PROSITE entry PS51540

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	AV_PCP_BETA
Accession [info]	PS51540
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-MAY-2011 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51539
Associated ProRule [info]	PRU00873

Name and characterization of the entry

Description [info]

Arterivirus papain-like cysteine protease beta (PCPbeta) domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=114;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=109;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.0472593; R2=0.0134401; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8240.9267578; R2=3.2376945; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=406; H_SCORE=9555; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=257; H_SCORE=9073; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-23; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D';  M=-30, 28,-56, 40, -6,-46,-34,-19,-47,-19,-38,-34, 21,-37,-14,-27,-11,-17,-41,-68,-46, -9;
/M: SY='Q';  M= -9, 11,-42, 17,  7,-48,-28,-14,-46, -4,-46,-28,  8,-28, 18,-14, 15, 14,-34,-58,-38, 10;
/M: SY='T';  M=-17,-27,-39,-27, -5, -9,-46,-24,-16,-20,-23,-12,-28,-36,-15,-28,-13,  7,  0,-41,-20,-11;
/M: SY='Q';  M=-15,-12,-59,-10, 25,-54,-40, -9,-52, 25,-47,-29,-11,  8, 31,  2,-12,-17,-40,-57,-44, 26;
/M: SY='D';  M=-33, 12,-62, 30, -6, -8,-40, 12,-52,-26,-47,-39, -4,-40,-16,-29,-20,-28,-47,-49,-13,-11;
/M: SY='G';  M=  5,-15,-49,-25,-32,-55, 63,-35,-62,-25,-62,-45, -5,-42,-32,-35, 12,-17,-52,-60,-52,-32;
/M: SY='K';  M=-27,-13,-52,-25,-19,-10,-36, -6,-41, 14,-33,-24,  1,-38, -6, 12,-16,-18,-37,-43,-18,-16;
/M: SY='C';  M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70;
/M: SY='W';  M=-50,-80,-50,-80,-60,  0,-60,-40,-50,-60,-40,-30,-70,-70,-40,-50,-60,-50,-50,160, 30,-50;
/M: SY='L';  M=-32,-51,-45,-48,-22,-16,-60,-34,-17,-31,  5, -2,-49,-46,-21,-34,-36,-32,-17, -1,-17,-20;
/M: SY='K';  M=-14,-12,-60,-22,  6,-50,-32, -8,-50, 69,-40,-30, -2,-22, 18, 43,-12,-12,-40,-58,-40,  8;
/M: SY='L';  M=-25,-67,-27,-67,-55, -5,-67,-50, 25,-40, 47, 25,-57,-47,-40,-40,-37,-22, 26,-43,-23,-47;
/M: SY='F';  M=-37,-63,-37,-63,-60, 72,-63,-28, -2,-47, 17,  8,-60,-57,-47,-47,-40,-37,-12,-11, 23,-57;
/M: SY='P';  M=-17, -4,-65, 12, 16,-60,-43,-25,-57,-12,-57,-44,-19, 49, -9,-25,-15,-25,-44,-70,-57,  8;
