PROSITE entry PS51539

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	AV_PCP_ALPHA
Accession [info]	PS51539
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-MAY-2011 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51539
Associated ProRule [info]	PRU00872

Name and characterization of the entry

Description [info]

Arterivirus papain-like cysteine protease alpha (PCPalpha) domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=111;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=106;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.9728270; R2=0.0241619; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3410.5651855; R2=9.3043480; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.1%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=229; H_SCORE=5541; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=146; H_SCORE=4769; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-11; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='S';  M=  1,  4,-23,  9, 22,-24, -9, -6,-24,  4,-30,-20,  6,-10,  9, -6, 23,  1,-24,-30,-20, 17;
/M: SY='C';  M= -3,-21, 22,-26,-26,-29, -2,-24,-24,-21,-24,-26,-21,  4,-21,-29, -7,-13,-19,-29,-26,-26;
/M: SY='L';  M= -6,-22,-17,-24,-17,-14,-24,-19,  3,-10,  4,  0,-18,-21, -9, -3, -8, -3,  3,-27,-14,-14;
/M: SY='P';  M=-10,-11,-33, -9,  7,-37,-20,-14,-30, -4,-30,-27,-14, 54, -1,-14, -7,-10,-23,-37,-27,  4;
/M: SY='G';  M=  8,-18,-18,-18,-21,-22, 22,-23,-14,-18,-22,-14,-18,-18,-18,-21, -4,-10, -4,-30,-22,-18;
/M: SY='G';  M= -3,-10,-33,-13,-14,-30, 37,-14,-37, -9,-34,-27, -7,-20,-11,  3, -3,-17,-30,-30,-27,-14;
/M: SY='Y';  M= -7,-22,-16,-24,-14,  1,-23, 18, -9,-17, -7, -6,-16,-23, -9,-12,-13,-14, -9,-11, 19,-14;
/M: SY='C';  M= -3,-21, 56,-31,-26,-23,-27,-24,-16, -7,-16,-20,-21,-24,-19,-23, -7,-10,-13,-23,-20,-26;
/M: SY='W';  M= -7,-31,-14,-39,-24, 16,-21,-17,-11,-24,-14,-11,-31,-31,-20,-24,-16,-19,-16, 37, 11,-24;
/M: SY='L';  M=-20,-40,-10,-40,-30,  0,-40,-30, 20,-30, 40, 20,-40,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,-10,-30;
/M: SY='S';  M= -1, -6,-19, -3,  6,-17,-17,-13, -6, -6,-16,-11, -4,-16, -3,-13, 12, -1, -9,-27,-17,  3;
/M: SY='G';  M=  6,-18,-21,-18,-18,-19, 22,-20,-19,-18,-19,  0,-15,-21,-12,-18, -4,-13,-12,-27,-22,-18;
/M: SY='I';  M=-16,-33,-13,-36,-30,  3,-37,-27, 23,-30,  9,  1,-33,-33,-27,-30,-23,-16, 13, 14, -1,-30;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='Y';  M=-14,-21,-14,-24,-16, 28,-21,  8, -5,-16, -5, -5,-16,-24,-16,-16,-14,-14, -7, 12, 42,-16; D=-12;
/I:         I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
/M: SY='P';  M= -7,-11,-24,-14, -4,-26,-14, -9,-21,  1,-19,-19, -9, 29, -1,  8, -7, -7,-17,-26,-19, -4; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='I';  M=  7,-19, -4,-19,-16, -6,-17,-19, 14,-16,  3,  1,-19,-16,-16,-16, -6, -4, 13,-17,-10,-16; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='A';  M= 29,-14,  0,-14, -7,-14,  0,-14, -7, -7,-14, -7,-14, -7, -7, -7,  7,  0,  0,-21,-14, -7; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='R';  M=-10,-10,-34,-17,  0,-33,-20, -9,-30, 20,-26,-23, -6, 11,  4, 26, -7,-10,-24,-33,-23,  0;
/M: SY='M';  M= -7,-30,-14,-30,-26, -3,-33,-26, 24,-23, 17, 32,-26,-27,-14,-26,-20, -7, 24,-23,-10,-23;
/M: SY='T';  M=  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 10, 50,  0,-30,-20,-10;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='S';  M= -1, -9,-10, -9, -6,  0, -9,  1,-11, -6,-16,-11, -1,-13, -6,-10, 12, -1,-11, -7, 11, -6; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-30,-30,-20;
/M: SY='N';  M=-17, 19,-33,  1,  0,-30,-13,  7,-30,  6,-34,-20, 43,-20,  3, 17,  4, -3,-30,-37,-20,  0;
/M: SY='Y';  M=-17,-17,-23,-22, -9, -2,-27, 14,-14,  0,-10, -9,-12,-22, -5, -4,-14,-15,-13,-11, 16, -9;
/M: SY='N';  M=-20, 13,-27, -4, -9, -4,-16,  4,-21, -9,-29,-14, 34,-26, -9, -9,  1, -6,-24,-26, -6, -9;
/M: SY='F';  M=-17,-27,-23,-34,-24, 31,-27,-13, -9,-24, -9, -9,-27, -6,-24,-27,-17,-17,-13, -4, 13,-24;
/M: SY='Q';  M=-16,-20,-21,-20, -6, -4,-29,  1,-10,-10,  0,  3,-17,-21, 14, -7,-14,-13, -9, -9,  8, -1;
/M: SY='C';  M=  4,-10,  8,-10,  5,-25,-18,-11,-20, -6,-20,-14,-13,-16,  8,-11, -1, -8,-16,-25,-20,  4;
/M: SY='R';  M=-13,-16,-29,-23, -6,-21,-26,-11,-16, 14, -6, -9,-11,-20,  1, 26,-13,-10,-16,-27,-17, -6;
/M: SY='L';  M=-15,-32,-18,-32,-22,-11,-32,-25,  4,-22, 16, 14,-30,  1,-13,-20,-22,-10,  1,-26,-16,-22;
/M: SY='Q';  M=-13,-11,-20,-16, -9,-17,-26,-10, -3,-10, -1,  3, -5,-20,  7, -9,-11, -6, -1,-27,-15, -4;
/M: SY='H';  M=-15,-14,-30,-22, -9, -7,-22, 15,-23, -8,-21,-18, -9,  4, -5,  0,-12,-15,-23,-21,  0, -9;
/M: SY='V';  M= -3,-27,-16,-27,-24,-19,-27,-27, 13,-17, -1, -1,-27,  8,-17,-27,-17, -3, 23,-33,-16,-17;
/M: SY='A';  M= 31,-14, -3,-14, -7,-20,  0,-17,-13, -7,-23,-13,-11,-10, -7,-10, 19,  3, -6,-30,-20, -7;
/M: SY='F';  M= -1,-21,-14,-27,-19, 26,-17,-12, -7,-19,-11, -7,-19,-27,-19,-21,  0, -9,-10, -7,  8,-19;
/M: SY='V';  M=  9,-19,-13,-17, -7,-17,-19,-21,  6,-11, -7, -2,-21,-15, -9,-18, -7, -2, 14,-30,-15, -5;
/M: SY='I';  M= -8,-21,-16,-21,-16,-11,-32,-19, 18,-16,  6,  7,-21,-22, -2,-19,-14, -8, 18,-22,-13,-11;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='Y';  M=-20,-36,-14,-36,-26, 13,-36, -8,  7,-26, 18,  7,-31,-30,-20,-20,-26,-14,  1, -3, 24,-26;
/M: SY='R';  M=  4,-13,-29,-20, -3,-27,-14, -6,-24, 11,-20,-17, -6,-17,  4, 40, -4, -7,-21,-30,-20, -3;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='G';  M=  0,-11,-11,-11,-14,-11,  9,-14, -3,-11, -9, -6,-11,-11,-11,-14, -6, -6,  3,-17,-11,-11; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='V';  M=  0,-17, -6,-17,-17, -6,-17,-17, 17,-11,  6,  6,-17,-11,-11,-17,-11,  0, 23,-17, -6,-11; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='D';  M= -5, 16,-29, 26, 14,-33,-11, -6,-26, -4,-30,-17,  1,-15, 15, -9,  2, -8,-21,-37,-25, 11;
/M: SY='G';  M= 11,-13,-21,-13,-17,-27, 43,-20,-31,-17,-34,-24,-13,-17,-17,-17,  3,-14,-21,-30,-27,-17;
/M: SY='Q';  M=-13,  9,-36,  9, 12,-33,-17, -3,-30, 16,-28,-19,  3,-16, 18, 18, -3,-10,-26,-34,-23, 11;
/M: SY='L';  M=-20,-40,-10,-40,-30,  0,-40,-30, 20,-30, 40, 20,-40,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,-10,-30;
/M: SY='T';  M= 11,-13, -7,-13,-10,-20,-14,-20,-10,-10,-13,-10, -6,-10,-10,-10, 10, 36,  0,-30,-20,-10;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='R';  M= -5, -1,-20, -1, 11,-15,-10,  0,-15,  8,-12,-10,  0, -8,  7, 17, -3, -5,-15,-15,-10,  9; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='P';  M= -7, -3,-24, -3, 10,-24,-14, -8,-21, 10,-21,-17, -6, 18,  4, -1, -3, -7,-17,-24,-17,  8; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='E';  M=  3,  1,-20,  6, 23,-19,-10, -4,-17,  3,-19,-12, -4, -7,  8, -2,  2, -5,-15,-21,-14, 18; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='F';  M=-11,-12,-18,-12,  1,  5,-21, -9, -4,-10,  0, -1,-15,-18, -5,-11,-11, -9, -9,-11, -1, -2; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='Q';  M= -4, -1,-18,  2, 12,-19,-14, -4,-16,  1,-14, -7,  0, -7, 14, -1,  3, 10,-11,-19,-14, 12; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='P';  M= -3,-19,-13,-19,-16,-16,-19,-19,  4,-11, -4, -4,-19, 14,-11,-19,-11, -3, 12,-24,-13,-11; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='Y';  M=-14,-24,-11,-24,-17, 13,-24,  0,  1,-17,  7,  1,-20,-21,-14,-14,-17,-11, -1,  3, 27,-17; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='P';  M= -3, -4,-19, -1,  8,-22,-10, -8,-19, -1,-21,-17, -3, 18,  1, -8,  6, -3,-16,-24,-17,  6; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='R';  M= -4, -7,-26,-11, -6,-21,  8, -6,-24,  3,-20,-17, -3,-14, -1, 20, -4,-10,-21,-21,-17, -6; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='G';  M=  0, -7,-21, -7,-14,-21, 43,-14,-29,-14,-29,-21, -7,-14,-14,-14,  0,-14,-21,-21,-21,-14; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='C';  M= -6,-21, 33,-26,-23,  0,-21, -7, -7,-19, -7,-11,-19,-21,-19,-23,-10,-10, -7, -3, 11,-23; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='R';  M= -4, -7,-26,-11, -6,-21,  8, -6,-24,  3,-20,-17, -3,-14, -1, 20, -4,-10,-21,-21,-17, -6; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='W';  M=-13,-26,-11,-30,-21,  1,-21,-17,  0,-19, -6, -6,-26,-23,-14,-21,-19,-13, -2, 35,  6,-19; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='Y';  M=-11,-21,-11,-21,-17, 13,-24,  0,  7,-17,  1, -1,-17,-21,-17,-17,-14,-11,  4,  3, 27,-17; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='P';  M= -7,-14,-21,-14, -7,-29,-14,-14,-21, -7,-21,-21,-14, 57, -7,-14, -7, -7,-14,-29,-21, -7; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='C';  M= -4,-21, 21,-24,-24, -6,-26,-21, 14,-21,  6, -1,-21,-21,-21,-24,-11, -7, 10,-14,-10,-24; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='W';  M= -9,-20,-10,-23,-17, -4,-19,-16, -2,-15, -6, -6,-18,-18,-12,-17,-11,  2,  0, 16, -1,-15; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='G';  M=  0, -7,-21, -7,-14,-21, 43,-14,-29,-14,-29,-21, -7,-14,-14,-14,  0,-14,-21,-21,-21,-14; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='P';  M= -7,-14,-21,-14, -7,-29,-14,-14,-21, -7,-21,-21,-14, 57, -7,-14, -7, -7,-14,-29,-21, -7; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='V';  M= -9,-21,-16,-24,-21, -7,-30,  1, 16,-20,  1,  1,-19,-23,-14,-21,-17, -9, 17,-24, -1,-17;
/M: SY='P';  M=-13,-17,-27,-14,  1,-26,-26,-17,-16,-10,-10,-13,-20, 23, -4,-14,-13,-10,-14,-31,-21, -2;
/M: SY='G';  M=  9, -7,-24, -4,  3,-27, 20,-14,-29, -9,-31,-21,-10,-14, -6,-11,  3,-11,-21,-30,-24,  0;
/M: SY='A';  M= 21,-24, -4,-24,-19,-13,-15,-24,  9,-17, -5, -1,-24,-17,-17,-19, -3, -2, 15,-28,-16,-17;
/M: SY='A';  M= 20,-17, -6,-17,-13,-17, -9,-20, -1,-10,-14, -7,-14,-13,-10,-16, 10,  3,  6,-30,-17,-10;
/M: SY='V';  M= -4,-27,-16,-27,-27,-13, -7,-27,  8,-22,  2,  1,-27,-22,-20,-25,-17, -8, 13,-28,-16,-22;
/M: SY='Y';  M=-20,-30,-20,-35,-25, 45,-30,  5, -5,-25, -5, -5,-25,-35,-25,-25,-20,-20,-10, 15, 50,-25;
/M: SY='I';  M=  9,-29, -6,-29,-21, -9,-23,-26, 13,-21,  8,  4,-29,-21,-19,-19,-10, -6, 11,-24,-14,-21;
/M: SY='N';  M= -3, 13,-19,  4,  0,-24, -4, -1,-24,  0,-34,-20, 32,-14,  0, -6, 27,  6,-24,-34,-20,  0;
/M: SY='P';  M=  8,-13,-13,-13, -8,-26,-11,-18,-18, -8,-22,-18, -8, 16, -8,-13, 11, 13,-10,-33,-23, -8;
/M: SY='A';  M=  2, -9,-16, -4,-10,-19,-18,-21, -1,-16, -6, -5,-18,-19,-11,-19, -8, -5,  2,-34,-19,-11;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,-10,  0,-10,-20, 80,-30,-10,-30,-20, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-20, 20,  0;
/M: SY='V';  M= 11,-27, -7,-27,-24,-13,-21,-27, 19,-17,  1,  4,-27,-17,-17,-24,-11,  0, 29,-30,-13,-17;
/M: SY='S';  M=  7, -3,-16, -3, -6,-23, 17,-13,-26, -6,-33,-23,  4,-13, -6,-13, 29,  1,-23,-30,-23, -6;
/M: SY='D';  M=  0,  9,-29, 14,  6,-31,-10,-10,-24, -1,-29,-21, -1,-17,  0,  6,  0, -7,-21,-39,-24,  1;
/M: SY='K';  M=-13, 14,-35, 17, 22,-33,-17, -8,-30, 24,-33,-23,  3,-13,  9,  4,  0,-10,-25,-36,-23, 17;
/M: SY='P';  M=-16,-23,-30,-29,-13,-23,-23,-14,-27, -7,-24,-24,-20, 17, -7,  0,-16,-16,-26,  3,-13,-13;
/M: SY='F';  M=-20,-30,-20,-40,-30, 60,-30,-10,  0,-30,  0,  0,-30,-40,-30,-30,-20,-20,-10, 10, 30,-30;
/M: SY='P';  M=-10,-11,-33, -9,  7,-37,-20,-14,-30, -4,-30,-27,-14, 54, -1,-14, -7,-10,-23,-37,-27,  4;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 60,-20,-40,-20,-40,-30,-10,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-30,-30,-20;
/M: SY='A';  M= 31,-22, 20,-24,-17,-20, -7,-22,-10,-14,-18,-12,-22,-14,-14,-17,  6, -2, -2,-28,-20,-17;
/M: SY='T';  M= -3,-10,-19,-13, -7,-23,-20,-14,-16, -1,-13,-13,  0,-13, -4, 10,  4, 33, -9,-30,-20, -7;
/M: SY='H';  M=-20, -9,-27,-19, -9, 10,-23, 54,-21,-16,-21,-14, -1,-26, -1, -9,-13,-20,-24,-11, 23, -9;
/M: SY='A';  M= 23,-24, -4,-24,-19,-16,-13,-24,  7,-14, -7, -1,-24,-14,-14,-19, -3,  0, 17,-30,-16,-14;
/M: SY='L';  M=-17,-37,-10,-37,-30,  0,-40,-30, 26,-30, 34, 17,-37,-30,-23,-23,-27,-10, 16,-20,-10,-30;
/M: SY='T';  M=  2,-13,-10,-13,-13,-17,-18,-21, -1,-11, -9, -7, -6,-13,-11,-16,  8, 27,  7,-30,-17,-11;
/M: SY='N';  M=-17,  7,-30, -4, -3,-27,-16, 21,-30, -6,-34,-23, 23,  8,  0, -6, -1, -9,-27,-34,-11, -3;
/M: SY='I';  M=-11,-34,-10,-34,-30, -3,-37,-30, 29,-27, 26, 14,-34,-27,-23,-26,-24, -7, 24,-23,-10,-27;
/M: SY='P';  M=-10,-20,-27,-20,-16,-17,  0, -9,-27,-16,-27,-24,-17, 20,-16,-20,-10,-16,-20,-20, -2,-16;
/M: SY='A';  M=  6,-23, -7,-23,-16,-11,-17,-21,  0,-16,  3,  0,-20,-19,-11,-14,  1, -1, -1,-26,-16,-16;
/M: SY='P';  M=-16, -9,-27,-14,-10,-17,-20,  0,-24,-10,-27,-21,  3, 20,-10,-14, -7,-10,-20,-23,  1,-10;
/M: SY='Q';  M=  7, -9,-21, -9,  0,-27,  8, -7,-27, -4,-26,-11, -9,-13, 17, -4,  3,-10,-17,-26,-23,  4;
/M: SY='W';  M=-13,-16,-29,-21,-10,-19,  0, -9,-30, -8,-26,-18,-14,-23,  4,  1,-11,-19,-28,  9,-11, -8;
/M: SY='P';  M=-10,-17,-24,-20,-13,-23,-23,  6,-13,-13,-19,-16,-14, 23, -7,-17,-13,-10, -6,-31,-10,-10;
/M: SY='E';  M= -9,-14,-23,-14,  1,-18,-27,-17, -2,  1, -3, -3,-17,-17, -2, -9,-12, -7,  1,-28,-15,  1;
/M: SY='R';  M= -4, -9,-29,-14, -2,-29,-14, -7,-27,  8,-25,-22, -1,  4,  3, 23,  4, -4,-25,-32,-22, -2;
/M: SY='P';  M=-10, -9,-32, -9,  7,-36,-20,-14,-30,  7,-30,-26,-11, 41,  1, -7, -6,-10,-22,-36,-26,  5;
/M: SY='T';  M=  7, -2,-18,  2, -6,-26,  5,-18,-21,-12,-26,-19, -6,-14,-10,-14,  6,  8,-13,-34,-24, -8;
/M: SY='T';  M=  3,-24, -9,-26,-19,  1,-21,-20, -1,-19,  0, -1,-21,-21,-16,-16, -5,  8,  0,-19, -7,-19;
/M: SY='C';  M= -9,-13, 27,-23,-26,-17,-27,-19, -1,-21,-10,-11, -4,-27,-21,-26, -7, -7, -4,-26,-17,-26;
/M: SY='P';  M= -4,-14,-24,-14, -7,-34,-14,-17,-27, -7,-30,-27,-11, 54, -7,-17,  4, -4,-20,-37,-27, -7;
/M: SY='F';  M=-20,-33,-17,-40,-30, 43,-33,-16,  6,-30, 11,  6,-33,-37,-27,-27,-23,-17, -4,  1, 19,-30;
/M: SY='N';  M= -8,  2,-22, -1,  2,-19,-18, -8, -8, -6,-19,-11, 11,-19, -4,-11,  6, -3,-11,-30,-17,  0;
/M: SY='T';  M= -4, -9,  4, -7,-15,-22,-23,-23, -3,-17,-11,-11,-13,-19,-15,-24, -5, 10,  3,-32,-19,-15;
/M: SY='T';  M= 17,-14, -6,-14,-10,-20,-11,-20,-10,-10,-14,-10, -9,-10,-10,-10, 10, 28,  0,-30,-20,-10;
/M: SY='T';  M= -4,-14,-24,-16,-13,-21,  1,-16,-19, -8,-14, -3, -7,-19, -6,  0, -4,  4,-13,-28,-21,-13;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_06 which contains 572'619 sequence entries.

Total number of hits	12 in 12 different sequences
Number of true positive hits	12 in 12 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Peptidase C31
Version [info]	4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

12 sequences

1ATF_PRRSS  (P0DJY0), RPOA_EAVBU  (P19811), RPOA_LDVC   (Q06502),

RPOA_LDVP   (Q83017), RPOA_PRRS1  (Q9YN02), RPOA_PRRSB  (Q8B912), 
RPOA_PRRSL  (Q04561), RPOA_PRRSR  (Q9WJB2), RPOA_PRRSS  (A0MD28), 
RPOA_PRRSV  (A6YQT5), RPOA_SHFV   (Q68772), RPOTF_PRRSL (P0DJZ9)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment