PROSITE entry PS51634
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | CRC |
| Accession [info] | PS51634 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JAN-2012 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51634 |
| Associated ProRule [info] | PRU00971 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | CRC domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=125; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=120; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.4109969; R2=0.0071049; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=13140.6083984; R2=12.7448454; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=787; H_SCORE=23171; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=435; H_SCORE=18685; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-21; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='S'; M= -6, -1,-47,-11, 0,-51, -9,-12,-51, 11,-48,-32, 10,-26, 7, -1, 12, -2,-39,-58,-40, 1; /M: M=-21,-17,-13,-24,-22,-43,-33,-14,-38,-11,-38,-30, -7,-41,-13,-10,-15,-18,-33,-55,-37,-21; /M: SY='K'; M=-11,-25,-46,-32,-11,-34,-40,-24,-23, 22,-27,-19,-21,-16, -6, 0,-14,-11,-20,-54,-35,-12; /M: SY='S'; M= -6,-15,-43,-23,-12,-43,-21, -4,-42, 3,-41,-30, -4,-16, -5, -1, 7, -7,-34,-56,-31,-11; /M: SY='C'; M=-13,-61,109,-69,-69,-29,-61,-66,-17,-58,-22,-24,-51,-59,-49,-58,-23,-22,-18,-46,-43,-68; /M: SY='N'; M= -9, -4,-35,-16,-11,-46,-27, -9,-41, 9,-40,-28, 12,-26, 0, 5, 8, 1,-30,-57,-36, -8; /M: SY='C'; M= -9,-56,106,-65,-65,-43,-49,-66,-25,-56,-34,-32,-47,-49,-48,-57,-19,-21,-24,-52,-51,-65; /M: SY='K'; M=-12,-21,-42,-28, -7,-46,-38,-19,-36, 32,-34,-23,-12,-17, 5, 16,-10, -3,-23,-56,-39, -4; /M: SY='K'; M=-16, -9,-54,-19, -1,-44,-33, -4,-46, 37,-37,-26, 5,-18, 12, 8, -9, -8,-37,-55,-31, 1; /M: SY='S'; M= 12, -2,-27,-12,-12,-42,-10,-20,-39, -6,-40,-29, 10,-24,-10,-18, 51, 13,-28,-60,-33,-12; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='K'; M=-13,-12,-47,-21, -3,-37,-32,-10,-36, 29,-32,-20, -1,-28, 14, 9, -7,-10,-30,-51,-31, 1; D=-11; /I: I=-11; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23; /M: SY='C'; M= -9,-55,107,-64,-63,-38,-56,-64,-16,-54,-27,-25,-45,-55,-45,-54,-17,-11,-13,-49,-46,-63; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='L'; M=-25,-63,-16,-65,-56, -7,-65,-50, 23,-40, 40, 21,-54,-48,-39,-41,-34,-20, 15,-42,-24,-49; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='K'; M= -7, -4,-49,-12, 12,-48,-26, -6,-48, 43,-41,-27, 6,-22, 25, 12, 4, -5,-37,-55,-36, 14; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='L'; M=-21,-41,-33,-47,-44,-16,-42,-37, -4,-29, 22, 10,-27,-44,-30,-33,-18,-19, -7,-46,-26,-38; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='Y'; M=-39,-40,-51,-49,-45, 30,-56, 27,-33,-37,-24,-32,-31,-58,-28,-38,-27,-28,-32, 20, 95,-36; /M: SY='C'; M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70; /M: SY='E'; M=-16, -2,-56, 10, 15,-52,-33,-23,-43,-12,-47,-36,-14, -7, -7,-20,-11,-17,-26,-64,-49, 7; /M: SY='C'; M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70; /M: SY='F'; M=-32,-52,-38,-54,-53, 72,-54,-18,-13,-44, -3, -4,-50,-54,-43,-45,-25,-31,-20, -8, 32,-52; /M: SY='A'; M= 39,-20,-24,-22, -7,-42,-12,-18,-37, 0,-35,-22,-17,-16, 0,-14, 18, -1,-21,-51,-36, -5; /M: SY='S'; M= 17, -6,-30,-17,-18,-44, -4,-20,-37, -7,-40,-28, 6,-26,-14,-18, 22, 0,-27,-58,-38,-18; /M: SY='G'; M=-12,-12,-57,-24,-26,-51, 36,-19,-61,-10,-58,-41, 2,-44,-16,-13,-10,-23,-52,-53,-41,-23; /M: M=-14,-19,-44,-21,-12,-38,-23,-22,-27,-11,-30,-20,-13,-36, -6,-18,-11, -9,-13,-51,-32,-10; /M: SY='Y'; M=-35,-42,-49,-46,-31, 32,-56, 13,-23,-34,-18,-19,-38,-51,-25,-35,-30,-30,-23, -6, 47,-30; /M: SY='C'; M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='S'; M= 4, -6,-21,-13, -9,-28, -7,-16,-23, 2,-25,-17, 0,-18, -6, -9, 20, 12,-17,-38,-23, -9; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='E'; M=-16, 12,-54, 15, 16,-53,-31,-12,-50, 1,-51,-36, 9,-14, 7,-12, 2, -8,-40,-63,-45, 12; /M: SY='N'; M=-11, 10,-47, 0,-16,-52, -2,-17,-52,-10,-50,-37, 25,-20,-14,-21, 12, -7,-43,-65,-44,-16; /M: SY='C'; M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70; /M: SY='N'; M= -8, 5,-47, -4, 0,-49,-14, -6,-49, 4,-47,-33, 16,-30, -1, -6, 9, -1,-37,-59,-37, -2; /M: SY='C'; M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70; /M: SY='N'; M=-16, -7,-40,-16,-14,-30,-34, -7,-33, -6,-34,-22, 6,-36, 1,-15, 3, 3,-23,-44,-14,-10; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='N'; M=-20, 19,-44, 8,-12,-56, -8,-11,-56, -6,-56,-40, 36,-20, -9,-18, -2,-11,-47,-65,-46,-13; D=-12; /I: I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25; /M: SY='C'; M=-11,-58,115,-67,-67,-36,-58,-67,-13,-57,-26,-26,-49,-57,-48,-57,-21,-19,-15,-48,-47,-67; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: M=-18,-30,-33,-35,-22, -3,-37, -6,-31,-11,-22,-19,-23,-40,-14,-21,-11,-19,-28,-32, -1,-21; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='N'; M=-27, 41,-36, 13,-14,-56,-13, 4,-55, -4,-56,-38, 77,-40, -3,-13, 8, -1,-46,-66,-39,-14; D=-12; /I: I=-12; DM=-25; /M: SY='K'; M=-21, 3,-55,-11, -4,-46,-29, 3,-46, 34,-42,-29, 20,-31, 7, 17, -9,-11,-39,-58,-32, -2; /I: I=-6; MD=-13; /M: M= -7,-20,-34,-24,-11,-32,-33,-21,-19, -7,-18,-14,-14,-12,-12,-18, -1, -8,-12,-49,-30,-12; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: M=-17,-16,-43,-18, -2,-26,-30,-10,-23,-13,-25,-15,-16,-32, -7,-18,-13,-16,-20,-38,-17, -4; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='H'; M=-26, -5,-50,-17,-14,-18,-32, 41,-44,-10,-38,-32, 13,-26, -5,-12,-12,-18,-37,-29, 18,-12; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='E'; M=-14, 5,-46, 9, 36,-47,-26, -9,-44, -2,-46,-30, -4,-23, 9,-16, -8,-15,-31,-52,-42, 24; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='D'; M=-15, 8,-41, 14, 6,-40,-30,-17,-32,-12,-35,-26, 2,-22, -7,-20, -2, -2,-21,-54,-37, 1; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='A'; M= 7,-20,-27,-21, -8,-24,-26,-21,-22, -9,-23,-15,-19,-15, -9,-21, 3, 1,-12,-42,-26, -9; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='R'; M=-16,-30,-34,-35,-20,-30,-39,-20, -8, -3,-16,-11,-22,-29,-11, 21,-14, -8, 4,-43,-30,-16; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='Q'; M=-17,-16,-42,-15, 11,-24,-36, -8,-31, 1,-22,-10,-15,-27, 19, -6, -9,-14,-24,-38,-24, 13; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='E'; M= -6, -6,-40, -7, 12,-33,-26, -6,-36, 11,-34,-24, -8,-20, 6, -2, -1, -6,-25,-39,-22, 9; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='A'; M= 23,-19,-17,-22,-13,-32,-15,-20,-20, -5,-23,-13,-16,-17, -5,-11, 9, 10, -9,-39,-29,-11; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='I'; M=-18,-31,-28,-38,-24,-22,-42,-25, 9,-13, -6, 1,-26,-31,-11, 0,-18,-10, 6,-39,-26,-20; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='K'; M=-17, 2,-44, 3, 5,-33,-29,-11,-34, 10,-30,-23, 1,-24, 0, -2, -9,-12,-27,-47,-31, 2; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='Q'; M= 0,-20,-27,-25,-12,-28,-24,-17,-16, -6,-16, 1,-13,-24, 4, -5, -3, -2, -7,-37,-27, -7; D=-6; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='I'; M=-10,-38, 5,-45,-39,-18,-43,-41, 20,-32, 0, 2,-35,-35,-31,-34,-15, -2, 13,-39,-26,-39; D=-6; /I: I=-6; MI=-13; MD=-13; IM=-13; DM=-13; /M: SY='L'; M=-19,-33,-34,-33,-15,-17,-44,-24, -8, -5, 12, 4,-29,-30, -7,-15,-22,-18, -8,-36,-23,-12; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='E'; M= -7, -6,-36, -3, 4,-29,-17,-17,-29,-10,-26, -9, -9,-24, -2,-19, 1, -9,-23,-42,-31, 1; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='R'; M=-21,-14,-47,-22, -5,-39,-30, -1,-39, 31,-31,-23, -6,-22, 9, 62,-14,-14,-31,-40,-31, 1; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='N'; M=-20, 35,-43, 11, -9,-55,-13, 3,-54, -1,-54,-35, 67,-36, 2,-11, 19, 7,-43,-66,-37, -8; /M: SY='P'; M=-10,-38,-60,-29,-18,-59,-49,-38,-50,-15,-49,-39,-38,113,-27,-27,-19,-29,-40,-69,-59,-18; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='K'; M=-16, -6,-45, -9, -3,-36,-32,-14,-34, 8,-23,-20, 0,-28, -2, -2, -9,-13,-27,-51,-33, -4; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='A'; M= 57,-25,-14,-27,-18,-41, -4,-27,-33, -8,-32,-22,-22,-13,-17,-22, 26, 2,-15,-52,-38,-17; /M: SY='F'; M=-20,-55,-34,-56,-52, 66,-50,-24,-10,-42, 0, 3,-54,-50,-43,-45,-30,-31,-15,-12, 20,-51; /M: SY='P'; M= -1, -9,-47, -5, -3,-49,-30,-19,-46, 2,-42,-27, -9, 7, 4,-10, -1,-12,-35,-59,-44, 0; /M: SY='P'; M=-13,-41,-57,-32,-20,-54,-52,-39,-43,-21,-39,-33,-41, 96,-29,-30,-22,-30,-35,-66,-55,-20; /M: SY='K'; M=-11,-11,-60,-21, 9,-50,-31, -9,-50, 77,-40,-30, -1,-21, 19, 34,-11,-11,-40,-59,-40, 9; /M: SY='I'; M=-14,-55,-21,-62,-48,-13,-57,-51, 43,-40, 15, 29,-51,-42,-36,-42,-30,-12, 35,-46,-31,-46; /M: M= -5,-30,-33,-37,-28,-33,-21,-36, -7,-23,-18,-12,-23,-37,-26,-31, -5, -7, -1,-54,-37,-28; /M: SY='R'; M= -7,-11,-43,-21,-12,-46,-21,-15,-40, 8,-39,-27, 1,-24, -1, 12, 7, -6,-30,-56,-38, -8; /I: I=-4; MD=-8; /M: SY='S'; M= 0,-16,-28,-25,-24,-36,-11,-28,-20,-17,-29,-17, -7,-27,-19,-21, 15, 8,-16,-51,-34,-23; D=-4; /I: I=-4; MD=-8; /M: M= -7,-21,-26,-25,-17,-32,-33,-23,-19,-10,-19,-14,-13,-11,-11,-12, -1, -3, -9,-46,-30,-15; D=-4; /I: I=-4; MD=-8; /M: SY='Q'; M=-11, -2,-42, -1, 5,-37,-22, -3,-39, -6,-33,-23, -1,-23, 8,-14, -3, -9,-30,-46,-29, 5; D=-4; /I: I=-4; MD=-8; /M: SY='G'; M= 1, 0,-38, 3,-11,-41, 6,-17,-43,-11,-43,-32, -2,-22,-15,-21, 2, -2,-32,-49,-36,-13; D=-4; /I: I=-4; MD=-8; /M: M= 0,-14,-24,-21,-23,-28, -2,-22,-14,-16,-20,-11, -4,-27,-19,-23, -6, -8, -9,-39,-29,-22; D=-4; /I: I=-4; MD=-8; /M: SY='Q'; M= -5,-11,-16,-17, -9,-28,-23,-14,-19, -3,-20, -9, -3,-23, 6, -6, 3, 6,-14,-35,-23, -5; D=-4; /I: I=-4; MD=-8; /M: SY='D'; M= -9, 7,-27, 14, 14,-32,-21,-11,-30, -7,-30,-23, -1,-18, 0,-15, -5,-10,-21,-39,-30, 8; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8; /M: M= -4,-15,-22,-17, -7,-20,-16,-14,-14, -3,-16, -9,-12,-11, -5, -7, -6, -2, -6,-20,-18, -6; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='E'; M= -6, 10,-33, 17, 19,-32,-19, -9,-32, -4,-33,-25, 1,-15, 2,-12, 8, -4,-23,-41,-28, 13; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='D'; M=-14, 22,-35, 29, 10,-34,-15, -4,-36, 0,-35,-26, 17,-18, 5, -9, -2, -7,-30,-41,-29, 7; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='A'; M= 21,-16,-11,-18,-14,-21,-10,-18,-13, -9,-12, -9,-13,-10,-13,-17, 9, -1, -4,-31,-21,-14; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: M= -4,-11,-22,-16,-11,-21,-11, -9,-12,-11,-16, -7, -5,-21, -8,-15, -1, -5, -7,-31,-19,-11; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='K'; M= -3, -8,-33, -7, 1,-31,-21, -5,-30, 6,-28,-20, -7, 5, 0, -1, -4, -7,-22,-37,-25, 1; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='T'; M= -3,-16,-22,-22,-16,-24,-11,-21,-13,-10,-16, -3,-10,-20, -9,-16, 2, 8, -7,-34,-24,-14; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='P'; M= -6,-12,-41, -8,-12,-43,-31,-25,-34,-15,-36,-28,-12, 33,-18,-24, -7,-15,-26,-55,-42,-13; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='A'; M= 6,-25,-24,-26,-10,-25,-28,-25, -7,-15,-11, -1,-25,-17,-13,-23, -2, -7, -3,-40,-29,-12; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='S'; M= -7,-15,-27,-16,-11,-26,-31,-22, -9, -8,-15,-10,-13,-24, -8,-17, 1, -3, -3,-43,-26,-10; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: M= -2,-19,-37,-21,-16,-32,-11,-20,-35, -8,-31,-22,-16,-13, -9, -7, -5,-10,-27,-43,-32,-13; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='R'; M=-15,-22,-40,-27, -9,-32,-34,-13,-25, 21,-18,-14,-15,-16, 2, 22,-15,-12,-17,-41,-29, -5; D=-4; /I: I=-4; DM=-8; /M: SY='H'; M=-24,-14,-66,-17, 6,-33,-35, 63,-56,-10,-48,-38, -4,-16, 3,-10,-19,-28,-45,-48, -2, 3; /M: SY='K'; M=-12, -9,-43,-20,-15,-24,-28,-10,-41, 8,-36,-25, 4,-32, -4, 6, 4, -5,-33,-48,-24,-12; /M: SY='K'; M=-18, -3,-55,-16, -2,-51,-30, -5,-49, 44,-42,-30, 12,-27, 11, 37, -7, -4,-38,-58,-39, 1; /M: SY='G'; M= -4,-23,-58,-32,-39,-46, 71,-37,-64,-26,-63,-45,-14,-49,-38,-37,-12,-30,-56,-55,-51,-39; /M: SY='C'; M=-10,-60,118,-69,-68,-38,-60,-68,-15,-58,-27,-27,-50,-58,-49,-58,-21,-18,-13,-50,-48,-68; /M: SY='N'; M=-23, 24,-52, 3, -6,-48,-20, 28,-55, 4,-53,-37, 53,-36, 3, -5, 6, -2,-45,-60,-23, -6; /M: SY='C'; M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70; /M: SY='K'; M=-19,-14,-60,-24, 1,-50,-34, -6,-50, 58,-40,-30, -4,-24, 16, 56,-14,-14,-40,-56,-40, 6; /M: SY='K'; M=-16,-13,-60,-23, 4,-50,-33, -7,-50, 66,-40,-30, -3,-23, 17, 47,-13,-13,-40,-57,-40, 7; /M: SY='S'; M= 11, -3,-25,-11, -4,-42,-17,-16,-40, -5,-39,-24, 7,-23, 8,-15, 51, 21,-29,-55,-30, 0; /M: SY='G'; M= -9, 1,-53,-11,-14,-53, 23,-16,-59, -7,-58,-41, 16,-38,-14,-17, 5,-13,-48,-59,-43,-15; /M: SY='C'; M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70; /M: SY='L'; M=-15,-49,-27,-53,-45,-12,-52,-41, 4,-31, 30, 14,-39,-41,-31,-34, -8,-15, 1,-46,-23,-38; /M: SY='K'; M=-10,-10,-60,-20, 10,-50,-30,-10,-50, 80,-40,-30, 0,-20, 20, 30,-10,-10,-40,-60,-40, 10; /M: SY='K'; M=-19, -4,-56,-18, -2,-49,-31, -7,-47, 48,-37,-28, 11,-27, 11, 29,-10,-11,-39,-59,-39, 1; /M: SY='Y'; M=-40,-50,-50,-60,-50, 40,-60, 30,-30,-40,-20,-30,-40,-60,-30,-40,-30,-30,-30, 30,110,-40; /M: SY='C'; M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70; /M: SY='E'; M=-21, 16,-70, 29, 73,-60,-39, -2,-61, 7,-61,-42, -7,-21, 25,-12,-10,-20,-42,-62,-51, 54; /M: SY='C'; M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70; /M: SY='Y'; M=-36,-47,-46,-51,-40, 48,-56, 7,-26,-33,-16,-15,-41,-55,-16,-35,-30,-30,-28, 6, 57,-32; /M: SY='Q'; M=-17, -8,-56, -9, 31,-50,-37, 0,-49, 34,-41,-18, -3,-26, 54, 11,-11,-12,-38,-49,-37, 37; /M: SY='A'; M= 24,-16,-34,-20,-19,-46, 3,-23,-42, -7,-40,-26,-12,-24,-15, -9, 5, -9,-28,-54,-44,-17; /M: SY='N'; M= -9, -7,-46,-20,-19,-44, 7,-21,-44, -3,-40,-15, 9,-36, -8,-17, 3, -9,-37,-56,-42,-17; /M: SY='V'; M=-11,-47,-20,-53,-42,-22,-53,-48, 31,-35, 4, 8,-41,-40,-35,-38,-19, 11, 36,-50,-30,-41; /M: M=-17,-38,-49,-43,-37,-31, -4,-34,-33,-21,-21,-10,-29,-28,-27,-15,-23,-26,-30,-49,-40,-33; /M: SY='C'; M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70; /M: SY='S'; M= 12, -1,-21,-12,-13,-41,-16,-22,-35,-10,-38,-25, 10,-24,-10,-20, 54, 36,-22,-58,-30,-13; /M: SY='S'; M= 0, -9,-36,-10, -1,-38,-30,-24,-28, -8,-29,-18,-10,-26, -8,-21, 17, -2,-20,-57,-37, -4; /M: SY='N'; M=-26, 6,-46,-13,-19,-40,-30, -7,-34, 1,-38,-25, 27,-38, -7, 5, -4, -9,-31,-58,-34,-17; /M: SY='C'; M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70; /M: SY='K'; M=-20, -3,-58,-16, 0,-52,-30, -3,-52, 49,-44,-32, 13,-27, 13, 43,-10,-12,-42,-58,-40, 3; /M: SY='C'; M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='E'; M=-22,-18,-48,-16, 11,-34,-49,-20,-18,-10,-22,-10,-24,-34, 3,-22,-19,-14,-14,-49,-33, 7; /M: SY='D'; M=-14, 25,-62, 40, 0,-59, 11,-23,-66,-19,-66,-52, 11,-35,-17,-30, -7,-21,-55,-70,-57, -6; /M: SY='C'; M=-10,-60,130,-70,-70,-40,-60,-70,-20,-60,-30,-30,-50,-60,-50,-60,-20,-20,-20,-50,-50,-70; /M: SY='K'; M=-12, -7,-58,-13, 20,-51,-32, -8,-50, 53,-43,-31, -2,-21, 21, 23, -5, -9,-38,-58,-41, 18; /M: SY='N'; M=-30, 50,-50, 20,-10,-60,-10, 10,-60, 0,-60,-40, 90,-40, 0,-10, 10, 0,-50,-70,-40,-10; /M: M=-14,-33,-39,-35,-21, -6,-43,-12,-27,-19,-24,-13,-26,-21, -3,-25, -9, -8,-20,-30, -1,-15; /M: SY='E'; M=-21,-17,-55,-13, 20, -6,-43, -7,-41, -8,-37,-26,-26,-34, -1,-23,-15,-23,-32,-37,-13, 10; /M: SY='G'; M=-10,-18,-52,-23,-18,-48, 21,-28,-40,-24,-48,-33,-16,-42,-24,-33,-11,-20,-35,-58,-47,-21; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 19 in 19 different sequences |
| Number of true positive hits | 19 in 19 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | CRC |
| Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
19 sequences
LIN54_CAEEL (Q95QD7), LIN54_DANRE (Q08CM4), LIN54_DROME (A1Z9E2), LIN54_HUMAN (Q6MZP7), LIN54_MOUSE (Q571G4), LIN54_PONAB (Q5RBN8), LIN54_RAT (Q641Z1), LIN54_XENTR (Q0IHV2), MTL5_HUMAN (Q9Y4I5), MTL5_MOUSE (Q9WTJ6), MTL5_RAT(Q5XHX9), TCX2_ARATH (F4JIF5), TCX3_ARATH (Q8L548), TCX4_ARATH (Q84JZ8), TCX5_ARATH (Q9SZD1), TCX6_ARATH (Q9SL70), TCX7_ARATH (F4JY84), TCX8_ARATH (Q700D0), TSO1_ARATH (Q9LUI3)» more
|
| PDB [Detailed view] |
1 PDB
5FD3 |