/M: SY='D';  M=-13, 19,-56, 39,  2,-56,-31,-26,-58,-18,-58,-48,  1, 14,-16,-28,  5,-14,-48,-73,-53, -3;
/M: SY='H';  M=-25,-10,-59,  0,-12,-36,-46,  7,-43,-22,-31,-30,-14, -3,-16,-24,-22,-27,-37,-58,-27,-13;
/M: SY='S';  M= 11,-21,-38,-25,-14,-47,-25,-21,-43, -1,-40,-30,-16, 11,-11,  6, 13, -7,-30,-57,-42,-12;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='R';  M=  6,-16,-31,-19, -2,-36,-20, -6,-33, 10,-28,-16,-11,-18, 17, 19, -2, -8,-23,-36,-29,  6; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='C';  M=-15, -2,  4, -9,  1,-41,-30,-17,-36,-13,-38,-28,  4,-31, -5,-21, -6,-11,-28,-46,-36, -4; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='E';  M=  8,-17, -8,-14, 18,-50,-33,-24,-42,-12,-45,-32,-25,-26, -2,-27, -4,-14,-27,-55,-47,  8;
/M: SY='E';  M=-14,  2,-67,  6, 46,-60, -3,-11,-63, -1,-63,-43,-10,-28, 10,-18,-10,-23,-46,-60,-53, 32;
/M: SY='L';  M= -3,-57,-22,-59,-49,-13,-51,-47, 18,-34, 27, 14,-52,-39,-37,-40,-24,-20, 11,-45,-28,-44;
/M: SY='R';  M=-23,  4,-54,  7, -4,-50,-35,-12,-49,  7,-46,-34,  0,-30,  0, 33, -8,  3,-36,-58,-43, -2;
/M: SY='L';  M=-23,-45,-34,-50,-40,-20,-54,-34, -5,-18, 17,  8,-35,-41,-22, -7,-22, -3, -3,-44,-27,-32;
/M: SY='A';  M= 39,-36,-21,-38,-28,-18,-17,-13,-30,-18,-27,-23,-33,-24,-23,-33,  6, -8,-16,-28,  2,-26;
/M: SY='N';  M=-21, 13,-49, 12,-13,-27,-29,  1,-50,-19,-47,-40, 16,-38,-13,-26,  7, -9,-43,-42, -1,-13;
/M: SY='N';  M=-21,  4,-46, -9, -3,-51,-29, -2,-46, 10,-43,-24, 23,-33, 20, 19,  0, 11,-34,-53,-36,  4;
/M: SY='F';  M=-32,-43,-46,-49,-38, 39,-52, 14,-16,-33, -6, 13,-35,-49,-22,-31,-32,-29,-20,-19, 18,-35;
/M: SY='G';  M=-11,-28,-57,-38,-43,-32, 48,-20,-59,-33,-56,-44,-18,-53,-37,-40,-16,-30,-52,-35,-12,-40;
/M: SY='Y';  M=-37,-42,-53,-52,-39, 15,-54, 22,-36,-20,-26,-30,-32,-52,-19, -3,-27,-27,-33,  8, 68,-29;
/M: SY='Q';  M=-23, -7,-58, -7, 33,-53,-40,  4,-53, 20,-46,-24, -6,-27, 52, 26,-13,-16,-40,-48,-38, 39;
/M: SY='T';  M=-12,-24,-31,-29,-15,-34,-42,-23,-19, -8,-12, -1,-14,-35, 11,-16, -2, 30, -9,-45,-28, -7;
/M: SY='R';  M=-20, -7,-58,-16, -8,-55,-34,-11,-52, 21,-47,-35,  7, 10, -1, 22,-11,-16,-42,-62,-45, -5;
/M: SY='T';  M= 10,-27,  6,-34,-27,-36,-31, -6,-32,-21,-34,-24,-17,-34,-17,-27,  2, 11,-18,-48,-24,-27;
/M: SY='G';  M=  0,-20,-60,-30,-40,-60, 90,-40,-70,-30,-70,-50,-10,-50,-40,-40,-10,-30,-60,-60,-60,-40;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='V';  M=-16,-63,-23,-63,-46,-14,-63,-50, 34,-40, 24, 16,-53,-43,-40,-40,-33, -8, 53,-47,-27,-43;
/M: SY='S';  M= 13,-13,-35,-18, -1,-38,-21, 15,-44, -3,-40,-25, -3,-24, 14,-11, 18, -3,-31,-48,-19,  3;
/M: SY='G';  M= -3,-17,-60,-27,-26,-57, 56,-32,-64,  1,-62,-44, -7,-42,-23,-20,-10,-24,-54,-60,-54,-26;
/M: SY='P';  M= -9,-27,-42,-32,-18,-39,-40,-30,-26,  3,-24,  0,-20, 11, -9,-14, -9, 10,-18,-53,-40,-15;
/M: SY='Y';  M=-29,-42,-53,-52,-47, 12,-18, 10,-41,-37,-34,-36,-32,-57,-33,-40,-24,-30,-38,  5, 62,-40;
/M: SY='L';  M=-30,-68,-28,-70,-60, -2,-70,-52, 31,-42, 51, 28,-60,-50,-42,-42,-40,-28, 17,-42,-22,-52;
/M: SY='A';  M= 22,-23,-33,-26, -6,-45,-20,-13,-40,  8,-35,-21,-18,-20, 13, 13,  2, -8,-25,-48,-38,  1;
/M: SY='R';  M=-30,-34,-52,-41,-24,-36,-48,-14,-30, 10,-12,-13,-24,-36, -4, 53,-26,-23,-26,-47,-34,-14;
/M: SY='R';  M=-36,-37,-57,-44,-24,-36,-46,-11,-50,  5,-40,-30,-27,-41, -4, 51,-31,-28,-43,  9,-20,-14;
/M: SY='L';  M=-30,-70,-30,-70,-60,  0,-70,-50, 20,-40, 60, 30,-60,-50,-40,-40,-40,-30, 10,-40,-20,-50;
/M: SY='Q';  M=-14,-13,-53,-16, 10,-53, -3, -4,-56,  6,-48,-21, -3,-36, 53, -4,-10,-16,-46,-46,-38, 25;
/M: SY='T';  M=-21,-12,-42, -6,-21,-20,-45,-15,-23,-28,-30,-25,-16,-40,-22,-33,-13,  4, -9,-37, -1,-21;
/M: SY='N';  M=-30, -3,-47,-19,-24,-40,-35,-10,-35, -3,-21,-18, 21,-40, -9,  9,-12,-14,-30,-56,-34,-19;
/M: SY='G';  M=  0,-20,-60,-30,-40,-60, 90,-40,-70,-30,-70,-50,-10,-50,-40,-40,-10,-30,-60,-60,-60,-40;
/M: SY='L';  M=-30,-70,-30,-70,-60,  0,-70,-50, 20,-40, 60, 30,-60,-50,-40,-40,-40,-30, 10,-40,-20,-50;
/M: SY='R';  M=-17,-18,-60,-28,-14,-53, -1,-14,-56, 25,-48,-36, -8,-33, -2, 40,-15,-21,-46,-55,-46, -9;
/M: SY='A';  M= 25,-48,-17,-48,-35,-25,-33,-40,  1,-25,  2,  0,-42,-28,-30,-35, -8, -7, 17,-48,-33,-32;
/M: SY='V';  M=-16,-29,-28,-38,-32,-31,-46,-33, 12,-29,-10, -4,-11,-40,-29,-32,-19,  0, 36,-56,-33,-32;
/M: SY='T';  M= 12,-29,-24,-31,-14,-37,-32,-26,-13,-11,-21, -7,-22,-27,  2,-21,  0, 15,  7,-48,-33,-10;
/M: SY='N';  M=-11, 22,-49, 19,  2,-52,-20,-10,-54, 14,-51,-39, 28,-27,  0, -6, 17, -2,-44,-67,-42,  0;
/M: SY='S';  M= -2,-15,-38,-18, -6,-48,-32,-21,-41, -6,-40,-24, -8, 13,  7,-16, 16, 13,-28,-56,-38, -1;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='Q';  M=-17, -8,-62,-11, 15,-48, -3, 18,-60, -3,-55,-35, -3,-36, 22,-11,-12,-22,-48,-50,-30, 16;
/M: SY='G';  M= -8, -1,-57,-17,-32,-60, 63,-27,-67,-22,-67,-47, 17,-47,-29,-32, -5,-22,-57,-63,-55,-32;
/M:         M=-21,-15,-54, -4,-14,-41,-46,-31,-36, -3,-22,-23,-20,  0,-16,-19,-21,-23,-31,-62,-44,-14;
/M: SY='Y';  M=-29,-43,-44,-51,-38, 17,-54,-13, -9,-11,-12,-12,-38,-47,-25,-25,-29,-24,-15,-20, 21,-35;
/M: SY='V';  M=-23,-60,-26,-62,-50, 16,-62,-44, 33,-45,  9,  9,-55,-48,-45,-45,-35,-16, 38,-36,-10,-50;
/M: SY='V';  M= -2,-39,-32,-44,-29,-22,-43,  0,  3,-27,-14, -9,-31,-35,-24,-29,-18,-13, 11,-47,-15,-29;
/M: SY='W';  M=-35,-52,-42,-57,-38, -5,-58,-19,-12,-35,-19,-12,-45,-53,-12,-34,-36,-28,-18, 27, 18,-28;
/M: SY='M';  M=  4,-36,-27,-43,-32,-11,-34,-19,-14,-22,-11, 11,-28,-34,-17,-30, -5,  9, -7,-27, -2,-27;
/M: SY='F';  M=-34,-51,-43,-54,-46, 31,-57,-22,-13,-25,  5,  0,-46,-49,-30, -8,-34,-32,-18,-25,  1,-40;
/M: SY='G';  M= -2,-13,-53,-23,-24,-46, 38,  1,-61,-21,-59,-43, -1,-41,-22,-26,  5,-19,-51,-55,-33,-24;
/M: SY='V';  M= -6,-34,-29,-39,-25,-32,-41,-30, -3,-16,-15,-10,-24,-32,-20, -5,  0,  1, 17,-53,-32,-22;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E';  M=-13,-11,-65, -5, 25,-60,-13,-20,-59, -8,-59,-42,-18, 12, -3,-22,-13,-25,-45,-63,-55, 15;
/M: SY='S';  M=  9, -3,-28,-10,  1,-43,-18,-12,-43, -2,-40,-24,  7,-23, 18,-12, 48, 12,-33,-54,-30,  7;
/M: SY='W';  M=-42,-55,-53,-61,-43, -3,-54,-10,-45,-29,-35,-30,-45,-56,-23, -8,-41,-36,-42, 66, 32,-33;
/M: SY='I';  M= -2,-54,-19,-59,-49,-16,-50,-49, 31,-36, 15, 11,-52,-39,-39,-42,-23,-17, 19,-48,-31,-46;
/M: SY='R';  M=-29,-37,-57,-44,-31,-38,-16,-20,-55, -9,-47,-35,-27,-46,-15, 21,-29,-31,-47,  7,-25,-23;
/M: SY='H';  M=-30,-10,-70,-20,  0,-20,-40,120,-60,-10,-50,-40, 10,-40, 10,  0,-20,-30,-50,-40, 30,  0;
/M: SY='I';  M=-30,-62,-22,-70,-60, -8,-70,-58, 59,-48, 29, 22,-60,-50,-48,-48,-40,-22, 33,-48,-28,-58;
/M: SY='S';  M=  3,-10,-38,-20,-15,-47,  3,-25,-43,  5,-44,-29,  0,-30,-10,-13, 20, 19,-31,-57,-39,-15;
/M: SY='R';  M=-22,-26,-44,-34,-22,-29,-44,  8,-28, -6,-17,-13,-14,-37, -7, 10,-13,  4,-20,-46,-17,-17;
/M: SY='A';  M= 22,-32,-28,-37,-22,-34,-22,-24,-25, -3,-19,  2,-27,-22, -9,  4, -2, -8,-14,-46,-38,-17;
/M: SY='D';  M= -6, 10,-53, 16,  9,-54,  6,-21,-59,-13,-59,-44,  2,-30, -9,-25, 12,-11,-47,-65,-49,  2;
/M: SY='E';  M=-17,-10,-14, -5, 38,-54,-46,-20,-49,-10,-52,-37,-21,-31,  8,-24,-13,-20,-34,-57,-50, 23;
/M: SY='P';  M= -3,-22,-51,-23, -9,-53,-35,-27,-48, 10,-45,-35,-17, 49,-11,-11,  3,-13,-38,-65,-48, -9;
/M: SY='V';  M= -9,-49,-23,-52,-39,-19,-52,-43, 17,-33, 13,  7,-39,-38,-33,-36,-11, -4, 31,-49,-27,-36;
/M: SY='K';  M=-17,-25,-56,-23,  7,-44,-46,-23,-37, 12,-25,-22,-25,  5, -2,-10,-19,-22,-29,-58,-43,  3;
/M: SY='P';  M= -7, -4,-46,-11,-14,-54,-28,-21,-50,-12,-50,-37,  9, 37,-16,-22, 13, -8,-40,-67,-46,-14;
/M: SY='Y';  M=-29,-21,-54,-17,-35, 11,-20,-10,-43,-36,-37,-33,-25,-51,-33,-40,-24,-30,-41,-23, 15,-34;
/M: SY='F';  M=-33,-57, -4,-62,-59, 51,-60,-17,-18,-49,-12,-15,-52,-60,-44,-49,-33,-33,-23, -3, 39,-57;
/M: SY='V';  M=-14,-33,-38,-31,  3,-36,-51,-25, -3,-15,-17, -6,-30,-33,  5,-22,-21, -7, 21,-50,-34,  3;
/M:         M=-24,-23,  0,-21,-32,-40,-50,-38,-19,-25,-30,-25,-26,-43,-25,-11,-22,-20,-21,-57,-45,-31;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='I';  M=-16,-45,-17,-48,-38, -8,-48,-38, 31,-31, 21, 14,-40,-33,-31,-31,-26,-11, 30,-34,-19,-36; D=-11;
/I:         I=-11; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
/M: SY='A';  M=  9,-28,-25,-30,-29,-25,  9,-29,-21,-19,-12,-11,-23,-27,-24,-26, -7,-15,-16,-36,-30,-26; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='R';  M=-19, -6,-46, -8, 17,-39,-29,  0,-39, 16,-34,-24, -7,-19, 13, 38,-12,-14,-29,-39,-31, 16; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='F';  M=-27,-43,-24,-45,-43, 47,-45,-23, 11,-36,  4,  4,-43,-41,-36,-36,-29,-24, -1,-11, 13,-43; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='D';  M= -8,  9,-35, 13,  0,-36,-18,-10,-38, -1,-36,-28,  5,-19, -3,  8, 12, -4,-31,-45,-31,  0; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='V';  M=-21,-26,-34,-18,-29,-29,-54,-44, 17,-37,-10, -7,-33,-40,-34,-40,-27,-11, 25,-58,-38,-31;
/M: SY='V';  M=-22,-47,-33,-47,-24,-22,-61,-42, 22,-32,  9,  6,-46,-41,-27,-36,-31,-17, 24,-50,-32,-26;
/M: SY='P';  M=  7,-18,-38,-19,-14,-49,-28,-29,-44,-14,-44,-34,-12, 43,-19,-24, 30, -2,-34,-64,-43,-14;
/M: SY='N';  M=-29, 16,-56,  2,  6,-37,-30, 12,-53, -6,-51,-38, 32,-39,  2,-17, -5,-12,-43,-44, -9,  3;
/M: SY='C';  M= 10,-15, 16,-27,-31,-45,-25,-32,-32,-21,-37,-25, -1,-35,-21,-31,  7, 12,-20,-55,-40,-31;
/M: SY='D';  M=-11,  3,-45, 14, 11,-45,-36,-24,-31,-16,-39,-30, -8,-28, -9,-26,  2, -6,-14,-63,-43,  3;
/M: SY='W';  M= -9,-58,-41,-55,-40,-24,-42,-37,-45,-38,-40,-30,-53,-12,-32,-40,-30,-32,-37, 52, -9,-35;
/M: SY='S';  M=  3,-18,-22,-26,-24,-31,-29,-29,-21,-17,-15,-11, -8,-29,-17,-24, 32, 25,-13,-53,-28,-22;
/M: SY='P';  M=  8,-43,  4,-41,-34,-50,-42,-46,-37,-29,-40,-33,-41, 41,-33,-38,-11,-21,-28,-60,-53,-34;
/M: SY='L';  M=-26,-53,-42,-58,-53, -3,-32,-26,-13,-38, 10, -4,-43,-53,-37,-40,-31,-30,-16,-26,  6,-45;
/M: SY='P';  M=-10,-33,-60,-28,-13,-58,-46,-33,-50,  2,-48,-38,-31, 89,-19,-17,-18,-26,-40,-68,-56,-13;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='I';  M=-16,-32,-27,-37,-24,-16,-40,-27,  7,  1,  7,  3,-27,-28,-15,-12,-21,-14,  0,-36,-22,-22; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='F';  M=-26,-45,-26,-45,-43, 49,-45,-21,  0,-34, 14,  7,-43,-41,-34,-34,-29,-26, -8, -9, 15,-41; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='R';  M=-17,-12,-43,-19, -3,-36,-26, -2,-36, 33,-29,-22, -5,-19,  9, 51,-12,-12,-29,-38,-29,  2; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='F';  M=-26,-45,-26,-45,-43, 49,-45,-21,  0,-34, 14,  7,-43,-41,-34,-34,-29,-26, -8, -9, 15,-41; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='Q';  M= -8,-16,-40,-16, -5,-40, -2,-15,-40, -6,-38,-23,-11,  8,  9,-13, -9,-16,-33,-40,-35,  0; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='S';  M=  4, -7,-23,-14,-17,-33, 10,-22,-30,-12,-33,-21,  0,-24,-14,-19, 19, 19,-20,-40,-28,-17; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='R';  M=  3,-18,-48,-26, -6,-41,-26, 16,-47, 21,-39,-29, -9,-24,  4, 23, -6,-14,-34,-50,-24, -3;
/M: SY='K';  M= -5,-13,-51,-23,-11,-51,  4,-23,-49, 29,-46,-31, -3,-31, -4, -1, -3,  5,-37,-58,-43,-11;
/M: SY='Y';  M=-39,-29,-50,-42,-41,  3,-46,  9,-43,-33,-36,-33,-10,-57,-24,-34,-25,-26,-40, 31, 50,-34;
/M: SY='Y';  M=-40,-52,-48,-60,-52, 54,-60, 19,-25,-42,-15,-23,-45,-60,-35,-42,-32,-32,-28, 23, 94,-45;
/M: SY='G';  M=  0,-20,-60,-30,-40,-60, 90,-40,-70,-30,-70,-50,-10,-50,-40,-40,-10,-30,-60,-60,-60,-40;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_06 which contains 572'619 sequence entries.

Total number of hits	12 in 12 different sequences
Number of true positive hits	12 in 12 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	Peptidase C32
Version [info]	4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

12 sequences

1ATF_PRRSS  (P0DJY0), RPOA_EAVBU  (P19811), RPOA_LDVC   (Q06502),

RPOA_LDVP   (Q83017), RPOA_PRRS1  (Q9YN02), RPOA_PRRSB  (Q8B912), 
RPOA_PRRSL  (Q04561), RPOA_PRRSR  (Q9WJB2), RPOA_PRRSS  (A0MD28), 
RPOA_PRRSV  (A6YQT5), RPOA_SHFV   (Q68772), RPOTF_PRRSL (P0DJZ9)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment