69,-31,-69,-48,-89,-79, -8,-31,-75, -6,113, -7,-87;
/M: SY='D';  M=-10, 50,-90, 60, 40,-90,-10,-10,-40,-20,-70,-60, 30,-40,  0,-50,-10,-20,  0,  0,-70, 20;
/M: SY='S';  M= 10, -3,-18,-13,-23,-43, -5,-33,-32,-17,-47,-27,  7, -5,-30,-15, 35, 28,-25,-43,-40,-23;
/M: SY='G';  M= -4, -8,-66, -8,-12,-64, 41,-37,-56,-34,-62,-44,-10,-26,-19,-49, -6,-22, -8,-15,-78, -7;
/M: SY='A';  M= 37,-10,-40,-11,-12,-50, -2,-40,-19,-37,-40,-29, -9, -2,-21,-39, 11, 14, -1,-80,-49,-12;
/M: SY='D';  M= -3, 10,-69, 13, 13,-72,-21,-21,-25,-14,-49,-33,  4,-25,  2,-32, -3,  6,-10,-45,-55, 11;
/M: SY='I';  M=-18,-40,-35,-35,-26, -5,-53,-49, 65,-41,  9, 10,-31,-48,-40,-32,-39,-10, 26,-70,-32,-40;
/M: SY='T';  M= 10,-10,-40,-20,-30,-50,-20,-40,-10,-10,-40,-20,  0,-20,-30,-30, 20, 50,-10,-80,-40,-30;
/M: SY='C';  M=-40,-70, 90,-90,-90,-80,-60,-50,-40,-90,-90,-80,-60,-50,-90,-50,-10,-40,  0,  0,-20,-90;
/M: SY='I';  M= -8,-40,-17,-17,-12,-23,-25,-44, 47,-46,  4, 10,-36,-38,-40,-42,-34,-10, 12,-33,-42,-40;
/M: SY='P';  M=  0,-30,-50,-40,-30,-70,-30,-20,-50,-40,-40,-50,-30, 70,-10,-20,  0,-20,-30,-90,-80,-20;
/M: SY='Z';  M= -3, -1,-72,  1,  9,-74,-23,-20,-30, -6,-44,-23, -5,-19, 10,-19,-11, -8,-19,-59,-58, 15;
/M: SY='S';  M=  4,-12,-26,-12,-15,-35,-16,-36, -2,-31,-30,-18, -7,-18,-30,-26,  5,  5, -6,-44,-42,-23;
/M: SY='F';  M=-48,-64,-74,-84,-80, 59,-65,-29, -2,-78,  6,-18,-47,-66,-69,-59,-42,-47,-34,-22, 31,-70;
/M: SY='L';  M=-37,-57,-83,-66,-56,  0,-69,-41, 18,-49, 53, 19,-47,-41,-31,-47,-49,-36,  4,-37,-39,-40;
/M: SY='Z';  M=-17,-13,-72, -9,  4,-49,-41,-25,  1,-26,-18,-13,-16,-32,  2,-30,-27,-18, -1,-48,-50,  7;
/M: SY='D';  M= -8, 29,-84, 40, 35,-84,  0,-21,-41,-24,-67,-52, 13,-35, -1,-49,-11,-23,  0,  0,-69, 22;
/M: SY='E';  M=-10, 20,-90, 40, 60,-90,-20,-20,-30,-20,-60,-40,  0,-30, 20,-40,-20,-30,  0,  0,-60, 50;
/M: SY='Q';  M=-17, -3,-75,  5, 22,-70,-34, -6,-19,-17,-34,-21,-12,-23, 30,-15,-27,-26,-18,-44,-61, 30;
/M: SY='P';  M=  0,-30,-50,-40,-30,-70,-30,-20,-50,-40,-40,-50,-30, 70,-10,-20,  0,-20,-30,-90,-80,-20;
/M: SY='I';  M=-14,-40,-27,-27,-20,-13,-41,-47, 57,-43,  7, 10,-33,-44,-40,-36,-37,-10, 20,-54,-36,-40;
/M: SY='K';  M=-23,-13,-71,-20,-21,-72, -5,-29,-46,  9,-56,-25, -8,-30,-14, -3,-11,-19,-30,-30,-70,-10;
/M: SY='Z';  M=-16,  6,-77,  4,  5,-76,-28,-13,-32,  6,-46,-23,  5,-27, 10,-13,-11, -5,-28,-57,-57, 11;
/M: SY='T';  M=-14,-19,-56,-22,-18,-55,-34,-24,-10, -3,-29, -5,-13,-26, -6, -7,-12,  2,-20,-60,-53,-12;
/M: SY='L';  M=-27,-20,-71,-21,-26,-30,-39,-24,-14,-33,  2,-14,-14,-40,-26,-38,-23,-22, -9,-23,-41,-27;
/M: SY='I';  M=-16,-40,-32,-32,-24, -8,-49,-48, 62,-42,  8, 10,-32,-46,-40,-34,-38,-10, 24,-65,-34,-40;
/M: SY='K';  M=-17, -5,-74, -9, -7,-76,-31,-26,-29, 18,-46,-14, -1,-29, -3, -7, -8,  4,-29,-65,-55, -1;
/M: SY='T';  M= 10,-10,-40,-20,-30,-50,-20,-40,-10,-10,-40,-20,  0,-20,-30,-30, 20, 50,-10,-80,-40,-30;
/M: SY='I';  M=-20,-40,-40,-40,-30,  0,-60,-50, 70,-40, 10, 10,-30,-50,-40,-30,-40,-10, 30,-80,-30,-40;
/M: SY='H';  M=-40,  0,-50,-10,-20,-30,-50, 80,-50,-30,-40,-50, 20,-20, 20,  0,-30,-40,-40,-40,-10, 10;
/M: SY='G';  M= -1, -3,-60, -5,-17,-59, 51,-41,-56,-35,-67,-49, -2,-30,-36,-55,  1,-17, -5, -7,-73,-17;
/M: SY='E';  M=-12,  3,-75, 11, 21,-72,-27,-29,-16, -9,-47,-25, -3,-32, -1,-29,-15,-10, -5,-34,-53, 16;
/M: SY='K';  M=-28, -9,-80,-17,-10,-79,-40,-11,-35, 25,-42,-11, -5,-26, 15, 13,-18,-12,-42,-67,-62,  8;
/M: SY='Z';  M=-23,  2,-86,  6, 20,-84,-34,-11,-35,  7,-49,-23, -4,-27, 22, -4,-21,-25,-28,-37,-63, 28;
/M: SY='Q';  M=-19,  4,-83,  8, 22,-74,-30, 14,-40,-17,-41,-31, -4,-17, 44,-14,-26,-31,-28,-50,-60, 40;
/M: SY='B';  M=-16, 18,-78, 16,  5,-79,-21,-12,-40,  0,-56,-39, 15,-18, -6,-21, -7,-14,-25,-43,-62,  2;
/M: SY='I';  M= -1,-40,-17,-11, -9,-35,-10,-40, 22,-49,  4,  7,-38,-28,-37,-49,-29,-12,  0,-13,-49,-37;
/M: SY='Y';  M=-50,-40,-20,-70,-60, 40,-80,-10,-30,-60,-40,-60,-30,-80,-70,-70,-40,-40,-50,-20, 90,-60;
/M: SY='Y';  M=-50,-40,-20,-70,-60, 40,-80,-10,-30,-60,-40,-60,-30,-80,-70,-70,-40,-40,-50,-20, 90,-60;
/M: SY='L';  M=-22,-51,-50,-39,-33,-18,-39,-40, 19,-50, 33, 16,-46,-36,-34,-50,-41,-27,  0,-17,-44,-40;
/M: SY='T';  M= -3,  3,-57, -3,-11,-61,-21,-25,-21,  0,-46,-24, 10,-26,-17,-22,  7, 21,-20,-62,-44,-11;
/M: SY='F';  M=-45,-65,-82,-82,-78, 52,-61,-35,  3,-70, 14,  2,-49,-62,-63,-53,-41,-44,-26,-29, 12,-66;
/M: SY='K';  M=-40,-10,-90,-20,-20,-90,-40,-30,-40, 60,-50,  0,  0,-40,-10, 20,-20,-10,-50,-70,-60,-10;
/M: SY='I';  M=-11,-40,-22,-22,-17,-18,-33,-46, 52,-44,  6, 10,-34,-41,-40,-39,-36,-10, 17,-44,-39,-40;
/M: SY='Z';  M=-22,  6,-87,  7,  9,-71,-33, -8,-31, -6,-34,-23,  1,-30, 14,-20,-22,-23,-23,-42,-59, 16;
/M: SY='G';  M= -5,-10,-64,-11,-20,-64, 47,-47,-57,-27,-67,-43, -9,-31,-36,-49, -3,-19, -7, -9,-77,-19;
/M: SY='R';  M=-40,-30,-50,-50,-40,-60,-60,  0,-30, 20,-50,-20,-20,-20,  0, 70,-10,-30,-50,  0,-70,-10;
/M: SY='K';  M=-40,-14,-82,-26,-24,-84,-44,-24,-38, 52,-50, -4, -4,-36, -8, 30,-18,-14,-50,-57,-62,-10;
/M: SY='I';  M= -8,-42,-18,-16,-13,-28,-20,-42, 35,-48,  9, 11,-39,-35,-39,-46,-34,-13,  6,-19,-45,-40;
/M: SY='Z';  M= -7, 16,-78, 23, 31,-75,-20, -5,-31,-16,-49,-34,  6,-22, 21,-27,-13,-20,-17,-38,-55, 33;
/M: SY='A';  M= 24,-18,-23,-22,-24,-54,-12,-41,-21,-41,-47,-35,-15,-10,-31,-39,  9, 11, -2,-69,-44,-24;
/M: SY='E';  M=-10, 20,-90, 40, 60,-90,-20,-20,-30,-20,-60,-40,  0,-30, 20,-40,-20,-30,  0,  0,-60, 50;
/M: SY='I';  M=  0,-40,  0,  0,  0,-40,  0,-40, 30,-50,  0, 10,-40,-30,-40,-50,-30,-10,  0,  0,-50,-40;
/M: SY='I';  M=-17,-37,-43,-39,-32, -7,-55,-48, 55,-36,  6,  6,-27,-45,-38,-31,-32, -4, 22,-77,-32,-39;
/M: SY='A';  M= 21, -8,-40,-10,-15,-51, 18,-41,-37,-36,-51,-36, -6, -9,-28,-40, 13,  3, -7,-45,-57,-15;
/M: SY='T';  M= 10, -4,-23,-14,-24,-44, -9,-34,-27,-16,-46,-26,  6, -9,-30,-19, 31, 33,-21,-52,-40,-24;
/M: SY='P';  M=  6,-17,-50,-25,-22,-62,-24,-25,-32,-27,-39,-34,-15, 22, -9,-24,  4,  6,-21,-84,-62,-14;
/M: SY='L';  M=-44,-52,-61,-70,-60, 17,-74,-27, -7,-54, 18,-14,-42,-57,-47,-58,-46,-40,-21,-26, 15,-48;
/M: SY='D';  M= -3, 36,-83, 47, 36,-84,-10,-16,-35,-23,-64,-52, 19,-33,  1,-47, -9,-18,  0,-11,-65, 21;
/M: SY='Y';  M=-50,-40,-20,-70,-60, 40,-80,-10,-30,-60,-40,-60,-30,-80,-70,-70,-40,-40,-50,-20, 90,-60;
/M: SY='I';  M= -1,-34,-24,-19,-15,-25,-25,-44, 37,-44, -3,  2,-30,-33,-36,-40,-27, -6, 13,-49,-42,-34;
/M: SY='L';  M=-31,-51,-68,-57,-47,  0,-66,-44, 37,-46, 38, 16,-41,-44,-34,-41,-46,-27, 13,-52,-36,-40;
/M: SY='I';  M=-25,-50,-56,-46,-38, -8,-52,-43, 33,-47, 32, 15,-42,-41,-35,-44,-43,-24,  9,-39,-39,-40;
/M: SY='S';  M= 15,-10,-20,-18,-24,-51,-11,-35,-26,-32,-48,-34, -4,-11,-31,-30, 17, 14,-12,-57,-41,-24;
/M: SY='P';  M=  0,-30,-50,-40,-30,-70,-30,-20,-50,-40,-40,-50,-30, 70,-10,-20,  0,-20,-30,-90,-80,-20;
/M: SY='T';  M=  6,-16,-31,-15,-19,-41,  0,-41,-12,-31,-36,-21,-10,-20,-34,-34,  5,  8, -5,-41,-49,-26;
/M: SY='D';  M=-10, 50,-90, 60, 40,-90,-10,-10,-40,-20,-70,-60, 30,-40,  0,-50,-10,-20,  0,  0,-70, 20;
/M: SY='I';  M= -9,-40,-19,-19,-14,-21,-28,-45, 49,-45,  5, 10,-35,-39,-40,-41,-35,-10, 14,-37,-41,-40;
/M: SY='P';  M=  0,-30,-50,-40,-30,-70,-30,-20,-50,-40,-40,-50,-30, 70,-10,-20,  0,-20,-30,-90,-80,-20;
/M: SY='W';  M=-80,-70,  0,  0,  0,-20,  0,-40,-80,-70,-30,-70,-50,-90,-80,  0,-30,-80,  0,130,-20,-90;
/M: SY='F';  M=-40,-48,-53,-64,-54, 16,-72,-30,  6,-52, 12,-13,-38,-57,-47,-54,-44,-34,-14,-36, 12,-48;
/M: SY='K';  M=-28,-24,-80,-33,-28,-55,-44,-31,-18, 11,-15, 11,-16,-35,-10,-10,-21, -9,-24,-65,-54,-16;
/M: SY='K';  M=-24,-13,-79,-20,-12,-82,-37,-13,-43, 13,-42,-19,-11, -2, 12,  4,-17,-18,-42,-78,-68,  4;
/M: SY='K';  M=-23,-11,-71,-19,-15,-63,-29,-18,-37,  4,-45,-22, -8,-32, -2,-14,-17,-12,-35,-59,-45, -3;
/M: SY='P';  M= -1,-24,-55,-31,-20,-72,-29,-20,-48,-38,-42,-49,-27, 58, -7,-22, -2,-21,-27,-80,-78,-12;
/M: SY='L';  M=-40,-60,-90,-70,-60,  0,-70,-40, 10,-50, 60, 20,-50,-40,-30,-50,-50,-40,  0,-30,-40,-40;
/M: SY='Z';  M=-14, 12,-90, 23, 43,-86,-28, -3,-34,-16,-47,-32, -4,-22, 41,-23,-24,-30,-17,-34,-64, 50;
/M: SY='L';  M=-40,-60,-90,-70,-60,  0,-70,-40, 10,-50, 60, 20,-50,-40,-30,-50,-50,-40,  0,-30,-40,-40;
/M: SY='T';  M= 10,-10,-40,-20,-30,-50,-20,-40,-10,-10,-40,-20,  0,-20,-30,-30, 20, 50,-10,-80,-40,-30;
/M: SY='I';  M=-14,-38,-33,-32,-25,-11,-47,-48, 57,-39,  4,  8,-29,-44,-39,-33,-34, -5, 22,-66,-34,-39;
/M: SY='K';  M=-40,-31,-90,-41,-37,-52,-53,-34,-19, 14, -4,  8,-21,-40,-18, -9,-33,-23,-29,-53,-52,-23;
/M: SY='I';  M=-18,-47,-40,-33,-27,-17,-38,-42, 33,-48, 22, 13,-41,-38,-37,-45,-39,-20,  7,-30,-42,-40;
/M: SY='P';  M= -4,  5,-68,  4,  1,-79,-21,-16,-46,-31,-53,-54, -4, 22, -6,-33, -4,-20,-17,-50,-76, -2;
/M: SY='L';  M=-21,-45,-50,-40,-35,-16,-41,-40, 16,-45, 24, 10,-38,-34,-34,-43,-32,-21,  0,-28,-42,-38;
/M: SY='Z';  M=-17,  9,-87, 16, 34,-81,-32,  7,-36,-16,-43,-31, -4,-19, 45,-17,-26,-31,-23,-43,-62, 47;
/M: SY='E';  M=-12, 16,-79, 25, 33,-82,-20,-17,-35,-10,-56,-35,  4,-27, 12,-26,-12,-20,-14,-20,-60, 30;
/M: SY='Y';  M=-35,-25,-61,-39,-25,-18,-61, -1,-29,-37,-22,-31,-24,-44, -3,-36,-37,-36,-39,-48,  2, -9;
/M: SY='Q';  M=-27, -2,-90, -4,  8,-85,-38, -2,-39, 16,-40,-14, -5,-23, 36,  4,-25,-22,-41,-70,-65, 27;
/M: SY='Z';  M=-17, 13,-74, 19, 22,-71,-22,  0,-35,-15,-56,-41,  8,-28,  8,-20,-14,-26,-17,-12,-52, 24;
/M: SY='R';  M=-15,-15,-55,-27,-26,-61,-37,-20,-23,  7,-43,-18, -7,-21, -7,  9,  0,  9,-30,-55,-55,-12;
/M: SY='L';  M=-34,-54,-76,-62,-52,  0,-67,-43, 27,-47, 46, 17,-44,-43,-33,-44,-47,-32,  8,-44,-37,-40;
/M: SY='L';  M=-32,-55,-71,-56,-48, -6,-59,-41, 21,-49, 45, 17,-46,-40,-33,-47,-46,-32,  4,-32,-40,-40;
/M: SY='N';  M=-12,  6,-51, -3,-14,-54,-21, -3,-35,  0,-46,-27, 16,-20, -9, -8,  6,  3,-35,-53,-40, -7;
/M: SY='Z';  M=-16,  9,-78,  9, 13,-75,-27, -5,-32,  2,-45,-25,  7,-25, 18,-13,-12,-12,-29,-54,-55, 21;
/M: SY='T';  M= 14, -7,-30,-15,-24,-47,-11,-37,-21,-17,-43,-25,  2,-11,-29,-25, 25, 35,-15,-64,-41,-24;
/M: SY='T';  M=  6, -6,-48,-11,-16,-38,-21,-27, -2,-23,-28,-14,  1,-24,-23,-30, -1,  7, -5,-72,-41,-17;
/M: SY='L';  M=-37,-57,-83,-66,-56,  0,-69,-41, 18,-49, 53, 19,-47,-41,-31,-47,-49,-36,  4,-37,-39,-40;
/M: SY='S';  M=  4, -7,-37,-13,-15,-56, -2,-30,-42,-27,-51,-38, -4,  8,-21,-24, 17,  2,-21,-41,-57,-13;
/M: SY='K';  M=-16, -6,-70, -9, -8,-76,-12,-31,-43,  5,-54,-26, -5,-17,-13,-14, -7,-13,-27,-43,-64, -4;
/M: SY='Z';  M=-17, 12,-84, 18, 27,-84,-26,-12,-36, -2,-51,-29,  2,-26, 20,-18,-16,-21,-21,-35,-62, 29;
/M: SY='G';  M=-15, -8,-70,-11,-12,-47,  3,-23,-44,-37,-51,-42,-10,-35,-15,-45,-16,-27,-18,-23,-50, -7;
/M: SY='K';  M=-37, -9,-90,-17,-15,-89,-40,-23,-40, 51,-47, -3, -1,-36,  1, 17,-21,-13,-49,-71,-61, -2;
/M: SY='Z';  M=-20, -7,-82, -2, 14,-65,-37,-18,-15, -8,-30, -6,-12,-31, 17,-18,-27,-24,-11,-51,-59, 20;
/M: SY='Q';  M=-30,-11,-77,-16, -4,-62,-45, -9,-32, -1,-38,-21,-12,-32, 11, -5,-26,-27,-34,-42,-45, 10;
/M: SY='L';  M=-40,-60,-90,-70,-60,  0,-70,-40, 10,-50, 60, 20,-50,-40,-30,-50,-50,-40,  0,-30,-40,-40;
/M: SY='K';  M=-24, -8,-83,-14, -9,-82,-34,-19,-37, 29,-44, -9, -4,-27,  9,  7,-18,-12,-40,-74,-61,  5;
/M: SY='K';  M=-18,  1,-67, -7,-11,-71,-28,-17,-33, 15,-49,-21,  6,-27, -7,  1, -4, -3,-34,-50,-55, -5;
/M: SY='L';  M=-38,-58,-85,-67,-57,  0,-69,-41, 16,-49, 55, 19,-48,-41,-31,-48,-49,-37,  3,-35,-39,-40;
/M: SY='F';  M=-46,-66,-84,-82,-79, 50,-64,-34,  4,-75, 23, -5,-50,-59,-61,-56,-44,-46,-25,-24, 10,-65;
/M: SY='D';  M=-11,  2,-62, 10,  4,-53,-23,-27, -9,-30,-29,-25, -3,-34,-17,-42,-16,-14,  0,-21,-53, -8;
/M: SY='K';  M=-32, -9,-85,-17,-16,-85,-38,-24,-37, 43,-46, -5, -1,-34, -2, 12,-17, -6,-45,-72,-59, -4;
/M: SY='Y';  M=-50,-43,-26,-72,-63, 44,-78,-12,-27,-63,-36,-56,-32,-79,-71,-69,-40,-41,-49,-20, 85,-62;
/M: SY='D';  M=-10, 39,-81, 44, 28,-80,-13, -4,-39,-16,-61,-50, 26,-32,  6,-37, -7,-16,-12,-19,-63, 19;
/M: SY='A';  M= 15, 13,-53, 10, -2,-56, -6,-19,-25,-23,-47,-36, 14,-16,-15,-35,  8,  7,-13,-60,-46, -5;
/M: SY='L';  M=-40,-60,-90,-70,-60,  0,-70,-40, 10,-50, 60, 20,-50,-40,-30,-50,-50,-40,  0,-30,-40,-40;
/M: SY='W';  M=-80,-70,  0,  0,  0,-20,  0,-40,-80,-70,-30,-70,-50,-90,-80,  0,-30,-80,  0,130,-20,-90;
/M: SY='Q';  M=-20,  0,-90,  0, 20,-80,-40, 20,-40,-10,-30,-20,-10,-10, 70,  0,-30,-30,-40,-80,-70, 50;
/M: SY='H';  M=-28,-10,-34,-20,-24,-53,-39, 21,-44,-23,-48,-40,  1,-21, -1, -6,-13,-24,-34,-42,-31, -6;
/M: SY='W';  M=-80,-70,  0,  0,  0,-20,  0,-40,-80,-70,-30,-70,-50,-90,-80,  0,-30,-80,  0,130,-20,-90;
/M: SY='E';  M=-10, 24,-90, 43, 57,-90,-19,-19,-31,-20,-61,-43,  4,-31, 17,-41,-19,-29,  0,  0,-61, 46;
/M: SY='N';  M=-10, 40,-60, 30,  0,-50,-10, 20,-30,  0,-50,-40, 50,-30,-10,-20, 10,  0,-40,-50,-30,  0;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_06 which contains 572'619 sequence entries.

Total number of hits	5 in 5 different sequences
Number of true positive hits	5 in 5 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Peptidase A9
Version [info]	4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

5 sequences

POL_FFV (O93209), POL_FOAMV   (P14350), POL_SFV1(P23074),

POL_SFV3L   (P27401), POL_SFVCP   (Q87040)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

1 PDB

2JYS